全 文 ：书西北植物学报!
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文章编号$
#""")*"!%
"
!"#$
#
#)!#%&)"+
收稿日期$
!"#$)"+)!&
%修改稿收到日期$
!"#$)#")#!
基金项目$广西直属公益性科研院所基本科研业务费专项"桂热研
!"#""(
#%国家公益性行业"农业#科研专项"
!"#!"$"!#
#
作者简介$杨祥燕"
#&,*
#!女!硕士!助理研究员!主要从事果树生理与分子生物学研究&
-)./01
$
2
/3
4
50/3
42
/3,**#!
!
#!(678.
"
通信作者$蔡元保!硕士!助理研究员!主要从事植物生理与分子生物学研究&
-)./01
$
7/0
2
9/3:/8!"%
!
#($678.
番木瓜基因型遗传关系的
!"#$
分析
杨祥燕#!蔡元保#"!黄
!
强#!周全光#!杨伟林!!孙光明$!*!郭凌飞%
"
#
广西亚热带作物研究所!南宁
%$"""#
%
!
广西农垦集团有限责任公司!南宁
%$""!!
%
$
中国热带农业科学院南亚热带作物研究
所!广东湛江
%!*"&#
%
*
国家重要热带作物工程技术研究中心!海口
%+##"#
% 厦门市农业机械监理所!福建厦门
$(#""&
#
摘
!
要$利用
;<=>
标记对中国
!!
个番木瓜主要栽培品种"系#进行亲缘关系和遗传多样性研究&结果表明$"
#
#
筛选出的
!"
对
;<=>
引物共扩增
!*&
条谱带!其中多态性条带
##"
条!多态性比率为
*$6!"?
!平均每对引物扩增
的条带数和多态性条带数分别为
#!6*%
条和
%6%"
条&"
!
#引物多态性信息含量"
!"#
#值变化范围为
"6#%
"
"6+&
!
平均值为
"6*&
&"
$
#聚类分析和主坐标分析显示!供试材料间的遗传相似系数为
"6+!
"
"6&(
!遗传多样性水平较
低!在相似性系数为
"6,+
时!可将所有试材分为
$
个类群&该研究结果有效地揭示了中国番木瓜主要栽培品种
"系#资源的遗传背景和亲缘关系!可为番木瓜种质资源的分类保护和有效利用以及新品种选育提供理论依据&
关键词$番木瓜%序列相关扩增多态性%聚类分析%遗传关系
中图分类号$
@$*(
A
6%
%
@+,&
文献标志码$
=
!"#$#%&
(
)*)+,-.%./*0".&/*+%)1*
2
)&3+%
4
1$(-"$
2
$
2
$
3
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(2
.)
B=CDE0/3
42
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#
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F=GB9/3:/8
#
"
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HI=CD@0/3
4
#
!
JHKI@9/3
4
9/3
4
#
!
B=CDLM0103
!
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;ICD9/3
4
.03
4
$
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*
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DIKN03
4
OM0
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#D9/3
4
50;9:PQ8
R
07/1FQ8
R
S!
C/3303
4
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!
FT03/
%
!D9/3
4
50=
4
Q0791P9Q/1R
N0.0PMU
F8.
R
/3
2
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C/3303
4
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!
FT03/
%
$;89PT;9:PQ8
R
07/1FQ8
R
S!
FT03MSM=7/UM.
2
8OVQ8
R
07/1=
4
Q0791P9Q/1;70)
M37MS
!
JT/3
W
0/3
4
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D9/3
4
U83
4
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FT03/
%
*C/P083/1FM3PMQ8OG.
R
8QP/3PVQ8
R
07/1FQ8
R
S-3
4
03MMQ03
4
/3UVM7T3818
42
SM/Q7T
!
H/0X89%+##"#
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FT03/
%
E0/.M3;9
R
MQY0S083ZM
R
/QP.M3P8O=
4
Q0791P9Q/1[/7T03MQ
2
!
E0/.M3
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FT03/
#
#7)/8&0/
$
DM3MP07QM1/P083ST0
R
/3UU0YMQS0P
2
8O!!
R
/
R
/
2
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"
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(
$
(
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)
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#
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8Q791P0Y/QS03FT03/]MQM
/3/1
2
M^U:/SMU83SM
_
9M37M)QM1/PMU/.
R
10O0MU
R
81
2
.8Q
R
T0S.
"
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#
6
"
#
#
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R
/0QS8O;<=>
R
Q0.MQS
4
M3MQ/PMU/P8P/18O!*&OQ/
4
.M3PS
!
/3U
R
81
2
.8Q
R
T07:/3US]MQM##"]T07T/77893PMUO8Q*$6!"?03PTMP8)
P/1/.
R
10O0MUOQ/
4
.M3PS6VTM39.:MQ8O/.
R
10O0MU/3U
R
81
2
.8Q
R
T07OQ/
4
.M3PS]/S#!6*%/3U%6%"
R
MQ
R
Q0.)
MQ
R
/0Q
!
QMS
R
M7P0YM1
2
6
"
!
#
VTM
R
81
2
.8Q
R
T0S.03O8Q./P083783PM3P
"
!"#
#
Y/19MS8OPTMSM./QXMQSY/Q0MUOQ8.
"6#%P8"6+&
!
/YMQ/
4
03
4
"6*&6
"
$
#
I>D[=719SPMQ/3/1
2
S0S/3U
R
Q0370
R
/1788QU03/PMS/3/1
2
S0S
"
>FK=
#
ST8]MUPT/PPTMQ/3
4
M8O
4
M3MP07S0.01/Q0P
2
"
D;
#
]/S"6+!
"
"6&(/.83
4
!!
R
/
R
/
2
/791P0Y/QS]0PT/18]
4
M)
3MP07U0YMQS0P
2
6=1791P0Y/QS7891U:MU0Y0UMU03P8PTQMM
4
Q89
R
S/PPTMD;8O"6,+6VTMSMQMS91PS03U07/PMU
PT/P;<=>/3/1
2
S0S7891U:M9SMUP8QMYM/1MOOM7P0YM1
2
PTM
4
M3MP07QM1/P083ST0
R
S8O
R
/
R
/
2
/791P0Y/QS03FT0)
3/
!
R
Q8Y0U03
4
/S70M3P0O07:/S0SO8QPTM71/SS0O07/P083
!
R
Q8PM7P083/3UMOOM7P0YM9P010^/P0838OPTMSMQMS89Q7MS
/3U:QMMU03
4
3M]Y/Q0MP0MS6
9.
(
:+8;)
$
#$%&$
(
$
(
$
)
$
%
;<=>
%
719SPMQ03
4
/3/1
2
S0S
%
4
M3MP07QM1/P083ST0
R
!!
番木瓜"
#$%&$
(
$
(
$
)
$N6
#属于热带亚热带大
型草本果树!在中国华南地区广泛栽培!具有较高营
养价值和经济价值!素有(岭南果王)美称&长期以
来!由于应用分子生物学手段对其种质资源的研究
相对滞后!使得中国在番木瓜杂交亲本选配上存在
很大盲目性!导致番木瓜种质资源不能被有效利用!
从而影响了育种效率的提高&尤其是番木瓜杂交育
种中集中利用了少数从国外引进亲本的倾向!导致
育成品种亲缘关系相近!遗传基础狭窄&因此!对番
木瓜种质的亲缘关系进行系统研究!拓宽番木瓜主
要栽培品种的遗传背景!对于中国番木瓜遗传育种
具有重要意义&
ZC=
分子标记技术的迅速发展!可
以从分子水平上为评估不同种质间的遗传多样性和
亲缘关系提供了技术支持&目前!国外对番木瓜指
纹图谱和遗传图谱构建*#)!+遗传多样性和亲缘关系
分析*$)%+!以及性别连锁研究*(+等都有较大的研究进
展%国内分子标记主要应用于番木瓜的性别鉴定与
连锁分析*+)&+!而应用于中国番木瓜栽培品种资源的
遗传多样性和亲缘关系的研究鲜有报道*#")##+&
序列相关扩增多态性"
SM
_
9M37M)QM1/PMU/.
R
10)
O0MU
R
81
2
.8Q
R
T0S.
!
;<=>
#标记是一种基于
>F<
的标记系统!由
N0
等*#!+在云薹作物上首先应用&
该技术针对基因外显子
DF
含量丰富以及启动子和
内含子
=V
含量丰富的特点来设计引物进行扩增!
因不同个体的内含子启动子与间隔区长度不等而
产生多态性&
;<=>
标记因其具有简便高效产率
高高共显性重复性好易测序!以及便于克隆目标
片段的特点!目前己被成功地应用于遗传多样性分
析遗传图谱构建重要性状的标记以及相关基因的
克隆等方面*#$)#*+&其中!
;<=>
标记运用于研究果
树的遗传多样性和亲缘关系已较为常见*#$)#*+&本研
究采用
;<=>
标记对中国番木瓜主要栽培品种
"系#进行亲缘关系和遗传多样性分析!为指导番木
瓜种质资源引进和利用!进而进行分子标记辅助选
择育种等提供科学依据&
#
!
材料和方法
<6<
!
试验材料
供试材料为中国
!!
个番木瓜主要栽培品种
"系#!均取自于广西亚热带作物研究所番木瓜种质
资源圃"编号与名称见表
#
#!其中,日升-,白皮日
升-,蓝茎-和,夏威夷-为国外引进品种!其余试材
均为国内杂交品种"系#&本实验在广西亚热带优势
作物繁育及综合开发技术重点实验室进行!试材按
照各品种"系#单株进行采集!选取干净无病虫害幼
嫩叶片!液氮速冻后于
,"`
冰箱保存备用&
*$
+
聚合酶和
UCV>S
均购自天根生化科技"北京#有限
公司&
<6=
!
方
!
法
番木瓜基因组
ZC=
的提取采用
FV=a
改良
法*#%+进行&利用
a08
R
T8P8.MPQM
核酸蛋白仪和
#6"?
琼脂糖凝胶电泳检测其浓度和质量!模板
ZC=
工作浓度稀释至
$"3
4
.
#
N
!
!"`
保存备用&
;<=>
正反向引物"表
!
#参考
N0
等*#!+
\MQQ081
等*#(+及
b/3UM./QX
等*#++发表的引物序列!由上海
生工公司合成&
;<=>
正反向引物各
#"
条!两两组
合成
#""
个引物组合!用
(
个形态差异较大的番木
瓜品种"系#对这
#""
个引物组合进行筛选!筛选出
扩增条带清晰且重复性和多态性良好的引物组合&
最后!用这些引物组合对所有的番木瓜供试材料进
行
;<=>)>F<
扩增&
;<=>)>F<
扩增的总体积为
!"
#
N
!包括
!
#
N
的
#"c:9OOMQ
!
$6"..81
.
N [
4
!A
!
"6!..81
.
N
UCV>S
!
"6*
#
.81
.
N
引物!
$"3
4
.
#
N
模板
ZC=
和
#6"I*$
+
聚合酶&扩增程序为$
&*`
预变性
%
.03
%
&*`
变性
#.03
!
$%`
复性
#.03
!
+!`
延伸
表
<
!
供试番木瓜材料的编号和名称
V/:1M#
!
F8UM/3U3/.M8OPMSPMU#,
(
$
(
$
)
$Y/Q0MP0MS
编号
F8UM
材料名称
C/.M8O./PMQ0/1
#
穗中红
*,
号
;90^T83
4
T83
4
*,
!
美中红
[M0^T83
4
T83
4
$
桂热
#
号
D90QM#
*
桂热
!
号
D90QM!
%
日升
;93Q0SM
(
白皮日升
LT0PM)S93Q0SM
+
万顷沙
#
号
L/3
4_
03
4
ST/#
,
红铃
H83
4
103
4
&
红铃
!
号
H83
4
103
4
!
#"
台农
#
号
V/0383
4
#
##
穗黄
;90T9/3
4
#!
红妃
H83
4
OM0
#$
蓝茎
a19MSPM.
#*
园优
B9/3
2
89
#%
红日
#
号
H83
4
Q0#
#(
庞博
#
号
>/3
4
:8#
#+
庞博
!
号
>/3
4
:8!
#,
庞博
$
号
>/3
4
:8$
#&
新世纪
E03ST0
W
0
!"
风云
#
号
\M3
42
93#
!#
兴农矮
*,)!
号
E03
4
383
4
-
/0*,)!
!!
夏威夷
H/]/0
"(#!
西
!
北
!
植
!
物
!
学
!
报
!!!!!!!!!!!!!!!!!!!
$$
卷
表
=
!
!"#$
引物及其序列
V/:1M!
!
;<=>
R
Q0.MQS/3UPTM0QSM
_
9M37MS
正向引物
\8Q]/QU
R
Q0.MQ
编号
F8UM
序列
;
_
9M37M
"
%d
#
$d
#
反向引物
R
Q0.MQ
编号
F8UM
序列
;
_
9M37M
"
%d
#
$d
#
.M# %d)VD=DVFF===FFDD=V=)$d M.# %d)D=FVDFDV=FD==VV==V)$d
.M! %d)VD=DVFF===FFDD=DF)$d M.! %d)D=FVDFDV=FD==VVVDF)$d
.M$ %d)VD=DVFF===FFDD==V)$d M.$ %d)D=FVDFDV=FD==VVD=F)$d
.M* %d)VD=DVFF===FFDD=FF)$d M.* %d)D=FVDFDV=FD==VVVD=)$d
.M% %d)VD=DVFF===FFDD==D)$d M.% %d)D=FVDFDV=FD==VV==F)$d
.M( %d)VD=DVFF===FFDDV==)$d M.( %d)D=FVDFDV=FD==VVDF=)$d
.M+ %d)VD=DVFF===FFDDVFF)$d M.+ %d)D=FVDFDV=FD==VVF==)$d
[-( %d)VD=DVFFVVVFFDDV==)$d <, %d)D=F=FFDV=FD==VVD=F)$d
[-+ %d)VD=DVFFVVVFFDDVFF)$d <& %d)D=F=FFDV=FD==VVVD=)$d
\+ %d)DV=DF=F==DFFDD=DF)$d <#% %d)FDF=FDVFFDV==VVFF=)$d
&"S
!
%
个循环%
&*`
变性
#.03
!
%"`
复性
#.03
!
+!`
延伸
&"S
!
$%
个循环%最后
+!`
延伸
#".03
!
*
`
保存&对番木瓜所有供试材料进行
;<=>)>F<
扩增时!重复
!
次&扩增结束后!在
#6,?
琼脂糖凝
胶中电泳!电极缓冲液为
"6%cVa-
!电泳的电压小
于
%b
.
7.
%电泳结束后于凝胶成像系统上检测并
拍照&
<6>
!
数据统计与分析
在电泳图谱上清晰且可重复出现的条带记为
(
#
)!同一位置上无条带记为(
"
)!缺失记为(
&
)!模糊
不清的条带不予记录!从而生成由(
#
)和(
"
)组成的
原始矩阵&统计每个引物组合扩增出的总条带数和
多态性条带数!并计算引物多态性比率"
!!-
#和多
态性信息含量"
!"#
#&其中!按照
a8PSPM03
公式*#,+
计算多态性信息含量
!"#e#
$
!
&
!
!式中!
!
&
表
示第
&
种基因型出现的频率&利用
>8
R
DM3#6$!
软
件分析番木瓜总群体的遗传分化系数"
.
SP
#和基因
流"
/
.
#&用
CV;B;)
R
7!6#M
软件进行
f/77/QU
相
似系数计算和基于
I>D[=
算法的聚类分析!用
[578.
R
程序对协表征矩阵和相似矩阵之间的相似
性进行
[/3PM1
检验!同时还进行基于遗传相似系数
的 主 坐 标 分 析 "
R
Q0370
R
/1788QU03/PMS/3/1
2
S0S
!
>FK=
#!构建三维空间和二维平面散点分布图以检
验聚类结果&
!
!
结果与分析
=6<
!
!"#$
标记的多态性引物筛选
;<=>
正反向引物各
#"
条!两两组合成
#""
个
引物组合!用
(
个形态差异较大的番木瓜试材对这
#""
个引物组合进行筛选!筛选出
!"
个扩增条带清
晰且重复性和多态性良好的引物组合&利用这些引
物组合对所有的番木瓜试材进行
;<=>)>F<
扩增&
扩增产物分子量在
#""
"
!""":
R
之间!条带清晰
且重复性和多态性良好!可适用于番木瓜遗传关系
研究&其中代表性引物组合
.M$)M.*
在
!!
个番木
瓜品种"系#中的
;<=>)>F<
扩增结果见图
#
&
图
#
!
引物组合
.M$)M.*
对番木瓜所有试材的
;<=>
扩增
#
"
!!
材料编号同表
#
\0
4
6#
!
;<=>/.
R
10O07/P0838O#,
(
$
(
$
)
$
4
MQ.
R
1/S.:
2R
Q0.MQ78.:03/P083.M$)M.*
#
"
!!/QMPTMS/.M/SV/:1M#
#(#!
##
期
!!!!!!!!!!!!!!
杨祥燕!等$番木瓜基因型遗传关系的
;<=>
分析
=6=
!
!"#$
标记的引物多态性分析
对
!"
个
;<=>
多态性引物组合在所有试材上
扩增出的条带进行统计分析!条带统计结果见表
$
&
由表
$
可知$"
#
#
!"
个引物组合共产生
!*&
条清晰
条带!其中多态性条带共计
##"
条!平均每对引物多
态性比率"
!!-
#为
*$6!"?
%"
!
#平均每个引物组合
扩增条带数和多态性条带数分别为
#!6*%
条和
%6%"
条!每个引物组合扩增出的条带数和多态性条带数
分别从
,
"
#(
条和
$
"
##
条不等!其中
.M+)M.#
和
[-+)<&
引物组合扩增出的条带数和多态性条带数
最多!而
.M*)M.!
引物组合最少%"
$
#不同引物组合
扩增的多态性也有较大差异!多态性比率"
!!-
#从
$$6$$?
"
(,6+%?
不等!大部分引物组合扩增的多
态性较好!其中
[-+)<&
引物组合的
!!-
最高"为
(,6+%?
#!而
.M%)M.(
和
.M()M.*
引物组合的
!!-
最低"
$$6$$?
#%"
*
#
!"
个引物组合的多态性
信息含量"
!"#
#值变化范围为
"6#%
"
"6+&
!平均每
个引物组合的
!"#
值为
"6*&
!其中
.M#)M.+
引物
组合的
!"#
值最高"
"6+&
#!而
.M$)M.+
引物组合
的
!"#
值最低!仅为
"6#%
&这些研究结果表明!
;<=>
标记对番木瓜具有较强的鉴别能力!适合于
番木瓜遗传关系研究&
=6>
!
番木瓜品种"系#间的聚类分析
基于
;<=>
标记对
!!
个番木瓜品种"系#的扩
增结果进行聚类分析!绘制树状聚类图"图
!
#&将
聚类结果转换为协表征矩阵!对协表征矩阵和相似
系数矩阵之间的相关性进行
[/3PM1
检验&结果表
明!这
!
种矩阵极显著正相关!相关系数为
%e
"6,&
!说明聚类结果能很好地体现番木瓜种质之间
的遗传关系&从图
!
中可知!
;<=>
标记能将
!!
个
品种"系#完全区分开!当
f/77/QU
-
S
遗传相似系数
"
D;
#在
"6,+
处作截值时!可将所有试材分为
$
个
类群"
$

%
和
&
类群#&
G
类群"
,
份试材#包括,穗
中红
*,
号-,庞博
$
号-,新世纪-,兴农矮
*,)!
号-,庞博
!
号-,穗黄-,园优-和,庞博
#
号-!群
内遗传相似系数在
"6,&
"
"6&(
之间&其中!,新世
纪-和,兴农矮
*,)!
号-亲缘关系最近!都具有黄色
果肉肉厚味甜单果重
#6%
"
!6"X
4
等方面的共同
果实特征&
%
类群"
&
份试材#包括,美中红-,红
妃-,桂热
!
号-,日升-,夏威夷-,台农
#
号-
,红日
#
号-,白皮日升-和,万顷沙
#
号-!群内遗传
相 似系数在
"6,,
"
"6&*
之间&
&
类群"
%
份试材#
表
>
!
不同
!"#$
引物组合在番木瓜供试材料中扩增出条带的多态性
V/:1M$
!
>81
2
.8Q
R
T0S.03S/.
R
1MS8O#,
(
$
(
$
)
$QMYM/1MU:
2
;<=>
R
Q0.MQ78.:03/P083S
引物组合
>Q0.MQ78.:03/P083
总扩增条带数
V8P/1:/3US
多态性条带数
>81
2
.8Q
R
T07:/3US
多态性比率
>81
2
.8Q
R
T07Q/PM
"
!!-
#.
?
多态性信息含量
>81
2
.8Q
R
T0S.03O8Q./P083
783PM3P
"
!"#
#
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西
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植
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物
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学
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报
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卷
图
!
!
!!
份番木瓜种质的
I>D[=
聚类分析图
\0
4
6!
!
I>D[=UM3UQ8
4
Q/.O8Q!!QMS89Q7MS8O#,
(
$
(
$
)
$:/SMU83;<=>U/P/
图
$
!
番木瓜各试材的
;<=>
标记主坐标分析图
=6
三维图%
a6
平面图%
#
"
!!
材料编号同表
#
\0
4
6$
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>Q0370
R
/1788QU03/PMS/3/1
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M38P
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Q/
R
T
%
a6>1/3/Q
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Q/
R
T
%
C86#
"
!!/QMPTMS/.M/SV/:1M#
包括,红铃-,蓝茎-,风云
#
号-,桂热
#
号-和,红
铃
!
号-!群内遗传相似系数在
"6++
"
"6,*
之间&
其中!,红铃
!
号-在整个聚类树中处于最基础地位!
遗传差异性明显区别于其他栽培品种"系#&
=6?
!
番木瓜品种"系#间遗传相似性分析
基于
;<=>
标记的扩增结果!经
CV;B;)
R
7
软
件计算获得番木瓜各品种"系#间的
f/77/QU
-
S
遗传
相似系数"
D;
#&
!!
个番木瓜品种"系#的
D;
值变
化范围为
"6+!
"
"6&(
!平均
D;
值为
"6,%
!变幅为
"6!*
!绝大多数试材的
D;
值在
"6,!
"
"6&!
之间&
其中!,红铃
!
号-和,白皮日升-之间
D;
值最小
"
6+!
#!这两者亲缘关系最远%,新世纪-和,兴农矮
*,)!
号-之间
D;
值最大"
6&(
#!这两者亲缘关系最
近&从整体来看!所有试材的遗传相似系数比较高!
变幅比较小!说明中国番木瓜主要栽培品种"系#的
遗传多样性比较低!遗传基础较为狭窄&利用
>8
R
)
DM3#6$!
软件分析番木瓜总群体的遗传分化系数
"
.
SP
#和基因流"
/
.
#的结果显示!
.
SP
值为
"6#$
!
/
.
值为
$6$$
!表明中国番木瓜主要栽培品种"系#的群
体遗传分化不显著!总群体间的基因交流程度较小&
=6@
!
番木瓜品种"系#主坐标分析"
>FK=
#
基于
;<=>
标记的原始矩阵对
!!
个番木瓜品
种"系#进行主坐标分析"
>FK=
#!前
$
个主坐标所
能解释的相关性分别为
#,6!&?

#!6(,?
和
,6+"?
&
$(#!
##
期
!!!!!!!!!!!!!!
杨祥燕!等$番木瓜基因型遗传关系的
;<=>
分析
主坐标分析所形成的三维图"图
$
!
=
#和平面图"图
$
!
a
#中!位置相靠近者表示亲缘关系密切!远离者
表示亲缘关系疏远&将位置靠近的番木瓜品种"系#
划分在一起!其分类结果与
I>D[=
聚类分析结果
相似!共得到
$
个主要类群"
$

%
和
&
类群#&其
中!
$
和
%
类群比较集中!分别集中在平面的第
#
和
第
!
象限%而
&
类群最为分散!
#$
号,蓝茎-还交错
到
G
类群中!可见,蓝茎-的遗传背景较为复杂&比
较图
!
和图
$
可以看出!系统聚类分析和主坐标分
析所得结果基本上一致&但是!主坐标分析能从不
同方向不同层面更加直观地显示了不同番木瓜品
种"系#之间的亲缘关系&
$
!
讨
!
论
>6<
!
番木瓜种质的
!"#$
引物多态性分析
多态性是评价任何一种分子标记的一个重要依
据&本研究利用筛选出的
!"
对
;<=>
引物组合对
!!
个番木瓜基因型进行分析!共扩增出
!*&
条清晰
条带!其中多态性条带共计
##"
个!平均多态性比率
"
!!-
#为
*$6!"?
&
N0
等*#!+在甘蓝遗传作图和基
因标记研究中!
#*
对
;<=>
引物组合可以产生
#!"
条多态性条带%
\MQQ081
等*#(+在西葫芦和笋瓜种质遗
传多样性研究中
!!-
为
+!6+?
!而本研究中仅为
*$6!"?
&其主要原因是本研究使用的材料为遗传
关系比较近的品种"系#!而前者所用的材料为遗传
关系较远的种间或亚种间种质材料&这从侧面反映
了中国番木瓜主要栽培品种"系#亲缘关系接近!遗
传背景狭窄&多态性信息含量"
!"#
#也是评价分子
标记多态性的一个重要指标&当
"6!%
%
!"#
%
"6%
时!为中度多态性信息引物%当
!"#
&
"6%
时!为高
度多态性信息引物*#&+&本研究平均每个引物组合
的
!"#
值为
"6*&
!属于中偏高多态性信息引物&这
些研究结果表明!
;<=>
标记在番木瓜种质中具有
较高的鉴别能力!可作为一种很好的品种"系#鉴定
手段&
>6=
!
!"#$
在番木瓜遗传研究上的适用性分析
在番木瓜种质资源的遗传多样性研究中!国内
外应用较多的标记方法有
<=>Z

=\N>
和
G;;<
等!不同的标记系统具有不同的作用原理!却产生类
似的研究结果*$)%!#"+&
;<=>
扩增的是
K<"
8
R
M3
QM/U03
4
OQ/.M
#区域!而
K<\S
区域决定了基因对应
的蛋白序列!是不同品种之间呈现差别的重要因
素*#!+&本研究应用
;<=>
标记能将
!!
个番木瓜品
种"系#完全区分开!条带清晰重复性和多态性良
好!而且对番木瓜具有较强的鉴别能力!适合于番木
瓜种质资源的遗传多样性和亲缘关系研究&相对于
番木瓜遗传研究上的其他分子标记!
;<=>
标记的
操作比
=\N>
标记更简单快捷!比
<=>Z
标记的稳
定性和多态性更好!而且
;<=>
标记可以检测基因
的
K性*#(+&因此!
;<=>
标记所提供的遗传信息更能接
近于番木瓜农艺性状的差异&
>6>
!
番木瓜品种"系#的遗传关系分析
分子标记从
ZC=
水平揭示品种"系#间的差异
和相关性&本研究的聚类分析和主坐标分析结果显
示!中国番木瓜主要栽培品种"系#可分成
$
个类群!
与形态学的分类基本吻合&该聚类结果也与番木瓜
遗传多样性的
<=>Z
*
#"
+和
;F8V
*
##
+分析结果大概
相一致&本研究与相同参试材料的
;F8V
分析结
果*##+比较发现!这
!
种分子标记分析都可以将所有
的参试材料分为上述的
$
个类群!但由于分子标记
的原理不同所聚类的结果有些差异&如
;<=>
标
记聚类图中黄色果肉的,桂热
!
号-没有聚到相应的
黄色果肉类型%
;F8V
标记聚类图中大果型的,园
优-却和小果型的,红日
#
号-亲缘关系接近&此外!
从本研究的聚类结果和总群体遗传变异情况中还可
以看出!绝大多数番木瓜品种"系#的遗传相似系数
在
"6,!
"
"6&!
之间!而且遗传变异度小!说明中国
番木瓜主要栽培品种"系#的遗传多样性比较低!亲
缘关系较近!其遗传基础较为狭窄&该结论与杨祥
燕*##+
g0.
等*$+和
;P01MS
等*!"+的研究结果相同!从
而进一步验证了
;<=>
标记在番木瓜遗传多样性
研究中的可靠性&本研究的聚类结果可以为番木瓜
育种的杂交亲本选配提供重要依据!但是由于目前
中国番木瓜主要栽培品种"系#的遗传基础较为狭
窄&因此!在进行番木瓜新品种选育时!除了注意番
木瓜品种间的亲缘关系外!还应该发掘和利用新的
优异番木瓜资源!拓宽番木瓜的遗传基础!从而降低
亲本选配的盲目性!提高番木瓜种质资源利用率和
育种效率&
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杨祥燕!等$番木瓜基因型遗传关系的
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