全 文 :太空环境对甘草中甘草酸生物合成相关基因的
诱变作用分析
严硕1,高文远1,路福平2,赵润怀3
(1.天津大学 药物科学与技术学院,天津 300072;
2.天津科技大学 生物工程学院,天津 300457;3.中国药材集团公司,北京 100195)
[摘要] 目的:探讨太空环境对甘草酸相关基因的诱变作用分析。方法:利用返回式卫星搭载甘草,18d后返回地球,搭
载种子返回地面后与对照组同时种植于实验田中,采集三年生甘草叶子,对甘草酸形成相关基因ITS序列,β香树酯醇合成酶
基因的多态性以及基因表达差异进行了研究。结果:甘草经过卫星搭载后,甘草酸相关基因ITS序列没有发生变化,而甘草酸
合成关键基因β香树酯醇合成酶基因某些位点呈现了差异性,并且太空环境对甘草酸合成关键基因 β香树酯醇合成酶基因
表达有一定影响。结论:太空环境对甘草酸相关形成和表达产生一定影响,这些变化对于揭示太空环境对甘草酸形成的基因
机制具有重要意义,并且对于后期选育甘草优良种质奠定基础。
[关键词] 甘草;航天;ITS序列;β香树酯醇合成酶基因
[收稿日期] 20090226
[基金项目] 国家自然科学基金项目(30472148;30772732)
[通信作者] 高文远,Tel/Fax:(022)87401895,Email:pharmgao
@tju.edu.cn
甘草GlycyrhizauralensisFisch是豆科多年生草
本植物,其根茎具有补脾益气、止咳祛痰、清热解毒、
调和诸药等功效,是最常用的中药之一,具有“十方
九草”之说。甘草是我国应用最广泛的药用植物之
一,也是西部地区重要的固沙生态植物,近年来,由
于大量的掠夺式采挖,已经对甘草种质资源多样性
构成了严重的威胁[1]。其资源和栽培问题一直未
能解决,主要原因是缺乏优良的甘草种质资源。人
工种植甘草是野生资源的替代品,但是低萌发率以
及有效成分含量低限制了人工种植甘草的大规模发
展[2]。国内外空间植物学表明,太空环境可以为优
良种质的培育提供地面难以达到的诱变条件[3],选
育甘草优良种质资源。
本实验组前期研究表明,对卫星搭载甘草一年
生根的甘草酸(GA)和甘草苷(LQ)的含量分别比对
照组高219,118倍。实验表明空间环境对甘草种
质产生一定诱变作用并且影响其次生代谢产物含
量[4]。本实验选择常用分子标记ITS序列[5]和甘草
酸合成的关键酶基因 β香树酯醇合成酶基因[6]作
为研究对象,分析它们在航空飞行组以及地面对照
组中的变异,并对β香树酯醇合成酶基因表达差异
进行了研究,由于 β香树酯醇合成酶基因比较长,
如已经报道的光果甘草β香树酯醇合成酶的 cDNA
长度达2600bp。如果考虑到内含子的存在,长度
更长,因此本实验选择了该基因的第一外显子作为
研究对象,初步探讨该基因和甘草酸形成的相关性,
并通过逆转录,对该基因表达进行研究,为探讨航空
环境对甘草酸诱变形成的基因机制提供依据。
1 材料
1.1 植物
实验所用的甘草种源见表1,由北京航天总公司
搭载于我国发射的“神州”号返回式卫星上,在太空中
飞行18d,(飞行回收舱平均辐射剂量为0102mGy
·d-1,飞行远地点距地球350km,重力为10-6),地
面对照组是与搭载种子同一批甘草种子,种子返地
后,由中国药材集团总公司将太空飞行组和地面对照
组同时种植到实验田中。太空飞行组和地面对照组
的甘草叶子均为三年生,实验田采集。每种材料分别
取10株,各混为1份样品,提取DNA和RNA基因组。
实验材料均经过天津大学药物科学与技术学院
高文远教授鉴定。
1.2 化学药品
引物从上海生工生物工程技术服务有限公司
(上海,中国)购得,用于分析的 Taq酶,10×PCR缓
冲液,dNTP均购于宝生物工程(大连)有限公司,其
他化学试剂均为国产分析纯。
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表1 甘草种质来源
甘草名称 种源地区
1 内蒙古鄂尔多斯鄂托克前旗太空组
2 内蒙古鄂尔多斯鄂托克前旗地面对照组
3 内蒙古鄂尔多斯杭锦旗太空组
4 内蒙古鄂尔多斯杭锦旗地面对照组
2 方法
2.1 DNA组的提取
提取2个品种太空飞行组和地面对照组甘草
DNA,DNA提取方法采用3%的CTAB法,并做改良,
液氮研磨时加入PVP干粉,水浴时间调整到1h,所
得DNA粗提物经RNAase37℃保温1h,乙醇沉淀后
溶于50μLTE,分别经08%琼脂糖凝胶电泳(EB)
和01TE稀释后低温(-20℃)保存备用。
2.2 甘草酸形成相关基因差异研究
2.2.1 ITS序列差异 引物序列:P1,5′GGAAG
TAAAAGTCGTAACAAGG3′;P2,5′GCTGCGTTCT
TCATCGATGC3′。PCR反应体系50μL反应体系
中,10×PCRbufer5μL;dNTP1μL;上下游引物各
2μL;BSA5μL;TaqDNA聚合酶03μL,10~20ng
模板DNA,超纯水补足 50μL。扩增程序为94℃
预变性6min;94℃变性1min;56℃复性1min;72
℃延伸 1min;共35个循环,72℃ 延伸10min。用
优化后的 PCR扩增条件扩增的 PCR产物,条带清
晰,长度在700bp左右,切胶回收后测序。
2.2.2 β香树酯醇合成酶第一外显子序列差异研
究 引物设计 Pa1,5′ATGTGGAGGCTGAAGAT
AGCGG3′;Pa2,5′CTGAAAACGCCAAAGGAGG
3′。反应体系为10×PCRbufer5μL,dNTP1μL,
上游引物和下游引物各2μL,BSA2μL,TaqDNA
聚合酶04μL,10~20ng模板DNA,超纯水补足50
μL。扩增程序:94℃预变性 6min,94℃ 变性 1
min,56℃退火150min,72℃ 延伸1min共35个
循环,72℃延伸10min。用优化后的PCR扩增条件
扩增的PCR产物,条带清晰,长度在200bp左右,切
胶回收后测序。
2.2.3 甘草酸形成相关基因 β香树酯醇合成酶表
达差异研究 Trizol法提取2个品系航空组和地面
对照组的甘草 RNA基因组提取,逆转录为 cDNA,
参照文献[7]。
引物设计:Pa1,5′ATGTGGAGGCTGAAGAT
AGCGG3′;Pa2,5′CTGAAAACGCCAAAGGAGG
3′。反应体系50μLPCR管中混合下列组分10×
PCRbufer50μL,dNTP(10mmol·L-1)10μL,
Pa1(5μmol·L-1)20μL,Pa2(5μmol·L-1)20
μL,cDNA30μL,TaqDNA酶,03μLBSA(25g·
L)50μL,总500μL。混匀后按下列条件进行反
应,94℃ 6min,94℃ 1min,53℃ 2min;72℃ 1
min,共45个循环。72℃10min,取5μLPCR产物
在10%的琼脂糖凝胶上电泳,检测是否扩增出目
的片段。
3 结果
3.1 ITS序列差异
通过 Genebank中已有的 ITS序列比较,查阅
《中国植物志》甘草 ITS序列,杭锦旗与鄂托克前旗
组中太空飞行组以及地面对照组的ITS序列没有发
生变化,结果表明太空环境对甘草核DNA没有发生
诱变作用,ITS序列并没有反应太空环境对甘草酸
积累相关变化。
3.2 甘草酸形成相关基因 β香树酯醇合成酶基因
差异的研究
通过Genebank中已有的 β香树酯醇合成酶基
因序列比较,2个品系中,95位杭锦旗为 G,而鄂托
克前旗为A。杭锦旗品系中,太空飞行组和地面对
照组在13位以及190位产生变异,13位太空飞行
组为G,而地面对照组为 A。190位太空飞行组为
G,而地面对照组为 A。鄂托克前旗品系中,太空飞
行组和地面对照组在11位以及21位产生变异,11
位太空飞行组为 C,而地面对照组为 T。21位太空
飞行组为C,而地面对照组为 G。这些变化表明太
空环境对甘草中甘草酸基因产生了一定的诱变作
用,表现在一些碱基变化上。
3.3 甘草酸形成相关基因 β香树酯醇合成酶基因
表达的研究
测序结果与基因组测序结果一致,说明DNA变
异位点能够表达出来,见图1。这对于研究太空环
境对甘草酸形成诱变机制有重要意义。
4 讨论
已经有许多太空搭载试验,包括马铃薯,番茄,
真菌,结果表明,太空已经对这些植物产生了形态变
异和DNA诱变作用。太空环境对药用植物桔梗,藿
香的影响,高文远等[8]飞行后的药用植物进行了电
镜观察,试验表明太空搭载后药用植物超微结构发
生了变化。
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1.杭锦旗地面对照组;2.杭锦旗太空飞行组;
3.鄂托克前旗地面对照组;4.鄂托克前旗太空飞行组;M.marker。
图1 甘草酸形成相关基因β香树酯醇合成酶基因
表达差异谱图
ITS序列在一些药用植物中已被证实能够反映
化学成分的含量变异,因而推测其也能反映甘草酸
的含量变异。差异结果显示参照《中国植物志》,查
阅甘草ITS序列,发现太空飞行组与地面对照组没
有差异,而且杭锦旗和鄂托克前旗没有差异,这表
明,太空环境对于核 DNAITS序列没有产生诱变。
分析原因可能是,从理论上讲,ITS序列是18S58S
28S的内转录间隔区,属于非编码区,不是功能基
因,不能直接反映甘草酸的积累,它和甘草酸的相关
性可能是 ITS序列和甘草酸关键功能基因同步进化
的原因。
本实验表明太空环境对甘草基因发生诱变作用,
表现在一些碱基变化上。通过RTPCR方法研究β
香树酯醇合成酶基因表达差异研究,测序结果与基因
组测序结果一致,说明DNA变异位点能够表达出来。
太空搭载植物产生的优良性状遗传问题,蒋兴
村等[9]研究了卫星搭载对水稻种子遗传性的影响,
认为航天诱变材料一般在诱变第1代生长发育发生
变异,到第2代大多数性状发生广谱分离,在第3代
中这些变异的性状基本稳定地遗传给后代。如果太
空搭载甘草产生的优良变异性状能稳定遗传给下一
代,必能加快甘草育种育种速度,从而选育出优良甘
草种质资源。由于没有导入新的基因太空育种不会
产生安全问题[10],所以甘草太空育种必定有一个光
明的未来。
[参考文献]
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Efectsofspaceflightonglycyrrhizicacidrelatedgenemutation
inGlycyrrhizauralensis
YANShuo1,GAOWenyuan1,2,LUFuping2,ZHAORunhuai3
(1.ColegeofPharmaceuticalsandBiotechnology,TianjinUniversity,Tianjin300072,China;
2.InstituteofBiologicalEngineeringofChineseMedicine,TianjinUniversityofScienceandTechnology,Tianjin300074,China;
3.ChinaNationalgroupCorpoftraditional&herbalMedicine,Beijing100195,China)
[Abstract] Objective:TosubstantiatetheefectsofspaceflightontheglycyrhizicacidrelatedgenemutationinGlycyrhiza
uralensis.Method:Licorice(G.uralensis)seedswerecariedbyarecoverablesatelitefor18days(theaverageradiationdoseinthe
flightrecoverymodulewas0.102m·d-1,theorbitsemidiameter350km,gravity10-6).Afterreturnedtotheearth,thesatelite
flownseedsandtheunflownseeds(groundcontrol)wereplantedinthefieldsofexperimentalfarm.Theleavesofeachgroupwere
usedforstudyingtheefectsofspaceflightontheglycyrhizicacidrelatedgenemutationincludingITSsequenceandβamyrinesyn
thasegene.Result:TheITSsequenceofglycyrhizicacidrelatedgeneshowednochangesafterspaceflight.Whileβamyrinesynthase
genehadsomediferentpointsafterspaceflightandthediferentpointscouldgettheexpression.Conclusion:Theresultsindicatedthat
spaceflightinducegeneticvariationinG.uralensisandspaceflightcouldalsohaveefectsonglycyrhizicacidrelatedgenemutationin
G.uralensis.Itmayneedtofurtherresearchhowthespaceflightinducedthemutationoftheglycyrhizicacidrelatedgene.Theresults
suggestedthatrecoverablesateliteflownconditioncouldbringinheritablemutagenicefectsonG.uralensisseedsandmaybeusedasa
toolforacceleratingtheprogressinG.uralensisbreeding.
[Keywords] Glycyrhizauralensis;spaceflight;ITS;βamyrinesynthasegene
[责任编辑 吕冬梅]
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