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The Variation of DNA Cytosine Methylation in Wheat Genome Induced by 60Co-γ Rays

60Co-γ射线诱导的小麦基因组DNA的甲基化变异


诱发突变技术在小麦品种改良中具有重要作用,辐射诱变能通过改变DNA甲基化的方式而影响基因组稳定性。本研究分别采用100和150Gy 60Co-γ射线处理小麦品种京411(J411)干种子,利用甲基化敏感扩增多态性技术检测处理后幼根和幼叶基因组甲基化相对水平的变化及甲基化模式的变异规律。结果表明,γ 射线处理对幼苗的苗高和根长都有显著抑制作用。与未处理对照比较,处理后小麦幼苗叶片和根部DNA胞嘧啶甲基化相对水平均发生变化,叶片的甲基化相对水平下降, 而根中升高。2种处理剂量下,叶片和根的甲基化模式变异均表现为CG位点变化率高于CNG位点变化率。不同位点的甲基化模式变异在诱变后也存在一定的差异。叶片中不同剂量下CG位点和CNG位点的去甲基化率都高于相应位点的甲基化率;根部CNG位点在所有剂量下的去甲基化率都低于相应位点的甲基化率,而CG位点在100Gy剂量下去甲基化率高于相应位点的甲基化率,而在150Gy剂量下的去甲基化率则低于相应位点的甲基化率,反映出同一组织同一位点在不同诱变剂量处理下甲基化模式变异存在一定的差异。


全 文 :  核 农 学 报  2015,29(1):0001 ~ 0009
Journal of Nuclear Agricultural Sciences
收稿日期:2014⁃03⁃12  接受日期:2014⁃05⁃01
基金项目:国家 863 计划(2012AAl01202),农业部公益性行业项目(201103007),国际原子能机构项目(RAS5056)
作者简介:杨震,男,副研究员,主要从事小麦诱发突变与生物技术育种研究。 Email:yz473@ 163. com
通讯作者:刘录祥,男,研究员,主要从事作物诱发突变与生物技术育种研究。 E⁃mail:liuluxiang@ caas. cn
文章编号:1000⁃8551(2015)01⁃0001⁃09
60 Co⁃γ 射线诱导的小麦基因组 DNA的甲基化变异
杨  震1,2,3   郭会君2   赵林姝2   古佳玉2   谢永盾2   刘录祥2
( 1湖南农业大学, 湖南 长沙  410125;2中国农业科学院作物科学研究所 /国家农作物基因资源与
基因改良重大科学工程 /国家农作物航天诱变技术改良中心,北京  100081;3湖南省农业科学院
核农学与航天育种研究所,湖南 长沙  410125)
摘  要:诱发突变技术在小麦品种改良中具有重要作用,辐射诱变能通过改变 DNA甲基化的方式而影响
基因组稳定性。 本研究分别采用 100 和 150Gy60Co⁃γ射线处理小麦品种京 411(J411)干种子,利用甲基
化敏感扩增多态性技术检测处理后幼根和幼叶基因组甲基化相对水平的变化及甲基化模式的变异规
律。 结果表明,γ 射线处理对幼苗的苗高和根长都有显著抑制作用。 与未处理对照比较,处理后小麦幼
苗叶片和根部 DNA胞嘧啶甲基化相对水平均发生变化,叶片的甲基化相对水平下降, 而根中升高。 2
种处理剂量下,叶片和根的甲基化模式变异均表现为 CG位点变化率高于 CNG 位点变化率。 不同位点
的甲基化模式变异在诱变后也存在一定的差异。 叶片中不同剂量下 CG 位点和 CNG 位点的去甲基化
率都高于相应位点的甲基化率;根部 CNG 位点在所有剂量下的去甲基化率都低于相应位点的甲基化
率,而 CG位点在 100Gy剂量下去甲基化率高于相应位点的甲基化率,而在 150Gy剂量下的去甲基化率
则低于相应位点的甲基化率,反映出同一组织同一位点在不同诱变剂量处理下甲基化模式变异存在一
定的差异。
关键词:小麦;60Co⁃γ射线; 甲基化敏感扩增多态性; 变异
DOI:10􀆰 11869 / j. issn. 100⁃8551􀆰 2015􀆰 01. 0001
    小麦(Triticum aestivumlinn L. )是重要的粮食作
物,小麦的稳定增产对国民经济的发展具有重要的战
略意义。 然而近年来随着全球性气候的变化,尤其是
诸如极端性冷热、干旱、沙化等气候变化对小麦的丰产
带来严重的影响,迫切需要新的小麦种质资源的利用
来应对这种气候改变。 实践证明,利用人工诱发遗传
变异是丰富小麦种质资源,选育新品种的重要手段之
一[1]。 诱发突变技术应用于农作物新材料创制和优
良新品种培育,在解决世界粮食安全与营养供给中发
挥了显著作用[2]。60Co⁃γ 射线辐照作为一种传统的物
理诱变方式在改良植物单一性状(如早熟、矮秆、产量
等)方面具有显著效果,因此被育种学家广泛利用。
虽然关于植物在辐射诱变后的表型特征、生理生化变
化等方面国内外已经做了大量研究报道[3 - 6],但诱变
的分子机理尚不明确。
DNA 甲基化是最早发现的基因表观修饰方式之
一,能抑制或减弱某些基因的活性,去甲基化则能诱导
基因的重新活化和表达。 同一个体在不同的生理条件
下,DNA甲基化特征都会不一致[7]。 DNA 甲基化作为
一种重要的表观遗传标记,在维持高等植物体基因组稳
定和调控基因表达方面有重要作用[8 - 9]。 在外界环境
胁迫下,DNA甲基化利用甲基转移酶或 RNA介导机制
能快速和可逆的修饰植物基因组 DNA,提高基因组
DNA适应复杂环境的能力,从而避免外界环境胁迫对
植物体产生的影响[10 - 12]。 研究表明在诱变与非诱变胁
迫条件下植物体能通过适当调节基因组的 DNA 甲基
化,形成新的表观等位基因来应对特定环境[13 - 14]。
甲基化敏感扩增多态性 ( methylation sensitive
amplification polymorphism,MSAP)是改良的 AFLP 技
术,采用对基因组甲基化敏感性不同的 2 种限制性内

核  农  学  报 29 卷
切酶 Hpa Ⅱ和 Msp I对 5′⁃CCGG位点甲基化进行特异
性切割。 Hpa Ⅱ和Msp I都能识别并切割 CCGG序列,
但对该位点胞嘧啶甲基化的敏感性不同,可产生不同
的 DNA切割片段来揭示甲基化位点。 因此,能够很好
地反映基因组 DNA 5′⁃CCGG 位点胞嘧啶的甲基化状
态和程度。 现在,MSAP 技术被广泛应用于水稻、高
粱、棉花等基因组的胞嘧啶甲基化评定[15 - 17],已成为
检测基因组甲基化水平和模式的重要方法之一。 本研
究利用 MSAP标记检测60Co⁃γ射线诱导的小麦基因组
DNA甲基化变异,分析小麦在应答辐射诱变胁迫时
DNA甲基化变异可能存在的规律。
1  材料与方法
1􀆰 1  试验材料
中国农业科学院作物科学研究所航天诱变技术改
良中心繁殖保存的小麦品种京 411(‘ J411’)风干种
子。
1􀆰 260Co⁃γ 诱变处理   风干的小麦种子被平均分为 3
份,1 份留作对照,其余 2 份分别用来进行60Co⁃γ 射线
辐照处理。 辐照所用剂量率约为11􀆰 56Gy·min - 1,照射
剂量分别为 100Gy和 150Gy。
1􀆰 3  小麦幼苗培养
小麦种子用 75%的酒精消毒后用无菌水浸泡
9h,当种子呈露白状态时,将其转移至有无菌水的
培养发芽架上,保持一致的温度、光照时间、湿度和
光强。
1􀆰 4  MSAP分析
1􀆰 4􀆰 1  DNA的提取  采用中国农业科学院作物科学
研究所航天诱变技术改良中心改良的 PVP40 法提取
小麦基因组 DNA。
1􀆰 4􀆰 2  MSAP检测  250 ng基因组 DNA样品在 37℃
酶切 12h,各限制性酶切包含 3U EcoRI(New England)
和 3 U HpaⅡ或 MspⅠ(New England),终体系为
25μL。 16℃连接过夜,连接体系包含 5 pmol·L - 1
EcoRI 接头(表 2),50 pmol·L - 1 HpaⅡ/MspⅠadaptor
接头(表 2),0􀆰 5 mmol·L - 1 ATP 和 1 U T4 DNA 连接
酶(TaKaRa),终体系为 20μL。
预扩增体系:总体积 10μL,其中包含连接产物
1μL,EcoR I预扩引物(10μM) 0􀆰 3μL,Hpa II /Msp I 预
扩引物(10μM) 0􀆰 3μL,dNTPs (10μM) 0􀆰 2μL,10 ×
PCR Buffer 1􀆰 5μL,rTaq DNA polymerse 0􀆰 1μL,补水至
终体积 10μL。
选扩增体系:总体积 20μL,其中包含预扩增产物
(稀释 20 倍 ~ 30 倍) 8μL,EcoR I 选扩引物(10μM)
0􀆰 8μL,Hpa II /Msp I 选扩引物(10μM) 0􀆰 8μL,dNTPs
(10μM) 0􀆰 4μL, 10 × PCR Buffer 6μL, rTaq DNA
polymerse 0􀆰 2μL,补水至终体积 20μL。
PCR程序:预扩增,94℃预变性 2min,20 个循环:
94℃变性 30s,56℃退火 1min,72℃延伸 1min。 72℃延
伸 7min,4℃保存。
选扩增,94℃预变性 2min,14 个循环:94℃变性
30s,60℃(每循环 - 0􀆰 7℃)退火 30 s,72℃延伸 1min。
24 个循环:94℃变性 30s,56℃退火 30 s,72℃延伸
1min。 72℃延伸 7min,4℃保存。
1􀆰 4􀆰 3  条带记录与多态性差异分类  将 HpaⅡ和Msp
Ⅰ酶切产物的扩增条带分为 4 种类型(表 2)。
1􀆰 4􀆰 4  多态性差异分类  与对照比较,根据诱变前后
条带的差异(图 2),将其主要分类:A 类型为单态性:
诱变处理前后甲基化状态未发生改变,A1 为未发生甲
基化,A2、A3 均为全甲基化,A2 为双链内侧甲基化,
A3 为双链内外侧甲基化,A4 为半甲基化;B、C、D类型
为多态性:B 类型为甲基化条带增加状态,其中 B1、
B2、B3 为重新甲基化状态,B4、B5 为超甲基化状态;C
类型与 B类型相反,为去甲基化状态,其中 C1、C2、C3
为完全去甲基化状态,C4 为部分去甲基化状态,D 类
型为不确定类型。
1􀆰 4􀆰 5  生物损伤计算  在第 7 天随机取 30 个单株进
行幼苗根长和苗高的测量。
生物损伤(刺激) = (处理 -对照) /对照 × 100%
正值为生理损伤,表示株高或根长受到抑制,值越
大抑制越强。
2  结果与分析
2􀆰 1  60Co⁃γ射线诱变对当代小麦幼苗生长的影响
由图 1 可知,与对照(CK)相比,采用 100、150Gy
诱变剂量的60Co⁃γ 射线处理对其小麦品种 J411 苗高
和根长都有抑制作用。 经 t测验(表 3),在 100、150Gy
剂量60Co⁃γ 射线诱变处理下,J411 的苗高和根长均出
现一定的生理损伤,并且 2 个诱变剂量下对苗高的抑
制作用而产生的这种生理损伤效果达显著差异水平,
150Gy 剂量下对根长的抑制作用达显著差异水平。
150Gy诱变剂量对苗高与根长造成的生物损伤率均高
于 100Gy的。
2􀆰 2  60Co⁃γ射线辐射诱导小麦叶片和根基因组甲基
化水平的改变
为了检测60Co⁃γ 射线辐射诱变过程中引起的小麦

  1 期 60Co⁃γ 射线诱导的小麦基因组 DNA的甲基化变异
        表 1  MSAP检测所使用的接头和引物序列
Table 1  Sequences of MSAP adaptors and primers
名称
Name
引物
Primers
引物序列
Primers sequence
接头 EcoR I接头⁃F 5′⁃CTCGTAGACTGCGTACC ⁃3′
Adaptors EcoR I接头⁃R 5′⁃AATTGGTACGCAGTC⁃3′
HpaⅡ/MspⅠ接头⁃F 5′⁃GATCATGAGTCCTGCT⁃3′
HpaⅡ/MspⅠ接头⁃R 5′⁃CGAGCAGGACTCATGA⁃3′
预扩增引物 EcoR I⁃A 5′⁃GACTGCGTACCAATTCA⁃3′
Pre⁃amplification primers HpaⅡ/MspⅠ⁃T 5′⁃ATCATGAGTCCTGCTCGGT ⁃3′
选扩增引物 EcoR I ⁃AAC + HpaⅡ/MspⅠ⁃TAG EcoR I ⁃AAG + HpaⅡ/MspⅠ⁃TAG
Selective amplification primer combinations EcoR I ⁃AAC + Hpa Ⅱ / MspⅠ⁃TCG EcoR I ⁃AAG + HpaⅡ/MspⅠ⁃TAC
EcoR I ⁃AAC + HpaⅡ/MspⅠ⁃TTC EcoR I ⁃AAG + HpaⅡ/MspⅠ⁃TTC
EcoR I ⁃AAC + HpaⅡ/MspⅠ⁃TTA EcoR I ⁃ACA + HpaⅡ/MspⅠ⁃TAC
EcoR I ⁃AAG + HpaⅡ/MspⅠ⁃TTA EcoR I ⁃ACA + HpaⅡ/MspⅠ⁃TAG
EcoR I ⁃AAG + HpaⅡ/MspⅠ⁃TCG EcoR I ⁃ACA + HpaⅡ/MspⅠ⁃TCG
EcoR I ⁃ACA + HpaⅡ/MspⅠ⁃TTC EcoR I ⁃ACG + HpaⅡ/MspⅠ⁃TAC
EcoR I ⁃ACA + HpaⅡ/MspⅠ⁃TTA EcoR I ⁃ACG + HpaⅡ/MspⅠ⁃TAG
EcoR I ⁃ACG + HpaⅡ/MspⅠ⁃TCG EcoR I ⁃AAC + HpaⅡ/MspⅠ⁃TAC
EcoR I ⁃AAG + HpaⅡ/MspⅠ⁃TAA
表 2  HpaⅡ和 MspⅠ酶切小麦基因组 DNA
Table 2  Methylation patterns of HpaⅡand MspⅠdigested genomic DNA of wheat
类型
Type
甲基化状态
Methylation status
酶切识别位点
Sensitivity of enzymes
条带记录方式
Amplified bands patterns obtained
Hpa Ⅱ Msp Ⅰ EcoR Ⅰ/ Hpa Ⅱ EcoR Ⅰ/Msp Ⅰ
Ⅰ CCGG
GGCC
有活性 有活性 1 1
Ⅱ CCGG
GGCC
有活性 无活性 1 0
Ⅲ CCGG
GGCC
无活性 有活性 0 1
Ⅳ CCGG
GGCC
无活性 无活性 0 0
    注:1,表示有条带;0,表示无条带;C,表示胞嘧啶甲基化位点。
Note: 1, band present; 0,band absent; C, the site is methylated.
基因组甲基化水平的变化,利用 19 对引物组合对对照
和诱变处理的小麦幼苗叶片和根基因组 DNA 进行
MSAP分析(图 2)。 表 4 结果表明,2 种不同诱变剂量
处理能引起小麦幼苗叶片和根中全基因组 DNA 胞嘧
啶甲基化水平的变化,叶片胞嘧啶甲基化比率 100
(48􀆰 27% )、150Gy(47􀆰 6% )低于对照(50􀆰 39% ),但在
根部胞嘧啶甲基 化 比 率 100 ( 52􀆰 78% )、 150Gy
(52􀆰 6% )高于对照(49􀆰 77% )。 在诱变的叶片和根

核  农  学  报 29 卷
        表 3  不同剂量60Co⁃γ诱变对小麦品种 J411 苗高和根长的影响
Table 3  Damage rate of seedling height and root length irradiated by gamma ray of wheat variety J411
剂量
Dose / Gy
苗高 Seedling height / cm 根长 Root length / cm
平均值
Average
生物损伤 /刺激率
Stimulate rate / %
t值
t value
平均值
Average
生物损伤 /刺激率
Stimulate rate / %
t值
t value
0 16􀆰 75 ± 0􀆰 62 15􀆰 43 ± 0􀆰 92
100 12􀆰 55 ± 0􀆰 60 25􀆰 07 16􀆰 91∗∗ 13􀆰 30 ± 0􀆰 86 13􀆰 8 2􀆰 45
150 9􀆰 30 ± 1􀆰 06 44􀆰 48 13􀆰 09∗∗ 10􀆰 00 ± 1􀆰 00 35􀆰 19 6􀆰 91∗∗
    注:平均值用平均数 ± S. D表示,∗∗表示 P < 0􀆰 01 水平差异。
Note:Values are means ± S. D. of five replicates ( independent plant individuals) . ∗∗mean significant differences at 0􀆰 01 level.
表 4  不同剂量60Co⁃γ诱变对小麦品种 J411 幼苗叶片和根部基因组 DNA甲基化水平的影响
Table 4  DNA methylation relative levels of leaf and root in wheat seedlings induced by different dose of gamma ray treatment
MSAP扩增带谱类型
MSAP band types
甲基化状态
Methylation status
叶片 Leaf 根部 Root
CK 100Gy 150Gy CK 100Gy 150Gy
Ⅰ H M (1 1) CCGG
GGCC
507 546 537 438 424 419
Ⅱ H M (1 0) CCGG
GGCC
66 99 143 107 178 191
Ⅲ H M (0 1) CCGG
GGCC
160 226 186 172 141 125
Ⅳ H M (0 0) CCGG
GGCC
289 171 172 155 155 149
总扩增条带数
Total amplified bands
1022 1042 1038 872 898 884
总甲基化条带总数
Total methylated bands
515 496 501 434 474 511
甲基化条带比率
MSAP / %
50􀆰 39 47􀆰 6 48􀆰 27 49􀆰 77 52􀆰 78 52􀆰 6
全甲基化条带数
Full methylated bands
449 397 358 327 296 274
全甲基化比率
Full methylated loci ratio / %
43􀆰 93 38􀆰 1 34􀆰 49 37􀆰 5 32􀆰 96 31
    注:总甲基化条带数 =Ⅱ +Ⅲ +Ⅳ;全甲基化条带数 =Ⅲ +Ⅳ,表示双链 DNA发生甲基化。
Note:Total methylated bands = Ⅱ +Ⅲ +Ⅳ; Full methylated bands = Ⅲ +Ⅳ, means methylation of double strand DNA.
中,100Gy与 150Gy相比,总的甲基化相对水平基本相
当。 在对照与各个诱变处理中,叶片和根组织的全甲
基化率均高于半甲基化率。 此外,在 2 个诱变剂量下
的叶片和根部组织中 DNA 胞嘧啶全甲基化率与对照
相比均有所下降。
2􀆰 3  60Co⁃γ射线辐射诱导小麦叶片和根基因组胞嘧
啶甲基化状态的变化
由表 5 可知,不同诱变剂量处理下,都有 50%以
上的甲基化状态在处理前后未发生变化,通过 2 种剂
量诱变处理后与对照比较,小麦 J411 在应答诱变胁迫
时的甲基化变化类型叶片中,100、150Gy 诱变剂量处
理下 B类型即甲基化增加类型(8􀆰 8% 、14􀆰 43% )均低
于 C类型即去甲基化类型(18􀆰 96% 、22􀆰 25% ),而根
部中,100、150Gy 诱变剂量处理下 B 类型(21􀆰 95% 、
24􀆰 86% )均高于 C类型(12􀆰 97% 、10􀆰 08% )。

  1 期 60Co⁃γ 射线诱导的小麦基因组 DNA的甲基化变异
表 5  不同60Co⁃γ诱变剂量处理下小麦幼苗叶片和根部基因组 DNA甲基化状态变化情况
Table 5  The changes of DNA methylation status of leaf and root in wheat seedlings induced by
different dose of gamma ray treatment
分类
Classify
酶切
Enzyme digestion
甲基化状态
Methylation status
差异位点数量(比率)
No. of polymorphic bands (rate)
叶片 Leaves 根 Roots
对照
control H M
诱变
treatment H M
对照
control
诱变处理
treatment CK⁃100 CK⁃150 CK⁃100 CK⁃150
A 21(66􀆰 27% ) 15(51􀆰 68% ) 12(57􀆰 31% ) 16(54􀆰 76% )
A1 1  1 1  1 CCGG
GGCC
CCGG
GGCC
438(42􀆰 82% ) 393(36􀆰 59% ) 339(37􀆰 58% ) 285(31􀆰 91% )
A2 0  1 0  1 CCGG
GGCC
CCGG
GGCC
75(7􀆰 33% ) 46(4􀆰 28% ) 58(6􀆰 43% ) 71(7􀆰 95% )
A3 0  0 0  0 CCGG
GGCC
CCGG
GGCC
139(13􀆰 59% ) 104(9􀆰 68% ) 70(7􀆰 76% ) 98(10􀆰 97% )
A4 1  0 1  0 CCGG
GGCC
CCGG
GGCC
26(2􀆰 54% ) 12(1􀆰 12% ) 50(5􀆰 54% ) 35(3􀆰 92% )
B 90(8􀆰 80% ) 15(14􀆰 43% ) 19(21􀆰 95% ) 22(24􀆰 86% )
B1 1  1 1  0 CCGG
GGCC
CCGG
GGCC
17(1􀆰 66% ) 21(1􀆰 96% ) 66(7􀆰 32% ) 36(4􀆰 03% )
B2 1  1 0  1 CCGG
GGCC
CCGG
GGCC
46(4􀆰 5% ) 70(6􀆰 52% ) 44(4􀆰 88% ) 63(7􀆰 05% )
B3 1  1 0  0 CCGG
GGCC
CCGG
GGCC
6(0􀆰 59% ) 23(2􀆰 14% ) 15(1􀆰 66% ) 36(4􀆰 03% )
B4 0  1 0  0 CCGG
GGCC
CCGG
GGCC
12(1􀆰 17% ) 28(2􀆰 61% ) 41(4􀆰 55% ) 39(4􀆰 37% )
B5 1  0 0  0 CCGG
GGCC
CCGG
GGCC
9(0􀆰 88% ) 13(1􀆰 21% ) 30(3􀆰 33% ) 48(5􀆰 38% )
C 194(18􀆰 96% ) 239(22􀆰 25% ) 117(12􀆰 97% ) 90(10􀆰 08% )
C1 1  0 1  1 CCGG
GGCC
CCGG
GGCC
21(2􀆰 05% ) 23(2􀆰 14% ) 19(2􀆰 11% ) 9(1􀆰 01% )
C2 0  0 1  1 CCGG
GGCC
CCGG
GGCC
21(2􀆰 05% ) 103(9􀆰 59% ) 14(1􀆰 55% ) 16(1􀆰 79% )
C3 0  1 1  1 CCGG
GGCC
CCGG
GGCC
61(5􀆰 96% ) 66(6􀆰 15% ) 53(5􀆰 88% ) 53(5􀆰 94% )
C4 0  0 0  1 CCGG
GGCC
CCGG
GGCC
91(8􀆰 9% ) 47(4􀆰 38% ) 31(3􀆰 44% ) 12(1􀆰 34% )
D 87(5􀆰 96% ) 137(11􀆰 64% ) 122(7􀆰 99% ) 127(10􀆰 30% )
D1 1  0 0  1 CCGG
GGCC
CCGG
GGCC
10(0􀆰 98% ) 19(1􀆰 77% ) 9(1% ) 14(1􀆰 57% )
D2 0  1 1  0 CCGG
GGCC
CCGG
GGCC
12(1􀆰 17% ) 20(1􀆰 86% ) 22(2􀆰 44% ) 44(4􀆰 93% )
D3 0  0 1  0 CCGG
GGCC
CCGG
GGCC
39(3􀆰 81% ) 86(8􀆰 01% ) 41(4􀆰 55% ) 34(3􀆰 81% )
2􀆰 4  60Co⁃γ诱变处理小麦不同位点 DNA 甲基化模
式的变异
CCGG 位点中内侧胞嘧啶甲基化的位点称为 CG
位点(CCGG);外侧胞嘧啶的甲基化位点称为 CNG 位
点(CCGG);内外侧同时甲基化的位点既是 CG位点也
是 CNG 位点。 如表 6 所示,在叶片中,100Gy 剂量处
理下叶片中不同位点总甲基化率和总去甲基化率分别
为 8􀆰 21% 、20􀆰 73% ,150Gy 剂量下叶片中不同位点总

核  农  学  报 29 卷
图 1  小麦品种 J411 不同诱变剂量处理的效果
Fig,1  Seedlings of J411 induced by different
doses of gamma ray
注:箭头指示诱变前后扩增条带的变化;虚线框内显示 DNA甲基化
    的组织特异性。
Note: Arrow indicate polymorphic bands induced by gamma ray
treatment. The tissue⁃specific of DNA methylation is displayed in the
dotted line box. ‘H’ enzyme HpaⅡ lane. ‘M’ enzyme MspⅠ lane.
图 2  诱变处理 M1 代幼苗叶和根基因组 MSAP 检测(引
    物 EcoR I ⁃ACA + HpaⅡ/MspⅠ⁃TCG)
Fig. 2   The MSAP in wheat leaf and root induced by
gamma ray irradiation in M1 generation (primer:EcoR I ⁃
    ACA + HpaⅡ/MspⅠ⁃TCG)
甲基化率和总去甲基率化分别为 12􀆰 29% 、20􀆰 67% ,
不同剂量下总的去甲基化率高于甲基化率。 在根部,
100Gy剂量下不同位点的总甲基化率和总去甲基化分
别为 20􀆰 06% 、15􀆰 96% ,150Gy剂量下不同位点的总甲
基化率和总去甲基化分别为 20􀆰 83% 、12􀆰 09% ,与叶
片中甲基化模式变异率正好相反,2 者剂量下均表现
为总甲基化率高于总去甲基化率。 在根部与叶片中每
个位点的甲基化模式变异也存在差异,叶片中每个剂
量下 CG位点和 CNG 位点的去甲基化率都高于相应
位点的甲基化率,而根部在 100Gy 下 CG 位点的甲基
化模式变异率与叶片中表现一致,150Gy 剂量下 CG
位点的甲基化变异率高于去甲基化变异率,在 CNG位
点甲基化模式的变异率则与叶片相反,即 2 者剂量下
CNG位点的甲基化率均高于去甲基化率。
3  讨论
DNA 甲基化是抑制基因表达的一种有效手段,一
般甲基化主要发生在基因的启动子区域和编码区,在
转录水平抑制基因的表达,从而引起基因沉默,而去甲
基化则促进基因的表达。 DNA 甲基化水平的改变在
植物生长发育过程中对于调控重要功能基因表达、基
因组防御以及细胞发育与分化等方面具有重要作
用[19]。 分析小麦基因组甲基化水平的变异有助于研
究功能基因的表达调控以及小麦在受到诱变胁迫时适
应逆境的分子机理。
干旱胁迫会引起水稻 DNA 甲基化水平及状态发
生改变,而且这种改变具有一定品种特异性和时空特
异性[17]。 盐、碱胁迫对棉花幼苗叶片和根基因组
DNA甲基化相对水平的影响具有组织特异性[20]。 小
麦种子 J411 经不同诱变剂量处理,诱变处理后的 M1
幼苗叶片基因组 DNA甲基化的相对水平均低于对照,
而根部基因组 DNA 甲基化相对水平则在诱变处理后
高于对照。 幼苗叶片基因组甲基化模式的变异主要以
去甲化状态为主,而根部则主要以重新或超甲基化状
态变化为主,说明诱变处理后小麦不同组织基因组以
不同的 DNA甲基化变化状态来应答诱变胁迫。
有研究已经发现离子辐照、EMS、空间诱变能引起
动植物(人体外培养的人角质形成细胞[21]、水稻[22]、
拟南芥[23] 等)胞嘧啶甲基化的改变。 在试验中发
现,60Co⁃γ射线辐射小麦 DNA甲基化相对水平的变化
并没有随辐射剂量的增加而呈现一种正相关或负相关
的特定联动性,但在每个辐照剂量下小麦基因组全甲
基化率高于半甲基化,并且从辐射诱变的动态变化规

  1 期 60Co⁃γ 射线诱导的小麦基因组 DNA的甲基化变异
表 6  不同60Co⁃γ诱变剂量处理下小麦不同部位基因组 DNA甲基化模式的变异
Table 6  The variation of DNA methylation patter of leavers and root in wheat seedlings induced by
different dose of gamma ray treatment / %
组织
Tissue
诱变剂量
Dose / Gy
CG去甲基化
CG Hypo⁃ HpaII(0→1)
CNG去甲基化
CNG hypo⁃ MspI(0→1)
CG甲基化
CG hyper⁃ HpaII(1→0)
CNG甲基化
CNG hyper⁃ MspI(1→0)
叶 100 100(9. 78) 112(10. 95) 55(5. 38) 29(2. 83)
Leaf 150 152(14. 15) 70(6. 52) 83(7. 73) 49(4. 56)
根 100 94(10. 42) 50(5. 54) 74(8. 20) 107(11. 86)
Root 150 87(9. 74) 21(2. 35) 111(12. 43) 75(8. 40)
律来看,每个辐照剂量下 CG 位点的变化率均高于
CNG位点,与前人在研究激光辐射对水稻甲基化变异
分析的结果一致[24]。 但在 CG 和 CNG 位点不同甲基
化模式的变异率则因组织而异,说明辐射诱变诱导的
DNA胞嘧啶甲基化模式变异的复杂性。
生物有机体有着一整套相当严密而复杂的调节功
能以适应外界条件的变化,使自身受外界环境的影响
最小化。 所以当小麦种子受到射线辐照诱变时,生物
体自身就会调动各方面的调节机制以迅速应对这种外
界环境的变化,并且在后续的生命周期中也会不断的
加以修复、调节,最后形成一种植物体自适应的相对稳
定的动态模式,而 DNA甲基化变异仅仅是其迅速调节
机制之一,因此辐射诱变后的植物机理机制研究是一
个相当复杂的生命过程,还需要更深入的研究解析。
有文献报道甲基结合蛋白(MBD)参与诱导甲基化的
沉默,也有研究表明小麦[25]、大麦[26]、玉米[27]在受到
干旱胁迫时 MBD 在叶和根中的表达不同,并且与
DNA甲基化直接相关的 DNA 甲基化转移酶的研究也
有助于理解 DNA 甲基化的变异。 因此本研究下一步
将研究 MBD和甲基化转移酶在诱变胁迫时的基因表
达情况,以进一步更好的理解诱变胁迫时的甲基化调
控机制。
4  结论
60Co⁃γ射线辐照改变小麦基因组 DNA 甲基化的
方式而影响基因组稳定性。 甲基化相对水平方面,小
麦种子经不同剂量 γ 射线辐照处理后,幼苗叶片的甲
基化相对水平下降,而根中有所升高。 甲基化变异模
式方面,甲基化模式的变异因组织和剂量而异。
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Journal of Nuclear Agricultural Sciences
2015,29(1):0001 ~ 0009
The Variation of DNA Cytosine Methylation in Wheat Genome
Induced by60 Co⁃γ Rays
YANG Zhen1,2,3   GUO Huijun2   ZHAO Linshu2   GU Jiayu2   XIE Yongdun2   LIU Luxiang2
( 1 Hunan Agriculture University, Changsha,Hunan  410125;2 Institute of Crop Science,
National Center of Space Mutagenesis for Crop Improvement / National Key Facility for Crop Gene
Resources and Genetic Improvement / Chinese Academy of Agricultural Science,
Beijing  100081;3 Hunan Institute of Nuclear Agricultural
Sciences and space mutagenesis breeding, Changsha, Hunan  410125)
Abstract:Mutation technique has played an important role in wheat improvement. Nuclear irradiation may affect genome
stability by altering DNA methylation patterns (including hyper⁃methylation and hypo⁃methylation). In this study, seeds
of wheat variety Jing 411 were irradiated by 60Co⁃γ rays with the dose of 100Gy and 150Gy, respectively. Variation of
DNA cytosine methylation in seedling leaf and root were detected by methylation sensitive amplification polymorphism
(MSAP). The results showed that seedling height and root length were significantly inhibited after 60 Co⁃γ ray
irradiation. DNA cytosine methylation in leaves and roots was altered after 60 Co⁃γ ray treatment. Compared with the
control, the methylation variations in leaves and roots were different. The relative level of methylation in leaves was
decreased, but increased in roots, indicating tissue specificity. The rates of demethylation variation in leaves at both
dosages were higher than those of methylation, and it was opposite in roots. At different sites, the variations of
methylation patterns were different. At CG and CNG sites of leaves, demethylation rates were higher than those of
methylation at both dosages. In root, demethylated variation rate of CNG sites were lower than the corresponding
methylation sites. Under 100Gy, the demethylation variation rate at CG sites is higher than the methylation variation rate
of the corresponding sites, and it is consistent with methylation patterns variation of leaves. under 150Gy, the
methylation variation rate at CG sites is higher than the demethylation variation rate of the corresponding sites. The result
indicated that the variation of methylation pattern , induced by different dosage of 60 Co⁃γ rays, even in the same
organization and same site was different.
Keywords:wheat,60Co⁃γ ray, MSAP, variation