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The fengycin lipopeptides are major components in the Bacillus subtilis strain NCD-2 against the growth of Botrytis cinerea

脂肽类抗生素fengycin在枯草芽胞杆菌NCD-2菌株抑制番茄灰霉病菌中的功能分析



全 文 :植物病理学报
ACTA PHYTOPATHOLOGICA SINICA  43(4): 401 ̄410(2013)
收稿日期: 2012 ̄09 ̄04ꎻ 修回日期: 2013 ̄04 ̄10
基金项目: 国家自然科学基金资助项目(30900962)ꎻ 国家高技术研究发展计划(“863”计划) (2011AA10A205)ꎻ 河北省财政专项
(F12C10036)
通讯作者: 郭庆港ꎬ副研究员ꎬ主要从事植物病害生物防治研究ꎻ Tel:0312 ̄5915677ꎬ E ̄mail:gqg77@163. com
第一作者: 董伟欣ꎬ女ꎬ河北省石家庄人ꎬ主要从事生防细菌的分子遗传学研究ꎮ
脂肽类抗生素 fengycin在枯草芽胞杆菌
NCD ̄2 菌株抑制番茄灰霉病菌中的功能分析
董伟欣ꎬ 李宝庆ꎬ 李社增ꎬ 鹿秀云ꎬ 马 平ꎬ 郭庆港∗
(河北省农林科学院植物保护研究所ꎬ河北省农业有害生物综合防治工程技术研究中心ꎬ
农业部华北北部作物有害生物综合治理重点实验室ꎬ 保定 071000)
摘要:枯草芽胞杆菌 NCD ̄2 菌株及其无细胞发酵液对多种植物病原真菌具有较强的拮抗活性ꎮ 为了明确 NCD ̄2 菌株抑菌
作用机理ꎬ本研究利用快速蛋白液相色谱技术(FPLC)结合抑菌活性测定ꎬ对 NCD ̄2 菌株的脂肽类抑菌物质进行分离、纯
化ꎬ经质谱鉴定ꎬ该抑菌物质为芬荠素( fengycin)ꎮ 从 NCD ̄2 菌株中克隆出 fengycin 合成酶基因 fenC 及其上游启动子序
列ꎬ通过同源重组技术对 fenC基因进行了内缺失突变ꎬ同 NCD ̄2 野生型菌株相比ꎬfenC基因缺失突变子丧失了 fengycin的
合成能力ꎬ同时该突变子显著降低了对番茄灰霉病菌的拮抗活性ꎮ 进一步在离体叶片上比较了 NCD ̄2 野生型菌株和突变
子之间脂肽提取物和菌体细胞对番茄灰霉病的保护作用ꎬ结果发现ꎬ突变子不论是脂肽提取物还是菌体细胞显著降低了对
番茄灰霉病的防治作用ꎮ
关键词:枯草芽胞杆菌ꎻ 番茄灰霉病菌ꎻ fengycinꎻ 突变
The fengycin lipopeptides are major components in the Bacillus subtilis strain NCD ̄
2 against the growth of Botrytis cinerea   DONG Wei ̄xinꎬ LI Bao ̄qingꎬ LI She ̄zengꎬ LU
Xiu ̄yunꎬ MA Pingꎬ GUO Qing ̄gang  (Plant Protection Institute ꎬ Hebei Academy of Agricultural and Forestry Sciencesꎻ
IPM Centre of Hebei Provinceꎻ Key Laboratory of IPM on Crops in Northern Region of North Chinaꎬ Ministry of Agricultureꎬ
Baoding 071000ꎬ China)
Abstract: The Bacillus subtilis strain NCD ̄2 and its cell ̄free supernatant showed strong inhibitive activity
against the growth of phytopathogens. The NCD ̄2 lipopeptide extracts showed a strong inhibitive activity against
the growth of Botrytis cinerea. The major antifungal activity compounds were isolated from the lipopeptides by
Fast Protein Liquid Chromatography (FPLC)ꎬ and identified as fengycin based on the profiles of matrix assisted
laser desorption / ionization ̄ time of flight mass spectrometry (MALDI ̄TOF) . The antifungal activity of fengy ̄
cin was supported by in ̄frameless deletion mutagenesis and it targeted to suppress the biosynthesis of fengycin
production. Compared to the strain NCD ̄2 wild typeꎬ the fengycin ̄deficient mutant strain decreased the antifun ̄
gal capability significantly. Further bioassay indicated that the lipopeptides extracted from the fengycin ̄deficient
mutant not only lost the inhibitive activity against the growth of B. cinerea in vitroꎬ but also significantly de ̄
creased the control effect against tomato grey mold on detached tomato leaves. The results could be confirmed
by assays using bacterial suspension between strain NCD ̄2 wild type and the fengycin ̄deficient mutant.
Key words: Bacillus subtilisꎻ Botrytis cinereaꎻ fengycinꎻ mutagenesis
中图分类号: S476          文献标识码: A          文章编号: 0412 ̄0914(2013)04 ̄0401 ̄10
 
植物病理学报 43 卷
    枯草芽胞杆菌(Bacillus subtilis)防治植物病
害的机制复杂多样ꎬ主要包括抑菌作用、竞争作用
和诱导抗性等ꎮ 枯草芽胞杆菌可以产生多种抑菌
活性物质ꎬ其中脂肽类抗生素是其所产生的主要抑
菌物质ꎮ 脂肽类抗生素由于具有抑菌谱广、热稳定
性强、持效期长等优点ꎬ在植物病害防治中具有重
要的作用[1]ꎮ 表面活性素( surfactin)、伊枯草菌素
(包括 iturin A、mycosubtilin 和 bacillomycin D)以
及芬荠素 ( fengycin) 类抗生素 ( fengycin A 和
fengycin B)是枯草芽胞杆菌产生的三大类脂肽抗
生素[2]ꎮ 这些抗生素由多酶复合体通过非核糖体
途径合成ꎬ一般由 7 ( surfactin 和 iturins) 或 10
(fengycins)个 α ̄氨基酸组成的环形肽链和 1 个由
13 ̄18 个 ̄CH2 组成的 β ̄脂肪酸链组成ꎬ并且同一
种脂肽类抗生素一般具有 3 ̄5 个同系物ꎬ不同的同
系物在脂肪酸链的长度上有所差异[3]ꎮ iturins 和
fengycins类抗生素对多种植物病原真菌具有较强
的拮抗活性[4ꎬ5]ꎬsurfactin 虽然自身对真菌没有明
显的抑菌活性ꎬ 但 surfactin 可增强 iturins 或
fengycins的抑菌活性[6ꎬ7]ꎮ 除了直接的抑菌活性
外ꎬsurfactin和 fengycins还具有诱导抗病性的作用
( ISR) [8ꎬ9]ꎮ
枯草芽胞杆菌 NCD ̄2 菌株是一株对棉花黄萎
病菌和番茄灰霉病菌等多种植物病原真菌具有较
强拮抗活性的生防细菌[10]ꎬ以 NCD ̄2 菌株为活性
成分开发的微生物农药“10 亿 /克枯草芽胞杆菌可
湿性粉剂”已获得农药正式登记ꎮ 前期研究发现ꎬ
该菌株产生的抑菌活性物质具有热稳定性ꎬ并且对
酸、碱和蛋白酶 K 不敏感[11]ꎬ据此推测 NCD ̄2 菌
株产生的抑菌活性物质可能为脂肽类抗生素ꎮ 本
研究以番茄灰霉病菌(Botrytis cinerea)为指示菌ꎬ
通过蛋白质液相色谱(FPLC)和质谱技术对 NCD ̄
2 菌株产生的抑菌活性物质进行分离鉴定ꎬ通过分
子遗传学手段明确抑菌活性物质在 NCD ̄2 菌株抑
制番茄灰霉病菌中的作用ꎮ 明确 NCD ̄2 菌株产生
的主要抑菌活性物质ꎬ可为 NCD ̄2 菌株发酵条件
的优化以及 NCD ̄2 菌株的遗传改良提供重要理论
依据ꎮ
1  材料与方法
1. 1  供试菌株与质粒
本研究所用的菌株及质粒见表 1ꎮ 大肠杆菌
(Eschrichia coli) 采用 LB 培养基、37℃培养ꎻ枯草
芽胞杆菌 NCD ̄2 菌株及其突变子在含有 30%甘油
的 LB(Luria Bertani)培养基中于 - 80℃长期保存ꎬ
使用前在 LB固体培养基上 37℃活化ꎮ 根据质粒的
抗性ꎬ在 LB培养基中加入抗生素(抗生素的终浓度
分别为:氨苄青霉素 100 μg / mL、红霉素 2􀆰 5 μg /
mL)ꎮ 番茄灰霉病菌由本实验室分离并保存ꎮ
1. 2  引物合成及 PCR扩增
本研究所用引物均根据枯草芽胞杆菌 NCD ̄2
菌株基因组序列设计ꎬ引物设计由 Primer premier
5. 0 软件完成ꎬ引物名称和序列见表 2ꎮ 引物合成
和序列测定由上海生工生物工程公司完成ꎮ PCR
扩增所用DNA聚合酶购自北京全式金生物技术
Table 1  Strains or plasmids used in this study
Strain & plasmid Characteristics Source
Bacillus subtilis strain
NCD ̄2 Wild type Laboratory stock
NCD ̄2(Δfen)
NCD ̄2 mutant typeꎬ fenC and its promoter were deleted by
homologous recombination
This study
Botrytis cinerea Pathogen of tomato gray mold Laboratory stock
Escherichia coli DH5α recA / endA / hsdR17 deoR thi2 / supE44 gyrA96 relA / TransGen Biotech
pMAD
E. coli and B. subtilis shuttle vectorꎬ temperature ̄sensitive
plasmidꎬ Amprꎬ Eryr
Gifted by Dr Zhang Jie
pMAD ̄Δfen
pMAD containing fenC and promotor deletion structureꎻ
Amprꎬ Eryr
This study
Note: Amprꎬ and Eryr indicate resistance to Ampicillin and Erythromycin.
204
 
  4 期     董伟欣ꎬ等:脂肽类抗生素 fengycin在枯草芽胞杆菌 NCD ̄2 菌株抑制番茄灰霉病菌中的功能分析
Table 2  Primers information
Primer Sequence of primer (5 ̄3) Restriction site Position of primer∗
P1 CGC GGATCCGCAGATACGCCGAAGCAC BamHⅠ +2 005 bp
P2 CGC ACGCGTCCGCAACGACGCCATTAG Mlu Ⅰ +161 bp
P3 CGC ACGCGTAAAACAGGTCTGCCGCTAT Mlu Ⅰ -363 bp
P4 CGC GAATTCGGTGACAAACGCAGTGAAT EcoRⅠ -2 008 bp
“∗”: Position of primer was fixed to the initiation codon of fenC gene. Specified restriction sites are underlined.
有限公司的 HiFi DNA聚合酶ꎻ试验所用限制性内
切酶、T4 DNA连接酶、PCR 产物纯化试剂盒均购
自宝生物工程(大连)有限公司ꎮ
1. 3  NCD ̄2 菌株脂肽类抑菌物质的提取
采用盐酸沉淀和甲醇溶解的方法提取 NCD ̄2
菌株中的脂肽类物质[12]ꎮ NCD ̄2 菌株于 5 mL LB
液体培养基中ꎬ30℃、180 r / min 培养 12 hꎬ然后以
1%的接种量转接到 200 mL 3 号培养基中[13]ꎬ
30℃、180 r / min 培养 48 hꎮ 培养结束后ꎬ将发酵液
于 4℃、8 000 r / min 离心 20 minꎬ收集上清液ꎬ并用
5 mol / L 的 HCl 调节 pH 值至 2. 0 ~ 2. 5ꎬ4℃静置
过夜ꎮ 次日以 8 000 r / min 离心 20 minꎬ收集沉淀ꎬ
将沉淀在超净工作台中吹干后用 50 mL 甲醇抽提
2 次ꎬ合并抽提液得到脂肽粗提物ꎮ
1. 4  NCD ̄2 菌株抑菌活性物质的分离和鉴定
NCD ̄2 菌株脂肽粗提物过 Ф = 0. 22 μm 细菌
过滤器ꎬ采用 AKTA Purifier 10 快速蛋白液相色谱
(FPLC)对过滤液中抑菌活性物质进行分离和纯
化ꎮ 色谱柱为 SOURCE 5RPC ST 4. 6 / 150 柱ꎮ 流
动相 A 为含 0. 065%三氟乙酸和 2%乙腈的水溶
液ꎬ流动相 B为含 0. 05%三氟乙酸的 80%乙腈溶
液ꎮ 检测波长为 215 nmꎬ流速为 1 mL / minꎮ 梯度
洗脱过程为 50 min 内流动相 A 由 100%到 0ꎮ 手
动收集 FPLC各组分ꎬ收集液利用旋转蒸发仪进行
浓缩ꎬ利用浓缩液进行抑菌活性测定 (方法见
1􀆰 6)ꎬ对具有抑菌活性的组分进行基质辅助激光
解析电离飞行时间质谱(MALDI ̄TOF ̄MS)分析鉴
定ꎬ根据文献已报道的枯草芽胞杆菌脂肽类抗生素
的分子量对 NCD ̄2 菌株中的抑菌活性物质进行鉴
定[14ꎬ15]ꎮ
1. 5  Fengycin合成酶基因缺失突变菌株的构建
根据枯草芽胞杆菌 NCD ̄2 菌株 fengycin 合成
酶基因序列ꎬ利用 Primer Premier 5. 0 软件在
fengycin合成酶基因 fenC的上、下游分别设计 4 条
引物ꎬ引物名称、位置及所带酶切位点见表 2ꎮ 以
NCD ̄2 菌株基因组为模板ꎬ分别以 P1 / P2 和 P3 /
P4 引物组合进行 PCR 扩增ꎮ PCR 扩增产物回收
纯化后同时利用 MluⅠ进行酶切ꎮ 酶切产物互连
后以连接产物为模板ꎬ用 P1 / P4 引物进行 PCR 扩
增ꎮ 扩增产物用 BamHⅠ和 EcoRⅠ双酶切后插入
到 pMAD 质粒 BamHⅠ和 EcoRⅠ位点间ꎬ构建
fengycin合成酶基因缺失突变载体 pMAD ̄△fenꎮ
缺失突变载体经测序验证正确后ꎬ采用原生质转化
的方法转入枯草芽胞杆菌 NCD ̄2 菌株中[16]ꎮ 参
照 Arnaud 等[17]和 Wang 等[18]报道的方法筛选
fengycin合成酶基因缺失突变子ꎮ
1. 6  对番茄灰霉病菌的抑菌活性测定
采用平板对峙培养法比较 NCD ̄2 菌株野生型
及突变子对番茄灰霉病菌的抑菌活性ꎮ 在直径 9
cm的 PDA 培养基中心位置接种直径为 5 mm 的
番茄灰霉病菌菌盘ꎬ距离灰霉病菌 2 cm 处点接新
活化的 NCD ̄2 野生型菌株及其突变子ꎬ25℃培养
5 ~ 7 d后比较 NCD ̄2 野生型菌株及其突变子对番
茄灰霉病菌的拮抗活性ꎮ
利用牛津杯法比较 NCD ̄2 菌株野生型及其突
变子脂肽提取物对番茄灰霉病菌的拮抗活性ꎮ 制
备 1% PDA(1 L培养基中含有 10 g 琼脂)培养基
作为下层平板ꎬ待下层平板完全凝固后(间隔 24
h)ꎬ在 50℃、100 mL 0. 8% PDA 培养基(1 L 培养
基中含有 8 g琼脂)中加入 2 mL 番茄灰霉病菌分
生孢子悬浮液(孢子浓度为 106 个 / mL)ꎬ轻轻混匀
后倒在下层培养基上作为上层平板ꎮ 待培养基凝
固后ꎬ在制备好的双层培养基平板上放置 2 个灭菌
牛津杯ꎬ分别加入 NCD ̄2 菌株野生型及突变子的
脂肽提取液ꎬ每个牛津杯中加入 150 μL 脂肽提取
304
 
植物病理学报 43 卷
物ꎬ25℃静置培养 5 ~ 7 d 后比较 NCD ̄2 野生型菌
株及其突变子的脂肽提取物对番茄灰霉病菌的拮
抗活性ꎮ
1. 7  NCD ̄2 菌株野生型及其 fenC突变子对番茄
灰霉病的防效测定
在番茄离体叶片上分别比较 NCD ̄2 菌株野生
型及其 fenC突变子脂肽提取物和菌体细胞对番茄
灰霉病的保护作用ꎮ
1. 7. 1  脂肽提取物对番茄灰霉病的保护作用  选
取叶龄相同ꎬ大小一致的健康番茄叶片ꎬ用无菌水
洗净晾干后将超纯水溶解的脂肽提取物均匀喷洒
于叶片的正反面ꎬ叶片放入铺有湿润滤纸的培养皿
中ꎬ叶柄用湿润的脱脂棉包裹保湿ꎬ在每张叶片中间
部位接种直径为 5 mm 的番茄灰霉病菌菌盘ꎬ然后
将盛有叶片的培养皿放入25℃光照培养箱中培养ꎬ5
~7 d后观察叶片的发病情况ꎬ设超纯水为对照ꎮ
1. 7. 2  菌体细胞对番茄灰霉病的保护作用  NCD ̄
2菌株野生型及其 fenC 突变子分别于 200 mL NB
(Nutrient Broth)培养液中 37℃ꎬ180 r / min 振荡培
养 24 hꎬ10 000 r / min 离心 20 min 收集菌体ꎬ并用
30 mL 新鲜的 NB 培养液悬浮菌体ꎬ制备菌悬液
(菌体浓度约为 109 cfu / mL)ꎮ 选取叶龄相同ꎬ大
小一致的健康番茄叶片ꎬ用无菌水洗净晾干后在菌
悬液中浸泡 1 minꎬ在每张叶片中间接种番茄灰霉
病菌菌盘ꎬ然后置于 25℃光照培养箱中培养ꎬ5 ~ 7
d后观察叶片的发病情况ꎬ设新鲜的 NB 培养液处
理为对照ꎬ每个处理重复 3 皿ꎬ每皿 2 张叶片ꎮ
2  结果与分析
2. 1  NCD ̄2 菌株中抑菌物质的分离和鉴定
NCD ̄2 菌株脂肽提取物经 FPLC 分离后呈现
3 组物质(LP ̄a、 LP ̄b、 LP ̄c)ꎬ手工收集 3 组物质ꎬ
分别浓缩定容至 1 mL 后进行抑菌活性测定ꎮ 结
果表明ꎬ只有组分 2 物质 (LP ̄b) 对番茄灰霉病菌
表现出明显的拮抗活性ꎬ而组分 1 和组分 3 没有明
显拮抗活性(图 1)ꎮ 将组分 2 物质 (LP ̄b) 进行
MALDI ̄TOF质谱分析ꎬ结果表明ꎬLP ̄b 中包含 2
种物质ꎬ而每种物质又包含 5 种同系物ꎬ相邻同系
物之间的分子量相差 14 Daꎬ恰好为脂肪酸链 ̄
CH2ꎮ LP ̄b中的第一种物质分子量分别为 1 447、
1 461、1 475、1 489 和 1 503 Daꎬ该物质与 fengycin
A的分子量相匹配ꎻLP ̄b 中的另一种物质分子量
分别为 1 449、1 463、1 477、1 491 和 1 505 Daꎬ该物
质与 fengycin B的分子量相匹配(图 2)ꎮ 因此ꎬ根
据分子量推断 NCD ̄2 菌株产生的主要抑菌活性物
质为 fengycins[19]ꎮ
Fig. 1  FPLC chromatogram of antifungal activity compound extracted from the culture of NCD ̄2
strain (A) and the inhibition capability of active fractions
against the growth of Botrytis cinerea (B)
aꎬ b and c were three main fractions analyzed by FPLCꎬ respectivelyꎬ the lipopeptides
was the extract from cell ̄free supernatant of B. subtilis strain NCD ̄2.
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  4 期     董伟欣ꎬ等:脂肽类抗生素 fengycin在枯草芽胞杆菌 NCD ̄2 菌株抑制番茄灰霉病菌中的功能分析
Fig. 2  Mass spectrometry analysis (MALDI ̄TOF) of the main
antifungal activity fractions of Bacillus subtilis NCD ̄2
2. 2  NCD ̄2 菌株 fenC基因缺失突变子的构建
通过对 NCD ̄2 菌株的全基因组序列进行分
析ꎬ获得 9. 06 kb的 fengycin合成酶基因簇的部分
序列(GenBank 登录号:GQ906579)ꎮ 序列比对发
现ꎬNCD ̄2 菌株中的 fengycin 合成酶基因簇序列
与枯草芽胞杆菌 168 菌株中 plipastatin( fengycin)
合成酶基因簇(AL009126)序列同源性为 95% ꎬ与
枯草芽胞杆菌 F29 ̄3 菌株中 fengycin 合成酶基因
簇(AF087452)序列同源性为 83% ꎮ Fengycin合成
酶存在 5 个编码基因ꎬ依次为 fenC、fenD、fenE、fe ̄
nA和 fenB[20]ꎬ根据 NCD ̄2 菌株中第一个 fengycin
合成酶基因—fenC 基因上下游序列设计 4 条引
物ꎬ以 NCD ̄2 野生型菌株基因组为模板ꎬ分别利用
P1 / P2 和 P3 / P4 引物组合进行 PCR 扩增ꎬ获得大
小为 1 844 bp 和 1 645 bp 的扩增片段ꎮ 2 个扩增
片段经 MluⅠ酶切、连接后为模板ꎬ利用 P1 / P4 引
物进行 PCR 扩增ꎬ获得大小为 3 489 bp 的扩增片
段ꎮ 同 NCD ̄2 菌株中的 fenC 基因相比ꎬP1 / P4 扩
增片段中缺少了 524 bp 的片段ꎬ缺少的片段中包
含 fenC基因及其启动子的部分序列ꎮ P1 / P4 扩增
片段经 BamHⅠ、EcoRⅠ双酶切后ꎬ插入同样双酶
切的 pMAD 质粒相应位点ꎬ即得到 PMAD ̄△fen
缺失突变载体ꎮ 将构建好的缺失突变载体转入
NCD ̄2 菌株中进行高温突变筛选ꎬ获得红霉素敏
感菌株ꎮ 以敏感菌株及 NCD ̄2 野生型菌株基因组
DNA为模板ꎬ以 P1 / P4 为引物进行 PCR扩增ꎮ 结
果证明ꎬ红霉素敏感菌株的扩增片段较 NCD ̄2 野
生型菌株扩增片段小约 500 bp(图 3)ꎬ表明该红霉
素敏感菌株即为 fenC 基因缺失突变菌株ꎬ命名为
NCD ̄2(Δfen)ꎮ
Fig. 3   Agarose gel electrophoresis analysis
of the construction of integrational
vectors
Lane M: DNA markerꎻ Lanes 1 ̄2 were PCR fragments am ̄
plified by primers P1 / P2 and P3 / P4 using NCD ̄2 DNA as
templateꎻ Lane 3 was PCR fragment amplified by primers
P1 / P4 using NCD ̄2 (Δfen) DNA as templateꎻ Lane 4 was
PCR fragment amplified by primers P1 / P4 using NCD ̄2
DNA as template.
504
 
植物病理学报 43 卷
2. 3   NCD ̄2 菌株野生型及其突变子 NCD ̄2
(Δfen)脂肽提取物的高效液相色谱分析
将盐酸沉淀法提取的 NCD ̄2 野生型菌株及其
突变子脂肽类物质ꎬ经 FPLC 分析表明ꎬ野生型
NCD ̄2 菌株在 39. 41 - 48. 95 min 处出现响应峰
值ꎬ前期研究证实ꎬ该峰为 fengycin 检测峰(图 4 ̄
A)ꎮ 与 NCD ̄2 野生型菌株相比ꎬ突变子 NCD ̄2
(Δfen)在 39. 41 -48. 95 min处没有出现明显的响
应峰值(图 4 ̄B)ꎬ证明突变子 NCD ̄2(Δfen)丧失
了产生 fengycin的能力ꎮ
2. 4  NCD ̄2 菌株及其突变子对番茄灰霉病菌的
拮抗活性比较
在 PDA培养基上比较了 NCD ̄2 野生型菌株
及其突变子对番茄灰霉病菌的抑菌活性ꎮ 结果发
现ꎬNCD ̄2 野生型菌株对番茄灰霉病菌表现出明
显的抑菌活性ꎬ而突变子对番茄灰霉病菌的抑菌活
性显著降低(图 5 ̄A)ꎮ 采用牛津杯法比较了野生
型 NCD ̄2 和突变子的脂肽提取物对番茄灰霉病菌
的抑菌活性ꎬ结果表明ꎬNCD ̄2 野生型菌株的脂肽
提取物对番茄灰霉病菌表现出较强的抑菌活性ꎬ而
Fig. 4  FPLC analysis of fengycin synthesis from Bacillus subtilis NCD ̄2
wild type strain (A) and fengycin deficient mutant strain NCD ̄2 (Δfen) (B)
Fig. 5  Inhibition of the growth of Botrytis cinerea in vitro
A: Inhibition of the growth of B. cinerea by B. subtilis NCD ̄2 wild type and its mutant strain NCD ̄2(Δfen)ꎻ
B: Inhibition of the growth of B. cinerea by the lipopeptides extracted from B. subtilis NCD ̄2
wild type and its mutant strain NCD ̄2(Δfen) .
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  4 期     董伟欣ꎬ等:脂肽类抗生素 fengycin在枯草芽胞杆菌 NCD ̄2 菌株抑制番茄灰霉病菌中的功能分析
突变子的脂肽提取物几乎完全丧失了对番茄灰霉
病菌的抑菌活性(图 5 ̄B)ꎬ证明 fengycin在 NCD ̄2
菌株对灰霉病菌的抑制作用中发挥主要功能ꎮ
2. 5  NCD ̄2 菌株野生型及其 fenC突变子对番茄
灰霉病的防治作用
在离体叶片上比较了野生型 NCD ̄2 菌株及其
突变子脂肽提取物和菌体细胞对番茄灰霉病的防
治作用(图 6)ꎮ 接种 5 d 后ꎬ对照处理的叶片出现
大面积灰褐色病斑ꎬ并且病斑上着生大量灰色霉
层ꎮ NCD ̄2 野生型菌株不论是脂肽提取物还是菌
体细胞处理的叶片没有明显的发病迹象ꎬ而突变子
NCD ̄2(Δfen)的脂肽提取物或菌体细胞处理的叶
片均出现明显的灰霉病斑ꎬ尽管相比对照而言病斑
面积有所减小ꎬ但在灰褐色病斑上面仍然着生大量
的灰色霉层ꎮ 证明在离体叶片上ꎬNCD ̄2 野生型
菌株的脂肽提取物或菌体细胞对番茄灰霉病具有
较理想的防治作用ꎬ而突变子 NCD ̄2(Δfen)的脂
肽提取物或菌体细胞显著降低了对番茄灰霉病的
防治作用ꎮ
3  讨论
目前对枯草芽胞杆菌中脂肽类抗生素的鉴定
主要采用液谱分析结合质谱鉴定ꎬ根据物质的保留
时间和分子量判断物质的性质[21ꎬ22]ꎬ而通过分子
遗传学手段对活性物质进行验证的研究报道较少ꎮ
本研究从 NCD ̄2 菌株中分离纯化出一种对番茄灰
霉病菌具有较强活性的抑菌物质ꎬ液谱分析发现ꎬ
该物质与解淀粉芽胞杆菌(B. amyloliquefaciens)
FZB42 菌株中的 fengycins 具有相同的保留时间
(结果未列出)ꎬ经质谱分析发现该物质与 fengycin
的分子量相匹配ꎬ据此推断该活性物质为 fengycin
类抗生素ꎮ 为进一步证明 NCD ̄2 菌株产生的抑菌
活性物质为 fengycinꎬ本研究通过同源重组技术对
NCD ̄2 菌株中编码 fengcyin合成酶的基因 fenC进
行了缺失突变ꎬ通过液谱分析证明ꎬ突变子丧失了
产该抑菌活性物质的能力ꎬ据此确认该活性物质为
fengycinꎮ
Fengycin对多种植物病原真菌ꎬ尤其是丝状真
菌具有较强的拮抗作用ꎬ其作用机理是作用于病原
菌细胞壁的类脂层ꎬ从而破坏细胞膜的结构和透
性[5]ꎮ 目前已有报道证明 fengycin 对番茄灰霉病
菌表现较强的拮抗活性ꎬ如 Li 等[23]研究发现ꎬ枯
草芽胞杆菌 BAB ̄1 菌株所产生的 fengycin 对番茄
灰霉病菌表现较强的拮抗活性ꎬ并且造成灰霉病菌
Fig. 6  Control of tomato gray mold by the lipopeptides (A) and bacterial
suspension (B) from Bacillus subtilis NCD ̄2 wild type and its mutant in vivo
704
 
植物病理学报 43 卷
菌丝膨大、畸形ꎬ部分原生质体外渗ꎬToure 等[24]也
发现 fengycin对灰霉病菌具有抑菌活性ꎮ 然而由
于这些生防菌株同时产生多种抑菌物质ꎬ如 surfac ̄
tin、iturin A、bacillomycin D 和 mycosubtilin 等ꎬ因
此无法明确 fengycin 在生防枯草芽胞杆菌抑菌功
能中所发挥的作用ꎮ 通过分子遗传学手段ꎬ对生防
菌株中抑菌物质的编码基因进行突变ꎬ比较野生型
生防菌株和突变子对病原菌的抑菌活性ꎬ可确定生
防菌中发挥主要抑菌作用的活性物质[25]ꎮ 解淀粉
芽胞杆菌(B. amyloliquefaciens)C06 菌株同时产
生脂肽类抗生素 bacillomycin D 和 fengycinꎬ通过
基因突变技术分别获得丧失 bacillomycin D 和
fengycin合成能力的突变子ꎬ抑菌活性测定表明ꎬ
fengycin在 C06 菌株抑制褐腐病菌(Monilinia fruc ̄
ticola)发挥主要作用[26]ꎮ Yanez ̄Mendizabal 等[27]
研究发现ꎬ尽管枯草芽胞杆菌 CPA ̄8 菌株可以产
生 fengycin、iturin A和 surfactin等多种脂肽类抗生
素ꎬ但丧失 fengycin合成能力的突变子完全丧失了
对 M. fructicola 的抑菌活性ꎬ该结果同样证明
fengycin在抑菌活性中发挥主要的作用ꎮ 本研究
对 NCD ̄2 菌株中 fengycin 合成酶基因 fenC 进行
了缺失突变ꎬ结果发现ꎬ同野生型 NCD ̄2 菌株相
比ꎬ丧失产 fengycin的突变子显著降低了对番茄灰
霉病菌的拮抗活性ꎻ进一步在离体叶片上比较了
NCD ̄2 菌株野生型及其突变子的脂肽提取物对番
茄灰霉病的防治作用ꎬ结果证明ꎬ同 NCD ̄2 菌株野
生型相比ꎬ其突变子的脂肽提取物也丧失了对番茄
灰霉病的防治作用ꎮ 由此说明ꎬfengycin 在枯草芽
胞杆菌 NCD ̄2 菌株抑制灰霉病菌生长以及防治番
茄灰霉病中发挥了主要作用ꎮ
枯草芽胞杆菌基因组中大约 5%的基因用于
编码抑菌物质[3]ꎬ其中包括脂肽类抗生素ꎬ如
fengycin、surfactin、 iturin A、bacillomycin Dꎬmyco ̄
subtilin 等ꎬ但这并不意味着同一菌株在生长代谢
过程中能够同时产生这些抑菌物质ꎬ某些抗生素编
码基因或其启动子只有在某些特定的生长阶段或
特定环境下才表达[28]ꎮ 通过对 NCD ̄2 菌株的全
基因组序列进行分析发现ꎬNCD ̄2 菌株基因组中
存在多个脂肽类物质的编码基因簇ꎬ其中包括编码
surfactin的 srf基因簇、编码 bacillomycin D 的 bmy
基因簇、编码 fengycin 的 fen 基因簇以及编码 ba ̄
cillaene的 pks 基因簇ꎬ由于本研究采用了适合
fengycin 合成的 3 号培养基(数据未发表)ꎬ因此
NCD ̄2 菌株的脂肽提取物中主要为 fengycinꎮ 但
本研究发现ꎬ缺失 fenC 基因的突变子虽然丧失了
fengycin的合成能力ꎬ但突变子中产生了一种新的
物质ꎬFPLC结果发现ꎬ该物质与 bacillomycin D 的
保留时间基本一致ꎬ质谱分析结果发现该物质与
bacillomycin D具有一致的分子量(结果未列出)ꎬ
因此推测ꎬ缺失突变 fenC 基因造成 fengycin 合成
能力丧失ꎬ但增加了突变子中 bacillomycin D 的合
成ꎮ 通过 RT ̄PCR( reverse transcription PCR)技术
分析突变 fenC 基因后 bacillomycin D 合成酶基因
的表达情况ꎬ将会从分子水平明确 fenC基因对 ba ̄
cillomycin D合成能力的影响ꎮ
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责任编辑:于金枝
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