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Isolation and identify of the rice OsGSTLc promoter

水稻OsGSTLc启动子的分离和鉴定



全 文 :广 西 植 物 Guihaia Mar.2014,34(2):256-262           http://journal.gxzw.gxib.cn 
DOI:10.3969/j.issn.1000G3142.2014.02.022
胡廷章,杨俊年,陈再刚,等.水稻OsGSTLc启动子的分离和鉴定[J].广西植物,2014,34(2):256-262
HuTZ,YangJN,ChenZG,etal.IsolationandidentifyofthericeOsGSTLcpromoter[J].Guihaia,2014,34(2):256-262
水稻OsGSTLc启动子的分离和鉴定
胡廷章∗,杨俊年,陈再刚,吴应梅
(重庆三峡学院 生命科学与工程学院,重庆404100)
摘 要:半定量RTGPCR分析表明,OsGSTLc在水稻根中的表达受绿磺隆的诱导.从水稻基因组中分离到
的OsGSTLc读码框上游22171bp序列,在起始密码ATG上游G86bp处有CAATGbox,但在CAATGbox与
读码框之间没有典型的TATAGbox.因此,OsGSTLc启动子是无TATA框启动子.将OsGSTLc启动子5′G
端系列缺失后,分别与GUS报告基因融合,获得GSTL2171::GUS、GSTL1761::GUS、GSTL962::GUS 和
GSTL525::GUS表达载体,利用农杆菌介导转化水稻,获得转基因水稻,均能启动下游GUS 报告基因的表
达.氯磺隆处理后,转入GSTL2171::GUS、GSTL1761::GUS 和GSTL962::GUS 的水稻植株根部的GUS
活性明显增加.氯磺隆诱导的应答元件在G962~G525bp的范围内.
关键词:OsGSTLc;诱导;缺失分析;启动子;水稻
中图分类号:Q71  文献标识码:A  文章编号:1000G3142(2014)02G0256G07
IsolationandidentifyofthericeOsGSTLcpromoter
HUTingGZhang∗,YANGJunGNian,CHENZaiGGang,WUYingGMei
(SchoolofLifeSciencesandEngineering,ChongqingThreeGorgesUniversity,Chongqing404100,China)
Abstract:TheexpressionofOsGSTLcinricerootswasinducedbychlorsulfuronthroughsemiGquantitativeRTGPCR
analysisdemonstrated.A2171bpupstreamsequenceofthetranslationstartcodonATGofOsGSTLcgenewasisoG
latedfromthegenomicDNAofrice,whichcontainedaputativeCAATGboxatpositionG86bpupstreamofATG,but
therewasn’tTATAGboxbetweentheCAATGboxandATG.Therefore,OsGSTLcpromoterwasaTATAGlessproG
moter.Todefinethecorepromotersequence,aseriesof5′truncationderivativesofGST2171werefusedtoaGUS
reportergenetoconstructGSTL2171::GUS,GSTL1761::GUS,GSTL962::GUSandGSTL525::GUS,respecG
tively.ThefourfusiongeneswereintroducedintoriceplantsbyAgrobacteriumGmediatedtransformation,alpromotG
erfragmentswith5′GdeletiondrivedsuccessfulytheexpressionofGUSreportgene.Quantitativefluorescenceassays
showedthattheGUSactivitiesintherootsofGSTL2171::GUS,GSTL1761::GUSandGSTL962::GUStransgenG
icriceseedlingswereupregulatedbychlorsulfuron.ThetranscriptionalactivationelementofchlorsulfuronmaybeloG
catedbetweenpositionsG962andG525.
Keywords:OsGSTLc;induction;deletionanalysis;promoter;rice
  谷胱甘肽转移酶(Glutathionetransferases,
GSTs;EC2.5.1.18)在植物的初级代谢和次级代谢、
胁迫耐受和细胞信号转导中行使功能,影响植物的
生长发育.植物GST的主要功能在于解除外界毒
素以及内源有毒代谢物的侵害,能催化还原型谷胱
甘肽的疏基与多种亲电和亲脂底物的结合,生成水
收稿日期:2013G07G09  修回日期:2013G10G08
基金项目:重庆市自然科学基金(cstc2011jA80027,cstc2012jA80009);重庆市教育委员会科学技术研究项目(KJ121106,KJ131101).
作者简介:胡廷章,博士,教授,主要从事生物化学与分子生物学研究,(EGmail)tzhu2002@yahoo.com.cn.
∗通讯作者
溶性的产物,从而降低底物的毒性(Edwardsetal.,
2000;Dixonetal.,2002b;Moons,2003).GSTF和
GSTU的主要功能是与包括杀虫剂、除草剂在内的
异生素结合,从而解除这些异生素毒性;GSTT主要
是作为谷胱甘肽过氧化酶,还原有机氢过氧化物;
DHAR催化脱氢抗坏血酸还原成抗坏血酸;GSTL
作为植物的抗氧化酶起作用(Dixonetal.,2002a;
Edwardsetal.,2005);有些GST在细胞的氧化还
原稳态和调节细胞程序衰老中起作用(Moons,
2005);GST也作为细胞信号在胁迫耐受中起作用
(Loyaletal.,2000).GSTZ具有依赖谷胱甘肽的
异构酶活性,催化顺丁烯二酸单酰乙酰乙酸异构化
成反丁烯二酸单酰乙酰乙酸(Dixonetal.,2000).
GST是个多基因家族,自20世纪70年代从玉
米中克隆到能解除除草剂毒性的GST基因以来,许
多GST和与GST类似的序列已经从多种植物中得
到克隆(Shimabukuroetal.,1970).目前,至少从
17种植物中分离到GST基因,己经发现拟南芥有
53个GST基因,大豆有25个GST基因,玉米有42
个GST基因,水稻有79个GST基因,毛果杨有81
个GST基因(Chietal.,2011;Dixonetal.,2002b;
McGonigleetal.,2000;Soranzoetal.,2004;WagG
neretal.,2002).根据蛋白同源性和基因组织结
构,植 物 GST 分 为 φ(GSTF)、τ(GSTU)、ζ
(GSTZ)、θ(GSTT)、λ(GSTL)和脱氢抗坏血酸还原
酶(DHARs)、四氯对苯二酚脱卤素酶(TCHQD)和
微粒体谷胱甘肽转移酶(MicrosomalGclassGSTs)
等8类(Mohsenzadeh等,2011).在研究水稻GST
家族基因功能的过程中,发现OsGSTLc基因在水
稻根中的表达受到除草剂氯磺隆的诱导.为了分析
OsGSTLc在水稻中的表达特性,研究OsGSTLc启
动子的功能,本实验从水稻基因组中分离到OsGG
STLc基因的启动子,并对该启动子进行了研究.
1 材料与方法
1.1材料
水稻“中华11号”(Oryzasativacv.Zhonghua
11)、农杆菌LBA4404、大肠杆菌TOP10菌株和植
物转化载体pCAMBIA1301由重庆三峡学院生命
科学与工程学院实验室保藏.
1.2方法
1.2.1材料培养和处理 取水稻种子,用自来水浸泡
2d,种子发芽露白后,铺在纱布上;在自然条件下培
养10d后,转入0.02%的氯磺隆水溶液中培养.在
转入氯磺隆水溶液后的0、2、6、10、24和48h分别
收集水稻幼苗的根和叶.
1.2.2RNA提取和半定量RTGPCR分析 用Trizol
试剂分别提取水稻幼苗根和叶的总RNA,取1μg
RNA为模板,以olig(dT)18为反转录引物进行反
转录,合成cDNA.半定量 RTGPCR是以反转录产
物为模板,以引物OsGSTLcsf和 OsGSTLcsr(表
1)扩增 OsGSTLc基因片段,以引物 ACTIN1f和
ACTIN1r(表1)扩增持家基因ACTIN1片段为内
参(McElroy等,1990),扩增条件为94℃变性30s、
58℃退火30s、72℃延伸30s,进行28个循环.
表1 PCR扩增引物序列
Table1 PrimersequencesusedforthePCRamplification
序号
Sequence
No.
引物名称
Nameof
theprimers
 序列
 Sequence









OsGSTLcsf
OsGSTLcsr
ACTIN1f
ACTIN1r
pGSTLcf1
pGSTLcf2
pGSTLcr
p1301f
p1301r
5′GCGTTCAACAAAGCATCGTACG3′
5′GGCAAAAACTGTGGGTCCTGTG3′
5′GTCCGTGACATCAAGGAAAAGG3′
5′GGATATCAACATCGCACTTCATGG3′
5′GCACCCTGCAGCCATTAGTGTGAGTGTG
TTCGGTGAG3′
5′GCACCCTGCAGGAAATCGGTAGCATCTG
CTTCAGGAG3′
5′GAACAAGCGGTTTATTCTTCTCCTCG3′
5′GCCAGGCTTTACACTTTATGCTTCCG3′
5′GCCTAACCAAGAAAATGAAGGAGAAG3′
1.2.3基因上游调控序列的分离 用植物DNA提取
试剂盒提取水稻总DNA,并以此为模板.根据OsGG
STLc读码框上游的DNA序列设计引物pGSTLcf1
和pGSTLcr,在正向引物5′G端引入了PstI酶切位
点,扩增片段长度为2254bp.将扩增到的DNA片
段克隆到pENTR/DGTOPO载体上,构建的质粒命名
为pGSTLcGTOPO,测序后,利用 PLACE(http://
www.dna.afrc.go.jp)和 PlantCARE(http://intra.
psb.ugent.be:8080/PlantCARE/)进行序列分析.
1.2.4植物表达载体的构建 通过PstI和NcoI酶切
位点将pGSTLcGTOPO载体上的OsGSTLc读码框上
游的2171bp片段插入到pCAMBIA1301载体上,取
代GUS 基因前的35S启动子,得到GSTL2171::
GUS 转 植 物 载 体;用 Hind Ⅲ 和 NcoⅠ酶 切
GSTL2171::GUS质粒,回收小的OsGSTLc启动子
片段,该片段的大小为1761bp.通过Hind Ⅲ和
NcoⅠ酶切位点克隆到pCAMBIA1301载体上,得
7522期           胡廷章等:水稻OsGSTLc启动子的分离和鉴定
到GSTL1761::GUS 载体;根据OsGSTLc启动子
序列设计引物pGSTLcf2(表1),用引物pGSTLc
f2和pGSTLcr以pGSTZ2GTOPO质粒为模板作
PCR,PCR产物通过PstⅠ和NcoI酶切位点克隆到
得到 pCAMBIA1301载体上,得到 GSTL962::
GUS 载体;用 XbaⅠ和 NcoⅠ酶切GSTL962::
GUS质粒,回收小的 OsGSTLc 启动子片段,用
XbaⅠ和NcoⅠ酶切位点克隆到pCAMBIA1301载
体上,得到GSTL525::GUS载体.
1.2.5植物转化和转基因植株的鉴定 采用冻融法
将植物转化载体 GSTL2171::GUS、GSTL1761::
GUS、GSTL962::GUS和GSTL525::GUS分别转
化农杆菌LBA4404(Hofgen等,1988),采用农杆菌
介导共培养法转化水稻,25mg/L潮霉素筛选转基
因水稻(Hu,2008;段承杰等,2012).按pCAMG
BIA1301载体GUS基因上游插入的启动子两侧的
载体序列设计引物p1301f和p1301r(表1),以转基
因水稻DNA为PCR模板进行PCR分析.
1.2.6 转基因植株的 GUS活性定量测定 转
GSTL2171::GUS、GSTL1761::GUS、GSTL962::
GUS和GSTL525::GUS的水稻种子在水中培养,待
种子萌发出苗10d,转入0.02%氯磺隆溶液中培养,
分别在0、6、8、10和12h收取幼苗的根和叶.参考
Jefersonetal.(1987)方法进行GUS活性检测.
2 结果与分析
2.1OsGSTLc基因诱导表达
半定量 RTGPCR分析表明,OsGSTLc在水稻
根中的本底表达量(诱导0h)非常低,经绿磺隆处
理2h后表达量开始升高,诱导6h时表达量达到
峰值,之后逐渐下降,到48h时,OsGSTLc的表达
量逐渐回到接近诱导之前的水平(图1:a).而在水
稻的叶中OsGSTLc的表达不受绿磺隆影响,绿磺
隆处理后表达水平没有明显变化(图1:b).说明
OsGSTLc在水稻根中的表达受绿磺隆的诱导.
2.2OsGSTLc基因启动子的克隆
以水稻总 DNA为模板,由引物pGSTLcf和
pGSTLcr进行PCR扩增(表1),将扩增产物进行
琼脂糖凝胶电泳分析,得到约2250bp左右的条
带.回收PCR产物,并与pENTRTOPO载体的连
接、鉴定、测序.测序结果显示,扩增得到的片段包
含OsGSTLc读码框上游的2171bp序列.利用
图1 半定量RTGPCR分析OsGSTLc的表达 a.根;b.叶
Fig.1 OsGSTLcgeneexpressionbysemiGquantitative
RTGPCRanalysis a.roots;b.leaves
PLACE(http://www.dna.affrc.go.jp)和 Plant
CARE(http://intra.psb.ugent.be:8080/PlantG
CARE/)分析,发现在起始密码ATG上游G86bp处
有推测的CAATGbox存在,但在CAATGbox与读
码框之间没有典型的TATAGbox存在(图2).
2.3植物转化载体的构建
为研究OsGSTLc启动子的功能,对启动子的
5′G端侧翼序列进行系列缺失,从而得到2171、
1761、962和525bp的启动子片断(图2,图3).用
获得的这些启动子片段取代pCAMBIA1301载体
的GUS基因上游的35S启动子,获得不同长度的
启动子与GUS融合的植物转化载体(图3).
2.4转基因水稻植株的获得
将 GSTL2171::GUS、GSTL1761::GUS、
GSTL962::GUS 和GSTL525::GUS 载体由农杆
菌AGL0介导转化中花11号水稻,经潮霉素筛选,
获 得 GSTL2171::GUS、GSTL1761::GUS、
GSTL962::GUS 和GSTL525::GUS 转化的植株
都在5株以上.进行PCR鉴定表明,绝大部分转化
株都能扩增出特异条带,证明外源基因已经整合到
水稻基因组中(图4).
2.6OsGSTLc启动子对氯磺隆响应的转录调节
GUS活性分析表明,未经氯磺隆处理的转基因
幼苗中,转入GSTL525::GUS 的水稻幼苗根和叶
的GUS活性最高,GSTL962::GUS 的水稻幼苗根
和叶 的 GUS 活 性 最 低,GSTL1761::GUS 和
GSTL962::GUS的GUS活性无明显差异(图5).
在氯磺隆处理后,转入 GSTL2171::GUS、
GSTL1761::GUS和GSTL962::GUS 的水稻植株
根部的GUS活性得到明显增强,峰值大约在绿磺
852 广 西 植 物                  34卷
图2 OsGSTLc启动子序列分析 下画线标出的是用于5′G端缺失的引物和酶切位点HindIII、XbaI、NcoI;阴影标出的是推测的
CAATGbox;加粗的ATG是翻译的起始密码.
Fig.2 NucleotidesequenceoftheOsGSTLcpromoter TheprimersandHindIII,XbaIandNcoIsiteusedfor5′GdeletionareunderG
lined;theputativeCAATGboxisshadedgray;thetranslationstartcodonATGisblack.
隆处理后6h左右,GUS活性是未经处理的3~4
倍(图7),而叶中的GUS活性没有多大变化(图6).
在转入GSTL525::GUS 的水稻植株的根和叶,
GUS活性几乎不受绿磺隆的影响(图5).
3 结论与讨论
生物和非生物胁迫会诱导一些植物GST的表
达.如受炭疽病(Colletotrichumorbiculare)感染
的烟草,其中NbGSTU1和 NbGSTU3的表达得到
增强(Deanetal.,2005).非生物因素如冷、热、重
金属离子、盐、PEG、H202、甲基紫精、脱落酸、水杨
酸、生长素、细胞分裂素可引起一些GST的响应,除
草剂和除草剂安全剂也会诱导一些GST表达(胡廷
章等,2007).在一些情况下,GST因对一般的细胞
损伤或除草剂和化学毒素引起的氧化胁迫反应而受
到诱导(Urbaneketal.,2005).玉米中的GST可
促使除草剂阿特津脱毒,就是因为除草剂形成的氧
9522期           胡廷章等:水稻OsGSTLc启动子的分离和鉴定
图3 OsGSTLc启动子与GUS融合的植物转化载体
Fig.3 Schematicdiagramofplantexpressioncassettes
图4 转基因水稻植株DNA的PCR检测 a.GSTL2171::GUS;b.GSTL1761::GUS;c.GSTL962::GUS;d.GSTL525::GUS.
M.DNAmarker;NT.非转基因植株(阴性对照);1~5.转基因植株;P.表达载体(阳性对照).
Fig.4 PCRanalysisoftransgenicrice a.GSTL2171::GUS;b.GSTL1761::GUS;c.GSTL962::GUS;d.GSTL525::GUS.M.DNA
marker;NT.NonGtransgenicrice;1-5.Independenttransgeniclines;P.Exptessionvector.
图5 转基因水稻幼苗的GUS活性分析 数据是3个转基因独立株系测得的平均值±SD;∗表示标记的氯磺隆处理与未处理水
稻的GUS活性达到P<0.05差异水平.
Fig.5 AnalysisofGUSactivityoftransgenicriceseedlings TheaverageGUSactivityandstandarddeviationswereobtainedfromthree
independenttransgeniclines;∗denotediferencesbetweenmeanvaluesmeasuredintheindicatedriceseedlingstreatedbychlorsulfuroncomparedto
untreatedriceseedlingsareP<0.05.
胁迫能诱导 GST大量表达(Shimabukuroetal.,
1970),其它如磺酰脲类、异丙甲草胺、硫胺甲酸亚
砜、氯乙酰苯胺和联苯醚类等除草剂也可诱导GST
表达(胡廷章等,2007).而在另一些情况下,GST
062 广 西 植 物                  34卷
的诱导则是其对特异胁迫作用的响应,激发起植物
的防御反应,如经除草剂安全剂处理的禾谷类植物,
通过增加包括GST在内的解毒酶表达而增强其对
除草剂的耐受性(Daviesetal.,1999).OsGSTLc
在水稻根中的表达受绿磺隆的诱导,OsGSTLc很可
能在解除除草剂毒性方面发挥作用.
真核生物有3种RNA 聚合酶,每一种都有自
己特定的启动子类型.PolGⅠ负责rRNA 转录,
PolGⅡ负责tDNA和5SrDNA的转录,其启动子位
于转录的DNA序列之内,称为下游启动子.PolGⅢ
负责编码蛋白质基因和部分snRNA 基因的转录.
PolGⅡ启动子分为含有TATAbox的启动子(TAG
TApromoter)和不含有TATAbox的启动子(TAG
TAGlesspromoter)两大类(左永春等,2009).在
OsGSTLc启动子的CAATGbox与读码框之间没有
典型的TATAGbox存在,因此,OsGSTLc启动子是
无TATA框启动子.由于OsGSTLc基因编码的
是蛋白质,因此,PolGⅢ启动子存在不含TATAbox
的启动子.绝大多数植物启动子正确表达需要
TATAbox,而在没有TATAbox的启动子中,在
调控基因表达的过程中,可能存在着某些替代机制,
涉及到某种蛋白质因子与启动子中的某些DNA序
列相互作用.如AC2转座酶基因启动子无TATA
box,TPASE抑制转座作用是通过与起始点上游
100~180bp处结合而实现(Fridlenderetal.,
1996).
未经 氯 磺 隆 处 理 的 转 基 因 幼 苗 中,转 入
GSTL525::GUS 的水稻幼苗根和叶的 GUS活性
最高;当启动子的长度从525bp延长到962bp,转
基因水稻幼苗的根和叶的 GUS活性最低;而启动
子的长度再延长到1761bp,其 GUS活性有所升
高,但较GSTL525::GUS 的低得多;当启动子的长
度延长到2171bp时,转基因水道幼苗根和叶的
GUS活性没有多大变化,其GUS活性与1761bp
启动子的相似.这些结果说明在起始密码ATG上
游G1761~G1bp的范围存在完整的启动子;在G525
~G1bp和G1761~G962bp有增强基因表达的元件,
在G962~G525bp的范围内存在抑制基因表达的元
件;在G962~G525bp存在的抑制基因表达元件非常
强,其抑制能力远远超过了在G525~G1bp和G1761
~G962bp存在的增强基因表达元件的增强能力.
在绿磺隆处理后,转GSTL525::GUS 水稻植株的
根和叶中,GUS 活性几乎不受绿磺隆的影响;
GSTL2171:: GUS、 GSTL1761:: GUS 和
GSTL962::GUS 转基因水稻植株根部的 GUS活
性明显增强,其峰值大约在处理后6h;而叶中的
GUS活性没有多大变化.这说明在G962bp~G525
bp的范围内,存在绿磺隆诱导OsGSTLc基因在水
稻根表达的元件.结果与半定量RTGPCR分析一
致,即OsGSTLc在水稻幼苗根中的表达受到氯磺
隆的诱导.
有关GST基因家族启动子的研究报道较少.
拟南芥GST6基因的表达受到生长素、水杨酸和H2
02的诱导,其启动子具有1个ocs元件,OBF1能够
促进ocs 元件结合因子(OBF)与ocs 元件结合
(Chen等,1996).在转基因马铃薯中,玉米GSTG27
启动子可以驱动 GUS报告基因的表达,安全剂
R329148(3G二氯乙酰基G2,2,5G三甲基G1,3G唑烷酮)
的诱导使叶中GUS报告基因的表达提高40倍,而
在茎、根和块茎的表达是组成型的,不受诱导(RoG
bertsonetal.,2000).
在氯磺隆处理后6hOsGSTLc基因大量表达,
说明该基因对氯磺隆处理的应答反应快.另外,该
启动子在受诱导后的表达水平不是很高,仅使基因
的表达水平提高了3~4倍.这些特点有利于该启
动子在实际生产中的应用.因为在一些转基因植物
中,外源基因的过度表达往往会破坏植物自身体内
的平衡,从而影响植物的正常生长发育.在研究和
生产中,用一个受氯磺隆诱导的中度表达的启动子
引入外源基因,则有利于解决外源基因在植物中过
度表达的问题,使外源基因在转基因植物的表达得
到很好控制.本研究为OsGSTLc启动子的应用和
OsGSTLc基因功能的深入研究奠定了基础.
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