全 文 ：中草药 Chinese Traditional and Herbal Drugs 第 44卷 第 22期 2013年 11月

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·专 论·
中药指纹图谱技术进展及未来发展方向展望
李 强，杜思邈，张忠亮，吕春明，周永全，赵 燕，张 宁*
上海中医药大学 科技实验中心，上海 201203
摘 要：中药指纹图谱在现代及未来的中药质量控制中都占有很重要的地位，其可分析中药中有效成分和无效成分的种类和
含量分布的信息，符合中医中药整体性和模糊性的特点。随着越来越多的技术不断被应用于中药指纹图谱的研究，中药指纹
图谱必在中药质量控制、中药药效成分研究、中药作用机制研究等多方面发挥更加重要的作用。总结了近年来中药指纹图谱
研究技术和分析方法的进展，并就其未来发展方向进行探析。
关键词：中药；质量控制；指纹图谱；药效成分；作用机制
中图分类号：R284.1 文献标志码：A 文章编号：0253 - 2670(2013)22 - 3095 - 10
DOI: 10.7501/j.issn.0253-2670.2013.22.001
Progress in fingerprint technology on Chinese materia medica and prospect of its
future development
LI Qiang, DU Si-miao, ZHANG Zhong-liang, LV Chun-ming, ZHOU Yong-quan, ZHAO Yan, ZHANG Ning
Experiment Center for Science and Technology, Shanghai University of Traditional Chinese Medicine, Shanghai 201203, China
Abstract: Fingerprint of Chinese materia medica (CMM), which could be used to comprehensively analyze the information of the type
and content distribution of the effective and ineffective components in CMM, is in line with the integral and fuzzy characteristics of
CMM and has held its own important space in modern and future CMM quality control. As more and more technologies have been
applied to the fingerprint research of CMM, it is sure to play a much more important role in many aspects, such as the quality control of
CMM, the researches of efficient components, and the mechanism in CMM, and so on. This paper generalizes the research in
progresses in research and analytic methods on CMM fingerprint technology, and the prospect of the future development in the
fingerprint is discussed.
Key words: Chinese materia medica; quality control; fingerprint; efficacious constituents; mechanism of action

随着中药在国际上的广泛应用，其有效性、安
全性问题引起了广泛关注。建立高品质的质量标准
以保证药物的安全性、有效性是一项长期而艰巨的
任务。中药质量控制一直都是中药研究与生产中的
难点和热点，也是实现中药现代化的重要基础和关
键[1]；而且目前国内中药质量控制的模式和手段具
有很多局限性，已成为中药打入国际市场的主要障
碍之一。
我国目前推行的中药质量标准体系是由区分优
劣的定量指标（包括纯度、异物、灰分、水分等）
和辨别真伪的定性指标（包括产地、采收期、形状、
特征、颜色反应、浸出物等）组成的。由药材中单
一或几个化合物来对一种或几种药材定性或定量标
定是一种普遍现象，其控制的是中药中的某部分组
分，忽略了中药中多种成分、多种机制的协同作用，
难以全面衡量中药的疗效和质量。
经过二十几年发展的中药指纹图谱在中药质量
的综合评价和控制方面迈进了一大步，被认为是中
药质量控制的里程碑[2]，已由最初的在方法和技术
方面的基础研究，开始逐渐进入到中药质量控制和
评价的实际应用中[3]。
指纹图谱是基于对中药物质群整体作用的认

收稿日期：2013-08-02
基金项目：上海市教育委员会重点学科资助项目（J50302）；上海市科促会联盟计划（2012033）
作者简介：李 强（1987—），男，中药学硕士生，河南焦作人，研究方向为中药新剂型与质量评价。E-mail: liqiang875@foxmail.com
*通信作者 张 宁 Tel: (021)51322384 E-mail: ningzh18@126.com
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识，借助于波谱和色谱等技术获得中药化学成分的
光谱或色谱图，是实现鉴别中药真实性、评价质量
一致性和产品稳定性的可行模式，具有信息量大、
特征性强、整体性和模糊性等特点。指纹图谱包括
了对已知成分和未知成分的分析，反映的化学成分
信息（具体表现为相对保留时间和相对峰面积）具
有高度特异性和选择性，可较充分地反映出中药复
杂混合体系中各种化学成分量分布的整体状况，尤
其是在现阶段有效成分绝大多数没有明确的情况
下，能够结合各种色谱、光谱、波谱手段[4]，特征
性地鉴定中药的真伪与优劣，成为中药自身的“化
学条码”[5-6]。因此，中药指纹图谱能较全面地反映
药材所含化学成分的相对关系，体现了中药成分的
复杂性和相关性，与中医药的传统理论相适应，能
真正对中药内在质量进行有效表征、综合评价和全
面控制，尤其适用于有效成分不完全明确或不需要
完全明确的情况下，对中药材及中药产品进行质量
控制。中药指纹图谱除能用于考察中药材产地、采
收季节、采收部位、炮制加工、储存时间等因素[7-12]，
以提供依据鉴别生产前原料药材的真伪优劣，更可
用于中药生产过程的质量控制：追踪制剂中某些化
学成分的变化，监测原料药材与成品之间、成品的
各批次间质量的一致性及稳定性[13-15]。
本文将以指纹图谱所用技术（化学指纹图谱、
生物指纹图谱和代谢指纹图谱三大类）及分析方法
为依据分类阐述近年来指纹图谱研究进展，并指出
指纹图谱在未来研究中应注意的问题，以期指纹图
谱能为中药质量控制、中药的现代化和国际化提供
有益的参考。
1 化学指纹图谱
化学指纹图谱是依据中药中所含化学成分种类
及其量用不同的仪器、方法检测得到的指纹图谱。
根据所用方法的不同将中药化学指纹图谱分为 2
类：波（光）谱指纹图谱、色谱指纹图谱。
1.1 波（光）谱指纹图谱
光谱指纹图谱中常用的有红外光谱、近红外
光谱、紫外光谱以及 X射线衍射光谱、核磁共振
等。由于这些方法能够给出药效物质基础的结构
信息，部分信息也可能与特定的化学成分有直接
关联，所以它们在中药指纹图谱的研究中仅是作
为辅助手段。
1.1.1 红外光谱（近红外光谱）指纹图谱 红外光
谱法测定的是物质中分子吸收光谱，是由分子振动
或转动引起偶极距的净变化产生，不同物质有其特
征指纹性[16]。近些年来，近红外光谱用于中药质
量控制尤其广泛。由于近红外光谱仪具有体积小、
分析速度快及受温度、压力和振动等外部因素干扰
小等优点[17]，已充分应用于中药的加工过程监控
和质量控制，不仅可以对原药材、饮片、成药、颗
粒剂以及注射剂等连续的加工过程进行在线的质
量控制，而且对于药材的提取过程也可以进行全程
质量监控[18-20]。
孙素琴等[21-22]以红外光谱法对地黄、正红花油
的分析以及对鹿角、鹿茸、鹿角霜的鉴别为例指出：
中药多组分化合物的红外光谱中，具有同一类官能
团的多种成分可整体形成叠加峰，对其分析可得物
质群组的信息，逐步分析后，再逐级利用二阶导数
红外光谱及二维红外光谱等分辨能力更高的方法，并
借助于光谱数据库检索、相似度量化评价、多组分
定量分析等识别手段，对多产地的中药进行质量控
制，能够真实反映中药样品的整体信息，可进行宏
观物质群组分析，对特定的群组进行微观分析，并
可对多成分进行定量分析。整个分析过程直接、简
便、合理、有效，可从源头开始，建立从整体到局
部、从定性到定量的全过程、全成分的分析体系。
Fournier 等[23]应用一种特殊形式的二维四波混频红
外振动光谱（2DIR FWM）作为可能的蛋白质指纹
识别工具，可以测定某些肽的氨基酸量。Vijayalakshmi
等[24]用紫外-可见光谱和红外光谱指纹图谱比较和
评价铁力木根提取物的提取率，每个提取物和官能
团在 500～3 500 cm−1区域内可出现指纹光谱。
1.1.2 拉曼光谱指纹图谱 拉曼光谱具有无需预处
理、不需破坏样品、分析速度快、灵敏度较高、样
品浓度低的特点，为中药的质量控制、中药有效成
分的微量分析与深层次研究提供了一种新的方便而
可靠的分析方法[25]。
刘蓬勃等[26]和朱世玮等[27]分别采用傅里叶变
换拉曼光谱鉴别了八角茴香真伪品、肉桂及其混淆
品阴香，鉴别方法快速、准确。林文硕等[28]采用拉
曼光谱对山药成分进行分析，并在其拉曼光谱的基
础上获得了一阶导数谱。结果显示：拉曼光谱中出
现的 477、863、936 cm−1强峰，可认为是山药的特
征峰；在其一阶导数谱 600～800 cm−1，1 000～1 400
cm−1区域内可以更为清晰的表现山药拉曼光谱。
1.1.3 紫外光谱指纹图谱 紫外光谱可反映出中药
中化学组分 π→π*、n→π*及 n→σ*化学键信息，由
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于不同的化学成分体系紫外吸收曲线具有指纹特
征，故紫外光谱指纹图谱可用于中药及其制剂的质
量鉴别。
孟庆华等[29]建立了一种计算紫外光谱相似度
的方法，实现对中药注射液质量的控制。用紫外吸
收光谱上所有数据点计算样品紫外光谱和多个对照
品紫外光谱的相似度并求出平均值，通过该平均值
与阈值的比较对样品质量进行评价。邹华彬等[30]采
用紫外指纹图谱技术和双指标（共有峰率和变异峰
率）序列分析法对不同产地、不同采集年份的白芍
及相近植物赤芍、丹皮进行了定量评价。结果表明，
在本实验采用的药材范围内，相近产地的白芍具有
最相近的关系，不同产地的白芍之间存在着较明显
的差异，同一地区不同年份的白芍之间有较明显的
差异，并可以明确区分白芍及丹皮，并可对至少 2
个样品进行定量评价，为白芍质量的准确定量评价
提供了一种新方法。冀宪领等[31]对紫外指纹图谱鉴
定（别）白僵蚕质量的可行性进行了分析，初步建
立了可应用于白僵蚕鉴别的紫外指纹图谱技术，该
方法可为白僵蚕的质量控制提供依据。
1.1.4 荧光光谱指纹图谱 大多数中药成分具有荧
光性质，荧光光谱能形象地反映出荧光组分的各种
信息，特别是所有荧光组分的种类和量的信息分别
都会反映在光谱上，使得每种中药的荧光光谱有所
差异而具有了良好的指纹性；如果再结合计算机技
术，根据一定的标准进行确认，便可达到对中药的
识别和质量控制等目的[32]。
牟新利等[33]用三维荧光研究柳杉种子、银杏叶
和槐米的指纹图谱，化学成分芦丁能显示唯一的指
纹图谱特征，因此，三维荧光可以较准确地鉴定中
药中的化学成分，三维荧光可以作为中药指纹图谱
研究的一种标准。王琳等[34]利用液晶光谱仪通过光
谱成像法对黄柏和人参总皂苷进行了荧光光谱图像
检测，采用滤波器与像素点定位联用的方法提取有
效像素点，获取了荧光光谱图像，绘制了中药荧光
指纹图谱，其所得荧光指纹图谱稳定性好、谱线优，
结果表明该方法可以用于构建中药荧光指纹图谱。
1.1.5 核磁共振指纹图谱 中药核磁共振指纹图谱
是一种整体的、综合的鉴定手段，核磁共振具有高
度的重现性和特征性，操作简单、分析周期短、易
于解析，可用于鉴别中药真伪、评价药材和中成药
的质量均一性和稳定性，具有其他光谱学方法无可
比拟的优越性。
张瑜等[35]建立关黄柏的 1H-NMR 指纹图谱方
法，对关黄柏的总提取物、总生物碱提取物和总柠
檬苦素提取物三者的指纹图谱进行对比分析研究。
结果表明，关黄柏总提取物的指纹图谱主要显示小
檗碱、巴马汀的特征共振信号；关黄柏总生物碱提
取物的指纹图谱主要显示小檗碱、巴马汀和黄柏碱
的特征共振信号；关黄柏总柠檬苦素提取物的指纹
图谱主要显示黄柏酮、黄柏内酯的特征共振信号；
各图谱能够很好地表征出主要成分的特征信号，可
以作为关黄柏指纹图谱研究的辅助方法以控制中药
质量。姜苗苗等[36]应用 1H-NMR技术建立银翘解毒
液的指纹图谱，并应用 Excel 2003 软件计算 10 批
银翘解毒液样品相似度，其中 8批样品的相关系数
和夹角余弦相似度在 0.97以上，另外 2批相似度在
0.82～0.91。该指纹图谱专属性强，准确可行，能全
面、快速、客观地反映其质量特征，可用于银翘解
毒口服液类中药复方制剂的质量评价和控制。Lin
等[37]通过 1H-NMR 指纹图谱方法分别检测 1～6 年
生栽培干人参，产生的数据集使用主成分分析和聚
类分析，建立一个能够真实、明确区分人参栽培年
限的质量监控方法。
1.1.6 X射线衍射指纹图谱 X射线衍射是用X射
线对被测样品进行照射而产生的衍射图谱（如
Fourier 指纹图谱的几何拓扑图形和特征衍射峰
等），是各组分衍射效应的叠加，是恒定组成的样品
的特征图谱。X射线衍射法对样品前处理只需进行
物理（粉碎）加工，不需化学处理，可保持样品组
分全貌，所需样品量小，操作快捷方便，所获得的
图谱信息量大、指纹性强、稳定可靠，作为样品定
性鉴别的依据可靠性强。目前建立的方法中以动物、
矿石类药材居多，但也不乏植物药材。
Wang等[38]建立了大黄的 X射线衍射指纹图谱
方法并对 3个产地的大黄进行检测和图谱峰差异性
评价和整体相似性评价。结果显示：3 个样品所含
的化学成分相同，但量不相等，其衍射图谱及衍射
峰值具有一定的指纹特征，表明 X射线衍射法可为
区分不同产地大黄药材的质量及鉴别提供依据，是
鉴别不同产区的大黄及其他中药材的一种快捷有效
的方法。赵翠等[39]采用 X射线衍射技术对 8个煅硼
砂样品进行定性分析，并对各样品共有峰进行相似
度分析。结果显示：其中 7个样品衍射图谱几何拓
扑特征基本一致，后经夹角余弦法和相关系数法计
算，发现不同样品 X射线衍射图谱共有峰相似度均
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较高，与聚类分析结果一致，表明 X射线衍射指纹
图谱分析方法专属性强，准确可靠，可实现对煅硼
砂的鉴别和质量评价。刘广桢等[40]建立冰硼散 X射
线衍射分析方法，对市售 8个厂家冰硼散进行 X射
线衍射指纹图谱分析及特征标记峰鉴别，发现不同
厂家冰硼散样品 X射线衍射图谱中均可检出冰片、
玄明粉和朱砂的特征峰，部分样品可检出硼砂的特
征峰。该方法可用于冰硼散的鉴定。
1.2 色谱指纹图谱
色谱法是分析化学领域中发展最快、应用最广
泛的分析方法之一，也是中药指纹图谱最基本的技
术和现代中药产业的关键技术，非常适合我国的国
情。常用的色谱指纹图谱技术有薄层色谱指纹图谱、
液相色谱指纹图谱、气相色谱指纹图谱、高效毛细
管电泳指纹图谱等[41]。各种技术均有各自的优点和
缺点，适用范围也各有差别，选择何种色谱指纹图
谱技术取决于供试品的性质和研究目的。
1.2.1 薄层色谱指纹图谱 薄层色谱是应用最普遍
的鉴别手段，多国药典都采用其作为必不可少的药
材鉴别方法。薄层色谱具有经济、简便、直观、快
速、时效高、适用广、专属性强等优点，以及效能
低、受环境影响大、重现性差等缺点。
杨成等[42]应用高效薄层色谱法和薄层扫描技
术获得了可用于区分来自冬虫夏草、灵芝、黄芪、
人参、西洋参和三七的 6种多糖组分的薄层色谱指
纹图谱。雷敬卫等[43]为鉴别生熟地黄及考察熟地
黄饮片质量的稳定性和一致性而建立了薄层色谱
指纹图谱方法，结果显示 10批清蒸和 10批酒炖样
品间的相似程度较高，饮片质量比较均一、稳定，
与《中国药典》2010年版中规定的鉴别方法比较，
反映的信息更丰富、更具说服力。Galal 等[44]建立
了白花丹叶薄层色谱指纹图谱的方法，对 3种白花
丹（蓝花丹 Plumbago auriculata Lamk.、紫花丹 P.
indica L. 和白花丹 P. zeylanica L.）的叶、茎和根
进行分析，结果表明，三者的叶和根差异明显，而
茎无明显差异。
1.2.2 液相色谱指纹图谱 高效液相色谱是研究指
纹图谱应用最广泛的方法之一，具有分离效能高、
分析速度快及仪器自动化等特点，依托正相色谱和
反相色谱两大技术、紫外检测器（UV）、荧光检测
器（FD）、电化学检测器（ECD）、蒸发激光光散射
检测器（ELSD）、示差折光检测器（RID）、二极管
阵列检测器（DAD）、质谱检测器（MS）等多种检
测器以及种类丰富的色谱柱，使得液相色谱法适用
性非常强。
王海波等[45]通过对 65 种不同来源羌活药材的
荧光指纹图谱进行实验研究，构建羌活的高效液相-
荧光指纹图谱质控方法，确定了羌活药材质量评价
荧光指纹谱的基准样本值，得到 20个共有指纹色谱
峰，各羌活样品与基准样本相似度值均在 0.8以上。
周慧等[46]分别采用高效液相色谱技术和 ESI-MS 技
术得到了分离度、精密度和重现性均较好的刺五加
叶 HPLC-UV 及 ESI-MS 指纹图谱，并成功鉴别了
刺五加叶与山楂叶，可为刺五加叶的质量控制提供
参考。Xiong 等[47]建立了普通针毛蕨的高效液相指
纹色谱法鉴定和质控方法，图谱中有 11个特征峰，
并可同时定量分析原芹黄酮、原芹黄素-4′-O-β-D-
葡萄糖苷、芹黄素 4′-O-β-D-葡萄糖苷和芹黄素 4种
物质的量，该方法可靠、快速。Zhao等[48]建立了牛
膝的高效液相指纹色谱质量控制标准，确定其中 3
个峰为蜕皮甾酮、25R-牛膝甾酮和 25S-牛膝甾酮，
并，进行定量 HPLC-UV分析，量化分析了怀牛膝、
尖叶牛膝、结球甘蓝和川牛膝 4种同属药材。结果
表明，该方法是良好的评价牛膝质量的方法。Dou
等[49]用 LC-DAD 和 LC-ESI-MS-MS 联用方法对黄
连解毒汤进行质量评价，由 C18色谱柱分离得到 25
个色谱峰，其中对 13个化学成分进行ESI-MS鉴定，
7个成分进行 LC-DAD定量分析，用该方法能够更
充分、完整地监测及评价黄连解毒汤的质量。
1.2.3 气相色谱指纹图谱 气相色谱指纹图谱主要
应用于含挥发性成分较多的中药材及中药制剂的质
量鉴定和质量控制，具有分离效能高、选择性好、
灵敏度高、样品用量少、分析速度快和应用范围广
等优点。
沈振铎等[50]建立了评价五味子质量的气相色
谱指纹图谱分析和鉴定方法，根据聚类和相似度分
析结果对南五味子、北五味子进行了鉴别，确定了
北五味子、南五味子挥发油类成分中各自的 28个和
16个共有峰。吴志成等[51]提取了海南沉香挥发油并
对其进行 GC-MS 分析，建立了海南沉香药材挥发
油的 GC指纹图谱，并对 10批海南沉香药材进行分
析，相似度为 0.913～0.997。该方法稳定性好、特
征性强，可作为海南沉香药材地道性鉴定的一种新
手段。李红梅等[52]采用水蒸气蒸馏和正己烷萃取藿
香正气水，以正十七烷为参照物经毛细管气相色谱
柱（含 FID 检测器）进行了分析，对 10 批次藿香
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正气水进行检测，建立了该药品的 GC指纹图谱，
并标示了 16个共有指纹峰。该方法准确、重现性好，
为进一步质量标准化研究和质量控制提供依据。Jiao
等[53]建立了广东海风藤提取物 GC-MS指纹图谱，
并对色谱图中的 23个主要特征峰进行了鉴定，通过
SPSS 进行分层聚类分析，10 个批次的相似度值较
低，该药材可分为三大类。该方法重现性好，提供
了一个有效控制海风藤质量的方法。
1.2.4 毛细管电泳色谱指纹图谱 毛细管电泳已被
用于分析中药中生物碱、黄酮（黄酮苷）、酚酸、香
豆素、醌类、强心苷、皂苷、葡萄糖异硫氰酸盐等
成分，具有抗污染能力强、前处理简单、分析运行
成本低、水溶性样品的指纹特征强等特点，而且在
分析基质复杂的样品和运行费用方面比 HPLC方法
有着极为突出的优越性，同时已有性能较好的国产
仪器。
王丽聪等[54]用毛细管电泳法研究运行缓冲液
的浓度和酸度、检测波长及分离电压对黄芩药材指
纹图谱的影响，得到了优化的测定条件（50 mmol/L
硼砂缓冲液，pH值 7.94，分离电压为 20 kV，柱上
254 nm 紫外检测），从而建立了不同产地黄芩药材
的指纹图谱，通过对 10批次药材的测定，结果与实
际样品分类相符合，为黄芩药材的质量控制提供了
新的参考。崔洋等[55]建立了连翘的高效毛细管电泳
指纹图谱共有模式，确定了 12个共有峰，并对不同
产地、不同采收部位药材进行了比较和评价。结果
显示：河北产连翘药材指纹图谱较相似，山西、河
南产与河北产质量相近，不同部位连翘药材化学成
分差异较大。郭涛等[56]采用高效毛细管电泳法建立
以 10批当归道地药材、10批川芎道地药材、10批
红花道地药材、10批心舒口服液的指纹图谱，分别
建立标准指纹图谱，再分别对制剂、单味药材水煎
液、各药材阴性对照液的指纹图谱进行在线紫外光
谱和迁移时间的比较，初步确定了样品制剂与原料
药材指纹图谱之间的相关性，最终建立复方中药制
剂心舒口服液的质量控制方法。
1.2.5 高速逆流色谱指纹图谱 高速逆流色谱分离
原理是利用螺旋柱产生巨大离心力，使螺旋柱中互
不相溶的两相不断反复进行混合和静置这一频率极
高的分配过程，可使样品在两相之间不断反复地进
行分配，由于样品中各组分分配系数不同，导致在
螺旋柱中的移动速度不同，因而能使样品各组分依
次得到分离。高速逆流色谱技术的特点：操作简单
易行，应用范围广，无需固体载体，产品纯度高，
使得其他色谱技术中可能出现的样品吸附、损失、
污染和色谱峰拖尾等问题得到解决。目前，该技术
主要应用于分离和提纯方面，如果在各组分洗脱出
口处串联上适当的检测器，其检测信号谱图则为指
纹图谱，且具有分析成本底、易于操作、性能可靠、
仪器价格低廉、分离和分析同时完成等优点[57]。
Gu 等 [58]用高速逆流色谱法研究丹参指纹图
谱，用高速逆流色谱仪分离纯化丹参脂溶性成分，
选用正己烷-乙醇-水（10∶5.5∶4.5）体系进行分
步洗脱，3 个丹参样品分别分离得到 12 个相同的
洗脱组分，但相对量有较大差异，说明高速逆流色
谱法可以体现中药化学成分浓度分布的状况，表明
高速逆流色谱法作为指纹图谱研究方法具有可行
性。沈平孃等[59]建立了五味子的高速逆流色谱指
纹图谱方法，得到的谱图有 13 个特征峰，对分离
得到的 4种成分（五味子醇甲、五味子酯甲、五味
子甲素、五味子乙素）进行检测，质量分数均大于
97%，对建立五味子高速逆流色谱指纹图谱质量控
制标准进行了有益的探索。
2 生物指纹图谱
中药生物指纹图谱主要应用于植物遗传育种研
究以及种子质量标准化、品种审定、假种辨别等方
面，包括蛋白质组学指纹图谱和 DNA（基因组学）
指纹图谱。蛋白质组学的研究是一个细胞或一个基
因组所表达的全部蛋白质，是在空间和时间上动态
变化的整体，其研究主要依赖三大技术，即双向电
泳技术、电喷雾质谱（ESI-MS）和基质辅助激光解
吸离子飞行时间质谱（MALDI-TOF-MS）技术、生
物信息学技术。中药材 DNA 指纹图谱多运用聚合
酶链反应（PCR）从不同生物样品中人工合成 DNA
片段，这种 DNA 片段的大小、数目因不同生物而
不同，所以直接分析的是生物遗传因子，只能用于
药材种质资源的考察。其分析技术目前主要有 DNA
随机扩增多态性（ random amplified polymorphic
DNA，RAPD）、简单重复序列间扩增（inter-simple
sequence repeat，ISSR）和扩增限制性片段多态性
（amplified restriction fragment polymorphism，AFLP）。
蒋军富等[60]用筛选出的两条随机引物对不同
采集地绞股蓝及乌蔹莓基因组 DNA 进行 PCR 扩
增，将扩增样品中的具有相同迁移率的 1 条 DNA
片段进行克隆、测序、一致性分析，并在美国国立
生物技术信息中心（NCBI）上进行 Blastn比对检索。
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结果发现该 DNA 序列为新发现序列，以上 2 条引
物能分别扩增得到绞股蓝与乌蔹莓样品基因组的差
异性 DNA片段，可以明确区别绞股蓝与乌蔹莓，为
绞股蓝的品种鉴定、辅助选择育种等研究奠定了基
础。高霞等[61]利用 RAPD标记对膜荚黄芪（父本）
和斜茎黄芪（母本）及其杂交种黄芪草进行了指纹
图谱及遗传相似度分析。结果表明，黄芪草在引物
P3和 P5的扩增图谱中分别具有 l条和 2条特异带，
而父本与母本无此特异带；在引物 P4 的扩增下父
本具有一条特异带，而其余 5份材料均未出现该特
异带；黄芪草与其父本遗传相似系数较小，而与母
本遗传相似系数较大，其遗传偏向母本。Rana等[62]
把相关序列扩增多态性（SRAP）标记法用于 31个
品种的麻黄遗传多样性研究，43 个引物对扩增出
394个条带，其中 89%的条带覆盖了所有 31个品种，
43 个引物对其中 24 个品种可以唯一标识，结果表
明，SRAP 标记可以有效地用于黄麻遗传多样性分
析，对于确定黄麻的种质是非常有用的。
3 代谢指纹图谱
代谢指纹图谱的研究有 2种：一种是植物和中药
的代谢组学研究，主要研究不同的处置方式（包括栽
培、环境、病虫害、采集、加工和贮存）对中药材的
影响，以及提取物的标准化和质量控制等；另一方面，
研究中药对动物、人体代谢组的影响，以进行药物安
全性评价和发现生物活性化合物群及其作用机制研
究等。后者目前见诸报道的较多。中药化学成分的复
杂性决定其经体内代谢后的入血成分会更加复杂，而
且量一般也很低，所以检测体液的中药代谢成分的方
法应该灵敏、准确、快速[63]。故代谢组学研究多以质
谱法为基础技术，其主要优点是应用范围广、选择性
和灵敏度高，能提供化合物的相对分子质量、元素组
成和结构信息。与分离技术相结合，可减少代谢物质
谱的复杂性，减少离子抑制效应并进一步提供了代谢
物的物理化学性质[64]。
Tianniam 等[65]根据经验丰富的药工判断采自
不同气候条件和不同加工方式的日本当归的品质
（分为高、中、低 3个等级），然后利用 GC-TOF/MS
技术结合主成分分析其质量的差异。结果表明，质
量差的当归果糖和葡萄糖的量远远高于中、高质量
的当归。Fang等[66]在不同时间点采集舌下含服复方
丹参滴丸后的人血浆样品，通过微血管张力实验测
试血管扩张效果，采用柱切换系统对样品进行富集
纯化，再测定血浆中活性成分的代谢特征指纹图谱。
结果表明，1.5 h采集的血浆扩张血管能力最强，在
色谱图中出现 5个新的色谱峰，与复方丹参滴丸的
药效物质基础关系密切。汪江山等[67]运用 UPLC/
TOF-MS测定尿液代谢物的变化，建立了大鼠 iv人
参皂苷 Rg3后的尿液代谢指纹图谱，且得到了其中
2种发生显著变化的代谢物的结构信息。Wang等[68]
用结合 LC-MS 的代谢组学法对红景天提取物的质
量进行评价，共成功分离和检测到红景天提取物中
131 个峰，结果表明不同红景天提取物的质量差异
主要体现在 6个成分，络赛维（rosavin）的量对其质
量影响较大。
4 中药指纹图谱分析方法
指纹图谱方法结合现代化学测量仪器，给出的
有关定性和定量的信息量远比任何单一成分的测量
所得的信息量要多得多，如何提取、分析和处理所
需要的有用的化学信息还要借助于化学信息学和计
量学中有关数据的提取与处理、信息基础理论等手
段。在对中药指纹图谱进行评价时，只要好好把握
中药指纹图谱整体性和模糊性这两大特征，建立直
观而又全面、合理而又简易、精确而又方便的中药
色谱指纹图谱计算机处理方法，就可能对中药指纹
图谱的质量进行合理评价。
4.1 化学模式识别方法
4.1.1 人工神经网络学模式识别技术 是根据物质
所含化学成分信息，用计算机对其进行分类或描述，
其能够较好地迎合指纹图谱整体性和模糊性的要
求，分为无监督方法和监督方法。
（1）无监督的模式识别方法：用图谱信息对样
本进行归类，特别适用于不利用或没有样本所属类
别信息的情况，其将复杂的数据以分类图的形式显
示出来进行系统分析。常用方法包括主成分分析
（principle component analysis，PCA）和系统聚类分
析（hierarchical clustering analysis，HCA）[69]等。
（2）监督模式识别方法：其基本思路是用一组
已知类别的样本作为训练集得到类别间判别模型，
使各类样品间达到最大的分离，并利用建立的多参
数模型对未知的样本进行预测[70]。常用方法包括：
偏最小二乘法（partial least squares，PLS）[69]、簇
类独立软模式分类法（soft independent modeling of
class analogy，SIMCA）[71]、线性判别分析（linear
discriminant analysis，LDA）[71]、K邻域判别法（K2
nearest neighbor analysis，KNN）[7]、人工神经网络
技术（artificial neural networks，ANN）[72]等。
中草药 Chinese Traditional and Herbal Drugs 第 44卷 第 22期 2013年 11月

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4.1.2 其他的化学模式识别方法 包括广义夹角余
弦法（cosine of generalized angle，CGA）[73]、星座
图技术（constellation graphing technique）[74]、典型
相关分析（canonical correlation analysis，CCA）[75]、
模糊信息分析法（fuzzy information analysis）[76]、
灰色关联聚类法（gray relational grade cluster，
GRGC）[76]等。
4.2 其他相似度评价方法
其他相似度评价方法主要有相关系数法
（correlation coefficient）[77]、夹角余弦法（inter-angle-
cosine；vector cosine）[77]、模糊尖 T-分布法（fuzzy
distribution）[77]、总量统计矩相似度法（ the total
quantum statistical moment similarity）[77]、欧氏距
离法（euclidean distance analysis）[77]、相对熵方法
（relative entropy）[78]、相似系统理论（similarity system
theory） [79]、组合相似度评价方法（combination
similarity）[80]、马氏距离法（mahalanobis distance
analysis） [81]、全定性全定量相似度法（overall
qualitative similarity and overall quantitative similarity
method） [82]、权值非均一性相似度法（similarity
method of assigning the different weight according to
different size of the peak）[83]、乘方相似度和定量乘
方相似度法（average involution similarity and the
quantitative involution similarity）[84]、假设检验法
（hypothesis test）[85]等。
以上任意一种方法在中药指纹图谱相似度评价
中的应用均非全部适用，需要科研工作者不断实验
和遴选，从而选择最佳的评价方法，以期使指纹图
谱在中药质量控制上能发挥其独特的作用。另外，随
着各种相似度评价方法与计算机、可视化软件的不
断深入结合，各种综合性评价系统软件和专家评价
系统软件也在不断被研发出来，甚至应用于中药指
纹图谱相似度评价上，为使用者带来了极大方便，很
大程度地促进了中药指纹图谱技术的发展和进步，
而指纹图谱技术的进步对于相似度评价方法的要求
必定也会越来越苛刻，需要更多专业人才综合多学
科知识进行相似度评价系统的研发和改进。
5 展望
与仅检测若干种物质的量相比，中药指纹图谱
具有很多优越性，可以最大程度地综合评价中药及
其制剂的质量。中药指纹图谱应用于中药质量控制
研究已有 20年左右时间，随着越来越多的仪器和方
法被用于指纹图谱技术研究，越来越多的药材及制
剂的指纹图谱方法被开发用于质量控制，可以预见，
距离其成为各种中药及复方制剂质量标准体系中必
备的一部分的时间已经不远。但是，在研究过程中，
中药指纹图谱应该被扩展应用的空间还是很大，为
求更好地控制中药和中药制剂的质量、解决目前在
中药指纹图谱研究中遇到的问题（如何划定合适的
相似度的界限以区分合格与不合格的药材及各种中
间产品和最终产品，如何判断一种指纹图谱方法能
够比较好地控制和评价中药质量的好坏等），今后应
该从以下几个方面加大研究力度。
5.1 中药制剂质量标准体系
中药制剂质量标准体系从内容上可以分为药材
质量标准、过程质量标准和产品质量标准 3个部分；
其中，药材质量标准是良好质量的源头，过程质量
标准是良好质量的保证，产品质量标准是良好质量
的最终体现。这 3个部分可以体现中药原料药材在
被加工制备成中药制剂的过程中各种化学成分的综
合变迁，使质量控制的技术和指标得以深入和细化，
更能保证制剂的均一和稳定。中药指纹图谱由于其
独特的优势，如果加大研究力度，从中药材到产品
的整个提取分离制备过程中，根据不同工艺步骤的
质量控制水平建立不同层次的过程质量控制指纹图
谱，实现生产工艺的稳定性控制，从而建立制剂制
备过程质量控制指纹图谱体系，那么会使得中药质
量标准体系的建立不再是纸上谈兵，迎来一个美好
的前景。
5.2 中药代谢指纹图谱
中药代谢指纹图谱是近些年来研究的热点，其
通过监测中药的入血成分间接表征其药理效应，比
中药化学指纹图谱更直接地反映中药的质量，而且
代谢指纹图谱不仅将中药质量比较的着眼点放在共
有的化学信息上面，还能显著地体现出差异性成分
的信息，因此，中药代谢指纹图谱对于中药的质量
控制具有重要意义，甚至似乎更能反映中药的质量。
所以，笔者认为应该把中药化学指纹图谱和中药代
谢指纹图谱研究联合起来进行物质追踪和比较，在
比较中药化学指纹图谱的相似度时，可以考虑增加
主要代谢物及其原形物质的相似性的权重，这对于
恰当的设定相似度、更好地评判中药质量，甚至深
入的研究谱效学指纹图谱与组效学指纹图谱都具有
重要的意义。
5.3 建立各种手段的指纹图谱的综合数据库
目前研究中药指纹图谱的技术和手段多种多
中草药 Chinese Traditional and Herbal Drugs 第 44卷 第 22期 2013年 11月

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样，缺少系统的有机整合比较，笔者认为很有必要
建立各种手段的指纹图谱的综合数据库，以求得到
中药质量控制的网状立体体系，使整个中药质量控
制不再片面和偏颇，而变得完整和全面。叶敏等[64]
提出把中药指纹图谱的全面指认与多指标成分定量
相结合的思路；罗国安等[86]提出建立多维多息特征
谱的思路等，都是可以借鉴和继续发展的为指纹图
谱增添更多深刻的化学和药效内容的研究思路。
5.4 建立微量元素的指纹图谱
目前中药指纹图谱只表示了有效有机物类成分
种类和含量分布，并没有涵盖微量元素的种类和含
量分布，随着对中药有效成分的分析，微量元素的
作用已越来越被人们熟知和重视，所以笔者认为应
该建立微量元素指纹图谱的方法，充分表征中药中
微量元素的分布，并和中药指纹图谱体系综合起来，
为中药的作用机制研究以及质量控制打下更加坚实
的基础。
5.5 建立中药制剂生产过程数字化指纹图谱质量
控制体系
借助于目前在线自动化检测、分析和质控技术，
在指纹图谱技术基础上结合中药生产过程质量控
制、数字化控制技术于一体建立一套健全的具有中
医药特色的中药制剂生产过程数字化指纹图谱质量
控制体系，将中药产业各个环节的质量控制技术进
行有效整合，可以对中药制剂生产过程中的每一个
环节进行质量检测与控制，能从实质上控制中药复
方的药效物质及其变化规律，能准确地反映药品的
全面质量特征、制备工艺环节、原辅料与中间体的
情况，解决中药的质量控制问题，提高我国中药产
品品质；可以更好地保证中药复方制剂的有效性、安
全性和稳定性，有利于突破制约中药产业发展的技
术瓶颈，满足解决我国中药产业急需解决的标准和
质量控制关键技术问题的需要，对于提高中药的药
效和安全性、推动中药产业技术现代化和产业化发
展、提升中药产业的核心竞争力、促进中药进入国
际化市场具有重要的现实意义。
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