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菜薹荧光微卫星锚定片段长度多态性(MFLP)技术体系的建立



全 文 :园 艺 学 报 2011,38(增刊):2541 http: // www. ahs. ac. cn
Acta Horticulturae Sinica E-mail: yuanyixuebao@126.com

收稿日期:2011–07–20
基金项目:国家自然科学基金项目(30871526);广州市科技支撑项目(2009Z1-E801)
* E-mail:guopg@gzhu.edu.cn;Tel:020-39366911
菜薹荧光微卫星锚定片段长度多态性(MFLP)
技术体系的建立
郭培国 1,*,李荣华 1,张 华 2,郑岩松 2,黄红弟 2,夏岩石 1
(1广州大学生命科学学院,广州 510006;2广州市农业科学研究院,广州 510308)
选用 16个菜薹(菜心)品种作材料,采用 CTAB法提取基因组 DNA,荧光引物M13-F-IRDye
700购自美国 LICOR公司,其序列为 5′-CACGACGTTGTAAAACGAC-3′;SSR锚定引物、加尾 SSR
锚定引物、MseI 接头、预扩增和选择性扩增引物均由上海生物工程有限公司合成,用于 PCR 反应
的 Taq DNA 聚合酶、MseI限制性内切酶、T4 DNA连接酶等试剂购自上海生工生物工程有限公司。
根据 MFLP 的基本原理,调节酶切反应、预扩增和选择性扩增的条件,运用琼脂糖凝胶电泳检测
预扩增效果,利用 LICOR 4300 DNA遗传分析仪进行变性聚丙烯酰胺凝胶电泳检测选择性扩增产
物。
经过多次摸索和探讨,建立了适合于菜薹的荧光MFLP技术体系,主要方法如下。(1)酶切反
应:酶切反应液总体积为 30 μL,包括菜薹 DNA(100 ng · μL-1)3.0 μL,MseI酶(10 U · μL-1)0.6 μL,
10 × 反应缓冲液 3.0 μL,在 37 ℃条件下酶切 2 h,之后在 80 ℃条件下保温 20 min终止反应。(2)
MseI 接头制备:取 MseI接头 1(100 pmol · L-1)和 MseI接头 2(100 pmol · L-1)各 62 μL,混均后
在 95 ℃水浴 5 min,取出后放在操作台上冷却 20 min,作为下步反应的 MseI接头。(3)连接:反
应总体积为 40 μL,包括 MseI酶切产物 30 μL,MseI接头 1 μL,10 × 反应缓冲液 2 μL,T4 DNA连
接酶(5 U · μL-1) 0.2 μL,双蒸水 6.8 μL,在 20 ℃条件下反应 5 h,产物作预扩增模板。(4)预扩
增:反应总体积为 30 μL,含预扩增模板 6 μL,Taq DNA聚合酶(5 U · μL-1)0.45 μL,SSR锚定引
物(10 μmol · L-1)1.5 μL,MseI选择性引物(10 μmol · L-1)1.5 μL,10 × PCR缓冲液 3.6 μL,10 mmol · L-1
dNTP 0.9 μL;PCR反应程序如下:94 ℃预变性 2 min,25个 PCR循环(94 ℃ 30 s,52 ℃ 30 s, 72 ℃
1 min)。(5)选择性扩增:10 μL反应体积,含选择性扩增模板 1 μL,Taq DNA聚合酶(5 U · μL-1)
0.15 μL,加尾 SSR锚定引物(1 μmol · L-1) 0.6 μL,10 × PCR缓冲液 1.2 μL,10 mmol · L-1 dNTP 0.3
μL,M13荧光引物(0.1 μmol · L-1)0.5 μL;选择性扩增的 PCR程序为 94 ℃ 30 s,60 ℃(每个循环
下降 0.7 ℃)30 s,72 ℃ 1 min,循环 9次,再按 94 ℃ 30 s,54 ℃ 30 s,72 ℃ 1 min循环 25次。
按此体系操作 16个菜薹材料预扩增产物在 300 ~ 900 bp区域呈明显的弥散带,表明预扩增效果
好;16个菜薹品种的选择性扩增结果显示MFLP荧光图谱清晰,多态性条带丰富可辨,表明该技术
体系适用于菜薹材料的基因分型。

关键词:菜薹;荧光MFLP;技术体系的建立
中图分类号:S 634.5 文献标识码:A 文章编号:0513-353X(2011)S-2541-01