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作 者 ：刘瑞娟  王海庆

期 刊 ：西北植物学报 2007年 4期

关键词：锌指蛋白；电子克隆；马铃薯；

Keywords:zinc finger protein, in silico cloning, Solanum tuberosum,

摘 要 ：利用紫花苜蓿盐胁迫相关锌指结构蛋白Alfin1基因cDNA序列,通过电子克隆在GenBank中对马铃薯同源EST序列进行查询比较和拼接,获得了1个含有完整编码区的cDNA序列,并通过RT-PCR成功获得了该序列.获得的全长cDNA序列中包含1个747 bp的最大读码框,编码248个氨基酸,将其命名为Stfin1.氨基酸序列分析表明存在典型的Cys4-His-Cys3锌指结构,与Alfin1一致性达93.09%.从结构分析结果推测Stfin1与Alfin1在功能上具有一定的相关性.

Abstract:A full length cDNA sequence was obtained by in silico cloning.After searching against potato EST database in GenBank using Alfin1 cDNA sequence from alfalfa.The native cDNA sequence denoted as Stfin1(Solanum tuberosum Alfin1-like protein1) was isolated wi

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