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Identification of the pathogen causing rust on Adzuki bean

小豆锈病病原菌鉴定



全 文 :植物病理学报
ACTA PHYTOPATHOLOGICA SINICA  44(6): 581 ̄585(2014)
收稿日期: 2014 ̄03 ̄06ꎻ 修回日期: 2014 ̄08 ̄09
基金项目: 国家现代农业产业技术体系建设专项(CARS ̄09)
通讯作者: 朱振东ꎬ研究员ꎬ主要从事豆类病害研究ꎻTel: 010 ̄82109609ꎬE ̄mail: zhuzhendong@caas.cn
第一作者: 支 叶ꎬ女ꎬ硕士ꎬ主要从事豆类病害研究ꎻTel:010 ̄82109609ꎬE ̄mail:abcdefghzhiye@126.comꎮ
doi:10.13926 / j.cnki.apps.2014.06.003
小豆锈病病原菌鉴定
支 叶ꎬ 段灿星ꎬ 孙素丽ꎬ 王晓鸣ꎬ 朱振东∗
(中国农业科学院作物科学研究所ꎬ农作物基因资源与基因改良国家重大科学工程ꎬ北京 100081)
摘要:小豆锈病是小豆的重要病害ꎮ 然而ꎬ小豆锈病病原菌在我国还没有被鉴定ꎮ 本文对从黑龙江省和内蒙古自治区采集
的 5个小豆锈病菌样品的分类地位进行了研究ꎮ 形态学观察表明ꎬ小豆锈病菌夏孢子芽孔位于赤道线或赤道线上方ꎬ冬孢
子平均壁厚为 2.0 μmꎮ 分子标记检测发现ꎬ小豆锈病菌不能被疣顶单胞锈菌特异性引物对 UA ̄ITSF / UA ̄ITSR扩增ꎬ小豆
锈病菌和豇豆锈病菌不能被豇豆单胞锈特异性引物对 UV ̄ITSF / UV ̄ITSR 区分ꎮ 对豇豆单胞锈特异性引物对扩增的 4 个
小豆锈病菌样品 PCR产物进行测序ꎬ比对分析表明目标序列与小豆单胞锈 ITS序列的同源性为 99% ~ 100%ꎮ 基于夏孢子
的芽孔位置、冬孢子壁的厚度、疣顶单胞锈菌及豇豆单胞锈特异性引物检测结果和 ITS 序列分析ꎬ小豆锈病菌被鉴定为小
豆单胞锈ꎮ
关键词:小豆ꎻ 锈病ꎻ 小豆单胞锈
Identification of the pathogen causing rust on Adzuki bean   ZHI Yeꎬ DUAN Can ̄xingꎬ
SUN Su ̄liꎬ WANG Xiao ̄mingꎬ ZHU Zhen ̄dong  ( Institute of Crop Scienceꎬ National Key Facility for Crop Gene
Resources and Genetic Improvementꎬ Chinese Academy of Agricultural Sciencesꎬ Beijing 100081ꎬ China)
Abstract: Rust is a severe disease on adzuki bean. Howeverꎬ the rust fungus has not been identified in China.
Five rust isolates were collected from plants of adzuki bean in Heilongjiang Province and Inner Mongolia. The
taxonomical status of these rust isolates was studied. Morphological examination revealed that position of
urediniospore germ pores was equatorial or superequatorialꎬ and the mean thickness of teliospore wall was 2.0
μm. Detection with specific molecular markers showed that a specific primer pair UA ̄ITSF / UA ̄ITSR for
Uromyces apprendiculatus did not amplify any product in the five isolatesꎬ and the rust isolates from adzuki bean
and cowpea could not be distinguished by U. vignae ̄specific primer pair UV ̄ITSF / UV ̄ITSR. The PCR products
amplified by U. vignae ̄specific primer pair UV ̄ITSF / UV ̄ITSR from the four rust isolates were subjected to
sequencing analysis. BLAST analysis of the resulting sequences showed that they were 99% to 100% identical to
the ITS sequences of U. azukicola isolates. Based on the position of germ pores in urediniosporesꎬ the teliospore ̄
wall thicknessꎬ amplification of U. appendiculatus ̄ and U. vignae ̄specific markersꎬ and ITS sequence analysisꎬ
the rust fungus on adzuki bean was identified as U. azukicola.
Key words: Vigna angularisꎻ rustꎻ Uromyces azukicola
中图分类号: S435.21          文献标识码: A          文章编号: 0412 ̄0914(2014)06 ̄0581 ̄05
    小豆(Vigna angularis)是我国主要的食用豆
类作物之一ꎮ 由于其具有较高的营养和药用价值ꎬ
作为传统和特色作物ꎬ在我国农业生产和人们生活
中具有独特的作用ꎮ 在世界上ꎬ小豆主要栽培于亚
洲地区ꎬ其中我国在栽培面积及产量均居首位ꎮ 小
豆在我国大部分地区都有种植ꎬ其中东北、华北、黄
 
植物病理学报 44卷
河中下游和长江中下游为主要产区[1]ꎮ 小豆锈病
是我国小豆生产中重要病害之一ꎬ尤其在华北及东
北地区发生严重ꎬ常导致叶片枯黄脱落ꎬ植株早衰ꎬ
籽粒瘪瘦ꎬ产量损失严重ꎬ甚至绝收[2~4]ꎮ
    小豆锈病最早于 1922年在日本报道ꎮ 由于夏
孢子形态与菜豆(Phaseolus vulgaris)上的相似ꎬ
Ito[5]将小豆锈病菌视为疣顶单胞锈 (Uromyces
appendiculatus)ꎮ 后来ꎬHirata[6]发现小豆、野生小
豆(V. angularis var. nipponensis)和饭豆(V. um ̄
bellata)上的锈病菌与疣顶单胞锈在夏孢子和冬孢
子形态与大小上存在差异ꎬ将这些寄主上的锈病菌
描述为一个新种ꎬ即小豆单胞锈(U. azukicola)ꎮ
然而ꎬHiratsuka 等根据夏孢子芽孔位置、冬孢子壁
上饰物及寄主专化性ꎬ界定小豆锈病菌为疣顶单胞
锈的一个变种 ( U. appendiculatus var. azukico ̄
la) [7]ꎮ 最近ꎬChung 等[7]发现疣顶单胞锈小豆变
种的锈孢子形态与疣顶单胞锈其他变种的相似ꎬ但
夏孢子和冬孢子形态特征及寄主关系不同于其他
变种ꎬ根据对日本豆类的疣顶单胞锈和豇豆单胞锈
(U. vignae)进行形态和系统发育分析结果ꎬ将不
同寄主来源的锈病菌划分为疣顶单胞锈、小豆单胞
锈和豇豆单胞锈 3个种ꎬ其中疣顶单胞锈主要为害
菜豆ꎬ小豆单胞锈主要为害小豆、野生小豆、饭豆
(V. umbellata)、土坘儿(Apios fortunei)ꎬ豇豆单胞
锈主要为害豇豆(V. unguiculata) [8]ꎮ 在我国ꎬ迄
今还没有鉴定小豆锈病菌的报道ꎬ在少数几篇文献
中ꎬ一些研究者将小豆锈病菌分别视为小豆单胞
锈[2~3]或疣顶单胞锈[4ꎬ9]ꎮ 2012 年 8 月和 9 月ꎬ在
黑龙江省牡丹江市、萝北县及内蒙古自治区呼和浩
特市调查发现部分小豆田锈病发生严重ꎮ 本研究
对这 3个地点采集的小豆锈病菌样品进行形态学
和分子鉴定ꎬ以期确定小豆锈病的病原ꎮ
1  材料与方法
1.1  试验材料
    5个小豆锈病菌样品ꎬ于 2012 年 8 月和 9 月
分别从黑龙江省牡丹江市(样品号 XDR1 ̄XDR3)、
萝北县 (XDR4) 和内蒙古自治区呼和浩特市
(XDR5)小豆田采集ꎬ其中牡丹江市采集的 3 份样
品分别来自不同小豆品种ꎮ 1 个菜豆锈病菌和 1
个豇豆锈病菌样品作为对照菌ꎬ其中菜豆锈病菌于
2012年 9月从贵州省毕节市菜豆田采集ꎬ豇豆锈
病菌于 2012年 9月本实验室试验基地采集ꎮ 采集
的病叶夹于多层吸水纸间带回实验室ꎬ之后多次更
换吸水纸以保持叶片干燥ꎮ
1.2  夏孢子和冬孢子形态鉴定
    无菌解剖刀从病叶上刮取单孢子堆ꎬ用 Olym ̄
pus CX31光学显微镜观察夏孢子和冬孢子的形态
特征ꎬ测量孢子大小及孢子壁厚度ꎮ 每个样品分别
测量 50个夏孢子和冬孢子ꎮ
1.3  特异性分子标记检测及序列分析
    用无菌解剖刀从病叶上刮取孢子堆ꎬDNA提取
采用 CTAB方法ꎮ 用 Chung 等[10]基于 ITS 序列设
计的疣顶单胞锈特异性引物对 UA ̄ITSF / UA ̄ITSR
( 5′ ̄GGTTTTTGCCATTGCACTCAG ̄3′ / 5′ ̄CATTT ̄
GTTTAGGAGTCCTGAC ̄3′)和豇豆单胞锈特异性
引物对 UV ̄ITSF / UV ̄ITSR(5′ ̄CATCTTTGCCATT
GCACTCAG  ̄ 3 ′ / 5 ′  ̄ AGTTAGTTTAGGAGTTCTA
AC ̄3′)分别扩增锈病菌样品基因组 DNAꎮ PCR 扩
增体系和程序参照文献[10]ꎮ PCR 产物用 1.5%琼
脂糖凝胶电泳检测ꎮ
    回收小豆锈病菌样品 XDR1、XDR2、XDR4 和
XDR5的 PCR产物ꎬ并克隆到 pGM ̄T 载体ꎮ 挑取
阳性克隆送北京六合华大基因科技股份有限公司
测序ꎮ 测序结果在 NCBI网站直接进行 BLAST 比
对ꎬ根据比对结果从 GenBank 数据库获得疣顶单
胞锈、小豆单胞锈 和豇豆单胞锈的 ITS 序列ꎬ应用
MEGA 5.0 采用 NJ 算法构建系统发育树ꎮ
2  结果与分析
2.1  夏孢子形态特征
    7个锈病菌样品的夏孢子均为球形、卵形或椭
圆形ꎬ壁上有刺ꎬ黄褐色(图 1)ꎮ 小豆锈病菌样品
夏孢子大小为(22.2 ̄25.9)μm ×(19.1 ̄23.3)μmꎬ平
均为 25.0 μm × 21.8 μmꎬ壁厚为(1.3 ̄1.9) μmꎬ平
均为 1.6 μmꎮ 菜豆锈病菌样品的夏孢子大小为
(22.4 ̄28.6)μm ×(19.1 ̄24.0) μmꎬ平均24.2 μm×
22.5 μmꎬ壁厚为(1.2 ̄1.9) μmꎬ平均为1.5 μmꎮ 豇
豆锈病菌样品的夏孢子大小为(23.6 ̄29.0) μm ×
(19.8 ̄24.6) μmꎬ平均为 26.0 μm × 21.8 μmꎬ壁厚
为(1.2 ̄1.6) μmꎬ平均为 1.4 μmꎮ 这些结果表明ꎬ
3个寄主来源的锈病菌夏孢子形态和大小没有明
285
 
  6期 支 叶ꎬ等:小豆锈病病原菌鉴定
显差异(P >0.05)ꎮ 3 个寄主来源的锈病菌夏孢子
均具有 2个芽孔ꎬ但芽孔所在位置存在差异ꎮ 小豆
锈病菌样品夏孢子芽孔位于赤道线或赤道线上方
(图 1 ̄A)ꎻ菜豆锈病菌样品夏孢子芽孔位于赤道
线ꎬ但不明显(图 1 ̄C)ꎻ豇豆锈病菌样品夏孢子芽
孔位于赤道线上方(图 1 ̄E)ꎮ
2.2  冬孢子形态特征
    7 个锈病菌样品的冬孢子均为亚球形至椭圆
形ꎬ褐色ꎬ顶部有无色至淡黄褐色乳状突起(图 1)ꎮ
小豆锈病菌样品冬孢子大小为(26.6 ̄32.5) μm ×
(19.6 ̄22.9) μmꎬ平均为 29.3 μm ×21.4 μmꎬ壁厚
为(1.7 ̄2.3) μmꎬ平均为 2.0 μmꎮ 菜豆锈病菌样
品冬孢子大小为(27.6 ̄34.7)μm×(23.2 ̄26.9) μmꎬ
平均为 31.6 μm ×24.9 μmꎬ壁厚为(2.4 ̄3.5) μmꎬ
平均为 3.1 μmꎮ 豇豆锈病菌样品冬孢子大小为
(28.4 ̄39.7)μm ×(122.6 ̄27.5) μmꎬ平均33.0 μm
× 25.4 μmꎬ壁厚为(2.9 ̄3.6) μmꎬ平均为 3.4 μmꎮ
3个寄主来源的锈病菌冬孢子形态存在差异ꎬ小豆
样品锈病菌冬孢子的大小和壁的厚度都显著小于
豇豆和菜豆的样品(P <0.05)ꎮ
2.3  特异性分子标记检测
    根据 Chung等[10]研究结果ꎬ引物对 UA ̄ITSF /
UA ̄ITSR只在疣顶单胞锈基因组 DNA 中扩增约
500 bp的特异性片段ꎬ而引物对 UV ̄ITSF / UV ̄ITSR
仅在豇豆单胞锈基因组 DNA 中扩增 500 bp 特异
性片段ꎮ 在 3个寄主来源的 7 个锈病菌样品基因
组 DNA中ꎬ 引物对 UA ̄ITSF / UA ̄ITSR只在 1个菜
豆锈病菌样品中扩增约 500 bp 片段ꎬ在其他 6 个
样品中没有扩增出条带(图 2)ꎬ表明菜豆锈病菌样
品为疣顶单胞锈ꎻ引物对 UV ̄ITSF / UV ̄ITSR 在 5
个小豆锈病菌样品和 1 个豇豆锈病菌样品中扩增
大小约 500 bp 片段ꎬ而在菜豆锈病菌样品中没有
扩增出条带(图 2)ꎬ表明该引物对不能区分豇豆单
胞锈和小豆单胞锈ꎮ
Fig. 1  Urediniospores and teliospores of Uromyces spp. under light microscope
Aꎬ B: From Vigna angularis var. angularisꎻ Cꎬ D: From Phaseolus vulgarisꎻ
Eꎬ F: From Vigna unguiculata. Black arrow pointing to be germ pore on urediniospore.
385
 
植物病理学报 44卷
Fig. 2   PCR amplification of rust specimens
collected from adzuki beanꎬ common
bean and cowpea with species ̄speci ̄
fic primers UA ̄ITSF / UA ̄ITSR for Uro ̄
myces appendiculatus (top) and UV ̄
ITSF / UV ̄ITSR (bottom) for U. vignae
M: DNA ladder D2000ꎻ Lane 1: From common bean in Bijieꎬ
Guizhou Provinceꎻ Lane 2: From cowpea in Beijingꎻ Lane 3:
From adzuki bean in Luobei Countyꎬ Heilongjiang Province
(XDR4)ꎻ Lane 4: From adzuki bean in Hohhotꎬ Inner Mon ̄
golia (XDR5)ꎻ Lane 5 ̄7: From adzuki bean in Mudanjiangꎬ
Heilongjiang Province (XDR1 ̄XDR3)ꎻ Lane 8: Water.
    测序引物对 UV ̄ITSF / UV ̄ITSR 扩增的小豆
锈病菌样品 XDR1、XDR2、XDR4 和 XDR5 的 PCR
产物ꎮ 将获得序列在 NCBI 网站上进行 BLAST 比
对ꎬ结果表明ꎬ4 个样品的序列与小豆单胞锈 ITS
序 列 ( AB115706、 AB115707、 AB115708、
AB115710、 AB115712、 AB115714、 AB115715、
AB115732)的同源性为 99% ~ 100%[8]ꎮ 从 Gen ̄
Bank 数据库获得疣顶单胞锈、小豆单胞锈和豇豆
单胞锈的 ITS 序列ꎬ用 MEGA 5.0 的 NJ 算法构建
系统发育树ꎮ 结果表明ꎬ疣顶单胞锈、小豆单胞锈
和豇豆单胞锈被分为 3 个明显不同的聚类组ꎬ
XDR1、XDR2、XDR4 和 XDR5 与小豆单胞锈聚类
在一起ꎮ 与疣顶单胞锈相比ꎬ小豆单胞锈和豇豆单
胞锈具有更近的遗传关系(图 3)ꎮ
    综合夏孢子芽孔位置、冬孢子侧壁厚度、特异
性分子标记检测及 ITS序列分析结果ꎬ将来源于小
豆的锈病菌鉴定为小豆单胞锈(U. azukicola)ꎬ而
来源于菜豆的锈病菌鉴定为疣顶单胞锈(U. ap ̄
pendiculatus)ꎬ来源于豇豆的锈病菌鉴定为豇豆单
胞锈(U. vignae)ꎮ
Fig. 3  Phylogenetic relationships of Uromyces azukicolaꎬ U. appendiculatus
and U. vignae based on ITS rDNA sequences
485
 
  6期 支 叶ꎬ等:小豆锈病病原菌鉴定
3  讨论
    Chung等[8]基于夏孢子芽孔位置、冬孢子侧壁
厚度和 ITS序列变异ꎬ将几种不同豆类寄主的疣顶
单胞锈和豇豆单胞锈区分为寄主关系不同的 3 个
单胞锈种ꎬ即疣顶单胞锈、小豆单胞锈和豇豆单胞
锈ꎮ 本研究鉴定的 5 个小豆锈病菌样品夏孢子芽
孔位于赤道线上或赤道线上部区域ꎬ冬孢子侧壁平
均厚度为 2.0 μmꎬ这 2 个特征与 Chung 等描述的
小豆单胞锈一致[8]ꎮ 然而ꎬ用疣顶单胞锈和豇豆
单胞锈特异性标记进行基因组 DNA 检测ꎬ发现 5
个小豆锈病菌样品不能被疣顶单胞锈特异性引物
对 UA ̄ITSF / UA ̄ITSR扩增ꎬ但能被豇豆单胞锈特
异性引物对 UV ̄ITSF / UV ̄ITSR 扩增ꎬ且片段大小
与豇豆单胞锈相近(图 2)ꎬ表明小豆锈病菌不是疣
顶单胞锈ꎬ但豇豆单胞锈特异性引物对 UV ̄ITSF /
UV ̄ITSR不能将小豆锈病菌和豇豆锈病菌分开ꎮ
Chung等[10]设计的疣顶单胞锈和豇豆单胞锈特异
性引物扩增的目标片段为部分 ITS序列ꎬ但引物设
计没有考虑小豆锈病菌的 ITS序列ꎬ引物特异性检
测也没有用小豆锈病菌作对照ꎬ因此不能排除对小
豆锈病菌的扩增ꎮ 从 GenBank 中下载 3 个小豆单
胞 锈 ITS 序 列 ( AB115707、 AB115708、
AB115730) [8]ꎬ利用 ClustalX2 与豇豆单胞锈特异
性引物序列进行比对ꎬ我们发现上游引物 UV ̄ITSF
序列与 AB115730序列的第 91 到 111 碱基序列完
全一致ꎬ与 AB115707 和 AB115708 序列比较只在
第 94个碱基上存在差异ꎬ而下游引物 UV ̄ITSR序
列与 AB115730、AB115707和 AB115708也分别只
有一个碱基不同ꎮ 显然ꎬ豇豆单胞锈特异性引物对
UV ̄ITSF / UV ̄ITSR完全可以在小豆单胞锈扩增ꎮ
进一 步 将 小 豆 单 胞 锈 ITS 序 列 AB115730、
AB115707和 AB115708 与 Chung 等[10]用于引物
设计的豇豆单胞锈 ITS 序列 AB115718 进行比对
分析ꎬ发现相似性分别为 96.9%、93.6%和 92.9%ꎬ
这一比对结果表明小豆锈病菌不同于豇豆单胞锈ꎮ
4个小豆锈病菌样品 ITS 序列测定也证明了这一
结果ꎬ4个样品与小豆单胞锈聚类在一起ꎬ与豇豆
单胞锈相似性仅为 94% ~ 95%ꎮ 因此ꎬ我国黑龙江
省和内蒙古自治区小豆锈病病原菌为小豆单胞锈ꎮ
参考文献
[1]   Wang L Xꎬ Cheng X Zꎬ Wang S H. Review on
genetic study and application of adzuki bean ( Vigna
angularis) germplasm ( in Chinese) [ J] . Journal of
Plant Genetic Resources (植物遗传资源学报)ꎬ 2013ꎬ
14(3): 440-447.
[2]   Zhao G F. Study on epidemics of rust on adzuki bean
( in Chinese ) [ J ] . Journal of Tianjin Agricultural
College(天津农学院学报)ꎬ 1995ꎬ 2(2):16-21.
[3]   Jin W Lꎬ Yu S Fꎬ Zhang Q Rꎬ et al. Genetic analysis
of resistant genes to rust and powdery mildew and
brown spot in adzuki bean ( in Chinese)[J] . Journal of
Beijing Agricultural College (北京农学院学报)ꎬ
1996ꎬ 11(1): 1-9.
[4]   Wang X Mꎬ Zang D Cꎬ Cui C Jꎬ et al. Spatial distri ̄
bution pattern of rust in maize and bean ( in Chinese)
[J] . Journal of Jilin Agricultural University (吉林农
业大学学报)ꎬ 2007ꎬ 29(5): 488-490.
[5]   Ito S. Uromyces of Japan[J] . Journal of the College of
Agricultureꎬ Hokkaido Imperial Universityꎬ 1922ꎬ 11
(4): 211-287.
[6]   Hirata Y. On the rust fungi of cowpeaꎬ kidney bean
and small red bean ( in Japanese) [ J] . Annals of the
Phytopathologicial Society of Japanꎬ 1952ꎬ 16:13-18.
[7]   Chung W Hꎬ Ono Yꎬ Kakishima M. Life cycle of
Uromyces appendiculatus var. azukicola on Vigna
angularis[J] . Mycoscienceꎬ 2003ꎬ 44(6): 425-430.
[8]   Chung W Hꎬ Tsukiboshi Tꎬ Ono Yꎬ et al. Morpholo ̄
gical and phylogenetic analyses of Uromyces appendic ̄
ulatus and U. vignae on legumes in Japan[ J] . Myco ̄
scienceꎬ 2004ꎬ 45: 233-244.
[9]   Cao R Hꎬ Wang X Lꎬ Nan C Hꎬ et al. Studies on
resistant identification to the rust in adzuki bean germ ̄
plasm resource ( in Chinese)[J] . Acta Phytopathogica
Sinica (植物病理学报)ꎬ 1989ꎬ 21(3): 180.
[10] Chung W Hꎬ Chung W Cꎬ Ting P Fꎬ et al. Molecular
identification of Uromyces appendiculatus andꎬ Uromy ̄
ces vignaefrom Taiwan with PCR ̄based method ( in
Chinese)[J] . Plant Pathology Bulletin (植物病理学
会刊)ꎬ 2008ꎬ 17(4): 297-305.
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