全 文 :植物科学学报 2014ꎬ 32(6): 612~619
Plant Science Journal
DOI:10 11913 / PSJ 2095-0837 2014 60612
漾濞大泡核桃病程相关蛋白 10基因
JsPR10 ̄1的克隆与表达分析
何 华ꎬ 陈朝银ꎬ 韩 青ꎬ 张南南ꎬ 葛 锋ꎬ 刘迪秋∗
(昆明理工大学生命科学与技术学院ꎬ 昆明 650500)
摘 要: 病程相关蛋白(pathogenesis ̄related proteinꎬ PR) 10的激活与积累在植物抗逆境胁迫中有非常重要的
作用ꎮ 根据漾濞大泡核桃(Juglans sigillata)编码 PR10的 EST (expressed sequence tag)序列设计引物ꎬ 利用
快速扩增 cDNA末端技术ꎬ 克隆得到 PR10基因的全长 cDNA序列ꎬ 并命名为 JsPR10 ̄1ꎮ JsPR10 ̄1全长 cDNA
为 776 bpꎬ 含有 483 bp的开放阅读框、 74 bp 5′ ̄非编码区以及 219 bp 3′ ̄非编码区ꎬ 编码含有 160个氨基酸的
蛋白质ꎮ 全长基因序列中含有 1个 124 bp的内含子ꎮ JsPR10 ̄1编码的蛋白质与栎树(Quercus suber)、 欧洲山
毛榉(Fagus sylvatica)以及欧洲板栗(Castanea sativa)的 PR10相似性较高ꎬ 并且在 PR10的系统进化树中与双
子叶植物聚为一支ꎮ qRT ̄PCR分析结果表明ꎬ 植物信号分子水杨酸、 茉莉酸、 乙烯以及过氧化氢处理均可诱导
JsPR10 ̄1表达ꎮ 在接种胶孢炭疽菌(Colletotrichum gloeosporioides)后ꎬ JsPR10 ̄1的表达量迅速上升并在接种
8 h时达到最大值ꎬ 表明 JsPR10 ̄1参与漾濞大泡核桃对胶孢炭疽菌的防卫反应ꎮ 本研究为揭示漾濞大泡核桃抗
性机制奠定了理论依据ꎮ
关键词: 漾濞大泡核桃ꎻ 病程相关蛋白 10ꎻ 基因克隆ꎻ 胶孢炭疽菌ꎻ 防卫反应
中图分类号: Q78 文献标识码: A 文章编号: 2095 ̄0837(2014)06 ̄0612 ̄08
收稿日期: 2014 ̄03 ̄25ꎬ 退修日期: 2014 ̄05 ̄13ꎮ
基金项目: 国家科技部科技支撑计划项目(2011BAD46B00)ꎮ
作者简介: 何华(1989-)ꎬ 女ꎬ 硕士研究生ꎬ 研究方向为植物分子生物学(E ̄mail: keke0512@163 com)ꎮ
∗通讯作者(Author for correspondence E ̄mail: diqiuliu@126 com)ꎮ
Cloning and Expression Analysis of a Pathogenesis ̄related
Protein 10 Gene from Juglans sigillata
HE Huaꎬ CHEN Chao ̄Yinꎬ HAN Qingꎬ ZHANG Nan ̄Nanꎬ GE Fengꎬ LIU Di ̄Qiu∗
(Faculty of Life Science and Technologyꎬ Kunming University of Science and Technologyꎬ Kunming 650500ꎬ China)
Abstract: The activation and accumulation of pathogenesis ̄related protein ( PR ) 10 play
predominant roles in the defense response against pathogens. Based on a Juglans sigillata
expressed sequence tag (EST) encoding PR10ꎬ gene ̄specific primers were designed and
used to amplify the full ̄length cDNA of a novel PR10 gene by rapid amplification of cDNA ends
(RACE) . This gene was named as JsPR10 ̄1. JsPR10 ̄1 was 776 bp in length with an open
reading frame (ORF) of 483 bpꎬ a 5′ ̄untranslated region (UTR) of 74 bpꎬ and a 3′ ̄UTR of
219 bpꎬ and the ORF encoded a protein with 160 amino acid residues. There was an intron of
124 bp in the genomic sequence of JsPR10 ̄1. Homology analysis indicated that JsPR10 ̄1 was
homologous with PR10s from Quercus suberꎬ Fagus sylvatica and Castanea sativaꎻ
moreoverꎬ JsPR10 ̄1 clustered together with the PR10s from dicots in the phylogenetic tree.
qRT ̄PCR analysis showed that the expression levels of JsPR10 ̄1 were induced by four
different plant signaling moleculesꎬ including salicylic acidꎬ jasmonic acidꎬ ethyleneꎬ and
H2O2 . In additionꎬ after inoculation with Colletotrichum gloeosporioidesꎬ JsPR10 ̄1 was sharply
up ̄regulated with the highest expression level at 8 h. The JsPR10 ̄1 gene was involved in the
defense response against C. gloeosporioides. This experiment lays a theoretical foundation for
revealing the mechanism of resistance in J. sigillata.
Key words: Juglans sigillataꎻ Pathogenesis ̄related protein 10ꎻ Gene cloningꎻ Colletotrichum
gloeosporioidesꎻ Defense response
植物在生长发育过程中常遭受多种生物和非生
物因子的胁迫ꎬ 如干旱、 寒冷、 真菌侵染等ꎬ 因此
进化出一系列的防御机制来抵御逆境胁迫ꎬ 其中病
程相关蛋白 (pathogenesis ̄related proteinꎬ PR)
的激活和积累是植物参与防御反应的重要组成部
分[1]ꎮ 根据其亲缘关系、 生物活性和结构的不同
将 PR蛋白分为 17个家族(PR1~ PR17) [2]ꎮ 大多
数 PR蛋白为胞外蛋白ꎬ 而 PR10 蛋白是典型的胞
内蛋白ꎬ 广泛存在于细胞溶质中ꎮ 另外ꎬ PR10 还
具有分子量较低(16~19 kD)、 等电点偏酸性以及
三级结构高度保守等特性[3]ꎮ PR10 与主要的树木
花粉过敏原和食物过敏原十分相似ꎬ 并且属于 Bet
v 1 ̄like超家族[4]ꎮ 其二级结构中存在一个高度保
守的氨基酸序列 GXGGXG (X为任意氨基酸)ꎬ 被
称为“P ̄loop”基序ꎮ 该基序广泛存在于核酸结合
蛋白中ꎬ 并且其磷酸化可能与 PR10 的核糖核酸酶
活性有关[5]ꎮ
PR10蛋白广泛存在于高等植物中ꎬ 当遭受细
菌、 真菌和病毒侵染时ꎬ 一些 PR10 基因的表达量
显著增高ꎮ Pseudomonas syringae 侵染可以诱导
葡萄(Vitis vinifera) VvPR10 ̄1的表达[6]ꎻ TMV 侵
染辣椒(Capsicum annuum)增加了 CaPR ̄10的表
达量[7]ꎮ PR10 基因也对干旱[8]、 物理损伤[9]、
UV射线[10]等非生物胁迫产生应答ꎮ 机械损伤和
Cronartium ribicola 侵染均可使松树(Pinus monti ̄
cola) PmPR10 上调表达[11]ꎮ 另外ꎬ 植物激素和
信号分子也可以使一些 PR10 基因上调表达ꎬ 例如
茉莉酸 ( jasmonic acidꎬ JA)、 水杨酸 ( salicylic
acidꎬ SA)、 过氧化氢(H2O2 )、 乙烯( ethyleneꎬ
ET)、 赤霉素(gibberellic acidꎬ GA3)等[12]ꎮ 研究
表明一些植物 PR10具有核糖核酸酶活性ꎬ 如 Park
等[7]研究发现辣椒 CaPR ̄10 的核糖核酸酶活性在
抗病毒侵染过程中起重要作用ꎮ 另外ꎬ 有研究证实
羽扇豆(Lupinus luteus)LaPR ̄10 在体外具有核糖
核酸酶活性[5]ꎮ 然而ꎬ 植物 PR10的生物学活性及
其参与防卫反应的分子机理有待深入研究ꎮ
核桃是中国主要的干果和木本油料植物ꎬ 近年
来ꎬ 随着核桃种植规模的扩大ꎬ 病害有逐渐上升的
趋势ꎮ 其中由病原真菌胶孢炭疽菌(Colletotrichum
gloeosporioides)引起的炭疽病是危害核桃的主要
病害之一ꎬ 该病潜伏期长、 发病时间短、 爆发性极
强ꎬ 被侵染的果皮变黑腐烂ꎬ 极易引起早期落果ꎬ
核仁干瘪ꎬ 严重影响产量与质量[13ꎬ14]ꎮ 目前ꎬ 从
核桃中分离真菌病害抗性基因的相关研究报道较
少ꎮ 漾濞大泡核桃(Juglans sigillata)是云南本地
主要的核桃之一ꎬ 具有果大、 壳薄、 仁厚、 味香、
含油率高等优点[15]ꎮ 本实验室在前期研究中发现
漾濞大泡核桃对胶孢炭疽菌具有较强的抗性ꎬ 因此
对胶孢炭疽菌接种后的漾濞大泡核桃叶片进行了转
录组测序(数据未发表)ꎮ 我们在对漾濞大泡核桃
受胶孢炭疽菌侵染过程的表达谱分析中发现有几个
PR10的 EST (expressed sequence tag)表达量明
显增高ꎬ 为了深入研究 PR10基因参与漾濞大泡核
桃对胶孢炭疽菌的防卫反应机制ꎬ 本实验选择其中
一个 PR10基因进行全长 cDNA的克隆和表达特性
分析ꎬ 以期为漾濞大泡核桃对胶孢炭疽菌的抗性机
制提供理论基础ꎮ
1 材料与方法
1 1 实验材料
漾濞大泡核桃( Juglans sigillata)苗购自大理
漾濞果艺核桃有限公司(该植株是以铁核桃 J. sigl ̄
lata为砧木的嫁接苗)ꎬ 栽种于昆明理工大学的温
室中培养ꎮ 选取温室中生长良好、 有大量新生萌发
叶的漾濞大泡核桃植株(株高 80~100 cm)作为实
验材料ꎮ 实验所用胶孢炭疽菌菌株由本实验室分
离、 鉴定并保存ꎮ
1 2 实验方法
1 2 1 样品处理
首先在植株大小和长势一致的漾濞大泡核桃嫩
316 第 6期 何 华等: 漾濞大泡核桃病程相关蛋白 10基因 JsPR10 ̄1的克隆与表达分析
叶上进行受伤处理ꎬ 即用砂纸磨去蜡质层ꎬ 处理面
积约 1 cm2ꎻ 再用打孔器取大小一致且生长良好的
新鲜胶孢炭疽菌菌丝附于伤口处ꎬ 用保鲜膜将处理
的叶片包好保湿ꎻ 对照组叶片只进行受伤处理ꎮ 然
后采集接种 2、 4、 8、 24、 48、 72 h 的叶片ꎬ 同
时采集相应时间段的对照叶片ꎮ 此外ꎬ 分别用
5 mmol / L SA、 100 μmol / L JA、 1 mmol / L ET 和
1 mmol / L H2O2四种逆境胁迫相关信号分子处理漾
濞大泡核桃叶片ꎬ 处理方法与胶孢炭疽菌接种处理
方法相同ꎬ 然后分别收集处理 6、 12、 24、 48 h
的叶片ꎬ 同时采集相应时间段的对照叶片ꎮ
所有处理均对 3个单株进行平行处理ꎮ 收集的
样品经液氮速冻后于-80℃保存ꎬ 备用ꎮ
1 2 2 RNA提取及 mRNA分离
将从 3个单株上采集的同一处理时间段的叶片
等量混合ꎬ 采用改良的异硫氰酸胍法[16]提取各处
理时间段样品的总 RNAꎮ 取适量胶孢炭疽菌接种
2、 4、 8、 24、 48、 72 h时的漾濞大泡核桃叶片分
别提取总 RNAꎬ 再从各 RNA 样品中取等量混合ꎬ
按照 NucleoTrap® mRNA Midi Kit (Macherey ̄
Nagelꎬ Germany)说明书分离 mRNAꎬ 并以分离
的 mRNA 逆转录合成 RACE ( rapid amplification
of cDNA ends)模板(Clontechꎬ USA)ꎮ
1 2 3 5′ ̄RACE和 3′ ̄RACE
根据本实验室转录组测序得到的漾濞大泡核桃
PR10 EST序列ꎬ设计 5′ ̄RACE 和 3′ ̄RACE 基因特
异引物ꎮ 5′ ̄RACE的基因特异引物为: 5′ ̄ACGTCT ̄
TCTTCCTTGATCTCGTGGTCG ̄3′ꎻ 3′ ̄RACE的基因
特异引物为: 5′ ̄CAAAGGTTGTACCTCAGGCAGT ̄
CAAGAG ̄3′ꎮ RACE ̄PCR 产物经 TA 克隆连接到
pMD18 ̄T (TaKaRaꎬ Japan)载体上ꎬ 再将连接产
物转化到大肠杆菌 DH5α 感受态细胞中ꎬ 挑选阳
性克隆测序ꎮ
1 2 4 DNA提取及基因组序列的克隆
采集温室中生长健壮植株的漾濞大泡核桃嫩
叶ꎬ 采用改良的 CTAB 法[17] 提取叶片基因组
DNAꎮ 以基因组 DNA 为模板ꎬ 用扩增全长开放阅
读框(ORF)的特异性引物进行基因组序列扩增ꎬ
扩增产物经 TA克隆ꎬ 转化至大肠杆菌 DH5α 感受
态细胞中ꎬ 然后挑选阳性克隆测序ꎮ
1 2 5 全长 ORF的克隆及生物信息学分析
使用在线分析软件 NCBI (http: / / www.ncbi.
nlm.nih.gov / )中的“bl2seq”对 3′ ̄RACE 扩增序
列、 5′ ̄RACE 扩增序列与 PR10 EST 序列进行拼
接ꎬ 并利用 NCBI中的“ORF finder”查找拼接得
到的全长 cDNA 序列中最大的开放阅读框ꎮ 根
据全长 cDNA 序列设计扩增全长 ORF 的特异引
物并对全长 ORF 进行 PCR 扩增与 TA 克隆后送
上海生工进行测序ꎮ 扩增全长 ORF 的上、下游
引物为: 5′ ̄ACTCCTTTTCCTTTTACCACTTCCA ̄
3′ꎻ 5′ ̄AACAACTCGCAGGGTCGCAGA ̄3′ꎮ 使用在
线软件 NCBI的 BLAST 对得到的基因和蛋白质序
列的同源性进行分析ꎮ 多重序列比对和聚类分析用
MEGA3软件完成ꎮ PR10 信号肽序列预测用 Sig ̄
nalP 4 1 ( http: / / www. cbs. dtu. dk / services / Sig ̄
nalP / )完成ꎮ 利用在线分析软件 ProtParam ( ht ̄
tp: / / www.au. expasy. org / tools / protpatam. html)
对 PR10 的理化性质进行预测ꎮ 借助 PredictPro ̄
tein ( http: / / www predictprotein org / )分析蛋白
质的二级结构并预测其亚细胞定位ꎮ 使用
ESyPred3D(http: / / www fundp ac.be / sciences /
biologie / urbm / bioinfo / esypred / )分析蛋白质的三
维结构ꎮ
1 2 6 qRT ̄PCR
采用 qRT ̄PCR 分析 PR10 基因在漾濞大泡核
桃经胶孢炭疽菌接种后以及 SA、 JA、 ET、 H2O2
四种信号分子处理后不同时间段的表达水平ꎮ 将从
3个单株上采集的同一时间段的叶片等量混合ꎬ 然
后提取总 RNAꎬ 经逆转录产生 cDNA 模板ꎻ 以漾
濞大泡核桃组蛋白 3 基因(JsHis3ꎬ KJ196384)作
为内参基因ꎮ 漾濞大泡核桃 PR10 基因的特异引物
序列为: 5′ ̄AAGGTTGTACCTCAGGCAGTCAA ̄3′ꎻ
5′ ̄TCATGGGATGCCACTATCTTCG ̄3′ꎮ 内参基因
JsHis3 的特异引物序列分别为: 5′ ̄GATCGCA ̄
CAGAGGTTGGTGTC ̄3′ꎻ 5′ ̄CGTCCGTGAAATT ̄
GCACAAGA ̄3′ꎮ qRT ̄PCR 反 应 条 件 为: 95℃
2 minꎻ 以下反应 40 个循环ꎬ 95℃ 15 sꎬ 60℃
1 minꎮ 每个 qRT ̄PCR 反应均设 3 次重复ꎬ 以正
常生长的漾濞大泡核桃叶片中 PR10 的表达量为对
照ꎬ 采用 2-△△CT法计算 PR10 在其它样品中的相对
416 植 物 科 学 学 报 第 32卷
表达量ꎮ 正常生长的漾濞大泡核桃叶片中 PR10 的
表达量与各处理后的叶片中 PR10 表达量之间采用
t检验进行差异显著性分析ꎮ
2 结果与分析
2 1 漾濞大泡核桃 JsPR10 ̄1 全长 cDNA 以及基
因组序列的克隆
根据转录组测序已得到的漾濞大泡核桃 PR10
的 EST 序列(数据未发表)ꎬ 通过 5′ ̄RACE 及 3′ ̄
RACE扩增获得了 EST 的全长 cDNA 序列ꎮ RACE
扩增结果显示(图 1: a)ꎬ 5′ ̄RACE产物约 474 bpꎬ
3′ ̄RACE产物约 608 bpꎮ 经过序列拼接获得该
PR10的全长 cDNAꎬ 序列长 776 bpꎬ 其中包括一
个 483 bp 的 ORF、 74 bp 的 5′ ̄非翻译区 ( un ̄
translated regionꎬ UTR)以及 219 bp 的 3′ ̄UTRꎬ
ORF编码一个含有 160 个氨基酸的蛋白质ꎮ 根据
拼接后得到的全长 cDNA 序列设计特异引物ꎬ 成
功扩增出全长 ORF以及基因组序列(图 1: b)ꎬ 其
M 1 2 M 3 4
bp bp
750
500
750
500
a b
M: DL2000标记ꎻ 1: 5′RACE 扩增产物ꎻ 2: 3′RACE 扩增产物ꎻ
3: JsPR10 ̄1基因组序列的扩增产物ꎻ 4: JsPR10 ̄1基因全长 ORF
的扩增产物ꎮ
M: DL2000 markerꎻ 1: Amplification product of 5′ RACEꎻ
2: Amplification product of 3′RACEꎻ 3: Amplification product of
genomic sequenceꎻ 4: Amplification product of ORF.
图 1 JsPR10 ̄1基因的 RACE扩增产物(a)、 全长
ORF 以及基因组序列的扩增产物(b)
Fig 1 Amplification results of RACEs (a)ꎬ full ̄
length ORFꎬ and genomic sequence of JsPR10 ̄1 (b)
中基因组序列中存在 1 个 124 bp 的内含子ꎬ 位于
编码精氨酸的 AGG 密码子内ꎬ 属于 GU ̄AG 型内
含子(图 2)ꎮ 后续的生物信息学分析表明所克隆的
cDNA序列编码 PR10蛋白ꎬ 因此将此基因命名为
JsPR10 ̄1ꎬ GenBank登录号为 KJ598787ꎮ
2 2 生物信息学分析
2 2 1 序列同源性分析、 多重序列比对及进化树
构建
BLASTn分析结果显示ꎬ 漾濞大泡核桃 JsPR10 ̄1
GU
Intron (124 bp)
AG
AGG5UTR (74 bp) 3UTR (219 bp)
74 bp AUG
ORF (483 bp)
UAA
图 2 JsPR10 ̄1的基因结构
Fig 2 Gene structure of JsPR10 ̄1
的第 82~259位核苷酸序列与桦树 PR ̄10 ̄02 (Be ̄
tula nigraꎬ EU5261881)的第 1~178位核苷酸序列
具有 83%的相似性ꎮ 蛋白质同源性分析表明
JsPR10 ̄1编码的蛋白质序列与栎树 Bet v 1过敏原
(Quercus suberꎬ AFF596891)、 欧洲山毛榉 PR1
(Fagus sylvaticaꎬ CAA102351) 以及欧洲板栗
ypr10 (Castanea sativaꎬ CAD103741)高度同源ꎬ
相似性分别为 83%、 79%和 77%ꎮ 将 JsPR10 ̄1 与
上述 3 个 PR10 蛋白以及苹果(Malus domestica)
Mal d 1 (CAA96535 1)进行多重序列比对ꎬ 结果
发现这 5 个 PR10 均有一个高度保守的 GXGGXG
(X 为任意氨基酸)基序ꎬ 称为 “P ̄loop” (图 3)ꎬ
另外ꎬ 还发现 E97、 E149 和 Y151 这 3 个保守的
氨基酸残基存在于每个 PR10中(图 3)ꎮ
聚类分析选取了来自不同物种的 14 个 PR10
与漾濞大泡核桃 JsPR10 ̄1构建 PR10系统进化树ꎮ
聚类结果显示(图 4)ꎬ 15 个 PR10 聚为 2 大支ꎮ
进化树下端的一支由单子叶植物麝香百合(Lilium
longiflorum)、 芦笋(Asparagus officinalis)、 水稻
(Oryza sativa)和高粱(Sorghum bicolor)的 PR10
组成ꎬ 其中水稻和高粱的 PR10 位于进化树的底
端ꎮ 双子叶植物欧洲山毛榉、 欧洲板栗、 栎树、 苹
果、 欧洲榛 (Corylus avellana)、 桦树、 羽扇豆、
紫花苜蓿 (Medicago sativa)、 黄果茄 (Solanum
surattense)、 辣椒的 PR10 与 JsPR10 ̄1聚为另一
大支ꎮ 其中欧洲山毛榉、 欧洲板栗、 栎树以及漾濞
大泡核桃的 PR10位于进化树的顶端ꎬ 再次证明它
们之间存在很高的同源性ꎮ
2 2 2 JsPR10 ̄1 编码蛋白质的理化性质预测、
信号肽及潜在修饰位点分析
JsPR10 ̄1分子量约为 17 53 kDꎬ 等电点约为
5 51ꎮ该蛋白在酵母和大肠杆菌中的半衰期分别大
516 第 6期 何 华等: 漾濞大泡核桃病程相关蛋白 10基因 JsPR10 ̄1的克隆与表达分析
80
80
80
80
80
160
160
160
160
159
Fagus sylvatica
Castanea sativa
Quercus suber
Juglans sigillata
Malus domestica
Fagus sylvatica
Castanea sativa
Quercus suber
Juglans sigillata
Malus domestica
P-loop motif
“P ̄loop”基序用方框标识ꎬ 3个保守氨基酸用倒三角形标识ꎮ
The ‘P ̄loop’ motif is indicated with frame. Three conserved amino acid residues of PR10s are labeled with inverted triangleꎬ respec ̄
tively.
图 3 JsPR10 ̄1与 4种植物 PR10的多重序列比对
Fig 3 Multiple alignment of amino acid sequence of JsPR10 ̄1 and four plant PR10s
100
54
100
100
99
94
85
94
49
48
32
48
0.1
Fagus sylvatica (CAA10235.1)
Castanea sativa (CAD10374.1)
Quercus suber (AFF59689.1)
Juglans sigillata (KJ598787)
Malus domestica (CAA96535.1)
Corylus avellana (CAA96549.1)
Betula pendula (CAA54484.1)
Lupinus luteus (CAA56298.1)
Medicago sativa (CAA67375.1)
Solanum virginianum (AAU00066.1)
Capsicum annuum (AAF63519.1)
Lilium longiflorum (AAD17336.1)
Asparagus officinalis (CAA44013.1)
Oryza sativa (AAL74406.1)
Sorghum bicolor (AAC12661.1)
JsPR10 ̄1用方框标识ꎮ 括号内分别为各物种 PR10的登录号ꎮ
JsPR10 ̄1 is indicated with frame. GenBank numbers of plant species PR10s are given in parenthesesꎬ respectively.
图 4 JsPR10 ̄1与其它物种 PR10的系统进化树
Fig 4 Phylogenetic tree of the deduced amino acid sequence of JsPR10 ̄1 and PR10s
from other plant species
于 20 h和 10 hꎬ 不稳定指数为 24 72ꎬ 小于阀值
40ꎮ 另外ꎬ JsPR10 ̄1脂肪族系数为 82 30ꎬ 总亲
水系数为 -0 408ꎮ SignalP 4 1 分析结果显示ꎬ
JsPR10 ̄1没有信号肽ꎬ 因此推测该蛋白不是分泌
蛋白ꎮ PredictProtein 分析表明该蛋白没有 N 端分
泌信号以及核定位信号ꎬ 可能定位在细胞溶质中ꎮ
在 JsPR10 ̄1中共发现了 5种可能的翻译后修饰位
点: N ̄糖基化位点(N ̄glycosylation siteꎬ 2 个)、
cAMP ̄ and cGMP ̄依赖的蛋白激酶磷酸化位点
( cAMP ̄ and cGMP ̄dependent protein kinase
phosphorylation siteꎬ 1个)、 蛋白激酶 C磷酸化位
点(Protein kinase C phosphorylation siteꎬ 1 个)、
616 植 物 科 学 学 报 第 32卷
酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化位点(casein kinase Ⅱ phos ̄
phorylation siteꎬ 3个)和 N ̄豆蔻酰化位点(N ̄my ̄
ristoylation siteꎬ 2个)ꎮ
2 2 3 JsPR10 ̄1编码蛋白质的二级结构及三维
结构预测
PredictProtein 预测结果表明ꎬ PR10 蛋白中
α ̄螺旋(H)、 β ̄折叠(E)和无规则卷曲(L)所占百
分比分别为 23 87%、 36 77%和 39 35%ꎮ 其中
二级结构共包含 2个可能的 α螺旋和 7个可能的 β
折叠: α1 (15 ~28)、 α2 (131 ~154)、 β1 (4 ~
12)、 β2 (40~46)、 β3 (53~60)、 β4 (67~75)、
β5 (81 ~88)、 β6 (97 ~107)、 β7 (112 ~122)ꎮ
蛋白质的三级结构很大程度上决定了蛋白质的功
能ꎬ 为了探究漾濞大泡核桃 JsPR10 ̄1结构与功能
之间的关系ꎬ 以樱桃(Prunus avium) 主要过敏原
pru av 1 (1E09 1)为模板构建了 JsPR10 ̄1 的三
维模型 (两者的蛋白质序列相似性为 53%)ꎮ 由
JsPR10 ̄1的三级结构可知(图 5)ꎬ 从 C 端开始以
一个长的 α 折叠连接 7 个反相平行的 β 折叠ꎬ 靠
近 N端的结构域为 2 个短的 α 螺旋ꎬ 它们通过无
规则卷曲连接在一起ꎮ 整个结构中心构成空穴ꎬ 该
空穴可能与黄酮类、 脂肪酸、 细胞分裂素等非极性
图 5 JsPR10 ̄1的三维结构模型
Fig 5 Putative 3D structure of JsPR10 ̄1
配体的胞内运输有关[18]ꎮ
2 3 JsPR10 ̄1的表达特性分析
采用 qRT ̄PCR 对漾濞大泡核桃 JsPR10 ̄1 经
胶孢炭疽菌侵染后以及 4种信号分子处理后表达量
的变化进行了比较分析ꎮ 结果显示(图 6)ꎬ 接种胶
孢炭疽菌后ꎬ JsPR10 ̄1 的表达量迅速上升ꎬ 在接
种 8 h时表达量达到最大值ꎬ 约为对照的 2 5 倍ꎻ
随后下降ꎬ 在接种 48 h 时下降到最低值且明显低
于对照ꎬ 随后略微上升ꎮ 信号分子 JA、 SA、 ET
和 H2O2处理均不同程度诱导了 JsPR10 ̄1的表达ꎬ
且表达量均在 6 h时达到最大值ꎮ 不同的是 SA和
**
**
**
**
**
**
0
0.5
1
1.5
2
2.5
3
Control2 4 8 24 48 72
Js
PR
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-1
Js
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Js
PR
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ET h
Hours post treatment with ET
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∗ꎬ P < 0 05ꎻ ∗∗ꎬ P < 0 01ꎮ
图 6 胶孢炭疽菌侵染过程中及 SA、 JA、 ET、 H2O2处理后 JsPR10 ̄1的表达水平
Fig 6 Expression levels of JsPR10 ̄1 during Colletotrichum gloeosporioides
infection as well as after treatment by SAꎬ JAꎬ ET and H2O2
716 第 6期 何 华等: 漾濞大泡核桃病程相关蛋白 10基因 JsPR10 ̄1的克隆与表达分析
JA处理 6~24 h 期间表达量持续下降ꎬ 直至处理
48 h 时才有小幅上升但仍低于对照ꎻ 而 ET 和
H2O2处理 6 ~12 h 期间表达量急剧下降ꎬ 在处理
24 h 时才略微回升ꎬ 随后再次下降ꎮ 综上分析ꎬ
JsPR10 ̄1的表达受胶孢炭疽菌和逆境胁迫相关信
号分子的诱导ꎬ 并且漾濞大泡核桃 JsPR10 ̄1显然
参与了对胶孢炭疽菌的防卫反应ꎮ
3 讨论
PR10是广泛存在于高等植物体内的一类非常
重要的病程相关蛋白ꎬ 不仅参与植物对生物和非生
物胁迫的防卫反应ꎬ 在植物正常生长发育中也有一
定的功能ꎮ 漾濞大泡核桃是云南省重要的经济树
种ꎬ 并且对胶孢炭疽菌有较强的抗性ꎬ 为了研究漾
濞大泡核桃的抗性机理ꎬ 我们对其进行胶孢炭疽菌
侵染ꎬ 转录组测序结果显示 PR10 EST的表达量明
显增加ꎮ 因此ꎬ 通过 5′ ̄RACE 和 3′ ̄RACE 克隆得
到了 PR10 基因 JsPR10 ̄1ꎬ 该基因编码的氨基酸
序列与栎树、 欧洲山毛榉、 欧洲板栗的 PR10 高度
同源ꎮ JsPR10 ̄1 不存在 N 端信号肽序列ꎬ 并且
PredictProtein 分析也表明 JsPR10 ̄1 是定位于细
胞溶质中的非分泌蛋白ꎬ 这些特征与已知植物物种
的 PR10高度一致ꎮ
植物 PR10 是低分子量的酸性蛋白ꎮ 棉花
(Gossypium arboreum) GaPR ̄10 和辣椒 CaPR ̄
10均编码含有 159 个氨基酸的蛋白质ꎬ 等电点分
别为 4 95 和 5 2[3ꎬ7]ꎮ 本研究从漾濞大泡核桃中
分离出的 JsPR10 ̄1基因编码含有 160个氨基酸的
蛋白质ꎬ 等电点约为 5 51ꎬ 说明 JsPR10 ̄1编码典
型的 PR10 蛋白ꎮ JsPR10 ̄1 与其它植物的 14 个
PR10构建的进化树显示ꎬ 单子叶和双子叶植物分
别聚为 2大支ꎬ 可见单子叶和双子叶植物的 PR10
能部分揭示单子叶物种和双子叶物种间的差异ꎮ 另
外ꎬ JsPR10 ̄1序列中存在保守基序“P ̄loop”ꎬ 该
基序广泛存在于核酸结合蛋白中ꎬ 并且参与 ATP
和 GTP的结合ꎬ 可能与维持 PR10 的核糖核酸酶
活性有关[19]ꎮ Wu 等[19]研究发现定点突变甘薯
(Pachyrrhizus erosus) PR10 蛋白 SPE ̄16 序列中
的 Glu95、 Glu147和 Tyr149 三个保守氨基酸ꎬ 导
致其核糖核酸酶活性丧失ꎮ 本研究 JsPR10 ̄1序列
中存在“P ̄loop”以及 E97、 E149 和 Y151 三个保
守的氨基酸ꎬ 暗示 JsPR10 ̄1可能具有核糖核酸酶
活性ꎮ
在病原菌的侵染过程中ꎬ 植物参与胁迫应答的
基因会大量诱导表达ꎬ PR10 的表达与积累是植物
响应生物胁迫的重要途径之一ꎮ 葡萄(V. pseudo ̄
reticulata)受病原菌(Plasmopara viticolainfection)
侵染后ꎬ VpPR10 2 的表达量显著提高[20]ꎮ 花生
(Arachis hypogaea) AhPR10 基因通过原核表达
的融合蛋白抑制 Fusarium oxysporum和 Rhizocto ̄
nia solani的生长[21]ꎮ 黄果茄 SsPR10 在体外对稻
瘟病有显著的抑制作用[12]ꎮ 本研究 qRT ̄PCR结果
显示ꎬ 胶孢炭疽菌接种到漾濞大泡核桃叶片后ꎬ
JsPR10 ̄1表达量迅速上升ꎬ 并且在接种 8 h 时表
达水平增加至对照的 2 5倍ꎬ 说明 JsPR10 ̄1参与
漾濞大泡核桃对胶孢炭疽菌的应答反应ꎮ 此外ꎬ 信
号分子 SA、 JA、 H2 O2 和 ET 处理可显著提高
JsPR10 ̄1的转录水平ꎬ 暗示 JsPR10 ̄1 可能通过
这些信号通路介导漾濞大泡核桃对胶孢炭疽菌或其
它逆境胁迫的抗性ꎮ
PR10 作为一类病程相关蛋白ꎬ 响应生物与
非生物胁迫ꎬ 是植物防御系统的重要组成部分ꎬ
并且有些 PR10 蛋白已证实具有核糖核酸酶活性
与抗菌活性[3ꎬ7ꎬ12ꎬ21] ꎮ 本研究结果表明漾濞大泡
核桃 JsPR10 ̄1 参与对胶孢炭疽菌的防卫反应ꎬ
因此下一步有必要对其生物学活性及其功能进行
深入分析ꎮ 目前我们已经构建了 JsPR10 ̄1超表达
载体ꎬ 下一步以期得到 JsPR10 ̄1的转基因烟草及
JsPR10 ̄1功能的初步信息ꎮ
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(责任编辑: 张 平)
916 第 6期 何 华等: 漾濞大泡核桃病程相关蛋白 10基因 JsPR10 ̄1的克隆与表达分析