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Preparation of (R

产碱杆菌ECU0401催化拆分扁桃酸及其衍生物



全 文 :第7卷第4期
2009年7月
生 物 加 工 过 程
ChineseJournalofBioprocessEngineering
Vol.7No.4
July2009
doi:10.3969/j.issn.1762-3678.2009.04.014
收稿日期:2008-04-29
基金项目:国家自然科学基金资助项目(20506037&20672037);华东理工大学生物反应器工程国家重点实验室开放课题资助项目(2008004)
作者简介:何玉财(1979—),男,辽宁开原人,助理研究员,博士,研究方向:生物催化;许建和(联系人),教授,博士生导师,Email:jianhexu@
ecust.edu.cn
产碱杆菌 ECU0401催化拆分
扁桃酸及其衍生物
何玉财1,2,许建和1
(1.华东理工大学 生物反应器工程国家重点实验室 生物催化研究室,上海 200237;
2.中国科学院 青岛生物能源与过程研究所,青岛 266071)
摘 要:从土壤中分离的1株产碱杆菌AlcaligenesspECU0401具有扁桃酸脱氢酶活性,可以以扁桃酸、苯甲酰甲酸或
苯甲酸为唯一C源生长,并且具有较高的脱氢酶活力。以外消旋扁桃酸为C源,采用分批补料策略培养(或反应)
99h,扁桃酸累计投入量为304g/L,(S)(+)扁桃酸被完全降解,(R)(-)扁桃酸回收产率为328%,对映体过量
值(ee)>999%。利用静息细胞作为催化剂不对称降解外消旋扁桃酸的氯代衍生物,制备获得光学活性的
(R)(-)邻氯扁桃酸、(S)(+)间氯扁桃酸和(S)(+)对氯扁桃酸,光学纯度均超过999% ee。
关键词:产碱杆菌;(S)扁桃酸脱氢酶;对映选择性降解
中图分类号:Q814    文献标志码:A    文章编号:1672-3678(2009)04-0065-07
Preparationof(R)()mandelicacidanditsderivativesfrom
racematesbyenantioselectivedegradationwithstrainAlcaligenessp.ECU0401
HEYucai1,2,XUJianhe1
(1.LaboratoryofBiocatalysisandBioprocessing,StateKeyLaboratoryofBioreactorEngineering,
EastChinaUniversityofScienceandTechnology,Shanghai200237,China;
2.QingdaoInstituteofBioenergyandBioprocessTechnology,ChineseAcademyofSciences,Qingdao266071,China)
Abstract:Anenantioselective(S)mandelatedegradingbacterium,Alcaligenessp.ECU0401,was
newlyisolatedfromsoil.Thesupplementofmandelicacid,benzoylformicacidorbenzoicacidtothe
culturemediumasasolecarbonsourceenhancedthedegradationactivityofthebacterialcels.Byfed
batchculture,(R)()mandelicacidwaspreparedina5Lfermenterwith32.8% biotransformation
for99h.(R)Mandelicacidwasrecoveredinanisolatedyieldof32.8% andanenantiomericexces
ses(e.e.)>99.9% fromtotaly304g/Lofracemicmandelicacid.UsingtherestingcelAlcali
genessp.ECU0401asabiocatalyst,(R)()ochloromandelicacid,(S)(+)mchloromandelic
acidand(S)(+)pchloromandelicacidwerepreparedwithhighyieldsandexcelentenantiomericex
cesses(>999% e.e.).
Keywords:Alcaligenessp.;(S)mandelicaciddehydrogenase;enantioselectivedegradation
  (R)(-)扁桃酸是一类重要的手性砌块,大量
用于半合成青霉素、头孢菌素类抗生素、抗肿瘤药
物和抗衰老药物中,还广泛用作光学拆分剂[1-2],每
年的产量达数百吨规模[3]。尽管人们已开发了许
多技术用于合成(R)(-)扁桃酸[4],但由于还原试
剂比较昂贵及物理化学方法在技术上比较困难,而
一些生物化学方法涉及辅酶再生,许多生产(R)
(-)扁桃酸的方法并不经济。另一方面,外消旋扁
桃酸可以采用化学方法以较低的价格大批量合
成[5]。因此,从外消旋扁桃酸中有效地分离(R)
(-)扁桃酸是一条比较经济的途径。利用(S)扁
桃酸脱氢酶不对称降解扁桃酸外消旋混合物,可以
直接回收获得(R)(-)扁桃酸。经典的动力学拆
分法[6]可以得到50%的理论产率,已经报道 Alcali
genesbronchisepticus[7]、Aspergilusniger[8]和 Pseudo
monaspolycolor[9]等微生物菌株含有对映选择性的
(R)或(S)扁桃酸脱氢酶。
近年来,生物催化剂在医药合成中获得广泛的
应用[10-12]。笔者从土壤中筛选分离出1株腈水解
酶产生菌AlcaligenesspECU0401,它可以催化外消
旋扁桃腈的水解合成(R)(-)扁桃酸(>999%
ee)[1],但是产率较低,原因是 Alcaligenessp
ECU0401细胞中还含有(S)扁桃酸脱氢酶。利用
其静息细胞选择性降解外消旋的扁桃酸时,(S)
(-)扁桃酸可以完全降解,而(R)(-)扁桃酸则以
较高的对映体过量值(ee)保留在反应体系中。本
文考察生长细胞和静息细胞对外消旋扁桃酸的选
择性降解特性。在此基础上,考察静息细胞对扁桃
酸氯代衍生物的选择性降解,并以此制备高光学纯
度的邻、间、对 氯代扁桃酸。
1 材料与方法
11 材料
外消旋扁桃酸、邻氯扁桃酸、间氯扁桃酸和对
氯扁桃酸 安徽广德化工有限公司,分析纯;甲醇 上
海试剂一厂,色谱纯;其他试剂为国产分析纯。
12 菌株
AlcaligenesspECU0401,以乙腈为唯一 N源从
土壤中筛选获得[1],现保存于中国普通微生物菌种
保藏中心,编号CGMCCNo2009。
13 培养基
斜面培养基:甘油150g,蛋白胨100g,酵母
膏50g,KH2PO420g,NaCl10g,MgSO402g,
FeSO4·7H2O003g,琼脂150g,自来水1000mL,
pH72;
发酵培养基1:甘油150g,蛋白胨100g,酵母
膏50g,KH2PO420g,NaCl10g,MgSO402g,
FeSO4·7H2O003g,自来水1000mL,pH72;
发酵培养基2:外消旋扁桃酸608g/L,蛋白胨
100g,酵母膏 50g,KH2PO420g,NaCl10g,
MgSO402g,FeSO4·7H2O003g,自来水1000
mL,pH72;
基础培养基:蛋白胨100g,酵母膏50g,KH2PO4
20g,NaCl10g,MgSO402g,FeSO4·7H2O003g,自
来水1000mL,pH72。
14 培养条件
取斜面保存的 AlcaligenesspECU0401菌种,
转接至50mL发酵培养基1中,在30℃、160r/min
的恒温摇床培养15h,取5mL发酵液作为种子液接
种到装液195mL发酵培养基1的1000mL摇瓶中,
在30℃、160r/min的恒温摇床上培养48h。离心
收获细胞(10000r/min,10min,4℃)。
(R)(-)扁桃酸的分批补料制备在5L发酵
罐(上海国强工程公司)中进行。先将 Alcaligenes
spECU0401种子液在装有150mL发酵培养基 1
培养的1000mL摇瓶(30°C和160r/min)预培养
15h,再将该培养液接种到装有3L发酵培养基2的
5L发酵罐中。在发酵罐操作过程中,调整搅拌速
度和空气流速以保持溶氧(DO)在饱和度 30%以
上,温度恒定于30°C,通过流加2mol/LH2SO4或2
mol/LNaOH使 pH保持于 72,另加入体积分数
003%的泡敌防止泡沫产生。
15 静息细胞生物转化
将发酵得到的产碱杆菌AlcaligenesspECU0401
细胞离心(10000r/min、10min、4℃),并利用生理
盐水洗涤3次,然后取20g湿细胞重新悬浮于20
mL磷酸缓冲溶液(pH65,100mmol/L)中,加入外
消旋扁桃酸至终浓度20mmol/L,在30℃、160r/min
的摇床上振荡反应。反应过程中定时取样400μL,立
即加入100μL的2mol/LHCl终止反应,充分振荡混
匀后离心取上清液,经微孔滤膜(045μm)过滤
后,用HPLC分析剩余底物及产物的浓度。
16 分析方法
细胞的生物量利用UV Vis分光光度计(Unico
UV 2100,上海)通过浊度 OD600测定。扁桃酸、苯
甲酰甲酸和苯甲酸的浓度利用HPLC(C18柱,Shim
66 生 物 加 工 过 程   第7卷 
packVP ODS,ShimadzuCo.,Japan)分析测定,流
动相为 10mmol/LKH2PO4CH3OH(体积比 87∶
13),流速为08mL/min,波长为215nm。扁桃酸、
苯甲酰甲酸和苯甲酸的停留时间分别为88、139
和494min。用手性色谱柱(ChiralcelOD H,日本
Daicel公司)测定产物扁桃酸的对映体过量值
(ee,%),流动相组成 V(正己烷)∶V(异丙醇)∶
V(三氟乙酸)=90∶10∶02,流速为08mL/min,检
测波长为228nm。(S)扁桃酸和(R)扁桃酸保留
时间分别为112min和129min。
生物转化中剩余的底物及反应中间体的分子结
构利用ESI MS(MicromassLCTTM)和1HNMR(300
MHZ,Bruker公司)进行确认。
17 (S)(+)扁桃酸降解活性分析
静息细胞中(S)(+)扁桃酸降解活性通过测
定(S)(+)扁桃酸含量的减少速度来分析。取
01g湿静息细胞悬浮于1mL磷酸缓冲溶液(pH
65、100mmol/L)中,加入外消旋扁桃酸至终浓度
20mmol/L,在 30℃、1100r/min的微型摇床
(ThermomixerCompact,Eppendorf,Germany)上振
荡反应 1h,取样 180μL立即与 20μL2mol/L
HCl振荡混合以终止反应,离心除去细胞后,取上
清液用 HPLC分析(S)(+)扁桃酸的含量,所有
的分析做3次平行反应。一个单位(U)的降解酶
活定义为:在30℃、pH65反应体系中,每分钟降
解10μmol/L(S) (+) 扁桃酸所需要的细胞
(酶)量。
2 结果与讨论
21 AlcaligenesspECU0401细胞中扁桃酸脱氢
酶的发现
  在以甘油为 C源培养收获的 Alcaligenessp
ECU0401静息细胞催化水解外消旋扁桃腈制备
(R)(-)扁桃酸时,意外发现反应中有苯甲酸生
成,提示 AlcaligenesspECU0401菌株中可能含有
扁桃酸脱氢酶,导致产物扁桃酸降解(氧化 +脱羧)
而生成苯甲酸。为证实上述猜想,设计如下实验:
将01g(湿质量)细胞重新悬浮于2mL磷酸钾缓
冲液(pH65,100mmol/L)中,外部加入外消旋扁
桃酸至终浓度为20mmol/L,在30℃和160r/min
摇床中反应,同时利用手性色谱柱监测扁桃酸的变
化,如图1所示,在12h反应期间,(S)(+)扁桃酸
被逐渐降解,而(R)(-)扁桃酸的浓度并无明显的
变化。由此可见,以甘油为 C源培养收获的 Alcali
genesspECU0401菌体中含有较高活性的(S)(+)
扁桃酸脱氢酶。下面的研究主要利用 Alcaligenes
spECU0401的扁桃酸对映选择性降解特征,制备
单一对映体扁桃酸及其衍生物。
图1 以手性液相色谱柱(ChiralcelOD H)监测(S)扁桃酸的变化进程
Fig.1 Timecourseof(S)
!
mandelicacidbiodegradationmornitoredbyHPLCusingachiralcolumn
22 培养基C源对扁桃酸脱氢酶活力的影响
AlcaligenesspECU0401能以外消旋扁桃酸、苯
甲酰甲酸或苯甲酸为唯一 C源/能源生长。在基础
培养基中分别加入40g/L的甘油、外消旋扁桃酸、
苯甲酰甲酸和苯甲酸,在摇瓶中培养48h后测定细
胞的OD600,离心(10000r/min,10min)收集细胞
测定扁桃酸的降解酶活性。如图2所示,当以甘油、
外消旋扁桃酸、苯甲酰甲酸和苯甲酸分别作为 C源
(或能源),(S)(+)扁桃酸脱氢酶的活性明显提高
(与空白做对照),以外消旋扁桃酸为 C源时,(R)
(-) 扁桃酸被保留在培养体系中,回收产率达
405%,光学纯度>999%。
23 分批补料发酵法制备(R)(-)扁桃酸
在上述实验中发现 AlcaligenesspECU0401能
以外消旋扁桃酸为唯一 C源生长。为提高细菌转
化扁桃酸的浓度,增强制备的效率,采取分批补加
76 第4期 何玉财等:产碱杆菌ECU0401催化拆分扁桃酸及其衍生物
图2 不同C源对ECU0401生长及扁桃酸
脱氢酶活力的影响
Fig.2 Efectsof(±)MA,benzoylformicacidorben
zoicacidoncelgrowthandproductionof(S)
(+)MAdehydrogenaseinECU0401
底物的方法,在加入底物的同时调节转化液的 pH,
使其维持在一个相对稳定的水平上。
具体的操作过程是,将预培养15h的种子液接
种到3L培养基2中(装于5L发酵罐),接种量为
体积分数6%。定时取样分析发酵液 OD600值和残
留扁桃酸含量,结果如图3所示。由图3可知,利用
ECU0401生长细胞,在培养过程中采用分批补料的
方式进行扁桃酸的降解,(S)(+)扁桃酸可以作为
图3 采用分批补料进行发酵法制备(R)
(-)扁桃酸反应进程曲线。
Fig.3 Timecourseprofilesforthepreparationof(R)
MAwithsequentialadditionofracemicsub
strate[(±)MA]duringthecultivationofAl
caligenesspECU0401
C源和能源而被降解,而(R)(-)扁桃酸则大部分
保留在发酵液中。分批补料培养至99h时,累积加
入的外消旋扁桃酸质量浓度为304g/L,在整个过
程中由于维持 pH72,细胞保持了旺盛的酶活力,
(S)(+)扁桃酸被完全降解,(R)(-)扁桃酸的
回收产率为328%,光学纯度 >999%,而且在培
养后期,细胞的活性仍然比较高,细胞量也比较高,
这说明还可以继续补加扁桃酸,得到更高浓度的
(R)扁桃酸,使制备效能进一步提高。
24 pH和温度对静息细胞(S)扁桃酸降解活性
的影响
  pH对AlcaligenesspECU0401静息细胞扁桃酸
脱氢酶的活性是有影响的。本文选择了柠檬酸钠
柠檬酸(pH30~60,100mmol/L)和 K2HPO4-
KH2PO4(pH60~80,100mmol/L)2种缓冲溶液
体系,01g(湿质量)细胞悬浮于 2mL缓冲溶液
中,外消旋扁桃酸的浓度为20mmol/L,在 30℃和
160r/min摇床上反应1h后,加入01mL2mol/L
HCl终止反应,取样分析。实验结果如图 4所示。
从图4可以看出,细胞内的酶在 pH30~65时,酶
活随着pH增大而逐渐增大,当pH为65时酶活达
到最大值,继续增加pH则酶活开始下降,可见反应
的最适pH为65。
图4 反应pH对静息细胞脱氢酶活性的影响
Fig.4 EfectofpHonthe(S)(+)MA
degradingactivity
  考察温度对 AlcaligenesspECU0401静息细胞
扁桃酸脱氢酶活性的影响。将01g(湿质量)细胞
重新悬浮于 2mL磷酸钾缓冲液(pH65,100
mmol/L)中,外消旋扁桃酸的浓度为20mmol/L,在
30℃、160r/min摇床条件下反应1h后,加入01
mL2mol/LHCl终止反应,取样分析。实验结果如
图5所示。从图5可以发现,在20~30℃的条件
下,随着温度上升,酶活逐渐增大,当温度为30℃时
酶活达到最大值,继续升高反应温度时酶活开始下
降,可能由于温度较高导致热失活。由此可见,生
物转化的最适温度为30℃。在下面的研究中分别
采用pH65、反应温度30℃进行反应。
25 扁桃酸对映选择性生物降解的可能途径
利用AlcaligenesspECU0401静息细胞考察了外
消旋扁桃酸[(±) MA]对映选择性降解的过程,底物
86 生 物 加 工 过 程   第7卷 
图5 反应温度对静息细胞脱氢酶活性的影响
Fig.5 Efectofreactiontemperatureonthe(S)(+)
MAdegradingactivity
和中间产物的浓度变化如图6所示。由图6可知:反
应12h后,(S)-(+)扁桃酸被彻底氧化生成苯甲酰
甲酸和苯甲酸。而(R)(-)扁桃酸在16h内只有少
量的降解,残留扁桃酸的浓度为86mmol/L(产率
430%;ee>999%)。从反应混合物中分离所得
的2个关键中间体(苯甲酰甲酸和苯甲酸)的分子结
构经过 MS ESI和1H NMR确认无误(数据未列
出)。反应过程中另一个可能的中间体———苯甲醛
没有被检测到,HPLC只检测到扁桃酸、苯甲酰甲酸和
苯甲酸这3种物质(数据未列出),苯甲酰甲酸和苯甲
酸达到最大浓度的时间分别为10h和18h。
图6 利用AlcaligenesspECU0401静息细胞对映选择
性降解(±)扁桃酸
Fig.6 Profileofenantioselectivedegradationof(±)
MAbyrestingcelsofAlcaligenesspECU0401
在反应过程中,苯甲酰甲酸大部分被氧化生成苯
甲酸,推测可能的降解途径如图7所示,(S)(+)扁
桃酸首先在脱氢酶的作用下生成苯甲酰甲酸,苯
甲酰甲酸在脱羧酶的作用下进一步降解生成苯
甲酸。
图7 Alcaligenessp.ECU0401降解扁桃酸的可能途径
Fig.7 ApresumedpathwayofmandelatedegradationbyAlcaligenesspECU0401
26 利用静息细胞制备光学纯扁桃酸及其衍生物
称取湿质量10g的AlcaligenesspECU0401静
息细胞,以表1中的外消旋扁桃酸及其衍生物为底
物,浓度分别为10、25和50mmol/L,反应体积100
mL,在 30℃、160r/min的恒温摇床上反应24~
48h,取样分析,残留底物的绝对构型根据文献
[13]所述方法确定。这4种外消旋的扁桃酸及其
衍生物经过静息细胞生物转化后生成了光学活性
的(R)(-)扁桃酸及其衍生物(R)(-)邻氯扁桃
酸、(S)(+)间氯扁桃酸和(S)(+)对氯扁桃酸,e.e.
值均>999%。AlcaligenesspECU0401静息细胞不
对称降解扁桃酸及其衍生物(1~4),可获得不同立体
构型的光学活性α 羟基酸,具体的原因尚不清楚,可
能的原因是苯环上Cl原子的取代位置不同导致了扁
桃酸脱氢酶降解对映体的选择性改变,因而所得的氯
代扁桃酸产物的立体构型也不尽一致。
96 第4期 何玉财等:产碱杆菌ECU0401催化拆分扁桃酸及其衍生物
表1 利用AlcaligenesspECU0401静息细胞不对称降解扁桃酸及其衍生物(1~4)制备光学活性的α 羟基酸(5~8)
Table1 Asymmetricdegradationofracemicmandelicacidandsubstitutedderivativesthereof(1~4)with
restingcelsofAlcaligenessp.ECU0401,yieldingopticalyactiveαhydroxyacids(5~8)
底物 c/(mmol·L-1) t/h 产率/% 构型 ee/% E
(±)-1
10 24 303 R >999
25 48 359 R >999
50 48 488 R 657
157
(±)-2
10 24 464 R >999
25 48 203 R >999
50 48 549 R 333
32
(±)-3
10 24 217 S >999
25 48 276 S >999
50 48 802 - 0
43
(±)-4
10 24 193 S >999
25 48 192 S >999
50 48 903 - 0
38
       E为对映体选择率(Enantiomericratio)[14]
3 结 论
笔者筛选得到的 AlcaligenesspECU0401不仅
具有腈水解酶的活性,而且利用甘油、扁桃酸、苯甲
酰甲酸、苯甲酸作为C源培养得到的细胞还含有扁
桃酸脱氢酶。利用静息细胞作为催化剂不对称降
解外消旋扁桃酸及其氯取代的衍生物,可制备光学
活性(R)(-)扁桃酸及其衍生物(R)(-)邻氯扁
桃酸、(S)(+)间氯扁桃酸和(S)(+)对氯扁桃
酸,光学纯度均十分理想(>999% e.e.)。与文献
[6~8]报道的扁桃酸脱氢酶产生菌的催化性能相
比,AlcaligenesspECU0401扁桃酸脱氢酶不仅对外
消旋扁桃酸的活性、底物耐受性和对映选择性与文
献报道的相当,并且利用 AlcaligenesspECU0401
静息细胞不对称降解扁桃酸衍生物(2~4)可获得
不同立体构型的手性 α 羟基酸。以外消旋扁桃酸
为C源,利用分批补料技术培养反应99h,累计扁
桃酸质量浓度为304g/L,(S)(+)扁桃酸完全被
降解,(R) (-) 扁桃酸的回收产率为 328%,
e.e.值>999% e.e.。
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JCat,1999,2(6):
櫒櫒櫒櫒櫒櫒櫒櫒櫒櫒櫒櫒櫒櫒櫒櫒櫒櫒櫒櫒櫒櫒櫒櫒櫒櫒櫒櫒櫒櫒櫒櫒櫒櫒櫒櫒櫒櫒櫒櫒櫒櫒櫒櫒櫒櫒
667670.
国外动态
科学家完成牛基因组测序
一个国际科学家团队2009年4月23日说,他们已完成了牛的基因组测序工作,这一成果将有助于生产
质量更好的牛肉和牛奶。
在美国农业研究局和贝勒医学院的领导下,来自25个国家的300多位科学家以海福特牛为样品牛,历
经6年完成了基因组测序工作。24日出版的新一期美国《科学》杂志刊登相关论文介绍这项成果。研究人
员发现,牛至少有22万个基因,其中80%与人类共享。牛在遗传上与人类的相似性远远超过老鼠。这也
意味着,牛可以替代实验鼠作为研究人类疾病的动物模型。研究人员还认为,通过将人类基因组与牛等动
物的基因组进行比较,可以更好地理解人类疾病的基因基础。
同一期《科学》杂志还刊登了另一个研究小组的研究论文,这篇论文比较了海福特牛与6种其他牛的
DNA差别,并对19种地理及生物学上完全不同的497头牛进行了研究。他们希望牛基因组测序工作的完
成能够有助于培育出肉质更好或产奶量更多的新品种牛。
美国农业部长汤姆·维尔萨克说:“这一成果对产值达490亿美元的美国养牛业非常重要。了解牛基
因组并完成对其测序将有助于认识牛类疾病的遗传基础,从而可以帮助减少养牛业对抗生素的依赖,并生
产出质量更好的牛肉和牛奶。”
(朱宏阳)
17 第4期 何玉财等:产碱杆菌ECU0401催化拆分扁桃酸及其衍生物