作 者 ：郑晓东
期 刊 ：山东农业大学 2009年 03期 页码：82
关键词：PLD；BLAST；基因家族；生物信息学；
摘 要 ：磷脂酶D(phospholipaseD,简称PLD)即磷脂酰胆碱磷脂水解酶,属催化磷酸二酯键水解和碱基交换的一类酶的总称。是植物组织中普遍存在的一种酶。PLD及其产物PA在信号传导、膜脂降解中起重要作用,与植物胁迫密切相关。 本研究中用两种方法检索了模式植物拟南芥和水稻的基因组,获得编码含有PLD的基因。一是以已知PLD基因的序列作为检索条件,利用BLAST查找其同源序列。二是根据PLD基因的保守氨基酸序列编写正则表达式,用Perl语言操纵含有基因组数据的本地Mysql数据库。这两种方法得到的结果经过数据处理之后,再用SMART或者Pfam检测序列中的PLD基序,最后从拟...