作 者 :张峰
期 刊 :扬州大学 2004年 04期 页码:59
关键词:生物信息学;SeqAs;基因组;比较基因组学;拟南芥;水稻;
摘 要 :比较基因组学是后基因组时代基因组研究的一项重要内容。面对比较基因组学中庞大而复杂的基因组数据,建立一个合适的基因组分析工具不仅能起到有效的辅助作用,而且可以相当显著地提高工作效率。本研究根据需要,设计和开发了“SeqAs”序列分析软件,软件主体部分共有20个模块,涉及序列编辑、氨基酸翻译、在线Blast比对、序列数据库统计等。软件的分析辅助功能较为全面,与同类软件相比,本软件最显著的特点就是能进行同源性比对分析时多个序列数据库和比对结果数据集的浏览、查询和数据的统计分析。软件运行稳定、界面友好、通用性较强。 本研究中利用多种植物的数据库,特别是拟南芥的基因组数据库和G...