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Dynamic QTL Analysis for Kernel Dry Matter Accumulation in Wheat

小麦籽粒干物质积累的动态QTL定位



全 文 :书西北植物学报!
"#$
!
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"
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#$
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!"#$%&#%&()$*+,""-.)/#0-/
!!
文章编号$
#""")$"!
"
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#
"&)##")"*
!!!!!!!!!!!!!!!
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$
#"+*&"&
%
,
+-../+#""")$"!+!"#$+"&+##"
收稿日期$
!"#$)"!)#&
&修改稿收到日期$
!"#$)"$)%"
基金项目$国家高技术研究发展计划"
0&%
#项目"
!"##11#"""#
#&西北农林科技大学唐仲英植物育种基金&陕西省农业厅小麦种质资源保
护项目
作者简介$李美霞"
#22#(
#!女!在读硕士研究生!主要从事数量性状遗传研究
3)45-6
$
47-8-5#"#2
!
#&%+9:4
"
通信作者$刘曙东!教授!硕士生导师!主要从事小麦遗传育种研究
3)45-6
$
6-;.<=%!
!
#&%+9:4
小麦籽粒干物质积累的动态
$
%&
定位
李美霞!沈玮囡!杨
!
睿!梁子英!孙风丽!奚亚军!王竹林!刘曙东"
"西北农林科技大学 农学院!陕西杨陵
*#!#""
#

!
要$以波兰小麦品系(
>?
)与普通小麦品系(中
#%
)杂交产生的
22

@
#"
重组自交系"
ABC.
#为材料!构建了
包含
!$#

DDA
分子标记的
1
*
E
染色体组
#$
个连锁群的遗传图谱!并采用
C:
F
-.G-9
方程拟合籽粒灌浆过程!对
粒重增长的缓慢增长期*快速增长期和平稳期进行千粒重条件
HIC
和非条件
HIC
定位分析结果显示$"
#
#在小

1
*
E
染色体组上共检测到

个非条件
HIC


个条件
HIC
"
!
#在小麦粒重缓慢增长期和快速增长期各有
!
个非条件
HIC
!平稳期有
#
个非条件
HIC
!它们分别位于
!E
*
%1
*
%E

*1
染色体上!单个
HIC
可解释表型变异

2+&&J
"
#+#0J
"
%
#在小麦粒重快速增长期检测到
#
个条件
HIC
!平稳期检测到
$
个条件
HIC
!涉及
#1
*
!E
*
E

*E
染色体!单个
HIC
可解释表型变异的
#%+"#J
"
!2+!*J
"
$
#于
!E
染色体
>K5L9%&#
"
>M49$!!

记区间距
>K5L9%&#
标记
"+"9N
处!在粒重快速增长期同时检测到一个条件
HIC
和非条件
HIC
!且在平稳期检
测到一个非条件
HIC
研究表明!小麦不同灌浆时期粒重增长相关
HIC
的数量和遗传效应各不同!同一
HIC

不同灌浆时期的遗传效应也不同!即
HIC
的表达具有时序选择性
关键词$小麦&干物质积累&粒重&动态
HIC
中图分类号$
H%$%+#
O
*
文献标志码$
1

(
)*+#,
$
%&-)*.
(
/#/0"1231)3.1
(
4*5531-,,6+6.*5#")#)783*5
CBN7-8-5
!
DP3? Q7-/5/
!
R1?SA;-
!
CB1?ST-
U
-/
F
!
DV?@7/
F
6-
!
>BR5
,
;/
!
Q1?ST<;6-/
!
CBVD<;=:/
F
"
"
W:67
F
7:X1
F
L:/:4
U
!
?:LGU
!
R5/
F
6-/
F
!
D<55/8-*#!#""
!
W<-/5
#
-9/51*,5
$
1
F
7/7G-945
[
9:4
[
:.7=:X#$6-/\5
F
7
F
L:;
[
.-/96;=-/
F
1
F
7/:475/=E
F
7/:47M5.9:/.GL;9G7=
M-G"
D-4
[
67D7
]
;7/97A7
[
75G
#
45L\7L.K
U
;.-/
F
5
[
:
[
;65G-:/9:/.-.G7=:X22@
#"
L79:4K-/5/G-/)
KL7=6-/7.
"
ABC.
#
=7L-Z7=XL:459L:..:X!"#$#%&
(
)*)+#%& C+6-/7
(
>?
)
5/=!"#$#%&,-.$#/& C+
6-/7
(
T<:/
F
#%
)
+Q-G<
F
L:MG<9;LZ7X-GG-/
F
:XC:
F
-.G-97
]
;5G-:/
!
9:/=-G-:/565/=;/9:/=-G-:/56HIC.X:L
G<:;.5/=)
F
L5-/M7-
F
[
7L-:=:X.6:M
F
L:MG<
!
L5
[
-=
F
L:MG<5/=
[
65G75;
[
<5.7M7L7=7G79G7=+
"
#
#

;/9:/=-G-:/56HIC.5/=9:/=-G-:/56HIC.X:LG<:;.5/=)
F
L5-/M7-
F
F
7/:475/=E
F
7/:47-/G:G56+
"
!
#
X^;/9:/=-G-:/56HIC.
!
GM:HIC.M7L7X:;/=-/G<7
[
7L-:=:X.6:M
F
L:MG<5/=L5
[
-=
F
L:MG<759<5/=:/7HICM5.X:;/=-/G<7
[
65G75;
[
<5.7
!
5..:9-5G-/
F
M-G<9!
%1
!
%E5/=
*1+I<7
[
<7/:G
U[
-99:/GL-K;G-:/:X-/=-Z-=;56;/9:/=-G-:/56HICM5.-/G<7L5/
F
7:X2+&&J
"
#+#0J+
"
%
#
X^9:/=-G-:/56HIC.
!
:/7HICM5.=7G79G7=-/G<7
[
7L-:=:XL5
[
-=
F
L:MG<5/=X:;LM7L7=7G79G7=-/G<7
[
65G75;
[
<5.7
!
-/Z:6Z-/
F
9!
E
!
E5/=*E
!
L7.
[
79G-Z76
U
+I<7
[
<7/:G
U[
-99:/GL-K;G-:/:X-/=-)
Z-=;569:/=-G-:/56HICL5/
F
7=XL:4#%+"#JG:!2+!*J+
"
$
#
/^7;/9:/=-G-:/56HIC5/=:/79:/=-G-:/56
HIC-/G<7
[
7L-:=:XL5
[
-=
F
L:MG<
!
5.56:/
F
M-G<:/7;/9:/=-G-:/56HIC-/G<7
[
65G75;
[
<5.7
!
M7L7=7G79)
G7=K7GM77/45L\7L.>K5L9%/=>M49$!!M-G<5=-.G5/97:X"+"9N5M5
U
XL:445L\7L>K5L9%&#:/
9U
45GG7L599;4;65G-:/:XM<75G\7L/76.
!
/;4K7L.:XHIC.5/=G<7
F
7/7G-97XX79G.:X
G<7.547HICM7L7=-XX7L7/G-/=-XX7L-/
FF
L5-/X-6-/
F[
7L-:=.
!
M<-9<-/=-95G7=G-47)=7
[
7/=7/G5/=.7)
]
;7/97=78
[
L7..-:/:XHIC.+
23
(
:"1!/
$
M<75G
&
=L
U
45GG7L599;4;65G-:/
&
G<:;.5/=)\7L/76M7-
F
&
=
U
/54-9HIC
!!
小麦是世界主要粮食作物之一!其产量丰欠直
接关系到世界粮食安全小麦粒重属于典型的数量
性状!相对于其他产量构成因素!受环境条件影响较
小!一直受到高产育种的重视+#,随着分子标记技
术日臻完善!使得在整个基因组上分析数量性状位
点"
HIC
#成为可能!
HIC
定位分析是目前最有效的
数量性状遗传分析方法!较之传统的遗传分析!能精
确地分析控制性状的基因位点数目*每个基因位点
位置及其效应+!,有关小麦粒重
HIC
的研究已有
很多报道
_5G-6
等+%,利用重组自交系"
L79:4K-/5/G
-/KL7=6-/7.
!
ABC.
#在

个不同的环境中检测到
##
个与粒重相关的
HIC
!分别位于
!E
*
!1
*
$E

*1
染色体!单个
HIC
可解释表型变异的
*+0&J
"
!%+*"J

A54
U
5
等+$,在
#1
*
#`
*
!E
*
!`
*
$E
*
E

&E
染色体上检测到
#"
个与粒重相关的
HIC

瑞霞等+,在多个环境中检测
ABC
群体!共得到了
%
个粒重相关的
HIC
位点!单个
HIC
可解释表型变
异的
$+%&J
"
#&+0"J
!涉及小麦
#1
*
#E
*
!1
*
!`
*
%1
*
%E
*
$1
*
$`
*
1
*
E
*
&`

*`
染色体!并且在
#E
*
!1

%E
上检测到稳定的
HIC
位点严峻
等+&,利用四倍体小麦在
#1

$E
染色体上检测到
与粒重有关的
HIC
陈佳慧等+*,利用重组自交系
群体!检测到
&
个粒重
HIC
位点!单个
HIC
可解
释表型变异的
&+""J
"
!+""J

上述有关小麦粒重
HIC
的研究均是以成熟后
最终粒重表型值进行的传统
HIC
定位分析!所反
映的是诸多基因在整个发育过程中表达效应的累积
作用!属于静态定位然而!许多生物性状是动态的
或渐进发育的!称为发育性状或动态性状!在整个生
长发育过程中随时空变化吴为人+0,*朱军等+2,提
出了动态
HIC
概念及其分析方法!将发育性状分
为不同的生长阶段!将根据某一发育阶段总增长量
检测出的
HIC
定义为非条件
HIC
!而将根据其在
上一阶段基础上的净增长量所检测出的
HIC
定义
为条件
HIC
!据此可有效地检测出不同发育时段内
基因表达的净效应!从基因网络的角度探索数量性
状发育过程中基因表达的时空差异特性!更详尽地
揭示数量性状发育过程的遗传作用机理近年来!
已有一些小麦动态性状的
HIC
研究报道!如谷蛋
白膨胀指数*株高和蛋白质含量相关性状的条件
HIC
和非条件
HIC
定位+#")#%,有关小麦千粒重的
动态
HIC
分析目前仅见王晖等+#$,的研究报道!他
们利用(
&"$$
)和(
"#)%
)构建
ABC
群体!从花后
#"=
起每隔
=
为一个观测时间点!在
!
种环境条件下共
检测到
!
个穗粒重动态
HIC

#$
个千粒重
HIC
!单

HIC
可解释表性变异的
#+""J
"
!+""J

然而!已有的关于小麦动态
HIC
的研究报道
都是人为划分性状表型值观测时间点!所定位出的
HIC
虽然能在某种程度上反映性状发育不同阶段
可能存在的基因"
HIC
#位点!但不能很好地拟合性
状表达变化特点众多研究表明!小麦籽粒干物质
积累过程中粒重变化呈典型的-
D
.型曲线!可划分
成区别明显的缓慢增长期*快速增长期和平稳期
%
个时期+#,本研究采用
C:
F
-.G-9
方程拟合小麦籽
粒干重增长过程!以缓慢增长期*快速增长期和平稳

%
个时期为性状表型值观测时间点!分析小麦千
粒重的动态
HIC
!以期更好地理解小麦籽粒干物质
积累遗传规律和发育遗传机理!为小麦高产育种提
供更详细的理论依据
#
!
材料和方法
;+;
!

!

;+;+;
!
小麦材料
!
波兰小麦"
!"#$#%&
(
)*)+#%&
C+
#品系(
>?
)和普通小麦"
!"#$#%&,-.$#/&
C+
#品系(中
#%
)杂交产生
@
#
!
@
#
自交形成
@
!

由于
@
#
是异源五倍体!高度不育!自交结实率一般
只有
#"+""J
"
!"+""J
!
@
!
及其以后世代育性逐步
恢复正常!并采用单粒传法获得
@
#"
代重组自交系群
体!共有
22
个株系所有株系经过细胞学检测均为
!/a$!
条染色体!其中
1
*
E
染色体组来自波兰小
麦和普通小麦杂交重组!
`
染色体组完全来自普通
小麦品系(中
#%
)
+
#&
,
上述亲本和重组自交系群体
均由西北农林科技大学小麦分子育种课题组提供
;<;<=
!
>>?
引物
!
由于本研究所用
ABC
群体只有
&"##
西
!

!

!

!

!

!!!!!!!!!!!!!!!!!!!
%$

1和
E
染色体组是由波兰小麦品系(
>?
)与普
通小麦品系(中
#%
)杂交重组的!因此!只选用
1

E
染色体组上的
DDA
标记!包括
>M49
*
>9X5
*
>9X=
等系列共
2
对引物引物序列参照
[
$%%
MMM+M<75G+
[
M+;.=5+
F
:Z
网站信息!由北京奥科
生物技术有限责任公司合成!基因定位信息见
G
[
$%%
MMM+SL5-/S7/7.+:L
F
网站
;+=
!

!

;+=+;
!
田间种植和性状调查
!
!"#!

#"
月上旬

22
个重组自交系和
!
个亲本播种于西北农林科
技大学实验农场!随机区组设计!
%
次重复! 行区!
行长
#4
!行距
!94
!株距
&94
!田间管理同大田
生产开花期选择发育正常*无病*大小基本一致*
中上部小穗刚开花的麦穗挂牌标记!每个重组自交
系至少标记
$"
个麦穗花后
$=
第一次取样!之后
每隔
=
取样一次!直至成熟每个重组自交系每
次取

穗!剥取小穗两侧基部籽粒称其鲜重!然后
#"b
杀青
#"4-/
!
&"b
烘干至恒重!称取干重并
换算成千粒重
;+=+=
!
数学模型拟合
!

C:
F
-.G-9
方程
0a1
%"
#
O5-
(K$
#"
1
为最大千粒重!
$
为开花后天数!
5

K
为常数#对粒重增长过程进行拟合+#*)#2,!对
C:
F
-.G-9
方程求二阶导数!得到由缓慢增长期进入到快速增
长期的时间拐点"
$
#
#和由快速增长期进入到平稳期
的时间拐点"
$
!
#将
$
#

$
!
代入方程
0a1
%"
#O
5-
(K$
#分别求得缓慢增长期和快速增长期结束时的
千粒重"
ISQ
#

ISQ
!
#!成熟后的最终千粒重作
为平稳期结束时的千粒重"
ISQ
%
#
ISQ
%
)ISQ
!

ISQ
!
)ISQ
#
的差值分别作为平稳期和快速增
长期的粒重净增长量"
ISQ
%)!

ISQ
!)#
#
;<=<@
!
A-
的提取
!
田间苗期每个重组自交系取
幼嫩叶片
#
F
左右!采用
WI1E
法+!",提取
?`1


#J
的琼脂糖凝胶电泳检测
?`1
质量!分光光度

?5/:`L:
[
!"""
检测
?`1
浓度!并稀释成
"
#
F
%
#
C
的浓度用于
_WA
扩增
;<=!
>>?
分析
!
利用
EB^)A1`
公司生产的
_WA
仪筛选在双亲间具有多态性的
DDA
引物!并对
筛选出的多态性引物在
ABC
群体中进行扩增反
应总体系为
!
#
C
!
#"cE;XX7L!+
#
C
!
N
F
W6
!
"
!
44:6
%
C
#
+0
#
C
!
=?I_.
"
!44:6
%
C
#
"+0
#
C
!
DDA
引物"
#"
#
4:6
%
C
#
"+%
#
C
!
!,
2

"+#
#
C
!模板
?`1#+"
#
C
!
==P
!
^#"+"
#
C
!液体石蜡油覆盖
_WA
扩增程序为
2$b
预变性
%4-/
&
2$b
变性
#
4-/
&
"b
%
b
%
&"b
%
&b
"因引物而异#复性
$
.
&
*!b
延伸
#4-/
&循环
%
次&
*!b
延伸
#"4-/
&
降至
#"b
保存用
&J
变性聚丙烯酰胺凝胶电泳
分离!银染显影
;<=!
遗传连锁图谱构建和
$
%&
定位
!
根据
DDA
扩增结果!与波兰小麦品系(
>?
)相同的带型记
作-
1
.!与普通小麦品系(中
#%
)相同的带型记作
-
E
.!杂合*缺失或者模糊带型记作-
(
.整合本试
验和课题组之前发表的结果+#&,!采用
N5
[
45\7L
%
3>_%+"
软件构建更加饱和的连锁遗传图谱利用
Q-/HICW5LG:
F
L5
[
软件采用复合区间作图
法定位
ISQ
#
*
ISQ
!

ISQ
%
千粒重非条件
HIC
运用条件变量分析方法+2,结合复合区间作
图法定位
ISQ
!)#
*
ISQ
%)!
千粒重条件
HIC

C^ `
阈值设定为
!+

HIC
的命名参照
N9W:;9<
等+!#,
的命名法!即-
HO
性状名称缩写
O
染色体
O
编号
"如同一染色体有多个
HIC
#.
;+@
!
数据处理

D1D
"
Q-/=:M.?Id7L.-:/
#和
38976!""*
对表型数据进行统计处理
!
!
结果与分析
=+;
!
各灌浆时期重组自交系间千粒重的表型差异
分析
对缓慢增长期*快速增长期和平稳期
%
个时期
结束时的千粒重"
ISQ
#
*
ISQ
!

ISQ
%
#以及快
速增长期和平稳期的粒重净增长量"
ISQ
!)#

ISQ
%)!
#进行重组自交系间差异显著性分析!结果
列于表
#
由表
#
可以看出!
%
个时期的千粒重以及

;
!
各灌浆时期千粒重和粒重净增长量的表型差异
I5K67#
!
_<7/:G
U[
-9=-XX7L7/97:XG<:;.5/=)
F
L5-/
M7-
F
F
L5-/M7-
F
表型
_<7/:G
U[
7
平均值
N75/
变化范围
A5/
F
7
变异系数
W:7XX-9-7/G:X
Z5L-5G-:/
%
J
ISQ
#
##+*"e"+2#
""
"+2
"
#+$* *+0"
ISQ
!
$%+&$e%+!2
""
%+&%
"
+!" *+"
ISQ
%
$2+%"e%+!
""
%+*&
"
+& *+#"
ISQ
!)#
%#+2$e!+$%
""
!+&0
"
%+0% *+&"
ISQ
%)!
+20e#+!0
""
"+#&
"
"+0$ #2+""
!!
注$
""
+
表示重组自交系间差异达到
"+"#
显著水平&
ISQ
#
*
ISQ
!

ISQ
%
分别表示小麦粒重缓慢增长期*快速增长期和平稳期的千粒重&
ISQ
!)#

ISQ
%)!
分别表示快速增长期和平稳期的粒重净增长量
?:G7
$
""
.G5/=X:L.-
F
/-X-95/G=-XX7L7/9754:/
F
ABC.5G"+"#67Z76
&
ISQ
#
*
ISQ
!
5/=ISQ
%
L7
[
L7.7/GG<7G<:;.5/=
F
L5-/M7-
F
F
G<7
[
7L-)
:=:X.6:M
F
L:MG<
!
L5
[
-=
F
L:MG<5/=
[
65G75;
[
<5.7
!
L7.
[
79G-Z76
U
&
ISQ
!)#
5/=
ISQ
%)!
L7
[
L7.7/G/7G-/9L75.7:X
F
L5-/M7-
F
[
7L-:=:XL5
[
-=
F
L:MG<
5/=
[
65G75;
[
<5.7+
*"##
&

!!!!!!!!!!!!!!
李美霞!等$小麦籽粒干物质积累的动态
HIC
定位
快速增长期和平稳期的粒重净增长量在重组自交系
间都达到了极显著差异
ISQ
#
*
ISQ
!

ISQ
%

变异系数分别为
*+0"J
*
+"J

*+#"J
粒重净增
长量
ISQ
!)#

ISQ
%)!
的变异系数分别为
*+&"J

#2+""J
说明
%
个时期的千粒重和快速增长期及平
稳期的粒重净增长量在重组自交系间存在真实而丰
富的遗传变异!满足数量性状遗传分析要求
=<=
!
-
*
D
染色体组的遗传图谱构建
2

1
*
E
染色体组上的
DDA
引物中共检测

!!%
对在双亲"波兰小麦品系(
>?
)和普通小
麦品系(中
#%
)#间有差异!用这
!!%
对引物检测
ABC
群体!共有
##$
对引物表现出多态性!多态性检
出率为
#+!#J
将这
##$
个标记与杨睿等+#&,发表
的遗传图谱进行整合!构建
1

E
染色体组的
#$
个连锁群的遗传图谱!共含有
!$#

DDA
标记图
谱全长
#%%0+2!9N
!标记间的平均遗传距离为
+&9N
平均每个连锁群含有
#*+!"
个标记!连
锁群最长的是
*E
染色体!达到
#0%+&*9N
!含有
!
个标记&最短的是
*1
染色体!只有
%*+$09N
!含有
#%
个标记
=<@
!
各灌浆时期的千粒重
$
%&
分析
=<@<;
!
非条件
$
%&
!
依据小麦籽粒干物质积累的
缓慢增长期*快速增长期和平稳期
%
个时期千粒重
的表型值!用复合区间作图法检测非条件
HIC
!结
果见表
!
和图
#

C^ `
阈值为
!+
时!共检测到

个千粒重非条件
HIC
!缓慢增长期和快速增长期各
!

HIC
!平稳期
#

HIC

缓慢增长期的
!
个非条件千粒重
HIC
分别位

%1

*1
染色体上其中!
%1
染色体上的非条

HIC
位于
>M49"
"
>
F
M4
标记之间!与最近
标记
>M49"
相距
"+"#9N
!加性效应值为
"+"
!
可解释表型变异的
#"+%#J
!暂时命名为
34
5
6%7
&
*1
染色体上的非条件
HIC
位于
>
F
M4&%
"
>M49%$&
标记之间!与最近标记
>M49%$&
相距
"+"#9N
!加性效应值为
"+#"
!可解释表型变异的
2+&&J
!暂时命名为
34
5
6*7
快速增长期的
!

非条件
HIC.
分别位于
!E

%E
染色体上其中!
!E
染色体上的非条件
HIC
位于标记
>K5L9%&#
"
>M49$!!
之间!与最近标记
>K5L9%&#
相距
"+"
9N
!加性效应值为
("+$"
!可解释表型变异的
#%+&J
!暂时命名为
34
5
6!8)#
&
%E
染色体上的非
条件
HIC
位于标记
>K5L9*
"
>M49#
之间!与最
近标记
>K5L9*
相距
"+"#9N
!加性效应值为
"+%"
!
可解释表型变异的
#"+2!J
!暂时命名为
34
5
6%8

平稳期检测到的
#
个非条件
HIC
位于
!E
染色体

>K5L9%&#
"
>M49$!!
标记之间!与最近标记
>K5L9%&#
相距
"+"9N
!加性效应值为
("+**
!可
解释表型变异的
#+#0J
!暂时命名为
34
5
6!8)!

另外!快 速 增 长 期 和 平 稳 期 都 在
!E
染 色 体
>K5L9%&#
"
>M49$!!
标记之间检测到一个千粒重
非条件
HIC
!加性效应方向一致!与最近标记
>K5L9%&#
的距离也相同!但贡献率有差异!可能是

#

HIC
在不同时期的差异表达&其他千粒重
非条件
HIC
都只在某一特定时期才能检测出来
上述结果表明!小麦籽粒灌浆之所以能分成缓慢增
长期*快速增长期和平稳期
%
个明显不同的阶段!可
能是由于分别受不同基因控制或者同一基因在不同
时期的表达量不同而引起的
=<@<=
!
条件
$
%&
!
对快速增长期和平稳期的粒重
净增长量采用复合区间作图法检测这
!
个时期的粒
重条件
HIC
!结果见表
%
和图
#

C^ `
阈值为
!+
时!共检测到

个粒重条件
HIC
!其中快速增长期
#
个!平稳期
$
个快速增长期的
#
个条件
HIC
位于
!E
染色体的
>K5L9%&#
"
>M49$!!
标记之间!与最
近标记
>K5L9%&#
相距
"+"9N
!加性效应值为
("+!2
!可解释表型变异的
#%+&#J
!暂时命名为
34
5
6!8)%
平稳期检测到的
$
个粒重条件
HIC
!
分别分布于
#1
*
E

*E
染色体上
#1
染色体上

=
!
不同灌浆时期千粒重非条件
$
%&/
I5K67!
!
V/9:/=-G-:/56HIC.X:LG<:;.5/=)
F
L5-/M7-
F
[
:.-G7
-/G7LZ5645
[[
-/
F
5/56
U
.-.-/=-XX7L7/GX-6-/
F[
<5.7.
表型
_<7/:G
U[
7
染色体
W标记区间
N5L\7L-/G7LZ56
与最近标记的距离
-`.G5/97XL:4
/75L7.G45L\7L
%
9N
C^ `

C^ `
加性效应
1==-G-Z7
7XX79G
贡献率
A!
W:/GL-K;G-:/
L5G7
%
J
ISQ
#
%1 >M49"
"
>
F
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!E >K5L9%&#
"
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ISQ
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"
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西
!

!

!

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!
个粒重条件
HIC
!分别位于标记
>K5L9#0
"
>K5L90%

>K5L90%
"
>M49#
之间!暂命名为
349
5
6#79#

34
5
6#79!

34
5
6#79#
与最近标记
>K5L90%
相距
"+ N
!加性效应值为
("+#"
!可解
释表型变异的
#%+"#J
&
34
5
6#7)!
与最近标记
>K5L90%
相距
!+2*9N
!加性效应值为
("+!!
!可解
释表型变异的
!+!2J

E
染色体上的
#
个粒重条

HIC
位于标记
>M49$#
"
>M49%!&
之间!与最
近标记
>M49%!&
相距
%+29N
!加性效应 为
("+#$
!可解释表型变异的
!2+!$J
位于
*E
染色
体上的
#
个粒重条件
HIC
!存在于标记
>M49!&
"
>
F
M4$""
之间!与最近标记
>M49!&
相距
#+2*

#
!
小麦粒重条件和非条件
HIC.
在染色体上的位置
#
+ISQ
#
时期的非条件
HIC
位点&
$
+ISQ
!
时期的非条件
HIC
位点&
%
+ISQ
%
时期的非条件
HIC
位点&
&
+ISQ
!)#
时期的条件
HIC
位点&

+ISQ
%)!
时期的条件
HIC
位点
@-
F
+#
!
W:/=-G-:/565/=;/9:/=-G-:/56HIC.X:LM<75G
F
L5-/M7-
F
#
+V/9:/=-G-:/56HICX:LISQ
#
&
$
+V/9:/=-G-:/56HICX:LISQ
!
&
%
+V/9:/=-G-:/56HICX:LISQ
%
&
&
+W:/=-G-:/56HICX:LISQ
!)#
&

+W:/=-G-:/56HICX:LISQ
%)!

@
!
不同灌浆时期千粒重条件
$
%&/
I5K67%
!
W:/=-G-:/56HIC.X:LG<:;.5/=)
F
L5-/M7-
F
[
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表型
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染色体
W标记区间
N5L\7L-/G7LZ56
与最近标记的距离
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9N
C^ `

C^ `
加性效应
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李美霞!等$小麦籽粒干物质积累的动态
HIC
定位
9N
!加性效应为
("+#!
!可解释表型变异的
!"+"*J

在快速增长期和平稳期内未能检测到相同的条件
HIC
!可能是因为反方向表达抵消了部分效应!致
使效应值变小而不能被检测出来!亦可能是生长末
期!干物质积累的基因被其他生殖相关的基因所掩
盖在快速增长阶段检测到的条件
HIC
"
34
5
6!8)
%
#!与在快速增长期和平稳期检测到的
!
个非条件
HIC
"
34
5
6!89#

34
5
6!8)!
#!位于同一染色体
的同一位点!可能是同一基因的持续表达在稳定
期未能检测到与非条件
HIC
位点相同的条件
HIC
!可能正好反映了基因表达的时空选择性
%
!

!

作图群体一定的条件下!构建饱和连锁遗传图
谱是精确定位
HIC
的基础!遗传图谱越饱和!标记
之间的距离越小!
HIC
定位的结果越精确可靠本
研究结合杨睿+#&,的结果!构建的
1
*
E
染色体组
#$
个连锁群的遗传图谱由
!$#

DDA
标记组成!标记
间的平均距离为
+&9N
!这在利用二代标记构建
小麦连锁遗传图谱中已算相当饱和了!所检测到的
HIC
位点与最近标记的距离间最大也不过
%+2
9N
!有
%

HIC
与最近标记的距离仅为
"+"#9N
!
还有
%

HIC
与最近标记的距离为
"+"9N
!几乎
是与连锁标记共分离!这为基因图位克隆奠定了良
好的基础!也为分子辅助育种提供坚实的技术支撑
传统
HIC
定位大都以性状发育终点的累积量
为表型值进行
HIC
分析!这种定位分析的结果可
解释该位点基因表达的累积遗传效应!但是忽略了
性状形成的发育特性动态性状的发育受基因网络
的控制!其遗传基础复杂以性状发育终点的累积
量为表型值进行
HIC
分析不能够充分反映性状发
育的不同阶段不同基因表达的动态变化及相应阶段
的净遗传效应!也不能揭示基因表达的时空差异
小麦籽粒干物质积累是一个动态的发育过程!受遗
传网络控制!基因表达存在时空选择性和发育阶段
特征本研究在灌浆期内不同阶段共检测到

个千
粒重非条件
HIC


个条件
HIC
随着发育过程
推进!所检测到的
HIC
的贡献率逐渐增加!与干物质
积累量的趋势一致因此!结合非条件
HIC
和条件
HIC
的研究!不仅能了解
HIC
表达的最终结果!也
能了解到发育过程中
HIC
表达的具体时段和遗传效
应另外!
E
染色体上
>K5L9%&#
"
>M49$!!
之间的
同一位点在快速增长期和平稳期都检测到了粒重非
条件
HIC
!而且在快速增长期也检测到了粒重条件
HIC
!但是其加性效应值和贡献率存在差异!一方面
说明该
HIC
位点可能是一个很重要的小麦粒重基因
位点!具有表达的连续性!另一方面也说明相同基因
位点在不同时段的表达量有差异!这与发育遗传学理
论一致+!!,为什么在缓慢增长期没有在
!E
染色体
上的
>K5L9%&#
"
>M49$!!
间检测出粒重
HIC
呢/
结合小麦籽粒发育学!缓慢增长期主要是籽粒器官
建成时期!决定籽粒框架!少有干物质的累积!所以!
该位点在这一时期没有表达
早在前几年就有人提出了动态
HIC
分析的三
种方法$一是将持续发育的性状人为划分成若干个
表型值观测时间点!视为同一性状的重复测定值&二
是将不同时间点观测值视为不同性状!采用多变量
方法分析该性状&三是用数学模型拟合性状发育过
程!对模型参数进行
HIC
分析+2!%)!$,前两种方法
都是人为划分表型值观测时间点!当间隔时间很短
的两个观测值定位出完全不同的
HIC
!而性状表现
又没有明显的变化仅仅是由于累积作用表型值稍有
差别时!所定位出的
HIC
很难给出合理的生物学
解释应用数学模型拟合时间点与性状表达变化的
对应表型值!依据性状发育中的生物学阶段定位相
应的动态
HIC
才具有实际生物学意义
Q;
等+!,
曾采用这种方法定位了水稻叶龄动态性状的
HIC

已有的关于小麦动态
HIC
的研究报道大都是人为
划分性状表型值观测时间点!采用数学模型模拟性
状发育的变化特点分析小麦动态
HIC
研究目前尚
未见报道本研究采用数学模型拟合小麦籽粒干重
增长过程!尝试以缓慢增长期*快速增长期和平稳期
%
个特征明显的时期为表型值观测时间点定位小麦
千粒重的动态
HIC
!以便更好地揭示小麦籽粒干物
质积累过程中基因时空性的特异表达特性
本研究定位的小麦粒重
HIC
涉及到
#1
*
!E
*
%1
*
%E
*
E

*E
染色体其中
#1
*
!E
*
%1
*
%E

E
染色体已有发现粒重
HIC
的研究报道但
*E
染色体上存在粒重
HIC
尚未见报道本研究所用
的群体是波兰小麦与普通小麦品系杂交后产生的
ABC
群体!与普通小麦相比!波兰小麦最显著的特征
之一就是高粒重!因此!研究中发现的
*E
染色体上
的粒重
HIC
是否是波兰小麦所特有!尚需进一步
研究证实
"###
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参考文献!
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