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Establishment and Application of Specific InDel Markers on Different Linkage Groups of Cabbage Compared with Chinese Cabbage

结球甘蓝相对于大白菜连锁群特异InDel标记的建立及应用



全 文 :园 艺 学 报 2014,41(8):1699–1706 http: // www. ahs. ac. cn
Acta Horticulturae Sinica E-mail: yuanyixuebao@126.com
收稿日期:2014–04–11;修回日期:2014–06–03
基金项目:国家自然科学基金项目(31171964,31101552);‘十二五’农村领域国家科技计划课题项目(2012AA100202-5);高等学校
博士学科点专项科研基金项目(20101302120006);农业科研杰出人才培养计划项目(2130106);河北省自然科学基金项目(C2010000677);
河北省高等学校科学技术研究项目(Z2010149)
* 通信作者 Author for correspondence(E-mail:shensx@hebau.edu.cn)
结球甘蓝相对于大白菜连锁群特异 InDel 标记
的建立及应用
朱东旭 1,王彦华 1,赵建军 1,刘 博 2,李晓峰 1,轩淑欣 1,申书兴 1,*
(1 河北农业大学园艺学院,河北保定 071001;2 中国农业科学院蔬菜花卉研究所,北京 100081)
摘 要:以 4 个大白菜品种和 4 个结球甘蓝品种为试材,对位于芸薹属结球甘蓝 C 基因组 9 个连锁
群的 458 个 InDel 标记进行 PCR 筛选,筛选出 286 个结球甘蓝相对于大白菜的特异 InDel 标记,其中位于
C01 连锁群 31 个,C02 连锁群 45 个,C03 连锁群 54 个,C04 连锁群 24 个,C05 连锁群 22 个,C06 连
锁群 20 个,C07 连锁群 32 个,C08 连锁群 34 个,C09 连锁群 24 个。利用结球甘蓝 C02 连锁群特异 InDel
标记对实验室创建的大白菜—结球甘蓝易位系自交后代进行了初步鉴定,明确了外源甘蓝染色体片段的
物理位置在 18 096 729 ~ 18 786 494 bp 之间的 689 764 bp 区域内。
关键词:大白菜;结球甘蓝;InDel 标记;易位系;连锁群
中图分类号:S 634.1;S 635.1 文献标志码:A 文章编号:0513-353X(2014)08-1699-08

Establishment and Application of Specific InDel Markers on Different
Linkage Groups of Cabbage Compared with Chinese Cabbage
ZHU Dong-xu1,WANG Yan-hua1,ZHAO Jian-jun1,LIU Bo2,LI Xiao-feng1,XUAN Shu-xin1,and SHEN
Shu-xing1,*
(1College of Horticulture,Agricultural University of Hebei,Baoding,Hebei 071001,China;2Institute of Vegetables and
Flowers,Chinese Academy of Agricultural Sciences,Beijing 100081,China)
Abstract:A total of 458 InDel markers derived from 9 linkage groups of cabbage were screened on
four cabbage and four Chinese cabbage varieties by PCR amplification. The results showed that 286 InDel
markers were specific on cabbage compared with Chinese cabbage,31 of them on linkage group C01,45
of them on linkage group C02,54 of them on linkage group C03,24 of them on linkage group C04,22 of
them on linkage group C05,20 of them on linkage group C06,32 of them on linkage group C07,34 of
them on linkage group C08,and 24 of them on linkage group C09. The inbred progeny of one Chinese
cabbage-cabbage translocation line developed by our laboratory was identified preliminarily by specific
InDel markers on linkage group C02. The physical location of exogenous cabbage chromosome fragment
was in the 689 764 bp region from the 18 096 729 bp to 18 786 494 bp.
Key words:Chinese cabbage;cabbage;InDel marker;translocation line;linkage group

1700 园 艺 学 报 41 卷
研究表明,大白菜(Brassica compestris ssp. pekinensis,AA)的 A 染色体组与结球甘蓝(Brassica
oleracea var. capitata,CC)的 C 染色体组之间具有部分同源性(McGrath & Quiros,1991;Hu & Quoris,
1996;Lagercranta & Lydiate,1996;Cheung et al.,1997),这为引进结球甘蓝优良性状、扩大种质
遗传背景提供了机会,能够通过染色体的附加、重组和易位获得新种质。
易位系是指一段染色体和另一物种的相应染色体片段发生交换后形成的新类型个体。易位系有
效克服了单体异附加系遗传上的不平衡、配对重组的局限性和导入不良连锁基因等主要缺陷,并且
具有相对的稳定性,是作物改良最有效的途径之一(王二明 等,1997;Peterka et al.,2004; 张延
明 等,2010)。本实验室以大白菜—结球甘蓝异源三倍体(AAC)与二倍体大白菜(AA)回交世
代为材料,筛选出一套大白菜—结球甘蓝单体异附加系(刘畅 等,2008;刘炜 等,2008;桑丹 等,
2008),并从中获得了两个添加甘蓝 02 连锁群片段的大白菜—结球甘蓝易位系(闻晓英,2012)。
目前鉴定易位系中外源染色体片段的方法主要包括基因组原位杂交(Genomic in situ
hybridization,GISH)和分子标记等。基于大白菜 A 基因组和甘蓝 C 基因组之间的部分同源性,采
用常规的 GISH 方法进行易位片段的准确鉴定非常困难,需使用高密度的特异分子标记进行鉴定。
SSR 标记(Tautz,1989)广泛用于小麦易位系的鉴定(丁海燕 等,2009;王睿 等,2011;白耀博
等,2013)。顾爱侠等(2009)选用结球甘蓝 9 个连锁群的 91 个 SSR 标记,筛选出 25 个结球甘蓝
相对于大白菜的特异 SSR 标记,但标记数量较少,密度较低,难以实现外源染色体片段的精确鉴定。
SNP(single nucleotide polymorphism)和 InDel(insertion/deletion)是基于全基因组序列的新一代分
子标记,因其在基因组中的高密度分布,为染色体片段的精确鉴定提供了可能。SNP 标记的分布频
率虽然比 InDel 标记高(Feltus et al.,2004;Shen et al.,2004),但是设计和检测方法复杂(潘存红
等,2007)。InDel 标记方法简单经济,目前应用广泛(高颖 等,2012;孟霖 等,2012;Liu et al.,
2013)。但 InDel 标记在易位系鉴定中的应用还鲜有报道。
本研究中利用 458 个分布在结球甘蓝 C 基因组不同连锁群上的 InDel 标记,对不同大白菜和结
球甘蓝基因组 DNA 进行扩增,筛选结球甘蓝每个连锁群相对于大白菜的特异 InDel 标记,并对实验
室获得的大白菜—结球甘蓝易位系进行初步鉴定,为大白菜—结球甘蓝易位系的精确鉴定开辟新途
径。
1 材料与方法
供试材料为本实验室创建的一个大白菜—结球甘蓝易位系自交后代及其二倍体大白菜亲本
‘85-1’、结球甘蓝亲本‘11-1’,大白菜品种‘新津绿’、‘北京新 3 号’、‘秋珍白’,结球甘蓝品种
‘8398’、‘蓝宝’、‘晚丰甘蓝’。所有供试材料于 2012 年 9 月播种于河北农业大学实验基地,2 ~ 3
片真叶时剪取新鲜叶片,采用改良 CTAB 法提取基因组 DNA。
InDel 标记由中国农业科学院蔬菜花卉研究所提供,选取结球甘蓝 9 个连锁群上均匀分布的 458
个 InDel 标记。引物由上海生工生物工程技术服务有限公司合成。
PCR 反应总体系 10 μL,体系中各组分含量为:10× PCR Buffer(含 Mg2+)1 μL,2.5 mmol · L-1
dNTPs 0.8 μL,2.5 U · μL-1 Taq 酶 0.2 μL,50 ng · μL-1 正向引物 0.5 μL,反向引物 0.5 μL,30 ng · μL-1
模板 DNA 1.5 μL,其它用灭菌双蒸水补齐。PCR 扩增程序:94 ℃预变性 3 min,94 ℃变性 45 s,
60 ℃退火 30 s,72 ℃延伸 45 s,此后每个循环退火温度降低 0.5 ℃,共计 10 个循环,94 ℃变性 45 s,
55 ℃退火 30 s,72 ℃延伸 45 s,25 个循环,72 ℃延伸 5 min,4 ℃保存。扩增产物采用 8%聚丙烯
酰胺凝胶电泳进行分离,采用银染法检测,并拍照。
8 期 朱东旭等:结球甘蓝相对于大白菜连锁群特异 InDel 标记的建立及应用 1701

2 结果与分析
2.1 InDel 标记的扩增分析
在 286 个能够在结球甘蓝和大白菜间扩增出差异片段的特异 InDel 标记中,每个标记位点在大白
菜中检测到的等位基因数为 0 ~ 5 个。其中检测到两个等位基因的频率最高,为 44.41%;3.50%的标
记无扩增产物;检测到 1 个等位基因频率为 40.55%;3 个的为 7.69%;4 个的为 3.50%;5 个的为 0.35%。
在 286 个特异 InDel 标记中(表 1),每个 InDel 标记位点在结球甘蓝中检测到的等位基因数为
1 ~ 4 个。其中检测到 1 个等位基因的频率最高,为 132 个,占特异 InDel 标记的 46.15%;121 个 InDel
标记检测到两个等位基因,其频率为 42.31%;25 个 InDel 标记检测到 3 个等位基因,频率为 8.74%;
只有 8 个 InDel 标记检测到 4 个等位基因,频率为 2.80%。

表 1 286 个特异 InDel 标记在结球甘蓝中的等位基因频率
Table 1 Allele frequency of specific InDel markers amplified in cabbage accessions
连锁群
Linkage
group
等位基
因数
Number
of allele
InDel 标记名称
InDel marker
标记数
Number of
marker
1 C01-5,C01-36,C01-37,C01-39,C01-46,C01-51,C01-52 7
2 C01-1,C01-6,C01-7,C01-10,C01-12,C01-14,C01-15,C01-18,C01-19,C01-26,C01-27,C01-28,
C01-29,C01-31,C01-41,C01-42,C01-53,C01-55,C01-56
19
C01

3 C01-2,C01-11,C01-16,C01-25,C01-54 5
1 C02-4,C02-8,C02-12,C02-13,C02-14,C02-15,C02-16,C02-17,C02-18,C02-19,C02-20,C02-22,
C02-23,C02-24,C02-25,C02-29,C02-30,C02-37,C02-38,C02-40,C02-45,C02-47,C02-48,C02-52,
C02-53,C02-54,C02-57,C02-58,C02-59,C02-61
30
2 C02-2,C02-3,C02-5,C02-6,C02-7,C02-26,C02-32,C02-36,C02-49,C02-60 10
3 C02-9,C02-10,C02-27,C02-50 4
C02

4 C02-56 1
1 C03-3,C03-8,C03-29,C03-30,C03-33,C03-36,C03-37,C03-45,C03-52,C03-71,C03-75,C03-81,
C03-85,C03-87
14
2 C03-1,C03-6,C03-7,C03-14,C03-16,C03-19,C03-21,C03-28,C03-38,C03-39,C03-40,C03-41,
C03-42,C03-44,C03-46,C03-47,C03-51,C03-53,C03-56,C03-57,C03-63,C03-66,C03-67,C03-68,
C03-70,C03-72,C03-73,C03-80,C03-83
29
3 C03-4,C03-9,C03-18,C03-20,C03-26,C03-50,C03-82 7
C03

4 C03-23,C03-24,C03-49,C03-64 4
1 C04-2,C04-3,C04-8,C04-18,C04-26,C04-28,C04-29,C04-31,C04-33 9
2 C04-5,C04-6,C04-13,C04-15,C04-22,C04-27,C04-30,C04-34,C04-35,C04-36,C04-38,C04-45,
C04-46
13
C04

3 C04-24,C04-37 2
1 C05-5,C05-14,C05-19,C05-23 4
2 C05-1,C05-2,C05-3,C05-4,C05-7,C05-9,C05-11,C05-12,C05-15,C05-16,C05-17,C05-22,C05-31,
C05-32,C05-34
15
3 C05-21 1
C05

4 C05-35,C05-24 2
1 C06-1,C06-2,C06-4,C06-5,C06-6,C06-8,C06-11,C06-13,C06-14,C06-15,C06-17,C06-19,C06-23 13
2 C06-24,C06-25,C06-26,C06-27 4
3 C06-9,C06-22 2
C06

4 C06-29 1
1 C07-3,C07-7,C07-8,C07-26,C07-29,C07-32,C07-35,C07-38,C07-42,C07-43,C07-44,C07-47,
C07-48,C07-49
14
2 C07-1,C07-2,C07-5,C07-10,C07-12,C07-13,C07-14,C07-15,C07-18,C07-19,C07-21,C07-22,
C07-23,C07-39,C07-46
15
C07

3 C07-4,C07-11,C07-20 3
1 C08-1,C08-3,C08-4,C08-5,C08-6,C08-7,C08-9,C08-11,C08-13,C08-15,C08-20,C08-21,C08-22,
C08-23,C08-25,C08-26,C08-28,C08-31,C08-32,C08-38,C08-39,C08-43,C08-44,C08-45
24
2 C08-8,C08-12,C08-16,C08-27,C08-29,C08-30,C08-35,C08-37,C08-40 9
C08

3 C08-24 1
C09

1 C09-1,C09-3,C09-8,C09-10,C09-13,C09-15,C09-16,C09-19,C09-20,C09-22,C09-23,C09-24,
C09-26,C09-27,C09-28,C09-29,C09-34
17
2 C09-5,C09-11,C09-14,C09-21,C09-31,C09-33,C09-35 7
1702 园 艺 学 报 41 卷
2.2 结球甘蓝特异 InDel 标记在连锁群上的分布
筛选特异标记的标准是:在结球甘蓝上有扩增产物而在大白菜上没有,或者大白菜和结球甘蓝
均有扩增产物,但产物大小存在差异。在 286 个结球甘蓝特异 InDel 标记中(部分结果见图 1),有

图 1 部分连锁群特异 InDel 标记在结球甘蓝和大白菜中的扩增结果
1 ~ 4:甘蓝(11-1、8398、蓝宝、晚丰甘蓝);5 ~ 8:大白菜(85-1、北京新 3 号、新津绿、秋珍白)。
Fig. 1 Amplification results of section linkage group specific InDel markers on varieties of cabbage and Chinese cabbage
1–4:Cabbage(11-1,8398,Lanbao,Wanfeng);5–8:Chinese cabbage(85-1,Beijing Xin 3,Xinjinlü,Qiuzhenbai).
8 期 朱东旭等:结球甘蓝相对于大白菜连锁群特异 InDel 标记的建立及应用 1703

图 2 结球甘蓝 C02 连锁群特异 InDel 标记对
大白菜—结球甘蓝易位系的鉴定结果
1:甘蓝 11-1;2:大白菜 85-1;3 ~ 13:易位系自交后代。
Fig. 2 Identification result of linkage group specific InDel
markers on Chinese cabbage–cabbage translocation lines
1:11-1 cabbage;2:85-1 Chinese cabbage;
3–13:Progeny of selfed translocation line.
10 个标记在结球甘蓝上有扩增产物,而大白菜上无扩增产物,其余均能在结球甘蓝和大白菜间扩增
出清晰的差异片段。286 个 InDel 标记涉及了甘蓝的 9 个连锁群,其中 C01 连锁群 31 个,C02 连锁
群 45 个,C03 连锁群 54 个,C04 连锁群 24 个,C05 连锁群 22 个,C06 连锁群 20 个,C07 连锁群
32 个,C08 连锁群 34 个,C09 连锁群 24 个(表 1)。
2.3 大白菜—结球甘蓝易位系的鉴定
利用筛选出的结球甘蓝 C02 连锁群的 45
个特异 InDel 标记(表 2),以易位系二倍体亲
本‘85-1’大白菜和‘11-1’甘蓝为对照,对
大白菜—结球甘蓝易位系自交后代的 35 株进
行了鉴定。结果表明,仅有 Indel 标记 C02-45
(起始位置 18 551 678 bp)在 6 株中具有结
球甘蓝的特异条带(图 2),在 C02-45 相邻两
侧的特异标记 C02-14(起始位置 18 096 496
bp)和 C02-15(起始位置 18 786 494 bp)中
均未出现结球甘蓝的特异条带。说明该大白菜
—结球甘蓝易位系群体中易位的结球甘蓝片段
位于 InDel 标记 C02-14 和 C02-15 位点之间。



表 2 甘蓝 C02 连锁群特异 InDel 标记
Table 2 Specific InDel markers from C02 linkage groups of cabbage
标记
Marker
片段位置
Fragment
类型
Type
5′引物序列
5′ primer sequence
3′引物序列
3′ primer sequence
C02-2 1148019 缺失 Deletion GACACTTGTTTCTTTCTCGC TGTTTTAACCAGTGTTGCTG
C02-3 2127233 缺失 Deletion ACAAGAAACCATTGGATCAG TGTGATTGGAACTCAGTCAA
C02-4 3944891 缺失 Deletion TCTATCGGTTGGACCTAAAA GACTAGGCAGGAAGCACTAA
C02-5 5387293 插入 Insertion ACGCAATGTAGACAAGAACC TTGGATCCTCTTCTTGATTC
C02-6 6761923 插入 Insertion ATGAGCAAAATAGAAGGCAC CAAATCTCCCACACATTTCT
C02-7 8410397 插入 Insertion ATAAAAGGCCATACAGTCCA ATGTCTAGCCGTGTTGTCTC
C02-8 9259575 插入 Insertion TGATACGCCTCAATACTGGT TGGAATTGCTAAAGTATGGG
C02-9 10672209 插入 Insertion GCACCACTAAAAACTTCCAC GATCCATCACTTGTCGATTT
C02-10 12440349 缺失 Deletion CTCACACACACCAAACACAT GTCATACGGACCTAATCTGAA
C02-12 14909364 缺失 Deletion TGCCGGTAGAGAATAAAGAA CAAAGATAGCACAAAAACCC
C02-13 15574918 缺失 Deletion AGGGATGTTCCCATTCTACT AAGTTGTGTCTCTTTTTGGC
C02-14 18096496 缺失 Deletion GTAATTTAACCGGAAATGGC CTTCCATGCAGAACTCTGTT
C02-15 18786494 缺失 Deletion ACCTAACGTTGTGGATTTGT TATTTCAGTTTCCCGACACA
C02-16 19965249 缺失 Deletion ACATTCCATTTACCTGTTGC GTTTATGCTCGAAGTTGGTC
C02-17 26147801 插入 Insertion GTTCTGAACAAAACAGCTCA GTTCATCTTGCTGATAAGGC
C02-18 32286015 缺失 Deletion TTTCTGGAAGTATTGTGCCT GGGTTGTCGACTATGTTTGT
C02-19 34568194 插入 Insertion TAAATTGTATACCCGAACCG TACTATTTCAAGTGCCCGTT
C02-20 36732119 插入 Insertion GCAACCACCTATTCACTGTT TGAAAGTGTTATACGGGAGG
C02-22 38349354 插入 Insertion AGCAACTCTTACATGACGCT ACCACACTGCTCAGGTAAAT
C02-23 40978471 插入 Insertion GATTTTGTGGTTAGCTTTGG AACACTGTTCAAAATGGGTC
C02-24 42101407 插入 Insertion CAACAACCACTAAATTCACC CCTAATAGAGATCTTTTGCGTG
C02-25 42739836 缺失 Deletion CCGGTTTATAAAACTCCACA AGATTCACATGGTACAAGGG
C02-26 1021048 缺失 Deletion CCTCCTTACGTACCTTCTCC GCTTGCCATGTAAAGTCTCT
C02-27 1222790 插入 Insertion CAATGGTGATGTACGAATGA CTAAGATGGGTCAATGTTCC


1704 园 艺 学 报 41 卷
续表 2
标记
Marker
片段位置
Fragment
类型
Type
5′引物序列
5′ primer sequence
3′引物序列
3′ primer sequence
C02-29 2591815 插入 Insertion GATGGATTGATGGTGAATCT TCACCATTGATGACTGAGAA
C02-30 3592413 缺失 Deletion CATTTGCACTAGATTGCTTG TCATGACGTATACTCTCACATC
C02-32 4848973 缺失 Deletion ATGAATCTAGCCAGAAAGCA AGTACTGGAGCAAGAATCCA
C02-36 8521773 插入 Insertion CCACATTAGATTGAAGTTGC ATATGGCCCTAAATCTTGGT
C02-37 9384098 缺失 Deletion TCGTATACGCTTATTGATGC CACTCAAGCCTTTCTTTTTG
C02-38 10942891 插入 Insertion ACCACAAAGGATCAACACAT TACTGGCTTTTCTTGTTGGT
C02-40 13041996 插入 Insertion AATGACAGAATTATGGTGGG TTTATCTGCACGTTGTCTTG
C02-45 18551678 插入 Insertion TAGAGGTGGAAGAGGTTTGA ACGTATGTCGTTGACAACTC
C02-47 23357664 插入 Insertion GATCTTTGATGCTCGTTTCT TCAGTCATTCTCACCTCTGA
C02-48 24393946 插入 Insertion GCCAACAAGGTGTTAATGAT AAGGGCTAAATAGCTCGAAT
C02-49 25551030 插入 Insertion CTGATGATCCTTTATCAGTGC ATATGGGCCACTAGCTAACA
C02-50 30698830 缺失 Deletion TCGCTTAAAGAGTTACACCC GTTGACCGAATTGGTATACAG
C02-52 33665985 缺失 Deletion ACGCAAAATCATCTGCTTAC ACAATATCCATCGTCGTCTC
C02-53 34369063 插入 Insertion TGTCATGCTCATTTCCTACA TTCACTACCAAACACCAACA
C02-54 36079610 插入 Insertion CACCAGCTTAATCCGAGTAG CAGCAGTGATGAGAACTGG
C02-56 38261588 缺失 Deletion AGCGAATATAGGTGTGGTTG TCAGTCCATTCTCCAAGTCT
C02-57 38956340 缺失 Deletion CTTCAATGTTTCCCAAAGAC GAGTTATGCAAAAAGTTGGC
C02-58 39140362 缺失 Deletion GCTGTTAGAACATAATGGGG TAACGAAGATGAAAGCATCC
C02-59 39384071 插入 Insertion ACCGGTAGTGTCTTCGTAAA GTGAAAACAGCCGTAGAGAC
C02-60 41398318 缺失 Deletion ATCTCAAATCAGGAGGCTTT CCACAATGTCGACTCCTACT
C02-61 41687605 缺失 Deletion ATTAGTCCGTCCTTTTCACC TACCATTACTCGGTCCTGTC
3 讨论
前人研究表明,InDel 标记密度远高于 SSR 标记,如在水稻基因组中平均每 157 kb 有 1 个 SSR
标记(Temnykh et al.,2001;McCouch et al.,2002),平均每 953 bp 就有 1 个 InDel 标记(Shen et al.,
2004)。在芸薹属作物的研究中,基于大白菜 BAC 文库测序的 SSR 分布频率为 364.96 SSRs · Mb-1
(Xu et al.,2010),基于甘蓝全基因组鸟枪测序的 SSR 分布频率为 151.52 SSRs · Mb-1(Li et al.,
2010),而基于大白菜全基因组的 InDel 分布频率为 4 830 InDels · Mb-1(Park et al.,2010)。相对于
SSR 标记,高密度的 InDel 标记提高了易位系中染色体片段精确鉴定的可行性。
已有研究表明,在芸薹属 A 基因组和 C 基因组间 SSR 标记多态性比率偏低。顾爱侠等(2009)
以不同结球甘蓝和大白菜品种为试材,从 91 个 SSR 标记中筛选出 25 个结球甘蓝相对于大白菜的特
异 SSR 标记,多态性比率为 27.47%。Geleta 等(2012)以二倍体白菜、芥蓝及其异附加系为试材,
从 180 个 SSR 标记中筛选出 64 个 A 基因组和 C 基因组间特异标记,多态性比率为 35.56%。本研究
中选用结球甘蓝 C 基因组 9 个连锁群均匀分布的 458 个 InDel 标记,筛选出 286 个结球甘蓝相对于
大白菜的特异 InDel 标记,多态性比率达到 62.45%,InDel 标记多态性明显高于 SSR 标记。多态性
比率较高的原因在于 InDel 标记基于大白菜基因组和结球甘蓝基因组序列差异开发,具有较强的针
对性,有效地解决了因大白菜 A 基因组与结球甘蓝 C 基因组具有较强同源性而难于区分的难题。
本研究中利用筛选出的 45 个结球甘蓝 C02 特异 InDel 标记,对实验室创建的一个大白菜—结球
甘蓝易位系自交后代植株进行了鉴定,明确了外源甘蓝染色体片段的物理位置在 18 096 729 bp ~
18 786 494 bp 之间的 689 764 bp 区域内,可以针对此区域开发新的 InDel 标记,实现对易位片段的
精确鉴定。为了进一步探明甘蓝染色体片段插入大白菜染色体的具体位置,可以利用大白菜 A 基因
组 10 个连锁群上均匀分布的 InDel 标记对该易位系进行分子鉴定,根据 InDel 标记的扩增结果可以
初步确定甘蓝染色体片段在大白菜染色体上的位置。

8 期 朱东旭等:结球甘蓝相对于大白菜连锁群特异 InDel 标记的建立及应用 1705

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