全 文 :植物病理学报
ACTA PHYTOPATHOLOGICA SINICA 45(1): 7 ̄13(2015)
收稿日期: 2013 ̄11 ̄17ꎻ 修回日期: 2014 ̄09 ̄25
基金项目: 国家自然科学基金项目 ( 31260424)ꎻ公益性行业 (农业) 科研专项 ( 201103018)ꎻ “十二五”国家科技支撑计划项目
(2012BAD19B06 ̄07)
通讯作者: 陈绵才ꎬ研究员ꎬ主要从事植物病理学研究ꎻ E ̄mail:miancaichen@163.com
第一作者: 练冬梅ꎬ女ꎬ福建永安人ꎬ在读硕士生ꎬ 主要从事植物病原线虫研究ꎻE ̄mail:woshildm1987@163.comꎬ Tel:18876178352ꎮ
doi:10.13926 / j.cnki.apps.2015.01.002
象耳豆根结线虫 Hsp70基因的克隆与原核表达
练冬梅1ꎬ2ꎬ 王会芳2ꎬ 赵志祥2ꎬ 陈绵才2∗
( 1海南省农科院农业环境与植物保护研究所 /海南省植物病虫害防控重点实验室ꎬ海口 571100ꎻ
2 海南大学环境与植物保护学院ꎬ海口 571101)
摘要:采用 RT ̄PCR、cDNA 末端快速扩增法(RACE)ꎬ克隆了象耳豆根结线虫 Hsp70 基因的全长 cDNA(MeHsp70)序列ꎮ
MeHsp70 cDNA全长 2 203 bpꎬ含有 1 959 bp的开放阅读框ꎬ编码 653个氨基酸ꎬ相对分子量为 71.09 kDaꎬ具有 3段Hsp70家族
的签名序列ꎬGenBank 登录号 KF739434ꎮ 同源性分析表明ꎬ氨基酸序列与其他真核生物的 Hsp70序列具有很高的相似性ꎮ 该
Hsp70与其他物种中的 Hsp70进行系统进化分析ꎬ结果显示ꎬHsp70的系统发育树不能体现物种间的亲缘关系ꎬ推测其反映的
是不同物种间 Hsp70 生物学功能的相似性程度ꎮ 构建了一个原核表达载体 pEASY ̄E1 ̄MeHsp70ꎬ当 IPTG 终浓度为
0.4~1.0 mmol / L时ꎬ能诱导表达融合蛋白ꎮ MeHsp70基因的克隆和表达ꎬ将为象耳豆根结线虫的生态适应性机理研究提供依据ꎮ
关键词:象耳豆根结线虫ꎻ Hsp70ꎻ 克隆ꎻ 表达
Cloning and prokaryotic expression of Hsp70 from Meloidogyne enterolobii LIAN
Dong ̄mei1ꎬ2ꎬ WANG Hui ̄fang2ꎬ ZHAO Zhi ̄xiang2ꎬ CHEN Mian ̄cai2 ( 1 Institute of Environment & Plant Protec ̄
tionꎬ Hainan Academy of Agricultural Sciencesꎬ Hainan Key Laboratory for Control of Plant Diseases and Insect Pests ꎬ Haikou
571100ꎬ Chinaꎻ 2Environment and Plant Protection Collegeꎬ Hainan Universityꎬ Haikou 571101ꎬ China)
Abstract: The full length cDNA (MeHsp70) of Hsp70 from Meloidogyne enterolobii was cloned by using
RT ̄PCRꎬ rapid amplification of cDNA ends ( RACE) . The full ̄length cDNA of MeHsp70 was 2 203 bp
containing an open reading frame (ORF) of 1 959 bp encoding a polypeptide of 653 amino acids with a predic ̄
ted molecular mass of 71.09 kDaꎬ which carried three important and intact Hsp70 signature sequencesꎬ which
was registered in GenBank with accession No. KF739434. The result of sequence similarity ̄analysis revealed that
the translated molecules showed high homology to other eukarya. The Hsp70s phylogenetic analysis showed that
the phylogenetic tree could not reflect the genetic relationship of the organismsꎬ maybe similarity of biological
functions was revealed. The complete ORF encoding MeHsp70 was inserted into pEASY ̄E1 and an expression
vector pEASY ̄E1 ̄MeHsp70 was constructed. The MeHsp70 protein was induced to express by 0. 4 ̄1.0 mmol / L
IPTG. This study provided theoretical basis supporting research on mechanisms of the ecological adaptability of
M. enterolobii.
Key words: Meloidogyne enterolobiiꎻ Hsp70ꎻ cloningꎻ expression
中图分类号: S432.45 文献标识码: A 文章编号: 0412 ̄0914(2015)01 ̄0007 ̄07
象耳豆根结线虫(Meloidogyne enterolobii)最
早于 1983年由杨宝君等在海南儋州的象耳豆树上
发现并鉴定和命名[1]ꎮ M. enterolobii 在全球农作
物中已经成为一种经济上重要的寄生线虫[2ꎬ3]ꎮ
植物病理学报 45卷
该线虫在美洲、非洲、欧洲等均有分布ꎬ为世界上公
认的危害最大的根结线虫之一ꎮ 近年来ꎬM. enter ̄
olobii 的迅速传播也引起了学者的广泛关注ꎬ在国
内外ꎬM. enterolobii 也陆续被报道ꎮ 据调查ꎬ在海
南岛主要栽培作物葫芦科蔬菜、茄果类蔬菜、南药
作物和热带果树均已发现有 M. enterolobii 广泛寄
生[4]ꎬ同时 M. enterolobii 还可寄生携带 Mi抗性基
因的番茄和辣椒[5]ꎮ 通过海南岛茄果类蔬菜根结
线虫种类鉴定ꎬ发现 M. enterolobii 种群已进一步
扩散ꎬ正在显示出取代南方根结线虫ꎬ而成为我国
热带亚热带地区最重要根结线虫种类的趋势ꎮ
热激蛋白(Heat shock proteinsꎬ Hsps)于 1962
年由遗传学家 Ritossa 在研究果蝇唾液腺时被发
现ꎬ继而成为众多学者研究植物抗逆性机制的热
点ꎮ 热激蛋白家族中以 Hsp70 的含量最丰富、结
构和功能最为保守ꎬ且充当分子伴侣ꎬ高温、干旱、
低温以及重金属离子等各胁迫因子均可诱导其合
成增加[6]ꎬ因而成为 Hsps家族中最受关注的对象ꎮ
目前ꎬ国内外已从旋尾目、杆形目和垫刃目等线虫
中克隆了多个 Hsp70 基因[7]ꎮ 克隆到 Hsp70 基因
的全长序列ꎬ有助于揭示该基因的功能ꎬ并通过异
源表达分析蛋白的性质和功能ꎮ 本研究获得了 M.
enterolobii Hsp70 基因的完整编码区序列ꎬ同时将
该蛋白原核融合表达到大肠杆菌中ꎬ为进一步揭示
M. enterolobii环境适应机制奠定基础ꎮ
1 材料与方法
1.1 材料
M. enterolobii 原始种群来源于海南省农业科
学院植物保护研究所植物线虫保存圃ꎬ在室内用改
进的贝尔曼漏斗法分离得到ꎮ
1.2 方法
1.2.1 第一链 cDNA 的合成 采用 Trizol 法提取
M. enterolobii 总 RNAꎬ其 RNA 沉淀用 20 μL 无
RNase水溶解ꎮ 取 5 μL 总 RNA 为模板ꎬ以 oligo ̄
dt为引物ꎬ用反转录酶 (TaKaRa PrimeScriptTM II
1st Strand cDNA Synthesis Kit)进行反转录ꎬ合成
cDNA第一链ꎮ
1.2.2 M. enterolobii Hsp70基因片段的克隆 Hsp70
的氨基酸序列含有多个签名序列及高度保守区域ꎬ
合成简并引物 70F 和 70R (表 1)ꎬ用于扩增
M. enterolobii Hsp70 部分序列ꎮ 以第一链 cDNA
为模板进行扩增ꎬ反应参数为:94℃预变性 3minꎻ
然后 94℃变性 30 sꎬ45℃退火 30 sꎬ72℃延伸 50 sꎬ
共 35个循环ꎻ最后 72℃延伸 10 minꎮ PCR产物以
1.2%琼脂糖凝胶电泳检测和分离ꎬ用 DNA 回收试
剂盒回收后连接到 pEASY ̄T1 克隆载体中ꎬ转化
Trans1 ̄T1感受态细胞ꎬ挑取阳性单菌落放大培养ꎬ
PCR 鉴定阳性转化子ꎬ挑选阳性克隆送上海生工
生物技术有限公司进行序列测定ꎮ
1.2.3 RACE 扩增 根据已分离得到的目的片段
分别设计 5′和 3′RACE 特异性引物 5GSP、5NGSP
和 3GSP(表 1)ꎬ用于 RACE反应获得 M. enterolo ̄
bii Hsp70基因的全长 cDNA序列ꎮ
以 M. enterolobii 总 RNA 为模板ꎬ利用 RLM ̄
RACE GeneRacerTM Kit( Invitrogen)合成带 3′接
头和 5′接头的 cDNA 第一链ꎮ 以带 3′接头的
cDNA第一链为模板ꎬ3GSP和GeneRacerTM3′Primer
Table 1 Oligo nucleotide ̄primers ̄designed in this study
Primer name Primer sequence( 5′→3′)
Amplification of partial
Hsp70 sequence
70F TKGTCACWGTSCCMGCTTAC
70R GGYTGRTTRTCMGAATAGGT
5′RACE
5GSP CAAAATCTTCGCCTCCAAGGTGAGTGTC
5NGSP TCCAGCATCCTTTGTGGCTTGACG
3′RACE 3GSP GTGCTCTCCGTCGTCTTCGTACTGCTT
GeneRacerTM Kit
GeneRacerTM5′Primer CGACTGGAGCACGAGGACACTGA
GeneRaceTM 5′Nested Primer GGACACTGACATGGACTGAAGGAGTA
GeneRacerTM3′Primer GCTGTCAACGATACGCTACGTAACG
pEASY ̄E1 ̄MeHsp70
construction
MeF GATGTCTAAAGCTAACGCTG
MeR ATCAACTTCTTCAATGGTTG
8
1期 练冬梅ꎬ等:象耳豆根结线虫 Hsp70基因的克隆与原核表达
为引物ꎬ进行 3′端的 cDNA 扩增ꎻ以带 5′接头 cD ̄
NA第一链为模板ꎬ5GSP 和 GeneRacerTM5′Primer
进行 5′端的 cDNA扩增ꎬ将扩增产物稀释 100倍以
后ꎬ以 5NGSP和 GeneRaceTM 5′Nested Primer 进行
巢式 PCR扩增ꎮ 然后电泳检测ꎬ纯化 3′和 5′RACE
PCR 产物后再进行连接、转化和测序ꎮ 测序结果
与核心序列利用 DNAMAN 6. 0 进行拼接ꎬ得到
Hsp70基因的全长 cDNA序列ꎮ
1.2.4 序列比对和生物信息学分析 序列同源性
比对和相似性搜索用在线生物学软件 http: / /
www. ncbi. nlm. nih. gov / blast 进行ꎬ多序列比对
采用生物软件 DNAMAN 6.0ꎬ开放阅读框(ORF)
预测和氨基酸序列分析采用 BioXM 2. 6 生物软
件ꎬHsp70 进化树采用 MEGA4ꎬ以邻位相连法
(Neighbor ̄JoiningꎬNJ)构建ꎮ
1.2.5 表达载体的构建及目的蛋白的诱导表达 以
第一链 cDNA为模板ꎬ用引物MeF和MeR(表 1)扩
增 Hsp70基因的开放阅读框区域ꎮ PCR 产物连入
pEASY ̄E1ꎬ连接产物 42℃热激转化到感受态细胞
Transl ̄T1 中涂板培养 (含氨苄青霉素 100μg /
mL)ꎬ挑取单克隆培养ꎬ以菌液为模板进行 PCR 鉴
定ꎬ将阳性克隆送公司测序ꎬ并进行序列分析ꎮ 将
构建好的表达载体 pEASY ̄E1 ̄Hsp70 转化到感受
态细胞 BL21(DE3)中ꎬ涂板培养ꎮ 挑取转化子接
种于含氨苄青霉素的培养液中振荡培养至菌液 OD
值约为 0.4~ 0.5 时ꎬ加入 IPTG 使终浓度为0.4、0.8、
1.0 mmol / L时ꎬ37℃振荡培养 3 h后离心收集菌体ꎬ
向收集的菌体中加入 100 μL 1×蛋白上样缓冲液ꎬ
100℃加热 5 minꎬ将样品取出冷却至室温ꎬ离心后取
8 μL 上清于 8%分离胶和 5%浓缩胶中进行
SDS ̄PAGE电泳分析ꎮ 最后将所获得的电泳图片利
用 Quantity One 4.6.6软件预测其分子量的大小ꎮ
2 结果与分析
2.1 Meloidogyme enterolobii Hsp70 基因全
长 cDNA序列的克隆
采用同源克隆的策略ꎬ以 M. enterolobii cDNA
为模板ꎬ用设计的简并引物进行 PCR 扩增ꎬ结果
获得880 bp 的片段(图 1)ꎮ 与 GenBank 上已注册
的其他线虫 Hsp70部分序列进行对比ꎬ结果表明ꎬ
M. enterolobii Hsp70 部分序列与大豆孢囊线虫
(Heterodera glycines)、马铃薯腐烂茎线虫(Ditylen ̄
chus destructor )、 松 材 线 虫 ( Bursaphelenchus
xylophilus)、拟松材线虫(B. mucronatus)Hsp70部分
序列的同源性分别为 77. 27%、78.07%、78. 98%、
79.55%ꎬ说明具有较高的同源性ꎮ 进而通过 RACE ̄
PCR技术分别获得 1 385 bp 的3′端序列(图 2)和
544 bp的 5′端序列(图 3)ꎮ 最后利用 DNAMAN 6.0
Fig. 1 RT ̄PCR of Meloidogyne enterolobii Hsp70
M: DNA marker2000ꎻ Lane 1 and 2: Partical sequence of Hsp70.
Fig. 2 3′RACE of Meloidogyne enterolobii Hsp70
M: DNA marker2000ꎻ Lane 1 and 2: The fragment of 3′RACE.
Fig. 3 5′RACE of Meloidogyne enterolobii Hsp70
M: DNA marker2000ꎻ Lane 1: The fragment of 5′RACE.
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植物病理学报 45卷
软件将相互重叠的 3 段序列进行拼接ꎬ得到
2 203 bp的全长 cDNA 序列ꎬ并命名为 MeHsp70
(GenBank登录号为:KF739434 )ꎮ
2.2 序列分析
经 BioXM 2.6 生物软件分析ꎬMeHsp70 全长
cDNA为 2 203 bpꎬ5′末端有 49 bp 的非翻译区ꎬ3′
末端有 195 bp 非翻译区并含有一个短的 polyA 尾
巴ꎬ开放阅读框(ORF) 长度为 1 959 bpꎬ编码 653
个氨基酸ꎬ预测编码蛋白质的分子量为 71.09 kDaꎬ
等电点为 5.29ꎮ MeHsp70 氨基酸序列中含有真核
生物 Hsp70 家族蛋白的三个标签序列(9 ~ 16 位的
IDLGTTYSꎬ 198 ~ 211 位的 IFDLGGGTFDVSILꎬ
335~348位的 IVLVGGSTRIPKVQ)和胞质型 Hsp70
所特有的末端高度保守序列EEVD[8ꎬ9] (图4) ꎮ与
Fig. 4 Nucleotide and deduced amino acid sequence of Meloidogyne enterolobii Hsp70 cDNA
Lowercase represents 5′ and 3′ untranslation regionꎻ Capital represents translation regionꎬ above: nucleotide sequenceꎬ
below: amino acid sequenceꎻ The initiation codon are overlinedꎻ Asterisks mark termination codonꎻ
Signature sequences are indicated byboldꎻ The EEVD motif are framed.
01
1期 练冬梅ꎬ等:象耳豆根结线虫 Hsp70基因的克隆与原核表达
GenBank中注册的全序列植物寄生线虫 Hsp70 以
及其他代表性真核生物的 Hsp70 基因所推导的氨
基酸序列进行对比ꎬ结果表明ꎬMeHsp70 与大豆孢
囊线虫(H. glycines)、马铃薯腐烂茎线虫(D. de ̄
structor)、松材线虫 (B. xylophilus)、拟松材线虫
(B. mucronatus)、秀丽隐杆线虫 (Caenorhabditis
elegans)、果蝇 (Drosophila melanogaster)和酵母
( Saccharomyce scerevisiae ) 的 同 源 性 分 别 为
92.07%、90.06%、88.21%、88.51%、86.37%、77.95%
和 75.04%ꎮ
2.3 进化分析
将本研究所获得的 MeHsp70 氨基酸全长序列
与 GenBank中注册的大豆孢囊线虫(H. glycines)、
马铃薯腐烂茎线虫(D. destructor)、马来丝虫(Bru ̄
gia malayi)、班氏吴策丝虫 (Wuchereria bancrof ̄
ti)、和指状腹腔丝虫(Setaria digitata)等真核生物
的 Hsp70ꎬ弗氏志贺菌(Shigella flexneri)、鼠疫杆菌
(Yersinia pestis)、大肠杆菌(Escherichia coli)等原
核生物ꎬ采用 MEGA4ꎬ以邻位相连法(Neighbor ̄
JoiningꎬNJ)构建进化树ꎬ多序列比对等参数的设
置采用默认设置值(图 5)ꎮ 结果表明ꎬ来自真核生
物的 Hsp70 聚为一支ꎬ来自原核生物的 Hsp70 形
成另一支ꎻ在真核生物中ꎬ动物寄生线虫 Hsp70 聚
为一支ꎬ而同属于植物寄生线虫的松材线虫
(B. xylophilus)、拟松材线虫(B. mucronatus)未与
马铃薯腐烂茎线虫(D. destructor)、M. enterolobii、
大豆孢囊线虫(H. glycines)形成一支ꎮ
2.4 目的融合蛋白的表达
重组表达载体质粒的 PCR 产物约为 2 kB(图
6)ꎬ进一步通过测序证实 MeHsp70 基因已定向插
入 pEASY ̄E1的多克隆位点ꎬ且读码框正确无误ꎮ
将构建好的重组质粒转化 BL21(DE3) 工程菌ꎬ进
行工程菌诱导表达 MeHsp70ꎮ 经 SDS ̄PAGE 分析
(图 7)ꎬ与空载体相比ꎬ IPTG 终浓度为 0. 4、0. 8、
1.0 mmol / L时ꎬ能显著诱导重组质粒表达出约 71
kDa左右的融合蛋白ꎬ其分子量经 Quantity One
4.6.6软件预测ꎬ结果为 71.00 kDaꎬ说明 MeHsp70
融合蛋白表达成功ꎮ
Fig. 5 Phylogenetic tree of Hsp70 from different species
The species′names and the GenBank Accession numbers of different Hsp70s: Heterodera glycines(AAN78300)ꎬ Ditylenchus
destructor(AEP19214)ꎬ Bursaphelenchus xylophilus(ABG74349)ꎬ B. mucronatus(ACU00685)ꎬ B. malayi(XP_001900197)ꎬ
Wuchereria bancrofti(AAF32254)ꎬ S. digitata(AAD13154)ꎬ Caenorphabditis elegans(AAA28078)ꎬ Yersinia pestis(NP_671003)ꎬ
Shigella flexneri(NP_705973)ꎬ C. koseri(YP_001454892)ꎬ E. coli(YP_001456799)ꎬ C. briggsae(XP_002632429)ꎬ
D. medinensis(ADI54942)ꎬ C. curvatus(CAA72797) . The values of branches represent evolutionary distance.
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植物病理学报 45卷
Fig. 6 Identification of pEASY ̄E1 ̄MeHsp70
transformant by PCR
M: DNA marker2000ꎻ Lane 1 ̄3: Transformant.
Fig. 7 Detecting the pEASY ̄E1 ̄MeHsp70
expression in prokaryotic cell by
SDS ̄PAGE
M: Protein markerꎻ 0: pEASY ̄E1 induced for 3 h with
1.0 mmol / L IPTGꎻ 1ꎬ 2 and 3: pEASY ̄E1 ̄MeHsp70 induced
for 3 h with 0.4ꎬ 0.8 and 1.0 mmol / L IPTGꎬ respectively.
3 讨论
Hsp70 是所有原核生物和真核生物在发育过
程中为了适应不同环境而合成起关键作用的蛋白
质家族ꎮ 试验首次克隆了 M. enterolobii 的 Hsp70
基因ꎬ其在氨基酸水平上与其他线虫的同源性均在
80%以上ꎬ具有较高的同源性ꎬ这证实了 Hsp70 基
因在不同的生物中具有很强的保守性ꎮ 研究发现ꎬ
在 C. elegans 中ꎬ当温度从 25℃ 升到 33℃ 后ꎬ
Hsp70能够迅速增加 2倍多[10]ꎮ 在 B. malayi的三
龄幼虫中ꎬ当温度从 28℃升到 42℃后ꎬ45 min 内
Hsp70增加了 2倍多ꎬ与 37℃高温诱导上调程度一
样ꎬ而且随着高温处理时间的延长继续增加[11]ꎮ
因此ꎬMeHsp70的克隆将为我们进一步研究M. en ̄
terolobii 适应温度逆境的机制开辟了一条途径ꎮ
该研究还将克隆得到的 MeHsp70 基因转化到表达
载体中ꎬ发现浓度为 0.4 ~ 1.0 mmol / L 的 IPTG 均
能显著诱导目的蛋白的融合表达ꎬ重组蛋白的表达
将更有利于有关 MeHsp70基因及其产生蛋白的相
关性质和功能研究ꎮ 同时ꎬMeHsp70 基因的克隆
也有利于线虫与寄主植物的互作机制的研究ꎮ
以不同物种间的 Hsp70s 为研究对象ꎬ分析了
Hsp70系统进化关系ꎮ 结果显示ꎬ以 Hsp70 为对象
构建的物种系统进化树不能很好的反映物种间的
亲缘关系:虽然 Hsp70 能够将真核生物、原核生
物、动物寄生线虫具为一支ꎬ但同属于植物寄生线
虫的 B. xylophilus、B. mucronatus 未与 D. destruc ̄
tor、M. enterolobii、H. glycines形成一支ꎬ而是另成
一支(图 4)ꎬ这与以核糖体 ITS序列建立的植物寄
生线虫系统进化分析结果不符[12]ꎮ 由于 Hsp70 是
多基因家族ꎬ且具有生物学功能的多样性ꎬ可以推
测以 Hsp70构建系统进化树的分析结果并非反映
了物种间的亲缘关系ꎬ而是 Hsp70 功能相似性的
分析ꎮ
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责任编辑:曾晓葳
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