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Genetic diversity and relationships of zoysiagrass as revealed by SRAP markers

结缕草属植物种间关系和遗传多样性的SRAP标记分析



全 文 :书结缕草属植物种间关系和遗传
多样性的犛犚犃犘标记分析
郭海林1,2,郑轶琦1,2,陈宣2,薛丹丹1,2,刘建秀2
(1.南京农业大学园艺学院,江苏 南京210095;2.江苏省中国科学院植物研究所 南京中山植物园,江苏 南京210014)
摘要:通过SRAP标记技术对结缕草属植物5种1变种共96份种源进行遗传多样性分析。结果表明,1)结缕草属
种质间存在丰富的遗传多样性,54对SRAP引物共扩增出362条清晰的用于多样性分析的谱带,其中多态性条带
337条,多态性比率(PPB)为93.09%,Nei’s基因多样性指数(犎)为0.2409,Shannon信息指数(犐)为0.3746。2)
应用Nei-Li相似系数法估算了96份材料间的遗传相似系数(GS),其GS为0.5939~0.9834,平均为0.7588。
不同种之间,结缕草与中华结缕草、沟叶结缕草与细叶结缕草中的部分材料遗传相似系数较高,遗传距离较近。大
穗结缕草Z010和长花结缕草Z122与其他结缕草的遗传相似系数都相对较低。同一个种内,结缕草、中华结缕草
和沟叶结缕草种内遗传变异均较大,GS分别为0.5994~0.9834,0.6243~0.9807和0.6630~0.9475。3)通过
UPGMA分子系统聚类法,将96份种源分为7个大的类群,其中第1大类和第2大类均包含结缕草、中华结缕草和
少量的沟叶结缕草种源;第3大类群主要包括4份美国引进的材料;第4大类主要包括沟叶结缕草和细叶结缕草;
大穗结缕草Z010、长花结缕草Z122和结缕草Z115都单独聚为一类。从聚类结果可以看出,结缕草、中华结缕草和
沟叶结缕草均有交叉聚类现象,并不是同一个种的材料完全相聚,个别种源自行一类,遗传基础与其他材料差异较
大,从遗传聚类图可以很明确地看出96份种源间的遗传距离及亲缘关系。
关键词:结缕草属;种质资源;种间关系;遗传多样性;SRAP
中图分类号:S543+.903;Q943  文献标识码:A  文章编号:10045759(2009)05020110
   结缕草属(犣狅狔狊犻犪)植物是一种优良的暖季型草坪草,由于其具有广泛的土壤适应性,较强的抗性(抗寒性、
抗旱性、耐盐性、抗病虫害等)和耐粗放管理、省水节肥等优良特征,已被成功地应用于公园绿化、高尔夫球场和体
育场等各种草坪的建设中。随着对结缕草属植物应用的增加,对结缕草属植物的研究也越来越引起人们的重视,
从资源收集、资源评价到新品系选育已有一系列的研究报道[1~3]。
一般认为结缕草属植物有11个种和一些变种与变型,种的划分主要是根据小穗的特征与叶片的长度与宽度
等形态特征进行的[4,5]。综合系统地研究结缕草属植物不同种的系统发育关系和不同种源间的遗传多样性,将
有利于促进结缕草属植物的育种工作和新品系的改良。刘建秀等[6]和李亚等[7,8]对中国结缕草属植物的外部形
态遗传多样性进行了研究,Weng等[9~11]对生长在台湾地区的结缕草属植物进行了形态变异和同工酶变异2个
方面的研究,Kitamura[12],Yang等[13],Choi等[14]分别对分布于日本和韩国地区的结缕草属植物进行了形态变异
及同工酶的变异研究。形态学研究结果表明,由于结缕草属植物兼性的繁殖系统,种间天然杂种的普遍存在,结
缕草属植物不同的种在形态上存在连续的变异,因此给形态学分类鉴定和系统学研究带来了许多困难[15~17]。细
胞学研究结果表明,结缕草属植物在染色体数目上存在非常高的遗传相似性,染色体数目均为2n=4X=
40[18,19]。随着分子生物学的发展,分子标记技术被逐渐应用到结缕草属植物的遗传多样性及分类研究中,
Yaneshita等[5]对来自日本的17份结缕草品系通过RFLP(restrictionfragmentlengthpolymorphism,限制片段
长度多态性)技术进行遗传多样性研究;Choi等[20,21]和 Weng等[22]应用RAPD(randomamplifiedpolymorphic
DNA,随机扩增的多态性DNA)技术分别对韩国和台湾地区的结缕草属植物进行了遗传多样性研究,金洪[23]和
第18卷 第5期
Vol.18,No.5
草 业 学 报
ACTAPRATACULTURAESINICA   
201-210
2009年10月
 收稿日期:20080916;改回日期:20081023
基金项目:国家自然科学基金项目(30571307)资助。
作者简介:郭海林(1975),女,内蒙古乌盟人,助理研究员,在职博士生。Email:ghlnmg@sina.com
通讯作者。Email:turfunit@yahoo.com.cn
黄占兵[24]分别对中国的结缕草的遗传多样性进行了研究。研究结果表明,通过分子标记方法可以将结缕草、中
华结缕草、沟叶结缕草、细叶结缕草和大穗结缕草等不同的种以及杂种加以区分与鉴别,部分通过形态标记难以
区分的种(如中华结缕草和大穗结缕草)通过分子标记得以区分。
如上所述,前人已对结缕草属植物遗传多样性从不同角度进行了研究,但是日本的研究者只是对分布于日本
的结缕草属植物进行了遗传多样性的研究,韩国的研究者只对分布于韩国地区的结缕草属植物进行了研究,翁仁
宪等[10]主要是针对分布于台湾省的结缕草进行研究。中国是结缕草属植物的起源地之一,具有丰富的结缕草属
植物种质资源,天然分布的有5个种和1个变种[2]。金洪[23]和黄占兵[24]对中国的结缕草进行了遗传多样性研
究,但他们只研究了结缕草一个种的遗传多样性。本单位从1993年开始从全国各地收集结缕草属植物种质资
源,同时从国外引进部分种质,在中国分布的5个种和1个变种都收集到了不同数量的种质资源,并从外部形态
(地上、地下)[6~8]、抗性(寒、旱、盐、病)[25~28]等各个方面对这些种质资源进行了较全面系统的评价,结果表明这
些种质在外部形态和抗性上均存在丰富的遗传变异,并通过部分种源应用同工酶和SSR(simplesequencere
peat,简单序列重复)分子标记技术对结缕草属植物不同种的种间关系进行了初步研究 [29,30]。前期的这些研究
工作均为结缕草属植物进一步研究及其应用奠定了良好的基础,但是关于这些来自全国各地以及从国外引进的
包含5种1变种96份的种质资源的遗传关系如何,到目前为止还没有作研究报道。
SRAP(sequencerelatedamplifiedpolymorphism,相关序列扩增多态性)标记是2001年由Li和Quiros[31]开
发的一种基于PCR的新型分子标记技术,SRAP标记自开发以来,已在多种植物的遗传多样性、指纹图谱、纯度
鉴定、资源亲缘关系分析、连锁图谱构建、基因定位、比较基因组学研究等领域得到广泛应用[32~34],研究表明该标
记具有操作简便、快速,多态性丰富,重复性好,不需预知物种序列信息以及成本较低等优点,虽然AFLP(ampli
fiedfragmentlengthpolymorphism,扩增片段长度多态性)、ISSR(intersimplesequencerepeat,简单重复序列区
间)、SSR、RAPD这些分子标记已经在结缕草属植物及其他许多植物的遗传多样性研究中得到了成功应用,但在
研究中发现RAPD虽然简单快捷,但稳定性较差,SSR引物的开发成本很高,ISSR引物受数量的限制,而SRAP
分子标记技术不仅具有RAPD简单快捷之优点,同时还具有AFLP的稳定性和多态性,是简单又经济、有效又可
靠的分子标记系统。
本研究在前期工作的基础上,通过SRAP分子标记技术对已拥有的覆盖了国内结缕草属植物分布范围和应
用区域的5种1变种共84份代表性种质资源及从国外引进的12份种源进行遗传多样性及其亲缘关系的研究,
以达到如下研究目的,首先明确我国结缕草属植物种质资源的遗传多样性及亲缘关系,以及与引进材料间的亲缘
关系,其次对现有种源的种名归属问题进行进一步鉴定以及对部分种类的分类地位进行分析,从而为结缕草属植
物种质资源进一步研究和利用提供分子水平的科学依据。
1 材料与方法
1.1 试验材料
试验材料为来自中国12个省份的覆盖国内结缕草属植物分布和应用区域的5个种1变种84份种源和从美
国、日本引进的12份品种及种源材料,其中包括结缕草(犣.犼犪狆狅狀犻犮犪)65份,中华结缕草(犣.狊犻狀犻犮犪)18份,沟叶
结缕草(犣.犿犪狋狉犲犾犾犪)9份,大穗结缕草(犣.犿犪犮狉狅狊狋犪犮犺狔犪)1份、细叶结缕草(犣.狋犲狀狌犻犳狅犾犻犪)1份,长花结缕草(犣.
狊犻狀犻犮犪var.nipponica)1份和1个杂交种(犣.犼犪狆狅狀犻犮犪×犣.犿犪狋狉犲犾犾犪)。目前均种植于江苏省中国科学院植物研
究所苗圃地内。
1.2 DNA的提取
DNA的提取采用SDS(sodiumdodecylsulfate,十二烷基硫酸钠)法,具体参照郭海林等[35]的方法。
1.3 SRAP分析
SRAP分析引物:SRAP引物由上海博亚生物技术有限公司合成,随机选取20条正向引物和10条反向引物
(表1),共组合成200对SRAP引物,从中筛选出54对扩增条带清晰、多态性丰富的引物组合(表2)对96份种源
进行扩增。
SRAP反应体系:扩增反应采用10μL的反应体系,其中包括50ng模板DNA,10×PCR缓冲液,Mg
2+1.5
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mmol/L,dNTPs200μmol/L,引物0.2μmol/L,TaqDNA聚合酶0.5U。
SRAP-PCR扩增程序:94℃预变性4min;94℃变性1min,37℃退火1min,72℃延伸10s,5个循环;94℃
变性1min,50℃退火1min,72℃延伸10s,35个循环;循环结束后72℃延伸7min,4℃保存。扩增反应在英国
TECHNE公司的TC412型PCR仪上进行。
扩增产物的检测:扩增结束后,在扩增产物中加入2μL6×loadingBuffer缓冲液混匀,上样于10%的聚丙烯
酰胺凝胶进行分离(电泳仪为DYY8B型,电泳槽为JYSCZ6型),电泳结束后快速银染检测。
表1 犛犚犃犘引物序列
犜犪犫犾犲1 犜犺犲狆狉犻犿犲狉狊犲狇狌犲狀犮犲狊狌狊犲犱犳狅狉犛犚犃犘犪狀犪犾狔狊犻狊
编号Code 正向引物Forwardprimers 编号Code 正向引物Forwardprimers 编号Code 反向引物Reserseprimers
Me1 5′XATA3′ Me11 5′XAAG3′ Em1 5′YCAA3′
Me2 5′XAGC3′ Me12 5′XTAG3′ Em2 5′YCTG3′
Me3 5′XACC3′ Me13 5′XTTG3′ Em3 5′YGAC3′
Me4 5′XACA3′ Me14 5′XTGT3′ Em4 5′YTGA3′
Me5 5′XTGC3′ Me15 5′XTCA3′ Em5 5′YAAC3′
Me6 5′XAGA3′ Me16 5′XGAC3′ Em6 5′YGCA3′
Me7 5′XACG3′ Me17 5′XGTA3′ Em7 5′YGAG3′
Me8 5′XAAA3′ Me18 5′XGGT3′ Em8 5′YGCC3′
Me9 5′XAAC3′ Me19 5′XCAG3′ Em9 5′YTCA3′
Me10 5′XAAT3′ Me20 5′XCAT3′ Em10 5′YCAT3′
 表中Intable,X=TGAGTCCAAACCGG,Y=GACTGCGTACGAATT。
表2 54对犛犚犃犘引物组合及其扩增结果
犜犪犫犾犲2 54犛犚犃犘狆狉犻犿犲狉犮狅犿犫犻狀犪狋犻狅狀狊犪狀犱狋犺犲狉犲狊狌犾狋狊狅犳犪犿狆犾犻犳犻犮犪狋犻狅狀
引物组合
PC
多态位点百分率
PPB(%)
引物组合
PC
多态位点百分率
PPB(%)
引物组合
PC
多态位点百分率
PPB(%)
引物组合
PC
多态位点百分率
PPB(%)
Me18+Em1 100.00 Me19+Em4 87.50 Me18+Em6 100.00 Me6+Em9 100.00
Me19+Em1 100.00 Me2+Em5 100.00 Me7+Em7 100.00 Me14+Em9 100.00
Me7+Em2 100.00 Me3+Em5 100.00 Me11+Em7 100.00 Me15+Em9 100.00
Me10+Em2 100.00 Me5+Em5 80.00 Me15+Em7 100.00 Me19+Em9 100.00
Me11+Em2 66.67 Me11+Em5 100.00 Me17+Em7 100.00 Me20+Em19 90.00
Me18+Em2 100.00 Me13+Em5 100.00 Me1+Em8 100.00 Me4+Em10 80.00
Me1+Em3 100.00 Me17+Em5 100.00 Me3+Em8 100.00 Me9+Em10 66.67
Me3+Em3 85.71 Me19+Em5 80.00 Me4+Em8 100.00 Me13+Em10 77.78
Me6+Em3 100.00 Me7+Em6 87.50 Me6+Em8 75.00 Me14+Em10 88.89
Me14+Em3 66.67 Me8+Em6 100.00 Me7+Em8 100.00 Me16+Em10 100.00
Me2+Em4 66.67 Me9+Em6 100.00 Me8+Em8 91.67 Me17+Em10 100.00
Me11+Em4 85.71 Me15+Em6 100.00 Me9+Em8 71.43 Me19+Em10 71.43
Me14+Em4 66.67 Me16+Em6 100.00 Me13+Em8 100.00
Me17+Em4 100.00 Me17+Em6 100.00 Me16+Em8 92.31
 PC:引物组合;TB:全部条带;PB:多态性条带;PPB:多态位点百分率。
 PC:Primercombinations;TB:Totalbands;PB:Polymorphicbands;PPB:Percentrateofpolymorphicbands.
302第18卷第5期 草业学报2009年
1.4 数据处理
对供试96份材料扩增的电泳谱带总数和多态性带的数目进行统计。根据各多态性引物扩增条带的有无,按
有带的记为“1”,无带的记为“0”,建立原始数据矩阵。用POPGENE3.2软件在假定种群处于 HardyWeinberg
平衡状态下,计算多态带数(PB)、多态位点百分率(PPB)、Nei’S[36]基因多样性指数(犎)、Shannon信息指数
(犐)[37]、Nei’s[36]遗传距离(GD)和遗传相似系数(GS),并通过UPGMA分子系统聚类法由 MEGA3.1软件生成
聚类图。
2 结果与分析
2.1 基因组DNA遗传多态性分析
选用54对带型清晰,多态性较好的SRAP引物对96份结缕草属种源材料进行扩增,所扩增条带的分子量一
般都为50~500bp(图1),54对引物共扩增出362条清晰的可用于多样性分析的谱带,平均每对引物扩增出6.7
条,最多的15条,最少的只有2条(表2),其中多态性条带337条,多态性比率(PPB)为93.09%,多样性分析结
果表明,Nei’s基因多样性指数(犎)变异范围为0~0.5,平均为0.2409,Shannon信息指数(犐)为0.3746,变异范
围为0~0.6913。这些结果均表明在这些结缕草属种质间存在丰富的遗传多样性,同时也说明SRAP标记在检
测结缕草基因组遗传多态性上有较显著的检出效率。
图1 引物组合 犕犲19+犈犿9对96份结缕草属种质资源的扩增结果
犉犻犵.1 犚犲狊狌犾狋狅犳犘犆犚犪犿狆犾犻犳犻犮犪狋犻狅狀犳狅狉96犣狅狔狊犻犪犵犲狉犿狆犾犪狊犿狊狌狊犻狀犵狆狉犻犿犲狉犮狅犿犫犻狀犪狋犻狅狀犕犲19+犈犿9
2.2 遗传相似性分析
应用POPGENE3.2软件,通过扩增谱带的1,0原始数据矩阵,对96份种源进行遗传相似性分析,结果表
明,供试材料样本间相似系数(GS)的变异范围为0.5939~0.9834,平均GS为0.7588,平均遗传距离(GD)为
0.2412。
根据相似系数矩阵表,对不同种种间的遗传相似系数进行了比较分析(表3),从种间的遗传相似系数来看,
结缕草与中华结缕草的遗传相似系数平均值为0.7653,最大值达0.9779,这说明结缕草与中华结缕草的遗传距
离较近,沟叶结缕草与细叶结缕草的遗传相似系数平均值也较高为0.7825,最大值为0.9088,说明这2个种的
遗传距离也较近,同样在结缕草与中华结缕草之间,沟叶结缕草与细叶结缕草之间都存在一些遗传差异较大的材
料,遗传相似系数的最小值分别为0.6133和0.6713。而结缕草与沟叶结缕草、细叶结缕草,中华结缕草与沟叶
结缕草、细叶结缕草的遗传相似系数均较低,相似系数的最高值都小于0.9,因此,相对来说,它们的遗传距离较
远。大穗结缕草与长花结缕草的相似系数最高为0.7348,与沟叶结缕草和细叶结缕草的相似系数也较高,分别
402 ACTAPRATACULTURAESINICA(2009) Vol.18,No.5
为0.7118和0.7238,而与结缕草和中华结缕草的相似系数相对最低,分别为0.6640和0.6736。长花结缕草
与大穗结缕草和细叶结缕草的相似系数最大,均为0.7348,与中华结缕草的相似系数位居第2,为0.7125,从相
似系数可以看出,长花结缕草虽然是中华结缕草的变种,但与中华结缕草的差异也较大,与中华结缕草的相似系
数和与其他4个种的遗传相似系数相当。
与种间的遗传相似系数相比,同一个种内的不同材料遗传相似性相对较高,相似系数的平均值均在0.75以
上,但从相似系数的变异范围可以看出,仍有一部分材料间存在着明显的遗传差异,结缕草种内的遗传相似系数
最低值为0.5994,中华结缕草和沟叶结缕草种内的最低遗传相似系数分别为0.6243和0.6630,3个种的遗传
相似系数变异范围分别为0.5994~0.9834,0.6243~0.9807,0.6630~0.9475,其中结缕草的遗传相似系数
变异范围最大,中华结缕草的遗传相似系数次之,沟叶结缕草的遗传相似系数最低,这与其分布范围相一致。
表3 结缕草属植物不同种之间的犛犚犃犘标记遗传相似系数变异范围
犜犪犫犾犲3 犞犪狉犻犪狀犮犲狉犪狀犵犲狅犳犵犲狀犲狋犻犮狊犻犿犻犾犪狉犻狋狔犮狅犲犳犳犻犮犻犲狀狋狅犳犛犚犃犘犿犪狉犽犲狉狊犫犲狋狑犲犲狀犱犻犳犳犲狉犲狀狋狊狆犲犮犻犲狊狅犳犣狅狔狊犻犪犵狉犪狊狊
种名
Species
变异范围
Variancerange
平均
Average
种名
Species
变异范围
Variancerange
平均
Average
结缕草-结缕草J-J 0.5994~0.9834 0.7801 中华结缕草-大穗结缕草S-Ma 0.6298~0.7182 0.6736
中华结缕草-中华结缕草S-S 0.6243~0.9807 0.7586 沟叶结缕草-细叶结缕草 M-T 0.6713~0.9088 0.7940
沟叶结缕草-沟叶结缕草 M-M 0.6630~0.9475 0.7704 沟叶结缕草-大穗结缕草 M-Ma 0.6823~0.7514 0.7118
结缕草-中华结缕草J-S 0.6133~0.9779 0.7653 细叶结缕草-大穗结缕草T-Ma 0.7238 0.7238
结缕草-沟叶结缕草J-M 0.5967~0.8729 0.7102 长花结缕草-结缕草Sv-J 0.6050~0.7707 0.6867
结缕草-细叶结缕草J-T 0.6243~0.7155 0.6680 长花结缕草-中华结缕草Sv-S 0.6354~0.7873 0.7125
结缕草-大穗结缕草J-Ma 0.6243~0.7155 0.6640 长花结缕草-沟叶结缕草Sv-M 0.6547~0.7486 0.7093
中华结缕草-沟叶结缕草S-M 0.5939~0.8785 0.7150 长花结缕草-细叶结缕草Sv-T 0.7348 0.7348
中华结缕草-细叶结缕草S-T 0.6133~0.7790 0.6812 长花结缕草-大穗结缕草Sv-Ma 0.7348 0.7348
 J:犣.犼犪狆狅狀犻犮犪;S:犣.犛犻狀犻犮犪;M:犣.犿犪狋狉犲犾犾犪;T:犣.狋犲狀狌犻犳狅犾犻犪;Ma:犣.犿犪犮狉狅狊狋犪犮犺狔犪;Sv:犣.狊犻狀犻犮犪var.nipponica.
2.3 遗传多样性的分子聚类分析
从96份结缕草属种质的分子聚类图可知,当以L1 作切割线时,所有材料被分为7个大的类群,其中第1大
类和第2大类分别为包含结缕草、中华结缕草和沟叶结缕草3个种的40份种质与41份种质;第3大类群包括4
份美国引进材料与1份海南的中华结缕草Z091;第4大类主要是沟叶结缕草,细叶结缕草Z160也聚在这一类,
另外还包含1份中华结缕草Z097;大穗结缕草Z010、长花结缕草Z122和结缕草Z115都单独聚为一类。对第1
大类和第2大类进行进一步分析,第1大类又分为A、B两个亚类群,A类群主要以结缕草为主,2份中华结缕草
Z039和Z008也聚在这一类;B类群则主要以沟叶结缕草为主,另还有2份从日本引进的结缕草Z073和Z080也
与这些沟叶结缕草聚为一类。第2大类进一步分为C、D、E、F四个亚类群,这4个亚类群均既包含结缕草又包含
中华结缕草,其中C亚群还包含1份沟叶结缕草Z114。从采样地来看,C亚群主要以山东、辽宁、北京和江苏苏
北等北方地区的材料为主,D亚群主要以浙江、安徽、江苏的材料为主。从以上分析可以看出,同一个种的材料基
本上聚在一起,不同种之间结缕草与中华结缕草遗传距离较近,聚在一起,沟叶结缕草与细叶结缕草聚在一起,大
穗结缕草和长花结缕草单独聚类,也有一些例外,如来自重庆的结缕草Z097与沟叶结缕草聚在一起,来自北京
的沟叶结缕草Z114与来自山东枣庄的中华结缕草Z116聚在一起,而来自河南新乡的结缕草Z115单独聚为一
类,这些结果说明结缕草属植物不同种之间有一定的遗传特异性,但由于其常异花授粉的特性,不同种之间相互
杂交,出现基因漂流现象,产生了一些中间类型。
3 结论与讨论
3.1 结缕草属植物种质资源间存在着丰富的的遗传多样性
我国是结缕草属植物的原产地之一,种质资源的数量位居世界之首,分布范围也很广,北起辽宁北部,南到福
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图2 基于犛犚犃犘数据绘制的96份结缕草属植物种质资源间的分子聚类图
犉犻犵.2 犆犾狌狊狋犲狉犱犲狀犱狉狅犵狉犪犿狅犳96犣狅狔狊犻犪犵犲狉犿狆犾犪狊犿狊犫犪狊犲犱狅狀犛犚犃犘犿犪犽犲狉狊
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建,东起吉林省鸭绿江中上游,西到陕西东南部都有结缕草属植物的分布,前人已通过形态学标记对我国结缕草
属植物的遗传多样性进行了研究[6~8]。结果表明,我国的结缕草属植物在形态上存在着丰富的遗传变异,本研究
通过SRAP分子标记技术对涵盖了我国主要分布和应用区域的结缕草属植物的遗传多样性进行研究,结果54
对引物扩增出337条多态性条带,多态性比率(PPB)为93.09%,不同种质资源间的遗传相似性变异范围很大,为
0.5939~0.9834,这些结果从分子标记的角度进一步说明了我国结缕草属植物种质资源间存在丰富的遗传变
异。结缕草属植物丰富的遗传变异为结缕草属植物的优良品系选育、开发和利用提供了空间,避免了因遗传基础
狭窄而给育种工作造成的限制。因此,对结缕草属植物进行深入研究,选育优良的结缕草属植物新品种,既具有
资源优势,又具有开发潜力。
3.2 结缕草属植物丰富的遗传多样性与结缕草属植物的起源及分布范围有关
遗传相似性分析结果表明,结缕草属植物种质资源间较大的变异范围不仅存在于种间而且存在于种内,这种
结果可能与结缕草属植物的起源与分布范围有关,结缕草属植物的分布范围非常广泛,分布区域南北跨近20个
纬度(23°30′~43°22′N),东西占34个经度(109°~143°E),从平原绿地到低山丘陵,到沿海滩涂均有结缕草属植
物的分布,因此,在长期的进化过程中,为了适应各自的生长地理环境和气候条件,就形成了遗传上的差异性。结
缕草、中华结缕草、沟叶结缕草和细叶结缕草是研究最多的4种草坪草,也是种质资源相对较丰富的4个种,从种
间关系来看,结缕草和中华结缕草、沟叶结缕草和细叶结缕草的遗传相似系数较高,遗传距离较近,这个结果与前
人的研究结果一致,也认为是与它们的起源和分布区域相似性有关,结缕草和中华结缕草的起源与分布区域相
似,而沟叶结缕草和细叶结缕草的起源与分布区域相近[2]。大穗结缕草与其他种的遗传相似系数均不太高,长花
结缕草虽为中华结缕草的变种,但与中华结缕草的遗传相似系数和与其他种的遗传相似系数相近,也较低。笔者
从叶片、匍匐茎、直立茎以及花序等外部形态的观察结果发现,长花结缕草与大穗结缕草比较相似,两者地理分布
范围比较接近,并且从相似系数来看,长花结缕草与大穗结缕草的相似系数为0.7348,高于长花结缕草与中华结
缕草的相似系数(0.7125),因此,长花结缕草倒像是大穗结缕草的一个变种。但是在本研究中长花结缕草和大
穗结缕草均只有1份材料,所以本研究结果只能说明这2份种源材料间的相似性,关于这2个种之间的遗传相似
性还有待于进一步研究。
通过同工酶技术和RAPD技术对结缕草属植物的遗传多样性研究结果均表明,结缕草属植物的遗传多样性
与不同种的植物学分类相关性较低,而与其长期对生长环境的适应性的相关性更高[11,22]。本研究对来自中国12
个不同省份的84份结缕草属种质资源和12份从美国、日本等引进的材料进行遗传多样性分析,遗传相似性分析
结果表明,中华结缕草和结缕草因地理分布相似,这2个种遗传相似系数较高,沟叶结缕草和细叶结缕草的分布
范围有很大重叠,遗传相似系数也高。聚类分析结果表明,来自同一地区的材料基本上聚在一起,如第3大类主
要是从美国引进的材料为主,另外几份从美国引的材料Z135,Z136,Z137虽然没聚在第3大类,但它们也单独聚
在一起。第2大类的C亚群主要以山东、辽宁、北京和江苏苏北等北方地区的材料为主,D亚群主要以浙江、安
徽、江苏等长江中下游地区的材料为主。这进一步说明了遗传多样性与地理来源和分布的相关性。
3.3 结缕草属植物不同种间的交叉聚类现象普遍存在,个别材料因具有遗传上的特异性,单独聚为一类
从聚类图上可以看出,96份种源材料并不是完全按照种的划分进行聚类的,而出现了交叉聚类现象,如中华
结缕草Z039和Z008聚在以结缕草为主的第1大类的A亚群,第2大类的C、D、E、F四个亚类群中均既包含结
缕草又包含中华结缕草。结缕草属植物的开花习性为雌蕊先熟雄蕊后熟,先后间隔5~7d,因此,自交结实率很
低,平均只有16.15%,并且大量研究结果表明,结缕草属植物种间杂交是普遍存在的,这种常异花授粉的特性,
导致结缕草属植物种内个体间丰富的遗传多样性和种间个体间的遗传相似性,并产生了许多中间类型,以致于从
外部形态上表现出连续的变异。根据聚类结果,本试验中2份从日本引进的材料Z073和Z080,与沟叶结缕草
Z102,Z014,Z142聚为一类,从外部形态来看,两者也间于结缕草和沟叶结缕草之间,这2份材料的叶片较一般的
结缕草细致,花序长度较短,这两特征与沟叶结缕草较接近,但这2份材料的生殖枝高度较高,小穗的特征也与结
缕草接近,这也是这2份材料被定为结缕草这个种的原因,从聚类的结果来看,Z073与Z080很可能是结缕草与
沟叶结缕草的杂交种。本试验中大穗结缕草、细叶结缕草、长花结缕草都只有1份种质,结果发现细叶结缕草与
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沟叶结缕草聚在一起,进一步证明了细叶结缕草与沟叶结缕草亲缘关系较近,而大穗结缕草和长花结缕草都分别
聚为一类,说明这2个材料与其他材料的亲缘关系都较远,但从聚类图上可以发现,这2份材料虽然没有聚在一
起,却紧靠在一起,因此,相对来说,相似性较高,长花结缕草虽然是中华结缕草的变种,但并没有与中华结缕草相
聚。最为特别的是来自河南新乡的结缕草Z115,从外部形态看,与其他的结缕草相比,没有特别的区别,但从聚
类的结果发现,Z115单独聚为一类,与其他结缕草的遗传基础差异较大,亲缘关系较远,本研究在对结缕草属植
物SRAP分子标记研究的同时,也进行了SSR分子标记的研究,中华结缕草Z115也单独聚为一类(未发表资
料),这说明这份材料虽然在外部形态上没有表现出特异性,但在遗传基质上确实存在一些特异的基因。因此,结
缕草属植物开放的授粉系统导致结缕草属植物不同种源的基因渗透,也导致了种源基因构成上异质性的提高,杂
交育种中发现,结缕草属植物在杂交一代即发生高度分离,因此,对于结缕草属植物的研究,种的划分非常重要,
但是对于每一个种源来说,种源间的遗传关系也不可忽视,对于品种选育、改良至关重要。
3.4 SRAP分子标记技术可以有效地应用于结缕草属植物遗传多样性的研究中
本研究应用SRAP分子标记技术对96份结缕草属植物的遗传多样性进行研究,54对引物扩增出362条清
晰的用于多样性分析的谱带,其中多态性条带就有337条,多态性比率为93.09%,这一方面说明了结缕草属植
物不同种质资源间存在着丰富的遗传变异,同时也说明了SRAP分子标记技术在结缕草属植物遗传多样性研究
中较高的检出效率。
分子标记技术通过直接检测DNA本身的序列变化,对种质间的遗传多样性进行研究,被认为是目前最有效
的遗传多样性分析方法。本研究通过SRAP分子标记技术对结缕草属植物的遗传多样性进行研究,结果将形态
上与其他的结缕草没有特殊差异的Z115单独聚为一类,对一些形态上处于中间类型的材料(如:Z073和Z080),
以及长花结缕草和中华结缕草的遗传关系,通过SRAP分子标记聚类分析为其身份的确定提供了新的信息,这
些都体现出SRAP分子标记技术在结缕草属植物遗传多样性研究中的优越性和有效性,本研究结论为SRAP分
子标记技术在结缕草属植物进一步研究中的应用奠定了良好的基础。
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犌犲狀犲狋犻犮犱犻狏犲狉狊犻狋狔犪狀犱狉犲犾犪狋犻狅狀狊犺犻狆狊狅犳狕狅狔狊犻犪犵狉犪狊狊犪狊狉犲狏犲犪犾犲犱犫狔犛犚犃犘犿犪狉犽犲狉狊
GUOHailin1,2,ZHENGYiqi1,2,CHENXuan2,XUEDandan1,2,LIUJianxiu2
(1.ColegeofHorticulture,NanjingAgriculturalUniversity,Nanjing210095,China;2.InstituteofBotany,
JiangsuProvinceandChineseAcademyofSciences,Nanjing210014,China)
犃犫狊狋狉犪犮狋:Thegeneticdiversityandrelationshipsof98germplasmsoffivespeciesandonevarietyof犣狅狔狊犻犪
wereanalyzedusingSRAPmarkers.Atotalof362bandsweredetectedwith54pairsofSRAPprimersand337
ofthebandswerepolymorphic(PPB=93.09%).TheNei’sgenediversityindex(H)was0.2409andthe
Shannondiversityindex(I)was0.3746,indicatingahighlevelofgeneticdiversityofzoysiagrass.Thegenetic
similarity(GS)among96犣狅狔狊犻犪germplasmsrangedfrom0.5939to0.9834withanaverageof0.758.Eight
showedthatalargegeneticpolymorphismexistedamongthegermplasmsof犣狅狔狊犻犪grass.TheGSbetween犣.
犼犪狆狅狀犻犮犪and犣.狊犻狀犻犮犪,andbetween犣.犿犪狋狉犲犾犾犪and犣.狋犲狀狌犻犳狅犾犻犪wererelativelyhighcomparedwiththeGS
ofotherspecies.ThevariancerangesofGSwithinspeciesof犣.犼犪狆狅狀犻犮犪,犣.狊犻狀犻犮犪and犣.犿犪狋狉犲犾犾犪were
0.5994-0.9834,0.6243-0.9807and0.6630-0.9475,respectively.Basedonthepresenceofbands,96
zoysiagermplasmwereclassifiedintosevenmajorgroupsbyUPGMAclusteranalysis,inwhichgroupIand
groupIIincludedthreespeciesof犣.犑犪狆狅狀犻犮犪,犣.狊犻狀犻犮犪andafewaccessionsof犣.犿犪狋狉犲犾犾犪.GroupIIIin
cludedfouraccessionsintroducedfromAmerica.GroupIVmainlycomsistedof犣.犿犪狋狉犲犾犾犪and犣.狋犲狀狌犻犳狅犾犻犪.
犣.犿犪犮犺狉狅狊狋犪犮犺狔犪(Z010),犣 .狊犻狀犻犮犪varnipponica(Z122)and犣.狊犻狀犻犮犪 (Z115)formedagroupbythem
selves.TheresultsofUPGMAclustershowedthatsomeaccessionsof犣.犼犪狆狅狀犻犮犪,犣.狊犻狀犻犮犪and犣.犿犪狋狉犲犾犾犪
clusteredintoonegroup:noonespeciesclusteredintoonegroup,Moreover,averyfewgroupscontainedonly
oneaccession,suggestingthatithadaspecialgeneticbase.Inthispaper,thediversityandrelationshipsamong
96germplasmshavebeeninvestigatedandapreliminarydiscussionmadeontheownershipofpartaccessions.
Thisresearchshouldprovideascientificbasisatthemolecularlevelforfurtherstudyandtheapplicationof
犣狅狔狊犻犪grassgermplasms.
犓犲狔狑狅狉犱狊:犣狅狔狊犻犪;germplasmresources;interspecificrelationship;geneticdiversity;SRAP
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