分析植物液泡和细胞壁酸性转化酶基因的保守区序列,设计2对PCR引物,以温州蜜柑基因组DNA为模板,采用PCR方法扩增出长分别为741bp(A)和524bp(B)的2个DNA片段,克隆入pUCm-T载体测序,序列已在GenBank中登记(登记号分别为AY029481和AF332881)。在GenBank中进行同源性检索,结果表明片段A编码的氨基酸与植物液泡酸性转化酶同源性较高,与胡萝卜、马铃薯和番茄同源性分别为79%、79%和78%。片段B编码的氨基酸序列与草莓、拟南芥和豌豆细胞壁转化酶同源性分别为78%、78%和77%。推测A和B分别定位于液泡和细胞壁。运用Clustalx和Bioedit软件包对已获得的柑桔转化酶基因家族的7个基因序列进行分析,结果表明7个基因分属转化酶基因家族的4种类型。推测A和B为2个新成员,分别属于柑桔液泡酸性转化酶基因Ⅱ型(CUAI2)和细胞壁酸性转化酶基因Ⅱ型(CUCWI)。Southern杂交结果表明,CUCWI和CSCWI 2个探针有时会出现较弱的杂交干扰信号,可采用CSCWI与CUCWI同源性较低的另一段序列制作探针进行杂交,也可通过缩短杂交时间、提高杂交和洗膜的温度以及降低洗膜SSC的浓度等措施来降低;其它成员之间无干扰信号产生
Two pairs of primers, designed from conserved regions of plant vacuolar and cell wall bound acid invertase genes respectively, were used to amplify 741bp (A) and 524 bp (B) fragments from Citrus unshiu genomic DNA by polymerase chain reaction (PCR). The fragments were cloned into pUCm-T, and then sequenced. The deduced amino acid sequence of fragment A is 79%, 79%, 78% identical to genes from Daucus carota (X75353), Solanum tuberosum (X70368) and Lycopersicon esculentum (Z12025)respectively, and was suggested to encode a soluble acid invertase located in vacuole, while B is 78%, 78%, 77% identical to genes from Fragaria ananassa (AF000521), Arabidopsis thaliana (AP001307) and Pisum sativum (X85327) respectively, and was suggested to encode a insoluble acid invertase in cell wall. Lower homology among A, CUAI1, B and CSCWI suggested that A and B were two new members of acid invertase gene family in Citrus, respectively belong to putative CUAI2 and CUCWI. There was no interaction among these members (CUAI1, CUAI2, CUCWI or CSCWI) except for CUCWI and CSCWI in Southern blot analysis. The interaction between CUCWI and CSCWI could be eliminated by using CSCWI‘s partial sequence which was lower homologous to CUCWI as probe, and weakened by shortening hybridization time, increasing hybridization and washing temperature, washing membrane in lower concentration of SSC.
全 文 :第 ws卷 第 w期
u s s w年 z 月
林 业 科 学
≥≤∞× ≥∂ ∞ ≥≤∞
∂²¯1ws o²1w
∏¯ qou s s w
柑桔酸性转化酶基因家族成员的克隆及特性分析 3
安新民 张上隆 徐昌杰
k浙江大学 杭州 vtssu|l
陶 俊
k扬州大学 扬州 uuxstwl
摘 要 } 分析植物液泡和细胞壁酸性转化酶基因的保守区序列 o设计 u对 °≤ 引物 o以温州蜜柑基因组 ⁄为
模板 o采用 °≤ 方法扩增出长分别为 zwt¥³kl和 xuw¥³k
l的 u个 ⁄片段 o克隆入 ³≤°2×载体测序 o序列已在
¨ ±
¤±®中登记k登记号分别为 ≠su|w{t和 ƒvvu{{tl ∀在 ¨ ±
¤±®中进行同源性检索 o结果表明片段 编码的氨
基酸与植物液泡酸性转化酶同源性较高 o与胡萝卜 !马铃薯和番茄同源性分别为 z| h !z| h 和 z{ h ∀片段
编码
的氨基酸序列与草莓 !拟南芥和豌豆细胞壁转化酶同源性分别为 z{ h !z{ h和 zz h ∀推测 和
分别定位于液泡
和细胞壁 ∀运用 ≤¯ ∏¶·¤¯¬和
¬²¨ §¬·软件包对已获得的柑桔转化酶基因家族的 z个基因序列进行分析 o结果表明 z
个基因分属转化酶基因家族的 w种类型 ∀推测 和
为 u个新成员 o分别属于柑桔液泡酸性转化酶基因 µ型
k ΧΥΑΙ2l和细胞壁酸性转化酶基因 µ型k ΧΥΧΩΙl ∀≥²∏·«¨µ±杂交结果表明 o ΧΥΧΩΙ和 ΧΣΧΩΙ u个探针有时会出现较
弱的杂交干扰信号 o可采用 ΧΣΧΩΙ与 ΧΥΧΩΙ 同源性较低的另一段序列制作探针进行杂交 o也可通过缩短杂交时
间 !提高杂交和洗膜的温度以及降低洗膜 ≥≥≤ 的浓度等措施来降低 ~其它成员之间无干扰信号产生 ∀
关键词 } 柑桔 o酸性转化酶 o基因家族 o克隆 o特性
中图分类号 }≥zt{1wy ~±|wv1u 文献标识码 } 文章编号 }tsst p zw{{kusswlsw p ssx{ p sx
收稿日期 }ussu p ts p vt ∀
基金项目 }国家自然科学基金kv|zvsvws ovstzsyw{l资助 ∀
3 张上隆为通讯作者 ∀
Χλονινγ ανδ Χηαραχτεριζατιον οφ Μεµ βερσ οφ Αχιδ Ινϖερτασε Γενε Φαµιλψιν Χιτρυσ
± ÷¬±°¬± «¤±ª≥«¤±ª¯²±ª ÷∏≤«¤±ª¬¨
k Ζηεϕιανγ Υνιϖερσιτψ Ηανγζηουvtssu|l
פ²∏±
kΨανγζηου Υνιϖερσιτψ Ψανγζηουuuxstwl
Αβστραχτ } ׺²³¤¬µ¶²©³µ¬°¨ µ¶o§¨¶¬ª±¨ §©µ²°¦²±¶¨µ√¨ §µ¨ª¬²±¶²©³¯¤±·√¤¦∏²¯¤µ¤±§¦¨¯¯ º¤¯¯¥²∏±§¤¦¬§¬±√¨ µ·¤¶¨ ª¨ ±¨ ¶µ¨2
¶³¨¦·¬√¨ ¼¯ oº¨ µ¨ ∏¶¨§·²¤°³¯¬©¼zwt¥³kl ¤±§xuw ¥³k
l©µ¤ª°¨ ±·¶©µ²° Χιτρυσυνσηιυ ª¨ ±²°¬¦⁄ ¥¼³²¯¼°¨ µ¤¶¨ ¦«¤¬±µ¨2
¤¦·¬²± k°≤ l q׫¨ ©µ¤ª°¨ ±·¶º¨ µ¨ ¦¯²±¨ §¬±·²³≤°2× o¤±§·«¨ ± ¶¨ ∏´¨±¦¨§q׫¨ §¨§∏¦¨§¤°¬±²¤¦¬§¶¨ ∏´¨±¦¨ ²©©µ¤ª°¨ ±·
¬¶z| h oz| h oz{ h ¬§¨±·¬¦¤¯ ·²ª¨ ±¨ ¶©µ²° ∆αυχυσχαροτα k÷zxvxvl o Σολανυµ τυβεροσυµ k÷zsvy{l ¤±§ Λψχοπερσιχον εσχυ2
λεντυµ ktusuxlµ¨¶³¨¦·¬√¨ ¼¯ o¤±§º¤¶¶∏ªª¨¶·¨§·² ±¨¦²§¨ ¤¶²¯∏¥¯¨¤¦¬§¬±√¨ µ·¤¶¨ ²¯¦¤·¨§¬± √¤¦∏²¯¨oº«¬¯¨
¦z{ h oz{ h o
zz h ¬§¨±·¬¦¤¯ ·²ª¨ ±¨ ¶©µ²° Φραγαρια ανανασσα kƒsssxutl o Αραβιδοπσιστηαλιανα k°sstvszl ¤±§ Πισυµ σατιϖυµ k÷{xvuzl
µ¨¶³¨¦·¬√¨ ¼¯o¤±§º¤¶¶∏ªª¨¶·¨§·² ±¨¦²§¨ ¤¬±¶²¯∏¥¯¨¤¦¬§¬±√¨ µ·¤¶¨ ¬± ¦¨¯¯ º¤¯¯q²º¨ µ«²°²¯²ª¼ ¤°²±ª o ΧΥΑΙ1 o
¤±§
ΧΣΧΩΙ ¶∏ªª¨¶·¨§·«¤· ¤±§
º¨ µ¨ ·º² ±¨ º °¨ °¥¨µ¶²©¤¦¬§¬±√¨ µ·¤¶¨ ª¨ ±¨ ©¤°¬¯¼¬± Χιτρυσoµ¨¶³¨¦·¬√¨ ¼¯ ¥¨ ²¯±ª·² ³∏·¤·¬√¨
ΧΥΑΙ2 ¤±§ ΧΥΧΩΙ q׫¨µ¨ º¤¶±²¬±·¨µ¤¦·¬²±¤°²±ª·«¨¶¨ °¨ °¥¨µ¶k ΧΥΑΙ1 , ΧΥΑΙ2 , ΧΥΧΩΙ ²µΧΣΧΩΙl ¬¨¦¨³·©²µΧΥΧΩΙ
¤±§ ΧΣΧΩΙ¬± ≥²∏·«¨µ± ¥¯²·¤±¤¯¼¶¬¶q׫¨ ¬±·¨µ¤¦·¬²± ¥¨·º¨ ±¨ ΧΥΧΩΙ ¤±§ ΧΣΧΩΙ ¦²∏¯§¥¨ ¨¯¬°¬±¤·¨§¥¼ ∏¶¬±ª ΧΣΧΩΙ. ¶³¤µ2
·¬¤¯ ¶¨ ∏´¨±¦¨ º«¬¦«º¤¶ ²¯º¨ µ«²°²¯²ª²∏¶·² ΧΥΧΩΙ ¤¶³µ²¥¨ o¤±§º¨ ¤®¨ ±¨ §¥¼ ¶«²µ·¨±¬±ª«¼¥µ¬§¬½¤·¬²±·¬°¨ o¬±¦µ¨¤¶¬±ª«¼2
¥µ¬§¬½¤·¬²± ¤±§º¤¶«¬±ª·¨°³¨µ¤·∏µ¨ oº¤¶«¬±ª °¨ °¥µ¤±¨ ¬± ²¯º¨ µ¦²±¦¨±·µ¤·¬²± ²©≥≥≤ q
Κεψ ωορδσ} Χιτρυσo¦¬§¬±√¨ µ·¤¶¨ o ¨ ±¨ ©¤°¬¯¼o≤¯ ²±¬±ªo≤«¤µ¤¦·¨µ¬½¤·¬²±
蔗糖是植物光合产物运转和贮藏的主要形式 ∀许多研究证实 o转化酶k蔗糖酶l催化蔗糖水解生成葡萄
糖与果糖 o在蔗糖代谢中起着重要作用 ∀转化酶分为酸性 !中性或碱性 ∀酸性转化酶存在于细胞壁k不溶性l
和液泡k可溶性l中 o中性或碱性转化酶存在于细胞质中 ∀转化酶的活性高低直接决定了组织库强度k¯¤±±
ετ αλqot||ul o从而影响光合产物的运转 o进而影响作物生长发育 ∀有关番茄kΛψχοπερσιχον εσχυλεντυµl和胡萝
卜k ∆αυχυσχαροταl等作物转化酶基因转化植株的研究表明 o转化酶活性的改变影响植株光合能力 !光合产物
的运转分配乃至植株生长 !果实大小 !品质 !产量和育性k«¼¤°¤ ετ αλqot||x ~t||| ~ ¯¤±± ετ αλqot||y ~
≥¦«²¯ ¶¨ ετ αλqot||y ~פ±ª ετ αλqot|||l ∀
转化酶基因的研究也取得较大进展 ∀目前已在甜菜k Βετα ϖυλγαρισl !马铃薯k Σολανυµ τυβεροσυµl !拟南芥
kΑραβιδοπσιστηαλιαναl !烟草k Νιχοτιαναταβαχυµl !玉米k Ζεα µαψσl !胡萝卜 !番茄以及绿豆kςιγνα ραβιαταl等植物
上分离了该基因 o但就果树而言 o只有葡萄kςιτισϖινιφεραlk⁄¤√¬¨¶ετ αλqot||yl !草莓k Φραγαρια ανανασσαlk¨ ±2
¤±®登记号 ƒsssxutl ∀安新民等kusstl分离了柑桔k Χιτρυσl转化酶基因家族的 u个成员并在 ¨ ±
¤±®中登
记kƒstw|ux和 ƒvtwt|zl ∀本文报道了获得该基因家族的另外 u个新成员 ΧΥΑΙu和 ΧΥΧΩΙk登记号分别为
≠su|w{t和 ƒvvu{{tl的过程 o并对所获得的 w个成员的序列特性进行分析 ∀这对于进一步研究它们的时
空表达特性 o探讨柑桔果实发育过程中蔗糖积累和分解机理具有重要意义 ∀
t 材料与方法
111 材料
t1t1t 植物材料 以温州蜜柑k Χιτρυσ υνσηιυl幼叶为提取基因组 ⁄的材料 ∀
t1t1u 引物 根据 ¨ ±
¤±®登记液泡转化酶基因kƒwyxytv Λψχοπερσιχον εσχυλεντυµ o ƒst|ttv Ορψζα σατιϖαo
≠svz|v{ Ιποµοεα βατατασo ÷zsvy{ Σολανυµ τυβεροσυµ o {z{w| Χαπσιχυµ αννυυµ o ÷zxvxv !÷zxvxu !÷zxvxt !
÷t{zsz ∆αυχυσχαροτα ouzzwxx Βετα ϖυλγαρισl和细胞壁转化酶基因kƒsssuxt Φραγαρια ανανασσα o ÷{xvuz !
ƒsyvuwy Πισυµ σατιϖυµ o vxtyv ςιχια φαβα o ƒs|txw| Ηαµαµελισ ϖιργινιανα o ƒwvwzuz Φορτυνελλα χρασσιφολιαo
°sstvsz !÷zwxtw !÷zwxtx !≠swxzzy Αραβιδοπσιστηαλιαναl序列的保守区分别设计下列 u对引物 }
ƒ° }xχ ××≤≤×≤×××≤××≤ vχ ~ ° }xχ ×≤××≤×≤×××≤×≤ vχ ~
ƒ°
}xχ ×≤≤×≤×××≤×≤≤×≤ vχ ~ °
}xχ ×≤≤≤×≤≤≤≤× vχ ∀
t1t1v ≥²∏·«¨µ±杂交试剂盒 ⁄ ⁄ ¤¥¨ ¬¯±ª¤±§ ⁄¨·¨¦·¬²± ¬·k购自 ²¦«¨ 公司l ∀
112 方法
t1u1t 基因组 ⁄提取 参照陈大明等kt||zl的方法 ∀
t1u1u °≤ 反应 在 ≠
⁄ °≤ ∞÷° ∞≥≥中进行 ∀反应 }xs Λ°≤ 反应体系包括 xs ±ª温州蜜柑基因
组 ⁄ o各 s1u Λ°²¯#pt上游引物 和下游引物 ot ≅ °≤ 反应缓冲液 ou °°²¯ #pt ª≤¯ u ouss Λ°²¯ #pt
§×°¶和 u单位 פ´ ⁄聚合酶k购自上海生工l ∀°≤ 循环条件为 |w ε 预变性 v °¬±o最后 zu ε 延伸 ts °¬±o
|w ε 变性 wx ¶ow{ ε 退火 |s ¶ozu ε 延伸 |s ¶o共进行 vx轮循环 ∀反应
}xs Λ°≤ 反应体系包括 xs ±ª温州
蜜柑基因组 ⁄ os1u Λ°²¯#pt上游引物
和下游引物
ot ≅ °≤ 反应缓冲液 ou °°²¯#pt ª≤¯ u ouss Λ°²¯#
pt §×°¶和 u单位 פ´ ⁄聚合酶k购自上海生工l ∀°≤ 循环条件为 |w ε 预变性 x °¬±o最后 zu ε 延伸 ts
°¬±o|w ε 变性 ws ¶oxs ε 退火 ws ¶ozu ε 延伸 t °¬±o共进行 vx轮循环 ∀
t1u1v ⁄片段重组入质粒载体 °≤ 产物 和产物
经纯化后分别与 ³≤°2×k购自上海生工l载体连
接 o连接产物转化大肠杆菌 ×t菌株感受态细胞 o通过蓝白斑筛选 !质粒长度和酶切k采用 Πστ ´进行酶切l
鉴定获得重组质粒k≥¤°¥µ²²® ετ αλqot|{|l ∀
t1u1w ⁄序列测定 由上海基因有限公司晶泰测序部测定 ∀
t1u1x 序列分析 采用 ≥¨ ¤´¬§ µ !≤¯ ∏¶·¤¯¬和
¬²¨ §¬·等软件进行分析 ∀
t1u1y ≥²∏·«¨µ±
¯²·¶分析 按照 ⁄ ⁄ ¤¥¨ ¬¯±ª¤±§ ⁄¨·¨¦·¬²± ¬·k²¦«¨ l 说明书进行 ∀
u 结果与分析
211 °≤ 产物的扩增和克隆
以温州蜜柑基因组 ⁄为模板 o用所设计的 u对引物进行 °≤ 反应 o得到长度分别大约为 zws ¥³和
xvs ¥³的 u条带 o将 °≤ 产物 和
经纯化后分别与 ³≤°2×载体连接 o连接产物分别转化大肠杆菌 ×t菌
株感受态细胞 o在含氨苄青霉素 !÷2ª¤¯ 及 °×的
平板上涂布获得白色菌落 o挑取这些菌落培养 !提取质
粒 o经长度和酶切k Πστ´l鉴定获得重组质粒 和
∀
212 基因序列与同源性分析
测定重组质粒 和
的序列 o表明 u个基因片段长分别为 zwt ¥³和 xuw ¥³o在 ¨ ±
¤±®中进行
¯¤¶·结
果表明 ou片段分别属于温州蜜柑液泡酸性转化酶基因 !细胞壁酸性转化酶基因 ∀基因片段 长 zwt ¥³o属
|x 第 w期 安新民等 }柑桔酸性转化酶基因家族成员的克隆及特性分析
图 t 温州蜜柑液泡酸性转化酶基因部分序列k划线部分为引物序列l
ƒ¬ªqt °¤µ·¬¤¯ ±∏¦¯ ²¨·¬§¨ ¤±§§¨§∏¦¨§¤°¬±²¤¦¬§¶¨ ∏´¨ ±¦¨ ²© Χq υνσηιυ √¤¦∏²¯¤µ
¬±√¨ µ·¤¶¨ ª¨ ±¨ k ΧΥΑΙ2l k≥¨´ ∏¨ ±¦¨¶«²°²¯²ª²∏¶·²·«¨ ²¯¬ª²±∏¦¯ ²¨·¬§¨
³µ¬°¨ µ¶∏¶¨§©²µ°≤ ¤°³¯¬©¬¦¤·¬²± ¤µ¨ ∏±§¨µ¯¬±¨ §l
于温州蜜柑液泡酸性转化酶基因开放阅读
框的一部分 o不含内含子 ∀其序列如图 t ∀
在 ¨ ±
¤±®中进行同源性检索 o结果表明 o
该基因片段序列与番茄kƒwyxytvl !水稻
k Ορψζα σατιϖαo ƒst|ttvl !马铃薯k÷zsvy{l
液泡转化酶基因的同源性分别为 {s h !
{v h和 {t h ∀该基因编码的氨基酸序列与
胡萝卜k÷zxvxvl !马铃薯k÷zsvy{l和番茄
ktusuxl液泡酸性转化酶基因编码的氨基
酸同源性分别为 z| h !z| h 和 z{ h ∀推测
该基因定位于液泡 ∀基因片段
长 xuw ¥³o
属温州蜜柑细胞壁酸性转化酶基因开放阅
读框的一部分 o不含内含子 ∀其序列如图
u ∀在 ¨ ±
¤±®中进行同源性检索 o结果表
明 o该基因片段序列与甜橙k Χιτρυσσινενσισo
ƒvtwt|zl !Λοτυσϕαπονιχυσ k°sswxutl 和金
缕梅k Ηαµαµελισ ϖιργινιανα oƒs|txxsl 细胞
壁转化酶基因的同源性分别为 {s h !{s h
和 {s h o 该基因氨基酸序列与草莓
kƒsssxutl !拟南芥k°sstvszl和豌豆k Πι2
συµ σατιϖυµ oƒsyvuwyl细胞壁转化酶基因编
码的同源性分别为 z{ h !z{ h 和 zz h ∀推
图 u 温州蜜柑细胞壁酸性转化酶基因部分序列k划线部分为引物序列l
ƒ¬ªqu °¤µ·¬¤¯ ±∏¦¯ ²¨·¬§¨ ¤±§§¨§∏¦¨§¤°¬±²¤¦¬§¶¨ ∏´¨±¦¨ ²© Χq υνσηιυ ¦¨¯¯ º¤¯¯¤¦¬§
¬±√¨ µ·¤¶¨ ª¨ ±¨ k ΧΥΧΩΙl k≥¨´ ∏¨±¦¨¶«²°²¯²ª²∏¶·²·«¨ ²¯¬ª²±∏¦¯ ²¨·¬§¨
³µ¬°¨ µ¶∏¶¨§©²µ°≤ ¤°³¯¬©¬¦¤·¬²± ¤µ¨ ∏±§¨µ¯¬±¨ §l
测该基因定位于细胞壁 ∀
运用 ≤¯ ∏¶·¤¯¬和
¬²¨ §¬·软件包将获得
的 z 个柑桔酸性转化酶基因kƒstw|ux o
ƒwvwzu{ o≠su|w{t oƒwvvywv oƒvvu{{t o
ƒvtwt|z oƒwvwzuzl推导的氨基酸序列进
行聚类和同源性分析 o结果表明 z个基因序
列分 属 w 种 酸 性 转 化 酶 基 因 类 型 o
ƒstw|uxk温州蜜柑l和 ƒwvwzu{k代代酸
橙 Χq αυραντιυµl属液泡 ´型 o≠su|w{tk温
州蜜柑l和 ƒwvvywvk甜橙l属液泡 µ型 o
ƒvvu{{t k温州蜜柑l属细胞壁 ´ 型 o
ƒvtwt|zk甜橙l和 ƒwvwzuzk金柑 Φορτυνελ2
λα χρασσιφολιαl属细胞壁 µ型k图 vl ∀同源性
分析结果表明基因片段 和
不同于已经
获得的柑桔转化酶基因家族的 u 个成员
kΧΥΑΙ1和 ΧΣΧΩΙlk安新民等 ousstl ∀ 与
ΧΥΑΙ1 和 ΧΣΧΩΙ 核酸序列同源性分别为
yz1ut h和 x{1x| h o氨基酸序列同源性分别为 zs1vv h和 xu1vs h k表 tl ∀推测该基因属于柑桔液泡酸性转
化酶基因 µ型k ΧΥΑΙ2) ∀
与 ΧΥΑΙ1和 ΧΣΧΩΙ核酸序列同源性分别为 xy1vs h和 {s1|u h o氨基酸序列同源
性分别为 xt1tx h和 zw1zt h k表 tl o推测该基因属于柑桔细胞壁酸性转化酶基因 µ型k ΧΥΧΩΙl ∀以上结果
表明已经获得了柑桔转化酶基因家族成员的 w种类型 ∀
213 Σουτηερν杂交分析
sy 林 业 科 学 ws卷
图 v z个柑桔酸性转化酶氨基酸
序列的系统聚类树状图
ƒ¬ªqv °«¼¯²ª¨ ±¬¦¤±¤¯¼¶¬¶²©¶¨√¨ ± ¤¦¬§
¬±√ µ¨·¤¶¨ ª¨ ±¨ ¶²© Χιτρυ󤦦²µ§¬±ª
·²³µ²·¨¬± ¶¨ ∏´¨ ±¦¨¶
u1v1t 探针标记效率的检测 将经过 ⁄标记 us «的对照 ⁄和 w个成
员的探针分别按 tΒtsu otΒvvs otΒtsv otΒtsw otΒtsx otΒtsy 进行梯度稀释 o
按浓度梯度各取 t Λ依次点样于尼龙膜上进行 ⁄标记效率检测 ∀检测
结果表明 o ΧΥΑΙ1 ! ΧΥΑΙ2 ! ΧΥΧΩΙ和 ΧΣΧΩΙ均获得了较理想的标记效率 o
与对照 ⁄的标记效率为同一数量级 o达 vs ±ª#Λptk图 wl o用于 ≥²∏·«¨µ±
杂交分析时可获得理想的印迹效果 ∀
u1v1u ≥²∏·«¨µ±杂交分析 分别按照 ΧΥΑΙ1 !ΧΥΑΙ2 !ΧΥΧΩΙ 和 ΧΣΧΩΙ w个
成员的顺序各取 s1x Λª相应的重组质粒 ⁄依次点样于每条尼龙膜上 o用
混有 ⁄标记的 ΧΥΑΙ1 !ΧΥΑΙ2 !ΧΥΧΩΙ和 ΧΣΧΩΙ w个成员 ⁄探针的杂交
液分别杂交 w条尼龙膜 ∀结果表明 oΧΥΑΙ1 和 ΧΥΑΙ2 两个探针分别只与相
应的重组质粒 ⁄出现杂交印迹 o而 ΧΥΧΩΙ 和 ΧΣΧΩΙ 两个探针则除各自
与相应的重组质粒 ⁄出现杂交主信号外 o同时由于二者 {s1|u h的核苷
酸同源性出现杂交次信号k图 xl ∀说明 v个探针间k ΧΥΑΙ1 !ΧΥΑΙ2 以及
ΧΥΧΩΙ和 ΧΣΧΩΙ二者之一l不会出现杂交干扰现象 o而 ΧΥΧΩΙ 和 ΧΣΧΩ两
个探针杂交有时会出现次信号 o可通过改用 ΧΣΧΩΙ序列的上游或下游部分
制作探针来消除干扰信号 ∀经过试验后表明 o适当地提高杂交温度和洗膜
的严紧度也可降低甚至消除 ΧΥΧΩΙ和 ΧΣΧΩΙ的杂交干扰 ∀
表 1 柑桔转化酶基因家族 4 个成员核酸(ΝΑ)序列和相应的氨基酸(ΑΑ)序列的同源性
Ταβ . 1 Ηοµολογουσ περχενταγε οφ νυχλεοτιδε αχιδ(ΝΑ) σεθυενχεσ ανδ χορρεσπονδινγ αµινο αχιδ(ΑΑ) σεθυενχεσ
βετωεεν 4 µεµ βερσ οφ αχιδ ινϖερτασε γενε φαµιλψ οφ Χιτρυσ h
¨ ±
¤±® ²q
液泡 ∂¤¦∏²¯¤µ 细胞壁 ≤¨¯¯ º¤¯¯
温州蜜柑液泡转化酶
基因 ´型 ΧΥΑΙ1
ƒstw|ux
温州蜜柑液泡转化酶
基因 µ型 ΧΥΑΙ2
≠su|w{t
温州蜜柑细胞壁转化酶
基因 ´型 ΧΥΧΩΙ
ƒvvu{{t
甜橙细胞壁转化酶
基因 ´型 ΧΣΧΩΙ
ƒvtwt|z
ΧΥΑΙ1 tss tss
ΧΥΑΙ2 yz1ut zs1vv tss tss
ΧΥΧΩΙ xy1vs xt1tx x|1|u xy1vu tss tss
ΧΣΧΩΙ xw1zz xt1zu x{1x| xu1vs {s1|u zw1zt tss tss
图 w 柑桔转化酶基因家族 w个成员
探针 ⁄标记效率的检测
ƒ¬ªqw ⁄¨ ·¨µ°¬±¤·¬²± ²© ⁄2¯ ¤¥¨ ¬¯±ª ©¨©¬¦¬¨±¦¼ ²©w ³µ²¥¨¶©²µw
°¨ °¥¨µ¶²©¤¦¬§¬±√ µ¨·¤¶¨ ª¨ ±¨ ©¤°¬¯¼ ²© Χιτρυσ
图 x 柑桔转化酶基因家族 w个成员的
⁄ ≥²∏·«¨µ± ¥¯²·¶分析
ƒ¬ªqx ⁄ ≥²∏·«¨µ± ¥¯²·¶²©w ° °¨¥¨µ¶²©¤¦¬§
¬±√¨ µ·¤¶¨ ª¨ ±¨ ©¤°¬¯¼ ²© Χιτρυσ
v 结论与讨论
转化酶水解蔗糖为葡萄糖和果糖 o与蔗糖代谢密切相关 ∀转化酶活性的高低直接影响组织库强 o进而影
响植株的生长发育乃至产量品质的形成 ∀根据转化酶催化的最适 ³可将其分为酸性转化酶和碱性转化酶
k包括近中性的转化酶l o酸性转化酶一般定位于细胞壁k不溶性的l及液泡k可溶性的l o而碱性转化酶则定
ty 第 w期 安新民等 }柑桔酸性转化酶基因家族成员的克隆及特性分析
位于细胞质k≥·∏µ° ετ αλqot||sl ∀转化酶基因是一个多成员的基因家族 o不同定位的转化酶同工型由几个不
同的基因成员编码 ∀在玉米中已分离到 w 个不同的细胞壁转化酶基因成员k ΙΝΧΩ1 tzy|x o ΙΝΧΩ2
ƒsxsyvt o ΙΝΧΩ3 ƒswvvwy o ΙΝΧΩ4 ƒswvvwzl和 t个液泡转化酶基因kΙϖρ1 tytuvlk¬° ετ αλqousssl ∀在
胡萝卜转化酶基因家族中 o编码细胞壁酸性转化酶基因的 x个不同成员k÷y|vut o ÷z{wuv o ÷z{wuw o ÷t{zsy o
÷t{zszl和编码液泡酸性转化酶基因的 w个不同成员k÷yztyv o ÷zxvxt o ÷zxvxu o ÷zxvxvl以及编码中性转化
酶的 t个基因均已得到分离k²µ¨±½ ετ αλqot||x ~≥·∏µ°ot||y ~≥·∏µ° ετ αλqot|||l ∀
柑桔转化酶基因也是一个多成员基因家族 o已经报道了 u个转化酶基因成员k柑桔液泡酸性转化酶基因
´型 ΧΥΑΙ1和柑桔细胞壁酸性转化酶基因 µ型 ΧΣΧΩΙ o¨ ±
¤±®登记号分别为 ƒstw|ux和 ƒvtwt|zlk安新
民等 ousstl ∀本研究获得了柑桔可溶性酸性转化酶基因家族的另外 u个成员柑桔液泡酸性转化酶基因 µ型
k ΧΥΑΙ2l和柑桔细胞壁酸性转化酶基因 µ型k ΧΥΧΩΙl o已经在 ¨ ±
¤±®登记k≠su|w{t和 ƒvvu{{tl ∀
对已获得的 z个柑桔转化酶基因的聚类和同源性分析表明 }ktl柑桔酸性转化酶基因家族至少有 w个成
员 o而且 u个新成员与 ΧΥΑΙ1和 ΧΣΧΩΙ分属酸性转化酶基因家族的 w个不同的成员 ∀kul柑桔属不同种和
品种之间同一成员差异极小 o因此推测 w个成员的探针通用于柑桔属不同种和品种的 ≥²∏·«¨µ± !²µ·«¨µ±和
• ¶¨·¨µ±杂交分析 ∀kvl≥²∏·«¨µ±杂交分析表明 ΧΥΑΙ1 !ΧΥΑΙ2 !ΧΥΧΩΙ v个成员杂交时不会产生相互干扰的信
号 oΧΥΑΙ1 !ΧΥΑΙ2 !ΧΣΧΩΙ v个成员杂交时也不会产生相互干扰的信号 oΧΥΧΩΙ 和 ΧΣΧΩΙ 之间的交叉干扰现
象是由于二者核酸序列具有近 {s h的同源性所致 o为消除干扰信号的产生可采用 ΧΣΧΩΙ 基因与 ΧΥΧΩΙ 同
源性较低的上游或下游区制作探针进行杂交 ∀此外也可通过提高杂交温度和洗膜的严紧度来降低非特异性
的杂交信号k≥¤°¥µ²²® ετ αλqot|{| ~李德葆等 ot||yl o以达到真实反映其中一个探针杂交结果的目的 ∀由于 w
个成员间相对较低的核苷酸和氨基酸同源性使得它们不会在 ²µ·«¨µ±和 • ¶¨·¨µ±杂交中干扰主信号的获得 ∀
w个成员的获得有利于研究各成员在不同组织和发育阶段的表达情况 o为探讨它们各自在柑桔果实发育期
间蔗糖的积累和分解中所起的作用 o进而为理解果实发育以及含糖量这一品质性状形成机制打下基础 ∀
植物液泡和细胞壁中存在的酸性转化酶又各有几种同工酶 o柑桔中其它几种酸性转化酶的编码基因仍有
待克隆 ∀我们现已构建了柑桔基因组 ⁄文库 o并从文库中分离出 ΧΣςΙ1和 ≤≥≤ • 全长基因 o其中包括启动
子在内的 ΧΣςΙ1全序列测定已完成 oΧΣΧΩΙ全长基因的测序和其它几个全长基因的分离工作正在进行 ∀
参 考 文 献
安新民 o徐昌杰 o张上隆 q柑橘酸性转化酶基因片段的克隆 q果树学报 ousst ot{kwl }t{| p t|u
陈大明 o张上隆 o金勇丰 q一种木本果树基因组 ⁄提取方法研究 q浙江农业大学学报 ot||z ouvkyl }yut p yuw
李德葆 o周雪平 o许建平等编著 q基因工程操作技术 q上海 }上海科学技术出版社 ot||y
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