Effects of long-term cropping patterns on the activities of peroxidase, invertase, arylsulfatase, dehydrogenase and protease were investigated in this paper. Four long-term cropping patterns included (1) 10 years continuous cropping of corn, (2) 8 years continuous cropping of wheat followed by 10 years continuous cropping of cotton, (3) 15 years continuous cropping of cotton, and (4) 6 years continuous cropping of cotton followed by 6 years of wheat/sunflower rotation. The responses of soil bacteria, fungi, ammonia oxidizing bacteria (AOB), and the ammonia oxidizing archaea (AOA) to different copping patterns were analyzed. The results showed that cropping patterns significantly affected the activities of soil peroxidase, arylsulfatase, dehydrogenase and protease, while had no significant effect on soil invertase activity. The cropping patterns significantly influenced the diversity index of AOA, but had no significant influence on that of soil bacteria, fungi and AOB. The community structures of soil fungi and AOB were more sensitive to cropping patterns than soil bacteria and AOA. In conclusion, long-term continuous cropping of cotton decreased the activities of soil enzymes activities and soil microbial diversity in oasis farmland, while crop rotation could alleviate the negative influence.
全 文 :不同种植方式对绿洲农田土壤酶活性
与微生物多样性的影响∗
李 锐 刘 瑜 褚贵新∗∗
(新疆石河子大学农学院 /新疆生产建设兵团绿洲生态农业重点实验室, 新疆石河子 832003)
摘 要 研究了玉米连作 10年、小麦连作 8年⁃棉花连作 10年、棉花连作 15 年和棉花 6 年⁃6
年小麦 /油葵轮作 4种种植方式对土壤过氧化氢酶、蔗糖酶、芳基硫酸酯酶、脱氢酶和蛋白酶
活性的影响,并分析了土壤细菌、真菌、氨氧化古菌与氨氧化细菌对北疆绿洲农田不同种植方
式的响应.结果表明: 不同种植方式对土壤过氧化氢酶、芳基硫酸酯酶、脱氢酶和蛋白酶活性
影响明显,但对蔗糖酶无显著影响;对氨氧化古菌多样性指数有显著影响,对土壤细菌、真菌
和氨氧化细菌多样性指数无明显影响.土壤真菌和氨氧化细菌群落结构对不同种植方式的响
应较细菌和氨氧化古菌敏感.长期棉花连作使绿洲农田土壤酶活性下降,微生物群落多样性
降低,而轮作可提高土壤酶活性和微生物群落结构多样性.
关键词 连作; 土壤酶活性; 微生物多样性; 轮作; PCR⁃DGGE
文章编号 1001-9332(2015)02-0490-07 中图分类号 S154.36 文献标识码 A
Effects of different cropping patterns on soil enzyme activities and soil microbial community
diversity in oasis farmland. LI Rui, LIU Yu, CHU Gui⁃xin (College of Agronomy, Shihezi Uni⁃
versity / Xinjiang Production and Construction Group Key Laboratory of Oasis Ecological Agriculture,
Shihezi 832003, Xinjiang, China) . ⁃Chin. J. Appl. Ecol., 2015, 26(2): 490-496.
Abstract: Effects of long⁃term cropping patterns on the activities of peroxidase, invertase, arylsul⁃
fatase, dehydrogenase and protease were investigated in this paper. Four long⁃term cropping patterns
included (1) 10 years continuous cropping of corn, (2) 8 years continuous cropping of wheat fol⁃
lowed by 10 years continuous cropping of cotton, (3) 15 years continuous cropping of cotton, and
(4) 6 years continuous cropping of cotton followed by 6 years of wheat / sunflower rotation. The re⁃
sponses of soil bacteria, fungi, ammonia oxidizing bacteria (AOB), and the ammonia oxidizing ar⁃
chaea (AOA) to different copping patterns were analyzed. The results showed that cropping patterns
significantly affected the activities of soil peroxidase, arylsulfatase, dehydrogenase and protease,
while had no significant effect on soil invertase activity. The cropping patterns significantly influ⁃
enced the diversity index of AOA, but had no significant influence on that of soil bacteria, fungi
and AOB. The community structures of soil fungi and AOB were more sensitive to cropping patterns
than soil bacteria and AOA. In conclusion, long⁃term continuous cropping of cotton decreased the
activities of soil enzymes activities and soil microbial diversity in oasis farmland, while crop rotation
could alleviate the negative influence.
Key words: continuous cropping; soil enzyme activity; microbial diversity; crop rotation; PCR⁃
DGGE.
∗农业部公益性行业科研专项(201103004)资助.
∗∗通讯作者. E⁃mail: chuguixinshzu@ 163.com
2014⁃04⁃27收稿,2014⁃11⁃12接受.
维持土壤微生物群落结构多样性对提高农田生
产力、抑制土传病害及增强土壤缓冲能力具有重要
意义.微生物广泛参与土壤 C、N、P、S 等养分循环,
是土壤有机物降解转化的驱动力.土壤氮的生物小
循环是地球大循环中最重要的物质循环,而氨氧化
过程是整个氮循环过程的限速步骤.土壤微生物分
泌的各类酶与土壤各种生物转化过程紧密相关,土
壤酶活性可表征土壤生物活性.土壤微生物群落结
构多样性与生物活性对农业活动中各种人为扰动有
敏感的响应.贾志红等[1]利用 PCR⁃DGGE 技术研究
应 用 生 态 学 报 2015年 2月 第 26卷 第 2期
Chinese Journal of Applied Ecology, Feb. 2015, 26(2): 490-496
发现,烤烟轮作土壤微生物多样性较连作高;棉花连
作致使土壤细菌群落结构多样性发生较大变化[2] .
在新疆绿洲地区,棉花连作 5 ~ 10 年土壤酶活性明
显降低[3] .李坤等[4]得出葡萄连作使土壤细菌、真菌
种群发生变化.长期连作影响土壤中氨氧化古菌
(ammonia oxidizing archaea,AOA)的群落组成,使土
壤氨氧化细菌( ammonia oxidizing bacteria,AOB)的
组成趋于单一,同时也使得 AOB 优势种群富集[5] .
宋亚娜等[6]报道,AOA对红壤硝化作用的影响程度
较大.而轮作能有效克服连作障碍,提高土壤微生物
多样性[7] .综上,不同种植方式可导致土壤生物活性
与微生物群落结构多样性发生变化.
新疆棉花种植面积占全国 1 / 3 以上,是国家主
要商品棉基地[8] .受经济利益驱动,棉花连作面积逐
年增加.据报道,新疆棉花大面积长期连作已超过 15
年[9],随着连作年限增加,棉花土传病害、地力下降
和土壤生物质量下降等问题值得关注.本文通过选
取典型样地,采用酶学和微生物分子生态学手段对
长期棉花连作、玉米连作、小麦 /油葵轮作等种植方
式的土壤生物活性和微生物多样性进行了研究,旨
在揭示农田关键微生物菌群多样性与生物活性对不
同种植方式的响应,为北疆绿洲农田土壤生物肥力
和微生物多样性维护提供科学依据.
1 材料与方法
1 1 试验设计
选取北疆绿洲长期种植作物的大田,分别为
T1:玉米连作 10年,样地面积 0.7 hm2;T2:小麦连作
8年⁃棉花连作 10 年,样地面积 0.5 hm2;T3:棉花连
作 15年,样地面积 1 hm2;T4:棉花 6年⁃6年小麦 /油
葵轮作,样地面积 3 hm2 .土壤类型为典型灌耕灰漠
土(calcaric fluvisal) .
1 2 样品采集
采用多点混合法以“S”型路线在样地上采集土
壤,在样点附近取 12 钻为 1 个混合样,共采集 3 个
混合样.土样采集后一部分存放在 4 ℃冰箱,用于测
定酶活性.另一部分存放在-80 ℃冰箱,用于土壤
DNA提取和后续 PCR⁃DGGE分子生物学指标测定.
1 3 土壤酶活性测定
土壤过氧化氢酶活性采用微量滴定法测定(5 g
土,0.5 h),结果以 1 g土壤 30 min 消耗的高锰酸钾
的毫升数表示[10] .蔗糖酶采用二硝基水杨酸比色法
(5 g 土,37 ℃,24 h),显色强度在分光光度计 508
nm波长下测定,酶活性用 24 h后 1 g土壤中的葡萄
糖毫克数表示[10] .芳基硫酸酯酶采用对硝基苯硫酸
钾比色法(5 g土,37 ℃,l h),显色强度通过分光光
度计 410 nm波长测定,结果以每小时 1 g 土壤中释
放的对硝基酚微克数表示[11] .脱氢酶采用 TTC 比色
法(6 g土,37 ℃,24 h),显色强度在分光光度计 485
nm波长下测定,结果以每小时 1 g 土壤中释放的三
苯基甲臜(TPF)的微克数表示[12] .蛋白酶采用以酪
蛋白为底物的方法(2.5 g 土,50 ℃,2 h),显色强度
在分光光度计 700 nm 波长下测定,结果以 2 h 后 1
g土壤中酪氨酸的微克数表示[12] .
1 4 土壤 DNA及微生物群落结构与多样性测定
土壤总 DNA的提取采用 PowerSoilTMDNA Isola⁃
tion Kit(MO BIO Laboratories Inc. USA).试验所用引
物和 Taq酶试剂盒均由大连宝生公司生产.
1 4 1 细菌 16S rDNA V6区 PCR扩增及变性梯度凝
胶电泳(DGGE) 细菌 16S rDNA V6 区 PCR 扩增
采用通用引物对 F968⁃R1404,引物序列见表 1.PCR
扩增条件为:94 ℃变性 5 min,20个循环(94 ℃变性
1 min,67 ℃退火 1 min,72 ℃延伸 1 min,每个循环
退火温度降 0.5 ℃),然后 15 个循环(94 ℃变性 1
min,57 ℃退火 1 min,72 ℃延伸 1 min,每个循环退
火温度降 0.5 ℃),最后再 72 ℃延伸 10 min.产物片
段长度 450 bp.土壤中总细菌(16S rDNA)PCR 产物
进行 DGGE分离时,使用 7%的胶,变性浓度 45% ~
55%,缓冲液为 1×TAE 溶液,电泳条件为电压 110
V,温度 60 ℃,时间 17 h.
1 4 2真菌 ITS 18S rDNA PCR 扩增及变性梯度凝
胶电泳(DGGE) 真菌 ITS 18S rDNA PCR 扩增采
用通用引物对 ITS1F⁃ITS2,引物序列见表 1.PCR 扩
增条件为:94 ℃变性 5 min,接着 36个循环(94 ℃变
性 30 s, 56 ℃退火 1 min,72 ℃延伸 1 min),最后再
72 ℃延伸 10 min.产物片段长度 300 bp.土壤中真菌
(ITS区)PCR 产物进行 DGGE 分离时,使用 8%的
胶,变性浓度 30% ~50%,缓冲液为 1×TAE 溶液,电
泳条件:电压 110 V,温度 60 ℃,时间 17 h.
1 4 3氨氧化古菌 PCR 扩增及变性梯度凝胶电泳
(DGGE) 氨氧化古菌(AOA) rDNA PCR扩增采用
通用引物对 CrenamoA23f和 CrenamoA616R,引物序
列见表 1.PCR扩增条件为 94 ℃变性 5 min,接着 35
个循环(94 ℃变性 45 S,53 ℃退火 1 min,72 ℃延伸
1 min),最后再 72 ℃延伸 10 min.产物片段长度 600
bp.土壤中氨氧化古菌(AOA)PCR 产物进行 DGGE
分离时,使用 6%的胶,变性浓度 15% ~55%,缓冲液
为 1×TAE溶液,电泳条件:电压 110 V,温度 60 ℃,
1942期 李 锐等: 不同种植方式对绿洲农田土壤酶活性与微生物多样性的影响
时间 17 h.
1 4 4氨氧化细菌 PCR 扩增及变性梯度凝胶电泳
(DGGE) 氨氧化细菌(AOB) rDNA PCR扩增采用
通用引物对 amoA1F ~ amoA2R,引物序列见表 1.
PCR扩增条件为 94 ℃变性 5 min,接着 35 个循环
(92 ℃变性 1 min, 50 ℃退火 1 min, 72 ℃延伸 45
s),最后再 72 ℃延伸 5 min.产物片段长度 500 bp.土
壤中氨氧化细菌 PCR产物进行 DGGE分离时,使用
7%的胶,变性浓度 27% ~ 45%,缓冲液为 1×TAE 溶
液,电泳条件:电压 110 V,温度 60 ℃,时间 17 h.
DGGE均使用 SYBRâ核酸凝胶染色 20 min.
1 5 数据处理
采用 Excel 2010 和 SPSS 17.0 统计分析软件进
行数据处理,处理间的差异显著性采用 Duncan法进
行单因素多重比较. DGGE 指纹图谱分析借助于
Photoshop 7.0 进行图片调整,采用 Gel⁃QuantTM 1.0
软件(Multiplexed Biotechnologies Inc, USA)进行条
带判读及迁移率、强度和面积计算,采用 UPGMA
(unweighted pair group method using arithmetic aver⁃
age)方法进行聚类分析,再根据 Primer 6 软件(Ply⁃
mouth, United Kingdom)对 DGGE 指纹图谱进行
PCA分析.
根据条带的相对位置和相对强度计算 Shannon
指数(H)和 Simpson 均匀度指数(E)来评价微生物
的多样性[17] .
H =- ∑
S
i = 1
P i lnP i
E = 1 - ∑
S
i = 1
P i 2
式中:P i为第 i 个物种在全部样品中的比例(P i =
ni / N. ni为第 i个物种的个体数; N为每个样品中检
测到的条带数);S为 DGGE检测到的每一泳道的条
带总数,即种的数目.
2 结果与分析
2 1 不同种植方式对土壤酶活性的影响
过氧化氢酶、蔗糖酶、芳基硫酸酯酶、脱氢酶及
蛋白酶主要参与土壤有机碳、氮、硫的生物转化与循
环.由表 2 可知,不同种植方式对过氧化氢酶、芳基
硫酸酯酶、脱氢酶和蛋白酶活性均有明显影响.棉花
6年⁃小麦 6年连作 /油葵轮作(T4)处理的过氧化氢
酶(CAT)活性最高,分别比玉米连作 10 年(T1)、小
麦连作 8 年⁃棉花连作 10 年(T2)和棉花连作 15 年
(T3)的 CAT活性高 8.2%、2.0%和 6.7%.T4处理的
脱氢酶(DHO)活性也最高,分别比T1、T2和T3处理
表 1 用于细菌、真菌、氨氧化古菌、氨氧化细菌的引物
Table 1 Primers used to identify the bacteria, fungi, AOA and AOB
项目
Item
引物
Primer
序列
Sequence (5′⁃3′)
参考文献
Reference
细菌
Bacteria
F968⁃GC 5′⁃CGCCCGGGGCGCGCCCCGGGCGGGGCGGG⁃
GGCACGGGGGGAACGCGAAGAACCTTAC⁃3′
[13]
R1401 5′⁃GCGTGTGTACAAGACCC⁃3′
真菌
Fungi
ITS1F⁃GC 5′⁃CGCCCGCCGCGCCCCGCGCCCGGCCCGC⁃
CGCCCCTTGGTCATTTAGAGGAAGTAA⁃3′
[14]
ITS2 5′⁃TTYGCTGYGTTCTTCATCG⁃3′
氨氧化古菌
AOA CrenamoA23f 5′⁃ATGGTCTGGCTWAGACG⁃3′ [15]CrenamoA
616R 5′⁃GCCATCCATCTGTATGTCCA⁃3′氨氧化细菌
AOB amoA1F 5′⁃GGGGHTTYTACTGGTGGT⁃3′ [16]
amoA2R 5′⁃CCCCTCKGSAAAGCCTTCTTC⁃3′
表 2 不同种植方式对土壤酶活性的影响
Table 2 Effects of different cropping patterns on enzymes activities
处理
Treatment
过氧化氢酶
Peroxidase
(mL·g-1)
蔗糖酶
Invertase
(mg·g-1·h-1)
芳基硫酸酯酶
Arylsulfatase
(μg PNP·g-1·h-1)
脱氢酶
Dehydrogenase
(μg TPF·g-1·24 h-1)
蛋白酶
Protease
(μg·g-1·h-1)
T1 2.34±0.02b 8.38±0.57a 64.3±0.4c 7.45±0.04b 6.07±0.13c
T2 2.50±0.04a 7.50±0.64a 68.0±0.7b 7.55±0.04b 9.69±0.16a
T3 2.38±0.06b 8.18±0.82a 59.7±0.6d 6.20±0.06c 6.13±0.10bc
T4 2.55±0.01a 8.85±1.51a 74.3±0.5a 8.81±0.08a 6.36±0.14b
T1: 玉米连作 10年 10 years continuous cropping of corn; T2:小麦连作 8年⁃棉花连作 10年 8 years continuous cropping of wheat followed by 10 years
continuous cropping of cotton; T3: 棉花连作 15年 15 years continuous cropping of cotton; T4: 棉花 6年⁃6年小麦 /油葵轮作 6 years continuous crop⁃
ping of cotton followed by 6 years of wheat / sunflower rotation. 同列不同字母表示差异显著(P<0.05)Different letters in the same column indicated sig⁃
nificant difference at 0.05 level. 下同 The same below.
294 应 用 生 态 学 报 26卷
的 DHO活性高 15.4%、14.3%和 29.6%.芳基硫酸酯
酶活性表现为: T4>T2>T1>T3 .蛋白酶活性则以 T2处
理下最高,其次为 T4处理,T1处理最低.不同种植方
式对土壤蔗糖酶的影响差异不显著.T4 处理的各种
酶活性处在一个比较高的水平,说明轮作有利于北
疆绿洲农田保持较高的土壤酶活性,而长期连作使
土壤酶活性明显下降.
2 2 不同种植方式对细菌、真菌群落结构的影响
对不同种植方式下土壤细菌、真菌的 DGGE 指
纹图谱进行主成分分析(principal component analy⁃
sis,PCA),其因子载荷可反映土壤中微生物群落结
构的变化.由图 1A 可以看出,土壤细菌群落结构遗
传多样性的 2 个主成分 PC1 和 PC2 分别代表总变
量的 21.3%和 19.0%.在相似度为 80%情况下,棉花
连作 15 年(T3)处理的土壤细菌群落在第 1 主成分
轴上(PC1)明显不同于棉花 6 年⁃6 年小麦 /油葵轮
作(T4)处理,由第 2 主成分轴同样发现,T4处理细
菌的群落结构明显不同于 T3 处理,玉米连作 10 年
(T1)、小麦连作 8 年⁃棉花连作 10 年(T2)两处理细
菌群落结构与 T3 处理比较接近.表明绿洲农田不同
种植方式对土壤细菌群落结构有明显影响.土壤真
菌群落的 2个主成分 PC1 和 PC2 分别代表总变量
的 28.2%和 24.9%,累计方差贡献率为 53.1%(图
1B).在相似度为 73%水平下,土壤真菌群落结构在
第 1主成分轴把 T3和 T4聚为一类,且明显有别于 T1
和 T2;在第 2主成分轴上 T1处理的真菌群落结构则
显著不同于 T2处理.说明不同种植方式改变了土壤
真菌群落结构,且绿洲农田土壤真菌群落结构对不
同作物长期种植的响应比细菌敏感.
2 3 不同种植方式对氨氧化古菌、氨氧化细菌群落
结构的影响
氨氧化古菌(AOA)和氨氧化细菌(AOB)是参
与土壤硝化作用的微生物,在农田氮素循环转化过
程中发挥重要作用.如图 2 所示,不同种植方式对氨
氧化古菌群落结构有显著影响.氨氧化古菌第 1 主
成分 ( PC1) 方差贡献率是 35. 5%,第 2 主成分
(PC2)方差贡献率是 17. 1%,累计方差贡献率为
52 6%.在相似度为 70%情况下,PC1 轴上长期玉米
连作(T1)与棉花 6年⁃6年小麦 /油葵轮作(T4)处理
的氨氧化古菌群落结构差异非常明显,但 T2、T3处
理氨氧化古菌群落结构差异不显著;第 2 主成分轴
上 T2、T3处理的氨氧化古菌群落明显区别于 T1与 T4
处理,但 T1与 T4之间无明显差异.表明不同种植方
式对土壤氨氧化古菌群落结构有显著影响.土壤氨
图 1 不同种植方式土壤细菌(A)、真菌(B)主成分分析
Fig.1 PCA analysis of bacterial (A) and fungal (B) diversity
as affected by cropping patterns.
T1: 玉米连作 10年 10 years continuous cropping of corn; T2: 小麦连
作 8年⁃棉花连作 10年 8 years continuous cropping of wheat followed by
10 years continuous cropping of cotton; T3: 棉花连作 15 年 15 years
continuous cropping of cotton; T4: 棉花 6 年⁃6 年小麦 /油葵轮作 6
years continuous cropping of cotton followed by 6 years of wheat / sunflower
rotation. 下同 The same below.
图 2 不同种植方式土壤氨氧化古菌(A)和氨氧化细菌(B)
主成分分析
Fig.2 PCA analysis of AOA (A) and AOB (B) as affected by
cropping patterns.
氧化细菌在主成分 PC1 和 PC2 轴上分别代表总变
量的 27.2%和 19.8%(图 2B),在群落结构相似度为
50%情况下,不同种植方式对氨氧化细菌群落结构
3942期 李 锐等: 不同种植方式对绿洲农田土壤酶活性与微生物多样性的影响
表 3 不同种植方式土壤细菌、真菌、氨氧化古菌、氨氧化细菌多样性指数
Table 3 Diversity indices for bacteria, fungi, AOA and AOB as affected by cropping patterns
处理
Treatment
细菌 Bacteria
H E
真菌 Fungi
H E
氨氧化古菌 AOA
H E
氨氧化细菌 AOB
H E
T1 3.02±0.03a 0.96±0.00a 3.20±0.10a 0.96±0.00a 2.83±0.16b 0.94±0.01b 2.21±0.26a 0.87±0.03a
T2 2.97±0.08a 0.96±0.00a 3.03±0.10a 0.95±0.01a 3.05±0.07a 0.95±0.00a 2.05±0.36a 0.85±0.05a
T3 3.02±0.15a 0.96±0.01a 3.02±0.16a 0.95±0.01a 3.11±0.11a 0.95±0.01a 2.15±0.06a 0.87±0.01a
T4 2.97±0.08a 0.96±0.00a 3.14±0.07a 0.95±0.00a 2.96±0.01ab 0.94±0.01ab 2.29±0.15a 0.89±0.02a
H: Shannon指数 Shannon index; E: Simpson指数 Simpson index.
的影响与氨氧化古菌相似,但氨氧化细菌群落结构
对不同种植方式的响应更为敏感.
土壤微生物多样性是保持农田土壤生态系统稳
定性和土地生产力的基础. Shannon 指数 (H)和
Simpson指数(E)常被用以表征微生物群落多样性.
由表 3 可知,不同种植方式下土壤细菌与真菌的
Shannon指数(H)、Simpson指数(E)变化均不显著,
表明不同作物长期种植并未明显改变土壤细菌、真
菌群落的多样性.不同种植方式对氨氧化古菌多样
性指数影响显著,对氨氧化细菌多样性指数无明显
影响,各处理氨氧化古菌的多样性明显高于氨氧化
细菌.
3 讨 论
存在于农田土壤中的过氧化氢酶、蔗糖酶、芳基
硫酸酯酶、脱氢酶、蛋白酶,对土壤中 C、N、P、S 等主
要营养物质的循环转化起着重要的作用[18] .棉花 6
年⁃6年小麦 /油葵轮作(T4)处理中过氧化氢酶、蔗
糖酶、芳基硫酸酯酶、脱氢酶活性均高于其他 3个处
理,而蛋白酶活性则在小麦连作 8 年⁃棉花连作 10
年(T2)处理出现最高值,其次为 T4,T1最低.原因可
能是 T2长期秸秆还田提供了充足的氮源和适宜的
根际微生态环境,所以有较高的蛋白酶活性.
土壤微生物群落功能与遗传结构多样性间存在
着复杂的关系,农田土壤功能的发挥依赖于稳定的
土壤生物群落结构和丰富的群落多样性.研究普遍
认为,长期连作会使土壤由“细菌型”向“真菌型”转
化.如董艳等[19]研究发现,土壤真菌数量随设施大
棚年限增加而逐渐升高,种植 10年和 20年的细菌 /
真菌比(B / F)显著低于露地土壤.作物轮作则可明
显增加土壤细菌和放线菌数量,显著降低真菌数量,
且轮作方式下土壤微生物的多样性较高,尤其是土
壤细菌群落多样性明显提高.
本文主成分分析表明,棉花 6 年⁃6 年小麦 /油
葵轮作(T4)处理细菌的群落结构明显区别于棉花
连作 15 年(T3)处理,玉米连作 10 年(T1)、小麦连
作 8 年⁃棉花连作 10年(T2)两处理细菌群落结构与
T3 处理比较接近,但通过对 DGGE 指纹图谱的多样
性指数进一步分析发现,无论细菌还是真菌的多样
性指数(Shannon指数与 Simpson 指数)在各处理间
并无显著差异.轮作处理细菌多样性并没有明显优
于连作处理,反而是 T1和 T3的细菌多样性指数略高
于 T4,这与前人研究结果[1,4]不一致.可能是由于长
期连作条件下,土壤异养微生物对土壤化感物质的
分解能力增强而引起其多样性指数增加[20-21],当连
作年限达到一定限度,土壤与作物根系环境筛选出
适宜的菌群,细菌多样性趋于新的相对稳定状态.此
外,新疆绿洲农田长期秸秆还田对土壤有机质含量
和组成有一定影响,加之根系分泌物参与腐殖质形
成,给土壤菌群繁殖生长提供了丰富的碳源与氮源,
这些因素均可改变土壤微生态环境,并影响微生物
群落与多样性.如李鑫等[22]报道,盐碱土 pH和盐度
是制约微生物群落多样性的主要因素;Marschner
等[23]研究表明,施用有机肥可使细菌 /真菌的比例
提高,且细菌群落多样性会受到土壤有机碳与 C / N
的影响.
氨氧化是硝化反应的第一步,也是限速步
骤[24],AOA在陆地生态系统中分布非常广泛,目前
研究者在碱性沙地、森林土壤、牧草土壤、稻田土壤
等陆地生态系统中均检测到了 AOA 的存在,且
AOA数量比 AOB 高出约 2 ~ 3 个数量级[25] . Chen
等[26]发现,AOA对土壤氨氧化过程起着主导作用,
其 amoA 基因拷贝数以及转录水平均显著高于
AOB.然而,也有研究认为,虽然氨氧化古菌 amoA基
因大量存在于陆地生态系统中,但并不意味着该基
因在驱动氨氧化过程中发挥主要作用[27] .如 Jia
等[28]采用稳定性同位素原位示踪农田土壤氨氧化
微生物核酸 DNA,发现 AOB 是土壤硝化过程的主
要驱动者.本研究发现,不同种植方式对土壤氨氧化
古菌多样性指数有所影响,但对氨氧化细菌多样性
指数无明显影响,氨氧化细菌群落结构对不同种植
方式的响应更为敏感.干旱区绿洲农田土壤硝化势
494 应 用 生 态 学 报 26卷
强,硝化反应快,耕层土壤矿质态氮以 NO3
-为主,弄
清绿洲农田 AOA和 AOB群落多样性及其丰度在土
壤铵氧化反应的贡献,是调控硝化反应和滴灌农田
氮素管理的基础.但目前关于 AOA 和 AOB 对氨氧
化过程相对贡献率的研究尚存在不同观点,通过土
壤微生物分子生态研究手段,进一步定量 PCR 和
15N标记稳定探针技术( stable isotope probe,SIP)结
合土壤硝化强度进行相关分析,阐明不同作物长期
种植对土壤关键微生物的影响、对绿洲农田土壤硝
化过程的生物学机制及氮素养分管理具有重要
意义.
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作者简介 李 锐,女,1991 年生,硕士研究生.主要从事土
壤微生物分子生态学研究. E⁃mail: ruiliedu@ 126.com
责任编辑 肖 红
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