期 刊 :植物保护学报 2015年
关键词:毒莴苣 ;近似种 ;EST-SSR ;遗传多样性 ;
Keywords:Lactuca serriola , closely related species , EST-SSR , genetic diversity ,
摘 要 :为明确毒莴苣EST序列中SSR的特点,并开发EST-SSR分子标记用于毒莴苣及其近似种的分类鉴定及遗传多样性分析,以筛选的7 438条毒莴苣EST序列为基础,利用SSRIT软件结合人工搜索查找SSR位点,并采用 Primer Premier 5.0软件设计EST-SSR引物,以毒莴苣及其近似种为材料对所合成引物进行多态性检测,应用UPGMA法构建11个毒莴苣及其近似种的系统发育树。结果表明,共搜索到SSR位点1 465个,发现重复基元598种,其中二、三、六核苷酸重复是主要的重复类型。合成的24对引物中有9对表现出多态性,利用这9对EST-SSR引物分析毒莴苣等11份材料的亲缘关系,其相似性系数在0.432~1.000之间;于0.513处可被划分为3大类:Ⅰ类包括翅果菊和北山莴苣,Ⅱ类只有宿根莴苣1种,Ⅲ类包括毒莴苣和莴苣。
Abstract:In order to reveal the characteristics of SSRs derived from prickly lettuce ESTs and develop EST-SSR molecular markers for genetic diversity study and identification of Lactuca serriola and related species, SSRs of prickly lettuce were analyzed by bioinformatics method based on 7 438 non-redundant ESTs which obtained from NCBI database. The EST-SSR primers were designed on Primer Premier 5.0, and the phylogenetic tree of L. serriola and related species was established by UPGMA. A total of 1 465 SSRs loci were screened and 598 types of motifs were identified in ESTs of prickly lettuce. The dominant motifs types were dinucleotide, trinucleotide and hexanucleotide repeats. Nine polymorphic primer pairs were used to analyze genetic diversity of 11 tested materials. The genetic similarity of paired cultivars varied from 0.432 to 1.000. The 11 materials could be divided into three groups with a similarity coefficient of 0.513. GroupⅠ included two cultivars, Pterocypsela indica and L. sibirica ; L. perennis was the only cultivar in groupⅡ, and group Ⅲ included two cultivars, L. serriola and L. sativa.
全 文 :植物保护学报 !"#$%&"()&%*)$"*+,*-"%! ./01! 2."2#$ 153 413: 678$ 0/90:3/.;<=,%>-=?@ABCA=./019/29/01 基金项目$ 江苏检验检疫局科技计划"./0.f!1E#!山西农业大学育种基金"./02c_.K5#!山西省青年科技研究基金"./0./.0/.1K.# !通讯作者"F#*B"$("$,"$+GH"%I+%,+#! JKL&-$ _B&%MA
收稿日期$ ./02 400 401 检疫性杂草毒莴苣 GNMHNN!标记的开发及应用 梁照文 0O童明龙0O高振峰.O张宝俊.!O伏建国:O范晓虹2 "0=宜兴出入境检验检疫局! 江苏 宜兴 .02./E .=山西农业大学农学院! 太谷 /:/3/0 :=江苏出入境检验检疫局! 南京 .0//D1 2=中国检验检疫科学研究院! 北京 0//0.:# 摘要! 为明确毒莴苣J[Y序列中 [[Z的特点!并开发J[YK[[Z分子标记用于毒莴苣及其近似种的 分类鉴定及遗传多样性分析!以筛选的 5 2:3 条毒莴苣J[Y序列为基础!利用 [[Z8Y软件结合人工 搜索查找 [[Z位点!并采用 )$-L+$)$+L-+$19/ 软件设计J[YK[[Z引物!以毒莴苣及其近似种为材 料对所合成引物进行多态性检测!应用U)RaF法构建 00 个毒莴苣及其近似种的系统发育树" 结 果表明!共搜索到 [[Z位点 0 2E1 个!发现重复基元 1D3 种!其中二三六核苷酸重复是主要的重 复类型" 合成的 .2 对引物中有 D 对表现出多态性!利用这 D 对J[YK[[Z引物分析毒莴苣等 00 份 材料的亲缘关系!其相似性系数在 /92:. 0^9/// 之间#于 /910: 处可被划分为 : 大类%#类包括翅 果菊和北山莴苣!$类只有宿根莴苣 0 种!类包括毒莴苣和莴苣" 关键词! 毒莴苣# 近似种# J[YK[[Z# 遗传多样性 Z")"B.0-"*,$*(:,+B+,4 ./GNMHNN!-$%V"%+*T:$%$*,+*"5""(/#-01-# $.++(&"# P-&%M_B&"@+%0OY"%Ma-%M"%M0OR&"_B+%(+%M.O_B&%MW&"<#%.!O\# !-&%M#":O\&% Q-&"B"%M2 "0=c-C-%MJ%*$SKJC-*8%GH+,*-"% &%I d#&$&%*-%+W#$+! c-C-%M.02./E! !-&%MG# )$"V-%,+! TB-%& .=T"+M+"(FM$-,#*#$+! [B&%C-FM$-,#*#$&U%-V+$G-*S! Y&-M# /:/3/0! [B&%C-)$"V-%,+! TB-%& :=!-&%MG# J%*$SKJC-*8%GH+,*-"% &%I d#&$&%*-%+W#$+! b&%<-%M.0//D1! !-&%MG# )$"V-%,+! TB-%& 2=TB-%+G+F,&I+LS"(8%GH+,*-"% &%I d#&$&%*-%+! W+-<-%M0//0.:! TB-% 12#,%$&,$ 8% "$I+$*"$+V+&*B+,B&$&,*+$-G*-,G"([[ZGI+$-V+I ($"LH$-,>S+*#,+J[YG&%I I+V+"H J[YK[[ZL"+,#&$L&$>+$G("$M+%+*-,I-V+$G-*SG*#IS&%I -I+%*-(-,&*-"% "(8&4$#4& *%./)"& &%I $+&*+I GH+,-+G! [[ZG"(H$-,>S+*#,+@+$+&%&S?+I ASA-"-%("$L&*-,GL+*B"I A&G+I "% 5 2:3 %"%K$+I#%I&%* J[YG@B-,B "A*&-%+I ($"LbTW8I&*&A&G+=YB+J[YK[[ZH$-L+$G@+$+I+G-M%+I "% )$-L+$)$+L-+$19/! &%I *B+HBS"M+%+*-,*$++"(8=*%./)"& &%I $+&*+I GH+,-+G@&G+G*&A-GB+I ASU)RaF=F*"*&"(0 2E1 [[ZG",-@+$+G,$++%+I &%I 1D3 *SH+G"(L"*-(G@+$+-I+%*-(-+I -% J[YG"(H$-,>S+*#,+=YB+I"L-%&%* L"*-(G*SH+G@+$+I-%#,+"*-I+! *$-%#,+"*-I+&%I B+C&%#,+"*-I+$+H+&*G=b-%+H"SL"$HB-,H$-L+$H&-$G @+$+#G+I *"&%&S?+M+%+*-,I-V+$G-*S"(00 *+G*+I L&*+$-&G=YB+M+%+*-,G-L-&$-*S"(H&-$+I ,#*-V&$G V&$-+I ($"L/92:. *"09///=YB+00 L&*+$-&G,"#I A+I-V-I+I -%*"*B$++M$"#HG@-*B &G-L-&$-*S ,"+(-,-+%*"(/910:=R$"#H# -%,#I+I *@",#*-V&$G! !$%.)4(,*%"& /3-/4& &%I 8=*/A/./4& 8=,%.%33/* @&G*B+"%S,#*-V&$-% M$"#H$! &%I M$"#H -%,#I+I *@",#*-V&$G! 8=*%./)"& &%I 8=*&$/B&= 3"4 5.%(#$ 8&4$#4& *%./)"& ,"G+S$+&*+I GH+,-+G J[YK[[Z M+%+*-,I-V+$G-*S OO毒莴苣 8&4$#4& *%./)"& 隶属菊科莴苣属!是我 国一种重要的进境检疫性有害杂草) 毒莴苣全株有 毒!极易混杂在农产品中随粮谷(油料作物及纺织原 料的调运而传播!降低作物品质(引起人畜中毒!我 国进出境口岸曾多次截获该杂草种子"吴海荣等! .//D黄益燕和李新芳!./00#) 毒莴苣结实量大( 适应能力强!在我国有广泛的潜在分布区"郭水良 等!./00#) 毒莴苣种子细小!与莴苣种子在形态上 非常相似!且莴苣属杂草种类繁多!常因部分种子发 生磨损!破坏其形态特征而增加了检疫鉴定工作的 难度) 因此!开发和利用分子标记!建立快速(有效 的毒莴苣分子检测方法!能提高毒莴苣检验检疫的 效率及准确度) 目前限制性内切酶片段长度多态性"$+G*$-,*-"% ($&ML+%*+%M*B H"SL"$HB-GL!Z\P)#(扩增片段长度 多态性 "&LH-(-+I ($&ML+%*+%M*B H"SL"$HB-GL! F\P)#(单核苷酸多态性"G-%M+%#,+"*-I+H"SL"$K HB-GL![b)#(简单重复序列"G-LH+G+h#+%,+$+H+&*! [[Z#等多种分子标记被应用于检疫性杂草的辅助 鉴定中!为杂草的遗传多样性研究及其分类鉴定提 供了便利"陈景堂等!.//0魏霜等!./02#) 表达序 列标签"+CH$+GG+I G+h#+%,+*&M!J[Y#作为表达基因 所在区域的分子标签因编码 6bF序列高度保守而 具有自身的特殊性质!其中 J[YK[[Z是基于物种相 对保守的转录区域开发的一类分子标记!除具有 [[Z标记的多态性丰富(共显性好(重复性高等特点 外"李成云等!.//1冯彦霞等!./0:#!在近缘种间 具有更高的通用性和保守性) J[YK[[Z标记已广泛 应用于多种植物(病原菌等的遗传图谱构建(遗传多 样性分析(群体遗传学研究(物种鉴定等多个领域 "李新凤等!./02#) 随着毒莴苣J[Y数据资源的不 断丰富!为开发和利用毒莴苣 J[YK[[Z标记提供了 基础!本研究通过对毒莴苣J[Y中 [[Z信息进行分 析!明确其 J[YK[[Z的发生频率和分布特点!并以 00 份毒莴苣及其近似种对 J[YK[[ZG标记进行验 证!以期探讨毒莴苣 J[YK[[Z标记跨种属的通用 性!为毒莴苣物种特异性引物的开发及其快速分子 检测方法的建立提供理论依据) 6 材料与方法 686 材料 供试植株$购自法国的宿根莴苣 8&4$#4& ,%.%33/* 及莴苣 8&4$#4& *&$/B& 品种6-&%&和Y&%M"!国内有采 自江苏连云港的毒莴苣 8=*&$/B&和翅果菊!$%.)4(,*%7 "& /3-/4&!山西左权的翅果菊!江苏泰州的 . 株翅果 菊!一种叶缘有锯齿记为#号!一种叶缘无锯齿记为$ 号!以及中国检验检疫科学研究院赠送的毒莴苣 8= *%./)"&"简称中国检科院毒莴苣#(北山莴苣 8=*/A/./7 4&和翅果菊"简称中国检科院翅果菊#) 试剂$植物基因组 6bF快速提取试剂盒(0// AH 6bFP&II+$(H&M6bF聚合酶(IbY)(琼脂糖等 购自宝生物工程"大连#有限公司!J[YK[[Z引物由 北京六合华大基因科技股份有限公司合成丙烯酰 胺(甲叉双丙烯酰胺等试剂和药品购自生工生物工 程"上海#股份有限公司) 仪器$YTKDE;R;X"A#F)TZ扩增仪!杭州博日 科技有限公司6ccK00 型电泳仪!北京六一仪器 厂R+6",QZl凝胶成像分析系统!美国伯乐公司) 687 方法 68786 毒莴苣J[Y序列的筛选和预处理 从R+%W&%> 数据库中以 \F[YF格式下载到毒 莴苣J[Y序列 11 2D/ 条"截止 ./0. 年 0. 月 5 日#) 应用JaW7[[ 软件包中的 YZaJ[Y工具!采用默认 参数去除 J[Y尾部的 )"SKF;Y序列! 并利用 TZ7[[KaFYTX软件去除毒莴苣J[Y中包含的载体 序列!随后运用ZJ)JFYaF[fJZ程序屏蔽序列中 的重复序列!再通过 TF): 软件进行重叠群分析和 聚类拼接!获得无冗余序列) 68787 毒莴苣J[Y序列中 [[Z信息分析 利用 [[Z8Y"G-LH+G+h#+%,+$+H+&*-I+%*-(-,&*-"% *""#在线软件并结合人工搜索对无冗余序列进行 [[Z搜索!并对搜索结果在 JC,+./0/ 中进行统计 分析) 搜索标准$单聚物重复次数&0.二聚物重复 次数&5三聚物重复次数&E四聚物重复次数&2 五(六聚物重复次数&:) 68789 J[YK[[Z引物的设计与合成 利用 )$-L+$)$+L-+$19/ 软件对筛选出的 J[Y 序列进行引物设计) 引物设计的主要参数$J[Y序 列中含有较多 [[Z位点引物长度为 03 .^2 AHRT 含量为 2/e 5^/e!YL为 21 E^/p预期扩增产物 控制在 0// 1^// AH!由北京六合华大基因科技股份 有限公司合成) 6878; )TZ反应体系的建立及扩增产物的检测 毒莴苣及其近似种基因组 6bF的提取采用 TYFW法"Z"M+$G` W+%I-,B!0D31#) )TZ反应体系 为 ./ "P$含6bF模板约 ./ %M(0/ "a;P正反引物 各 0 "P(.91 La;PIbY)09E "P(0/ uW#(+$"含 aM.l#. "P(1 U;"PH&M酶 /9. "P(IIX.7补足 ./ "P) 扩增程序$D1p预变性 1 L-%!D2p变性 :1 G! 2E 1^1p退火 :/ 2^1 G!5.p延伸 2/ G!:/ 个循环后 5.p再延伸 5 L-%!0/p保存) )TZ扩增产物采用 0/e的)FRJ凝胶电泳!.// g恒压电泳 : B!电泳 D512 期 梁照文等$ 检疫性杂草毒莴苣J[YK[[Z标记的开发及应用 结束后用银染法染色!并拍照记录) 6878< 毒莴苣及其近似种的聚类分析 对毒莴苣(莴苣(宿根莴苣(北山莴苣等 00 份材 料的电泳图谱进行分析!以6bF某一片段在某样品 中出现赋值%0&和不出现赋值%/&为依据!在 JC,+ ./0/ 中进行统计!利用bY[c[)T.90 软件基于b+-K P-遗传相似系数的 U)RaF法对供试 00 份材料进 行聚类分析!绘制聚类树状图) 7 结果与分析 786 毒莴苣GNMHNN!出现的频率和特点 通过预处理获得 5 2:3 条无冗余序列!基因全 长为 E9E u0/E AH) 共搜索到 0 2E1 个 [[Z位点!分 布于 0 03/ 条J[Y序列中!平均每 2 1.D AH J[Y出 现一个 [[Z!检出率为 0D95e!其中 ./. 条 J[Y序 列上有 0 个以上 [[Z位点!占 0590e) 0 2E1 个 [[Z位点中!0 E^ 核苷酸重复均有分布!并且每种 重复类型的出现频率存在差异) 六聚物最多!共 :5: 个! 占 .191e 三聚物次之! 共 ::5 个! 占 .:9/e四聚物最少!仅占 E9.e单聚物有 .0D 个! 占 019/e二聚物有 .E1 个!占 0390e五聚物 03/ 个!占 0.9:e"表 0#) 787 GNMHNN!#的基元种类及比例 在出现的 1D3 种重复基元中!单聚物重复基元 有 2 种!二聚物重复基元有 0. 种!三聚物重复基元 有 1/ 种!四聚物重复基元有 E/ 种!五聚物重复基元 有 0:3 种!六聚物重复基元有 ::2 种) 单聚物中主 要基元为F;Y二聚物中主要基元为FR;TY和YT; RF三聚物中主要基元为 RFY;FYT和 FYR;TFY 四聚物中主要基元为 YYYT;RFFF和 YYFY;FYFF 五聚物中主要基元为 YYYYF;YFFFF六聚物中主 要基元类型为RFYRFF;YYTFYT"表 .#) 表 6 毒莴苣GNM中NN!的组成及频率分布 Y&A+0 6-G*$-A#*-"% &%I ($+h#+%,S"([[ZG-% &G+*"(8&4$#4& *%./)"& J[YG 重复类型 Z+H+&**SH+ 基元种类数 b#LA+$"(L"*-(*SH+ [[Z数 [[Z%#LA+$ 占全部 [[Z比例 "e# )$"H"$*-"% -% &[[Z 出现频率 "e# \$+h#+%,S 单核苷酸 a"%"%#,+"*-I+ 2 .0D 019/ .9D 二核苷酸 6-%#,+"*-I+ 0. .E1 0390 :92 三核苷酸 Y$-%#,+"*-I+ 1/ ::5 .:9/ 291 四核苷酸 Y+*$&%#,+"*-I+ E/ D0 E9. 09. 五核苷酸 )+%*&%#,+"*-I+ 0:3 03/ 0.9: .92 六核苷酸 X+C&%#,+"*-I+ ::2 :5: .191 19/ 总计 Y"*& 1D3 0 2E1 0//9/ 0D92 表 7 毒莴苣GNMHNN!主要重复基元的出现频率 Y&A+. \$+h#+%,S"(*B+L&-% $+H+&*L"*-(G-% 8&4$#4& *%./)"& 重复类型 Z+H+&**SH+ 基元种类数 b#LA+$"(L"*-(*SH+ 主要重复基元 YB+L&-% $+H+&*L"*-( 出现次数 7,,#$+%,+%#LA+$ 频率 "e# \$+h#+%,S 单核苷酸 a"%"%#,+"*-I+ 2 F;Y .02 D595 二核苷酸 6-%#,+"*-I+ 0. FR;TY DD :592 YT;RF D0 :29: 三核苷酸 Y$-%#,+"*-I+ 1/ RFY;FYT 2. 0.91 FYR;TFY :. D91 RFF;YYT .D 39E YRF;YTF .1 592 四核苷酸 Y+*$&%#,+"*-I+ E/ YYYT;RFFF 1 191 YYYF;YFFF 2 292 YYFY;FYFF 1 191 FYRT;RTFY 2 292 五核苷酸 )+%*&%#,+"*-I+ 0:3 YYYYF;YFFFF 3 292 FYFYR;TFYFY 2 .9. YYYYR;TFFFF 2 .9. 六核苷酸 X+C&%#,+"*-I+ ::2 RFYRFF;YYTFYT E 09E FRYTFF;YYRFTY : /93 TYTYTT;RRFRFR : /93 /31 植O物O保O护O学O报 2. 卷 789 GNMHNN!引物的有效性及多态性检测 试验共设计合成 J[YK[[Z引物 .2 对!其中有 5 对引物对 00份材料的扩增带数为 /!其余 05 对能够 实现有效扩增!有效扩增率为 5/93e) 经 0/e)FRJ 电泳检测其多态性!有 D 对引物对 00 个样品能扩增 出多态性明显(条带清晰且稳定的标记条带!占有效 扩增引物的 1.9De!呈现出较高的多态性"表 :#) 78; 毒莴苣及其近似种的遗传多样性分析 所选 D 对引物对 00 份材料的扩增条带数在 : 5^条之间!平均每对引物产生 1 个条带) D 对引 物共扩增出 21 条谱带!其中多态性条带 2/ 条!多态 性比例为 339De) 其中引物 2510 扩增出条带 1 条! 多态性条带 1 条!引物 2:/ 扩增条带 1 条!多态性条 带 2 条"图 0#) 表 9 部分微卫星标记的特征表 Y&A+: [#LL&$S"(H&$*-&L-,$"G&*+-*+L&$>+$G 引物 )$-L+$ 重复基元 Z+H+&*L"*-( 上链引物"1m4:m# \"$@&$I H$-L+$"1m4:m# 下链引物"1m4:m# Z+V+$G+H$-L+$"1m4:m# 退火温度 YL "p# 产物大小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图 6 两对NN!引物对 66 份供试材料的扩增图谱 \-M=0 FLH-(-+I A&%IG"(*@"H"SL"$HB-,H$-L+$G-% 00 L&*+$-&G F$ 引物 2510 W$ 引物 2:/ a$ 6bF分子标量 0$ 中国检科院翅果菊 .$ 莴苣6-&%& :$ 宿根莴苣 2$ 中国检科院毒莴 苣 1$ 莴苣Y&%M" E$ 江苏毒莴苣 5 3^$ 江苏泰州#($号翅果菊 D$ 江苏连云港翅果菊 0/$ 山西翅果菊 00$ 北山莴苣) F$ )$-L+$2510 W$ H$-L+$2:/a$ 0// AH 6bFL&$>+$ 0$!=/3-/4&($"LTB-%+G+F,&I+LS"(8%GH+,*-"% &%I d#&$&%*-%+"TF8d# .$ 8=*&$/B& 6-&%& :$ 8=,%.%33/* 2$ 8=*%./)"& ($"LTF8d 1$ 8=*&$/B& Y&%M" E$ 8=*%./)"& ($"L!-&%MG# )$"V-%,+ 5 43$ !=/37 -/4& # &%I $ ($"LY&-?B"#! !-&%MG# )$"V-%,+ D$ !=/3-/4& ($"LP-&%S#%M&%M! !-&%MG# )$"V-%,+ 0/$ !=/3-/4& ($"L[B&%C-)$"VK -%,+ 00$ 8=*/A/./4&= O OO综合 D 对引物的扩增结果!所测 00 份材料间的 相似系数在 /92:. 0^9/// 之间) 其中翅果菊与毒 莴苣之间的相似系数较低!为 /92:.宿根莴苣与毒 莴苣间的相似系数为 /91.:法国莴苣6-&%&与毒莴 苣的相似系数为 /93E2) 系统发育树显示"图 .#! 在 /910: 处 00 份材料被划分为 : 大类!其中来自不 同地域的 1 种翅果菊与北山莴苣聚为#类$类仅 包含宿根莴苣 0 种!且与其它 0/ 份材料的遗传相似 性较低类包括 . 种毒莴苣和 . 种莴苣!表明这 . 个物种的遗传关系密切!在所分析的 J[Y序列中遗 传突变较少) 9 讨论 J[YK[[Z可对物种基因内部变异进行直接评价! 0312 期 梁照文等$ 检疫性杂草毒莴苣J[YK[[Z标记的开发及应用 图 7 基于NN!构建的毒莴苣及其近似种的系统发育树 \-M=. )BS"M+%+*-,*$++"(8&4$#4& *%./)"& &%I $+&*+I GH+,-+GAS[[Z O 本研究初步探讨了J[YK[[Z分子标记在毒莴苣及其 近似种分类与鉴定研究中的可行性) 对毒莴苣 5 2:3 条无冗余序列的 [[Z位点进行了搜索!共搜索到 0 2E1个 [[Z位点!检出率为 0D95e!高于荔枝 "0E91:e#(小麦".9/0e#和辣椒"3922e#等物种的 检出率"b-,"*+*&=!.//2李晶晶等!.//3孙清明等! ./00#!但低于柑橘".091Ee#和水稻".5e#"TB+% +* &=!.//EY&%M+*&=!.//3#) 从 0 2E1个 [[Z位点分 析!0 E^核苷酸重复均有出现且没有明显的偏倚性! 其中五核苷酸重复和六核苷酸重复的基元类型分别 为 0:3和 :22种!与理论值较为接近"P&Z"*&+*&=! .//1#!且 [[Z数量分别占所搜索 [[Z总数的 0.9:e 和 .191e!表明在毒莴苣物种中!J[YK[[Z出现的频 率较高!重复基元类型也较为丰富!这与一些栽培作 物的J[YK[[Z序列存在一定差异!也为毒莴苣 J[YK [[Z标记的开发奠定了基础) 本研究将毒莴苣J[YK[[ZG标记用于毒莴苣及其 近似种的遗传多样性分析!其中 D 对引物能够扩增到 条带清晰(重复性好的谱带!表现出J[YK[[ZG较好的 通用性和有效性多态性位点比率分析表明!多态率 高达 339De) 通过对所测 00份材料间的遗传距离及 聚类分析表明!莴苣属不同物种及翅果菊在聚类图上 表现出较好的分离!这可能是由于毒莴苣与其近似种 基因组中的 [[Z基因序列存在较大差异!引起引物结 合位点之间的片段长度差异所致) 其中翅果菊与莴 苣(毒莴苣等莴苣属物种的遗传相似性系数较低!表 明其具有与莴苣属不同的系统发育背景!与其被重新 划分为翅果菊属的研究结果相符!但毒莴苣与莴苣相 似度在 /9D以上!说明二者具有较近的亲缘关系) 口岸检疫中!常由于杂草种子外部形态特征不 明显或植株难以区分而无法准确鉴定!分子检测技 术的应用可有效解决快速而准确鉴定的问题!特别 是建立检疫性杂草的特异性分子标记!可有效提高 检疫工作效率及检出率) 邵秀玲等".//D#从 03 对 [[Z引物中筛选到 0 对引物 Fa0!该引物对应的标 记在细茎野燕麦?B%3& A&.A&$&(法国野燕麦?="#-)B7 /4/&3&(不实野燕麦?=*$%./"/*等检疫性杂草中具有多 态性!以燕麦和野燕麦作为参照!可很好地实现对这 些燕麦属杂草的区分与鉴定!这为燕麦属检疫性杂 草的快速鉴定提供了一定的辅助作用张姮等 ".//3#利用 )TZKZ\P)技术针对毒麦及其近似种 的$6bF8Y[区域进行分析!选取的 H#(5*[#和 F%2#限制性内切酶可实现对检疫性杂草毒麦与其 近似种亚麻毒麦 8)"/#9.%9)$#9(多花黑麦草 8= 9#"$/<").#9(瑞士黑麦草 8=./0/-#9的鉴别和区分 刘勇等"./00#依据茄科植物 O5++D基因序列差异! 设计了 0 对特异)TZ引物 [Z[\0;[Z[Z0!可用于刺 萼龙葵 +)"&3#9.)*$.&$#9的特异性检测) 本研究所 设计引物2510等对莴苣(宿根莴苣(毒莴苣(翅果菊 等物种的扩增片段差异明显!是否可通过毒莴苣及 其近似种J[Y序列的测定与分析!利用不同物种间 内含子长度多态性的差异设计 J[YK8H[ 特异性引 物"郭琼霞等!./0.#!用于毒莴苣或其近似种的快 速分子检测仍需进一步研究) 参 考 文 献 "Z+(+$+%,+G# TB+% T! _B"# )! TB"-cF! X#&%M[! RL-*+$\R!$=.//E=a-%-%M &%I ,B&$&,*+$-?-%ML-,$"G&*+-*+G($"L,-*$#GJ[YG=YB+"$+*-,& .31 植O物O保O护O学O报 2. 卷 &%I FHH-+I R+%+*-,G! 00."5#$ 0.23 40.15 TB+% !Y! ]&S"# b! P-# __! TB-[a! a-%+"a! F>-"U=.//0= YB+&HH-,&*-"% "(ZF)6*+,B%""MS-% *B+M+%+*-,,&GG-(-,&*-"% "(?9&.&3$2#*=F,*&W"*&%-,&W"$+&-K7,,-I+%*&-&[-%-,&! .0 "1#$ 35. 4353 "-% TB-%+G+# +陈景堂! 根本和洋! 刘志增! 池书敏! 南峰夫! 氏原晖男=.//0=ZF)6技术在几个苋属 植物遗传分类中的应用研究=西北植物学报! .0 "1#$ 35. 4353 \+%McQ!P-]! [#% Xc!6+%Mcc!c# X[!TB+% XR=./0:=R+K %+*-,I-V+$G-*S"(O&%#9&33)9(4%*0.&9/3/*V&$=$./$/4/H"H#&K *-"%G-% X#&%MKX#&-@-%*+$@B+&*H$"I#,*-"% $+M-"% "(TB-%&= !"#$%&"()&%*)$"*+,*-"%! 2/"E#$ 2D1 41/0 "-% TB-%+G+# +冯彦霞! 李伟! 孙海燕! 邓渊钰! 于汉寿! 陈怀谷=./0:= 黄淮麦区小麦全蚀病菌群体的遗传多样性分析=植物保护 学报! 2/"E#$ 2D1 41/0, R#"dQ! _B#&%MZ! X#&%M_! X#&%MfX=./0.=8I+%*-(-,&*-"% "( *B+G++IG"(1#*4#$& AS#G-%M*B+*+,B%""MS"(-%*$"% +%M*B H"SL"$HB-GLG"8P)G#=)&%*)$"*+,*-"%! :3 "E#$ 0/0 40/2 "-% TB-%+G+# +郭琼霞! 庄蓉! 黄振! 黄可辉=./0.=应用 J[YK8P)G分子标记技术快速鉴定菟丝子属种子=植物保护! :3"E#$ 0/0 40/2, R#"[P! R&")P! P"# cQ=./00=)$+I-,*-"% "(H"*+%*-&-%V&G-V+ $&%M+"(h#&$&%*-%+@++I 8&4$#4& *%./)"& -% TB-%&ASa&CJ%* L"I+=!"#$%&"([B&%MB&-!-&"*"%MU%-V+$G-*S"FM$-,#*#$& [,-+%,+#! .D"1#$ 01 40D "-% TB-%+G+# +郭水良! 高平磊! 娄玉霞=./00=应用a&CJ%*模型预测检疫性杂草毒莴苣在 我国的潜分布范围=上海交通大学学报"农业科学版#! .D "1#$ 01 40D, X#&%Mcc! P-Q\=./00=)$-,>S+*#,+@++IG(-$G*-%*+$,+H*+I -% \"GB&% H"$*G=)&%*d#&$&%*-%+! .1"E#$ 15 "-% TB-%+G+# +黄 益燕! 李新芳=./00=佛山口岸首次截获毒莴苣种子=植物 检疫! .1"E#$ 15, P&Z"*&a! f&%*+*SZg! c# !f! ["$+GaJ=.//1=b"%$&%I"L I-G*$-A#*-"% &%I ($+h#+%,-+G"(M+%"L-,&%I J[YKI+$-V+I L-,$"K G&*+-*+L&$>+$G-% $-,+! @B+&*! &%I A&$+S=WaTR+%"L-,G! E$ .:=678$ 0/9003E;0250K.0E2KEK.: P-Tc! P-!W! P-# P! c&%M!! _B"# QR=.//1=T"LH&$-G"% "(L-,K $"G&*+-*+G-% *B+M+%"L+"(*@"HBS*"H&*B"M+%-,(#%M-! E#*&./7 #90.&9/3%&.#9&%I ;&03&,).$2%0./*%&=!"#$%&"()&%*)$"K *+,*-"%! :.":#$ .10 4.11 "-% TB-%+G+# +李成云! 李进斌! 刘林! 杨静! 周晓罡=.//1=禾谷镰刀菌和稻瘟病菌基因组 中的微卫星序列比较=植物保护学报! :.":#$ .10 4.11, P-!!! ]&%M[W! P-# !W! )&% WR! TB+% !\=.//3=6+V+"HL+%*"( H+HH+$J[YK[[ZL&$>+$=a"+,#&$)&%*W$++I-%M! E "E #$ 0.0D 40... "-% TB-%+G+# +李晶晶! 王述彬! 刘金兵! 潘宝 贵! 陈劲枫=.//3=辣椒J[YK[[Z标记的开发=分子植物育 种! E"E#$ 0.0D 40..., P-Q\! _B&%M_R! ]&%M!a! R&"!a! Y-&% XQ=./02=J[YK[[Z -%("$L&*-"% &%&SG-G&%I L&$>+$GI+V+"HL+%*-%E#*&./#9)(*7 ,).#9=[,-+%*-&FM$-,#*#$+[-%-,&! 25"./#$ :D3. 4:DD0 "-% TB-%+G+# +李新凤! 张作刚! 王建明! 高俊明! 田宏先= ./02=尖镰孢 J[YK[[Z信息分析及分子标记建立=中国农 业科学! 25"./#$ :D3. 4:DD0, P-# c! P-&"\! c&%MQP! P-# )! b-# T!! X#&%MRa=./00=[*#IS "% L"+,#&$I+*+,*-"% "(h#&$&%*-%+@++I +)"&3#9.)*$.&$#9= )&%*d#&$&%*-%+! .1".#$ 10 412 "-% TB-%+G+# +刘勇! 廖 芳! 杨秀丽! 刘鹏! 牛春敬! 黄国明=./00=重要检疫性杂 草刺萼龙葵分子生物学检测的研究=植物检疫! .1 ".#$ 10 412, b-,"*b! TB-h#+*g! R&%I"% W! FL-B&*P! P+M+&-\! P+$"S)! W+$%&$I a! ["#$I-+)=.//2=[*#IS"(G-LH+G+h#+%,+$+H+&* "[[Z# L&$>+$G($"L@B+&*+CH$+GG+I G+h#+%,+*&MG"J[YG#= YB+"$+*-,&&%I FHH-+I R+%+*-,G! 0/D"2#$ 3// 43/1 Z"M+$G[7!W+%I-,B F!=0D31=JC*$&,*-"% "(6bF($"LL--M$&L&K L"#%*G"(($+GB! B+$A&$-#L&%I L#LL-(-+I H&%**-GG#+G=)&%* a"+,#&$W-""MS! 1".#$ ED 45E [B&"QP! c#&% cP! b-Qa! \&% QX! P-# Z!! _B&%M6a! TB&%M __=.//D=6+*+,*-"% "(-LH"$*h#&$&%*-%+@++IG"(?B%3%&%P= AS[[ZL&$>+$G=!"#$%&"([B&%I"%MFM$-,#*#$&U%-V+$G-*S "b&*#$&[,-+%,+#! 2/ "2#$ 105 41./ "-% TB-%+G+# +邵秀 玲! 原永兰! 尼秀媚! 范晓虹! 刘瑞军! 张德满! 常兆芝= .//D=燕麦属进境检疫性杂草种子的 [[Z标记检测=山东 农业大学学报"自然科学版#! 2/"2#$ 105 41./, [#% da!a&]T!a&[)!_B&"![!W&-P!!TB+% !_!T&-TX!Q-&%M Q!7# PQ=./00=TB&$&,*+$-G*-,G"([[ZGI+$-V+I ($"LJ[YG&%I I+V+"HL+%*"(J[YK[[Z L&$>+$G-% -*,B-" 8/$42/42/3%3*/* ["%%=#=[,-+%*-&FM$-,#*#$& [-%-,&! 22 " 0D #$ 2/:542/2D "-% TB-%+G+# +孙清明! 马文朝! 马帅鹏! 赵俊生! 白丽军! 陈洁珍! 蔡长河! 向旭! 欧良喜=./00=荔枝 J[Y资源的 [[Z信息分析及 J[YK[[Z标记开发=中国农业科学! 22 "0D#$ 2/:5 42/2D, Y&%M!\!W&I@-% [!!!&,"AG!a!V&% I+$P-%I+% TR!g""$-HGZJ! P+#%-GG+% !F!V&% J,> X!g"GL&% W=.//3=P&$M+KG,&+-I+%K *-(-,&*-"% "(H"SL"$HB-,L-,$"G&*+-*+G#G-%M&% /3 */"/4)&HK H$"&,B=WaTW-"-%("$L&*-,G! D$ :52=678$ 0/9003E;0250K .0/1KDK:52 ]+-[! c#&% !!! P-# cP! P-# WP! P-% P)! c-% !)! ]+%M_!! P-# Qc! _B+%M[W=./02=Z+G+&$,B &IV&%,+G"% L"+,#&$L&$>K +$G"(h#&$&%*-%+@++I=!"#$%&"(8%GH+,*-"% &%I d#&$&%*-%+! .2"1#$ 50 452 "-% TB-%+G+# +魏霜! 袁俊杰! 刘玉莉! 刘碧 琳! 林利平! 鄞杰平! 翁志坚! 刘晓莹! 郑少波=./02=检 疫性杂草分子鉴定研究进展=检验检疫学刊! .2"1#$ 50 4 52, ]# XZ!_B"%MRd!X# !!d-# Xc!6# ]!=.//D=F"*"(H$-,>S +*#,+G++IG@+$+-%*+$,+H*+I "% ,++$S-LH"$*+I -%*"TB-%& ($"LU[F=)&%*d#&$&%*-%+! .: ".#$ :E 4:5 "-% TB-%+G+# +吴海荣! 钟国强! 胡佳! 邱海洋! 杜伟江=.//D=从美国进 口芹菜种子中截获大量毒莴苣=植物检疫! .:".#$ :E 4 :5, _B&%MX!f&%MP!R&"W6!TB+% 6a=.//3=YB+H$+-L-%&$S&%&K SG-G"(*B+$6bF8Y[KZ\P)-% 8)"/#9$%9#"%&$#9P=&%I -*G G-L-&$GH+,-+G=)&%*d#&$&%*-%+! .. ".#$ 5/ 45. "-% TB-K %+G+# +张姮! 康林! 高必达! 陈冬美=.//3=毒麦及其近似 种$6bF8Y[KZ\P)初步分析=植物检疫! ..".#$ 5/ 45., $责任编辑%李美娟& :312 期 梁照文等$ 检疫性杂草毒莴苣J[YK[[Z标记的开发及应用