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Regulation of fengycin biosynthase by regulator PhoP in the Bacillus subtilis strain NCD-2

枯草芽胞杆菌NCD-2中调控因子PhoP对fengycin合成的调控作用



全 文 :植物病理学报
ACTA PHYTOPATHOLOGICA SINICA  44(2): 180 ̄187(2014)
收稿日期: 2013 ̄06 ̄07ꎻ 修回日期: 2013 ̄12 ̄21
基金项目: 国家现代农业产业技术体系资助项目(CARS ̄18 ̄15)ꎻ 国家自然科学基金资助项目(30900962ꎻ31272085)ꎻ 国家“863”计划资助
(2011AA10A205)
通讯作者: 郭庆港ꎬ博士ꎬ副研究员ꎬ主要从事植物病害生物防治研究ꎻ Tel:0312 ̄5915677ꎻ E ̄mail: gqg77@163.com
第一作者: 董伟欣ꎬ女ꎬ河北省石家庄人ꎬ主要从事生防细菌的分子遗传学研究ꎮ
枯草芽胞杆菌 NCD ̄2中调控因子 PhoP对
fengycin合成的调控作用
董伟欣ꎬ 李社增ꎬ 鹿秀云ꎬ 张晓云ꎬ 王培培ꎬ 马 平ꎬ 郭庆港∗
(河北省农林科学院植物保护研究所ꎬ河北省农业有害生物综合防治工程技术研究中心ꎬ
农业部华北北部作物有害生物综合治理重点实验室ꎬ 保定 071000)
摘要:PhoR / PhoP双因子调控系统是枯草芽胞杆菌中一个重要的全局性调控系统ꎬ在低磷环境下ꎬ感应激酶 PhoR 自磷酸
化ꎬ并且将获得的磷酸基团转移到调控因子 PhoP上ꎬ从而激活 PhoP的调控活性ꎮ 为了明确调控因子 PhoP 对枯草芽胞杆
菌 NCD ̄2菌株中主要抑菌活性物质 ̄fengycin合成能力的调控作用ꎬ本研究通过同源重组技术缺失突变 NCD ̄2菌株中的
phoP基因ꎬ拮抗活性测定结果表明ꎬphoP基因缺失菌株显著降低了对立枯丝核菌的抑菌活性ꎮ 通过快速蛋白质液相色谱
(FPLC)技术比较了 NCD ̄2菌株野生型及其 phoP基因突变子 fengycin的合成能力ꎬ结果证明ꎬphoP 基因突变菌株降低了
fengycin的合成能力ꎮ 对突变子进行 phoP基因互补发现ꎬ互补 phoP基因可使突变子的相关性状恢复到野生型菌株水平ꎮ
以上结果证明ꎬphoP基因对枯草芽胞杆菌 NCD ̄2菌株中 fengycin的合成具有正调控功能ꎮ
关键词:枯草芽胞杆菌ꎻ 双因子调控系统ꎻ 脂肽类抗生素ꎻ 抑菌活性
Regulation of fengycin biosynthase by regulator PhoP in the Bacillus subtilis strain
NCD ̄2  DONG Wei ̄xinꎬ LI She ̄zengꎬ LU Xiu ̄yunꎬ ZHANG Xiao ̄yunꎬ WANG Pei ̄peiꎬ MA Pingꎬ
GUO Qing ̄gang  (Plant Protection Institute ꎬ Hebei Academy of Agricultural and Forestry Sciencesꎬ IPM Centre of Hebei
Provinceꎬ Key Laboratory of IPM on Crops in Northern Region of North Chinaꎬ Ministry of Agricultureꎬ Baoding 071000ꎬ China)
Abstract: PhoR / PhoP two ̄component is a global regulatory system in Bacillus subtilis. Under the phosphate
starvation conditionꎬ the sensor protein kinase PhoR self ̄phosphorylates and transfers its phosphate group to the
regulator PhoP. The phosphorylated PhoP impresses or activates the expression of phosphate ̄regulated genes.
With the purpose of clarifying the function of regulator PhoP on the fengycin production in B. subtilis NCD ̄2ꎬ
the phoP was in ̄frameless deleted by homologous recombination. The testing showed that the phoP mutant
decreased the antifungal ability against the growth of Rhizoctonia solani in vitro. The lipopeptides were extracted
from strains NCD ̄2 wild type and phoP mutantꎬ then analyzed by Fast Protein Liquid Chromatography (FPLC) .
The results indicated that the production of fengycinꎬ the major antifungal activity compound in strain NCD ̄2ꎬ
was significantly decreased in the phoP mutant compared to that of strain NCD ̄2 wild type. All of these
characteristics were restored by complementation of phoP gene in the phoP deletion mutant. It was confirmed
that the phoP was a positively regulation factor for fengycin production in strain NCD ̄2.
Key words: Bacillus subtilisꎻ two ̄component systemꎻ lipopeptidesꎻ antimicrobial activity
中图分类号: S476          文献标识码: A          文章编号: 0412 ̄0914(2014)02 ̄0180 ̄08
    枯草芽胞杆菌(Bacillus subtilis)由于能产生多 种抑菌活性物质ꎬ并且能形成抗逆性较强的芽胞ꎬ
 
  2期 董伟欣ꎬ等:枯草芽胞杆菌 NCD ̄2中调控因子 PhoP对 fengycin合成的调控作用
目前已成为开发微生物源农药的重要资源[1ꎬ2]ꎮ
枯草芽胞杆菌所产生的抑菌活性物质按照其合成
途径分为核糖体和非核糖体途径ꎬ其中由非核糖体
途径合成的脂肽类抗生素 fengycins、iturins 和 sur ̄
factin 是枯草芽胞杆菌产生的主要抑菌活性物
质[3]ꎮ 枯草芽胞杆菌这些次级代谢产物的产生受
培养基成分及菌体自身生长阶段的影响[4]ꎬ说明
在枯草芽胞杆菌中存在复杂的调控网络控制其次
级代谢产物的产生ꎮ
在枯草芽胞杆菌中ꎬ可溶性磷酸盐参与细菌
多种生命代谢活动ꎬ控制细菌初级和次级代谢产物
的产生ꎬ可溶性磷酸盐对代谢产物的影响主要是通
过 PhoR / PhoP 双因子调控系统进行调控ꎮ 在低磷
环境下ꎬ位于细胞膜上的组氨酸蛋白激酶 PhoR 自
磷酸化ꎬ并且将获得的磷酸基团转移到位于细胞质
中的调控因子 PhoP 上ꎬ磷酸化的 PhoP 通过与下
游目的基因的启动子区相结合从而调控目的基因
的表达[5ꎬ6]ꎮ 目前已经从枯草芽胞杆菌中鉴定出
34个 PhoP 下游调控基因ꎬ这些基因参与细菌碱性
磷酸酶合成、磷元素的转运及细胞壁中磷脂的脱酰
化等多种生理代谢活动[7]ꎮ 在链霉菌( Streptomy ̄
ces) [8~10]和分枝杆菌 (Mycobacterium) [11]中ꎬ有报
道证明 PhoR / PhoP 双因子调控系统控制细菌抑菌
物质的产生ꎬ但目前为止ꎬ枯草芽胞杆菌中尚未见
有关 PhoR / PhoP 双调控系统调控抑菌物质产生的
报道ꎮ 由于在 PhoR / PhoP 双因子调控系统中ꎬ
PhoP 直接与目的基因结合并调控目的基因的转录
活性ꎬ并且未曾磷酸化的 PhoP 依然具有微弱的启
动子结合能力[12]ꎬ相比 PhoR而言ꎬPhoP 对目的基
因的调控功能更明显[13]ꎮ
枯草芽胞杆菌 NCD ̄2菌株对多种植物病原真
菌的生长表现出较强的抑制活性ꎬ以该菌株为主要
活性成分开发的微生物农药能有效防治棉花土传
病害[14]ꎮ 通过转座子随机插入突变技术ꎬ本课题
组成功构建了 NCD ̄2 菌株的突变子库ꎬ筛选到一
株抑菌功能降低的突变子ꎬ证明突变子中转座子插
入到 phoR 基因内部[15ꎬ16]ꎬ但未曾明确 phoR 所调
控的抑菌物质ꎮ 研究证明ꎬfengycin 是 NCD ̄2菌株
产生的主要抑菌活性物质[17]ꎮ 本研究拟通过对
phoP基因进行定位突变ꎬ明确 phoP 基因对 NCD ̄2
菌株抑菌活性及抑菌活性物质 fengycin 合成的影
响ꎬ为阐明 NCD ̄2 菌株中抑菌活性物质的代谢途
径提供依据ꎮ
1  材料与方法
1.1  供试菌株与质粒
    本研究所用菌株及质粒见表 1ꎮ 大肠杆菌
(Eschrichia coli)DH5α采用 LB (Luria Bertani)培
养基ꎬ37℃培养ꎻ枯草芽胞杆菌 NCD ̄2及其衍生菌
株在含有 30%甘油的 LB培养基中于-80℃长期保
存ꎬ使用前在 LB固体培养基上 37℃活化ꎮ 根据质
粒的抗性ꎬ在 LB 培养基中加入适量抗生素(氨苄
青霉素工作浓度为 50 μg / mL、红霉素工作浓度为
2.5 μg / mL、四环素工作浓度为 10 μg / mL)ꎮ 立枯
丝核菌(Rhizoctonia solani)由本实验室分离并保
存ꎮ
Table 1  Strains or plasmids used in this study
Strain & plasmid Characteristics Source
Bacillus subtilis NCD ̄2 Wide ̄type Laboratory stock
NCD ̄2Δ phoP NCD ̄2 mutant typeꎬ phoP was deleted by homologous recombination This study
HBphoP Complimentary of NCD ̄2ΔphoP by intact phoP This study
Botrytis cinerea Pathogen of tomato gray mold Laboratory stock
Escherichia coli DH5α recA1 endA1 hsdR17 deoR thi21 supE44 gyrA96 relA1 TransGen Biotech
pMAD E. coli and B. subtilis shuttle vectorꎬ temperature ̄sensitive plasmidꎬ Amprꎬ Eryr Donated by Dr Zhang Jie
pMAD ̄Δ phoP pMAD containing phoP deletion structureꎻ Amprꎬ Eryr This study
pHY300PLK E. coli and Bacillus shuttle vectorꎬ Ampr Tetr TaKaRa
pHB phoP pHY300PLK containing intact phoPꎬ Tetr This study
  Note: Amprꎬ Tetrꎬ and Eryr indicate resistance to Ampicillinꎬ Tetracyclineꎬ and Erythromycin.
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植物病理学报 44卷
1.2  引物合成及 PCR扩增
所用引物均根据枯草芽胞杆菌 NCD ̄2菌株基
因组序列ꎬ采用 Primer premier 5.0 软件设计ꎬ由上
海生工生物工程公司合成ꎬ引物名称和序列见表
2ꎮ PCR扩增所用 HiFi DNA聚合酶购自北京全式
金生物技术有限公司ꎻ试验所用限制性内切酶、T4
DNA连接酶、PCR 产物纯化试剂盒购自宝生物工
程(大连)有限公司ꎮ PCR扩增产物由上海生工生
物工程公司进行测序ꎮ
1.3  phoP基因缺失突变子及其互补菌株的筛选
根据枯草芽胞杆菌 NCD ̄2 菌株中 phoP 及其
上下游基因序列ꎬ在 phoP 基因的上、下游分别设
计 1对引物ꎬ引物名称、序列及所带酶切位点见表
2ꎮ 以 NCD ̄2菌株基因组为模板ꎬ分别以 P1 / P2和
P3 / P4引物组合进行 PCR 扩增ꎻPCR 扩增产物回
收纯化后同时利用 MluⅠ进行酶切ꎬ酶切产物互连
后以连接产物为模板ꎬ用 P1 / P4 引物进行 PCR 扩
增ꎻ扩增产物用 BamHⅠ和 Bgl Ⅱ双酶切后插入到
pMAD质粒 BamHⅠ和 Bgl Ⅱ位点间ꎬ构建 phoP
基因缺失突变载体 pMAD ̄ΔphoPꎮ 缺失突变载体
经测序验证正确后ꎬ采用原生质转化的方法转入枯
草芽胞杆菌 NCD ̄2 菌株中[18]ꎮ 参照Arnaud等[19]
和Wang等[20]报道的方法筛选 phoP 基因缺失突
变子ꎮ
在 phoP 基因起始密码子上游 198 bp 和终止
密码子下游 277 bp 处分别设计引物 HBphoP ̄U /
HBphoP ̄Dꎬ扩增完整的 phoP 基因及其启动子序
列ꎮ PCR 扩增产物回收纯化后利用 BamHⅠ和
Hind Ⅲ进行双酶切ꎬ酶切产物插入到穿梭载体
pHY300PLK中的 BamHⅠ和 Hind Ⅲ酶切位点之
间ꎬ构建 phoP基因的互补载体ꎬ测序正确后ꎬ采用
电击转化的方法转入 phoP 基因的突变体菌株中ꎬ
构建 phoP基因的互补菌株ꎮ
1.4  抑菌活性的测定
采用平板对峙培养法测定枯草芽胞杆菌对立
枯丝核菌的抑菌活性ꎮ 将枯草芽胞杆菌 NCD ̄2菌
株野生型及其衍生菌株在 NB(Nutrition Broth)培
养基中 30℃、180 r / min振荡培养过夜后ꎬ12 000 r /
min离心 2 min 收集菌体ꎬ并用无菌水悬浮菌体至
浓度为 OD600 =2.0ꎬ获得菌体悬浮液ꎮ 在直径 9 cm
的 PDA培养基中心位置接种直径为 5 mm 的立枯
丝核菌菌盘ꎬ距离立枯丝核菌 2 cm 处等间距放置
3个牛津杯ꎬ分别加入枯草芽胞杆菌 NCD ̄2 野生
型及其衍生菌株的菌体悬浮液 10 μLꎬ25℃培养
4~5 d后统计细菌菌落周围抑菌圈半径(抑菌带距
离细菌菌落边缘水平距离和垂直距离的平均值)ꎬ
每个处理 3次重复ꎮ 根据抑菌圈大小比较各个菌
株对立枯丝核菌的抑制活性ꎮ
利用牛津杯法比较枯草芽胞杆菌脂肽提取物
对立枯丝核菌的拮抗活性ꎮ 在直径 9 cm 的 PDA
培养基中心位置接种直径为 5 mm 的立枯丝核菌
菌盘ꎬ距离立枯丝核菌 2 cm 处等间距放置 3 个牛
津杯ꎬ分别加入 NCD ̄2 菌株野生型、phoP 基因突
变子及其互补菌株的脂肽提取液 150 μL(约 300
μg)ꎬ25℃静置培养 5~7 d后统计细菌菌落周围抑
菌圈半径(抑菌带距离细菌菌落边缘水平距离和
Table 2  Primers information
Primer Sequences of primer (5′ ̄3′) Restriction site Function
P1 CGGggatccCCATCTTCGGTTATTCTTTC BamHⅠ
Amplification of upstream of phoP
P2 CGGacgcgtTGAGTGCTTCTTCCCCAT Mlu Ⅰ
P3 CGGacgcgtGCAGACATAAAGGCAGAGTT Mlu Ⅰ
Amplification of downstream of phoP
P4 CGGagatctCACCAGATACATATTGAGGGT BglⅡ
HBphoP ̄U GCGggatccGGCTTGCTTAATACAGCCT BamHⅠ
Amplification of intact phoP
HBphoP ̄D GCCaagcttTCTCCCGTTTGACCCATA HindⅢ
pMAD ̄F CCTAGCTAATTTTCGTTTAAT -
Detection the inserted fragment in pMAD
pMAD ̄R GGAGTGGTGAATCCGTTA -
  Note: Underlined site indicated the restriction endonuclease recognition site􀆰
281
 
  2期 董伟欣ꎬ等:枯草芽胞杆菌 NCD ̄2中调控因子 PhoP对 fengycin合成的调控作用
垂直距离的平均值)ꎬ每个处理 3 次重复ꎮ 根据抑
菌圈大小比较各个菌株的脂肽提取物对立枯丝核
菌的拮抗活性ꎮ
1.5  脂肽类抑菌物质的提取
采用正丁醇萃取的方法提取 NCD ̄2野生型菌
株及其衍生菌株中的抑菌物质ꎮ NCD ̄2 菌株于
5 mL LB培养基中ꎬ30℃、180 r / min 培养 12 hꎬ然
后以 1%的接种量转接到 200 mL NB 培养基中ꎬ
30℃、180 r / min 振荡培养 72 hꎮ 培养液于 4℃、
8 000 rpm 离心 20 minꎬ收集上清液ꎬ用 200 mL 正
丁醇分 2次萃取抑菌物质ꎬ合并有机相ꎬ采用旋转
蒸发仪去除正丁醇ꎬ然后用甲醇溶解沉淀并调整浓
度为 2 mg / mLꎮ
1.6  脂肽类抑菌物质的 FPLC分析
脂肽粗提物经 0.22 μm 细菌过滤器过滤ꎬ采用
AKTA Purifier 10快速蛋白液相色谱(FPLC)对脂
肽提取物进行色谱分析ꎮ 色谱柱为 SOURCE
5RPC ST 4.6 / 150ꎮ 流动相 A 为含 0.065%三氟乙
酸和 2%乙腈的水溶液ꎬ流动相 B 为含 0.05%三氟
乙酸和 80%乙腈的水溶液ꎮ 检测波长为 215 nmꎬ
流速为 1 mL / minꎮ 梯度洗脱过程为 50 min 内流
动相 A由 100%降至 0ꎮ
1.7  数据分析
采用 Origin 7.0 软件中的方差分析(ANOVA)
对试验中的数据进行统计及显著性分析ꎮ
2  结果与分析
2.1  NCD ̄2 菌株 phoP 基因缺失突变子及其互
补菌株的构建
根据 phoP 基因上下游序列分别设计 4 条引
物ꎬ以 NCD ̄2 菌株基因组为模板ꎬ分别利用引物
P1 / P2和 P3 / P4进行 PCR扩增ꎬ获得大小为 1 510
和 1 585 bp的扩增片段ꎮ 2个扩增片段经 EcoRⅠ
酶切、连接后为模板ꎬ利用 P1 / P4引物进行 PCR扩
增ꎬ获得大小为 3 098 bp的扩增片段ꎬ同 NCD ̄2菌
株中的 phoP基因相比ꎬP1 / P4 扩增片段中缺少了
402 bp 的片段ꎮ phoP 基因的 P1 / P4 扩增片段经
BamHⅠ、 Bgl Ⅱ双酶切后ꎬ插入同样双酶切的
pMAD质粒相应位点ꎬ即得到 pMAD ̄ΔphoP 缺失
突变载体(图 1)ꎮ 以 pMAD 多克隆位点两侧引物
pMAD ̄F / pMAD ̄R为引物进行双向测序ꎬ证明重
组质粒 pMAD ̄ΔphoP 中的 phoP 基因内部缺失
402 bpꎮ
    将构建好的缺失突变载体转入 NCD ̄2菌株中
进行高温突变筛选ꎬ获得红霉素敏感菌株ꎮ 以敏感
菌株及 NCD ̄2野生型菌株基因组 DNA为模板ꎬ以
P1 / P4为引物进行 PCR扩增ꎬ结果发现ꎬ红霉素敏
感菌株的扩增片段较 NCD ̄2野生型菌株扩增片段
小约 400 bp(图 2)ꎮ 以该红霉素敏感菌株 DNA为
模板ꎬ利用引物 HBphoP ̄U和 HBphoP ̄D进行 PCR
扩增并对扩增片段进行测序ꎬ结果证明该菌株的
phoP基因中间缺少了402 bpꎮ以上结果证明ꎬ该
Fig. 1  Physical location of the regulator PhoP in Bacillus subtilis
NCD ̄2 and its derivative strains
The bars designate the fragments cloned into the vector pMAD to be pMAD ̄ΔphoPꎬ cloned into pHY300PLK to
be pHBphoP. The fragment inserted in pHBphoP was used to complement the phoP mutation in NCD ̄2ΔphoP.
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植物病理学报 44卷
红霉素敏感菌株即为 phoP 基因缺失突变子ꎬ命名
为 NCD ̄2ΔphoPꎮ 以 NCD ̄2 菌株基因组 DNA 为
模板克隆完整的 phoP 基因ꎬ其中包括 723 bp 的
CDS序列以及上游 507 bp的启动子区域ꎮ 将克隆
的 phoP基因插入穿梭载体 pHY300PLK的多克隆
位点中ꎬ构建 phoP 基因的互补载体 pHBphoPꎬ互
补获得突变子 NCD ̄2ΔphoP 的互补菌株ꎬ命名为
HBphoPꎮ
Fig. 2  In ̄frameless deletion of phoP in Bacil ̄
lus subtilis NCD ̄2
Lane M: l kb DNA markerꎻ Lanes 1 ̄2: PCR fragments
amplified by primer P1 / P2 and P3 / P4 using NCD ̄2 DNA as
templateꎻ Lane 3: PCR fragment amplified by primer P1 / P4
using NCD ̄2ΔphoP DNA as templateꎻ Lane 4: PCR
fragment amplified by primers P1 / P4 using strain NCD ̄2
DNA as template.
2.2  NCD ̄2 菌株野生型及其衍生菌株对立枯丝
核菌的抑菌活性比较
在 PDA培养基上比较了 NCD ̄2 菌株野生型
及其衍生菌株对立枯丝核菌的抑菌活性ꎮ结果表
明ꎬ25℃静置培养 5 d 后ꎬ同 NCD ̄2菌株野生型相
比ꎬ突变子 NCD ̄2ΔphoP 显著降低了对立枯丝核
菌的抑菌活性ꎬ而互补菌株对立枯丝核菌的抑菌能
力恢复到了野生型菌株的水平(表 3)ꎮ 采用牛津
杯法比较了 NCD ̄2菌株野生型及其衍生菌株的脂
肽提取物对立枯丝核菌的抑菌活性ꎮ 结果表明ꎬ
25℃静置培养 7 d后ꎬNCD ̄2野生型菌株的脂肽提
取物对立枯丝核菌表现出较强的抑菌活性ꎬ突变子
NCD ̄2ΔphoP显著降低了对立枯丝核菌的抑菌活
性ꎬ而互补菌株的脂肽提取物对立枯丝核菌的抑菌
能力恢复到了野生型菌株的水平(表 3)ꎮ
2.3  NCD ̄2 菌株野生型及其衍生菌株脂肽提取
物的色谱分析
采用正丁醇抽提法提取 NCD ̄2菌株野生型、突
变子 NCD ̄2ΔphoP 及其互补菌株的脂肽类物质ꎬ
FPLC 分析表明ꎬ野生型 NCD ̄2 菌株在(39. 41 ~
48.95)min处出现响应峰值ꎮ 前期研究证实ꎬ该峰为
fengycin检测峰ꎮ 与 NCD ̄2菌株野生型相比ꎬ突变
子 NCD ̄2ΔphoP在(39.41 ~ 48.95)min 处没有出现
明显的响应峰值ꎬ证明突变子丧失了 fengycin 产生
能力ꎬ对突变子 NCD ̄2ΔphoP进行互补ꎬ其互补菌株
恢复了 fengycin 的合成能力(图 3)ꎮ 结果证明ꎬ
phoP调控 NCD ̄2菌株 fengycin的合成ꎮ
3  讨论
PhoR / PhoP是枯草芽胞杆菌中普遍存在的双
因子调控系统ꎮ 前期研究发现ꎬ突变 phoR 基因可
降低枯草芽胞杆菌 NCD ̄2 菌株的抑菌活性ꎬ该结
果表明 PhoR / PhoP 双因子调控系统与 NCD ̄2 菌
株的抑菌活性有关[15]ꎮ PhoR 是一种位于细胞膜
上的组氨酸蛋白激酶ꎬ负责感应环境中的低磷信号
并激活反应调控因子 ̄PhoPꎬPhoP负责识别组氨酸
Table 3  Inhibitory activity of Bacillus subtilis NCD ̄2 and its
derivative strains on Rhizoctonia solani
Strain
Radius of inhibitory zone (mean±SD)
Bacterial colony Lipopeptides
NCD ̄2 wild type 0.87±0.10 a 1.31±0.05 a
HBphoP 0.90±0.05 a 1.09±0.07 a
NCD ̄2ΔphoP 0.53±0.13 b 0.36±0.07 b
The data in the table are mean±SD. The different letters in the same column show significant difference at P≤0.05 level
by ANOVA.
481
 
  2期 董伟欣ꎬ等:枯草芽胞杆菌 NCD ̄2中调控因子 PhoP对 fengycin合成的调控作用
Fig. 3  FPLC analysis of the lipopeptides extracted from Bacillus subtilis
NCD ̄2 wild type and its derivative strains
蛋白激酶传递的信号分子并进行自身磷酸化ꎬ磷酸
化的 PhoP通过与靶标基因上游启动区的结合ꎬ从
转录水平或转录后水平调控下游基因的表达[6]ꎮ
细菌中双因子调控系统往往具备以下特性:①组氨
酸蛋白激酶和调控因子的编码基因处于同一个操
纵子中ꎻ②定点突变组氨酸蛋白激酶编码基因和突
变调控因子编码基因一般具有相同的性状表现ꎬ但
相比组氨酸蛋白激酶ꎬ突变调控因子后引起的性状
改变更为明显[13]ꎮ 因此ꎬ本研究对 NCD ̄2菌株中
PhoR / PhoP双因子调控系统中的调控因子 phoP
基因进行了定位突变ꎮ
进一步试验证明ꎬphoP 基因突变子的脂肽提
取物显著降低了对立枯丝核菌的拮抗活性ꎮ 前期
研究证明ꎬNCD ̄2 菌株可以产生脂肽类抗生素
surfactin和 fengycinꎬ并且证明 fengycin 在 NCD ̄2
菌株抑菌活性中发挥主要作用[17]ꎮ 因此ꎬ推测突
变 phoP基因可能影响 NCD ̄2 菌株中 fengycin 的
合成ꎮ 通过快速蛋白液相色谱技术(FPLC)比较
NCD ̄2菌株野生型和 phoP 基因突变子的脂肽提
取物ꎬ结果发现ꎬphoP基因突变后没有改变 NCD ̄2
菌株脂肽提取物中的物质组成ꎬ即 NCD ̄2 菌株野
生型与 phoP 基因突变子的脂肽提取物具有相同
的液谱峰谱ꎮ 但 phoP 基因突变子显著降低了
fengycin的合成能力ꎮ 因此ꎬ证明调控因子 PhoP
正调控 NCD ̄2 菌株 fengycin 的合成ꎮ 在链霉菌
中ꎬ众多研究证明 phoP 基因与抑菌物质的产生有
关[9ꎬ 21]ꎬ但在枯草芽胞杆菌中ꎬ至今尚未有关于
phoP调控抑菌物质的报道ꎬ本研究结果首次证明
调控因子 PhoP 调控脂肽类抗生素 fengycin 的合
成ꎮ
PhoP属于多效应调控因子(Pleiotropic regula ̄
tor)ꎬ调控下游多个基因的表达ꎬ其中有些基因属
于直接调控ꎬ而有些基因属于间接调控ꎮ 以往研究
证实ꎬ受 phoP直接调控的基因其上游启动子区域
存在明显的 PhoP 识别序列ꎬ即 TT(A / T / C)ACA ̄
N4 ̄6 ̄TT ( ATC) ACA[22]ꎮ 在枯草芽胞杆菌中ꎬ
fengycin 合成酶基因簇包含 5 个基因ꎬ依次是
fenC、fenD、fenE、fenA 和 fenBꎬ在 fenC 基因上游存
在 2个启动子区域ꎬ分别控制指数生长期和对数生
长期末期 fengycin 的合成[23]ꎮ 通过对 NCD ̄2 菌
株中 fengycin合成酶基因簇启动子区域进行序列
分析ꎬ没有发现 PhoP 特异性识别的序列ꎬ据此推
测ꎬphoP对 fengycin合成的调控属于间接调控ꎬ即
磷酸化的 PhoP并不与 fengycin合成酶基因簇的启
动子区相结合ꎬ而是通过影响下游其他基因的表达
从而间接调控 fengycin合成酶基因的表达ꎮ
尽管 fengycin 对多种植物病原真菌具有较强
的拮抗活性ꎬ但在枯草芽胞杆菌中关于 fengycin 合
成的调控机制报道甚少ꎮ Tsuge 等[24]研究发现ꎬ
DegQ通过调控 DegU / DegS 双因子调控系统的活
性从而调控枯草芽胞杆菌 fengycin 的产生ꎮ 通过
转录组学分析研究 NCD ̄2 菌株中 PhoR / PhoP 下
游调控基因以及 DegQ 与 PhoR / PhoP 之间的关
系ꎬ将丰富人们对枯草芽胞杆菌中 fengycin 合成调
控途径的理解ꎬ为生防枯草芽胞杆菌的遗传改良和
明确生防菌的作用机理提供理论依据ꎮ
581
 
植物病理学报 44卷
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