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Cloning and Expression of Type Ⅱ Ribosome Inactivating Protein Genes CsRIP 1 and CsRIP 2 from Camellia sinensis

茶树Ⅱ型核糖体失活蛋白基因CsRIP1CsRIP2的克隆与表达分析



全 文 :第 51 卷 第 2 期
2 0 1 5 年 2 月
林 业 科 学
SCIENTIA SILVAE SINICAE
Vol. 51,No. 2
Feb.,2 0 1 5
doi:10.11707 / j.1001-7488.20150218
收稿日期: 2014 - 04 - 21; 修回日期: 2014 - 07 - 19。
基金项目: 河南省基础与前沿技术研究计划项目(092300410244) ; 河南省教育厅科学技术研究重点项目(12B180032)。
茶树Ⅱ型核糖体失活蛋白基因 CsRIP1 和 CsRIP2 的
克隆与表达分析
袁红雨1 马 宁1 杨会敏2 庞秋芬1 谢素霞1 程 琳1
(1.信阳师范学院生命科学学院 信阳 464000; 2.红河学院生物科学与技术学院 蒙自 661100)
摘 要: 【目的】克隆茶树Ⅱ型核糖体失活蛋白基因 CsRIP1 和 CsRIP2,探讨 CsRIPs 基因的组织表达特异性以及
假眼小绿叶蝉和机械伤害处理对其表达的影响。【方法】Cs-Ev2(GenBank 登录号: GH618807)为一受假眼小绿叶
蝉取食诱导的茶树Ⅱ型核糖体失活蛋白基因的 cDNA 片段,利用 RACE 技术克隆该基因的全长 cDNA,命名为
CsRIP1(GenBank 登录号: FJ648831)。利用 RT-PCR 技术从茶树子叶中分离出一个新的Ⅱ型核糖体失活蛋白基因
的 cDNA 序列,命名为 CsRIP2(GenBank 登录号: GU951535)。利用 PCR 技术克隆 CsRIPs 的基因组序列。设计基
因特异性引物,利用 Real-time qRT-PCR 技术检测 CsRIPs 的组织表达特异性,以及在叶片中假眼小绿叶蝉和机械伤
害处理对其表达的影响。【结果】CsRIP1 和 CsRIP2 的序列一致性为 98%,都含有一个 1 713 bp 的开放阅读框,编
码 570 个氨基酸残基,但是它们具有不同的 3 非翻译区。CsRIP1 和 CsRIP2 由信号肽序列、1 个 RIP 结构域、链接
肽和 2 个 RBL 结构域组成。CsRIPs 与其他Ⅱ型 RIPs 具有较高的序列一致性,Ⅱ型 RIPs 保守的氨基酸残基,包括
构成 A 链 N -糖苷酶活性位点的氨基酸残基、B 链中形成寡糖链结合位点的氨基酸残基、形成链间和链内二硫键
的半胱氨酸残基以及 RBL 结构域中的 QxW 基序,均出现在 CsRIPs 相应的位置上。系统进化树分析结果显示,同
一物种的Ⅱ型 RIPs 首先聚类合并,2 个 CsRIP 与樟的Ⅱ型 RIPs 聚为一支。比较 CsRIPs 的 cDNA 序列和基因组序
列,发现它们的基因组序列不含内含子。CsRIPs 基因的表达具有组织特异性,CsRIP1 在叶片中的表达水平最高,在
子叶中的表达水平最低,而 CsRIP2 在子叶中的表达水平最高,在叶片中的表达水平最低。在叶片中,CsRIP1 和
CsRIP2 的表达均受假眼小绿叶蝉取食的强烈诱导,并且其表达水平随着取食时间的增加而逐渐增加,取食 48 h
后,它们的表达水平大约分别是对照的 120 和 100 倍。在叶片中,CsRIPs 基因的表达也受机械伤害处理的诱导,
CsRIP1 的转录水平在处理后 6 h 达到最大值,CsRIP2 在处理后 6 h 表达水平显著升高,12 h 达到最大值。【结论】
克隆茶树的 2 个Ⅱ型核糖体失活蛋白基因,它们可能参与茶树的防卫反应,且已发生亚功能化。进一步分析这 2
个基因的启动子,可以加深对 CsRIPs 基因转录调控以及 RIPs 的生物学功能的理解。
关键词: 茶树; 假眼小绿叶蝉; Ⅱ型核糖体失活蛋白; CsRIP1; CsRIP2
中图分类号: S718. 46 文献标识码: A 文章编号: 1001 - 7488(2015)02 - 0147 - 07
Cloning and Expression of Type Ⅱ Ribosome Inactivating
Protein Genes CsRIP1 and CsRIP2 from Camellia sinensis
Yuan Hongyu1 Ma Ning1 Yang Huimin2 Pang Qiufen1 Xie Suxia1 Cheng Lin1
(1 . College of Life Sciences,Xinyang Normal University Xinyang 464000;
2 . College of Life Science and Technology,Honghe University Mengzi 661100)
Abstract: 【Objective】To clone ribosome inactivating protein (RIP) genes from Camellia sinensis,and to study tissue-
specific expression of CsRIPs and effects of Empoasca vitis feeding and mechanical damage on the expression of CsRIPs.
【Method】Cs-Ev2 (GenBank accession number: GH618807) is the cDNA fragment of a type Ⅱ RIP gene of tea plants,
which was up-regulated by mild infestation of green leafhopper. Its full length cDNA sequence was cloned by RACE
method,and designated as CsRIP1 (GenBank accession number: FJ648831) . The cDNA sequence of a new type Ⅱ RIP
gene was cloned by RT-PCR method from developing cotyledons of tea plants,and designated as CsRIP2 ( GenBank
accession number: GU951535 ) . The genomic sequence of CsRIP1 and CsRIP2 was obtained by PCR method. Their
tissue-specific expression pattern and expression characteristics induced by E. vitis feeding and mechanical damage were
detected by Real-time qRT-PCR,using gene-specific primers. 【Result】Both of CsRIP1 and CsRIP2 contained an open
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reading frame of 1 713 bp,encoding a predicted protein of 570 amino acid residues,but their 3 UTRs were different.
Analysis of the amino acid sequence showed that the predicted precursors of CsRIP1 and CsRIP2 consisted of a signal
peptide sequence,a RIP domain,and two RBL domains. CsRIPs had a high identity to other type Ⅱ RIPs at the overall
amino acid level. The conserved amino acid residues,including all residues that form active-site of RNA N-glycosidase of
A chain,residues that form two sugar-binding sites of B chain,cystein residues that form one interchain and four
intrachain disulfide bonds,and QxW motif of RBL domains,are strongly conserved in CsRIP1 and CsRIP2. Phylogenetic
analysis showed that different type Ⅱ RIPs from one species form a subgroup first,and two CsRIPs are closely related to
type Ⅱ RIPs from Cinnamomum camphora. The comparison of the CsRIP cDNA sequences and their corresponding
genomic sequences illustrated that the CsRIP genes have no intron. CsRIPs were expressed with tissue specificity. The
transcript level of CsRIP1 was the highest in leaves and lowest in cotyledons; while the transcript level of CsRIP2 was the
highest in cotyledons,and lowest in leaves. The expression of CsRIPs was induced by Empoasca vitis feeding dramatically
in leaf,and their expression level increased continuously,with approximately 120-fold and 100-fold higher after 48 h of
feeding,respectively. Mechanical damage enhanced the expression level of CsRIPs in leaf. The expression level of CsRIP1
reached maximal value after 6 h treatment. The expression level of CsRIP2 increased remarkably after 6 h treatment,but
reached the maximal value after 12 h. 【Conclusion】Two type II ribosome inactivating protein genes from C. sinensis were
cloned,which presumably play a defense-related role. Further analysis of the promoters will deepen our understanding of
the transcriptional regulation of CsRIP genes and our insight into the functions of RIPs in vivo.
Key words: Camellia sinensis; Empoasca vitis; Type Ⅱ ribosome inactivating protein; CsRIP1; CsRIP2
植物核糖体失活蛋白 ( ribosome inactivating
proteins,RIPs)是一种 rRNA N - 糖苷酶,作用于真
核生物核糖体大亚基 28S rRNA 上的一个高度保守
的茎环结构( ricin / sarcin),切除其上的一个特定的
腺嘌呤残基,使延伸因子 EF-2 不再与核糖体结合,
从而抑制蛋白质的生 物合成 ( Lapadula et al.,
2012)。除了 rRNA N -糖苷酶活性外,RIPs 还表现
出一系列其他酶学活性,例如超氧化物歧化酶和核
酸酶活性。一些 RIPs 的 N - 糖苷酶活性还能将腺
嘌呤从 rRNA 的其他位点上释放出来,或者作用于
病毒的 RNA 和基因组 DNA 释放腺嘌呤(Peumans et
al.,2001)。RIPs 可分为 2 种主要类型: Ⅰ型 RIPs
为单链结构,具有 rRNA N -糖苷酶活性; Ⅱ型 RIPs
为一异二聚体,由 1 条相当于Ⅰ型 RIP 的 A 链和 1
条具有凝集素性质的 B 链通过 1 个二硫键连接而
成,这 2 条多肽链均来自一个前体蛋白。
尽管目前对 RIPs 确切的生理活性尚未形成一
致的看法,但是越来越多的研究表明,RIPs 在植物
应答各种环境胁迫中发挥重要作用,是植物防御体
系的组成部分。RIP 基因的表达受多种环境胁迫的
诱导,其中非生物胁迫包括干旱、聚乙二醇、盐胁迫、
H2O2、热激和渗透压等,生物胁迫包括伤害、病毒、
真菌和昆虫等(Kawade et al.,2009)。在体外,几乎
所有被检测过的 RIPs 都具有广谱抗病毒活性,转基
因植物研究又为 RIPs 的抗病毒活性提供了新的证
据(Chen et al.,2002)。RIPs 还对昆虫表现出一定
的毒性,Bertholdo-Vargas 等(2009)发现 2 种鳞翅目
(Lepidoptera)昆虫摄食添加 5 种Ⅰ型核糖体失活蛋
白的叶片后,生长速度和存活率显著降低,细胞的
DNA 损伤增加; 表达西洋接骨木( Sambucus nigra)
Ⅱ 型 核 糖 体 失 活 蛋 白 SNA-I 的 转 基 因 烟 草
(Nicotiana tabacum cv. Samsun NN)对烟蚜 (Myzus
nicotianae)和甜菜夜蛾(Spodoptera exigua)产生抗性
(Shahidi-Noghabi et al.,2009); 辛纳毒蛋白对棉铃
虫(Helicoverpa armigera)和淡色库蚊 ( Culex pipiens
pallens)的幼虫具有毒性(Zhou et al.,2000)。
Yang 等(2011)在研究茶树 ( Camellia sinensis)
对刺吸式口器昆虫的应答反应时,从茶树‘凫早 2
号’(C. sinensis‘Fuzao 2’)叶片中分离出一种受假
眼小绿叶蝉(Empoasca vitis)取食诱导的Ⅱ型核糖体
失活 蛋 白 基 因 的 cDNA 片 段,命 名 为 Cs-Ev2
(GenBank 登录号: GH618807)。了解茶树Ⅱ型核
糖体失活蛋白基因在植物抗虫中的作用,对林木抗
虫基因工程具有重要意义。本研究以假眼小绿叶蝉
取食的茶树幼叶 SMART cDNA 文库为模板,采用
RACE 技术克隆了该基因的全长 cDNA ( CsRIP1),
并利用 PCR 技术分离出另一个在茶树种子中表达
的Ⅱ型 RIP 基因(CsRIP2)。同时还分析了这 2 个
茶树Ⅱ型 RIP 基因在假眼小绿叶蝉和机械伤害处理
不同时间的表达情况。试验结果将为进一步分析
CsRIP1 和 CsRIP2 的亚功能化以及其在茶树抗虫中
的作用创造条件。
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第 2 期 袁红雨等: 茶树Ⅱ型核糖体失活蛋白基因 CsRIP1 和 CsRIP2 的克隆与表达分析
1 材料与方法
1. 1 材料与处理 以在营养钵生长 2 年的茶树栽
培品种‘凫早 2 号’的幼苗为试验材料进行假眼小
绿叶蝉和机械伤害处理。处理前将茶树幼苗置于温
度 25 ~ 28 ℃、光照强度 160 μmol·m - 2 s - 1、光照时间
12 h·d - 1的条件下生长 7 天。
假眼小绿叶蝉处理: 每一茶树幼苗接种 50 头
左右的假眼小绿叶蝉成虫,用通风良好的塑料网罩
将茶树幼苗罩上,接虫 3,6,12,24,48 h 后剪取充分
伸展的茶树叶片。机械伤害: 用剪刀将茶树叶片的
边缘剪去,分别在处理 3,6,12,24,48 h 后剪取叶
片。每种处理 3 次重复,每次取 6 株,以培养在相同
条件下未进行处理的茶树幼苗作为对照。对照和各
种处理的叶片采集后迅速用液氮处理,并置于
- 80 ℃冰箱中保存。
1. 2 CsRIP1 基因全长 cDNA 的克隆 根据 Cs-Ev2
cDNA 片段的核苷酸序列设计 1 对特异性引物
CsRIP-F1 ( 5-ATACAGTTGTGGCCGTGTGA-3) 和
CsRIP-R1(5-TGACTCTGCGCTGAGGACTA-3)用于
5RACE 和 3 RACE。以 5-ready RACE cDNA 文库
为模板 (谢素霞等,2013 ),利用 5 通用引物和
CsRIP-R1 扩增该基因 cDNA 的 5 末端,反应程序
为: 96 ℃ 2 min; 94 ℃ 30 s,55 ℃ 30 s,72 ℃
2 min,30 个循环。以 3-ready RACE cDNA 文库为
模板,利用 3通用引物和 CsRIP-F1 扩增该基因
cDNA 的 3 末端,反应程序为: 96 ℃ 2 min; 94 ℃
30 s,52 ℃ 30 s,72 ℃ 2 min,30 个循环。
拼接 5RACE 产物和 3 RACE 产物,得到 CsRIP1
的全长 cDNA,并利用 NCBI 网站预测其 ORF,根据 5
和 3 非 编 码 区 序 列 设 计 引 物 CsRIP-F2 ( 5-
CTGCTACTGAAACGAAATATGAAAG-3)和 CsRIP-R2
( 5-TAGGGAATGACAAACAACCAAGTAGGC-3),扩
增该基因完整的 ORF,反应程序为: 96 ℃ 2 min;
94 ℃ 30 s,58 ℃ 30 s,72 ℃ 3 min,30 个循环。
1. 3 CsRIP2 基因 cDNA 的克隆 利用 RNeasy plant
mini kit(Qiagen,德国)从茶树子叶中提取总 RNA,
用 DNase I(Promega,美国)处理总 RNA 以去除其中
残余的 DNA。用 First Strand cDNA Synthesis 试剂盒
(Fermentas)合成第 1 链 cDNA,以第 1 链 cDNA 为
模板,利用特异引物 CsRIP-F2 和 CsRIP-R2 扩增
CsRIP2 基因的 cDNA 序列。
将 PCR 产物凝胶电泳后,回收目的片段,将目
的片段与 pMD19-T 载体 (大连宝生物工程有限公
司)连接并转化 DH5α,重组质粒鉴定后测序。
1. 4 CsRIP 基因组 DNA 的克隆 按照 Plant DNA
Isolation Reagent 试剂盒 (大连宝生物工程有限公
司)说明书,以茶树叶片为材料提取茶树的基因组
DNA。以基因组 DNA 为模板,利用特异引物 CsRIP-
F2 和 CsRIP-R2 扩增 CsRIP 基因的 gDNA 序列。
1. 5 Real-time qRT-PCR 分析 CsRIP 基因的表达
分别选取茶树的幼根、茎、叶 片 和 子 叶,用 Trizol
Reagent( Invitrogen)提取总 RNA,通过琼脂糖凝胶电
泳和紫外分光光度计检测 RNA 的完整性和浓度。
用 First Strand cDNA Synthesis 试剂盒(Fermentas)合
成第 1 链 cDNA,用于检测 CsRIP1 和 CsRIP2 在不同
组织中的表达水平。选取不同处理的茶树幼苗完全
伸展的叶片,分别提取总 RNA,以检测 CsRIP 基因
的表达水平。
根据 2 个 CsRIP 基因 3 UTR 的差异性区域,分
别设计 CsRIP1 基因特异性的实时荧光定量 RT-PCR
分 析 引 物 CsRIP1-F ( 5-CCAATCCAATCCTCC
AGCAA-3) 和 CsRIP1-R ( 5-GGGCCTTCTTTGG
ATTCAGCG-3),以及 CsRIP2 基因特异性的实时荧
光 定 量 RT-PCR 引 物 CsRIP2-F ( 5-CCAATCC
AATCCTCCAGCAA-3)和 CsRIP2-R(5-ACAAACGA
CGATTGAGCGCA-3)。采用茶树的 α-tubulin 基因
(上游引物: 5-CCACTCATTCCCTCCTTGAA-3; 下
游引物: 5-ATGGCTCCATCAAACCTCAG-3)作为内
参对不同样品 cDNA 的模板量进行校准。
按照 TaKaRa 公司 SYBR Premix Ex TaqTM(Tli
RNaseH Plus) 试剂盒说明书进行实时荧光定量
PCR 反应,反应体系为: cDNA 模板 2 μL,2 × SYBR
Premix Ex TaqTM 10 μL,上、下游引物 ( 10 μmol ·
L - 1)各 0. 4 μL,50 × ROX Reference Dye 0. 4 μL,
ddH2O 6. 8 μL。每个样品设 3 次重复。PCR 反应
在 ABI PRISM 7300 Real-Time PCR 仪 ( Applied
Biosystems)上进行,程序为: 95 ℃ 1 min; 95 ℃
15 s,58 ℃ 15 s,72 ℃ 30 s,40 个循环; 设定程序,
使扩增结束后 PCR 仪自动运行绘制熔解曲线
(95 ℃ 15 s,60 ℃ 15 s,95 ℃ 15 s)。数据分析按
2 - ΔΔCT方法 (Livak et al.,2001) 进行。在组织表达
分析中,用表达量最低的组织作为对照,在胁迫处理
的表达分析中,以未处理的材料作为对照,计算试验
组目的基因的表达相对于对照组的变化倍数。
2 结果与分析
2. 1 CsRIP 基因克隆与序列分析 以 SMART
cDNA 为模板,5 RACE 和 3 RACE 扩增后,1% 的
琼脂糖凝胶电泳检测,分别得到 1 条特异的条带。
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克隆测序后发现,5RACE 产物长 1 330 bp(图 1A),
其 3 端序列与 Cs-Ev2 的 5 端序列完全重叠;
3 RACE产物长936 bp(图 1B),其 5端与 Cs-Ev2 的
3端完全重叠; 拼接后得到 2 032 bp 的全长 cDNA,
命名为 CsRIP1(GenBank 登录号: FJ648831)。该序
列包含 5 非翻译区 73 bp、3 非翻译区 224 bp、阅读
框 1 713 bp,编码 570 个氨基酸残基,其预测分子质
量为 63. 55 kDa,等电点为 4. 75。根据 CsRIP1 基因
的5 UTR和 3 UTR 分别设计引物 CsRIP-F2 和
CsRIP-R2,以上述 SMART cDNA 为模板扩增得到
1 893 bp长的 cDNA 序列,含有一个与拼接序列相同
的阅读框(图 1C)。
图 1 CsRIP1 基因的 cDNA 扩增
Fig. 1 The amplification of CsRIP1 cDNA with PCR method
M: DNA Marker; A: CsRIP1 的 5 RACE 产物; B: CsRIP1 的3RACE
产物; C: CsRIP-F2 和 CsRIP-R2 的扩增结果。
M: DNA Marker; A: Product of 5 RACE; B: Product of 3RACE; C:
Product of amplification with CsRIP-F2 and CsRIP-R2.
植物的Ⅱ型 RIPs 常常在植物的种子中积累,本
研究以茶树子叶( ~ 210 DAF)的 mRNA 为模板,采
用 CsRIP-F2 和 CsRIP-R2 进行 RT-PCR 扩增。对扩
增产物克隆测序后,发现了 1 个新的茶树Ⅱ型核糖
体失活蛋白基因,命名为 CsRIP2(GenBank 登录号:
GU951535)。CsRIP2 与 CsRIP1 有 98%的序列一致
性,也含有一个 1 713 bp 的 ORF,编码产物与
CsRIP1 具有 96% 的相似性。与 CsRIP1 相比,已克
隆的 CsRIP2 的 3 UTR 缺失了一段 15 bp 的序列。
利用 CsRIP-F2 和 CsRIP-R2,以来自叶片的基
因组 DNA 为模板进行 PCR 扩增,克隆 CsRIP1 和
CsRIP2 的基因组序列。测序后发现,CsRIP1 和
CsRIP2 基因的 gDNA 都不含内含子。
2. 2 CsRIP 基因编码产物的结构域分析和同源性
比较 通过 Signal 4. 1 软件分析发现,CsRIP 含有 1
个由 22 个氨基酸残基组成的信号肽,其切割位点在
第 22 位的缬氨酸和第 23 位的半胱氨酸之间。
SMART 在线预测软件分析表明,CsRIPs 含有 1 个
RIP 结构域 (氨基酸残基 36—289 ) 和 2 个 ricin
B-like(RBL)结构域 (氨基酸残基 316—442,446—
569)。RIP 结构域相当于Ⅱ型 RIP 的 A 链,而 B 链
由 2 个 RBL 结构域组成。
BLASTP 搜索 GenBank 数据库,发现 CsRIPs 与
樟(Cinnamomum camphora)的辛纳毒蛋白Ⅲ前体、
蓖麻 ( Ricinus communis)毒素前体、相思子 ( Abrus
precatorius)毒素 - a、美丽相思子 ( Abrus pulchellus)
的 prepropulchellin Ⅳ 具 有 较 高 的 序 列 相 似 性
(61% ~ 54% )。序列比对表明相思子毒素 - a 和
蓖麻毒素 A 链的 N - 糖苷酶活性中心裂隙中所有
的氨基酸残基均出现在 CsRIPs 的相应位置上
(图 2)。
白果槲寄生(Viscum album)的凝集素 I、蓖麻毒
素和相思子毒素 - a 的 B - 链含有 2 个同源的 RBL
结构域,每个 RBL 结构域具有 3 个谷氨酰胺 -任意
氨基酸 -色氨酸(QxW)重复基序。序列比对显示,
CsRIPs 的每个 RBL 结构域在对应位置上均含有 3
个保守的 QxW 基序。蓖麻毒素的 2 个碳水化合物
结合位点各由 5 个保守的氨基酸残基组成,这 2 组
氨基酸残基在 CsRIPs 的 B 链中也高度保守(图 2)。
与其他Ⅱ型 RIPs 一样,CsRIPs 的 A 链靠近 C 末端
的位置上有 1 个半胱氨酸残基,B 链上有 9 个保守
的半胱氨酸残基。
2. 3 CsRIP 基因编码产物的系统进化树分析 核
糖体失活蛋白以多基因家族的形式存在于植物的基
因组中。分别从 8 种植物中选取序列差别最大的 2
种Ⅱ型 RIPs,同茶树的 2 种Ⅱ型 RIPs 一起,采用
DNAMAN 软件中的邻接法( neighbor-joining)构建进
化树。结果表明,同一物种的 RIPs 首先聚类合并,
茶树的 2 种 RIPs 与樟的 RIPs 聚为一支,蓖麻、荷兰
鸢尾( Iris × hollandica)、西洋接骨木和白果槲寄生
的 RIPs 聚为一支,美丽相思子和相思子的 RIPs 聚
为一支(图 3)。
2. 4 CsRIP 基因在不同组织中的表达分析 利用
Real-time qRT-PCR 技术检测 CsRIP1 和 CsRIP2 在
茶树 4 种不同组织中的表达模式,结果(图 4)显示,
CsRIP1 和 CsRIP2 在幼根、茎、叶和子叶中均有表
达。CsRIP1 在叶中的表达水平最高,约为子叶的
5. 5 倍、幼根的 4. 4 倍、茎的 2. 4 倍; CsRIP2 在子叶
中的表达水平最高,约为叶的 6 倍、幼根的 3 倍、茎
的 1. 6 倍。
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第 2 期 袁红雨等: 茶树Ⅱ型核糖体失活蛋白基因 CsRIP1 和 CsRIP2 的克隆与表达分析
图 2 不同物种Ⅱ型核糖体失活蛋白的氨基酸序列比对
Fig. 2 Amino acid multiple alignment of type Ⅱ RIPs from different species
黑色表示在所有 6 种蛋白质氨基酸序列中都相同的氨基酸残基; 灰色表示在 5 种蛋白质氨基酸序列中都相同的氨基酸残
基; “* ”表示构成 A 链 N -糖苷酶活性位点的氨基酸残基; “▲”和“:”分别表示 B 链中形成碳水化合物结合位点的氨基酸
残基; “ +”表示形成链间和链内二硫键的半胱氨酸残基; “QxW”表示 QxW 基序。CsRIP1: 茶树核糖体失活蛋白 1
(ACV60361) ; CsRIP2: 茶树核糖体失活蛋白 2(ADF45510) ; ricin: 蓖麻毒素前体(XP_002534649) ; abrin-a: 相思子毒素 - a
(AAA32624) ; Lectin Ⅰ: 白果槲寄生凝集素Ⅰ(AAR25545) ; cinna Ⅲ: 樟辛纳毒蛋白Ⅲ前体(AAK82460)。
Amino acids identical in all six proteins are shaded black,while amino acid residues that are conserved in at least five of the six
sequences are shaded grey. The amino acids that form the RNA N-glycosidase active site in A-chain are indicated with ( * ),whereas
amino acids that form two separate carbohydrate-binding sites in B-chain are marked by (▲) and ( :) . Ten cysteines that form one
interchain and four intrachain disulfide bonds in six RIPs are marked by ( + ) . QxW motifs in B chain are indicated with (QxW) .
CsRIP1: Camellia sinensis ribosome inactivating protein 1 ( ACV60361 ) ; CsRIP2: C. sinensis ribosome inactivating protein 2
(ADF45510) ; ricin: Ricinus communis preproricin (XP_002534649) ; abrin-a: Abrus precatorius abrin-a (AAA32624) ; Lectin Ⅰ:
Viscum album lectin Ⅰ(AAR25545) ; cinna Ⅲ: Cinnamomum camphora cinnamomin Ⅲ precursor (AAK82460) .
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图 3 基于不同物种Ⅱ型 RIP 氨基酸序列构建的系统进化树
Fig. 3 Phylogenetic tree derived from the alignment of the amino acid sequences of type Ⅱ RIPs from different plant species
图 4 CsRIP 基因组织特异性表达分析
Fig. 4 Expression of two CsRIP genes in different tissues of C. sinensis
2. 5 假眼小绿叶蝉和机械伤害处理对 CsRIP 基因
表达的影响 荧光定量 RT-PCR 分析表明,2 个
CsRIP 基因的表达均受假眼小绿叶蝉取食的强烈诱
导,并且具有类似的表达谱。从图 5 可知,假眼小绿
叶蝉取食 3 h 后,CsRIP1 和 CsRIP2 表达开始升高,
并且取食时间越长表达量越高,取食 48 h 后,
CsRIP1 和 CsRIP2 转录本水平大约分别是对照的
120 和 100 倍(图 5)。机械伤害处理后,CsRIP1 表
达升高,处理后 6 h 达到最大值,随后逐渐下降,处
理后 48 h 再度增强(图 6); CsRIP2 在机械伤害处
理后 6 h,表达水平显著升高,12 h 达到最高水平,
约为对照的 9. 5 倍,以后逐渐下降,处理后 48 h,降
至对照水平的 1 /2。
3 讨论
植物体常常编码一组不同的 RIPs,例如对水稻
(Oryza sativa)和蓖麻的基因组进行扫描,发现水稻
的基因组含有 31 个Ⅰ型 RIP 基因 ( Jiang et al.,
2008),蓖麻的基因组含有 7 个 Ⅱ 型 RIP 基因
图 5 假眼小绿叶蝉处理对 CsRIP 基因表达的影响
Fig. 5 Expression of two CsRIP genes in response to E. vitis feeding
图 6 机械伤害处理对 CsRIP 基因表达的影响
Fig. 6 Expression of two CsRIP genes in
response to mechanical damage
(Leshin et al.,2010),RIP 基因家族不同成员的表达
常常表现出组织特异性和发育阶段的特异性,并且
应答不同的环境胁迫。本研究从茶树中分离出 2 个
Ⅱ型核糖体失活蛋白基因,这 2 个 RIP 基因均含有
1 个 1 713 bp 的读码框,编码 570 个氨基酸残基。
CsRIP1 的 5 UTR 和 3 UTR 的长度分别是 73 bp 和
224 bp,与 CsRIP1 基因的 3 UTR 相比,除了 1 个位
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第 2 期 袁红雨等: 茶树Ⅱ型核糖体失活蛋白基因 CsRIP1 和 CsRIP2 的克隆与表达分析
置上的碱基不同之外,CsRIP2 基因已克隆的 3 UTR
缺失了一 段 15 bp 的 核 苷 酸 序 列。 CsRIP1 和
CsRIP2 编码产物具有 98%的一致性,结构域分析表
明,CsRIPs 的编码产物由信号肽、A 链、链接肽和 B
链组成。Ⅱ型核糖体失活蛋白前体在成熟的过程
中,信号肽和链接肽被切除,A 链和 B 链通过 1 个二
硫键连接起来。
Ⅱ型 RIPs 的 A 链具有 N -糖苷酶活性,氨基酸
序列的多重比对结果表明,其活性中心位点保守的
氨基酸残基均出现在 CsRIPs A 链的相应位置上。
另外,低水平的赖氨酸残基也是 A 链发挥其酶学活
性的关键因素,蓖麻毒蛋白的 A 链含有 2 个赖氨酸
残基,而 CsRIPs 的 A 链仅带有 1 个赖氨酸残基。低
水平的赖氨酸残基可能有助于 A 链躲避细胞质中
蛋白酶体的降解(Di et al.,2005),作用于 rRNA。
Ⅱ型 RIPs 的 B 链能够结合细胞表面寡糖链上
的半乳糖残基,介导毒蛋白的内吞过程。通过对蓖
麻毒蛋白和 abrin-a 的晶体结构分析发现,Ⅱ型 RIPs
的 B 链含有 2 个重复的结构域,而每个结构域又进
一步分成 3 个大约由 40 个氨基酸残基组成的亚结
构域。因此,Ⅱ型 RIPs 的 B 链可能起源于一个编码
40 个氨基酸残基的基因,该原初基因首先发生 3 次
重复,形成 RBL 结构域的编码序列,然后再发生 1
次重复,形成 2 个 RBL 结构域。由于每个亚结构域
中存在 1 个 QxW 基序,因此 RBL 结构域又称为
(QxW) 3 结构域 (Hazes,1996)。相同的结构模式
和保守的氨基酸残基也存在于 CsRIPs 的 B 链上。
尽管 2 个 CsRIP 基因在已检测的 4 种组织中均
有表达,但仍表现出一定的组织特异性。CsRIP1 在
叶片中的表达水平最高,而 CsRIP2 在发育的子叶中
高度表达。在本试验中,假眼小绿叶蝉取食快速诱
导 CsRIPs 基因的表达,并且随着取食时间的延长,
CsRIPs 基因的表达量逐渐增加。机械伤害显著诱
导 CsRIPs 基因的表达,但是在伤信号的诱导下,
CsRIP1 和 CsRIP2 的表达模式存在较大差别。结果
表明 CsRIPs 基因可能参与茶树的防卫反应,且已经
发生亚功能化。系统进化树分析显示,一种植物的
Ⅱ型 RIPs 首先聚类,说明Ⅱ型核糖体失活蛋白基因
在植物体中发生扩增是一个近期事件。序列分析显
示,CsRIPs 与樟的 cinnamomin Ⅲ的一致性最高,约
为 63%。cinnamomin 被认为是樟种子的贮藏蛋白
(Liu et al.,2002),因此可以设想昆虫取食的选择压
力导致 CsRIPs 演变成一种防卫蛋白,并在进化的过
程中获得了在叶片中表达且受昆虫取食诱导的
特性。
参 考 文 献
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(责任编辑 徐 红)
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