全 文 ：２０１６
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ＳｉｎｏｐｏｄｏｐｈｙｌｕｍｈｅｘａｎｄｒｕｍｉｎｆｏｒｅｓｔｏｆＵｐｐｅｒｎｏｒｔｈｍｏｕｎｔａｉｎｏｆ
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（１ＮｏｒｔｈｗｅｓｔＩｎｓｔｉｔｕｔｅｏｆＰｌａｔｅａｕＢｉｏｌｏｇｙ，ＣｈｉｎｅｓｅＡｃａｄｅｍｙｏｆＳｃｉｅｎｃｅｓ，Ｘｉｎｉｎｇ８１０００１，Ｃｈｉｎａ；
２ＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙｏｆＣｈｉｎｅｓｅＡｃａｄｅｍｙｏｆＳｃｉｅｎｃｅｓ，Ｂｅｉｊｉｎｇ１０００４９，Ｃｈｉｎａ；
３ＫｅｙＬａｂｏｒａｔｏｒｙｏｆＴｉｂｅｔａｎＭｅｄｉｃｉｎｅＲｅｓｅａｒｃｈ，ＣｈｉｎｅｓｅＡｃａｄｅｍｙｏｆＳｃｉｅｎｃｅｓ，Ｘｉｎｉｎｇ８１０００１，Ｃｈｉｎａ；
４ＲｅｓｅａｒｃｈＣｅｎｔｅｒｆｏｒＥｃｏＥｎｖｉｒｏｎｍｅｎｔａｌＳｃｉｅｎｃｅｓ，ＣｈｉｎｅｓｅＡｃａｄｅｍｙｏｆＳｃｉｅｎｃｅｓ，Ｂｅｉｊｉｎｇ１０００８５，Ｃｈｉｎａ）
［Ａｂｓｔｒａｃｔ］　ＨｉｇｈｔｈｒｏｕｇｈｐｕｔｓｅｑｕｅｎｃｉｎｇｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙｉｓａｌｓｏｃａｌｅｄＮｅｘｔＧｅｎｅｒａｔｉｏｎＳｅｑｕｅｎｃｉｎｇ（ＮＧＳ），ｗｈｉｃｈｃａｎｓｅｑｕｅｎｃｅ
ｈｕｎｄｒｅｄｓａｎｄｔｈｏｕｓａｎｄｓｓｅｑｕｅｎｃｅｓｉｎｄｉｆｅｒｅｎｔｓａｍｐｌｅｓａｔｔｈｅｓａｍｅｔｉｍｅＩｎｔｈｅｐｒｅｓｅｎｔｓｔｕｄｙ，ｔｈｅｃｕｌｔｕｒｅｉｎｄｅｐｅｎｄｅｎｔｈｉｇｈｔｈｒｏｕｇｈｐｕｔ
ｓｅｑｕｅｎｃｉｎｇｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙｗａｓａｐｐｌｉｅｄｔｏｓｅｑｕｅｎｃｅｔｈｅｆｕｎｇｉｍｅｔａｇｅｎｏｍｉｃＤＮＡｏｆｔｈｅｆｕｎｇａｌｉｎｔｅｒｎａｌｔｒａｎｓｃｒｉｂｅｄｓｐａｃｅｒ１（ＩＴＳ１）ｉｎｔｈｅ
ｒｏｏｔｏｆＳｉｎｏｐｏｄｏｐｈｙｌｕｍｈｅｘａｎｄｒｕｍＳｅｑｕｅｎｃｉｎｇｄａｔａｓｕｇｇｅｓｔｅｄｔｈａｔａｆｔｅｒｔｈｅｑｕａｌｉｔｙｃｏｎｔｒｏｌ，２２５６５ｒｅａｄｓｗｅｒｅｒｅｍａｉｎｅｄＣｌｕｓｔｅｒｓｉｍ
ｉｌａｒｉｔｙａｎａｌｙｓｉｓｗａｓｄｏｎｅｂａｓｅｄｏｎ９７％ ｓｅｑｕｅｎｃｅｓｉｍｉｌａｒｉｔｙ，ｗｈｉｃｈｏｂｔａｉｎｅｄ５１７ＯＴＵｓｆｏｒｔｈｅｔｈｒｅｅｓａｍｐｌｅｓ（ＬＤ１，ＬＤ２ａｎｄＬＤ３）
ＡｌｔｈｅｆｕｎｇｉｗｈｉｃｈｉｄｅｎｔｉｆｉｅｄｆｒｏｍａｌｔｈｅｒｅａｄｓｏｆＯＴＵｓｂａｓｅｄｏｎ０８ｃｌａｓｓｉｆｉｃａｔｉｏｎｔｈｒｅｓｈｏｌｄｓｕｓｉｎｇｔｈｅｓｏｆｔｗａｒｅｏｆＲＤＰｃｌａｓｓｉｆｉｅｒｗｅｒｅ
ｃｌａｓｓｉｆｉｅｄａｓ１３ｃｌａｓｓｅｓ，３５ｏｒｄｅｒｓ，４４ｆａｍｉｌｙ，５５ｇｅｎｅｒａＡｍｏｎｇｔｈｅｓｅｇｅｎｅｒａ，ｔｈｅｇｅｎｕｓｏｆＴｅｔｒａｃｌａｄｉｕｍｗａｓｔｈｅｄｏｍｉｎａｎｔｇｅｎｅｒａｉｎ
ａｌｓａｍｐｌｅｓ（３５４９％，６８５５％ ａｎｄ１２９６％）ＴｈｅＳｈａｎｎｏｎ′ｓｄｉｖｅｒｓｉｔｙｉｎｄｉｃｅｓａｎｄｔｈｅＳｉｍｐｓｏｎｉｎｄｉｃｅｓｏｆｔｈｅｅｎｄｏｐｈｙｔｉｃｆｕｎｇｉｉｎｔｈｅ
ｓａｍｐｌｅｓｒａｎｇｅｄｆｒｏｍ１７５～２９２，０１１～０３２，ｒｅｓｐｅｃｔｉｖｅｌｙＴｈｉｓｉｓｔｈｅｆｉｒｓｔｔｉｍｅｆｏｒａｐｐｌｙｉｎｇｈｉｇｈｔｈｒｏｕｇｈｐｕｔｓｅｑｕｅｎｃｉｎｇｔｅｃｈｎｏｌ
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ｈｙｐｅｒｄｉｖｅｒｓｉｔｙａｎｄｈｉｇｈｃｏｍｍｕｎｉｔｙｃｏｍｐｏｓｉｔｉｏｎｃｏｍｐｌｅｘｉｔｙｏｆｅｎｄｏｐｈｙｔｉｃｆｕｎｇｉｉｎｔｈｅｒｏｏｔｏｆＳｈｅｘａｎｄｒｕｍＩｔｉｓａｌｓｏｐｒｏｖｅｄｔｈａｔｔｈｅｈｉｇｈ
ｔｈｒｏｕｇｈｐｕｔｓｅｑｕｅｎｃｉｎｇｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙｈａｓｇｒｅａｔａｄｖａｎｔａｇｅｆｏｒａｎａｌｙｚｉｎｇｅｃｏｍｍｕｎｉｔｙｃｏｍｐｏｓｉｔｉｏｎａｎｄｄｉｖｅｒｓｉｔｙｏｆｅｎｄｏｐｈｔｙｅｉｎｔｈｅｐｌａｎｔ
［Ｋｅｙｗｏｒｄｓ］　Ｓｉｎｏｐｏｄｏｐｈｙｌｕｍｈｅｘａｎｄｒｕｍ；ｅｎｄｏｐｈｙｔｉｃｆｕｎｇｉ；ｈｉｇｈｔｈｒｏｕｇｈｐｕｔｓｅｑｕｅｎｃｉｎｇ；ｃｏｍｍｕｎｉｔｙｃｏｍｐｏｓｉｔｉｏｎ；ｄｉｖｅｒｓｉｔｙ
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Ｔｅｔｒａｃｌａｄｉｕｍ ２５５３ ３５４９ ４５４４ ６８５５ １１３３ １２９６
ｕｎｃｌａｓｓｉｆｉｅｄ＿ｆｕｎｇｉ １６７０ ２３２１ １５４１ ２３２５ １５６ １７８
Ｈｙｍｅｎｏｓｃｙｐｈｕｓ １３９９ １９４５ ０ ０ ０ ０
Ｐｓｅｕｄｏｇｙｍｎｏａｓｃｕｓ １０３１ １４３３ １８ ０２７ ２３９ ２７３
ｕｎｃｌａｓｉｆｉｅｄ＿Ａｓｃｏｍｙｃｏｔａ ２７６ ３８４ ４３ ０６５ ０ ０
Ｔｒｕｎｃａｔｅｌａ ９３ １２９ １１ ０１７ ０ ０
ｕｎｃｌａｓｉｆｉｅｄ ３８ ０５３ ７９ １１９ １３ ０１５
Ｅｘｏｐｈｉａｌａ ２２ ０３１ １４ ０２１ ２２ ０２５
Ｃａｐｒｏｎｉａ １３ ０１８ ４６ ０６９ １ ００１
Ｌｅｃｙｔｈｏｐｈｏｒａ １２ ０１７ ０ ０ ０ ０
Ｔｒｉｃｈｏｄｅｒｍａ １２ ０１７ ０ ０ ４ ００５
Ｔａｌａｒｏｍｙｃｅｓ １２ ０１７ ４ ００６ ４１ ０４７
Ｄａｃｔｙｌａｒｉａ １０ ０１４ ０ ０ ０ ０
Ｈｙｐｏｃｒｅａ １０ ０１４ ０ ０ ０ ０
Ｆｌａｇｅｌｏｓｃｙｐｈａ ８ ０１１ ２３ ０３５ ０ ０
Ｃａｄｏｐｈｏｒａ ７ ０１ ４ ００６ １ ００１
ｕｎｃｌａｓｉｆｉｅｄ＿Ｌｅｏｔｉｏｍｙｃｅｔｅｓ ７ ０１ ０ ０ ０ ０
ｕｎｃｌａｓｉｆｉｅｄ＿Ｓｏｒｄａｒｉａｌｅｓ ３ ００４ ０ ０ ０ ０
Ｂｏｔｒｙｏｔｉｎｉａ ３ ００４ ０ ０ ３７ ０４２
Ｃｌａｖｕｌｉｎｏｐｓｉｓ ２ ００３ ０ ０ ０ ０
Ａｃｉｃｕｓｅｐｔｏｒｉａ ２ ００３ １ ００２ ０ ０
ｕｎｃｌａｓｉｆｉｅｄ＿Ｍａｇｎａｐｏｒｔｈａｃｅａｅ ２ ００３ １ ００２ １ ００１
Ｂｉｓｐｏｒｅｌａ １ ００１ ０ ０ ０ ０
Ｅｕｃａｓｐｈａｅｒｉａ １ ００１ ０ ０ ０ ０
Ｂｌｕｍｅｒｉａ １ ００１ ０ ０ ０ ０
ｕｎｃｌａｓｉｆｉｅｄ＿Ｈｅｌｏｔｉａｌｅｓ １ ００１ ２ ００３ ５ ００６
Ｍｒａｋｉａ １ ００１ ０ ０ ０ ０
Ｐａｒａｌｅｐｔｏｓｐｈａｅｒｉａ １ ００１ ０ ０ ０ ０
Ｂｊｅｒｋａｎｄｅｒａ １ ００１ ０ ０ ０ ０
ｕｎｃｌａｓｉｆｉｅｄ＿Ｃｅｒａｔｏｂａｓｉｄｉａｃｅａｅ １ ００１ ５ ００８ ０ ０
ｕｎｃｌａｓｉｆｉｅｄ＿Ｄｏｔｈｉｄｅｏｍｙｃｅｔｅｓ １ ００１ ３５ ０５３ ０ ０
ｕｎｃｌａｓｉｆｉｅｄ＿Ｓｅｂａｃｉｎａｃｅａｅ ０ ０ １２９ １９５ ７００６ ８０１４
Ａｓｐｅｒｇｉｌｕｓ ０ ０ ８１ １２２ １６ ０１８
ｕｎｃｌａｓｉｆｉｅｄ＿Ａｕｒｉｃｕｌａｒｉａｌｅｓ ０ ０ ９ ０１４ ０ ０
Ｓｅｉｍａｔｏｓｐｏｒｉｕｍ ０ ０ ８ ０１２ ０ ０
Ｃｌａｄｏｐｈｉａｌｏｐｈｏｒａ ０ ０ ４ ００６ ４ ００５
Ｇｏｌｏｖｉｎｏｍｙｃｅｓ ０ ０ ４ ００６ ０ ０
Ｓｅｌｅｎｏｐｈｏｍａ ０ ０ ４ ００６ １ ００１
Ｓｔｒｅｌｉｔｚｉａｎａ ０ ０ ４ ００６ ０ ０
Ｚｙｇｏｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ ０ ０ ３ ００５ ２ ００２
ｕｎｃｌａｓｉｆｉｅｄ＿Ｔｒｅｍｅｌｏｍｙｃｅｔｅｓ ０ ０ ３ ００５ ０ ０
ｕｎｃｌａｓｉｆｉｅｄ＿Ｔｒｅｃｈｉｓｐｏｒａｌｅｓ ０ ０ ２ ００３ ０ ０
ｕｎｃｌａｓｉｆｉｅｄ＿Ｃｈａｅｔｏｔｈｙｒｉａｌｅｓ ０ ０ ２ ００３ １３ ０１５
ｕｎｃｌａｓｉｆｉｅｄ＿Ｘｙｌａｒｉａｌｅｓ ０ ０ ２ ００３ ０ ０
Ｍａｌａｓｅｚｉａ ０ ０ ２ ００３ ０ ０
Ｉｎｏｎｏｔｕｓ ０ ０ １ ００２ ０ ０
Ｇｅｏｍｙｃｅｓ ０ ０ ０ ０ １６ ０１８
Ｒｕｓｕｌａ ０ ０ ０ ０ １１ ０１３
Ｌｏｐｈａｒｉａ ０ ０ ０ ０ ８ ００９
Ｃｒｙｐｔｏｓｐｏｒｉｏｐｓｉｓ ０ ０ ０ ０ ５ ００６
ｕｎｃｌａｓｉｆｉｅｄ＿Ｂａｓｉｄｉｏｍｙｃｏｔａ ０ ０ ０ ０ ２ ００２
Ａｕｒｅｏｂａｓｉｄｉｕｍ ０ ０ ０ ０ ２ ００２
Ｐｅｎｉｃｉｌｉｕｍ ０ ０ ０ ０ １ ００１
Ｐｏｄｏｓｐｈａｅｒａ ０ ０ ０ ０ １ ００１
ｕｎｃｌａｓｉｆｉｅｄ＿Ｈｙｇｒｏｐｈｏｒａｃｅａｅ ０ ０ ０ ０ １ ００１
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ＬＤ２ ６６２９ ２５３ ２７８ ３９８９３ ３９９２２ ０９８ ０１８
ＬＤ３ ８７４２ １３８ １７５ ３３８４５ ２５０００ ０９９ ０３２
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［３］　ＳｔｏｎｅＪＫ，ＢａｃｏｎＣＥ，ＷｈｉｔｅＪＦＡｎｏｖｅｒｖｉｅｗｏｆｅｎｄｏｐｈｙｔｉｃ
ｍｉｃｒｏｂｅｓ：ｅｎｄｏｐｈｙｔｉｓｍｄｅｆｉｎｅｄＭｉｃｒｏｂｉａｌｅｎｄｏｐｈｙｔｅｓ［Ｍ］Ｎｅｗ
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［５］　ＳｃｈｕｓｔｅｒＳＣＮｅｘｔｇｅｎｅｒａｔｉｏｎｓｅｑｕｅｎｃｉｎｇｔｒａｎｓｆｏｒｍｓｔｏｄａｙ′ｓｂｉｏｌ
ｏｇｙ［Ｊ］ＮａｔＭｅｔｈｏｄｓ，２００８，５（１）：１６
［６］　ＺｉｍｍｅｒｍａｎＮＢ，ＶｉｔｏｕｓｅｋＰＭＦｕｎｇａｌｅｎｄｏｐｈｙｔｅｃｏｍｍｕｎｉｔｉｅｓ
ｒｅｆｌｅｃｔｅｎｖｉｒｏｎｍｅｎｔａｌｓｔｒｕｃｔｕｒｉｎｇａｃｒｏｓｓａＨａｗａｉａｎｌａｎｄｓｃａｐｅ
［Ｊ］．ＰｒｏｃＮａｔｌＡｃａｄＳｃｉＵＳＡ，２０１２，１０９：１３０２２
［７］　ＪｕｍｐｐｏｎｅｎＡ，ＪｏｎｅｓＫＬＭａｓｓｉｖｅｌｙｐａｒａｌｅｌ４５４ｓｅｑｕｅｎｃｉｎｇｉｎ
ｄｉｃａｔｅｓｈｙｐｅｒｄｉｖｅｒｓｅｆｕｎｇａｌｃｏｍｍｕｎｉｔｉｅｓｉｎｔｅｍｐｅｒａｔｅＱｕｅｒｃｕｓ
ｍａｃｒｏｃａｒｐａｐｈｙｌｏｓｐｈｅｒｅ［Ｊ］ＮｅｗＰｈｙｔｏｌ，２００９，１８４：４３８
［８］　ＮａｔｈａｎｉｅｌＬＲａｉｚｅｎＦｕｎｇａｌｅｎｄｏｐｈｙｔｅｄｉｖｅｒｓｉｔｙｉｎｆｏｌｉａｇｅｏｆ
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