全 文 ：农业生物技术学报，2010年，第 18卷，第 4期，第 682~688页
Journal of Agricultural Biotechnology, 2010, Vol.18, No.4, 682~688
研究报告
A Letter
SSAP逆转座子分子标记在柿属植物遗传分析中的应用
杜晓云 1,2 张青林 2 黄建民 1 罗正荣 2*
1 江西省农业科学院园艺研究所，南昌 330200；2 华中农业大学园艺植物学教育部重点实验室，武汉 430070
* 通讯作者，luozhr@mail.hzau.edu.cn
摘 要 对 SSAP（特异序列扩增多态性；sequence-specific amplification polymorphism）在部分柿属植物种质
鉴定和亲缘关系分析中的应用进行了研究， 并对每个 SSAP引物单独用于柿属植物遗传分析的性能作了探
讨。基于 5个逆转座子引物的 25对 SSAP引物组合在供试 28份柿属（Diospyros L.）基因型中共扩增出 1 300
个位点（多态位点 93.38％），每对引物平均产生 52 个位点（含 48 个多态位点），表明 SSAP 是一种高多重比
例系数（multiplex ratio）和高多态性的标记系统；经 SSAP 数据的 UPGMA 聚类和主坐标分析，原产中国、日
本的柿种质（D.kaki Thunb.）及柿的近缘种各自单独成组，该聚类结果与部分已知亲缘关系的试材十分吻合，
表明 SSAP技术可用于柿属植物亲缘关系研究。 此外，在 25 对 SSAP引物组合中筛选出 3 对具高信息含量
的引物组合，将在柿属植物遗传关系研究中广泛应用。
关键词 柿属植物，种质鉴定，亲缘关系，逆转座子，特异序列扩增多态性 （SSAP）
Applification of SSAP Retrotransposon-based Molecular Marker for Genetic
Analysis ofDiospyros spp. (Ebenaceae)
Du Xiaoyun1,2 Zhang Qinglin2 Huang Jianmin1 Luo Zhengrong2*
1 Institute of Horticultural Sciences, Jiangxi Academy of Agricultural Sciences, Nanchang 330200, China; 2 Key Laboratory of Horticultural Plant
Biology Affiliated to Ministry of Education, Huazhong Agricultural University, Wuhan 40070, China
*Corresponding author, luozhr@mail. hzau. edu. cn
DOI: 10.3969/j.issn.1674-7968.2010.04.009
Abstract Sequence-specific amplification polymorphism (SSAP) retrotransposon-based molecular marker for
germplasm identification and genetic relationship analysis in the genus Diospyros were investigated, and the
performance of each SSAP primer pair when individually used for aforementioned studies was also studied in
detail. Twenty five SSAP primer pairs generated a total of 1 300 robust fragments among inter- and intra-species
genotypes examined, of which 1 214 (93.38%) were polymorphic with an average of 48 polymorphic bands per
primer pair, indicating that SSAP is a high multiplex ratio and high polymorphic marker system. The analysis of
genetic relationships of 28 genotypes based on the molecular data from SSAPs revealed that the Chinese
genotypes, Japanese genotypes and related species were distinctly separated and some genotypes known genetic
relationships were clustered together, which was consistent with previous studies, suggesting that SSAP was
feasible and reliable for the future genetic analysis in the genus of Diospyros. Additionally, three SSAP primer
pairs were found to be the most informative. Our results suggest that SSAP can be as a potentially powerful tool
for characterization of Diospyros germplasm in the future.
Keywords Diospyros L., Germplasm identification, Genetic relationship, Retrotransposon, Sequence-specific
amplification polymorphism (SSAP)
DOI: 10.3969/j.issn.1674-7968.2010.04.009
基金项目：本研究由国家自然科学基金（No. 30871686，No. 30921002），教育部高等学校博士学科点专项科研基金（新教师基金）
（No. 200805041008），江西省农业科学院创新基金（博士启动项目：2009 博 -8）共同资助。
收稿日期： 2009-04-08 接受日期：2009-05-08
SSAP （sequence-specific amplification polymorp-
hism） 是一种检测逆转座子和与其临近的酶切位点
之间 DNA 片段扩增多态性的逆转座子分子标记
（Waugh et al., 1997）， 已广泛应用于植物种质鉴定、
遗传多样性评价、系统进化研究、遗传连锁分析和遗
传图谱构建等许多领域 （Schulman, 2007; Mansour,
2008; DOnofrio et al., 2010）。 国内近年也有报道（娄
群峰等, 2007; 马小峰等, 2008）。 但现有文献多集中
于大田农作物，在木本果树植物上应用较少，且仅限
于品种鉴定。 已有的研究初步表明，该标记较其它标
记方法在果树种质鉴别， 尤其对芽变性状的鉴定方
面更具灵 敏性 （Labra, 2004; Venturi et al.,2006;
Bretó et al., 2001; 韦 杰, 2007）。 柿属植物中已经
开发出 IRAP和 REMAP逆转座子分子标记（杜晓云
和罗正荣, 2006; Guo et al., 2006），但 SSAP逆转座子
标记尚未见报道。 本研究在建立柿属植物 SSAP 技
术体系的基础上，探讨其在柿属种质鉴定、亲缘关系
研究和遗传变异分析等领域的应用效果， 旨在为柿
属植物种质资源及其利用研究提供技术支撑和基础
资料。
1 结果与分析
1.1 SSAP 多态性分析
25 对引物共扩增出位点 1 300 个， 其中多态位
点 1 214个（多态位点百分率 93.38％）。 扩增片段大
小在 50～700 bp之间， 单引物对扩增产生 9～90 个
位点 （平均 52 个 ）， 多态位点率介于 81.25％～
100％。引物扩增的详细信息见表 1；每个引物组合均
产生各异的指纹图谱， 同一组合在种间扩增谱带差
异明显。 图 1 所示为 rtdk4/EcoR (AGC)引物组合的
SSAP扩增电泳图谱。
1.2 SSAP相似指数及聚类分析
表 1 不同逆转座子引物组合 SSAP扩增 28 份柿属基因型反映的多样性信息统计
Table 1 Comparison of diversity information for different retrotransposon primer-SSAP markers in 28 Diospyros spp. using SSAPs
analysis
a：括号内数字表示每对 SSAP引物可扩增的平均条带数；b：括号内的数字表示每对 SSAP引物可扩增的平均多态性条带数
a： Numbers in parenthesis indicates the average number of bands detected in each primer pair; b：Numbers in parenthesis indicates the
average number of polymorphic bands detected in each primer pair
SSAP逆转座子分子标记在柿属植物遗传分析中的应用
Applification of SSAP Retrotransposon-based Molecular Marker for Genetic Analysis of Diospyros spp. (Ebenaceae)
可被区分的基
因型比例
Percentage of
differentiable
genotype
71.43
85.71
53.57
78.57
100
100
100
78.57
100
21.43
85.71
50.00
92.86
100
75.00
82.14
82.14
92.86
57.14
78.57
82.14
75.00
100
75.00
75.00
100
平均遗传
距离 /D
Average
genetic
distance
0.23
0.33
0.25
0.25
0.30
0.23
0.33
0.26
0.37
0.20
0.27
0.25
0.35
0.35
0.32
0.30
0.29
0.31
0.20
0.25
0.31
0.28
0.31
0.24
0.24
0.29
Mantel 检验
相关性值 /r
Mantel
correlation
value
0.785
0.921
0.948
0.913
0.955
0.668
0.751
0.906
0.780
0.561
0.915
0.899
0.877
0.933
0.874
0.961
0.941
0.892
0.835
0.896
0.935
0.956
0.941
0.769
0.934
逆转座子引物
Retrotransposon
primer
rtdk14
rtdk16-r9
rtdk16-r10
rtdk11
rtdk4
Total
选择性扩增
引物
Selective
primer
Mse (CAG)
Mse (CAT)
Mse (CTT)
Mse (CCC)
Mse (CGG)
EcoR (ACG)
Mse (CAG)
Mse (CTT)
Mse (CGG)
EcoR (ACG)
Mse (CAG)
Mse (CTT)
Mse (CGG)
EcoR (ACG)
EcoR (AGC)
Mse (CAG)
Mse (CCC)
Mse (CGG)
EcoR (ACG)
EcoR (AGC)
Mse (CAG)
Mse (CCC)
Mse (CGG)
EcoR (ACG)
EcoR (AGC)
总扩增带数
Total No. of
amplified
bandsa
32
34
42
57
74
25
70
42
53
9
56
34
75
75
35
73
82
57
30
48
58
90
71
29
49
1300/(52)
多态带数
Total No. of
polymorphic
bandsb
26
34
39
54
71
22
70
37
51
9
49
32
72
74
35
68
77
54
25
42
56
80
70
26
41
1214/(48)
多态率 /%
Percentage of
polymorphic
fragments
81.25
100
92.86
94.74
95.95
88.00
100
88.10
96.23
100
87.50
94.12
96.00
98.67
100
93.15
93.90
94.74
83.33
87.50
96.55
88.89
98.60
89.66
83.67
93.38
可区分的基
因型数目
Total No. of
differentiable
genotypes
20
24
15
22
28
28
28
22
28
6
24
14
26
28
21
23
23
26
16
22
23
21
28
21
21
22
683
农业生物技术学报
Journal of Agricultural Biotechnology
应用 NTSYS 软件计算 28 份试材间的相似指
数，供试材料相似指数变化范围从 0.504（90-1-34 和
美洲柿）到 0.972（富有和松本早生），平均 0.729。
由图 2 可见， 以相似指数 0.60 为阈值，28 份试
材聚为 2组，供试的 6个柿近缘种单独形成一组。 柿
组内， 在相似指数为 0.81水平进一步可分为 3 个亚
组。 除 90-1-10，90-3-99和 90-1-34之外的 12份中国
柿基因型聚在一起形成 Cluster1， 该组内磨盘柿、宝
盖甜柿、 小宝盖甜柿直接相聚， 表现较近的亲缘关
系；小果甜柿、四方甜柿与罗田甜柿亲缘关系较近，
而鄂柿 1 号、 宝盖甜柿和小宝盖甜柿与罗田甜柿表
现较远的亲缘关系。Cluster2包括所有原产日本的柿
基因型。 其中，前川次郎是次郎的芽变，松本早生是
富有的芽变，在聚类图中各自相聚紧密，表明聚类结
果可靠。 90-1-10，90-3-99 和 90-1-34 因与其它 12 份
中国柿基因型关系较远而自成一组，形成 Cluster3。
图 3 为主坐标分析结果， 反映出的试材间的亲
缘关系与 UPGMA聚类图结果基本一致。 稍有不同
的是 UPGMA 聚类中的 Cluster1 和 Cluster3 在主坐
标分析结果中合并形成了 Group1。 前 3个主坐标总
的贡献率为 43.0％，第一、第二和第三主坐标贡献率
依次为 22.7%，12.4%和 8.0 %。
总的来看，UPGMA和主坐标分析结果均较好的
显示了聚类结果与地理起源相关性及种性差异之间
的关系，即柿种下试材依地理起源（中国、日本）的不
同而分聚为不同组；柿与其它 6个近缘种明显分开。
图 2 28 份柿属植物 SSAP分析的 UPGMA聚类图
1~28：编号对应的试材见表 2
Figure 2 Dendrogram of 28 accessions revealed by UPGMA cluster analysis based on genetic similarity estimates calculated from the
SSAP data
1~28 ：Correspond to the accessions listed in Table 2
图 1 引物组合 rtdk4/EcoR (AGC) SSAP扩增图谱
1~28：编号对应的试材见表 2
Figure 1 SSAP profiles of 28 accessions using the rtdk4/EcoR
(AGC) retrotransposon primer combination
1~28：Correspond to the accessions listed in Table 2
Cluster 1
Cluster 2
Cluster 3
Cluster 4
Coefficient
L=0.810L=0.600
1
4
6
8
10
11
7
9
13
14
15
12
16
18
17
20
21
19
22
2
3
5
23
24
26
28
27
25
0.657 0.762 0.867 0.9720.552
500
400
300
200
bp
100
684
SSAP逆转座子分子标记在柿属植物遗传分析中的应用
Applification of SSAP Retrotransposon-based Molecular Marker for Genetic Analysis of Diospyros spp. (Ebenaceae)
al., 200 6）， 由这些标记检测的多态性依次为
92.44％、80.88%、74.13％和 86.32％。 本研究 SSAP
检测到 93.38％的多态性， 均显著高于上述标记类
型， 这与前人在其它果树种类上得出的 SSAP 具高
灵敏性的结论相吻合 （Labra, 2004; Venturi et al.,
2006; Bretó et al., 2001; 韦杰, 2007）。 此外， 本研究
SSAP能有效鉴别所有供试芽变类型，揭示其鉴别微
小变异的良好能力。 因此，该标记可望作为研究柿属
植物遗传变异尤其是芽变鉴定的强有力的标记类
型。
本实验应用的 UPGMA聚类及主坐标分析均将
原产中国和日本的柿种质明显分开， 表明两类种质
间具有较远的亲缘关系，可能彼此相对独立起源，与
前人结果一致 （Kanzaki et al., 2000; Guo et al., 2006;
Guo and Luo, 2006; Hu and Luo, 2006）； 几个已知亲
缘关系的芽变和杂交品种都能各自相聚， 与预计结
果吻合。 因此，从已知亲缘关系试材间遗传关系的分
析结果，以及同前人已有研究相互印证情况看，本实
验开发的 SSAP 技术能较好地应用于柿属种质的遗
传关系研究。
SSAP 灵敏、高效，利用较少数量的引物即可获
得丰富遗传信息 （Pearce et al., 2000; Berenyi et al.,
2002; Syed et al., 2005; Petit et al., 2007)。 本实验筛选
出的 3 对高信息含量 SSAP 引物， 均具有独立应用
于柿属植物种质资源鉴定、 遗传多样性评价和系统
进化研究等的潜力， 有利于节约成本和提高研究效
率；其它引物对单独聚类结果间的 Mantel 相关值在
0.40～0.94 之间，平均为 0.77（资料略），表明其从不
同层面揭示了种质的遗传变异。 因此，这些引物的同
时应用可为客观评价遗传多样性、 全面研究系统进
化提供有益的遗传信息。
罗田甜柿及其 7 个变异单株 （一般认为其为前
者的芽变类型）未能聚在一组，表明这些单株间的变
异较大，而罗田甜柿作为我国最古老的完全甜柿，极
有可能并非单一品种而是一个品种（类型）群，在其
起源地大别山区可能还蕴藏着大量的变异类型。 其
中，90-3-99 和 90-1-34 与罗田甜柿在表型、脱涩类型
及其它生物学特性方面十分接近，90-1-10 则与罗田
甜柿差别很大，且属不同的脱涩类（PVNA）。 从聚类
分析反映的情况看，90-1-10、90-3-99 和 90-1-34 表现
出较近的亲缘关系和共享许多特有的谱带， 可能说
明其起源上应具更大相关性。 90-1-10是最近发现并
鉴定的迄今发现的首例中国原产不完全甜柿类型
图 3 SSAP主坐标分析图
1～28：编号对应的试材见表 2
Figure 3 Diagram showing the relationships among 28 genotypes
based on principal coordinates analysis using SSAP
1～28：Correspond to the accessions listed in Table 2
1.3 高信息量SSAP引物对的筛选
由表 1 可见， 单对 SSAP 引物能鉴别 6～28 份
种质，鉴别率介于 21.43％～100％，其中有 6 对引物
可以单独对所有供试种质进行鉴别； 不同引物对揭
示的种质间遗传距离值（D）在 0.20～0.37 之间，单独
对 28 份种质生成的聚类矩阵与 25 对引物总聚类矩
阵间的相关性值（r）变幅为 0.67～0.96。 进一步研究
发现， 种质鉴别率为 100％的引物对中 rtdk14/Mse
(CGG)、rtdk16-r10/EcoR(ACG)和 rtdk4/Mse(CGG) 同
时兼具高水平的多态性带检出率和 D值、r 值。因此，
综合多项参数表明 ，rtdk14/Mse (CGG)、rtdk16-r10
/EcoR(ACG)和 rtdk4/Mse(CGG) 为 25 对 SSAP 引物
组合中高信息含量的引物对。
2 讨论
SSAP 扩增逆转座子和与其较近的酶切位点之
间的 DNA片段，测序胶上不同片段长度代表着逆转
座子的插入事件（Pearce et al., 2000）。 本研究检测到
丰富的 SSAP 扩增位点， 表明逆转座子在柿属植物
中发生过频繁转座插入，可能参与其进化过程。 今后
利用对 SSAP 检测到的遗传背景相近的种质间的差
异片段的分离及分析， 可望探究由逆转座子转座所
致的变异机理。
线粒体非编码区扩增多态性 （Hu and Luo,
2006）、SRAP（Guo and Luo, 2006）、微卫星（郭大龙 ,
2006） 以及其它 2 种逆转座子分子标记 IRAP 和
REMAP 已应用于柿属种质的亲缘关系分析（Guo et
Dim-1
25
2824
1
3
Group3 Group1
Group2
27
26
23
2
4
16
17
18
19
20 21
22
5
7
8
10
13
6911
12
14
15
0.31
0.16
0.00
-0.15
-0.31
-0.52 -0.35 -0.17 0.01 0.19
D
im
-2
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农业生物技术学报
Journal of Agricultural Biotechnology
（Du et al., 2009a）。 从本研究结果推测，其可能起源
于罗田甜柿。 关于 90-1-10 起源的详细情况，尚需进
一步探讨。
3 材料与方法
3.1 材料
供试材料为柿属（Diospyros L.）7 种共 28 个基因
型（表 2），采自华中农业大学柿圃。
3.2 方法
3.2.1基因组 DNA提取
参考 Doyle和 Doyle的方法（1987）。
3.2.2 SSAP分析
逆转座子引物为本课题组通过从罗田甜柿
（Diospyros kaki Thunb. Luotian-tianshi） 中分离逆转
座子 RNaseH-LTR 序列自主开发 （杜晓云等, 2008;
Du et al., 2009b），引物序列见表 3。SSAP流程中的基
因组双酶切反应、连接反应、预扩增反应和选择性扩
增反应的配比和程序， 以及接头和接头引物序列均
参考 Vos 等（1995）。 与 AFLP 操作的不同之处在于
SSAP 选择性扩增由末端带有 3 个选择性碱基的
MseⅠ或 EcoRⅠ接头引物和逆转座子引物组合完
成。 PCR终产物由 6％聚丙烯酰胺变性胶 60 W恒功
率电泳分离，银染显色。 限制性内切酶购于深圳晶美
生物工程公司，PCR 试剂均为北京三博远志生物技
术有限责任公司产品。
3.2.3数据统计及分析
电泳条带按 1/0 形式进行数据转换， 只统计清
晰、重复性强的条带。 扩增产物按同一位点条带有或
无分别赋值， 有带记为 “1”， 无带记为 “0”； 利用
NTSYS-pc version2.1 (Rohlf，2000) 软件计算 Jaccard
相似指数 ，UPGMA （unweighted pair group method
with arithmetic mean）法聚类，采用 Mantel 检验不同
聚类相似矩阵之间的相关性，同时进行主坐标分析。
表 2 本研究所用试材及编号
Table 2 List of 28 Diospyros spp. used in this study
PCNA：完全甜柿； PVNA：不完全甜柿； PVA：不完全涩柿；PCA：完全涩柿。 －：不作甜涩分类
PCNA：Pollination-constant and non-astringent; PVNA：Pollination-variant and non-astringent; PVA：Pollination-variant and
astringent; PCA：Pollination-constant and astringent.－：No classification of astringent type
686
参考文献
Berenyi M., Gichuki S.T., Schmidt J., and Burg K., 2002, Ty1-
copia retrotransposon-based S-SAP (sequence-specific
amplified polymorphism) for genetic analysis of
sweetpotato, Theoretical and Applied Genetics, 105 (6-7):
862~869
Bretó M.P., Ruiz C., Pina J.A., and Asíns M.J., 2001, The
diversification of Citrus clementina Hort. ex Tan., a
vegetatively propagated crop species, Molecular
Phylogenetics and Evolution, 21(2): 285~293
DOnofrio C., Lorenzis G.D., Giordani T., Natali L., Cavallini A.,
and Scalabrelli G., 2010, Retrotransposon-based molecular
markers for grapevine species and cultivars identification,
Tree Genetics & Genomes, 6(3): 451~466
Doyle J.J., and Doyle J.L., 1987, A rapid DNA isolation
procedure for small quantities of fresh leaf tissue,
Phytochemical Bulletin, 19: 11~15
Du X., Zhang Q., and Luo Z., 2009a, Identification of a Chinese
PVNA type of Japanese persimmon discovered from
dabieshan region in central China, Acta Horticulturae, 833:
97~102
Du X.Y., Zhang Q.L., and Luo Z.R., 2009b, Development of
retrotransposon primers and their utilization for germplasm
identification in Diospyros spp. (Ebenaceae), Tree Genetics
& Genomes, 5(1): 235~245
Du X.Y., and Luo Z.R., 2006， Establishment of the inter-retro-
transposon amplified polymorphism (IRAP) reaction system
and construction of fingerprint in some Diospyros spp.,
Nongye Shengwu Jishu Xuebao (Journal of Agricult ural
Biotechnology), 14(6): 931~936（杜晓云, 罗正荣, 2006, 部
分柿属植物 IRAP 反应体系的建立和指纹图谱构建 , 农
业生物技术学报, 14（6）: 931~936）
Du X.Y., Zhang Q.L., and Luo Z.R., 2008, Isolation and
characterization of RNaseH-LTR sequences of Ty1-copia
like retrotransposons in oriental persimmon (Diospyros kaki
Thunb. Luotian-tianshi), Yuanyi Xuebao (Acta
Horticulturae Sinica), 35(4): 501~508（杜晓云 , 张青林 , 罗
正 荣 , 2008， 罗 田 甜 柿 Ty1-copia 类 逆 转 座 子
RNaseH-LTR 序列的分离和特性分析，园艺学报， 35（4）:
501~508）
Guo D.L., 2006, Establishment of several molecular markers and
analysis of genetic relationships in Diospyros Linn., Thesis
for Ph.D., Huazhong Agricultural University, Supervisor:
Luo Z.R （郭大龙, 2006, 几种分子标记技术的建立及其在
部分柿属植物亲缘关系研究中的应用 , 博士学位论文 ,
华中农业大学, 导师: 罗正荣）
Guo D.L., and Luo Z.R., 2006, Genetic relationships of some
PCNA persimmons (Diospyros kaki Thunb.) from China and
Japan revealed by SRAP analysis, Genetic Resouces and
Crop Evolution, 53(8): 1597~1603
Guo D.L., Zhang H.Q., and Luo Z.R., 2006, Genetic relationships
of Diospyros kaki Thunb. and related species revealed by
IRAP and REMAP analysis, Plant Science, 170(3): 528~533
Hu D.C., and Luo Z.R., 2006, Polymorphisms of amplified
mitochondrial DNA non-coding regions in Diospyros spp.,
Scientia Horticulturae, 109(3): 275~281
Kanzaki S., Yonemori K., Sato A., Yamada M., and Sugiura A.,
2000, Analysis of the genetic relationships among
pollination-constant and non-astringent (PCNA) cultivars of
persimmon (Diospyros kaki Thunb.) from Japan and China
using amplified fragment length polymorphism (AFLP),
SSAP逆转座子分子标记在柿属植物遗传分析中的应用
Applification of SSAP Retrotransposon-based Molecular Marker for Genetic Analysis of Diospyros spp. (Ebenaceae)
引物
Primer
rtdk14
rtdk16-r9
rtdk16-r10
rtdk11
rtdk4
方向
Orientation
反向Antisense
反向 Antisense
反向 Antisense
正向 Sense
正向 Sense
序列（5~3）
Sequence (5~3)
CATTGGGTCCATCAGTTTCC
CAACACGAAATACGGCTACG
CTGCGACTTCACCAAGCCATAAA
GCTTGAGGGGGAGTGTTGAGTT
GAAGGGAGGTCTAAACTGAGGAAA
Tm/℃
57.8
60.0
60.6
61.9
60.3
位置
Position
274～293
478～497
391～413
85～106
139～162
GenBank
Accession No.
EU068711
EU068713
EU068713
EU068708
EU068701
表 3 SSAP反应中逆转座子引物及接头引物序列
Table 3 Retrotransposon primer sequences and adapter primer sequences tested in SSAP analysis
SSAP选择性扩增接头引物
SSAP selective-amplification adapter primers
Mse(CAG)
Mse(CAT)
Mse(CTT)
Mse(CCC)
Mse (CGG)
EcoR(ACG)
EcoR(AGC)
GATGAGTCCTGAGTAACAG
GATGAGTCCTGAGTAACAT
GATGAGTCCTGAGTAACTT
GATGAGTCCTGAGTAACCC
GATGAGTCCTGAGTAACGG
GACTGCGTACCAATTCACG
GACTGCGTACCAATTCAGC
687
农业生物技术学报
Journal of Agricultural Biotechnology
Journal of the Japanese Society for Horticultural Science, 69
(6): 665~670
Labra M., Imazio S., Grassi F., Rossoni M., and Sala F., 2004,
Vine -1 retrotransposon-based sequence-specific amplified
polymorphism for Vitis vinifera L. genotyping, Plant
Breeding, 123(2): 180~185
Lou Q.F., Liu Q., and Chen J.F., 2007, Establishment of SSAP
marker techniques for cucumber, Jiangsu Nongye Kexue
(Jiangsu Agricultural Sciences), 4: 82~85 （娄群峰 , 刘强 ,
陈劲枫 , 2007, 黄瓜 SSAP 标记技术的建立 , 江苏农业科
学, 4: 82~85）
Ma X.F., Duan K., and Hu J.J., 2008, DNA Extraction
optimization and establishment of SSAP on waxy corn,
Xibei Nongye Xuebao (Acta Agriculturae
Boreali-Occidentalis Sinica), 17(6): 73~78 （马小锋 , 段可 ,
胡景江 , 2008, 糯玉米 DNA 提取方法的优化及 SSAP 方
法的建立, 西北农业学报, 17（6）: 73~78）
Wei J., 2007, Characterization of retrotransposon elements and
development of related molecular markers in Citrus, Thesis
for Ph.D., Huazhong Agricultural University, Supervisor:
Deng X.X（韦杰, 2007, 柑橘类反转录转座子基因的特征
分析及其相关分子标记的开发, 博士学位论文, 华中农业
大学, 导师: 邓秀新）
Mansour A., 2008, Utilization of genomic retrotransposons as
cladistic markers, Journal of Cell and Molecular Biology, 7
(1): 17~28
Pearce S.R., Knox M., Ellis T.H.N., Flavell A-J., and Kumar A.,
2000, Pea Ty1-copia group retrotransposons:
Transpositional activity and use as markers to study genetic
diversity in Pisum, Molecular Genetics and Genomics, 263
(6): 898~907
Petit M., Lim K.Y., Julio E., Poncet C., Dorlhac de Borne F.,
Kovarik A., Leitch A.R., Grandbastien M.A., and Mhiri C.,
2007, Differential impact of retrotransposon populations on
the genome of allotetraploid tobacco (Nicotiana tabacum),
Molecular Genetics and Genomics, 278(1): 1~15
Rohlf F.J., 2000, NTSYS-PC, Numerical taxonomy and
multivariate analysis system. Version 2.10e. Exeter
Software, Setauket, New York, USA
Schulman A.H., 2007, Molecular markers to assess genetic
diversity, Euphytica, 158(3): 313~321
Syed N.H., Sureshsundar S., Wilkinson M.J., Bhau B.S.,
Cavalcanti J.J.V., and Flavell A.J., 2005, Ty1-copia
retrotransposon-based SSAP marker development in cashew
(Anacardium occidentale L.), Theoretical and Applied
Genetics, 110(7): 1195~1202
Venturi S., Dondini L., Donini P., and Sansavini S., 2006,
Retrotransposon characterisation and fingerprinting of apple
clones by S-SAP markers, Theoretical and Applied
Genetics, 112(3): 440~444
Vos P., Hogers R., Bleeker M., Reijans M., van de Lee T.,
Hornes M., Frijters A., Pot J., Peleman J., Kuiper M., and
Zabeau M., 1995, AFLP: A new technique for DNA
fingerprinting, Nucleic Acids Research, 23(21): 4407~4414
Waugh R., McLean K., Flavell A.J., Pearce S.R., Kumar A.,
Thomas B.B.T., and Powell W., 1997, Genetic distribution
of Bare-1-like retrotransposable elements in the barley
genome revealed by sequence-specific amplification
polymorphisms (S-SAP), Molecular and General Genetics,
253(6): 687~694
688