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Cloning and expression of PtGAPDH from Puccinellia tenuiflora

星星草PtGAPDH基因的克隆与表达分析



全 文 :星星草犘狋犌犃犘犇犎基因的克隆与表达分析
张1,郭海俊1,刘龙飚2,王卅1,梁颖1,聂玉哲1,李玉花1
(1.东北林业大学生命科学学院,黑龙江 哈尔滨150040;2.中国石油天然气管道工程有限公司天津设计院,天津300457)
摘要:本试验利用RACE(rapidamplificationofcDNAends)克隆技术从星星草中克隆得到抗盐碱相关基因甘油醛
3磷酸脱氢酶(犌犃犘犇犎)的cDNA全长序列,其 GeneBank登录号为JX411954。犘狋犌犃犘犇犎 基因开放阅读框为
1014bp,编码337个氨基酸。该氨基酸序列与高羊茅、大麦、小麦、水稻等禾本科作物具有较高的序列相似性。系
统进化分析表明,犘狋犌犃犘犇犎 基因编码蛋白与单子叶植物的GAPDH具有较近的亲缘关系。Northern杂交分析显
示,在一定盐碱胁迫条件下,随着处理试剂Na2CO3 溶液浓度的增加,犘狋犌犃犘犇犎 基因在盐碱胁迫下的叶片和根部
表达量都显著升高;超过最大耐受量后,犘狋犌犃犘犇犎 基因表达丰度逐渐降低。犘狋犌犃犘犇犎 基因的表达模式代表了
星星草在盐碱胁迫下其自身的生理生化变化对分子水平上的基因表达丰度产生的影响趋势。
关键词:星星草;盐碱胁迫;犘狋犌犃犘犇犎;RACE克隆;表达分析
中图分类号:S540.3  文献标识码:A  文章编号:10045759(2014)02020708
犇犗犐:10.11686/cyxb20140225  
  星星草(犘狌犮犮犻狀犲犾犾犻犪狋犲狀狌犻犳犾狅狉犪)俗称碱茅,属多年生旱中生盐生草本植物,广泛分布在我国北方和世界大部
分地区,具有适应性强、耐旱、耐寒、耐盐碱等特性,是一种较好的改良盐碱化土壤的先锋植物[1]。该植物的根系
发达,具有较强的耐盐碱能力,在生理上通过渗透调节作用减轻盐碱对细胞膜的损害,利用有限的水分散失获取
最大的CO2 同化量,降低气孔导度、延缓蒸腾作用以适应盐碱胁迫下吸水困难的特性[2]。在分子水平上,通过构
建星星草cDNA文库及芯片杂交的方法,已获得部分与耐盐碱特性相关的高丰度表达基因[3],包括离子和水分
转运、细胞代谢和防御、信号转导与转录调控等方面。
目前在星星草抗盐碱特性分子机制的研究中,已经获得采用NaHCO3 胁迫的模拟盐碱环境中的星星草基因
表达谱,并通过差异显示技术获得了多个差异表达的基因片段[4]。
在从星星草中分离出的相关抗盐碱基因中,如 犎犓犜2[5],犌犃犘犇犎 等基因都是其中重要的基因之一,而
犌犃犘犇犎 编码的蛋白(GAPDH)是高等植物糖酵解过程中的关键酶,是维持生命活动能量形成的基本酶类之
一[6],参与基因表达的转录后控制,作用于核tRNA运输、DNA复制与修复等过程,以及调控组蛋白基因的表
达、调节端粒结构等[78]。此外,GAPDH通过抑制活性氧积累[9]、激活 MAPK级联反应[10]等途径及多种修饰作
用[1112]参与多种生理过程,具有抵抗逆境胁迫的功能。然而,关于GAPDH参与植物逆境胁迫响应的机制还需
进一步深入研究。
本研究以星星草为试材,采用cDNA末端快速扩增(rapidamplificationofcDNAends,RACE)的方法克隆
星星草犌犃犘犇犎 基因,并对其在盐碱胁迫下的表达情况进行了分析,为在分子水平上研究星星草的耐盐碱机制、
深入了解星星草犌犃犘犇犎 基因的功能提供依据。
1 材料与方法
1.1 试验材料
星星草种子来源于2008年5月份返碱期在黑龙江省青冈县(东经126°06″,北纬46°41″)天然盐碱地(pH
9.5)草场,采摘后于2010年种于温室,栽培基质采用草炭土∶珍珠岩∶蛭石=3∶2∶1,温度25℃,光照强度为
第23卷 第2期
Vol.23,No.2
草 业 学 报
ACTAPRATACULTURAESINICA   
207-214
2014年4月
收稿日期:20130822;改回日期:20131022
基金项目:“十二五”农村领域国家科技计划课题(2013AA102706)和东北林业大学中央高校基本科研业务费专项资金项目(DL12BA08)资助。
作者简介:张(1977),女,黑龙江哈尔滨人,副教授,博士。Email:summerzhang@126.com
通讯作者。Email:lyhshen@126.com
400μmol/(m
2·s),相对湿度65%~75%,生长到8周龄时用0,50,100,150和200mmol/LNa2CO3 分别处理
24h后取其地上部分,每组同时取3次样,用于实验重复,然后用液氮速冻,于-80℃保存备用。在此基础上,采
用200mmol/LNa2CO3 分别处理0,2,6,12,24,48和72h,将草的叶片和根部剪下,每组同时取3次样用于实验
重复,用液氮速冻,于-80℃冰箱保存备用。
1.2 RNA提取与RACE库构建
采用十六烷基三甲基溴化铵(CTAB)的方法提取
星星草地上部总RNA,灭菌去离子水溶解RNA,利用
NanoDrop1000微量紫外分光光度计测量样品的
OD260和 OD280比值及浓度,并用琼脂糖凝胶电泳检测
RNA的完整性。利用 mRNAPurificationKit(购自
AmershamBiosciences公司)对星星草RNA进行纯
化,然后利用 MarathonTM cDNA AmplificationKit
(购自BDBiosciences公司)构建星星草RACEcDNA
库,最后利用RACEcDNA库进行基因克隆。
星星草犌犃犘犇犎 基因克隆及Northern杂交探针
引物通过PrimerPrimer5软件设计,并由上海生物工
程有限公司进行合成。引物序列见表1。
1.3 星星草犌犃犘犇犎 基因克隆及序列测定
对星星草犌犃犘犇犎 基因3′序列的克隆,根据星星
表1 星星草犌犃犘犇犎基因同源克隆及表达分析所用引物
犜犪犫犾犲1 犔犻狊狋狅犳狆狉犻犿犲狉狊狌狊犲犱犳狅狉犮犾狅狀犻狀犵犪狀犱犲狓狆狉犲狊狊犻狅狀
犪狀犪犾狔狊犻狊狅犳犌犃犘犇犎犳狉狅犿犘.狋犲狀狌犻犳犾狅狉犪
编号
No.
引物名称
Primername
核苷酸序列(5′→3′)
Nucleotidesequence5′to3′
1 AP1 CCATCCTAATACGACTCACTATAGGGC
2 AP2 ACTCACTATAGGGCTCGAGCGGC
3 GSP5′1 CGTTCACTTGGTGGCGTGCGATG
4 GSP5′2 TGCTGGACCTGCTGTCACCCTGG
5 GSP3′1 TCCAGGGTGACAGCAGGTCCAGC
6 GSP3′2 TCGCACGCCACCAAGTGAACGGG
7 GAPDHLF ATGGCTCCCATCAAGATCGGCA
8 GAPDHLR GGCCTCAGCCCGTTCACTTGG
9 GAPDHNF ATGACCGCTACCCAGAAG
10 GAPDHNR TCCTCATCGACGTAACCTA
草抑制性消减杂交文库中犌犃犘犇犎 基因的EST序列(GeneBank登录号GW405820),设计2条3′RACE上游引
物GSP3′1和GSP3′2,然后以RACEcDNA库为模板进行巢式PCR扩增。第一轮PCR反应引物采用GSP3′1
及AP1,反应程序为94℃2min;94℃30s,68℃30s,72℃2min,35个循环;72℃,7min。第二轮PCR反应引
物采用GSP3′2及AP2,反应程序为94℃2min;94℃30s,57℃30s,72℃1.5min,35个循环;72℃,7min。
对于星星草犌犃犘犇犎 基因5′序列的克隆,根据星星草犌犃犘犇犎 基因片段,设计2条5′RACE上游引物
GSP5′1和GSP5′2。然后以RACEcDNA库为模板进行巢式PCR扩增。第一轮PCR反应引物采用GSP5′1及
AP1,反应程序为94℃2min;94℃30s,68℃30s,72℃2min,35个循环;72℃,7min。第二轮PCR反应引物采
用GSP5′2及AP2,反应程序为94℃2min;94℃30s,55℃30s,72℃1.5min,35个循环;72℃,7min。
对于克隆得到星星草犌犃犘犇犎3′和5′的基因片段测序并拼接,并在 NCBI网站上利用 ORF(openreading
framefinder)预测氨基酸序列,并根据ORF两端序列设计特异引物GAPDHLF和 GAPDHLR扩增犌犃犘犇犎
基因的编码区。反应程序为94℃2min;94℃30s,56℃30s,72℃2min,35个循环;72℃,7min。
将所有PCR产物利用天根公司的胶回收试剂盒对电泳后产物进行回收纯化,并与天根公司的pBSTTA载
体进行连接,转化到TaKaRa公司Top10大肠杆菌感受态细胞中,提取重组质粒,质粒经过PCR鉴定后送北京
六合华大基因进行测序。
1.4 序列比对及系统发育分析
为了明确所克隆基因在生物信息学中的进化地位,将所得序列与EMBL/DDBJ/GenBank数据库中序列进
行BLAST检索比对,获得与所克隆序列高度相似的同源基因序列,使用ClustalX1.83软件进行碱基序列比对,
使用GeneDoc软件进行氨基酸序列比对分析及保守域的信息标注;使用NCBI提供的ORFfinder与保守区数据
库(conserveddomaindatabase,CDD)分别进行基因开放阅读框分析与蛋白保守结构域分析,并将克隆所得碱基
序列按照标准遗传密码子的翻译方式转换为氨基酸序列。使用ExPASY软件计算蛋白的理论分子量、等电点、
不稳定系数等参数;使用ProtScale预测和分析蛋白质的疏水性/亲水性。利用SignalP3.0(或4.0)Server程序
预测信号肽结构。用 MEGA4软件的邻位相连法(neighborjoining,NJ)构建系统树。参数设定1000个抽样重
802 ACTAPRATACULTURAESINICA(2014) Vol.23,No.2
复进行Bootstrap验证,泊松校验(PoissonCorrection)作为计算距离的方法。
1.5 星星草犘狋犌犃犘犇犎 基因的表达分析
利用CTAB试剂提取经不同浓度Na2CO3(0,50,100,150,200mmol/L)处理及不同处理时间(0,2,6,12,
24,48,72h)的星星草地上部及根部样品总RNA;分别取10μg总RNA样品进行1.0%的甲醛琼脂糖变性凝胶
电泳,并转移到HybondN+尼龙膜上,65℃预杂交1h,使用地高辛标记的犌犃犘犇犎 特异探针(探针引物GAP
DHNF及NR,探针长度300bp)杂交1h,显影,通过Northern杂交检测犌犃犘犇犎 基因在不同处理条件下的表
达量变化。
2 结果与分析
2.1 星星草犌犃犘犇犎 基因全长cDNA序列的克隆及序列比对
根据星星草犌犃犘犇犎 基因的EST序列,设计犌犃犘犇犎 基因的3′端和5′端基因特异引物,利用构建的星星草
RACEcDNA库,分别克隆得到基因3′端(241bp)和5′端(953bp),经过拼接得到1300bp全长基因序列(图1)。
去除该基因的3′端非编码区和5′端非编码区,该基因CDS长为1014bp,包含1个编码337个氨基酸的开放阅读
框。将此基因序列及其推导的氨基酸序列在NCBI的数据库中进行Blastn和Blastp比对分析,该基因与大麦
(犎狅狉犱犲狌犿狏狌犾犵犪狉犲)、小麦(犜狉犻狋犻犮狌犿犪犲狊狋犻狏狌犿)、水稻(犗狉狔狕犪狊犪狋犻狏犪)等植物的犌犃犘犇犎 基因具有极高的相似
性,因而将该基因片段命名为犘狋犌犃犘犇犎,GenBank登录号为JX411954。该基因编码蛋白的预测分子量为36.5
kDa,理论等电点(pI)为6.40,负电荷残基总数(Asp+Glu)为41,正电荷残基总数(Arg+Lys)为39,不稳定系数
为23.17,属于稳定蛋白;亲水性(grandaverageofhydropathicity,GRAVY)值为-0.068,说明此蛋白属于亲水
蛋白。信号肽预测表明,犘狋犌犃犘犇犎 基因编码的蛋白无信号肽结构,为非分泌性蛋白(nonsecretoryprotein)。
图1 犘犆犚产物检测
犉犻犵.1 犜犺犲犘犆犚犪犿狆犾犻犳犻犮犪狋犻狅狀狉犲狊狌犾狋狊狅犳犘狋犌犃犘犇犎
M:DL2000标记;A:3′PCR产物;B:5′PCR产物;C:CDS产物。M:DL2000marker;A:3′PCRproduct;B:5′PCRproduct;C:CDSproduct.
利用NCBI的蛋白保守区数据库(CDD)对PtGAPDH蛋白进行蛋白保守区预测。结果显示,犘狋犌犃犘犇犎 基
因编码的蛋白具有2个保守区,分别是 Gp_dh_N 末端(Gp_dh_Nsuperfamily)和Gd_ph_C末端超家族
(Gd_ph_Csuperfamily)。结合已有报道,如毛竹(犘犺狔犾犾狅狊狋犪犮犺狔狊狆狌犫犲狊犮犲狀狊)GAPDH蛋白[12]为糖酵解和糖异生
的关键酶,也具有2个保守的结构域:其中保守区的C端为Gd_ph_Cα螺旋和反平行β折叠的混合结构,是行使
糖运输和糖代谢的催化功能域;另一个保守区是Gd_ph_N,为NAD+结合功能域(图2),由此类比表明PtGAP
DH蛋白具有高度的保守性。
PtGAPDH与其他近缘物种GAPDH蛋白质的多重氨基酸序列比对结果表明,星星草犘狋犌犃犘犇犎 基因编码
的氨基酸序列与其他近源物种的GAPDH蛋白均具有较高的相似性,相似度约在87%~97%之间,其中与禾本
科植物高羊茅(犉犲狊狋狌犮犪犪狉狌狀犱犻狀犪犮犲犪)、大麦、小麦、水稻的相似性最高,分别为97%,96%,95%和91%,显示了
犌犃犘犇犎 基因在物种进化过程中的保守性;MEMEMotif分析表明在PtGAPDH蛋白的第135~142个氨基酸
902第23卷第2期 草业学报2014年
位置以及第314~322个氨基酸位置分别含有2个保守的基序结构,推测其与GAPDH作为甘油醛3磷酸脱氢
酶在糖酵解中行使的功能相关(图3)。
2.2 犘狋犌犃犘犇犎 与其他近缘物种的犌犃犘犇犎 基因的系统发育关系
为了确定犘狋犌犃犘犇犎 基因的系统发生位置,从EMBL/DDBJ/GenBank数据库中选取16个近源物种的
犌犃犘犇犎 基因的序列信息来构建系统发生树。图4显示了系统发生树构建的结果,星星草犘狋犌犃犘犇犎 基因编码
蛋白与单子叶植物的GAPDH为同一起源,并与高羊茅的同源性最高,在进化上属于同一类分支。
图2 犘狋犌犃犘犇犎基因编码蛋白的氨基酸保守区
犉犻犵.2 犜犺犲犮狅狀狊犲狉狏犲犱犱狅犿犪犻狀狅犳犘狋犌犃犘犇犎
 Gp_dh_Nsuperfamily:甘油醛3磷酸脱氢酶,N端结构域。Gp_dh_Csuperfamily:甘油醛3磷酸脱氢酶,C端结构域。PLN02358:甘油醛3磷酸
脱氢酶。
 
图3 不同植物来源的犌犃犘犇犎氨基酸序列多重比对
犉犻犵.3 犆狅犿狆犪狉犻狊狅狀狅犳狋犺犲犪犿犻狀狅犪犮犻犱狊犲狇狌犲狀犮犲狊狅犳犌犃犘犇犎犻狀犱犻犳犳犲狉犲狀狋狆犾犪狀狋狊
012 ACTAPRATACULTURAESINICA(2014) Vol.23,No.2
续图3 不同植物来源的犌犃犘犇犎氨基酸序列多重比对
犆狅狀狋犻狀狌犲犉犻犵.3 犆狅犿狆犪狉犻狊狅狀狅犳狋犺犲犪犿犻狀狅犪犮犻犱狊犲狇狌犲狀犮犲狊狅犳犌犃犘犇犎犻狀犱犻犳犳犲狉犲狀狋狆犾犪狀狋狊
 犘狋犌犃犘犇犎 (GeneBank登录号Accessionnumber,JX411954):星星草犘狌犮犮犻狀犲犾犾犻犪狋犲狀狌犻犳犾狅狉犪;TmGAPDH (GeneBank登录号Accessionnumber,
AY857765):一粒小麦犜狉犻狋犻犮狌犿犿狅狀狅犮狅犮犮狌犿;ZmGAPDH (GeneBank登录号 Accessionnumber,EU963991):玉米犣犲犪犿犪狔狊;SiGAPDH (Gene
Bank登录号Accessionnumber,XM_004972916):小米犛犲狋犪狉犻犪犻狋犪犾犻犮犪;LtGAPDH(GeneBank登录号Accessionnumber,EU328533):毒麦犔狅犾犻狌犿
狋犲犿狌犾犲狀狋狌犿;FaGAPDH(GeneBank登录号Accessionnumber,GQ480772):高羊茅犉犲狊狋狌犮犪犪狉狌狀犱犻狀犪犮犲犪;HvAK359500(GeneBank登录号Accession
number,AK359500):大麦芽犎狅狉犱犲狌犿狏狌犾犵犪狉犲;OsGAPDH (GeneBank登录号 Accessionnumber,GQ848049):水稻犗狉狔狕犪狊犪狋犻狏犪;TaGAPDH
(GeneBank登录号 Accessionnumber,FN429985):小麦犜狉犻狋犻犮狌犿犪犲狊狋犻狏狌犿;HvGAPDH(GeneBank登录号 Accessionnumber,X60343):大麦芽
犎狅狉犱犲狌犿狏狌犾犵犪狉犲;BdGAPDH(GeneBank登录号Accessionnumber,XM_003573276):二穗短柄草犅狉狅犮犺狔狆狅犱犻狌犿犱犻狊狋犪犮犺狔狅狀;PsGAPDH(Gene
Bank登录号Accessionnumber,DQ922680):西伯利亚蓼犘狅犾狔犵狅狀狌犿狊犻犫犻狉犻犮狌犿;AlGAPDH(GeneBank登录号Accessionnumber,JN604531):獐草
犃犲犾狌狉狅狆狌狊犾犪犵狅狆狅犻犱犲狊;PpGAPDH(GeneBank登录号Accessionnumber,AB826123):沙梨犘狔狌狉狊狆狔狉犻犳狅犾犻犪.
2.3 盐碱胁迫下犘狋犌犃犘犇犎 基因的表达分析
为了检测星星草犘狋犌犃犘犇犎 基因与盐碱逆境的应答关系,利用Na2CO3 溶液模拟盐碱胁迫,对星星草犘狋
犌犃犘犇犎 基因的表达特性进行Northern杂交检测。采用不同浓度的Na2CO3 溶液对星星草植株进行处理,图5
所示的Northern杂交结果表明,50~200mmol/LNa2CO3 溶液处理24h后植株地上部犘狋犌犃犘犇犎 基因的表达
量均比对照组未处理的植株样品有不同程度的增加,且200mmol/LNa2CO3 处理后表达量处于较高的稳定水
平。
选择200mmol/LNa2CO3 溶液对星星草进行处理,并进行时间梯度的表达分析。图6和图7所示的结果表
明,植株地上部及根部犘狋犌犃犘犇犎 对Na2CO3 处理后的胁迫均具响应。在星星草的叶片中,犘狋犌犃犘犇犎 基因在
无盐碱处理的样品(0h)中几乎没有表达,在盐碱处理2和6h后表达量增加;但在处理12h时,表达量又有所下
降;当处理24h时表达量又上升且达到最高,在处理48及72h后表达量又回落,呈逐渐下降趋势。在根部中,
犘狋犌犃犘犇犎 基因在无盐碱胁迫处理时几乎不表达,在2h后开始出现表达丰度,且表达量缓慢升高,在24h后表
112第23卷第2期 草业学报2014年
达量达到最大值,但在48及72h后表达量又有所回落,呈逐渐下降趋势。表明一定浓度的盐碱胁迫诱导犘狋
犌犃犘犇犎 基因的高丰度表达,但是当胁迫程度(包括胁迫时间和浓度)超过可承受范围后,星星草样品的生理生
化机制发生变化,犘狋犌犃犘犇犎 基因的表达、应答通路受到干扰,导致其表达量回落到低水平。
图4 犘狋犌犃犘犇犎进化树分析
犉犻犵.4 犘犺狔犾狅犵犲狀犻犮犪狀犪犾狔狊犻狊狅犳犘狋犌犃犘犇犎犻狀狏犪狉犻狅狌狊狆犾犪狀狋狊狆犲犮犻犲狊
 犘狋犌犃犘犇犎(GeneBank登录号Accessionnumber,JX411954):星星草犘狌犮犮犻狀犲犾犾犻犪狋犲狀狌犻犳犾狅狉犪;AtGAPDH(GeneBank登录号 Accessionnumber,
NP17280):拟南芥犃狉犪犫犻犱狅狆狊犻狊狋犺犪犾犻犪狀犪;AcGAPDH (GeneBank登录号Accessionnumber,ADQ43814):菠萝犃狀犪狀犪狊犮狅犿狅狊狌狊;StGAPDH(Gene
Bank登录号 Accessionnumber,ABB72804):马铃薯犛狅犾犪狀狌犿狋狌犫犲狉狅狊狌犿;PpGAPDH(GeneBank登录号 Accessionnumber,EMJ23673):碧桃
犘狉狌狀狌狊狆犲狉狊犻犮犪;MtGAPDH(GeneBank登录号Accessionnumber,XP003601828):蒺藜苜蓿 犕犲犱犻犮犪犵狅狋狉狌狀犮犪狋狌犾犪;OsGAPDH(GeneBank登录号
Accessionnumber,NP001053139):水稻犗狉狔狕犪狊犪狋犻狏犪;TaGAPDH(GeneBank登录号 Accessionnumber,ABQ81648):小麦犜狉犻狋犻犮狌犿犪犲狊狋犻狏狌犿;
HvGAPDH(GeneBank登录号 Accessionnumber,BAJ90709):大麦 犎狅狉犱犲狌犿狏狌犾犵犪狉犲;SlGAPDH(GeneBank登录号 Accessionnumber,XP
004239181):番茄犛狅犾犪狀狌犿犾狔犮狅狆犲狉狊犻犮狌犿;FaGAPDH(GeneBank登录号Accessionnumber,ACV86034):高羊茅犉犲狊狋狌犮犪犪狉狌狀犱犻狀犪犮犲犪;AmGAPDH
(GeneBank登录号Accessionnumber,CAA42103):金鱼草犃狀狋犻狉狉犺犻狌犿犿犪犼狌狊;LcGAPDH(GeneBank登录号Accessionnumber,AEO72143):荔枝
犔犻狋犮犺犻犮犺犻狀犲狀狊犻狊;VvGAPDH(GeneBank登录号 Accessionnumber,XP_002263145):葡萄犞犻狋犻狊狏犻狀犻犳犲狉犪;ThGAPDH(GeneBank登录号 Accession
number,BAJ33926):盐芥犜犺犲犾犾狌狀犵犻犲犾犾犪犺犪犾狅狆犺犻犾犪;SdGAPDH(GeneBank登录号 Accessionnumber,AEO45785):野甘草犛犮狅狆犪狉犻犪犱狌犾犮犻狊;Zm
GAPDH(GeneBank登录号Accessionnumber,ADZ55283):玉米犣犲犪犿犪狔狊.
图5 不同浓度犖犪2犆犗3 处理后犘狋犌犃犘犇犎
基因的表达
犉犻犵.5 犘狋犌犃犘犇犎犲狓狆狉犲狊狊犻狅狀犪犳狋犲狉犱犻犳犳犲狉犲狀狋
犖犪2犆犗3犮狅狀犮犲狀狋狉犪狋犻狅狀狊狋狉犲狊狊
图6 200犿犿狅犾/犔犖犪2犆犗3 处理不同时间
后星星草叶片犘狋犌犃犘犇犎基因的表达
犉犻犵.6 犘狋犌犃犘犇犎犲狓狆狉犲狊狊犻狅狀犪犳狋犲狉狋犻犿犲犵狉犪犱犻犲狀狋
狊狋狉犲狊狊狑犻狋犺200犿犿狅犾/犔犖犪2犆犗3犻狀犾犲犪犳
3 讨论
在植物的抗盐生理研究中,先前多以 NaCl为研究对象。然而在自然界的盐害胁迫中,除了 NaCl外,以
Na2CO3 为主的碱性盐也对植物产生重要影响。盐、碱2种胁迫机理有着明显的不同,但较NaCl产生的盐胁迫
212 ACTAPRATACULTURAESINICA(2014) Vol.23,No.2
而言,Na2CO3带来的碱胁迫由于其能够提高土壤的
图7 200犿犿狅犾/犔犖犪2犆犗3 处理不同时间
后星星草根部犘狋犌犃犘犇犎基因的表达
犉犻犵.7 犘狋犌犃犘犇犎犲狓狆狉犲狊狊犻狅狀犪犳狋犲狉狋犻犿犲犵狉犪犱犻犲狀狋
狊狋狉犲狊狊狑犻狋犺200犿犿狅犾/犔犖犪2犆犗3犻狀狉狅狅狋 
pH 值,因而具有更大的生态破坏力。本研究以
Na2CO3 胁迫下的星星草为研究对象,对挖掘该植物
的抗逆潜力,揭示其抗性特点,讨论其耐盐碱机理具有
重要意义。研究表明星星草对盐胁迫的耐受强度要高
于碱胁迫[13]。处理结束时,NaCl胁迫的最高存活浓
度为600mmol/L,而 Na2CO3 的处理浓度超过200
mmol/L时即导致死亡。并且NaCl对植株产生的影
响比较缓慢,而Na2CO3 在处理浓度大于100mmol/L
后胁迫效应会明显加剧,使植物体的生长状态发生明
显变化,植物体内的一些渗透调节物质如脯氨酸等的积累量大幅升高[14],细胞内Na+含量较NaCl处理的植物
体有显著提高。而且与羊草(犔犲狔犿狌狊犮犺犻狀犲狀狊犻狊)具有相似的生长适应策略及 Na+、K+ 代谢响应[15]。尹尚军
等[16]研究指出,星星草的各种胁变指标的最大变化多发生在Na2CO3 浓度为150mmol/L时,本实验结果表明
星星草在Na2CO3 胁迫条件下的致死浓度为200mmol/L,因此在研究不同浓度盐碱胁迫对星星草抗逆基因表
达的影响中设计5个特定浓度,即:0,50,100,150和200mmol/L。此外,本研究中选取8周龄的星星草作为试
材的原因是因为星星草的草龄一般在4个月左右,而8周龄正好是该草的生理成熟期,在该时间段上基因的表达
和一些生理指标呈现稳定趋势,受外界环境的影响较小。而太老或太嫩的植株会在各种数据上产生波动,不宜揭
示植物耐盐碱特性。
植物在经受盐碱胁迫的过程中,随着盐碱浓度的增加,细胞膜的透性增强,对离子的选择性吸收减弱,从而使
细胞内积累大量Na+,保证细胞内外的渗透平衡。同时,盐碱胁迫会导致植物体内一些代谢副产物的累积,如活
性氧。Baek等[17]将犌犃犘犇犎 基因转化到拟南芥原生质体中,发现该基因能强烈抑制热胁迫时 H2O2 的产生和
细胞的死亡。而PtGAPDH就是该抗氧化系统中的重要酶类。随着对甘油醛3磷酸脱氢酶研究的不断深入,已
发现许多植物犌犃犘犇犎 基因可被多种环境胁迫所诱导,说明犌犃犘犇犎 基因的表达可能增强了植物抵抗这些胁
迫的能力。崔丽蓉等[18]对小麦进行胁迫处理后发现犌犃犘犇犎 基因被诱导,表达量迅速增加,进而强化其抵御环
境变化的胁迫。于丽丽等[19]利用PEG、NaCl及CdCl2 处理诱导柽柳(犜犪犿犪狉犻狓),发现犜犺犌犃犘犇犎 基因在根中
的表达上升,但抑制其在茎和叶中的表达,而NaHCO3处理均能诱导该基因在根、茎、叶中的表达。在本项研究
中,盐碱胁迫处理会导致犘狋犌犃犘犇犎 基因的高量表达。同时从各部分杂交结果体现的趋势来看,对于星星草的
叶片和根部,该基因在表达量上存在差异。
对星星草在不同浓度的盐碱胁迫下的犘狋犌犃犘犇犎 基因的表达情况进行研究发现,在Na2CO3 胁迫的致死浓
度范围内,不同浓度的Na2CO3 胁迫对基因的表达并没有太大影响,说明不同程度的胁迫都会引起该基因的表
达,但在表达量上却没有太大的差异。虽然在对关于不同浓度盐碱胁迫处理的 Northern杂交试验中不能得到
犘狋犌犃犘犇犎 基因表达量上的线性变化规律,但从Na2CO3 在处理浓度大于100mmol/L后胁迫效应会明显加剧
这一现象中可以推测,不同浓度盐碱胁迫对星星草生理指标的胁迫作用要强于基因表达方面对其的影响。因此
展开星星草不同浓度盐碱胁迫下生理指标的研究是进一步探讨抗逆植物耐盐碱机制的良好途径。
犘狋犌犃犘犇犎 基因在没有盐碱胁迫条件下,无论是叶片还是根部均几乎不表达。叶片在6和24h盐碱胁迫处
理后表达量达到最大值,其余的处理时间段上该基因都呈现弱的表达状态。而根部在24h处理后达到高峰,在
48h处理后表达量呈下降趋势,表明该基因在24h左右对胁迫的响应最大,而且在植物不同的部位,基因虽一直
持续对胁迫做出响应,但对胁迫的响应程度是有差异的。这可能是由于植株不同组织部位的渗透调节作用不同,
含水量以及无机离子和有机渗透调节物质的积累量也不同,所以叶片和根部在对胁迫的响应上可能存在时间和
空间上的差异。抗逆基因的表达量在盐碱胁迫下的规律性变化可以反应抗逆植株在抵御逆境胁迫过程中基因的
表达规律,为进一步深入地探讨植物耐盐碱机理奠定了理论基础。
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犆犾狅狀犻狀犵犪狀犱犲狓狆狉犲狊狊犻狅狀狅犳犘狋犌犃犘犇犎犳狉狅犿犘狌犮犮犻狀犲犾犾犻犪狋犲狀狌犻犳犾狅狉犪
ZHANGYang1,GUOHaijun1,LIULongbiao2,WANGSa1,
LIANGYing1,NIEYuzhe1,LIYuhua1
(1.ColegeofLifeSciences,NortheastForestryUniversity,Harbin150040,China;2.ChinaPetroleum
PipelineEngineeringCorporationTianjinDesignInstitute,Tianjin300457,China)
犃犫狊狋狉犪犮狋:AfullengthcDNAnamed犘狋犌犃犘犇犎relatedtosalinealkalitolerancewasclonedfrom犘狌犮犮犻狀犲犾犾犻犪
狋犲狀狌犻犳犾狅狉犪byRTPCRandRACE (rapidamplificationofcDNAends).犘狋犌犃犘犇犎 genewith1014bpopen
readingframeencodedaproteinwithapredictedlengthof337aminoacids.Phylogeneticanalysisindicatesthat
thisgene,denoted犘狋犌犃犘犇犎,hassequencecharacteristicssimilartoothermonocotyledon犌犃犘犇犎genes.
Northernblotshowstheexpressionof犘狋犌犃犘犇犎 hasincreasedwiththegrowthoftheconcentrationof
Na2CO3intheproperrealm,otherwise,hasdecreasedbothinleavesandroots.Theexpressionpatternof犘狋
犌犃犘犇犎genestandsfortheregulareffectsofthesalinealkalistressonthegeneexpressionof犘.狋犲狀狌犻犳犾狅狉犪on
themolecularstandard.
犓犲狔狑狅狉犱狊:犘狌犮犮犻狀犲犾犾犻犪狋犲狀狌犻犳犾狅狉犪;salinealkalistress;犘狋犌犃犘犇犎;RACEcloning;expressionanalysis
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