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Classical and Molecular Genetics of Bacterial Wilt Resistance in Tomato

番茄青枯病抗性遗传研究进展



全 文 :园 艺 学 报 2004,31(3):403~407
Acta Horticulturae Sin/ca
番茄青枯病抗性遗传研究进展
汪国平 林明宝 吴定华
(华南农业大学园艺学院,广州510642)
摘 要:从抗源、抗性经典遗传研究、分子遗传研究等方面对番茄青枯病抗性遗传研究进展进行了综
述,并就存在的问题及未来研究方向进行了讨论。
关键词:番茄;青枯病;抗性遗传
中图分类号:S 641.2 文献标识码:A 文章编号:0513-353X (2004)03-0403-05
Classical and Molecular Genetics of Bacterial Wilt Resistance in Tomato
Wang Guoping,Lin Mingbao,and Wu Dinghua
(College ofHorticulture,South China Agricultural University,Guangzhou 510642,China)
Abstract:Studies on inheritance of resistance to bacterial wilt caused by Ralstonia solanaceanum in
tomato were reviewed under the folowing headings:1)Germplasm sources of resistance;2)Classical genetics
of resistance;3)Molecular genetics of resistance;4)Discussions.
Key words:Tomato(Lycopersicon esculentum);Ralstonia solanaceanum;Resistance genetics
番茄青枯病由Ralstonia solanacearum (Smith 1 896)comb.Nov.(原命名为Pseudomonas solanacearum
E.F.Smith )引起,在世界各地均有发生,热带、亚热带地区更为严重 ,我国长江以南尤其是
华南地区发生较为普遍,造成巨大损失 。该病为土传病害,寄主范围广,病原变异大,给防治造
成严重困难。抗病育种是防病的最有效途径,而抗病遗传研究可为育种提供直接指导。本文就番茄青
枯病抗性遗传研究进展进行综述。
1 抗源
目前番茄青枯病的抗性材料主要有3个来源:(1)Lycopersicon pimpinelifolium PI127805A,最早
由美国夏威夷大学鉴定,是 ‘Kewalo¨ 、‘Hawai 7996’、‘Hawai 7997’、‘Hawai 7998¨ 的抗性
来源;(2)L.esculentum var.cer~ orlTte CRA66,最早由法国国家农业研究所 (INRA)鉴定,是
‘Caraibo’、‘Caravel’的抗性来源 。 ;(3)L.pimpinelifolium PI129080和Behsvile#3814,是北卡
罗来纳抗性系的来源,从该系统衍生出 ‘Venus’、‘Saturn¨ 、‘BW2’、‘BW4¨ ;从 ‘BW2’和
‘Roma VF’衍生出 ‘Rodade¨ ,从 ‘BW4’得到 ‘Rotam4¨ 。
上述3类抗源对欧、美的优势菌系小种1生化变种 1lJ叫及亚洲的优势菌系小种1生化变种 3¨I. J
都具有较高抗性,但抗性会随温度升高而降低,甚至完全丧失。源于PI127805A的抗性在高温湿热条
件下表现最不稳定,如 ‘Kewalo’在气温高于27~C时抗性会丧失 ],这也是亚洲蔬菜研究发展中心
培育抗病、耐湿热番茄材料时该类抗源未被广泛利用的原因 ¨。但也有研究表明存在一类不依赖于
温度的抗性,如在其它材料抗性随温度升高而降低时,由 ‘Venus’×CA-64—1169而来的VC-48却始
终维持稳定的中等抗性 ;气温高于40℃时,‘Venus’、‘Saturn’及 ‘Kewalo’都表现为感病,但
‘Rodade’仍具有较高的抗性 ],其可能原因是VC-48及 ‘Rodade’含有其它材料提供的与抗性在高
温条件下表达有关的基因。
收稿日期:2003—06—02;修回日期:2003—10—21
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园 艺 学 报 3l卷
此外,还发现其它一些抗源,如L.esculentum var.ceFasiforDze LA1421¨ 、L285 ,L.esculen—
tum PI263722、PI126408、PI196298及L.pimpinelifolium PI251323¨ ,已鉴定L285对小种 1生化变
种3、4[ ],PI126408对生化变种 1、3具有抗性 J ,其它材料对生化变种 1具有抗性 ,对其
它菌系类型的鉴定未见报道。到目前为止,所有这些抗源还未在育种中利用。
L.esculentum AS52是我国鉴定得到的新材料,其最初的抗性来源不明,但含有与我国现有品种
中抗病基因不同的新基因,对广东出现的青枯菌强致病力变异株系具有很强的抗性~1 。
2 抗性经典遗传学研究
Singh早于1961年开始抗性遗传研究,而Acosta最早正式报道研究结果 引,此后报道逐渐增多。
已报道的研究结果差异较大,抗性遗传规律有隐性 ¨· 、不完全显性 ¨ 或显性 等多种观点,
控制抗性的基因数目有单基因~20.24,25 3、寡基因 卫 及多基因 博 的报道,基因间的相互作用除
显性效应外,还存在加性效应及上位性效应,各种效应的大小也不同 ¨ 。 。导致差异的原因可以
归结为两类,一是许多客观因素 (如抗源、菌系、土壤微生物的交互作用、环境因子等)影响寄主
的抗性表现。例如,我国北方比南方较少有青枯病危害,而南方同一地点不同年份间发病程度也不一
样 ;广东省优势菌系为小种1生化变种3,其致病型分化复杂 ⋯,强致病力株系ZC一1对广东省主
要栽培的抗青枯病番茄品种都有致病性 。因此抗性遗传分析一定要具体联系抗源、菌系及鉴定地
的环境条件。另外,许多人为因素 (如接种方法、鉴定时期、评价标准及数据处理方式等)也影响
最后的分析结果。高抗材料 ‘Hawai 7997’、‘Hawaii 7998’、‘CRA66’用病圃鉴定时表现为高抗,
但用刺茎法接种表现为感病 10 3。Acosta的研究表明 ,不同生长阶段抗性遗传表现不同,用植株移
人病圃后7周的存活数据分析,抗性为部分显性,而用8~17周的数据分析却表现为多基因隐性。乐
素菊 与邓铭光 ¨在相同地区、用相似方法对抗性进行遗传分析,前者认为抗病为不完全显性,后
者认为感病为不完全显性,结果不同的原因可能主要与数据处理方式不同有关。
经典遗传分析的方法有两种,一种是双亲本多世代方法 ¨’ ’弱 ,可以分析单一抗源的抗性
遗传规律,如源于PI127805A的抗性可能由显性单基因 、不完全显性 或隐性多基因控制 ¨引,
北卡罗来纳系抗性由隐性多基因E18)或2个互作的显性基因控制 ,LA1421的抗性由多基因控制,具重
复隐性上位表现 ¨。另一种是多亲本双列杂交分析 “ 。 引,可以估计抗性基因的数目、基因间的
互作效应、遗传力及配合力。估计的基因数目有1、2、3、5对等不同结果;大多数结果支持基因作用
以加性效应为主 。 ,但也有结果表明以非加性效应为主 ¨矧 ,抗性遗传力较高 ¨ 。
许多材料在不同国家 (地区)都表现出较高的抗病性,说明这些材料中存在共同的抗性基因或
存在主效抗病基因。由于有些抗性表现为隐性,因而育种中需要双亲都具有抗性,但对于综合不同来
源的抗性基因所产生的效应,不同研究者结果不同,Mohamed认为会提高后代的抗性 ¨,Hanson认
为抗性不能得到提高,杂种的抗性不能超过高值亲本 。
目前大多数的研究结果支持抗性由多基因控制,这预示着可能存在不同的抗性机理,但有关抗病
机理的遗传研究不多。Grimault通过对抗、感材料组织解剖发现,抗病材料茎内细菌少 ,材料抗
性越强,茎内细菌繁殖越受到限制 ,这一性状在 ‘Hawai 7996’内是由单显性基因控制 。乐素
菊也证实抗、感材料组织解剖结构存在差异 。
用经典遗传学方法还进行了主效抗病基因的初步定位。早在 1956年McGuire发现难于将番茄根
结线虫抗性 ( 基因控制)和青枯病抗性综合到一起,依据 位于第6染色体而推测至少一个或多
个与青枯病抗性有关的基因位于第6染色体并在 基因位点附近 。后来的研究证实了这一推测,
将 基因导人 ‘Caraibo’及 ‘CRA66’,其后代的青枯病抗性明显下降 ,说明两基因位置非常近
或彼此互为等位基因[38 3;Acosta等 引¨通过青枯病抗性与sp+基因连锁分析,也证明抗性基因位于第
6染色.体。
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3 抗性的分子遗传研究进展
分子标记技术的发展使番茄青枯病抗性基因的精确定位成为可能,特别是 1992年Tanksley等 9J
发表的番茄高密度分子连锁图成为番茄分子标记研究的基石。到目前为止,对两套材料发展的群体应
用RFLP、AFLP、RAPD标记技术已鉴别出多个青枯病抗性QTL。这两套材料经多代自交已发展了各
自的永久群体——重组近交系 (recombinant inbred lines,RILs),使得抗性鉴定可以用永久群体重复
进行,不同条件下鉴定的结果可比性更强;由于RILs各株系的分子数据 (特别是稳定性好的RFLP标
记)可以累积并共享,因而在不同地区只要鉴定各株系的抗性再进行共分离分析,就可明确哪些 QTL
座位在起作用,而不需要再进行分子检测;此外,利用 RILs还有助于应用新标记对抗性位点加密。
第一个群体是由番茄 L285(R)×CLN286(S)发展而来。Danesh等 ¨ 对该组合的F 、F 群
体进行分析,在第6、7、10染色体上各发现 1个抗性 QTL。第 6染色体上的位点离 CT184标记40
cM,控制对小种1生化变种4的抗性,具有菌株特异性;第10染色体上的位点则对生化变种3、4都
表现抗性;伤根接种时,第6、10染色体上的位点表现抗病作用,刺茎法接种时,第6、7、10染色
体上的位点都起作用。Carlos等 用泰国株系对该组合的 1 12个RILs分析,发现第2染色体上的标
记TG48与抗性紧密连锁。
第二套材料是由 ‘Hawai 7996’(R)×Wva700(S)发展而来。Thoquet等 对该组合的F,、
F 群体的分析发现了7个QTL,分别位于第3、4(2个 QTL)、6、8、10及 1 1染色体,第 10染色体
上的QTL位于下端,其位置不同于Danesh等的结果 (位于上部),染色体 1 1上的QTL对无性繁殖2
年的F 群体有特异性,在 F 不表现。鉴于第6染色体上的QTL峰较宽,Mangin等 用时序分析
(temporal analysis)及双 QTL模型 (two·QTL mode1)统计分析将该QTL进一步细分为2个:一个与
Danesh等在L285上发现的第6染色体上位点相同,与此相距约30 cM存在另一位点,接近叶霉病抗
性基因Cf-2。相同的F 、F 群体在台湾 用小种 1生化变种3接种,结果证明除第6染色体上的强
QTL及第8染色体上的弱QTL外,还在第 12染色体上发现一个效应较大的新 QTL;时序分析表明3
个位点的作用有一定的先后顺序,接种后7 d染色体 12上的QTL就开始发挥明显作用,14 d时达到
高峰;而14 d时第6染色体上的QTL作用才刚明显可见,其作用一直维持到试验结束,而染色体8
上的QTL作用在14 d时达到高峰,但到试验结束时作用明显减小。Balatero等 引用小种 1生化变种3
对该组合的189个 RILs(F )接种,发现与抗性连锁的7个AFLP标记、1个 RGA (resistance gene
analog)标记集中分布于至少两个区域,AFLP标记 afO2b/af02c与抗性连锁非常紧密,同时还发现另
外3个株系特异性位点。
有的研究者用其它群体也进行了抗性标记研究,Yui等 舶 对一个以 ‘Hawai 7998’做抗性亲本的
F,群体进行RAPD分析,找到标记A 12·13(450 bp)及A 12-29(1600 bp)与抗性基因紧密连锁。
从分子标记分析得到的结果来看,第6染色体上的一个抗性QTL表现稳定,作用明显,具有广
谱性,在多数试验中都能检测到,其它的QTL是特异性的,只在某一条件下才表达,表达的强弱也
不一致;此外,各QTL不是同时起作用,而是有时序性的,这些结果从分子水平说明了寄主抗病机
理的复杂性。
4 问题与展望
番茄一青枯菌系统相当复杂,目前病菌的致病机制及寄主的抗病机制都未十分明确。经典遗传研
究表明不同地区寄主的抗性表现不同,因此,要应用当地的抗性遗传分析结果来指导育种,引进的抗
性材料需要在当地进行重新鉴定及分析。20世纪90年代中,亚洲蔬菜研究发展中心组织了东南亚区
域 (包括台湾、菲律宾、印度尼西亚、马来西亚、泰国)的国际协作,对目前育种中应用的抗源及
许多高代抗性系进行了鉴定,以明确各抗源的适用范围 (Jaw.Fen Wang,个人通讯),研究结果表明
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园 艺 学 报 31卷
抗源在不同地区的表现差异很大 。我国所有的抗源材料都从国外或亚洲蔬菜研究发展中心引进,
这些材料在我国南方番茄抗病育种中发挥了巨大作用 。但是,我国幅员辽阔,土壤及气候条件
差异很大,青枯菌菌系分化复杂,因而有必要借鉴他人经验,组织全国的协作鉴定,公开系谱资料,
规范鉴定方法,探明各类抗源在我国不同地区的抗性表现及适用区域范围,以利于更好地指导育种实
践。
目前青枯病分子遗传研究应用的标记多是 RFLP、AFLP、RAPD标记,在所应用的分析群体中,
这些标记都没有均匀覆盖整个基因组,其原因是番茄的遗传基础狭窄 ,亲本间的多态性标记少。
可以推测,应用亲缘关系较远的组合或应用新类型标记 (如能在更高水平上揭示多态性的SNP标
记),将可能会在目前的空白区段发现新的抗性位点。
抗性分子遗传的研究已证实在多条染色体上存在抗性位点,并已找到相应的分子标记,这为分子
标记辅助选择 (MAS)打下了基础,今后的一个方向将是研究各个位点的具体功能,进行不同效应
基因的聚合育种。但由于RFLP、AFLP标记应用技术复杂、成本高,而RAPD标记结果不稳定,这些
标记都较难于在育种中大规模利用,为实用起见需要将找到的连锁标记转换成以PCR为基础的标记
(如SCAR、STS标记)。SSR标记能克服上述标记的不足,已有人开始应用 ,但还未找到与抗性紧
密连锁的SSR标记,其原因是 SSR标记开发成本较高,目前发展的SSR标记数量不多,在全基因组
上分布也不均匀 ]。番茄核苷酸数据库序列数目的快速增加,特别是即将启动的番茄全基因组测序,
将极大地促进应用生物信息学方法发展高密度位置特异性 SSR标记及SNP标记,抗性位点的分子检
测将更精确、方便、快速,使MAS的实际应用成为可能,并为各个抗性QTL的最终克隆打下基础。
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