全 文 :书犇犗犐:10.11686/犮狔狓犫2015410 犺狋狋狆://犮狔狓犫.犾狕狌.犲犱狌.犮狀
姜志艳,于肖夏,于卓,张志成,石悦,姜超.利用SSR分子标记构建四倍体杂交冰草的遗传连锁图谱.草业学报,2016,25(6):94101.
JIANGZhiYan,YUXiaoXia,YUZhuo,ZHANGZhiCheng,SHIYue,JIANGChao.Constructionofageneticlinkagemapfortetraploidhybrid
wheatgrassusingaSSRmolecularmarker.ActaPrataculturaeSinica,2016,25(6):94101.
利用犛犛犚分子标记构建四倍体
杂交冰草的遗传连锁图谱
姜志艳1,2,于肖夏1,于卓1,张志成1,石悦1,姜超1
(1.内蒙古农业大学农学院,内蒙古 呼和浩特010019;2.内蒙古科技大学数理与生物工程学院,内蒙古 包头014010)
摘要:为构建四倍体杂交冰草分子遗传连锁图谱,对深入开展冰草产量、抗性等重要性状的 QTL定位及分子标记
辅助育种提供依据,以四倍体杂种F2 分离群体的347个单株及亲本蒙古冰草和航道冰草为材料,采用SSR分子标
记技术和Joinmap4.0软件进行了遗传作图研究。试验从256对SSR引物中筛选出条带清晰稳定、多态性丰富的
适宜引物30对,PCR扩增得到224个SSR标记位点,平均每对引物扩增出7.47个位点,其中多态性标记位点185
个,占82.6%。偏分离分析显示,在185个SSR多态性标记位点中有24个标记产生偏分离,占13.0%,符合植物
遗传作图时通常偏分离标记比率<30%的要求,可用于遗传作图。构建了1张四倍体杂交冰草的分子遗传连锁框
架图谱,该图谱包含14个连锁群、185个标记,其长度范围在123.0~202.6cM 之间,连锁群LG4最长、LG12最
短,各连锁群的平均长度167.32cM,覆盖基因组总长度2342.5cM,标记间的平均距离12.66cM。
关键词:杂交冰草;四倍体;SSR标记;遗传连锁图谱
犆狅狀狊狋狉狌犮狋犻狅狀狅犳犪犵犲狀犲狋犻犮犾犻狀犽犪犵犲犿犪狆犳狅狉狋犲狋狉犪狆犾狅犻犱犺狔犫狉犻犱狑犺犲犪狋犵狉犪狊狊狌狊犻狀犵犪犛犛犚
犿狅犾犲犮狌犾犪狉犿犪狉犽犲狉
JIANGZhiYan1,2,YUXiaoXia1,YUZhuo1,ZHANGZhiCheng1,SHIYue1,JIANGChao1
1.犃犵狉狅狀狅犿狔犆狅犾犾犲犵犲,犐狀狀犲狉犕狅狀犵狅犾犻犪犃犵狉犻犮狌犾狋狌狉犪犾犝狀犻狏犲狉狊犻狋狔,犎狌犺犺狅狋010019,犆犺犻狀犪;2.犛犮犺狅狅犾狅犳犕犪狋犺犲犿犪狋犻犮狊,犘犺狔狊犻犮狊犪狀犱犅犻狅
犾狅犵犻犮犪犾犈狀犵犻狀犲犲狉犻狀犵,犐狀狀犲狉犕狅狀犵狅犾犻犪犝狀犻狏犲狉狊犻狋狔狅犳犛犮犻犲狀犮犲牔犜犲犮犺狀狅犾狅犵狔,犅犪狅狋狅狌014010,犆犺犻狀犪
犃犫狊狋狉犪犮狋:Toestablishageneticlinkagemapintetraploidhybridwheatgrassgeneticmappingwasconductedu
singasimplesequencerepeats(SSR)molecularmarkertechniquewith‘Joinmap’4.0software.347individu
alsfromtheF2segregatingpopulationandtheirparentswereutilized,thishelpedlaythefoundationforfurther
studyofmarkerassistedbreeding,andquantitativetraitlocus(QTL)locationofimportanttraitsinwheat
grass,suchasdiseaseresistanceandyield.Thirtyoptimalprimerswithclear,stableandhighpolymorphic
bandswerescreenedfrom256testedSSRprimers.Atotalof224SSRlociwereobtainedfrompolymerase
chainreaction(PCR)amplificationwithanaverageof7.47lociperprimer,ofwhich185werepolymorphiclo
ci,accountingfor82.6%ofalloci.Segregationdistortionanalysisshowedthatatotalof24lociweredistort
ed,accountedfor13.0%ofal (185)polymorphicloci,whichmettherequirementof<30%segregationdis
tortionforplantgeneticmapping.Thesepolymorphiclociwouldbeusefulforgeneticmapping.Inthisstudy,
amoleculargeneticlinkagemapoftetraploidhybridwheatgrasswasconstructedwhichcontained185lociand
94-101
2016年6月
草 业 学 报
ACTAPRATACULTURAESINICA
第25卷 第6期
Vol.25,No.6
收稿日期:20150906;改回日期:20151021
基金项目:国家自然科学基金面上项目(31172254)资助。
作者简介:姜志艳(1976),女,内蒙古包头人,讲师,博士。Email:L2359916@sina.com
通信作者Correspondingauthor.Email:yuzhuo58@sina.com
14linkagegroupswithlengthrangingfrom123.0to202.6cM.Thelongestandtheshortestlinkagegroup
wereLG4andLG12,respectively.Theaveragelengthofeachlinkagegroupwas167.32cM,totallengthof
thegenomewas2342.5cMandtheaveragemarkerdistancewas12.66cM.
犓犲狔狑狅狉犱狊:hybridwheatgrass;tetraploid;SSRmarker;geneticlinkagemap
冰草为多年生草本植物,隶属于禾本科小麦族(Triticeae)。其抗逆性强、适应性广,饲用和生态价值高,可用
于退化的天然草地改良、人工草地建植及公路和铁路护坡等水土保持[12]。四倍体杂交冰草(犃犵狉狅狆狔狉狅狀犿狅狀犵狅
犾犻犮狌犿×犃.犮狉犻狊狋犪狋狌犿cv.Fairway,2狀=4狓=28)是课题组利用国产蒙古冰草(犃.犿狅狀犵狅犾犻犮狌犿,2狀=2狓=14)与产
自美国的航道冰草(犃.犮狉犻狊狋犪狋狌犿cv.Fairway,2狀=2狓=14)相组配,人工去雄授粉杂交获得的二倍体杂种F1,经
秋水仙碱溶液加倍染色体而育成的优良牧草,其既有母本蒙古冰草耐寒抗旱、适应性强等优良特性,又有父本航
道冰草再生性和分蘖性强、耐倒伏、叶量大、营养价值和产量高的特点[35]。
简单序列重复SSR(simplesequencerepeat)是一项成熟的DNA标记技术,因其具有重复性好、多态性丰富、
标记呈共显性等优点,在作物品种和杂种真实性鉴定、种质资源遗传差异分析、辅助选择育种、分子遗传连锁图谱
建立等方面已得到应用[69]。由于大多数多年生禾本科或豆科牧草都具有多倍性和异花授粉等生物学特性[10],
其复杂的遗传背景使得牧草的遗传作图、重要性状QTL定位及分子标记辅助育种研究工作相比作物进展较慢。
1993年Brummer等[11]最早利用RFLP分子标记构建了四倍体紫花苜蓿(犕犲犱犻犮犪犵狅狊犪狋犻狏犪)的遗传连锁图,之后
在二倍体的羊茅(犉犲狊狋狌犮犪spp.)、黑麦草(犔狅犾犻狌犿spp.)、高丹草(犛狅狉犵犺狌犿犛狌犱犪狀犵狉犪狊狊)及二倍体杂交冰草等牧
草上构建了分子遗传连锁图谱[1215],而有关四倍体杂交冰草的遗传作图至今未见有研究报道。本试验以四倍体
杂交冰草F2 群体为作图材料,拟利用SSR分子标记技术构建四倍体杂交冰草分子遗传连锁图谱,为深入开展四
倍体冰草重要农艺性状的QTL定位、分子标记辅助育种及基因图位克隆等奠定基础。
1 材料与方法
1.1 供试材料
材料为四倍体杂交冰草F2群体的单株及其亲本蒙古冰草和航道冰草,种植于呼和浩特市赛罕区内蒙古农业
大学农场的饲草材料圃内。试验于2014年5月—2015年5月在田间和室内进行。
1.2 DNA的提取与纯度检测
从四倍体杂交冰草F2 群体内随机取347个单株及其父母本各10个单株的嫩叶,用北京天根公司生产的植
物基因组试剂盒提取DNA,1.6%琼脂糖凝胶电泳检测其DNA纯度后稀释至50ng/μL,置于-20℃冰箱中备
用[16]。
1.3 SSR-PCR扩增反应体系和程序
SSR-PCR扩增体系:反应液总体积为20μL,其中含50μmol/L的10×Buffer2.0μL、2.5mmol/L的
dNTP2.0μL、25mmol/L的 MgCl21.8μL、50μmol/L的Forwardprimer和 Reverseprimer各1.0μL、5
U/μL的TaqDNA聚合酶0.1μL、模板DNA1.0μL、ddH2O11.1μL。SSR-PCR扩增程序:94℃5min,94℃
30s,56℃30s,72℃1min,30个循环,72℃延伸10min[17]。
1.4 PCR扩增产物检测及SSR引物来源
PCR反应结束后,加入6.0μL变性剂,于PCR仪上95℃变性5min,用7%的变性聚丙烯酰胺凝胶进行电
泳,功率70W,预电泳30min,电泳时间2h。电泳胶板在乙醇-冰乙酸溶液中固定,AgNO3 溶液中染色,
NaOH-甲醛溶液中显影,风干后照相[18]。
试验所用的256对SSR引物,是从 NCBI网站公布的禾本科作物小麦(犜狉犻狋犻犮狌犿犪犲狊狋犻狏狌犿)、玉米(犣犲犪
犿犪狔狊)和高粱(犛狅狉犵犺狌犿犫犻犮狅犾狅狉)上开发的部分SSR引物中选取,送至上海生物工程有限公司进行合成。
1.5 SSR多态性位点统计
按胶板点样顺序对每个位点上的多态性位点条带进行记录,有带记为“1”,无带记为“0”,带型模糊不清或缺
59第25卷第6期 草业学报2016年
失的记为“—”,生成“0”和“1”组成的原始矩阵进行统计分析。多态性标记位点百分率计算公式:P(%)=(K/N)
×100,式中,K为多态性位点数目、N为观测位点总数[19]。同一SSR引物PCR扩增2~3次,统计电泳胶板条带
清晰稳定后的多态性位点。
1.6 SSR标记偏分离统计
依据孟德尔分离规律,四倍体杂交冰草F2 群体基因型理论分离比为3∶1,将每个SSR标记的基因型数目进
行卡方检验(χ
2 测验),凡犘<0.05的SSR标记均列入偏分离标记之内。
1.7 SSR分子遗传连锁图谱构建
将统计的SSR标记数据中的“0”和“1”原始矩阵分别转换成F2 群体所要求的数据格式,应用计算机作图软
件Joinmap4.0,构建以SSR分子标记为基础的四倍体杂交冰草的分子遗传连锁图谱。具体步骤:开Newpro
ject命令创建一个新的文件夹;选择Options,设置参数即选择作图群体模式、群体数量和标记位点数;导入数据,
选择LODGroupings(tree)窗口,用Calculate命令进行标记连锁分组(LOD=3.0~10.0),选用LOD≥3.0标
记连锁组群,运行CreateGroupsforMapping命令得到用于作图的连锁群;选择Calculatemap命令构建连锁图
谱;用 Mapchart完成图谱的绘制。
2 结果与分析
2.1 各材料基因组DNA的纯度检测
用DNA试剂盒提取的四倍体杂交冰草F2 群体347个单株及其亲本的基因组DNA,其电泳条带清晰稳定、
无降解、无蛋白和RNA污染(图1),表明各材料的DNA纯度高,符合SSR分子标记试验的要求。
图1 犉2 群体部分单株基因组犇犖犃电泳纯度检测
犉犻犵.1 犌犲狀狅犿犻犮犇犖犃犲犾犲犮狋狉狅狆犺狅狉犲狊犻狊狆狌狉犻狋狔狋犲狊狋狅犳狆犪狉狋犻犪犾狆犾犪狀狋狊狅犳狋犺犲犉2狆狅狆狌犾犪狋犻狅狀
P1:蒙古冰草;P2:航道冰草;1-31:F2 群体部分单株。M:MarkerDL2000.P1:犃.犿狅狀犵狅犾犻犮狌犿;P2:犃.犮狉犻狊狋犪狋狌犿cv.Fariway;1-31:Partial
plantsoftheF2population.
2.2 SSR引物筛选及多态性分析
用亲本蒙古冰草和航道冰草及其四倍体杂种F2 群体1个单株的基因组DNA为模板进行适宜引物筛选,从
256对SSR引物中选出条带清晰、重复性和多态性好的SSR适宜引物30对(表1,图2)。
利用这30对引物对F2 作图群体347个单株及亲本的DNA进行PCR扩增,共获得224个位点,平均每对引
物扩增出7.47个位点,其中多态性标记位点185个,平均多态性标记位点百分率为82.6%,表明该四倍体杂交
冰草F2 群体的SSR多态性丰富(图3,表1)。
2.3 SSR作图标记的分离及遗传连锁图谱特征分析
SSR标记分离及连锁图谱的基本特征如表2和图4所示。经卡方检验表明,当犘<0.05时,在已获得的185
个SSR多态性标记位点中,有161个标记符合孟德尔分离比例,其占标记总数的87.0%。另有24个SSR标记
产生偏分离,偏分离比例仅为13.0%,符合植物遗传作图时通常偏分离标记比率<30%的要求[20],这185个SSR
分子标记均可用于遗传作图。
利用Joinmap4.0软件对185个SSR标记进行连锁分析,构建出1张四倍体杂交冰草的SSR分子遗传连锁
框架图谱,该图谱包含14个连锁群、185个标记,14个连锁群的长度范围在123.0~202.6cM 之间,连锁群
LG12最短、LG4最长,各连锁群的平均长度为167.32cM,总长度为2342.5cM,标记间的平均距离为12.66cM。
69 ACTAPRATACULTURAESINICA(2016) Vol.25,No.6
表1 适宜犛犛犚引物碱基序列及其多态性标记位点
犜犪犫犾犲1 犖狌犮犾犲狅狋犻犱犲狊犲狇狌犲狀犮犲狅犳犛犛犚狆狉犻犿犲狉狊犪狀犱狆狅犾狔犿狅狉狆犺犻犮犿犪狉犽犲狉狊犾狅犮犻
引物
Primer
正向引物碱基序列
Forwardprimernucleotide
sequence
反向引物碱基序列
Reverseprimernucleotide
sequence
扩增位点数
Amplified
lociNo.
多态位点数
Polymorphic
lociNo.
多态位点百分率
Polymorphicloci
percentage(%)
AH4 5′GCGAAACCAACAGCAAGG3′ 5′CGAAGTCGGCGTTCATCTC3′ 7 5 71.4
AH15 5′AGAGCGATCCCAGAAACA3′ 5′GCAACGGGTGGTAGAAAT3′ 8 7 87.5
AH25 5′TTGAACCGAAGAAAGGGAT3′ 5′CAAAGCAGTAAGGGGAAA3′ 5 3 60.0
AH63 5′CACCATCCTCCTCCTACCC3′ 5′AGCAGCAGCCATCTCAAAA3′ 8 6 75.0
AH70 5′TTGCACTACCGTGACTTT3′ 5′AGAAACCACGCTCACATA3′ 6 5 83.3
AH71 5′TGCCCAACCGAATCACAA3′ 5′CTGGACGGAGCCACATCA3′ 10 10 100.0
AH85 5′CAAGGCTGAGGTCAAGAA3′ 5′GGAAGCACCATGAAACAC3′ 6 5 83.3
B3107 5′CTTGTTCACCTTGCTTGCCTAT3′ 5′ATGCGTTTCTGCTCTGTTCACT3′ 5 5 100.0
B3252 5′CGCCGAGTCCCAGTAGTGTT3′ 5′CGAGGGCAATCCAGAGTTCA3′ 10 8 80.0
Brac124 5′TGCACCCCTTCCAAATCT3′ 5′TGCGAGTCGTGTGGTTGT3′ 5 4 80.0
Barc1060 5′GCGTCTATTTTTGCCATTTCCA3′ 5′GCGATGTTCTGTAGTTCTTAGTGTT3′ 5 4 80.0
C12 5′CGCCGAGTCCCAGTAGTGTT3′ 5′CGAGGGCAATCCAGAGTTCA3′ 12 10 83.3
C2743 5′CCTACTACTGGCGGATGAAG3′ 5′CTACTCCTGGACAGCGAAAC3′ 9 7 77.8
C3269 5′TTTCCACTCGGCTCTTG3′ 5′CCAGTTTGGCAGTTTCG3′ 7 7 100.0
C5511 5′GCAGCAACACCAATCCTA3′ 5′GCAGCAACACCAATCCTA3′ 5 5 100.0
D965 5′CTTTGAGAAGTGCCAGACG3′ 5′GGGAATAGCAGCAACGAA3′ 9 8 88.9
D5750 5′CGCCGAGTCCCAGTAGTGTT3′ 5′CGAGGGCAATCCAGAGTTCA3′ 6 6 100.0
F3974 5′ATGCCTACGCCTACAACAA3′ 5′CAACGGACGAAACGAGAA3′ 11 9 81.8
F2359 5′GGATTTCCAGCCCTACCA3′ 5′CTTTCCACCGATTCACCC3′ 9 8 88.9
S68 5′AACCGAACCAAACCAAGC3′ 5′GCAGAGCAACGCACAGAA3′ 8 6 75.0
Tc68268 5′CAGTGTTCTTGGAGCTGCTG3′ 5′GCAAACGAATAAGCAGGGTC3′ 7 5 71.4
Tc69675 5′ACACAACATAGCGCATGGAA3′ 5′CCTGTGGGTTTTGCTGAGAT3′ 7 5 71.4
Tc85804 5′CCTCCTCCGACTCCTTTTTC3′ 5′GCTCTGGTCTGTTTCCCTGT3′ 7 6 85.7
Txp83 5′CGCTAGTCAAAATTGAGGAG3′ 5′CAAACCGATAAACAAGTATG3′ 8 6 75.0
Txp158 5′GCCATCAGGGATTGAC3′ 5′GAGCTTCGCTGAGTAAGG3′ 6 6 100.0
Txp160 5′AGTCGGCTGGTAAAGTGG3′ 5′GGATATGGGATGGTTTGG3′ 7 5 71.4
Txp353 5′CTCCAACATGCTCTGCTG3′ 5′GGATCAACTTATTGGGGATG3′ 6 5 83.3
Wmc506 5′CACTTCCTCAACATGCCAGA3′ 5′CTTTCAATGTGGAAGGCGAC3′ 9 7 77.8
Wmc617 5′CCACTAGGAAGAAGGGGAAA3′ 5′ATCTGGATTACTGGCCAACTGT3′ 7 5 71.4
Xgwm169 5′GTGCTCTGCTCTAAGTGTGGG3′ 5′ACCACTGCAGAGAACACATACG3′ 9 7 77.9
合计Total 224 185 82.6
图2 用犉2 的1个单株及双亲的犇犖犃对部分犛犛犚引物筛选结果
犉犻犵.2 犛犛犚狆狉犻犿犲狉狊犮狉犲犲狀犻狀犵狉犲狊狌犾狋狑犻狋犺狅狀犲狆犾犪狀狋犻狀犉2狆狅狆狌犾犪狋犻狅狀犪狀犱狆犪狉犲狀狋狊
F2:F2的1个单株;P1:蒙古冰草;P2:航道冰草。F2:OneplantofhybridF2;P1:犃.犿狅狀犵狅犾犻犮狌犿;P2:犃.犮狉犻狊狋犪狋狌犿cv.Fariway.
79第25卷第6期 草业学报2016年
图3 引物犇965(犃)和犉3974(犅)对犉2 分离群体部分单株及其亲本犇犖犃的扩增结果
犉犻犵.3 犇犖犃犪犿狆犾犻犳犻犲犱狉犲狊狌犾狋狊狅犳狆犪狉狋犻犪犾狆犾犪狀狋狊狅犳犉2狊犲犵狉犲犵犪狋犻狀犵狆狅狆狌犾犪狋犻狅狀犻狀犺狔犫狉犻犱狑犺犲犪狋犵狉犪狊狊犪狀犱
狋犺犲犻狉狆犪狉犲狀狋狊狌狊犻狀犵狋犺犲狆狉犻犿犲狉犇965(犃)犪狀犱犉3974(犅)
P1:蒙古冰草;P2:航道冰草;1-55:F2群体部分单株。M:MarkerDL1000.P1:犃.犿狅狀犵狅犾犻犮狌犿;P2:犃.犮狉犻狊狋犪狋狌犿cv.Fariway;1-55:F2partial
plants.
表2 四倍体杂交冰草犛犛犚标记分离及遗传连锁图谱的基本特征
犜犪犫犾犲2 犜犺犲狊犲犵狉犲犵犪狋犻狅狀狅犳犛犛犚犿犪狉犽犲狉狊犪狀犱狋犺犲犫犪狊犻犮犮犺犪狉犪犮狋犲狉犻狊狋犻犮狊狅犳犵犲狀犲狋犻犮犿犪狆犻狀狋犲狋狉犪狆犾狅犻犱犺狔犫狉犻犱狑犺犲犪狋犵狉犪狊狊
连锁群
Linkage
groups
连锁群长度
Maplength
(cM)
连锁标记数
No.oflinked
markers
偏分离标记数 (犘<0.05)
No.ofbiased
markers
偏分离标记比率
Ratioofdistortedmarkers
(%)
标记间平均距离
Averagedistance
(cM)
LG1 174.9 5 1 20.0 34.98
LG2 175.4 10 2 20.0 17.54
LG3 180.8 5 0 0 36.16
LG4 202.6 29 4 13.8 6.99
LG5 195.3 18 2 7.1 11.49
LG6 147.5 41 6 11.8 3.60
LG7 150.5 12 2 16.7 12.54
LG8 141.4 3 0 0 47.13
LG9 151.2 3 0 0 50.40
LG10 178.0 14 3 21.4 12.71
LG11 161.3 23 2 8.7 7.01
LG12 123.0 7 1 14.3 17.57
LG13 178.4 10 1 0.1 17.84
LG14 182.2 5 0 0 36.44
合计Total 2342.5 185 24 13.0 12.66
89 ACTAPRATACULTURAESINICA(2016) Vol.25,No.6
图4 四倍体杂交冰草犛犛犚分子遗传连锁框架图谱
犉犻犵.4 犛犛犚犵犲狀犲狋犻犮犾犻狀犽犪犵犲犿犪狆狅犳狋犲狋狉犪狆犾狅犻犱犺狔犫狉犻犱狑犺犲犪狋犵狉犪狊狊
3 讨论
高密度的分子遗传连锁图谱是深入开展植物重要性状QTL定位及分子标记辅助育种等研究的基础[2122]。
与小麦、玉米、水稻(犗狉狔狕犪狊犪狋犻狏犪)等农作物构建的遗传连锁图相比,目前国内外已构建的牧草遗传连锁图谱的
图幅均偏小,且标记间空隙较大,使得遗传图谱在牧草分子标记辅助育种及重要性状QTL定位等研究方面较薄
弱。本课题组曾利用蒙古冰草×航道冰草杂种F2 分离群体构建了含7个连锁群、175个分子标记(AFLP标记
152个、RAPD标记23个)的二倍体杂交冰草分子遗传图谱,其全长为416cM,平均标记间密度为2.47cM[15];
本试验构建了含14个连锁群、185个SSR标记的四倍体杂交冰草分子遗传连锁图谱,其全长为2342.5cM,远超
过二倍体杂交冰草图谱的长度,表明四倍体的基因组明显大于二倍体;但标记间的密度(12.66cM)小于二倍体,
而且在各连锁群上标记的分布密度不均匀,如连锁群LG6上的标记数较多,密集了40个SSR标记,而连锁群
LG8和LG9上SSR标记数均只有3个,这说明该图谱是一张SSR框架图谱,还有待于进一步扩大SSR标记数
量或与其他分子标记如AFLP及SRAP等进行整合,来增加图谱中的分子标记数目、加大图谱密度,目前课题组
正在开展四倍体杂交冰草遗传连锁图谱的加密研究。
99第25卷第6期 草业学报2016年
遗传图谱精确度的高低很大程度取决于构建群体的大小,理论上作图群体越大,作图精度就越高,但若作图
群体过大,就会使实验工作量和费用相应增加,故选择合适的群体数目很重要[2324]。从作图效率看,作图群体的
大小主要决定于3个方面:一是参照随机分离的结果计算出最大图距,二是两个标记间能够测算出重组的最小图
距,三是所选用作图群体的类型。为了能够提高作图精度,在构建植物分子标记连锁图时需考虑作图群体的类
型,一般认为作图所需的群体大小的顺序为F2>Rl>BC和DH[25]。目前在牧草上遗传图谱构建所用的作图群
体在100~200个之间,本试验选用四倍体杂交冰草F2 分离群体的347个单株进行遗传作图研究,主要考虑多年
生牧草的多倍性,其数量性状分离复杂且表型受环境影响较大,因此控制试验误差显得尤为重要。
4 结论
试验筛选出条带清晰、重复性和多态性好的SSR适宜引物30对。对四倍体杂交冰草F2 群体347个单株及
亲本的基因组DNA进行PCR扩增得到185个SSR标记。构建了1张四倍体杂交冰草SSR分子遗传连锁框架
图谱,其14个连锁群的长度变幅123.0~202.6cM,覆盖基因组总长度2342.5cM,标记间的平均距离12.66
cM。
犚犲犳犲狉犲狀犮犲狊:
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