全 文 :·研究报告·
生物技术通报
BIOTECHNOLOGY BULLETIN 2015, 31(11):228-235
随着世界人口的增加,对粮食需求的不断增长。
为增加农作物的产量,避免病虫害造成的损失,各
种农药的使用量也在逐渐增长。有机磷农药(Orga-
nophosphorus pesticides,OPS)是一类非常重要的农
药品种,全球已注册的 500 多种农药或农药代谢物
中,有机磷农药占有很大的比例[1]。目前,世界上
有机磷农药种类达 150 多种,我国生产的有机磷农
药品种有 20 余种,年产量超过 10 万 t,占我国农药
总产量的 80% 以上[2]。虽然有机磷农药的大量使用
提高了作物的产量,但由于有机磷农药的半衰期较
长,大量的农药会残留在水体和土壤环境中造成严
重污染[3-5]。水体、土壤及农产品中残留的有机磷
收稿日期 :2015-03-02
基金项目 :国家自然科学基金项目(31170119),中国农业科学院基础研究基金项目(0042011006,0042012003,0042014011)
作者简介 :贾阳,女,硕士,研究方向 :微生物分子生物学与基因工程 ;E-mail :jia_yang@outlook.com
通讯作者 :闫艳春,女,教授,研究方向 :微生物分子生物学与基因工程 ;E-mail :yanyanchun@caas.cn
有机磷农药降解菌 YC-YH1 中 mpd 和 ophc2 的克隆及
酶学性质分析
贾阳 史延华 任磊 乔铖 王俊欢 闫艳春
(中国农业科学院研究生院,北京 100081)
摘 要 : 从一株有机磷农药降解菌施氏假单胞菌 Pseudomonas stutzeri YC-YH1 中克隆到两个有机磷水解酶基因 mpd 和 ophc2。
将两个基因分别连接到表达载体 pET-32a 并克隆到大肠杆菌 BL21(DE3)中进行表达 ;利用 Ni 亲和层析柱纯化甲基对硫磷水解酶
(MPH)和有机磷水解酶(OPHC2),并进行了酶学性质分析。MPH 最高活力的反应温度为 40℃,在 pH8-12 范围内,酶表现出
较高的活力。OPHC2 酶的最适反应温度为 30℃,在 pH 8-12 的范围内酶活力较高。两种酶按 11 比例混合组成的混合酶在 30-
40℃范围内酶活力很高,达 95% 以上,混合酶在 pH 范围为 8-12 内仍具有较高的活力。多种金属离子会对酶的活性产生一定影响,
酶对 SDS 和 EDTA 都有很高的敏感度,混合酶能够降低对金属离子的敏感性。
关键词 : 有机磷水解酶基因 ;MPH ;OPHC2 ;纯化 ;酶学性质
DOI :10.13560/j.cnki.biotech.bull.1985.2015.11.030
Cloning and Characterization of mpd and ophc2 from an
Organophosphorus Pesticide-degrading Bacteria YC-YH1
Jia Yang Shi Yanhua Ren Lei Qiao Cheng Wang Junhuan Yan Yanchun
(Graduate School of Chinese Academy of Agricultural Sciences,Beijing 100081)
Abstract: We cloned two organophosphorus hydrolase genes mpd and ophc2 from an organophosphorus pesticide-degrading bacteria
Pseudomonas stutzeri YC-YH1. The two genes were inserted into the expression vector pET-32a and transformed into E. coli BL21(DE3)
respectively. We used Ni-affinity column to purify enzymes and then study the nature of the two enzymes. It was suggested that the optimal
temperature of MPH is 40℃, and the MPH displays high activity in the pH range of 8 to 12. The optimal temperature of OPHC2 is 30℃. In the
pH ranging of 8 to12, OPHC2 has higher activity. The mixture of MPH and OPHC2 in the proportion of 11 showsed higher activity in the range
of 30℃ to 40℃, the enzyme showsed more than 95% activity in the range of pH8-12. A variety of metalions affect the activity of the enzymes
and the enzymes are sensitive to SDS and EDTA, but the compound could reduce the sensitivity to the metalions.
Key words: organophosphorus hydrolase gene ;MPH ;OPHC2 ;purification ;enzymatic property
2015,31(11) 229贾阳等 :有机磷农药降解菌 YC-YH1 中 mpd 和 ophc2 的克隆及酶学性质分析
农药已对人们的健康安全带来极大威胁[6-8]。乙酰
胆碱(Acetylcholine,ACh)是一种神经递质,在神
经信号传导过程中发挥着重要作用。有机磷农药能
够抑制乙酰胆碱酯酶(Acetylcholinesterase,AChE)
的活性从而使 ACh 不能降解而大量聚积进而对人体
产生毒性[9-11]。有研究表明,长期暴露于低剂量有
机磷环境下会造成机体多部位损伤,癌症、老年痴呆、
帕金森氏综合症和糖尿病等疾病都与包括有机磷农
药在内的环境污染物有关[12]。因此,消除环境中残
留的有机磷农药一直是人们关注的焦点。
有机磷农药的降解方式主要可分为化学降解、
物理降解和生物降解等[7,13,14]。生物降解是指通过
生物的作用将农药分解成小分子无毒的或者低毒的
化合物,并且最终降解为水、CO2 和矿物质的过程。
相对于物理、化学降解技术,生物降解特别是微生
物降解具有高效、操作简单、成本低、彻底、无二
次污染等诸多优点,目前对环境污染物的生物降解
已经成为研究的热点[15,16]。
微生物对有机磷农药的降解多是依靠酶促反
应进行,而利用纯化酶对农药尤其是低浓度农药的
降解效果远优于利用微生物本身,因为在农药浓度
较低的情况下,降解菌会优先利用其他碳源而不能
有效利用农药作为碳源,而降解酶的专一性高而且
不存在碳源的选择问题,因此降解效果不受碳源影
响,于是有机磷降解酶受到越来越多的关注[17]。到
目前为止,国内外的学者们已经分离了多种能够降
解有机磷的微生物,并且提取纯化了多种有机磷降
解 酶。1973 年,Sethunathan 等[18] 从 水 稻 田 土 壤
中分离到了第一株能够降解二嗪农和对硫磷的黄杆
菌 Flavobacterium sp. ATCC 27551。1982 年,Serdar
等[19] 发现了能够降解对硫磷的菌株 Pseudomonas
diminuta MG。2001 年, 崔 中 利 等[20] 分 离 到 了 水
解甲基对硫磷的菌株 Plesiomonas sp. Stain M6,并克
隆到了 mpd 基因。2002 年,陈亚丽等[21]从农药污
染土样中分离出的一株能彻底降解甲基对硫磷的菌
株 Pseudomonas sp. WBC-3。2003 年, 楚 晓 娜 等[22]
从有机磷农药降解菌 Pseudomonas sp. WBC-3 中纯
化了甲基对硫磷水解酶(Methyl parathion hydrolase,
MPH)并对酶性质进行了分析。2003 年,伍宁丰等[23]
从农药厂被污染的土壤中分离到了一株产有机磷水
解 酶(Organophosphorus hydrolase,OPH) 的 菌 株
Pseudomonas pseudoalcaligenes C2-1 并对其产生的有
机磷降解酶 OPHC2 进行了分离和纯化。
目前已报道的有机磷降解菌中只含有一种有机
磷降解酶基因,而本研究从一株有机磷农药降解菌
施氏假单胞菌 Pseudomonas stutzeri YC-YH1 中同时克
隆到两种有机磷降解酶基因 mpd 和 ophc2。将两种
基因分别连接到表达载体并转化大肠杆菌进行表达,
研究了这两种降解酶各自的酶学特性及二者联合的
酶学特性。
1 材料与方法
1.1 材料
1.1.1 主 要 试 剂 甲 基 对 硫 磷(Methyl parathion,
纯度 >99%)购自上海市农药研究所。对硝基苯酚
(p-Nitrophenol)(分析纯)购自天津市凯通化学试剂
有限公司。4×SDS 凝胶上样缓冲液低分子量标准蛋
白、限制性内切酶、Taq DNA 聚合酶、T4 DNA 连接
酶、IPTG、DNA 片段纯化试剂盒购自宝生物工程(大
连)有限公司(TaKaRa)。氨苄青霉素购自 Amresco
公司。细菌基因组提取试剂盒购自天根生化科技有
限公司。LB 培养基 :胰蛋白胨 10 g,酵母粉 5 g,
NaCl 10 g,去离子水 1 L,121℃灭菌 20 min。上样
缓 冲 液 :Na2HPO4·12H2O 1.78 g,NaH2PO4·2H2O
1.38 g,NaCl 29.22 g,Imidazole 2.0 g, 去 离 子 水 至
1 L,pH7.4。洗脱缓冲液 :Na2HPO4·12H2O 1.78 g,
NaH2PO4·2H2O 1.38 g,NaCl 29.22 g,Imidazole 34.0 g,
去离子水至 1 L,pH7.4。
1.1.2 菌株及质粒 本研究所用菌株为本实验室
分离的有机磷降解菌施氏假单胞菌(Pseudomonas
stutzeri)YC-YH1,在中国普通微生物菌种保藏管理
中心的保藏号为 CGMCC No. 9624。E.coli BL21(DE3)
购自天根生化科技有限公司。质粒 pET-32a 购自
Novagen 公司。
1.1.3 仪 器 AKTA avant 蛋 白 纯 化 系 统 配 Ni 柱
(HisTrapTM FF crude 1 mL),Tecan infinite 200 酶标仪,
Bio-Rad(PowerPacTM HV Power Supply)蛋白质电泳仪,
BRANSON 超声波仪器(DIGITAL SONIFIER 250)。
1.2 方法
1.2.1 mpd 和 ophc2 基因的克隆 根据施氏假单胞菌
生物技术通报 Biotechnology Bulletin 2015,Vol.31,No.11230
Pseudomonas stutzeri YC-YH1 全基因组测序结果,用
Primer Premier 5.0 设计引物(表 1),引物 P1 和 P2
PCR 扩增 mpd 基因,引物 P3 和 P4 PCR 扩增 ophc2
基因。以 YC-YH1 菌株基因组 DNA 为模板,扩增目
的基因。PCR 扩增程序为 :94℃预变性 5 min,94℃
变性 30 s,55℃退火 30 s,72℃延伸 1 min 20 s,进
行 30 个循环 ;72℃延伸 10 min ;10℃保存。扩增产
物用 DNA 片段纯化试剂盒纯化。
表 1 引物名称及序列
引物名称 序列(5-3)
P1 GCGCGGATCCATGCCCCTGAAGAACCGC
P2 GCGCGAGCTCGGGGTTGACGACC
P3 GCGCGGATCCATGCGTCTTTTCTCGCTG
P4 GCGCGAGCTCTCAGCGGTCGCTACGG
注 :黑色下划线处的碱基为酶切位点
1.2.2 重组质粒的构建 将纯化后的 mpd 和 ophc2
用 BamH Ⅰ和 Sac Ⅰ酶切,同时酶切载体 pET-32a,
用 DNA 片段纯化试剂盒回收,用 T4 DNA 连接酶将
酶切后 mpd 和 ophc2 分别与 pET-32a 质粒于 16℃过
夜连接,将连接产物转化 E.coli BL21(DE3)感受
态细胞,在含有 100 mg/L 氨苄青霉素的抗性平板上
筛选阳性克隆,提取质粒进行验证。
1.2.3 mpd 和 ophc2 基因的表达及蛋白纯化 将已
验 证 正 确 的 E.coli BL21(pET-mpd) 和 E.coli BL21
(pET-ophc2) 分 别 取 300 μL 接 种 到 30 mL 液 体 LB
培养基中,37℃下振荡培养 12 h。将培养后的菌液
取 4 mL 接 种 到 400 mL 液 体 LB 培 养 基 中,37℃,
200 r/min 振荡培养至菌液 OD600 达到 0.8,加入 IPTG
至 终 浓 度 1 mmo/L, 在 30℃,200 r/min 下 振 荡 培
养,诱导 3 h。然后 5 000 r/min 离心 8 min 收集菌体,
用 30 mL 上样缓冲液悬浮菌体后进行超声破碎。超
声功率为 20%,超声频率 :超声 3 s,暂停 5 s,共
超声破碎 20 min。破碎完成后 12 000 r/min 离心 10
min,收集上清液进行纯化。
用 AKTA avant 蛋白纯化系统对蛋白进行纯化,
流速 1 mL/min,上样 26 mL,用洗脱缓冲液进行洗脱,
从第 4 mL 开始收集,收集 2 mL 蛋白洗脱液。
1.2.4 纯化蛋白的检测 使用 SDS-PAGE 对纯化的
蛋白进行纯度测定。配制浓度为 12% 的分离胶,浓
度为 5% 的浓缩胶,固定染色液为考马斯亮蓝 R-250
(含异丙醇 25%,乙酸 10%),脱色液含乙酸 10% 和
乙醇 5%。未诱导及诱导后的全细胞蛋白处理方法 :
l mL 菌体细胞沉淀加入 20 μL 4×SDS 凝胶上样缓冲
液及 60 μL H2O,100℃加热 10 min 以充分裂解细胞,
12 000 r/min 离心 10 min 使细胞碎片及 DNA 等沉淀,
取适量溶液上样。纯化的 MPH 和 OPHC2 分别取 60
μL 加入 20 μL 4×SDS 凝胶上样缓冲液混匀,取适量
溶液上样。
1.2.5 酶的活性测定 取 1 μL 甲醇配制的浓度为
1×104 mg/L 的甲基对硫磷母液,1 μL 酶液,加入到
98 μL Tris-HCl(50 mmol/L,pH9.0) 中 混 匀,28℃
反应 2 min,然后用酶标仪检测溶液在 405 nm 下的
吸光度值。
有机磷降解酶的一个活性单位(U)定义为 :
在 28℃条件下,每分钟降解 1 μmol 甲基对硫磷所
需酶量。在甲基对硫磷的降解过程中,甲基对硫磷
的消耗量与其降解产物对硝基苯酚的生成量之间为
11 的关系,所以本研究通过检测产生的对硝基苯
酚的量而得到甲基对硫磷被降解的量。
1.2.6 酶 学 性 质 的 测 定 分 别 以 纯 化 的 MPH、
OPHC2 以及二者按 11 比例混合的混合酶为材料,
在不同温度、pH 及不同金属离子下检测酶对甲基对
硫磷的降解效率,测定了其最适反应温度、最适 pH
及金属离子对酶活性的影响。
取 4 μL 甲醇配制的浓度为 1×104 mg/L 的甲基
对硫磷母液,1 μL 酶液,加入到 995 μL Tris-HCl(50
mmol/ L,pH9.0) 中 混 匀, 在 不 同 温 度(20、30、
40、50、60、70 和 80℃)下保温 30 min,检测溶液
在 405 nm 下的吸光度值;在不同 pH(3、4、5、6、7、
8、9、10、11 和 12)下进行酶促反应,测定了其最
适 pH,取 0.5 μL 酶液,1 μL 甲醇配制的浓度为 1×104
mg/L 的甲基对硫磷母液,加入到 98.5 μL Tris-HCl(50
mmol/ L,pH9.0)中混匀,28℃反应 30 min 后检测
405 nm 下的吸光度值 ;在酶促反应体系中分别加入
不同金属离子及化学试剂,各种化合物的终浓度为
1 mmol/L,28℃下反应 30 min 后检测 405 nm 下的吸
光度值,以研究不同金属离子及化学试剂对酶反应
的影响。
1.2.7 降解甲基对硫磷的动力学分析 将不同浓度
2015,31(11) 231贾阳等 :有机磷农药降解菌 YC-YH1 中 mpd 和 ophc2 的克隆及酶学性质分析
的甲基对硫磷(25、50、100、200 和 400 mg/L)作
为底物,加入到 50 mmol/L Tris-HCl(pH9.0)缓冲
液体系中,在 28℃下测酶反应速度,按双倒数作图
法(Lineweaver-Burk 法)求 Km 和 Vm。
1.2.8 MPH 和 OPHC2 的比较分析 对几种常见的
有机磷农药降解酶基因基因进行分析,用 MEGA 5.2
构建系统进化树 ;用 Swiss-PdbViewer 4.1.0 对 MPH
和 OPHC2 蛋白结构进行分析。
2 结果
2.1 目的基因的获得与重组质粒的验证
以 Pseudomonas stutzeri YC-YH1 的 基 因 组 DNA
为模板,扩增获得两个目的基因,其大小与基因组
测序基因大小一致(图 1-A)。将扩增获得的 mpd 和
ophc2 基因片段纯化后,用 BamH Ⅰ和 Sac Ⅰ双酶
切,与载体 pET-32a 连接并转化 E.coli BL21(DE3),
在含有 100 mg/L 氨苄青霉素抗性平板上筛选转化
子,提取质粒酶切验证,并分别以 pET-mpd 和 pET-
ophc2 为模板进行 PCR 验证,与预测结果相符(图 1-B、
图 1-C)。
2.2 酶蛋白MPH和OPHC2的纯化
将未进行诱导的全细胞蛋白、诱导后的全细胞
蛋白及纯化后的 MPH 和 OPHC2 蛋白同时进行 SDS-
PAGE 电泳,结果证明纯化后的酶为单一条带(图 2)。
对纯化的酶进行蛋白定量,得到 MPH 浓度为 1.012
mg/mL,OPHC2 浓度为 1.028 9 mg/mL。
2.3 酶学性质的研究
2.3.1 MPH 酶和 OPHC2 酶反应最适温度 温度对
酶活力有重要影响,太高的温度会使得蛋白变性,
从而使酶失活,太低的温度又会降低酶的活性,因
此只有在最适温度下纯化酶才能发挥出最高活性。
MPH 酶在不同温度下具有不同的活性,MPH 对甲基
对硫磷的最适反应温度为 40℃左右。温度低于 40℃
时,酶的活性随着温度的升高而逐步上升,但超过
40℃酶活力迅速下降,到 80℃时酶已经失活。结果
表明此酶在室温下有较高的活性,但耐热能力较差,
高温时降解能力明显较弱。OPHC2 酶的最适反应温
度为 30℃左右。在 20-30℃的温度范围内,酶的活
力没有明显的变化,超过 30℃以后,酶的活力开始
下降,当超过 40℃后,酶活力会急剧下降,在 50℃
时只有室温时的 60%。混合酶的最适温度也在 30℃
左右,混合酶在室温时有较高的酶活,温度上升到
50℃时,酶活力下降到 60%,这与单一纯化酶相类
似(图 3)。
2.3.2 MPH 酶和 OPHC2 酶反应的最适 pH pH 值
1016 bp
A B
C
925
3472
6223
19329
bp
M 1 2 M 1 2 3 4
M 1 2 3 4
1243 bp
5900 bp
6890 bp
5888 bp
1002 bp
1016 bp
5900 bp7117 bp5888 bp
1229 bp 1243 bp
(A)M:λ-EcoT14 Ⅰ digest DNA Marker;1:mpd PCR 产物;2:ophc2 PCR 产物;
(B)M :λ-EcoT14 Ⅰ digest DNA Marker ;1 :pET-32a BamH Ⅰ 酶 切 ;2 :
pET-mpd BamH Ⅰ 酶 切 ;3 :pET-mpd BamH Ⅰ 和 Sac Ⅰ 酶 切 ;4 :pET-mpd
的 PCR 验证 ;(C)M :λ-EcoT14 Ⅰ digest DNA Marker ;1 :pET-32a BamH Ⅰ
酶切 ;2 :pET-ophc2 BamH Ⅰ酶切 ;3 :pET- ophc2 BamH Ⅰ和 Sac Ⅰ酶切 ;4 :
pET- ophc2 的 PCR 验证
图 1 PCR 扩增结果及重组质粒验证结果
14.3
66.4
29.0
97.2
kD
M 1 2 3 4 5 6
34 KD 35 KD
M :蛋白 Marker ;1 :对照全细胞蛋白 ;2 :诱导全细胞蛋白 ;3 :纯化后
MPH ;4 :对照全细胞蛋白 ;5 :诱导全细胞蛋白 ;6 :纯化后 OPHC2
图 2 MPH 及 OPHC2 纯化过程 SDS-PAGE 图
生物技术通报 Biotechnology Bulletin 2015,Vol.31,No.11232
能够对蛋白质的空间构象产生显著影响,过低或过
高的 pH 值均能够降低酶的活性甚至使酶失活,不
利于降解酶活性的发挥。降解酶通常只能在特定的
pH 值范围内具有活性。不同 pH 下酶活性测定结果
表明,两种酶都是在碱性环境中酶的活性较高,同
时都有很宽的 pH 酶解范围。MPH 的最适反应 pH
为 9,在 pH8-12 的范围内酶的相对活力均在 70%
以上,pH 为 7 时酶活力只有 40% 左右。OPHC2 酶
的 最 适 pH 为 10, 在 pH3-10 范 围 内, 随 着 pH 值
的增加,酶活一直呈增长状态,在 pH 为 10 时到达
最高值。在 pH8-12 的范围内,OPHC2 的酶活均在
70% 以上,而当 pH 为 7 时,酶活只有 50% 左右。
混合酶活力较高的 pH 范围仍是 8-12,pH8-10 范
围内酶活力在 90% 以上,pH 为 7 时酶活力下降到
50%(图 4)。
2.3.3 MPH、OPHC2 及混合酶的动力学参数 以甲
基对硫磷为底物,分别测定 MPH、OPHC2 及混合酶
的动力学参数,利用双倒数作图法,求取 K m 和 Vm
值,结果见表 2。
表 2 MPH、OPHC2 及混合酶的动力学参数
Km /(mmol·L
-1) Vmax/(mmol·L
-1·min-1)
MPH 0.23 0.03
OPHC2 0.15 0.06
混合酶 0.27 0.08
2.3.4 金属离子及有机试剂对酶活的影响 不同的
金属离子和有机试剂会对酶组分产生不同的影响,
从而促进或抑制酶的作用。由表 3 可以看出,有机
试剂 SDS 和 EDTA 对酶活的影响最大,是 MPH 和
OPHC2 的强变性剂。SDS 是一种表面活性剂,它是
两亲性分子,会使蛋白质变性,所以加入后酶会失
活;EDTA 是一种络合剂,可与金属离子形成络合物,
MPH 和 OPHC2 均金属酶,加入 EDTA 会与酶活性
中心的金属离子螯合,从而降低了酶的活性。不同
的金属离子会对酶的活性产生不同的影响。Co2+ 对
MPH 的活性有一定促进作用,但同时会对 OPHC2
的活性产生抑制作用。其他各种金属离子对 MPH
和 OPHC2 均表现出抑制作用,其中 Zn2+ 的抑制作
用最强。已有文献报道,MPH 活性中心的金属离子
为 Zn2+,晶体状态时每个活性中心的一个 Zn2+ 可被
Cd2+ 取代。OPHC2 的活性中心有 Zn2+ 还可能有 Co2+
或者 Fe2+。加入 Zn2+ 可能使得 Zn2+ 过量从而对酶的
活性产生强烈抑制。混合酶活性相对稳定,受各种
金属离子的影响较小,能够降低添加的金属离子对
酶活力的抑制作用。
2.4 MPH与OPHC2的比较分析
对常见的几种有机磷农药降解酶基因进行比较
分析,用 MEGA 5.2 构建系统进化树(图 5)。可见
mpd 和 ophc2 相似性较高,亲缘关系较近。
MPH 与 OPHC2 都属于 β-内酰胺酶,属于典型
的 β/α(TIM)折叠桶结构,活性位点均有两个金属
离子,其催化机制也类似。MPH 的晶体结构为同源
二聚体,包含 A,B 两条链;OPHC2 的晶体结构有 A、B、
C、D 和 E 5 条链,其中包括两个二聚体和一个单体
20
0.0
0.2
0.4ሩ⍫࣋% 0.60.81.01.2
30 40 ᓖć50 60 70 80
MPH
OPHC2ਸ䞦
图 3 温度对酶反应的影响
2
0.0
0.2
0.4ሩ⍫࣋% 0.60.81.01.2
4 6
pH
8 10 12
MPH
OPHC2ਸ䞦
图 4 pH 对酶反应的影响
2015,31(11) 233贾阳等 :有机磷农药降解菌 YC-YH1 中 mpd 和 ophc2 的克隆及酶学性质分析
(图 6)。MPH 每个单体中含有 45 个氢键和 8 个盐桥。
OPHC2 单体的 N 端与另一单体相互作用,单体间相
互作用强烈,有 29 个氢键和 15 个盐桥,涉及 61 个
氨基酸残基。同时 OPHC2 的每个单体还有一个二硫
键(Cys110-Cys146),可能使 OPHC2 有更好的热稳
定性。
MPH 每个单体通过 Asp151、His152、His302、
His147、His149、His234 和 Asp255 与 两 个 金 属 离
子相连,一个 H2O 分子桥与两个金属离子相连,还
有一个 H2O 分子只与一个金属离子配位。OPHC2
单 体 中 的 两 个 金 属 离 子 α 和 β,His294、His144、
Asp143、Asp247 与 α 金 属 离 子 作 用,His226、
His139、His141 还有一个 H2O 分子与 β 离子作用。
用 Swiss-PdbViewer 4.1.0 对 MPH 和 OPHC2 的 单 体
进行分析(图 7),其三维结构相似性很高,与之前
表 3 不同金属离子及有机试剂对酶解反应的影响
离子
相对酶活力 /%
MPH OPHC2 混合酶
对照组 100 100 100
Pb2+ 52.10 32.63 41.02
Zn2+ 18.48 13.07 30.49
Ni2+ 59.87 45.19 85.20
K+ 46.41 72.58 68.46
Mg2+ 39.65 56.46 65.30
Cu2+ 69.70 31.60 57.16
Li+ 67.06 56.33 73.74
Al3+ 62.21 44.02 65.08
Co2+ 110.29 77.17 93.25
Cd2+ 57.37 54.95 72.25
SDS 1.60 0 0
EDTA 0 0 0
opd-2Pseudomonas diminuta MG
opdA-1Agrobacterium tumefaciens
opdA-2Agrobacterium radiobacter
mpdPseudomonas stutzeri YC-YH1
ophc2Pseudomonas stutzeri YC-YH1
ophArthrobacter sp. B-5
opaAAlteromonas
hocAProteus mirabilis
opdBSalmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium
0.2
opd-1Flavobacterium sp. ATCC27551
图 5 几种常见有机磷降解酶基因的系统进化树
A B
A :MPH ;B :OPHC2
图 6 MPH 与 OPHC2 三维结构图
的报道一致。由图 7 中可以看到,MPH 的 Gln173-
Phe178,Gln182-Asp186,Phe196-Ala210 形 成 3 个
生物技术通报 Biotechnology Bulletin 2015,Vol.31,No.11234
α 螺 旋,Lys214-Phe216 形 成 β 折 叠, 此 段 区 域 在
OPHC2 中不存在,可能会对酶的性质有一定影响。
3 讨论
本研究将来源于施氏假单胞菌 YC-YH1 的 mpd
和 ophc2 基因克隆到大肠杆菌中,并成功进行了诱
导表达,得到了有功能活性的蛋白,通过亲和层析
的方法对蛋白进行纯化,得到了高纯度高浓度的目
的蛋白,对单一纯化酶和混合酶的酶学性质进行了
初步研究。
楚晓娜等[22]报道其纯化的的 MPH 在 pH9-12
范围内能够表现出较高的活力水平,最高活力的反
应温度为 40℃。在本研究中纯化的 MPH 的最适反
应温度也为 40℃,最适 pH 为 9,在 pH9-12 范围酶
活力同样较高。伍宁丰等对纯化的 OPHC2 进行酶学
性质分析,其降解甲基对硫磷的最适温度为 65℃,
最适 pH 为 9[24],本研究中纯化的 OPHC2 最适反
应温度为 30℃,更加接近自然环境温度,最适 pH
为 10,在 pH8-12 范围内酶活一直较高,具有较好
的 pH 适应性。MPH 和 OPHC2 组成的混合酶在 30-
40℃范围内具有很高的酶活性,在 pH9-10 范围内
其活力仍保持在最高水平。可以看出混合酶能够更
好地适应小范围内温度和 pH 的变化,使酶活力保
持在最高水平。不同金属离子及化学试剂对两种酶
的的活性都有一定影响,很多金属离子都会降低酶
的活性,SDS 和 EDTA 会使酶完全失活。比较二者
对底物甲基对硫磷的降解效率发现,MPH 对甲基对
硫磷的亲和力高于 OPHC2,而 OPHC2 对甲基对硫
磷的降解最大速率高于 MPH。混合酶对甲基对硫磷
亲和力虽然降低,但最大反应速率明显升高。
MPH 与 OPHC2 酶性质相似,OPHC2 的结构表
明其更强的热稳定性[25]。通过对酶性质的研究,可
以根据其特点定向对酶进行改造,提高降解效率和
稳定性。酶工程正在迅速发展,也逐渐应用到人们
的生活中。利用酶的进化和改造,使其应用到解决
农药污染和环境防治中具有十分重要的意义。
4 结论
株 有 机 磷 降 解 菌 施 氏 假 单 胞 菌 Pseudomonas
stetzeri YC-YH1 中产生的两种降解酶 MPH 和 OPHC2
性质相似,共同作用时混合酶比单一的降解酶具有
更好的温度和 pH 适应性,对金属离子和有机试剂
的抑制作用也具有较强的抗性,同时最高反应速率
也显著增大。
参 考 文 献
[1]Wu L, Yao J, Polonca T, et al. Compound specific isotope analysis of
organophosphorus pesticides[J]. Chemosphere, 2014, 111 :458-
463.
[2]刘建利 . 有机磷农药降解酶的研究进展[J]. 广东农业科学 ,
2010(1):60-64.
[3]Ahire KC, Kapadnis BP, Kulkarni GJ, et al. Biodegradation of
tributyl phosphate by novel bacteria isolated from enrichment
cultures[J]. Biodegradation, 2012, 23(1):165-176.
[4]Rovedatti MG, Castané PM, Topalián ML, et al. Monitoring of
organochlorine and organophosphorus pesticides in the water of the
Reconquista River(Buenos Aires, Argentina)[J]. Water Res,
2001, 35(14):3457-3461.
A B C
A :MPH 单体 ;B :OPHC2 单体 ;C :MPH 单体与 OPHC2 单体重叠比较
图 7 MPH 与 OPHC2 单体三维结构比较
2015,31(11) 235贾阳等 :有机磷农药降解菌 YC-YH1 中 mpd 和 ophc2 的克隆及酶学性质分析
[5]谷月 , 姜华 . 农药污染土壤的微生物降解[J]. 辽宁农业科学 ,
2013(4):52-55.
[6]Xie J, Zhao Y, Zhang H, et al. Improving methyl parathion hydrolase
to enhance its chlorpyrifos-hydrolysing efficiency[J]. Lett Appl
Microbiol, 2014, 58(1):53-59.
[7]王燕 , 刘建峰 , 刘振华 , 等 . 环境中有机磷农药微生物降解技术
的研究进展[J]. 安徽农业科学 , 2013, 41(16):7163-7164.
[8]Fu G, Cui Z, Huang T, et al. Expression, purification, and
characterization of a novel methyl parathion hydrolase[J]. Protein
Expression and Purification, 2004, 36(2):170-176.
[9]Zhao X, Kong W, Wei J, et al. Gas chromatography with flame
photometric detection of 31 organophosphorus pesticide residues in
Alpinia oxyphylla dried fruits[J]. Food Chemistry, 2014, 162 :
270-276.
[10]张呈祥 , 侯明 , 鲍海咏 , 等 . 急性有机磷农药中毒的相关进
展[J]. 青海师范大学学报 :自然科学版 , 2012, 28(1):54-
61.
[11]赵敏 , 陈良宏 , 张志刚 , 等 . 有机磷农药中毒机制和治疗新进
展[J]. 中国实用内科杂志 , 2014, 34(11):1064-1068.
[12]张宇童 , 杨兆娜 , 谢飞 , 等 . 有机磷农药神经发育毒性作用机
制研究进展[J]. 安徽农业科学 , 2014, 42(12):3561-3564.
[13]李松桧 , 李日强 . 有机磷农药生物降解的研究进展[J]. 科技
情报开发与经济 , 2008(2):123-124.
[14]金潇 , 颜冬云 , 秦文秀 . 有机磷农药的微生物降解技术[J].
湖南农业科学 , 2011(9):93-97.
[15]刘建利 . 利用微生物降解农药污染[J]. 生物学教学 , 2010,
35(4):5-9.
[16]龙致科 , 胡永志 , 王韧 , 等 , 农药降解酶在果蔬清洗剂中的应
用探讨[J]. 中国洗涤用品工业 , 2014(2):78-80.
[17]王晓辉 , 杜利平 , 赵丽霞 . 有机磷农药生物降解研究进展[J].
河北工业科技 , 2008, 25(6):405-409.
[18] 汤鸣强 . 三唑磷降解菌的分离鉴定及其降解酶特性的研
究[D]. 福州 :福建农林大学 , 2012.
[19] Serdar CM, Gibson DT, Munnecke DM, et al. Plasmid involvement
in parathion hydrolysis by Pseudomonas diminuta[J]. Applied
and Environmental Microbiology, 1982, 44(1):246-249.
[20]Cui Z, Li S, Fu G, et al. Isolation of methyl parathion-degrading
strain M6 and cloning of the methyl parathion hydrolase gene[J].
Applied and Environmental Microbiology, 2001, 67(10):4922-
4925.
[21]陈亚丽 , 张先恩 , 刘虹 , 等 . 甲基对硫磷降解菌假单胞菌
WBC-3 的筛选及其降解性能的研究[J]. 微生物学报 , 2002,
42(4):490-497.
[22]楚晓娜 , 张先恩 , 陈亚丽 , 等 . 假单胞菌 WBC-3 甲基对硫磷水
解酶性质的初步研究[J]. 微生物学报 , 2003, 43(4):453-
459.
[23] 伍宁丰 , 邓敏捷 , 史秀云 , 等 . 一种新的有机磷降解酶的分离
纯化及酶学性质研究[J]. 科学通报 , 2003, 48(23):2446-
2450.
[24]Su Y, Tian J, Wang P, et al. Improving the thermostability of a
methyl parathion hydrolase by adding the ionic bond on protein
surface[J]. Appl Biochem Biotechnol, 2011, 165 :989-997.
[25]Gotthard G, Hiblot J, Gonzalez D, et al. Structural and enzymatic
characterization of the phosphotrieterase OPHC2 from Pseudomonas
pseudoalcaligenes[J]. PLoS One, 2013, 8(11):e77995. doi :
10. 1371/journal. pone. 0077995.
(责任编辑 狄艳红)