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MoCOS1 regulates the expression level of MoCMR1 in rice blast fungus Magnaporthe oryzae

稻瘟病菌MoCOS1基因调控MoCMR1基因表达的研究



全 文 :植物病理学报
ACTA PHYTOPATHOLOGICA SINICA  44(3): 239 ̄246(2014)
收稿日期: 2013 ̄06 ̄06ꎻ 修回日期: 2014 ̄02 ̄14
基金项目: 国家自然科学基金资助项目(31260418)
通讯作者: 何朝族ꎬ研究员ꎬ主要从事植物 ̄病原微生物相互作用研究ꎻTel:0898 ̄66160728ꎬE ̄mail: czhe@hainu.edu.cn
第一作者: 韩秀秀ꎬ女ꎬ山东济宁人ꎬ硕士研究生ꎬ主要从事植物病原真菌基因功能研究ꎻE ̄mail: hanxiuxiu_1987@126.comꎮ
稻瘟病菌 MoCOS1基因调控
MoCMR1基因表达的研究
韩秀秀ꎬ 李晓宇ꎬ 何朝族∗
(海南大学农学院ꎬ海南省热带生物资源可持续利用重点实验室ꎬ 海口 570228)
摘要:以往研究证明 MoCOS1可能是一个新型的转录因子ꎬ其突变体不产生分生孢子ꎬ黑色素合成明显减少ꎮ 经过 RNA ̄
Seq分析ꎬ发现受 MoCOS1调控的基因达到 442个ꎬ其中 MoCMR1的表达水平受到 MoCOS1的下调ꎮ 本研究中通过实时定
量 PCR进一步证实 MoCOS1基因突变导致 MoCMR1基因表达水平下降ꎮ 基因 MoCMR1突变后ꎬ黑色素产量略有减少ꎬ但
分生孢子形态及产量和 MoCOS1的表达量没有发生变化ꎮ
关键词:稻瘟病菌ꎻ MoCOS1ꎻ 转录调控ꎻ MoCMR1
MoCOS1 regulates the expression level of MoCMR1 in rice blast fungus Magna ̄
porthe oryzae   HAN Xiu ̄xiuꎬLI Xiao ̄yuꎬHE Chao ̄zu  (College of Agricultureꎬ Hainan Universityꎬ Hainan
Key Laboratory for Sustainable Utilization of Tropical Bioresourcesꎬ Haikou 570228ꎬChina)
Abstract: The previous study found that MoCOS1 might function as a transcription factor. Mutant of MoCOS1
produced no conidiophore and less melanin in comparison with wild type strain Y34. RNA ̄Seq analysis revealed
that 442 genes were regulated by MoCOS1. Of themꎬ MoCMR1 was down ̄regulated. In this studyꎬ real ̄time
quantitative PCR analysis further confirmed that mutation of MoCOS1 down ̄regulated the expression level of
MoCMR1. Mutant of MoCMR1 had no obvious difference in quantity and shape of conidium. It was observed that
the mutant of MoCMR1 produced slightly less melanin. Howeverꎬ the expression of gene MoCOS1 in MoCMR1Δ
remained similar level with that of wild type strain Y34.
Key words: Magnaporthe oryzaeꎻ MoCOS1ꎻ transcriptional regulationꎻ MoCMR1
中图分类号: S432.44          文献标识码: A          文章编号: 0412 ̄0914(2014)03 ̄0239 ̄08
    稻瘟病菌属子囊菌属[1]真菌ꎬ可引起水稻产量
减少ꎬ严重时多达 30%[2]ꎬ严重威胁水稻产量和粮食
安全ꎮ 稻瘟病菌是研究真菌病原菌与植物互作的模
式真菌之一[3]ꎬ目前其基因组已经测序完成ꎬ将大大
地促进稻瘟病菌致病机理的研究[4]ꎮ
附着胞是稻瘟病菌的典型侵染结构ꎬ其内部会
产生甘油ꎬ沉积大量的黑色素ꎬ且黑色素的分布不均
匀ꎬ在细胞壁内表面形成黑色素层ꎬ使甘油等较大的
分子不能穿过ꎬ而像水等小分子可以通过ꎬ这就使附
着胞内积累很大的膨胀压ꎬ为附着胞穿透植物细胞
壁提供了压力基础[5 ̄6]ꎮ 因此附着胞的成熟和侵染
功能的完成离不开黑色素的合成ꎮ 黑色素合成缺陷
的突变体ꎬ其产生的附着胞缺少足够的膨压穿透寄
主植物的表皮细胞ꎬ也就失去了致病能力[7]ꎬ黑色素
是病原菌致病性和侵入寄主的前提条件ꎮ
炭疽病菌(Colletotrichum lagenarium)的 CMR1
是一种C2H2 型锌指结构的转录因子ꎬ调控黑色素的
合成ꎮ CMR1基因突变后导致菌丝黑色素积累的缺
 
植物病理学报 44卷
陷ꎬ但附着胞中的黑色素积累不受影响ꎮ CMR1 突
变体中ꎬ菌丝体黑色素化过程中黑色素合成基因
SCD1和 THR1不表达ꎬ但在附着胞黑色素化过程中
其表达没有变化[8]ꎮ
前期研究鉴定了一个分生孢子发生相关基因
MoCOS1( conidiophore stalk ̄less1) [9]ꎮ 通过 RNA ̄
Sequence (RNA ̄Seq) 技术分析显示ꎬ受MoCOS1调控
的基因有 442 个 [10]ꎬ其中 MoCMR1(MGG_07215.6)
受到MoCOS1的下调ꎬ说明 MoCOS1调控MoCMR1
的表达ꎮ 经生物信息学分析发现ꎬMoCOS1是一种
新型的调控因子ꎬ Gel Shift Experiments 证明
MoCOS1与 AAAAGAAA(A4GA3)保守序列可以
直接结合ꎬ调控着一条新的分生孢子发生途径[10]ꎮ
MoCOS1突变体(M2942)的黑色素产量明显减少[9]ꎬ
而MoCMR1调控着黑色素的表达ꎮ 本文旨在探究
MoCOS1 与 MoCMR1 的遗传关系ꎬ进一步了解
MoCOS1对分生孢子发生和黑色素合成途径的调控ꎮ
1  材料与方法
1.1  材料
1.1.1  植物材料   水稻品种日本晴(Orazy sativa
L.cv.Nipponbare)ꎮ
1.1.2  质粒和菌株   pGEM ̄T EasyVector 为 Pro ̄
mega产品ꎮ 大肠杆菌菌株为 DH5α购自北京艾德
莱生物科技有限公司ꎮ 稻瘟病菌野生型菌株 Y34、
M2942ꎬ基因敲除载体 pCB ̄1532ꎬ基因过表达载体
pSilent ̄1均由本实验室保存ꎮ
1.1.3  试剂盒、工具酶及生化试剂  真菌总 RNA
提取试剂盒购自 OMEGA 公司ꎮ 反转录试剂盒、
DNA回收试剂盒ꎬTaq DNA Polymerase 以及各种
限制性内切酶和 PCR 相关试剂均购自 Fermentas
公司ꎮ 引物合成均由上海英俊生物技术有限公司
合成ꎮ 测序由深圳华大基因科技有限公司完成ꎮ
其他试剂均为国产分析纯ꎮ
1.1.4  培养基  稻瘟病菌培养用燕麦培养基、CM
培养基(蛋白胨 6 g / L、酵母粉 6 g / L、蔗糖 10 g / L、
琼脂粉 15 g / L)和 SYM培养基(酵母粉 3 g / L、蔗
糖 3 g / L、淀粉 10 g / L、琼脂粉 15 g / L)培养ꎻ菌丝
用 CM 液体培养基ꎬ28℃、180 rpm 振荡培养ꎮ 原
生质体转化培养基为 DCM培养基(不含氨基酸的
酵母粉 1.7 g / L、天冬酰胺 2 g / L、蔗糖 200 g / L、琼
脂粉 15 g / L)ꎻSTC 溶液[山梨醇 1.2 mol / L、Tris ̄
HCl(pH 7.5)10 mmol / L、CaCl2 50 mmol / L]ꎮ
1.2  方法
1.2.1  MoCMR1 敲除载体的构建  根据数据库提
供的基因组序列ꎬ利用 Primer5.0 设计引物ꎬ上游片
段引物 CMR ̄UP ̄F 和 CMR ̄UP ̄Rꎬ下游片段引物
CMR ̄DOWN ̄F 和 CMR ̄DOWN ̄Rꎮ PCR 反应条
件:94℃ 5 minꎬ94℃ 30 sꎬ53℃ 1 minꎬ30 个循环ꎻ
72℃ 10 minꎬ克隆得到 MoCMR1 基因的上、下游片
段ꎮ 以 pGEM ̄T Easy载体作为初始载体ꎬ分两步连
接到基因敲除载体 pCB ̄1532上ꎬ经酶切验证得到稻
瘟病菌 MoCMR1 基因的敲除载体 (CMRU ̄pCB ̄
CMRD)ꎮ
1.2.2  稻瘟病菌MoCMR1过表达载体的构建  从稻
瘟病菌基因组数据库中获得基因MoCMR1的全长序
列ꎬ根据引物设计原则、载体上的酶切位点和基因序
列ꎬ设计引物 CMR1 ̄F 和 CMR1 ̄Rꎮ PCR 反应条件:
95℃ 5 minꎬ95℃ 30 sꎬ54℃ 3 minꎬ30个循环ꎻ72℃ 10
minꎬ克隆得到 MoCMR1的全长片段ꎮ 经 T 克隆ꎬ测
序正确后ꎬ用 Xho I / Kpn I将 MoCMR1片段切下ꎬ连
接到基因过表达载体 pSilent ̄1上ꎬ经酶切验证得到
MoCMR1基因的过表达载体(pSilent ̄CMR1)ꎮ
1.2.3  原生质体的制备及其转化  将幼嫩菌丝接
种于 50 mL CM 液体培养基上振荡培养 2 dꎬ然后
再扩大培养 1 dꎬ用 Miracloth过滤收集菌丝并尽可
能地挤掉多余液体ꎬ将菌丝体挑至溶壁酶溶液中ꎬ
裂解 2~3 h [溶壁酶(Sigma)溶液:10 mg / mLꎬ用 1
mol / L sorbitol 配制ꎬ过滤除菌] ꎮ 然后用 Mira ̄
cloth 过滤除去杂质ꎬ离心得到原生质体沉淀ꎬ用
STC溶液洗涤沉淀 2 次ꎬ再用适量的 STC 溶液溶
解ꎬ原生质体浓度 108 ~109 / mL[11]ꎮ
将 200 μL原生质体与 1 ~ 2 μg 质粒混匀ꎬ静
置 20 minꎬ然后加入 1. 5 mL 的 PTC 溶液 (40%
PEG3350ꎬSTC溶液)ꎬ混匀静置 20 minꎬ加入 5 mL
DCM液体培养基ꎬ室温振荡(120 rpm)12 hꎮ 将
培养物与 DCM 下层培养基混匀ꎬ倒板ꎬ放置
12 hꎬ然后再倒入上层培养基ꎮ 待菌丝长出上层
培养基时转移到新的筛选培养基上ꎬ进行复筛ꎬ
得到转化子ꎮ
042
 
  3期 韩秀秀ꎬ等:稻瘟病菌 MoCOS1基因调控 MoCMR1基因表达的研究
1.2.4  转化株的鉴定(PCR检测)   将转化子用 CM
液体培养基进行培养ꎬ收集菌丝ꎬ提取转化子的基因
组 DNA[12]ꎮ 用于 3对引物 F+R、UU+PI、PI1+DD进
行 PCR检测(图 1)ꎮ PCR的反应条件:95℃ 5 minꎬ
95℃ 30 sꎬ54℃ 3 minꎬ30个循环ꎻ72℃ 10 minꎮ
1.2.5  突变体表型鉴定
    (1) 菌落形态及生长速率   用打孔器取 0.6
mm的菌碟接种到燕麦培养基、CM培养基和 SYM
培养基上ꎬ28℃暗培养 7 dꎬ观察菌落形态并拍照ꎬ
测量菌落直径ꎮ 重复 3次ꎮ
(2) 分生孢子产量及形态   将稻瘟病菌接
种到燕麦培养基上ꎬ待菌丝铺满平板后ꎬ轻轻刮
去菌丝ꎬ然后持续光照 3 ~ 4 dꎬ用打孔器从培养基
边缘到中央分别取 3 块培养基ꎬ置于 3 mL 无菌
水中ꎬ充分振荡洗下分生孢子ꎬ过滤收集ꎬ拍照并
用细胞计数板计数ꎮ
(3) 致病力检测  取大小相等的菌碟倒置于
离体叶片上ꎬ28℃、保湿、持续光照培养 3 ~ 4 dꎬ观
察病斑状况ꎬ并拍照[13]ꎮ
1.2.6  过表达突变体的构建  将 pSilent ̄CMR1 质
粒用 SpeⅠ单酶切后ꎬ用 PEG 介导转入到 MoC ̄
MR1Δ的原生质体中ꎬ挑取转化子ꎬ用引物 CMR1 ̄
1+CMR1 ̄2进行检测ꎬ并与 Y34和MoCMR1Δ的表
型对比ꎬ观察其表型是否恢复ꎬ从而得到 MoCMR1
过表达突变体(MoCMR1 ̄OE)ꎮ
1.2.7  实时定量 PCR  提取稻瘟病菌 Y34、MoC ̄
MR1Δ和M2942的总 RNA后ꎬ用 oligo(dT) primer
andM  ̄MLVReverse Transcriptase ( Invitrogen ) ꎬ反
Fig. 1  Construction of MoCMR1 knockout mutation
A:Outline of knockout mutant MoCMR1Δꎻ B: Verification by PCR analysis with primers UU+PIꎻ
C: Verification by PCR analysis with primers F+Rꎻ D: Verification by PCR analysis with primers DD+PI1ꎻ
M: DL 2 000 bp markerꎻ CK: Blank control.
142
 
植物病理学报 44卷
转录成 cDNAꎮ 以野生型为对照ꎬβ ̄Tubulin为内参
基因ꎬCOS1 ̄F+COS1 ̄R、CMR1Fn+CMR1Rn 为引
物ꎬcDNA为模板ꎬ进行 RT ̄PCRꎮ
    以 Y34、MoCMR1Δ 和 M2942 的 cDNA 为模
板ꎬTubulin为内参基因ꎬCOS1 ̄1+COS1 ̄2、CMR1 ̄1
+CMR1 ̄2 为引物ꎬ用 ABI 7500 Real ̄time PCR
system进行 qRT ̄PCR[14]ꎮ 反应程序为 95℃ 30 s
(1个循环)ꎻ95℃ 5 sꎬ58. 5℃ 34 s(40 个循环)ꎻ
95℃ 15 sꎬ58.5℃ 60 sꎬ95℃ 15 s(1个循环)ꎮ 基因
的变化量计算公式 2-ΔΔCtꎬ其中-ΔΔCt = (Ctꎬ target
gene ̄Ctꎬ β ̄tubulin)-(Ctꎬ WT ̄Ctꎬ β ̄tubulin) [15]ꎮ
2  结果与分析
2.1  MoCMR1基因的敲除突变体构建与验证
为了构建 MoCMR1 基因的敲除突变体ꎬ通过
同源重组ꎬ将含有该基因上游和下游 DNA 片段的
载体(图 1 ̄A)转入野生型稻瘟病菌ꎬ共获得 278 个
MoCMR1基因候选突变体的转化子ꎬ分别提取基
因组 DNAꎬ以 F+R 为引物进行初步筛选ꎬ可扩增
出 1 000 bp左右条带(图 1 ̄C Y34)的转化子为假
阳性ꎬ其余转化子再用另外 2 对引物(UU+PI 引
物、DD + PI1 引物)进行鉴定ꎬ若分别能克隆出
1 400 bp和1 100 bp左右的条带(如图 1 ̄B CMR1、
图 1 ̄D CMR1)ꎬ可确定其为阳性转化子ꎮ
2.2  突变体表型鉴定
2.2.1  MoCMR1突变影响稻瘟病菌黑色素含量  与
野生 型 Y34 相 比ꎬ MoCMR1 敲 除 突 变 体
(MoCMR1Δ)、M2942 在燕麦培养基、完全培养基
和酵母淀粉培养基上的气生菌丝数量及形态基本
没有变化(图 2 ̄A)ꎬ且其菌落的生长速率也基本一
致(图 2 ̄B)ꎬ但 MoCMR1Δ 和 M2942 的黑色素产
量有所减少(图 2 ̄A)ꎮ 可见 MoCMR1 基因与稻瘟
病菌的营养生长不相关ꎬ但参与黑色素的合成ꎮ
2.2.2  MoCMR1 突变不影响稻瘟病菌分生孢子形
态及数量  将稻瘟病菌菌株的菌丝置于显微镜下观
察(图 3 ̄C)ꎬ结果显示:Y34、MoCMR1Δ、MoCMR1
过表达突变体(MoCMR1 ̄OE)的菌丝顶端都产生分
生孢子ꎬ但M2942的菌丝不产生分生孢子(图 3 ̄C)ꎮ
M2942能产生分生孢子梗ꎬ但不能产生分生孢子[9]ꎮ
将得到孢子悬浮液ꎬ于光学显微镜观察ꎮ MoC ̄
MR1Δ分生孢子的形状大小和数量与野生型相比较
并没有发生变化(图 3 ̄A)ꎮ 采用细胞计数板对菌株
的分生孢子进行计数ꎬ与野生型 Y34 相比ꎬMoC ̄
MR1Δ的分生孢子数目基本没有变化(图 3 ̄B)ꎮ 可
见MoCMR1基因不参与稻瘟病菌分生孢子发生ꎮ
2.2.3  MoCMR1突变导致稻瘟病菌致病性丧失  将
用打孔器取培养 7~8 d的稻瘟病菌菌株ꎬ倒扣于水
稻叶片上 ꎬ2 8℃保湿培养 3 ~ 4 d后 ꎬ与野生型
Fig. 2  Colony morphology and growth rate of different strains of Magnaporthe
A: Colonies grown in SYM mediumꎻ B: Growth rate of MoCMR1Δꎬ M2942 and wild type strain Y34 in different media.
242
 
  3期 韩秀秀ꎬ等:稻瘟病菌 MoCOS1基因调控 MoCMR1基因表达的研究
Y34 相比ꎬM2942 的致病性相对增强ꎬ而接种
MoCMR1Δꎬ不产生病斑(图 4)ꎬ其致病性丧失ꎬ表
明 MoCOS1 对稻瘟病菌的致病性起到负调控作
用ꎬ而 MoCMR1对致病性起到正调控作用ꎮ
Fig. 3  Conidial morphology and quantity of Y34 and MoCMR1Δ
A: Conidial morphologyꎻ B: The conidia quantityꎻ C: Mycelial morphology. No deference
was observed in the conidial morphology and quantity of Y34 and MoCMR1Δ.
Fig. 4  Mycelial infection on rice leaf
Mycelia of M2942 caused serious lesionsꎻ Mycelia of Y34 caused weak lesionsꎻ while mycelia of
MoCMR1Δ caused no lesions in leafꎻ CK:Blank control.
342
 
植物病理学报 44卷
2.2.4  MoCOS1正调控 MoCMR1的转录  本研究
提取稻瘟病菌 Y34、MoCMR1Δ 和 M2942 的总
RNA后ꎬ反转录成 cDNAꎬ以野生型为对照ꎬTubu ̄
lin为内参基因ꎬ进行实时定量 PCR 分析ꎮ 结果表
明ꎬ与野生型相比ꎬ在 M2942 突变体中 MoCMR1
的表达量明显减少(图 5)ꎬ这与 RNA ̄Seq 的结果
基本一致ꎬ说明 MoCOS1 突变后 MoCMR1 的表达
量下降ꎮ 同时ꎬ与野生型比较ꎬ在 MoCMR1 敲除突
变体中 MoCOS1 的表达量基本没有发生变化(图
5)ꎬ说明 MoCOS1单向调控着 MoCMR1 基因的表
达ꎮ 结合 MoCMR1 启动子序列中并不存在 Mo ̄
COS1的保守结合序列 A4GA3ꎬ推测MoCOS1可能
不是直接与 MoCMR1 的启动子区结合ꎬ而是间接
调控 MoCMR1的表达ꎮ
Fig. 5   Comparative analysis of expression
level of MoCMR1 and MoCOS1
In MoCOS1 mutant (M2942)ꎬ the expression level of MoC ̄
MR1 was down ̄regulated( log2 ratio(M2942 / Y34)= -3.78ꎬ
while in MoCMR1Δ ꎬ the expression level of MoCOS1 was
not changed( log2 ratio(MoCMR1Δ / Y34)= 0.260) .
2.2.5  MoCMR1过表达突变体的获得  为了证实
突变体的表型是由于 MoCMR1 基因突变所致ꎬ在
MoCMR1Δ转入过表达 MoCMR1 基因ꎬ获得阳性
转化子ꎮ MoCMR1 过表达转化子(MoCMR1 ̄OE)
的菌丝形态(图 3 ̄C MoCMR1 ̄OE)、致病性(图 4
MoCMR1 ̄OE)、黑色素产量(图 6)基本得到恢复ꎬ
证实了 MoCMR1的敲除导致黑色素产量减少和致
病性的减弱ꎮ
Fig. 6  Melanin production in different strains
of Magnaporthe oryzae
Similar melanin was produced in Y34 and MoCMR1 ̄OEꎬ
while less melanin in MoCMR1Δ.
3  讨论
稻瘟病菌黑色素的合成(图 7)ꎮ ALB1、RSY1
和 BUF1 3个基因的克隆证明了黑色素对附着胞
功能的重要性[16]ꎮ 基因 ALB1 编码一种多聚乙酞
合成酶ꎬ催化醋酸盐合成 4HNꎬ再通过 NADH 催
化ꎬ生成 scytaloneꎮ 基因 RSY1 编码 scytalone 脱水
酶ꎬ催化 scytalone 脱水生成 3HNꎮ 基因 BUF1 编
码一种 NADPH 脱氢酶ꎬ催化 3HN 生成 vermelo
ne ꎮVermelone经脱水生成2HN ꎬ最后合成黑色
Fig. 7  Fungal melanin biosynthetic pathway [18]
442
 
  3期 韩秀秀ꎬ等:稻瘟病菌 MoCOS1基因调控 MoCMR1基因表达的研究
素[17]ꎮ ALB1、 RSY1 和 BUF1 任何一个基因突变
后ꎬ突变体都产生不含黑色素的附着胞ꎬ失去致病
性[18]ꎮ
    M2942 在黑色素合成上具有明显的缺陷[7]ꎮ
而黑色素在很多病原性真菌的致病性方面都起到
重要作用ꎮ 在稻瘟病菌中ꎬ黑色素的形成需要
4HNR、 3HNR 和 SCD 共同的催化作用[19 ̄21]ꎮ
RNA ̄Seq数据显示 MoCMR1(MGG_07215.6)也受
到 MoCOS1 的下调 ( Log2Ratio (M2942 / Y34) =
-1.2) [10]ꎮ 其中 MoCMR1在黑色素产生过程中正
调控 3HNR 和 SCD 的表达[21]ꎮ 因此 M2942 和
MoCMR1Δ都存在黑色素合成缺陷ꎬ但 M2942 较
明显ꎮ
本研究构建了 MoCMR1 敲除突变体ꎬ通过表
型观察ꎬ发现 MoCMR1突变后ꎬ稻瘟病菌的营养生
长和分生孢子产生基本不受影响ꎬ但菌丝体失去致
病性ꎮ 通过实时定量 qRT ̄PCRꎬ证明了 MoCOS1
正调控 MoCMR1基因的转录表达ꎮ 但由于本实验
的转录表达分析中提取的 RNA 来自稻瘟病菌的
气生菌丝ꎬRNA ̄Seq 所用 RNA 来自液体培养菌
丝ꎬ可能所采用菌丝种类不同ꎬ得到的 M2942 中
MoCMR1表达变化量也不同ꎮ
本研究证明稻瘟病菌基因 MoCMR1 也参与菌
丝黑色素的积累ꎬMoCOS1 正调控 MoCMR1 的表
达ꎬ但两者之间的遗传关系还需要进一步的研究ꎮ
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责任编辑:于金枝
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