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Expression of Two Citrus AP2/ERF Genes Under Different Hormone and#br# Stress Treatments

柑橘CitERF9 和CitAP2-7 在不同逆境和外源激素处理下的表达



全 文 :园艺学报,2016,43 (2):239–248.
Acta Horticulturae Sinica
doi:10.16420/j.issn.0513-353x.2015-0602;http://www. ahs. ac. cn 239
收稿日期:2015–10–09;修回日期:2016–02–02
基金项目:重庆市研究生科研创新项目(CYS2015074);国家科技支撑计划项目(2013BAD02B02);重庆科技支撑示范工程项目
(cstc2014fazktjcsf80033);重庆市科委重点实验室项目;西南大学基本科研业务费专项资金项目(XDJKQ015C015)
* 通信作者 Author for correspondence(E-mail:heshaolan@cric.cn)
柑橘 CitERF9 和 CitAP2-7 在不同逆境和外源激
素处理下的表达
董翠翠,马岩岩,谢让金,邓 烈,易时来,吕 强,郑永强,何绍兰*
(西南大学/中国农业科学院柑桔研究所,重庆 400712)
摘 要:以‘资阳’香橙(Citrus junos‘Ziyang’)为试材,分别对 CitERF9 和 CitAP2-7 进行了分析。
结果表明:CitERF9 基因的开放阅读框(ORF)为 735 bp,含有 1 个外显子,可编码 244 个氨基酸残基的
多肽。CitAP2-7 的开放阅读框为 1 080 bp,具有 6 个外显子,可编码 360 个氨基酸残基。同源分析结果显
示,这两个基因编码的蛋白与大豆、蓖麻、碧桃、苜蓿等植物中的同源蛋白有 81% ~ 84%的相似性。实时
定量分析表明:CitERF9 和 CitAP2-7 在植株不同组织间的表达具有明显差异。在根中,CitERF9 受各种胁
迫处理诱导,而 CitAP2-7 主要受 ABA、NaCl、脱水等的诱导。在叶中,各种胁迫均对 CitERF9 具有诱导
作用,其模式与根中相似,而 CitAP2-7 的表达则主要受 ABA、ACC、MeJA、SA 等激素以及低温和 NaCl
的抑制。试验结果表明,CitERF9 和 CitAP2-7 参与了激素和非生物胁迫的响应过程。
关键词:柑橘;CitERF9;CitAP2-7;基因表达;激素;逆境胁迫
中图分类号:S 666 文献标志码:A 文章编号:0513-353X(2016)02-0239-10

Expression of Two Citrus AP2/ERF Genes Under Different Hormone and
Stress Treatments
DONG Cui-cui,MA Yan-yan,XIE Rang-jin,DENG Lie,YI Shi-lai,LÜ Qiang,ZHENG Yong-qiang,
and HE Shao-lan*
(Citrus Research Institute,Southwest University–Chinese Academy of Agricultural Scieneces,Chongqing 400712,China)
Abstract:Two AP2/ERF genes,CitERF9 and CitAP2-7 were analyzed in Citrus junos‘Ziyang’. The
data showed that CitERF9 genomic sequence contained a single exon of 735 bp long,which could encode
a protein of 244 amino acid residues. In contrast,CitAP2-7 genomic sequence possessed 5 introns and its 6
exons could encode a protein of 360 amino acid residues. Sequence alignment showed that CitERF9 and
CitAP2-7 shared 81%–84% amino acid identities with corresponding AP2/ERF members from soybean,
castor,peach and alfalfa. Real time quantitative analysis revealed that the expression of CitAP2-7 and
CitERF9 in different tissues exhibited different patterns. In roots,CitERF9 was induced by all hormone
and stress treatments,whereas CitAP2-7 was mainly modulated by NaCl,ABA and dehydration. In leaves,
CitERF9 was up-regulated by all treatments,similar to that in roots. But CitAP2-7 was suppressed by
ABA,ACC,MeJA,SA and NaCl treatments. The results suggested the involvement of both CitERF9 and

Dong Cui-cui,Ma Yan-yan,Xie Rang-jin,Deng Lie,Yi Shi-lai,Lü Qiang,Zheng Yong-qiang,He Shao-lan.
Expression of two citrus AP2/ERF genes under different hormone and stress treatments.
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CitAP2-7 in the responses of citrus to stresses and relevant hormones.
Key words:citrus;CitERF9;CitAP2-7;gene expression;hormone;stress

近年来研究发现,在植物逆境响应过程中,转录因子发挥着关键作用,如 MYB(Kranz et al.,
1998)、GRAS(Tian et al.,2004)、NAC(Lijavetzky et al.,2003)、AP2/ERF 类(Sakuma et al.,2002)
等。其中 AP2/ERF 类转录因子受到研究者的广泛关注,并成为研究热点。AP2/ERF 类转录因子为
超基因家族,其含有 1 个由 60 ~ 70 个氨基酸构成的 AP2/ERF 特征结构域,该结构域可以特异识别
GCC 启动子元件(AGCCGCC)来调控相关基因的表达。根据特征结构域可将 AP2/ERF 类转录因
子分为 3 个家族(Nakano et al.,2006),即 AP2 家族(含有两个重复的 AP2/ERF 结构域)、ERF 家
族(含有 1 个 AP2/ERF 结构域)和 RAV 家族(含有 1 个 AP2/ERF 结构域和 1 个 B3 结构域)。另外,
根据 AP2/ERF 结构域保守氨基酸的不同,又将 ERF 转录因子家族进一步划分为 ERF 亚家族和
CBF/DREB 亚家族(Sakuma et al.,2002)。当前已对拟南芥(Stockinger et al.,1997;Lasserre et al.,
2008;Nakano et al.,2012)、大豆(Mazarei et al.,2002)、葡萄(Zhuang et al.,2009;Licausi et al.,
2010)、桃(Zhang et al.,2012)、黄瓜(Hu & Liu,2011)和番茄(Upadhyay et al.,2013;Liu et al.,
2014)等中的 AP2/ERF 类转录因子进行过鉴定分析,Xie 等(2014)在柑橘中鉴定出 126 个 AP2/ERF
家族成员,并对各成员的基因结构以及在果实发育阶段的表达量进行了分析,但各成员在激素处理
和生物、非生物等胁迫下的响应模式至今尚未见研究报道。
大量研究表明:AP2/ERF 家族成员参与了植物的生长发育与逆境响应过程,但不同成员间的生
物学功能存在明显差异。Wang 等(2007)发现 MdERF1 主要在苹果成熟果实组织中表达,在其他
组织仅有少量表达,而 MdERF2 只在成熟果实中表达,意味着 MdERF1 和 MdERF2 可能是调控苹果
成熟的特异转录因子;在大豆中,GmERF089 的表达量受高盐、干旱、乙烯、水杨酸、茉莉酸等胁
迫上调(Zhang et al.,2008),表明该基因参与了逆境响应过程;过量表达大豆 GmERF3 基因可增
强烟草转基因植物对高盐、干旱、烟草花叶病毒的抵抗能力(Zhang et al.,2009),含 CitERF1 基
因的转基因烟草植株可增强对冷害的抗性(Ma et al.,2014);在转基因番茄植株中,Sl-ERF2 通过
诱导 mannanase2 基因的表达而促进种子提前萌发(Pirrello et al.,2006);拟南芥中的 AP2 调控着
第一轮和第二轮的花器发育(Drews et al.,1991)。
前期工作中对柑橘所有 AP2/ERF 家族成员基因与拟南芥相应家族基因聚类分析发现,CitERF9
和CitAP2-7与拟南芥AtERF14和AtANT逆境响应基因同源性较高(Klucher et al.,1996;Oñate-Sánchez
et al.,2007),推测这两个基因可能参与了柑橘的抗逆过程。本试验中以柑橘常用抗碱、抗旱砧木
‘资阳’香橙为试材,利用生物信息学和基因表达等方法,对 CitERF9 和 CitAP2-7 的基因结构、蛋
白质性质以及在激素和非生物胁迫下的表达进行分析,以期为进一步解析 CitERF9 和 CitAP2-7 的生
物功能提供新的依据,为柑橘抗逆新品种选育和发掘奠定基础。
1 材料与方法
1.1 试材及其处理
2014 年 12 月在国家柑橘种质资源圃(重庆)采集‘资阳’香橙(Citrus junos‘Ziyang’)种子,
依次用 1 mol · L-1 的 NaOH 处理 30 min,3%次氯酸消毒 30 min,无菌水清洗 3 ~ 5 遍,置于 MS 培
养基上,在 28 ℃、16 h 光照/8 h 黑暗条件下培养 4 周。待幼苗长出第 2 片真叶时,选取生长势一
董翠翠,马岩岩,谢让金,邓 烈,易时来,吕 强,郑永强,何绍兰.
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表 1 本试验所用引物
Table 1 Primers used in this study
引物名称
Primer name
引物序列
Forward primer
CitERF9-F
CitERF9-R
CitAP2-7-F
CitAP2-7-R
Actin-F
Actin-R
ATGGTGAAGACTGAGCAAAGGAT
TACTTTCTGGTGGCTTTT
TGTAGACATCAAGCAATAAGT
AGCCTGGTAAGAAGCACA
CCCCATCGTTACCGTCCAG
CGCCTTGCCAGTTGAATATCC
致的健壮幼苗,用无菌水清洗干净。擦干之后在室温 25 ℃条件下进行激素和非生物胁迫处理,每
处理选取 10 株幼苗,重复 3 次。
激素包括 ABA(100 μmol · L-1)、ACC(20 mg · L-1)、MeJA(2 mg · L-1)和 SA(100 mg · L-1),
将清洗干净的幼苗放入含有激素的密闭瓶中,每种激素分别处理 0(对照)、1、4、8、12 和 24 h。
非生物胁迫处理包括 NaCl(250 μmol · L-1)、生理脱水和 4 ℃低温处理。NaCl 处理方法与激素
相同,4 ℃低温处理在冰箱中进行,处理时间都为 0(对照)、1、4、8、12 和 24 h。生理脱水采用
吸水滤纸包裹植株根部,夹子夹紧,使其自然脱水 0(对照)、0.5、1、3 和 6 h。
分别收集各处理幼苗的根和叶,立即放入液氮中速冻后保存于–80 ℃冰箱中备用。
1.2 总 RNA 提取与 cDNA 合成
使用 RNA prep pure Kit 试剂盒(天根生化科技有限公司)提取‘资阳’香橙总 RNA,使用 TaKaRa
公司的 Prime ScriptTM RT reagent Kit 反转录试剂盒合成第一条 cDNA 链。上述操作过程均按照试剂
盒说明书进行。
1.3 基因结构与序列分析
从 phytozome 数据库中获得 CitERF9 和 CitAP2-7 的 mRNA 及其相应的基因组序列,使用 GSDS
(http://gsds. cbi. pku. edu. cn/)工具进行基因结构分析。用 BLASTp(http://blast. ncbi. nlm. nih. gov/
Blast. cgi)分析氨基酸序列同源性,使用在线软件 Conserved Domains(http://www. ncbi. nlm. nih. gov/
cdd)进行蛋白保守结构域分析,用 EXPASY 软件(http://web. expasy. org/protparam/)分析蛋白的
相对分子量和等电点(Artimo et al.,2012),使用软件 CLUSTALX 进行多重序列比对。系统进化树
采用邻接法(Neighbor-Joining,NJ),由 MEGA6.0 构建。利用 ProtScale Tool 软件(http://cn. expasy.
org/tools/pwtscMe. html)分析 CitERF9 和 CitAP2-7 蛋白的疏水性/亲水性(Kyte & Doolittle,1982)。
1.4 实时荧光定量 PCR 分析
采 用 软 件 Beacon Designer 7.0 设 计
CitERF9 和 CitAP2-7 的实时定量引物,内参引
物为柑橘 Actin 基因,引物信息见表 1。在
CFX96 Touch 荧光定量 PCR 仪上检测 CitERF9
和 CitAP2-7 基因的表达量。10 μL 反应体系:5
μL 荧光染料(Bio-Rad 公司)、3 μL H2O、0.5 μL
引物、1 μL cDNA。反应程序:95 ℃ 10 min,
95 ℃ 15 s,50 ℃ 30 s,40 个循环。每处理
设 3 次生物学重复和 3 次平行样重复。相对表达量采用 2-∆∆Ct 法计算,用 SPASS19.0 软件对数据显
著性分析。
2 结果与分析
2.1 CitERF9 和 CitAP2-7 基因的序列分析
基于柑橘全基因组,获得了 CitERF9 和 CitAP2-7 的 mRNA 及其相应的基因组 DNA 全长,结果
(图 1)表明 CitERF9 的开放阅读框为 735 bp,有 1 个外显子,不具有内含子,可编码 244 个氨基
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酸,预测蛋白的分子量为 26.7 kD,等电点 6.73;而 CitAP2-7 的开放阅读框长 1 080 bp,有 6 个外
显子,5 个内含子,可编码 360 个氨基酸残基,分子量为 40.3 kD,等电点 9.27。








图 1 CitERF9 和 CitAP2-7 基因组序列结构
Fig. 1 The genomic structure of the CitERF9 and CitAP2-7

使用 BLASTp 程序分别对 CitERF9、CitAP2-7 的蛋白序列进行同源性比对,结果显示与大豆、
蓖麻、碧桃、苜蓿等相应蛋白序列的同源性达 81% ~ 84%。通过多重序列比对发现,CitERF9 蛋白
序列含有 1 个 AP2/ERFs 家族特征结构域,并且其中存在 1 个 WLG 保守元件(图 2),区域外含有
两个保守元件,分别为 CMII-1 和 CMII-3。CitAP2-7 蛋白序列含有两个 AP2 结构域,在第 2 个结构
域中存在 1 个 YRG 保守元件(图 3)。
为了进一步研究 CitERF9 和 CitAP2-7 的亲缘关系,本试验中利用拟南芥的 AP2/ERF 类转录因
子构建了 NJ 进化树。结果(图 4)表明 CitERF9 与拟南芥 AtERF14 蛋白同源性较高(84%),而
根据 Nakano 等(2006)对拟南芥 ERF 家族成员分类可知,CitERF9 基因属于 ERF 亚家族中的第
A-5 亚组 a 组。CitAP2-7 与 AtAIL1 和 AtANT 的蛋白同源性较高,属于 AP2 家族(Klucher et al.,
1996)。
























图 2 CitERF9 与其同源蛋白序列的氨基酸聚类分析
Fig. 2 Amino acid sequence alignment between CitERF9 and its homologous proteins from other plant species
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图 3 CitAP2-7 与其同源蛋白序列的氨基酸聚类分析
Fig. 3 Amino acid sequence alignment between CitAP2-7 and its homologous proteins from other plant species



















图 4 CitERF9 和 CitAP2-7 与拟南芥相似蛋白氨基酸序列的系统进化树分析
分支处的数值表示支持率。
Fig. 4 Phylogenetic tree of CitERF9 and CitAP2-7 and their homologous proteins from Arabidopsis thaliana
Number besides the branches indicate the support rate.
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图 5 CitERF9 和 CitAP2-7 在根和叶中的表达特性
Fig. 5 Expression profiles of CitERF9 and
CitAP2-7 in root and leaf
2.2 CitERF9 和 CitAP2-7 蛋白的亲水性/疏水性分析
CitERF9 第 7 位精氨酸亲水性最强,疏水性分值为–2.456,第 85 位丙氨酸疏水性最强,其值
为 1.689。而 CitAP2-7 疏水性和亲水性最强的氨基酸则位于第 21 位的脯氨酸(2.856)和第 30 位的
精氨酸(–4.1)。另外,CitERF9 和 CitAP2-7 蛋白的氨基酸序列中,具有多个明显的亲水区域。
2.3 CitERF9 和 CitAP2-7 基因的表达分析
2.3.1 在叶和根器官中的表达分析
从图 5 可以看出,CitERF9 在根中表达量高
于叶中,而 CitAP2-7 主要在叶中表达,表明这
两个基因的生物功能在根和叶中存在差异。
2.3.2 对激素处理的响应
CitERF9 和 CitAP2-7 对各激素处理均有响
应,但在根和叶中存在明显差异(图 6,图 7)。
ABA 处理能诱导 CitERF9 表达,在根中
CitERF9 的相对表达量在 4 h 上升至最高(0.28),在 24 h 时下降到 0.07,而在叶中的相对表达量
在 24 h 达到最大值(0.03);CitAP2-7 基因在根中只是微弱的增加,在叶中 ABA 对其起下调作用。
ACC 是乙烯合成的直接前体物质,直接影响着乙烯在植物中的含量。ACC 处理幼苗后,CitERF9
在根中前期的表达量变化不大,在 12 h 后陡然上升后下降,在叶中的表达量呈先上升后缓慢下降的
趋势,说明 CitERF9 对 ACC 的响应叶早于根;在 ACC 处理下 CitAP2-7 在根中几乎不表达,在叶中,
ACC 处理对其起抑制作用,并且在叶中前期的表达量高于 CitERF9。
MeJA 处理 12 h 时,幼苗根中 CitERF9 的表达量最高,而在叶中 8 h 时表达量达最高,分别是
未处理时的 1.89 和 4.5 倍;CitAP2-7 在根和叶中的表达情况与 ABA 处理时相似。
在 SA 处理下,CitERF9 的表达量在根中呈先上升后下降的趋势,8 h 时表达量最高,在叶中的
变化不明显;而 CitAP2-7 在根中表达量变化不明显,在叶中 SA 处理则明显抑制了 CitAP2-7 的表达。












图 6 外源激素处理下 CitERF9 的表达特性
不同小写字母表示差异显著(P < 0.05)。下同。
Fig. 6 Expression profiles of CitERF9 under exogenous hormone treatment of different plant hormones
The different letter means significant difference(P < 0.05). The same below.
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图 7 外源激素处理下 CitAP2-7 的表达特性
Fig. 7 Expression profiles of CitAP2-7 gene under exogenous hormone treatment of different plant hormones

2.3.3 对非生物胁迫的响应
从图 8 可以看出,NaCl 胁迫处理后,根和叶中 CitERF9 的表达量在 12 h 时都达到最高;
CitAP2-7 的表达量在根呈现上升趋势,在 24 h 达到最大,而在叶中却先降低后又上升至正常值。4 ℃
低温处理对 CitERF9 基因的表达有显著影响,在根中 12 h 时表达量处于最大值,是不处理时的 9.57

























图 8 非生物胁迫下 CitERF9 和 CitAP2-7 表达特性
Fig. 8 Pression profiles of CitERF9 and CitAP2-7 genes under various abiotic stresses
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倍。在叶中 8 h 就达到了最大值,是不处理时的 16.1 倍;低温处理对 CitAP2-7 在根中的的表达影响
不明显,叶中 CitAP2-7 的表达则受到了抑制。
生理脱水胁迫处理时,CitERF9 表达量在根和叶中的趋势相同,只是在叶中的表达量很低;
CitAP2-7 的表达模式与 NaCl 处理时相似,表明 CitAP2-7 对高盐和干旱胁迫的响应机制可能相同。
3 讨论
CitERF9 的氨基酸序列具有 AP2/ERF 家族特有的保守结构域,在其结构域的 C 端具有一个
CMII-1 元件,这是 ERF 亚家族第 A-5 亚组的特征结构。而 CitAP2-7 的氨基酸序列含有两个保守结
构域,属于 AP2 亚家族。另外,通过亲水性/疏水性分析发现,CitERF9 和 CitAP2-7 都属于亲水性
蛋白,易溶解,其结构不稳定。该结果与前人对 TbAP2 (杨艳芳 等,2014)、CsERF-B3(吴致
君 等,2014)、BnaERF1、BnaERF2、BnaERF3(庄静 等,2008)的研究结果一致。
聚类分析发现,CitERF9 与 AtERF14 聚在一起。使用 BLASTp 程序对 CitERF9 蛋白序列进行同
源性比对发现,与 AtERF14 蛋白同源性达 84%。而 AtERF14 基因在植物的防御反应中发挥着重要
作用,其缺失的突变体易感染尖孢镰刀菌(Oñate-Sánchez et al.,2007),暗示了 CitERF9 可能参与
植物的生物胁迫响应。CitAP2-7 与 AtAIL1 和 AtANT 距离较近,属于 AP2 家族。其中 AtANT 参与了
拟南芥子房和雌配子体的发育过程(Klucher et al.,1996),由此推测 CitAP2-7 可能与植物生长发
育过程中的生殖生长有关,而 CitERF9 和 CitAP2-7 是否具有该功能还有待于进一步研究。
AP2/ERF 家族成员主要参与乙烯信号转导途径,而该途径是由乙烯受体 ERS 以及各级信号转导
元件,如 CTR1、EIN2、EILs 和 AP2/ERF 等组成。在乙烯信号传导途径中,乙烯信号传递到 EIN3
转录因子,使该蛋白特异地结合 ERF 基因上游的 PERE 元件从而启动该基因的表达,所合成的 ERF
以级联放大的方式转录激活下游基因的表达(Guo & Ecker,2004)。但有研究发现一些 AP2/ERF
家族成员不仅参与乙烯信号转导途径,还参与 MeJA(Sears et al.,2014)、SA(Gutterson & Reuber,
2004)、ABA(Zhu et al.,2010)等途径,并且是各信号途径交叉处的重要成分。例如乙烯和茉莉
酸同时诱导拟南芥 AtERF1 基因的表达,两种激素同时处理下的表达量是各激素单独诱导量的叠加
(Koornneef & Pieterse,2008),表明 AtERF1 是乙烯和茉莉酸两信号途径的调控结点。RAP2.6
是拟南芥 AP2/ERF 超家族成员,凝胶阻滞实验和酵母单杂交实验均证实 RAP2.6 基因可以通过
结合 GCC 和 CE1 顺式作用元件来激活下游基因,该基因过表达植株表现出对 ABA 超过敏的症状,
说明 RAP2.6 为乙烯和 ABA 信号传导途径的结点(Zhu et al.,2010)。小麦 TaERF3 基因在病原抗
性反应中首先响应 SA 信号,随后在乙烯和茉莉酸途径中发挥作用,从而激活植物对病原物的
防卫反应(Zhang et al.,2007)。在本试验中,CitERF9 和 CitAP2-7 对 ACC、ABA、MeJA 和 SA
均有不同程度的响应,该结果与前人的研究结论一致,表明 CitERF9 和 CitAP2-7 基因是多种激素的
调控节点。此外,研究还发现 CitERF9 和 CitAP2-7 基因在幼苗根中对 NaCl、生理脱水和 ABA 胁迫
具有相似的表达模式,这与大豆 GmERF6 和 GmERF7 基因在 ABA、NaCl、干旱条件下具有相似的
表达模式(翟莹 等,2012)一致,可能是因为高盐会使植物细胞产生渗透胁迫效应从而使植物脱水,
而脱水会促使植株体内的 ABA 增加,通过信号转导调节相关抗逆基因表达,进而保护植株的正常
生长发育。
综上所述,本试验中通过生物信息学和基因表达对 CitERF9 和 CitAP2-7 进行了系统分析,表明
这两个基因在柑橘生长发育和抗逆生理中发挥着重要作用。本结果为下一步解析 CitERF9 和
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CitAP2-7 的生物功能奠定了基础。

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