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北京地区侵染大葱的胡葱黄条病毒外壳蛋白基因的克隆与分析



全 文 :园 艺 学 报 2011,38(增刊):2527 http: // www. ahs. ac. cn
Acta Horticulturae Sinica E-mail: yuanyixuebao@126.com

收稿日期:2011–08–01
基金项目:国家自然科学基金项目(31071794);农业部‘948’项目(2011-Z61);北京市常规育种财政专项(2011-509)
* 通信作者(E-mail:wyqty@sohu.com;Tel:010-51503125)
北京地区侵染大葱的胡葱黄条病毒外壳蛋白基
因的克隆与分析
田保华 1,2,王永勤 1,*
(1 北京市农林科学院蔬菜研究中心,北京 100097;2山西大学生命科学学院,太原 030005)
我国是葱的原产地,长期以来品种改良多以产量和品质为主要目标,加之栽培面积的扩大和连
作栽培,葱病毒病发病日趋严重,田间发生率一般为 20% ~ 30%,严重的高达 75%。大葱病毒病已
成为葱高产优质栽培的主要限制因素之一。本研究中对北京地区胡葱黄条病毒 SYSV 病毒进行克隆
和序列分析。
感病大葱植株采自北京市农林科学院蔬菜研究中心试验田。病毒总 RNA 的提取参照试剂盒说
明书进行。根据 GenBank 上已发表的 SYSV 病毒的 CP 基因序列,设计特异性引物,由上海生工合
成。
按照天根公司的 Quant Reverse Transcriptase 合成第一链 cDNA 试剂盒说明书操作。以反转录产
物为模板进行 PCR 反应,取 5 μL 扩增产物用 1.5% 琼脂糖凝胶进行电泳检测。回收目的条带并克
隆测序。
以感染 SYSV 的大葱叶片总 RNA 为模板,利用 SYSV 病毒特异性引物 SY-CP1 和 SY-CP2 进行
RT-PCR 扩增,得到一条特异片段,长度约为 1 kb,而阴性对照无此特异片段。
测序结果显示,目的片段长 1 008 bp。开放阅读框 774 bp,编码 258 个氨基酸,其中 A:267 个,
C:147 个,G:190 个,T:170 个,G + C 含量 43.54%。将开放阅读框序列与 GenBank 中查找来
自不同国家和地区的其他 SYSV 分离物 CP 基因序列进行比较,表明核苷酸序列同源性最高达 96%,
氨基酸序列同源性最高可达 99%。

关键词:大葱;病毒;外壳蛋白基因;序列分析
中图分类号:S 633.1 文献标识码:A 文章编号:0513-353X(2011)S-2527-01