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Cloning and Expression Analysis of Class-B MADS-box Genes WPI 1 and WPI 2 in Wheat

小麦B类MADS-box基因WPI1WPI2的克隆及表达分析


为探究小麦雌蕊化现象的分子遗传机制,本文从CSTP和HTS-1 2个小麦品系的幼穗中克隆得到了2个B类MADS-box基因WPI 1 和WPI 2。WPI 1 基因cDNA序列长816 bp,ORF长627 bp,编码208个氨基酸残基;WPI 2 基因cDNA序列长983 bp,ORF长630 bp,编码209个氨基酸残基。WPI 1 和WPI 2 基因均含有典型的MADS-MEF2-like和K-box结构域,C端均具有PI 结构基序。系统进化树分析表明WPI 1 和WPI 2 基因属于PI/GLO亚家族成员。Real-time PCR分析表明WPI 1 和WPI 2 基因在CSTP和HTS-1小穗中的表达模式明显不同。雌雄蕊原基形成期,WPI 1 和WPI 2 基因在HTS-1中的表达量较高,而在CSTP中表达量较低,接近为0;药隔期,WPI 1 和WPI 2 基因在HTS-1中的表达水平明显低于CSTP中的表达。WPI 1 和WPI 2 基因表达模式的改变与HTS-1雌蕊化表型有关。本研究结果为进一步探讨B类基因WPI 1 和WPI 2 在HTS-1雌蕊化中的作用奠定了基础。


全 文 :核 农 学 报 2015,29 ( 2 ) : 0221 ~ 0228
Journal of Nuclear Agricultural Sciences
收稿日期: 2014-07-16 接受日期: 2014-11-10
基金项目:国家自然科学基金( 31301319 ) ,教育部重点项目( 211164 )
作者简介:杨宇凤,女,主要从事小麦遗传育种研究。E-mail: yufeng0650@ 126. com
通讯作者:彭正松,男,教授,主要从事小麦遗传育种研究。E-mail: pzs8833@ 163. com
文章编号: 1000-8551 ( 2015 ) 02-0221-08
小麦 B类 MADS-box基因 WPI1 和 WPI2 的
克隆及表达分析
杨宇凤 彭正松 杨在君 魏淑红 廖明莉 王育伟 王清海 杨 会
( 西华师范大学 /西南野生动植物资源保护省部共建教育部重点实验室,四川 南充 637009 )
摘 要:为探究小麦雌蕊化现象的分子遗传机制,本文从 CSTP 和 HTS-1 2 个小麦品系的幼穗中克隆得到
了 2 个 B 类 MADS-box 基因 WPI1 和 WPI2。WPI1 基因 cDNA 序列长 816 bp,ORF 长 627 bp,编码 208
个氨基酸残基 ; WPI2 基因 cDNA 序列长 983 bp,ORF 长 630 bp,编码 209 个氨基酸残基。WPI1 和 WPI2
基因均含有典型的 MADS-MEF2-like 和 K-box 结构域,C 端均具有 PI 结构基序。系统进化树分析表明
WPI1 和 WPI2 基因属于 PI /GLO 亚家族成员。Real-time PCR 分析表明 WPI1 和 WPI2 基因在 CSTP 和
HTS-1 小穗中的表达模式明显不同。雌雄蕊原基形成期,WPI1 和 WPI2 基因在 HTS-1 中的表达量较高,
而在 CSTP 中表达量较低,接近为 0 ;药隔期,WPI1 和 WPI2 基因在 HTS-1 中的表达水平明显低于 CSTP
中的表达。WPI1 和 WPI2 基因表达模式的改变与 HTS-1 雌蕊化表型有关。本研究结果为进一步探讨 B
类基因 WPI1 和 WPI2 在 HTS-1 雌蕊化中的作用奠定了基础。
关键词:小麦 ;花器官发育; MADS-box 基因 ;基因克隆 ;基因表达
DOI: 10. 11869 / j. issn. 100-8551. 2015. 02. 0221
生殖生长是高等植物生活史的一个重要阶段,开
花植物生殖生长的主要执行器官—花器官的形成发育
机理一直倍受研究者的关注[1]。花器官的发育由特
定的基因控制,把这些相关基因称为同源异型基因。
1991 年 Coen 等[2]提出花器官发育的“ABC 模型”,认
为花器官的发育由 3 类基因控制,分别是控制萼片和
花瓣发育的 A 功能基因,控制花瓣和雄蕊发育的 B 功
能基因,以及控制雄蕊和心皮发育的 C 功能基因,其
中 A、C 功能基因相互抑制,B 功能基因的表达则与 A、
C 功能基因的表达相互独立。随后在矮牵牛花和拟南
芥中又发现了发现了控制胚珠发育的 D 功能基因,以
及几乎参与所有花器官发育的 E 功能基因[3 - 5],至此
“ABC 模型”扩展为“ABCDE 模型”[6]。由于 E 类基
因功能的复杂多样性,Theiβen 等[7]在 2001 年又提出
了“四因子模型 ( floral quartet model ) ”。ABCDE 模型
中大部分基因属于 MADS-box 基因,它们编码的转录
因子调控不同基因的表达[8 - 9]。在植物中已知功能的
MADS-box 基因均属于 Type II 类型。该类型的基因由
保守程度各不相同的 MADS-box、I、K 和 C 结构域构
成,因而又叫做 MIKC-type MADS-box 基因[10 - 11],并且
这些基因在花器官发育过程中起着调控作用[12 - 15]。
目前,在小麦中已经克隆得到的 MADS-box 基因
包括 13 个 MIKCc型 MADS-box 亚家族基因。其中 B
功能基因包括 3 支 : AP3 /DEF 亚家族 ( TaMADS 51、
TaMADS 82 和 TaAP3 ) ,PI /GLO 亚家族 ( WPI1、WPI2、
TaPI-1 和 TaPI-2 ) ,以及 GGM13 亚家族,又称 为
Bsister( Bs) 亚家族基因[16]。Hama 等[17]从山羊草属
异质小麦[( cr ) -CSdt7BS]中克隆得到 WPI1 和 WPI2
基因,认为 WPI1 和 WPI2 基因表达模式的改变会导致
[( cr ) -CSdt7BS]小麦雌蕊化。此外,研究报道认为
WPI1 和 WPI2 基因分别与水稻 OsMADS4 和 OsMADS2
基因同源,抑制 OsMADS2 和 OsMADS4 基因的表达会
导致水稻雄蕊同源转化为雌蕊[18]。
普通小麦雄蕊雌蕊化突变体 HTS-1 是在中国春
三雌蕊近等基因系 CSTP 群体中发现的雄蕊同源转化
为雌蕊的小麦花发育突变体[19],它同时具有三雌蕊和
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核 农 学 报 29 卷
雄蕊同源转化为雌蕊 2 种突变性状。HTS-1 不含外源
细胞质,雄蕊同源转化与核质互作无关[20 - 21],它与早
期核质互作雄蕊同源转化为雌蕊的小麦完全不
同[22 - 23],这方便单独研究细胞核基因对雄蕊雌蕊化的
作用。
本研究从小麦雄蕊同源转化为雌蕊突变体 HTS-1
和其姊妹系 CSTP 的幼穗中分别克隆得到了 WPI1 和
WPI2 2 个基因的 cDNA 序列,并进行了生物信息学分
析。通过实时荧光定量 PCR 技术初步检测了这 2 个
基因的表达模式。研究结果为进一步探讨 WPI1、
WPI2 基因在花器官发育过程中的作用以及深入研究
小麦雄蕊同源转化为雌蕊的分子机制提供了参考依
据。
1 材料和方法
1. 1 材料
本试验以中国春三雌蕊近等基因系 CSTP[19]和雄
蕊雌蕊化突变体 HTS-1 作为研究材料。分别于孕穗
期取上述 CSTP 和 HTS-1 的幼穗 ( 穗长小于 10 mm ) ,
浸入 RNA 保存液中,液氮速冻后,- 70℃保存,供克隆
WPI1、WPI2 基因所用。分 3 个时期选取上述 2 种材
料的幼穗 : 二棱期至小花分化期 ( 幼穗长约 2 ~ 5
mm) ,雌雄蕊原基分化期 ( 幼穗长约 5 ~ 7 mm ) ,药隔
时期( 幼穗长约 7 ~ 10 mm) [24],处理方法同上,供实时
荧光定量 PCR 所用。
1. 2 方法
1. 2. 1 总 RNA 的提取和 cDNA 的制备 总 RNA 的
提取按照 EZgeneTM Plant Easy Spin RNA Miniprep Kit
( Biomiga 公司,美国) 试剂盒说明书进行,将所得 RNA
溶解在 DEPC-treated ddH2O 中。然后用 1%琼脂糖凝
胶电泳和 NANODROP 2 000c 检测 RNA 的浓度和纯
度,- 70℃保存备用。
分别以 CSTP 和 HTS-1 幼穗的 RNA 为模板,按
PrimeScriptTM RT Reagent Kit ( perfect real time )
( TaKaRa 公司,中国) 试剂盒说明书进行反转录,得到
CSTP 和 HTS-1 幼穗的 cDNA。
1. 2. 2 cDNA 克隆测序 基于 GenBank 登录号为
AB107991 和 AB107992 的序列,通过 Premier5. 0 软件
设计扩增 WPI1、WPI2 基因完整 ORF 的引物 WPI1-1
和 WPI2-1,其序列如表 1。
采用 20 μL 反应体系进行 PCR 扩增,成分分别
是 : 2 × Taq PCR MasterMix 10 μL,上下游引物各 1 μL,
cDNA 2 μL,ddH2O 6 μL。反应条件是 : 94℃ 预变性
5 min; 94℃变性 30 s,52℃退火 30 s,72℃延伸 1 min,
40 个循环 ; 72℃ 继续延伸 10 min; 4℃ 保存。用含有
0. 5 × TBE 缓冲液的 1% 的琼脂糖凝胶电泳检测克隆
产物。切胶回收,与 pMD19-T 载体连接。将重组质粒
导入 DH5α 感受态细胞,涂布于含 100 μg·mL - 1
Amp +,24μg·mL - 1 IPTG 和 40μg·mL - 1 X-gal 的 LB 固
体培养基上,37℃培养。每个材料挑取 10 个阳性克隆
培养,菌液送至中国北京中美泰和生物技术公司测序。
1. 2. 3 序列分析与系统发育的构建 获得的 cDNA
序列利用 NCBI 在线软件 ORF Finder ( http: / /www.
ncbi. nlm. nih. gov / gorf / gorf. html) 进行开放阅读框的
分析。使用 DNAMAN 软件进行氨基酸序列比对。运
用 BLAST 搜索同源基因,使用 ClustalX 1. 83 软件进行
多重序列比对,再使用 MEGA5. 0 软件中的邻近相连
法构建系统发育树,并进行 Bootstrap 检测。
1. 2. 4 实时荧光定量 PCR ( Real-time PCR) 检测 应
用 Primer Express 2. 0 软件设计定量引物 WPI1-2、
WPI2-2,以及作为内参基因的 Actin ( AB181991 ) 和
Ubiq ( DQ086482 ) [25 - 26]引物,引物序列如表 1。
表 1 用于 cDNA 克隆和荧光定量的引物序列
Table 1 Sequences of primer for cDNA cloning
and real-time PCR /bp
名称
Name
序列
Sequence
片段长度
Length / bp
WPI1-1F 5-GCTCCTGGGT CCTCTTTC-3 816
WPI1-1R 5-CAACTAGCGG TGTTAAGTTC AT-3
WPI2-1F 5-GGGATGAGAA ACACAAGAGC CT-3 983
WPI2-1R 5-CAAACTATTC ACCGTCCAGC AA-3
WPI1-2F 5-TCCTGTGGGACGAGAAGCA-3 109
WPI1-2R 5-TTCACATCCTCGCCTTTCATA-3
WPI2-2F 5-CAGGCTCGTGAAACATGGTAA-3 112
WPI2-2R 5-CCCAAGCTCAAGATCCCTCAT-3
Actin-F 5-ACGCTTCCTCATGCTATCCTTC-3 121
Actin - R 5-ATGTCTCTGACAATTTCCCGCT-3
Ubiq - F 5-AAGGCGAAGATCCAGGACAAG-3 107
Ubiq-R 5-TGGATGTTGTAGTCCGCCAAG-3
采用荧光染料法进行实时荧光定量表达分析,具
体按照 SsoFastTM EvaGreen Supermix ( BIO-RAD公司,
美国) 试剂盒操作说明,在 Bio-Rad 公司 BIO-RAD
CFX96BIO-RAD CFX96 Real-Time PCR 仪上完成,每
个试验重复 3 次。通过溶解曲线和扩增曲线确定各引
物的退火温度 ;根据不同浓度的 cDNA 在引物最适 Tm
222
2 期 小麦 B 类 MADS-box 基因 WPI1 和 WPI2 的克隆及表达分析
值下的扩增结果构建标准曲线,确定每个引物的扩增
效率( E) 和相关系数 ( R2 ) ; 最后检测基因在小穗不同
发育阶段的表达量。使用 BIO-RAD CFX- 96 Real-
Time PCR 软件,输入各引物 E 值,选定 Actin 和 Ubiq
为内参基因,采用 2 - ΔΔCt法计算 WPI1 和 WPI2 的相对
表达量[27]。
2 结果与分析
2. 1 WPI1、WPI2 基因序列分析
以 CSTP 和 HTS-1 幼穗( 穗长小于 10 mm) RNA 为
模板进行反转录,再以反转录产物为模板进行 PCR 扩
增,克隆得到 WPI1 和 WPI2 基因序列 ( 图 1 ) 。WPI1
和 WPI2 基因在 CSTP 和 HTS-1 共 2 个材料中分别挑
取 10 个克隆进行测序,测序后比较发现 10 个序列相
似性达到 100%,所以在 2 个材料中各取 1 个序列进
行分析。
将克隆得到的 WPI1 和 WPI2 的一致性序列分别
与 GenBank 中报道的小麦基因 WPI1 ( AB107991 ) 和
WPI2 ( AB107992 ) 进行比较,结果表明相似性达到
99. 36%和 99. 68%,认为克隆得到的序列即为 WPI1
和 WPI2 基因。本试验从 CSTP 和 HTS-1 中克隆得到
WPI1 和 WPI2 基因共 4 条序列,其中 2 条 WPI1 基因
cDNA 序列长度均为 816 bp,2 条 WPI2 基因 cDNA 序
列长度均为 983 bp。WPI1 基因开放阅读框 ( ORF ) 长
为 627 bp,含有 49 bp 的 5非翻译区和 40 bp 的 3非翻
译区。WPI2 基因开放阅读框( ORF) 长为 630 bp,含有
46 bp 的 5非翻译区和 107 bp 的 3非翻译区。对
CSTP 和 HTS-1 中克隆得到的 2 个基因序列分别进行
相似性分析,结果表明 WPI1、WPI2 基因在 2 种材料中
序列相似性均达到 100%。
2. 2 WPI1、WPI2 氨基酸序列同源性比较
在 CSTP 和 HTS-1 中克隆得到的 WPI1 基因的开放
阅读框( ORF) 627 bp,编码 208 个氨基酸残基,WPI2 基
因的开放阅读框( ORF) 长为 630 bp,编码 209 个氨基酸
残基。将 WPI1 和 WPI2 基因推测的氨基酸序列与其它
来源于不同物种的 PI /GLO 亚家族基因氨基酸序列进
行多序列比对,结果表明,WPI1 和 WPI2 基因氨基酸序
列具有植物 MADS-box 蛋白典型的 MIKC 结构域; 1 个
保守的 MADS-MEF2-like 结构域,1 个半保守 K 结构域
( K-box) 和 1 个可变的 C 区。C 端还发现了确定 B 类
PI /GLO 家 族 MADS-box 基 因 的 PI 结 构 基 序,即
MPFxFRVPxQPNLQE[28],说明 WPI1 和 WPI2 基因属于
MADS-Box 基因家族的 PI /GLO 亚家族基因( 图 2) 。
Note: M. DL2000 DNA marker,1. WPI1-CSTP,
2. WPI1-HTS-1,3. WPI2-CSTP,4. WPI2-HTS-1.
图 1 WPI1 和 WPI2 基因扩增
Fig. 1 Amplification profile of the putative
fragment of WPI1 and WPI2 genes
运用 DNAMAN 软件,将 WPI1 和 WPI2 基因推测
的氨基酸序列分别与水稻、玉米的氨基酸序列进行同
源性比较,结果表明 WPI1 和 WPI2 编码的蛋白分别与
水稻和玉米的 2 个 PI 类基因 OsMADS4、OsMADS2 和
ZMM18、ZMM16 的同源性分别是 82. 55%、85. 85%和
77. 83%、86. 32%。
2. 3 WPI1、WPI2 基因的系统进化分析
为了了解克隆得到的 WPI1、WPI2 基因与 B 类基
因家族中其它类型基因的关系,本试验重建了系统发
育树 ( 图 3 ) 。结果表明 B 类基因分为 AP3 /DEF 和
PI /GLO 2 个分支,每个分支又通过进化形成单子叶和
双子叶植物 2 个亚支。WPI1 和 WPI2 聚集在 B 功能
基因的 PI /GLO 分支,与水稻、玉米单子叶植物聚在一
起,构成了单子叶植物亚支。结果表明,WPI1、WPI2
蛋白属于 MADS-Box 蛋白家族的单子叶植物 PI /GLO
亚家族,分别与水稻的 OsMADS4 和 OsMADS2 以及玉
米的 ZMM18 /29 和 ZMM16 亲缘关系相近。这与氨基
酸序列同源性分析结果相同。
2. 4 WPI1、WPI2 基因实时荧光定量 PCR( Real-time
PCR) 分析
利用表 1 的引物,通过实时荧光定量 PCR 方法,
采用 2一 △△CT计算方法,本试验研究了 WPI1、WPI2 基
因在 CSTP 和 HTS-1 小穗各发育时期的表达模式。
如图 4 所示,WPI1 基因和 WPI2 基因在 CSTP 和
HTS-1 中均有一定的表达量。WPI1 基因在正常小麦
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图 2 WPI1、WPI2 氨基酸序列比对
Fig. 2 The amino acid sequences alignment of WPI1,WPI2 genes
CSTP 和雌蕊化小麦 HTS-1 中的表达量差异明显。
WPI1 基因在 HTS-1 幼穗的各时期均有表达,且表达量
相近,但是从雌雄蕊原基发育时期 ( 穗长 2 ~ 5 mm ) 至
药隔时期( 穗长 7 ~ 10 mm ) ,其表达量总体呈现下降
趋势。而在 CSTP 幼穗各时期 WPI1 基因的表达量差
异很大,在二棱期至小花分化期( 穗长 2 ~ 5 mm ) WPI1
基因表达量较高;但是在雌雄蕊原基发育时期 ( 穗长 5
~ 7 mm) WPI1 基因的表达量明显下降,其表达水平接
近为零,远远低于其在 HTS-1 中的表达量 ; 药隔时期
( 穗长 7 ~ 10 mm ) WPI1 基因的表达量迅速升高达到
最高水平,且此时期 CSTP 中 WPI1 基因的表达水平约
为 HTS-1 中的 2 倍。
WPI2 基因在 CSTP 和 HTS-1 的表达模式类似于
WPI1 基因,但其整体的表达量要低于 WPI1 基因。
WPI2 基因在 HTS-1 幼穗各时期中的表达水平差异不
大,随着小穗穗长的加长,表达量呈上升趋势。进一步
分析发现,在 CSTP 中 WPI2 基因的表达水平随着小穗
穗长的增加,表达量呈现出先下降后升高的趋势,并且
在雄蕊原基发育时期没有检测到表达量,但是 HTS-1
幼穗的同一阶段 WPI2 基因却有较高的表达量。在药
隔时期,WPI2 基因的表达水平达到最高,几乎是 HTS-
1 中 WPI2 基因表达量的 2 倍。
3 讨论
近年来已经从拟南芥、金鱼草和矮牵牛花等模式
植物中克隆得到大量 MADS-Box 基因,在植物花发育
过程中这些基因具有重要的调节作用[29 - 30]。本试验
克隆得到了 2 个 MADS-Box 基因 WPI1 和 WPI2。氨基
酸序列比对、蛋白结构域比对以及系统进化树分析均
显示这 2 个基因都属于 ABCDE 模型中的 B 功能基
因,为 MADS-Box 基因中的 PI /GLO 亚家族成员。基
于拟南芥、金鱼草建立起来的 ABC 模型认为 : B 类基
因在花的第 2、3 轮发育中表达。在拟南芥中控制花瓣
422
2 期 小麦 B 类 MADS-box 基因 WPI1 和 WPI2 的克隆及表达分析
注 : 各节点处数值表示 Bootstrap 值 ( 重复 1000 次 ) 。涉及的基因序列有 : 小麦 TaMADS51,TaMADS82 ( BAA33459. 1,BAD15367. 1 ) ; 水稻的
OsMADS2,OsMADS4,OsMADS16 ( AAB52709. 1,AAC05723. 1,AAD19872. 1 ) ; 玉米 SILKY1,ZMM16,ZMM18,ZMM29 ( AAF59838. 1,Q9AR51,
Q9AR50,Q9AR49 ) ; 拟南芥 PI,AP3 ( BAA06465. 1,BAA04665. 1 ) ; 金鱼草 GLO,DEF ( Q03378,P23706 ) ; 矮牵牛花 pMADS2 ( Q07474 ) ; 洋葱
AcPI( AFX61409. 1 ) ; 风信子 HoMADS2 ( AAD22493. 2 ) ; 郁金香 TGGLO ( BAC75972. 1 ) ; 蝴蝶兰 PeMADS6 ( AAV83997. 1 ) ; 藏红花 CsatPIC1
( ABB22780. 1 ) ; 芥菜 BjPI( AAY63867. 1 ) ; 番茄 TPI( ABG73411. 1 ) ; 辣椒 PPI( ADR83606. 1 ) 。
Note : The numbers next to the nodes give bootstrap values of 1000 replicates. The B group MADS-box genes listed in the tree are as follows: Triticum
aestivum L. ( TaMADS51, BAA33459. 1. TaMADS82, BAD15367. 1 ) . Oryza sativa ( OsMADS2, AAB52709. 1. OsMADS4, AAC05723. 1.
OsMADS16,AAD19872. 1 ) . Zea mays ( SILKY1,AAF59838. 1. ZMM16,Q9AR51. ZMM18,Q9AR50. ZMM29,Q9AR49 ) . Arabidopsis thaliana
( PI,BAA06465. 1. AP3,BAA04665. 1 ) . Antirrhinum majus L. ( GLO,Q03378. DEF,P23706 ) . Petunia hybrida Vilm ( pMADS2,Q07474 ) .
Allium cepa ( AcPI,AFX61409. 1 ) . Hyacinthus orientalis ( HoMADS2,AAD22493. 2 ) . Tulipa gesneriana ( TGGLO,BAC75972. 1 ) . Phalaenopsis
equestris ( PeMADS6,AAV83997. 1 ) . Crocus sativus ( CsatPIC1,ABB22780. 1 ) . Brassica juncea ( BjPI; AAY63867. 1 ) . Solanum lycopersicum
( TPI,ABG73411. 1 ) ; Capsicum annuum ( PPI,ADR83606. 1 ) .
图 3 不同植物 AP3 /DEF 类和 PI /GLO 类 MADS-box 基因系统进化树
Fig. 3 Phylogenetic analysis of AP3 /DEF-like and PI /GLO-like MADS-box genes in plant species
和雄蕊发育的 B 功能基因为 APETALA3 ( AP3 ) 和
PISTILLATA( PI) [31 - 32],AP3 或者 PI 基因的突变均会
导致花瓣萼片化,雄蕊心皮化[33]。迄今为止,已经从
拟南芥[Arabidopsis thaliana ( L. ) Heynh.]、金鱼草
( Antirrhinum majus L. ) 、矮牵牛花 ( Petunia hybrida
Vilm) 、洋葱( Allium cepa L. ) 、水稻( Oryza stativa L. ) 、
玉米 ( Zea mays L. ) 、小麦 ( Triticum aestivum L. ) 等植
物中克隆得到了 B 功能基因。
本试验中克隆得到的 WPI1、WPI2 基因 cDNA 和
开放阅读框 ( ORF ) 序列比对结果表明,在 CSTP 和
HTS-1 中克隆得到的 2 条 WPI1 基因 ORF 序列及推导
氨基酸序列完全相同,对 WPI2 基因比对也得到相同
的结果。这表明,HTS-1 的雌蕊化表型并不是由于
WPI1 和 WPI2 基因在 2 个材料中序列上的差异所致。
氨基酸序列比对结果表明 WPI1 蛋白和 WPI2 蛋
白与其他禾本科单子叶植物的 PI /GLO 亚家族蛋白具
有较高的同源性,与拟南芥 PI、金鱼草 GLO、矮牵牛花
pMADS2 蛋白的同源性分别为 48. 2% 和 48. 2%、
50. 9%和 53. 15%、45. 95% 和 46. 85%。聚类分析结
果表明,WPI1 和 WPI2 聚集在 B 功能基因 PI /GLO 分
支,与水稻、玉米的 PI /GLO 亚家族基因聚在一起,形
成单子叶植物 PI /GLO 亚支。WPI1 基因与水稻
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注 : 2 ~ 5 mm: 二棱期至小花分化期 ; 5 ~ 7 mm: 雌雄蕊原基形成
期 : 7 ~ 10 mm. 药隔期。
Note: 2 ~ 5 mm: Double ridge stage to floret differentiation stage. 5 ~
7 mm: Pistil and stamen primordiuxn formation stage. 7 ~ 10 mm:
Anther seperation stage.
图 4 WPI1 和 WPI2 基因在小穗
不同发育阶段的表达模式
Fig. 4 Relative expression levels of
WPI1 and WPI2 genes
OsMADS4 和玉米 ZMM18 /29 基因聚为一支,WPI2 分
别与水稻 OsMADS2 和玉米 ZMM16 基因聚为一支,推
测 WPI1 与 OsMADS4 和 ZMM18 /29,WPI2 与 OsMADS2
和 ZMM16 为直系同源基因,这与 Hama 等[17]的研究
结果一致。Hong-Guy 等[34]研究认为,OsMADS4 主要
在浆片和雄蕊原基中表达,而 OsMADS2 在浆片原基中
的表达量高于在雄蕊原基中的表达 ; Northern 杂交和
原位杂交结果表明,ZMM18 /16 /29 在玉米小穗整个发
育过程中都在浆片、雄蕊和心皮中表达。在拟南芥中,
AP3 和 PI 编码的蛋白质还能形成异质二聚体,共同控
制花瓣和雄蕊的发育[35]。水稻中酵母双杂交分析表
明,SPW1 与 OsMADS2 和 OsMADS4 都能形成异质二聚
体[36],并且 SPW1 功能缺失和双重抑制 OsMADS2 和
OsMADS4 都会导致雄蕊心皮化,说明在水稻中 SPW1
与 OsMADS2、OsMADS4 在决定雄蕊发育过程中起着同
等重要的作用。玉米中,DEF /AP3 类基因 Silky1 突变
体也会导致雄蕊心皮化。本研究中,WPI1 和 WPI2 基
因在花发育过程中的作用; 与水稻、玉米的 PI /GLO 基
因的表达模式是否相似 ; 它们在参与雄蕊发育的过程
中是否与小麦中的 DEF /AP3 类基因 TaAP3 有关 ; 这 2
个基因在中国春三雌蕊近等基因系 CSTP 和 HTS-1 中
的表达模式有何异同 ; 它们与 HTS-1 雌蕊化的产生相
互关系等问题都有待于进一步研究。
本研究中采用 Real-time PCR 探讨了 WPI1、WPI2
在 CSTP 和 HTS-1 花发育过程中的表达模式。WPI1
基因在 CSTP 和 HTS-1 幼穗不同发育时期均有一定水
平的表达,WPI1 基因在正常小麦 CSTP 中的表达量呈
现先增再减再增加的趋势,而在雌蕊化的 HTS-1 中,
WPI1 基因在幼穗发育不同时期的表达量趋于平衡。
在雌雄蕊原基形成期,CSTP 幼穗中 WPI1 基因呈现极
低水平的表达量,但在雌蕊化材料 HTS-1 中 WPI1 基
因的表达量相对较高,约是 CSTP 的 7 倍,这说明 WPI1
基因在 CSTP 和 HTS-1 中的表达模式发生了改变。
Meguro 等[37]研究表明基因表达模式的改变会导致雄
蕊心皮化。由此推测,HTS-1 雌蕊化现象与 WPI1 基因
表达模式的改变有一定关系,WPI1 基因在 HTS-1 雌雄
蕊原基形成过程中起重要作用,可能在这一时期导致
雄蕊同源转变为雌蕊。Hama 等[17]对雌蕊化的异质小
麦研究表明,雌蕊化的出现是由于 WPI1 基因在第 3
轮器官发育中表达缺陷所导致。这些结果说明,WPI1
基因的表达水平与小麦雌蕊化有关,只是在不同遗传
背景的雌蕊化小麦中表达模式不同。在药隔时期,
WPI1 基因在 CSTP 中的表达量相对较高,约为 HTS-1
中表达量的 2 倍。已有研究结果表明,HTS-1 在雄蕊
同源转化为雌蕊后,其花药发育受到影响,花粉粒少,
或者出现发育不正常的花粉粒,且花粉育性远远低于
CSTP 花粉育性[38],这可能与 WPI1 基因在 HTS-1 药隔
期幼穗表达量相对较低有直接关系。
WPI2 基因在 CSTP 和 HTS-1 中的表达模式与
WPI1 基因相似,因此推测 WPI2 基因表达模式的改变
也与 HTS-1 雌蕊化表型有关。
HTS-1 是一个新颖的小麦花发育突变体。本研究
结果表明,WPI1 和 WPI2 表达模式的改变与 HTS-1 雌
蕊化表型有关。WPI1 和 WPI2 基因在 HTS-1 花发育
中的具体功能,还有待于进一步研究,并最终为阐明
HTS-1 雄蕊同源转化为雌蕊的分子调控机理奠定基
础。
4 结论
本研究以中国春三粒近等基因系 ( CSTP ) 和其姊
妹系 HTS-1 为材料,从中克隆得到了 2 个 MADS-box
基因 WPI1 和 WPI2 完整的开放阅读框,其蛋白序列均
具有典型的植物 MADS-box 蛋白结构域。序列比对和
系统进化树分析表明,WPI1 和 WPI2 基因与禾本科植
物 B 类 PI /GLO 同源基因亲缘关系较近,聚为单子叶
植物亚支。实时荧光定量 PCR 表明,在 HTS-1 幼穗雌
622
2 期 小麦 B 类 MADS-box 基因 WPI1 和 WPI2 的克隆及表达分析
雄蕊原基形成期和药隔时期,WPI1 和 WPI2 基因的表
达模式都与其在 CSTP 中的表达明显不同,WPI1 和
WPI2 在 HTS-1 中表达模式的改变与其雌蕊化现象有
关。
参考文献:
[1] 高晶涵,李清昀 . 控制植物花器官发育的分子机理[J]. 生物学
通报,2008,43 ( 2 ) : 19 - 21
[2] Coen E S,Meyerowitz E M. The war of the whorls: genetic
interactions controlling flower development[J]. Nature,1991,353
( 5 ) : 31 - 37
[3] Skinner D J,Hill T A,Gasser C S. Regulation of ovule development
[J]. Plant Cell,2004,16 ( S1 ) : 32 - 45
[4] Angenent G C,Franken J,Busscher M,Dijken A,Went J L,Dons
H J,Tunen A J. An novel class of MADS box genes is involved in
ovule development in petunia[J]. Plant Cell,1995,7 ( 10 ) : 1569
- 1582
[5] Colombo L,Franken J,Koetje E,Went J L,Dons H J,Tunen A J.
The Petunia MADS-box gene FBP11 determines ovule identity[J].
Plant Cell,1995,7 ( 11 ) : 1859 - 1868
[6] Benedito V A,Angenent G C,Tuyl J M,Krens F A. Lilium
longiflorum and molecular floral development: The ABCDE model
[J]. Acta Horticulturae,2004,651 ( 1 ) : 83 - 89
[7] Theiβen G,Saedler H. Plant biology: floral quartets[J]. Nature,
2001,409 ( 6819 ) : 469 - 471
[8] Soltis D E,Ma H, Frohlich M W, Soltis P S,Albert V A,
Oppenheimer D G,Altman N S,Pamphilis C,Leebens-Mack J.
The floral genome: an evolutionary history of gene duplication and
shifting patterns of gene expression[J]. Trends in Plant Science,
2007,12 ( 8 ) : 358 - 367
[9] 甘德芳,丁飞,庄丹,梁丹迪 . 黄瓜全基因组转录因子 MADS-
box 家族基因的序列特征分析[J]. 核农学报,2012,26 ( 9 ) :
1249 - 1256
[10] Münster T,Pahnke J,Di Rosa A,Kim J T,Martin W,Saedler H,
Theissen G. Floral homeotic genes were recruited from homologous
MADS-box genes preexisting in the common ancestor of ferns and
seed plants[J]. Proceedings of the National Academy of Sciences of
the United States of America,1997,94 ( 6 ) : 2415 - 2420
[11] Nam J,Kim J,Lee S,An J,Ma H,Nei M. TypeⅠ MADS-box
genes have experienced faster birth-and-death evolution than typeⅡ
MADS-box genes in angiosperms[J]. Proceedings of the National
Academy of Sciences of the United States of America,2003,101
( 7 ) : 1910 - 1915
[12] Alvarez-Buylla E R,Liljergren S J,Pelaz S,Gold S E,Burgeff C,
Ditta G S, Vergara-Silva F, Yanofsky M F. MADS-box gene
evolution beyond flowers: expression in pollen,endosperm,guard
cells,roots and trichomes[J]. The Plant Journal,2000,24 ( 4 ) :
457 - 466
[13] Alvarez - Buylla E R,Pelaz S,Liljegren S J,Gold S E,Burgeff C,
Ditta G S,De Pouplana L R,Martínez-Castilla L,Yanofsky M F.
An ancestral MADS-box gene duplication occurred before the
divergence of plants and animals[J]. Proceedings of the National
Academy of Sciences of the United States of America,2000,97
( 10 ) : 5328 - 5333
[14] Ng M,Yanofsky M F. Function and evolution of the plant MADS-
box gene family[J]. Nature Reviews Genetics,2001,2 ( 3 ) : 186 -
195
[15] 任磊,王雁,周琳,彭镇华 . PsMADS 基因的克隆、表达及载体
构建[J]. 核农学报,2011,25 ( 5 ) : 939 - 944
[16] Becker A,Kaufmann K,Freialdenhoven A,Vincent C,Li MA,
Saedler H,Theissen G. A novel MADS-box gene subfamily with a
sister-group relationship to class B floral homeotic genes[J].
Molecular Genetics and Genomics,2002,266 ( 6 ) : 942 - 950
[17] Hama E,Takumi S,Ogihara Y,Murai K. Pistillody is caused by
alterations to the class-B MADS-box gene expression pattern in
alloplasmic wheats[J]. Planta,2004,218 ( 5 ) : 712 - 720
[18] Kang H G,Jeon J S,Lee S,An G. Identication of class B and
class C oral organ identity genes from rice plants[J]. Plant
Molecular Biology,1998,38 ( 6 ) : 1021 - 1029
[19] 杨在君,彭正松,周永红,彭丽娟,魏淑红 . 利用 SRAP 分子标
记评价小麦三雌蕊近等基因系的遗传背景[J]. 核农学报,
2012,26 ( 1 ) : 22 - 27
[20] Peng Z S. A new mutation in wheat producing three pistils in a floret
[J]. Journal of Agronomy and Crop Science,2003,189 ( 4 ) : 270
- 272
[21] Peng Z S,Yang J,Wei S H,Zeng J H. Characterization of common
wheat ( Triticum aestivum L. ) mutation line producing three pistils
in a floret[J]. Hereditas,2004,141 ( 1 ) : 15 - 18
[22] Murai K,Takumi S,Koga H,Ogihara Y. Pistillody,homeotic
transformation of stamens into pistil-like structures, caused by
nuclear-cytoplasm interaction in wheat[J]. The Plant Journal,
2002,29 ( 2 ) : 169 - 181
[23] Murai K,Miyamae M,Kato H,Takumi S,Ogihara Y. WAP1,a
wheat APETALA1 homolog, plays a central role in the phase
transition from vegetative to reproductive growth[J]. Plant Cell
Physiology,2003,44 ( 12 ) : 1255 - 1265
[24] 王俊英,赵春江,杨宝柱 . 小麦小花发育与退化的研究[J]. 华
北农学报,1996,11 ( 2 ) : 9 - 13
[25] Yamada K,Saraike T,Shitsukawa N,Hirabayashi C,Takumi S,
Murai K. Class D and B ( sister ) MADS-box genes are associated
with ectopic ovule formation in the pistil-like stamens of alloplasmic
wheat ( Triticum aestivum L. ) [J]. Plant Molecular Biology,2009,
71 ( 1 /2 ) : 1 - 14
[26] 杨在君 . 小麦三雌蕊突变体幼穗中基因的差异表达分析[D].
雅安 : 四川农业大学,2011 : 39 - 40
[27] Livak K J,Schmittgen T D. Analysis of relative gene expression data
using real-time quantitative PCR and the 2 ( - Delta Delta C ( T ) )
method[J]. Methods,2001,25 ( 4 ) : 402 - 408
[28] Kramer E M,Dorit R L,Irish V F. Molecular evolution of genes
controlling petal and stamen development: duplication and
divergence within the APETALA3 and PISTILLATA MADS-box gene
lineages[J]. Genetics,1998,149 ( 2 ) : 765 - 783
[29] Theiβen G. Development of floral organ identity: stories from the
722
Journal of Nuclear Agricultural Sciences
2015,29 ( 2 ) : 0221 ~ 0228
MADS house[J]. Current Opinion in Plant Biology,2001,4 ( 1 ) :
75 - 85
[30] Ferrario S, Immink R G H,Angenent G C. Conservation and
diversity in flower land[J]. Current Opinion in Plant Biology,
2004,7 ( 1 ) : 84 - 91
[31] Jack T, Brockman L L,Meyerowitz E M. The homeotic gene
APETALA3 of Arabidopsis thaliana encodes a MADS-box and is
expressed in petals and stamens[J]. Cell,1992,68 ( 4 ) : 683 -
697
[32] Goto K,Meyerowitz E M. Function and regulation of the Arabidopsis
floral homeotic gene PISTILLATA[J]. Genes and Development,
1994,8 ( 13 ) : 1548 - 1560
[33] Pelaz S, Tapia-López R, Alvarez-Buylla E R, Yanofsky MF.
Conversion of leaves into petals in Arabidopsis[J]. Current Biology,
2001,11 ( 3 ) : 182 - 184
[34] Hong - Guy K,Noh Y S,Chung Y Y,Costa M A,An K,An G.
Phenotypic alterations of petal and sepal by ectopic expression of a
rice MADS box gene in tobacco[J]. Plant Molecular Biology,1995,
29 ( 1 ) : 1 - 10
[35] Honma T,Goto K. Complexes of MADS-box proteins are sufficient
to convert leaves into floral organs[J]. Nature,2001,409 ( 6819 ) :
525 - 529
[36] Yoshida H,Itoh J,Ohmori S,Miyoshi K,Horigome A,Uchida E,
Kimizu M, Matsumura Y, Kusaba M, Satoh H, Nagato Y.
Superwoman-cleistogamy,a hopeful allele for gene containent in GM
rice[J]. Plant Biotechnology Journal,2007,5 ( 6 ) : 835 - 846
[37] Meguro A, Takumi S, Ogihara Y, Murai K. WAG, a wheat
AGAMOUS homolog, is associated with development of pistil-like
stamens in alloplasmic wheats[J]. Sexual Plant Reproduction,
2003,15 ( 5 ) : 221 - 230
[38] 欧阳钟鸣 . 小麦雄蕊同源转化型不育新材料的遗传分析及不育
基因的初步定位[D]. 南充 : 西华师范大学,2012 : 22 - 23
Cloning and Expression Analysis of Class-B MADS-box Genes
WPI1 and WPI2 in Wheat
YANG Yufeng PENG Zhengsong YANG Zaijun WEI Shuhong LIAO Mingli
WANG Yuwei WANG Qinghai YANG Hui
( Key Laboratory of Southwest China Wildlife Resources Conservation Ministry of Education /
China West Normal University,Nanchong,Sichuan 637009 )
Abstract: To study the molecular and genetic mechanisms of pistillody in wheat,two B-class genes,WPI1 and WPI2
were cloned from CSTP and HTS-1 in this study. Sequence alignment results showed that the cloned cDNA of WPI1 and
WPI2 was 816 bp and 983 bp in length,respectively. WPI1 gene contains a 627 bp open reading frame ( ORF) which
encodes 208 amino acids. WPI2 gene contains a 630 bp open reading frame ( ORF ) which encodes 209 amino acids.
Alignment of the predicted amino acid sequences from WPI1 and WPI2 genes,as well as with that from previously
published subfamily members,revealed the MADS-MEF2-like and K-box domains. In the two WPI genes,the consensus
PI motif was found in the C-terminal region. Phylogenetic tree reconstructed clearly showed that these proteins were
classed into PI /GLO subgroup of B class MADS-box protein family. Real-time PCR analysis indicated that the expression
patterns of WPI1 and WPI2 genes are significantly different in spikelet of CSTP and HTS-1. In pistil and stamen
primordiuxn formation stage the expression levels of WPI1 and WPI2 are higher in HTS-1 than CSTP,the latter is close
to zero. In contrast,in anther seperation stage the expression levels of WPI1 and WPI2 are lower in HTS-1 than CSTP,
obviously. WPI1 and WPI2 genes may be bound up with pistillody of HTS-1. The study provides more insights for future
research the functions of B-class genes WPI1 and WPI2.
Keywords: wheat,floral organ development,MADS-box gene,gene cloning,gene expression
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