全 文 :植物营养与肥料学报 2015,21(3):632-643 doi牶1011674/zwyf.20150310
JournalofPlantNutritionandFertilizer htp://www.plantnutrifert.org
收稿日期:2014-01-26 接受日期:2014-07-13 网络出版日期:2015-02-04
基金项目:国家自然科学基金重点项目(40830528)资助。
作者简介:陆海飞(1990—),男,江苏靖江人,硕士研究生,主要从事土壤碳氮循环与微生物过程研究。Email:lhf903@163com
通信作者 Email:pangenxing@aliyun.com
长期无机有机肥配施对红壤性水稻土微生物
群落多样性及酶活性的影响
陆海飞1,郑金伟1,余喜初2,周惠民1,郑聚锋1,张旭辉1,
刘晓雨1,程 琨1,李恋卿1,潘根兴1
(1南京农业大学农业资源与生态环境研究所,江苏南京 210095;
2江西省红壤研究所,农业部重点野外观测站,江西进贤 331717)
摘要:【目的】长期有机与无机肥配合施用是促进农田生产力和土壤有机碳固定的重要技术途径。本文以江西省
红壤研究所长期不同施肥试验田的表土(0—15cm)为对象,探讨不同施肥措施对土壤微生物群落多样性和酶活性
的影响。【方法】在水稻收获后,采集表土壤样品,提取土壤总 DNA。采用聚合酶链反应结合变性梯度凝胶电泳
(PCR-DGGE)的方法研究土壤微生物的群落结构多样性,并结合克隆测序研究土壤微生物的群落组成;用实时荧
光定量PCR(qPCR)的方法研究土壤微生物的丰度。土壤细菌定量和群落结构分析的分子标靶基因分别为16S
rRNA基因V3区和V6区片段,土壤真菌定量和群落结构分析的标靶基因均为18SrRNA基因。DGGE分析采用
8%的聚丙烯酰胺凝胶分离细菌和真菌,所用变性梯度分别为35% 65%和20% 40%。同时采用荧光微孔板检
测技术测定土壤几丁质酶、α-葡萄糖苷酶、β-葡萄糖苷酶、纤维素酶、酸性磷酸单脂酶和木聚糖酶活性;用紫外分
光光度计法测定土壤过氧化物酶活性。【结果】PCR-DGGE分析表明,与不施肥对照(CK)相比,有机无机肥配施
(NPKM),土壤细菌的香农指数和丰富度指数显著增大,而土壤真菌的香农指数和丰富度指数在不同施肥处理间
无显著差异。DGGE图谱聚类分析显示,NPKM处理的土壤细菌和真菌的群落结构显著区别于其他3个处理。后
续的切胶测序得出,土壤细菌分属于 Chloroflexi(绿弯菌门),Proteobacteria(变形菌门)和 Firmicutes(厚壁菌门);
NPKM处理下隶属于Clostridum(梭菌属)和Anaerolineaceae(厌氧绳菌科)的两类细菌显著增加。土壤真菌主要分
属于Basidiomycota(担子菌门)和Ascomycota(子囊菌门),这些真菌条带在DGGE图谱上的分布不同处理间均无明
显的规律性,因而不同处理间真菌的群落分布未出现较清晰的变化。qPCR的结果显示,土壤细菌和真菌拷贝数在
不同处理间无显著差异。土壤酶的检测结果表明,与CK相比,单施氮肥(N)处理的土壤几丁质酶活性显著提高,
常规氮磷钾处理(NPK)处理的几丁质酶和α-葡萄糖苷酶活性显著增强,NPKM处理提高了土壤几丁质酶、纤维素
酶和过氧化物酶活性;酸性磷酸单酯酶和木聚糖酶活性在各处理间无显著差异。归一化酶活性值,NPKM处理显
著高于CK和其他施肥处理。【结论】长期有机无机肥配施可显著提高土壤细菌多样性,并改变土壤细菌和真菌的
群落结构,提高土壤酶活性,因而提高了农田生态系统的生产力并对生态系统健康有改善作用。
关键词:微生物群落结构;多样性;酶活性;红壤水稻土;长期施肥
中图分类号:S1543;S1472 文献标识码:A 文章编号:1008-505X(2015)03-0632-12
Microbialcommunitydiversityandenzymeactivityofredpaddysoilunder
longtermcombinedinorganicorganicfertilization
LUHaifei1,ZHENGJinwei1,YUXichu2,ZHOUHuimin1,ZHENGJufeng1,ZHANGXuhui1,LIUXiaoyu1,
CHENGKun1,LILianqing1,PANGenxing1
(1InstituteofResources,EcosystemandEnvironmentofAgriculture,NanjingAgriculturalUniversity,Nanjing210095,China;
2JiangxiInstituteofRedSoil/FieldObservationStationofMinistryofAgriculture,Jinxian331717,China)
3期 陆海飞,等:长期无机有机肥配施对红壤性水稻土微生物群落多样性及酶活性的影响
Abstract:【Objectives】Amendmentofsoilwithorganicandinorganicfertilizershasbeenconsideredanimportant
sourceforcarbonsequestration.However,itneedsfurtherresearchoninfluencesofcarbonsequestrationtosoil
microbialhealthandreasonsofimprovingsoilbiologicalactivity.SoilsampleswerecolectedfromJiangxiInstitute
ofRedSoil’sexperimentalfields.Theaimofourstudywastodiscusstheinfluencestomicrobialcommunity
diversityandenzymeactivityofsoilcausingbydiferentfertilizations.【Methods】Soilsampleswerecolectedafter
theharvestofrice,andtotalsoilDNAwasextracted.Soilmicrobialcommunitydiversity,compositionand
abundancewereinvestigatedusingpolymerasechainreactioncombinedwithdenaturinggradientgelelectrophoresis
(PCR-DGGE),cloningcombinedwithsequencingandquantitativerealtimePCR(qPCR).Andthetargetgenes
forqPCRandPCR-DGGEwereV3andV6partialbacterial16SrRNAorpartialfungal18SrRNA.TheDGGE
analysisofusingan8% polyacrylamidegelwithadenaturantgradientof35%-65% forbacteriaand20%-40% for
fungi.96-welmicroplatefluorimetricwasappliedtoanalysisactivitiesofβ-N-acetylglucosaminidase,α-
glucosidase,β-glucosidase,celobiohydrolase,acidphosphataseandβ-xylosidaseofsoil,andultraviolet
spectrophotometrywasusedforinvestigatingactivityofsoilperoxidase.【Results】TheShannonindexandrichness
indexofsoilbacteriaareincreasedsignificantlyunderthetreatmentoforganicmanurepluschemicalfertilization
(NPKM)comparedtothecontrolwithoutapplicationoffertilizer(CK),whiletherearenochangesinthetwo
indexesofsoilfungiamongdiferenttreatmentsbasedonthePCR-DGGEanalysis.Moreovertheclusteringanalysis
demonstratesthattheNPKMtreatmentaltersthecommunitystructureofsoilbacteriaandfungi.Theresultsof
sequencingindicatethatsoilbacteriaisafiliatedwithChloroflexi,ProteobacteriaandFirmicutes,whilesoilfungiis
belongedtoBasidiomycotaandAscomycota.ThebacterialphylabelongedtoClostridiumandAnaerolineaceaeis
stimulatedundertheNPKMtreatment,andthecommunityoffungiisnotchangessignificantly.TheresultsofqPCR
showthatthecopiesofsoilbacteriaandfungiarenotalteredunderdiferenttreatments.Thesoilenzymeassay
indicatesthatcomparingtoCK,thetreatmentofnitrogen(N)significantlyimprovestheactivityofsoilβ-N-
acetylglucosaminidase,thetreatmentofnitrogen,phosphorusandpotassium(NPK)enhancestheactivitiesofsoilβ
-N-acetylglucosaminidaseandα-glucosdiase,andtheNPKM treatmentincreasestheactivitiesofβ-N-
acetylglucosaminidase,celobiohydrolaseandperoxidaseofsoil.Theactivitiesofsoilacidphosphataseandβ-
xylosidasearenotalteredamongdiferenttreatments.Meanwhile,thenormalizedenzymeactivityisincreasedunder
theNPKMtreatmentcomparedtotheCK,NandNPKtreatments.【Conclusions】Thefindingsofthisstudy
concludethatthelongtermfertilizationtreatmentofNPKMsignificantlyincreasessoilbacterialdiversity,changes
soilmicrobialcommunitystructureandimprovessoilenzymeactivity.Therefore,thecombinedinorganic/organic
fertilizationcanenhancetheproductivityofagriculturalecosystemandimprovethehealthofsoilecosystem.
Keywords牶microbialcommunitystructure牷diversity牷enzymeactivity牷redpaddysoil牷longtermfertilization
国际科学界早就提出,合理管理下土壤固碳具
有减缓气候变化与提高农田生产力的双赢作用[1]。
我国科学家也已证明,有机无机肥配合施用是提高
稻田生产力和土壤固碳的关键农田管理措施[2-3];
不同施肥以及有机物料的投入与否可通过影响土壤
养分、基本性质来影响土壤有机质含量及其稳定性,
进而影响利用这种有机质的微生物区系的丰度及结
构变化以及微生物生物活性的变化。施肥也可通过
影响土壤养分和作物生长而对土壤中微生物丰度、
结构及其功能产生深刻影响[4-7]。土壤微生物量及
其多样性和土壤酶活性是土壤质量和生态系统健康
的指标[8-9]。有研究表明,不同施肥影响了土壤微
生物总丰度的细菌/真菌的相对丰度[10-12];施有机
物料或有机无机配施可以提高土壤多种酶的活
性[13-15]。尽管单一的土壤酶活性作为土壤健康的
指标可能存在偏差[16],但土壤总体酶活性指标[17]
和归一化酶活性强度[18]可以用来表征土壤的总体
酶活性。有机无机肥配合施用下农田生产力和土壤
固碳作用的提高是否对土壤微生物区系、土壤生物
活性和生态系统健康有明显的改善作用,仍有待进
一步研究。
本文以江西省进贤市红壤试验站的长期定位试
验中不同施肥处理的表土(0—15cm)为研究对象,
通过对土壤微生物群落的研究和土壤总体酶活性的
336
植 物 营 养 与 肥 料 学 报 21卷
分析,探讨长期不同施肥对土壤微生物多样性及土
壤酶活性的影响,进一步认识有机无机肥配合施用
条件下水稻土的固碳对生产力及生态系统的功能
效应。
1 材料与方法
11 试验地概况
试验点位于江西省进贤市(28°15′N,116°20′
E),土壤为第四纪红色黏土发育的潴育型水稻土,
属美国制典型简育湿润老成土(typicalhapludult)或
属 酸 性 简 育 水 耕 人 为 土 (acihaplic stagnic
anthrosols)[19]。受亚热带季风气候影响,年平均气
温177℃,月平均最高和最低气温分别为290℃和
50℃,年降水量1400mm,其中50%集中在3 7
月,有明显的干湿季节变化。试验前土壤有机碳含
量163g/kg、全氮149g/kg、全磷0052g/kg、全
钾107g/kg、pH69。
12 试验设计
试验始于1981年,设不施肥对照(CK)、单施氮
肥(N)、常规施氮磷钾肥(NPK)、氮磷钾配施有机肥
(NPKM)4个处理,每个处理 3个重复,小区面积
4667m2,随机区组排列[20]。各处理施肥量为:N
处理每季作物施尿素 N90kg/hm2;NPK处理每季
水稻施尿素 N90kg/hm2、P2O545kg/hm
2、K2O75
kg/hm2;NPKM处理每季施氮、磷、钾肥的量与 NPK
处理一致,另外,早稻施紫云英 (鲜重)22500
kg/hm2,晚稻施猪粪(鲜重)22500kg/hm2。种植制
度为双季稻。
13 测定项目和方法
2011年于晚稻收获时采集土壤样品。采样时
各小区按“S形”随机取5点采集0—15cm土壤样
品,混合后装袋,放入保鲜箱内带回实验室,部分鲜
样置于-80℃冰箱中保存,剩余样品除去植物残体
和石块后风干,过015mm筛备用。
131土壤基本理化性状的测定 土壤有机碳、全
氮含量的测定采用元素分析仪(ElementarVariomax
CNSAnalyser,德国Elementary公司);土壤pH值的
测定参照《土壤农化分析》相关方法[21]。
132土壤酶活性的测定 称取相当于10000g烘
干土的风干土样,放入500mL的玻璃烧杯中,加入
灭菌后冷却的醋酸缓冲液125mL,于磁力搅拌器上
均质10min后,用移液枪吸取土壤悬液,枪头去掉
尖端。采用改进的Marx等[22]的荧光微孔板检测技
术测定土壤几丁质酶、α-葡萄糖苷酶、β-葡萄糖
苷酶、纤维素酶、酸性磷酸单脂酶和木聚糖酶活性
(土壤样品12次重复,标准6次重复,空白3次重
复);用改进的 Wiliams等[23]的紫外分光光度计法
测定土壤过氧化物酶活性(土壤样品16次重复,空
白12次重复)。所用试剂购自 SigmaAldrichCo.
Ltd公司,用无菌水配置后于 4℃冰箱短暂保存
待用。
133土壤微生物分子生态分析
1)基因组DNA的提取 取025g新鲜土样,
使用 DNA快速提取试剂盒(PowerSoil,MoBio公
司),按操作说明进行,提取的 DNA用15%琼脂糖
凝胶电泳验证。
2)荧光实时定量 PCR分析 土壤细菌定量
PCR分析的分子标靶基因为16SrRNA基因 V3可
变区,采用引物为338F和518R,目标片段200bp,
扩增程序:95℃预变性3min,95℃变性1min,56℃
退火1min,72℃延伸1min,40个循环[24]。土壤真
菌标靶基因为18SrRNA基因,所用引物为 NS1和
Fung,目标片段 300bp,扩增程序:95℃预变性
3min,95℃变性1min,57℃退火 1min,72℃延伸
1min,40个循环[25]。通过 TA克隆的方法,获得上
述基因的重组质粒,以10倍梯度稀释得到各自的标
准曲线。每个样品3个重复。定量反应体系为20
μL,包括扩增酶混合物 SYBRPremixEXTaqTM
(TakaraShuzo,Shinga,Japan)10μL,DNA模板
1μL,10μmol/L上、下游引物各 04μL,无菌水
82μL。
3)聚合酶链反应(PCR) 用引物 968F和
1401R扩增细菌16SrRNA基因 V6区片段,目标片
段430bp,扩增程序:94℃预变性10min,94℃变性
1min,56℃退火 1min,72℃延伸 1min,30个循
环[26]。选取引物 NS1和 Fung扩增土壤真菌 18S
rRNA,目标片段 300bp,扩增程序:95℃预变性
5min,95℃变性 1min,57℃退火 1min,72℃延伸
1min,30个循环[25]。GC夹[24]加在上游引物的5′
端。PCR采用50μL反应体系:包括扩增酶混合物
GoTaq GreenMasterMix(Promega,USA)25μL,
DNA模板1μL,10μmol/L上、下游引物各1μL,无
菌水22μL。PCR产物用2%琼脂糖凝胶电泳验证。
4)变性梯度凝胶电泳(DGGE) 变性梯度凝胶
制备使用 BioRad475型梯度灌胶系统(Model475
GradientDeliverySystem)。采用8%的聚丙烯酰胺
凝胶(丙烯酰胺∶甲叉双丙烯酰胺为375∶1),分离
细菌所用变性梯度为 35% 65%,真菌为 20%
436
3期 陆海飞,等:长期无机有机肥配施对红壤性水稻土微生物群落多样性及酶活性的影响
40%,100%的变性剂含有7mol/L的尿素和40%的
去离子甲酰胺。凝胶制备完毕,置于加热至60℃恒
温的1×TAE缓冲液中,每个泳道加入等量的PCR产
物(约200ng),先200V电泳5min后,120V电泳
600min。电泳结束后,选用 SYBRGREENI(Lonza,
Rockland,ME,USA)对凝胶染色30min,随后转移凝
胶至Doc2000凝胶成像系统(BioRad,USA)观察并
拍照,用QuantityOne软件对图片进行分析。
5)切胶、测序和系统进化树构建 凝胶拍照后
对明显的条带进行切割,对 PCR产物纯化后,酶连
转化,挑取插入目标片段的克隆子,在上海华大基因
公司完成测序。测序结果用 BioEdit软件进行检验
和比对,得到目标序列后,输入国际生物技术信息中
心网站(NCBI)比对,挑选相似度最高并有代表性的
序列。同时这些序列提交 GenBank数据库,登录号
分别为 KJ021730-KJ021749(细菌)和 KJ021750-
KJ021766(真菌)。使用 MEGA软件51版本,邻接
法(Neighborjoininganalysis)构建系统发育树,距离
矩阵按照pdistance参数模型计算,Bootstrap检验进
行1000次取样。
14 数据处理
单个土壤酶活性值计算参照 DeForest[27]的方
法,归一化酶活性值计算采用靳振江等[18]的方法。
即采用多属性决策法对酶活性归一化处理,首先将
4个处理的7种酶活性分别进行归一化,得到单个
处理的归一化酶活性值,计算公式为:
x′i=
xi
∑4i=1xi(i=1,2,3,4)
然后将每个处理归一化的7个酶活性值相加后取算
术平均数,得到单个处理的酶活性值。微生物丰富
度指数和香农指数计算采用Hedrick等[28]的方法。
试验数据用Excel2003进行处理,用单因素方
差分析检验不同处理间的差异显著性。
2 结果与分析
21 土壤有机碳、全氮含量和土壤酶活性
与试验前相比,4个处理对土壤有机碳含量的
增幅介于1258% 3859%之间,土壤全氮含量的
增幅为1812% 7383%。从表1可以看出,N和
NPK处理的土壤有机碳和全氮含量以及土壤碳氮
比与CK相比没有显著差异;NPKM处理的土壤有
机碳和全氮含量比 CK明显提高,土壤碳氮比显著
下降;各处理间的土壤pH无显著差异。
表1 长期施肥处理下土壤的理化性质
Table1 Soilphysicochemicalcharacteristicsunderthelongtermfertilizationtreatments
处理Treatment 有机碳SOC(g/kg) 全氮TotalN(g/kg) 碳氮比C/Nratio pH
CK 1835±101b 176±007b 1042±020a 453±031a
N 1989±098b 182±009b 1091±006a 446±033a
NPK 1942±055b 176±002b 1103±026a 455±041a
NPKM 2259±079a 259±023a 878±108b 467±045a
注(Note):同列数据后不同字母表示处理间差异达 5%显著水平 Valuesfolowedbydiferentletersinacolumnaresignificantamong
treatmentsatthe5% level.
表2显示,N处理与 CK相比土壤几丁质酶活
性显著提高,其余 6种酶活性与 CK无明显差异。
与CK相比,NPK处理的土壤几丁质酶和 α-葡萄
糖苷酶活性显著增强,其余酶活性无显著变化;NPK
处理的α-葡萄糖苷酶和β-葡萄糖苷酶活性均显
著高于N处理;NPKM处理的土壤纤维素酶、过氧
化物酶和几丁质酶活性均显著高于 CK、N和 NPK
处理,α-葡萄糖苷酶活性显著高于 CK和 N处理,
β-葡萄糖苷酶活性显著高于 N处理,酸性磷酸单
酯酶和木聚糖酶活性各处理间无显著差异。计算得
出的归一化酶活性值也表现为 NPKM处理显著高
于CK和其他施肥处理。
22 土壤细菌和真菌丰度
由表3可以看出,土壤细菌丰度为每克土壤
124×1010 208×1010拷贝数,真菌丰度为每克土
壤234×107 446×107拷贝数。土壤细菌和真
菌丰度不同处理间均无显著差异。
23 土壤微生物群落结构及多样性
图1A显示,NPKM处理下存在新的条带 1和
2。图1B聚类分析结果表明,CK和N处理处于一
536
植 物 营 养 与 肥 料 学 报 21卷
表2 长期施肥处理下土壤的酶活性
Table2 Soilenzymeactivitiesunderthelongtermfertilizationtreatments
处理
Treatment
α-葡萄糖苷酶
α-Glucosidase
[nmol/(g·h)]
β-葡萄糖苷酶
β-Glucosidase
[nmol/(g·h)]
纤维素酶
Celobiohyrolase
[nmol/(g·h)]
木聚糖酶
β-Xylosidase
[nmol/(g·h)]
CK 834±168b 3801±164ab 267±028b 3344±428a
N 879±019b 3188±449b 340±012b 3376±202a
NPK 1253±117a 4488±048a 308±129b 2618±011a
NPKM 1272±157a 4076±339a 583±025a 3102±394a
处理
Treatment
几丁质酶
β-N-acetylglucosaminidase
[nmol/(g·h)]
酸性磷酸单酯酶
AcidPhosphatase
[nmol/(g·h)]
过氧化物酶
Peroxidase
[μmol/(g·h)]
归一化酶
Normalizedenzyme
[μmol/(g·h)]
CK 378±087c 21169±1306a 678±092b 022±004b
N 562±010b 19784±4346a 662±111b 023±003b
NPK 555±014b 19634±424a 799±124b 024±004b
NPKM 1007±056a 20165±664a 1160±175a 031±007a
注(Note):同列数据后不同字母表示处理间差异达 5%显著水平 Valuesfolowedbydiferentletersinacolumnaresignificantamong
treatmentsatthe5% level.
表3 长期施肥处理下土壤微生物丰度和多样性指数
Table3 Abundancesanddiversityofsoilbacteriaandfungiunderthelongtermfertilizationtreatments
处理
Treatment
拷贝数Copynumber(copies/g)
细菌(×1010)
Bacteria
真菌(×107)
Fungus
香农指数Shannonindex
细菌
Bacteria
真菌
Fungus
丰富度指数Richnessindex
细菌
Bacteria
真菌
Fungus
CK 208±052a 243±055a 291±003c 260±008a 18±1c 14±1a
N 192±083a 446±247a 303±003b 274±010a 21±1b 16±2a
NPK 124±036a 234±028a 292±003c 251±019a 19±1c 13±2a
NPKM 143±038a 258±024a 317±004a 264±015a 24±1a 14±2a
注(Note):同列数据后不同字母表示处理间差异达 5%显著水平 Valuesfolowedbydiferentletersinacolumnaresignificantamong
treatmentsatthe5% level.
个独立簇,NPK处理形成另一个独立簇,NPKM处理
聚成一簇,与CK、N和NPK处理的一簇相似度仅为
66%。由此说明,NPKM处理下土壤细菌群落结构
与其他处理存在显著的差异。从图2A可以看出,
土壤真菌显示出较大的变异性。条带1、4、5、8、9、
10、11是所有泳道共有的条带。由图2B的聚类分
析看出,CK和N、NPK3个处理未被分开,形成交错
的一簇,而 NPKM处理构成另一簇。说明只有
NPKM处理明显改变了真菌的群落结构。对比表3
的结果可以看出,N和NPKM处理的土壤细菌香农
指数和丰富度指数均明显高于 CK,而且 NPKM处
理的两个指数均较高;NPK处理与CK无显著差异。
CK、N、NPK和 NPKM处理的土壤真菌香农指数和
丰富度指数均没有明显差异。
24 土壤微生物群落组成
如图3所示,细菌 DGGE图谱中的大部分条带
(条带 2、4、5、8、10、12 20)被鉴定出属于
Chloroflexi(绿弯菌门),除条带 2外其余属于
Ktedonobacteria(纤线杆菌纲),其中条带10、14属于
Thermosporotrichaceae,条带 4、5、8、12、13、15 20
归类为Ktedonobacter(纤线杆菌属)。另一部分条带
(条带3、6、7、9、11)属于 Proteobacteria(变形菌
636
3期 陆海飞,等:长期无机有机肥配施对红壤性水稻土微生物群落多样性及酶活性的影响
图1 16SrRNAV6片段PCR产物的电泳图(A)及聚类分析(B)
Fig.1 DGGEprofile(A)ofamplified16SrRNAfragmentsandclusteranalysis(B)
图2 18SrRNAPCR产物的电泳图(A)及聚类分析(B)
Fig.2 DGGEprofile(A)ofamplified18SrRNAfragmentsandclusteranalysis(B)
门),条带3、6属于Gammaproteobacteria,条带7、9、
11属于 Betaproteobacteria。NPKM处理下出现的特
异条带 1高度隶属于 Firmicutes(厚壁菌门)下的
Clostridum(梭菌属),特异条带 2被鉴定属于
Anaerolineae(厌氧绳菌纲)下的 Anaerolineaceae(厌
氧绳菌科)。图4所示为真菌18SrRNA系统进化
树,真菌 DGGE图谱中条带 1 5、9、17属于
Basidiomycota(担 子 菌 门),其 中 条 带 9属 于
Exobasidiomycetes(外担菌纲)下的 Rhodotorula(红
酵母属);其余归为 Agaricomycetes(伞菌纲),分属
于Corticiales(伏革菌目)(条带4)和 Agaricales(伞
菌目)(条带1 3、5、17),条带3被进一步鉴定属
于Strophariaceae(球盖菇科)。条带6 8、10 14、
16属于Ascomycota(子囊菌门),其中条带7、8、10、
11、14属于Dothideomycetes(座囊菌纲),条带11又
归为 Capnodiales(煤炱目),剩余归为 Pleosporales
(格孢菌目);条带12隶属于Eurotiomycetes(散囊菌
纲)下的 Chaetothyriales(刺盾炱目);条带 6属于
Tetracladium。条带15属于 Mucorales(毛霉菌目)。
这些真菌条带在不同处理间的分布无明显规律,因
736
植 物 营 养 与 肥 料 学 报 21卷
图3 土壤细菌系统进化树
Fig.3 Phylogenetictreeofsoilbacteria
[注(Note):克隆来自图1A电泳图中的标注条带ClonesareobtainedfromtheDGGEbandsinFig.1A.Bootstrapvaluesareshownatbranch
points(>50%);图中显示大于50%的引导值,标尺设置为005Thescalebarrepresents005substitutionspernucleotide.]
836
3期 陆海飞,等:长期无机有机肥配施对红壤性水稻土微生物群落多样性及酶活性的影响
图4 土壤真菌系统进化树
Fig.4 Phylogenetictreeofsoilfungus
[注(Note):克隆来自图2A电泳图中的标注条带ClonesareobtainedfromtheDGGEbandsinFig.2A.图中显示大于50%的引导值
Bootstrapvaluesareshownatbranchpoints(>50%);标尺设置为005Thescalebarrepresents005substitutionspernucleotide.]
而不同处理间真菌的群落分布未出现较清晰的
变化。
25 相关性分析
由表4看出,土壤归一化酶活性值与土壤有机
碳、全氮含量呈显著正相关关系。细菌的香农指数、
丰富度指数与土壤有机碳含量显著正相关,与全氮
含量和归一化酶活性值无显著相关关系。而真菌香
农及丰富度指数与土壤有机碳、全氮含量和归一化
酶活性值均无显著相关关系。
936
植 物 营 养 与 肥 料 学 报 21卷
表4 土壤酶活性、微生物香农及丰富度指数与土壤性质的相关分析
Table4 Correlationsbetweensoilenzymeactivity,microbialShannonindex,microbialrichnessindexandsoilproperties
项目
Item
归一化酶活性
Normalizedenzyme
activity
细菌香农指数
Shannonindexof
bacteria
细菌丰富度指数
Rhinessindex
ofbacteria
真菌香农指数
Shannonindex
offungus
真菌丰富度指数
Rhinessindex
offungus
有机碳SOC 096 096 098 026 004
全氮TotalN 098 092 091 019 -007
归一化酶活性NEA 100 088 090 004 -020
注(Note):SOC—Soilorganiccarbon;NEA—Normalizedenzymeactivity.—P<005
3 讨论
31 长期施肥对土壤酶活性的影响
本研究结果表明,施肥均提高了土壤几丁质酶
活性,而土壤中几丁质酶活性与土壤全氮含量显著
正相关,同时由根际细菌产生的几丁质酶对植物病
原菌的生物控制有重要作用[29]。对比3个施肥处
理,纯氮(N)处理下,α-葡萄糖苷酶和 β-葡萄糖
苷酶活性显著低于氮磷钾平衡施肥(NPK)和有机
无机配施(NPKM)处理,NPK和NPKM处理下,微生
物可能更强地分解土壤中的纤维素。只在 NPKM
处理下测出土壤纤维素酶和过氧化物酶活性增加,
因此有机无机肥配施可促进土壤中葡萄糖的水解。
为了反映土壤的总体酶活性,我们计算了土壤的归
一化酶活性值,结果显示,NPKM处理下,归一化酶
活性值高于CK和N、NPK处理,并且土壤归一化酶
活性值与土壤有机碳、全氮含量呈显著正相关关系
(表4)。由此得出,有机无机肥配施优于单施化肥,
可显著增强土壤酶活性,这与郑勇等[30]的研究结果
一致。另外,刘骅等[14]和李晨华等[15]对灰漠土长
期施肥的研究也指出,化肥配施有机物料增加了土
壤酶活性,且与单施化肥相比更具优势。同时,根据
袁颖红等[31]对同一试验地的研究指出,长期施用肥
料,特别是有机无机肥配施能提高土壤微生物量碳、
潜在可矿化碳和可溶性有机碳含量,从而提高土壤
碳库质量。Zheng等[32]对该试验地土壤的室内培
养试验表明,有机无机肥配合施肥下土壤有机碳含
量提高,同时降低了有机碳分解性,降低了有机碳分
解对升温的响应。因而认识到,有机无机配合施肥
可促进土壤固碳,并增强土壤碳库的稳定性。
32 长期施肥对土壤微生物群落结构和多样性的
影响
微生物群落在土壤有机质分解和营养元素循环
中有着至关重要的作用,因此,土壤微生物群落的数
量、结构和活性被认为与生态系统功能密切相
关[33]。而张平究等[4]对太湖地区水稻土长期试验
的研究也指出,长期化肥配施有机肥显著提高了土
壤细菌的多样性。刘恩科等[34]指出化肥配施有机
物料改变了土壤细菌的群落结构,而长期施化肥对
土壤细菌群落结构的影响不大。袁红朝等[35]采用
T-RFLP技术研究了同地带的水稻土不同施肥下
的微生物群落变化,提出氮磷钾配施和化肥配施有
机物料均可显著提高土壤细菌多样性,且化肥配施
有机物料处理的多样性指数最高。使用同样的测试
方法,Ge等[36]对河南封丘的潮湿雏形土(aquic
cambosols)长期施肥试验的研究观察到无机肥配施
有机物料显著提高了土壤细菌的多样性。本研究的
结论与上述研究类似,长期有机无机肥配施显著提
高了土壤细菌的多样性,并且土壤细菌的香农指数
和丰富度指数与土壤有机碳含量显著正相关。因
此,长期无机有机肥配施可通过增加土壤有机碳含
量,为土壤细菌提供了更多的碳源,从而提高土壤细
菌的多样性。不过,本试验中三种施肥处理对土壤
真菌的多样性无显著影响,这与魏巍等[7]的研究结
果一致。不同的是,在魏巍等[7]的研究中,相比不
施肥处理,施肥处理下土壤细菌多样性水平降低,可
能是黑土基础肥力较高,施化肥的影响可能与红壤
性水稻土不同。本研究中通过聚类分析得出,长期
有机无机肥配合施用改变了土壤细菌和真菌的群落
结构。张平究等[4]也发现,化肥配施有机肥改变了
土壤细菌的群落结构。由表1看出,NPKM处理相
对CK、N和 NPK处理显著提高了土壤有机碳和全
氮含量,这给土壤微生物带来了更多碳源和营养元
素,微生物活动变得更为活跃,群落结构也可能因此
改变。
33 长期施肥对土壤微生物群落组成的影响
土壤微生物的群落组成直接影响土壤微生物的
046
3期 陆海飞,等:长期无机有机肥配施对红壤性水稻土微生物群落多样性及酶活性的影响
功能,不同类群的微生物对土壤的生理生化过程有
不同的影响,因此,了解土壤微生物的群落组成就变
得十分重要。利用克隆文库技术,袁红朝等[35]对湖
南望城和王霞等[37]对湖南常德的红壤长期施肥试
验土壤进行了微生物群落组成研究,其水稻土的优
势菌群均为 Proteobacteria(变形菌门)细菌,在秸秆
还田后其丰度显著增加。而本研究中,通过对明显
条带的切胶测序得出,供试酸性红壤水稻土中
Chloroflexi(绿弯菌门)和 Proteobacteria(变形菌门)
为细菌的优势菌群,且以 Chloroflexi(绿弯菌门)细
菌占主导。值得注意的是,在本研究中,有机碳增加
最多的NPKM处理土壤中,隶属于 Clostridum(梭菌
属)和Anaerolineaceae(厌氧绳菌科)的细菌显著增
加。已有研究表明,Clostridum(梭菌属)作为纤维素
降解菌的优势菌群广泛存在于秸秆沼气工程发酵系
统中[38];并且Clostridum(梭菌属)作为产氢产乙酸
菌的一类,是有机物厌氧消化过程中酸化阶段的主
要微生物[39]。另根据研究,Anaerolineaceae(厌氧绳
菌科)作为Chloroflexi(绿弯菌门)的代表类群,是猪
粪厌氧消化过程中起降解作用的一类主要微生
物[40]。因此,增加的这两类细菌有利于有机物的分
解,促进营养元素的循环。本试验各处理的土壤真
菌 则 主 要 属 于 Ascomycota(子 囊 菌 门)和
Basidiomycota(担子菌门),这与 He等[41]的研究基
本一致,但没有表现出随施肥处理的显著变化。
4 结论
与不施肥对照(CK)相比,长期有机无机肥配施
(NPKM)显著提高了土壤有机碳和全氮含量,显著
增强了土壤酶活性,相应地土壤细菌多样性也显著
提高。同时,供试水稻土中 Chloroflexi(绿弯菌门)
和Proteobacteria(变形菌门)为细菌的优势菌群,但
有机无机肥配施处理中隶属于 Clostridum(梭菌属)
和Anaerolineaceae(厌氧绳菌科)的两类细菌显著增
加。因此,有机无机肥配施在促进土壤有机碳固定
的同时,也提高了微生物的多样性,进而改善了生态
系统的健康和生产力。
参 考 文 献:
[1] LalR.Soilcarbonsequestrationimpactsonglobalclimatechange
andfoodsecurity[J].Science,2004,304(5677):1623-1627
[2] PanG,SmithP,PanW.Theroleofsoilorganicmaterin
maintainingtheproductivityandyieldstabilityofcerealsinChina
[J].Agriculture,Ecosystems&Environment,2009,129(1):
344-348
[3] WangCJ,PanGX,TianYGetal.Changesincroplandtopsoil
organiccarbonwithdiferentfertilizationsunderlongtermagro
ecosystemexperimentsacrossmainlandChina[J].ScienceChina
LifeSciences,2010,53(7):858-867
[4] 张平究,李恋卿,潘根兴,张俊伟.长期不同施肥下太湖地区
黄泥土表土微生物碳氮量及基因多样性变化[J].生态学报,
2005,24(12):2818-2824
ZhangPJ,LiLQ,PanGX,ZhangJW.Influenceoflongterm
fertilizermanagementontopsoilmicrobialbiomassandgenetic
diversityofapaddysoilfromtheTaiLakeregion,China[J].Acta
EcologicaSinica,2005,24(12):2818-2824
[5] HeJZ,ZhengY,ChenCRetal.Microbialcompositionand
diversityofanuplandredsoilunderlongterm fertilization
treatments as revealed by culturedependent and culture
independentapproaches[J].JournalofSoilsandSediments,
2008,8(5):349-358
[6] ShenJP,ZhangLM,GuoJFetal.Impactoflongterm
fertilizationpracticesontheabundanceandcompositionofsoil
bacterialcommunitiesinNortheastChina[J].AppliedSoil
Ecology,2010,46(1):119-124
[7] 魏巍,许艳丽,朱琳,等.长期施肥对黑土农田土壤微生物群
落的影响[J].土壤学报,2013,50(2):372-380
WeiW,XuYL,ZhuLetal.Efectoflongtermfertilizationon
soilmicrobialcommunitiesinfarmlandofblacksoil[J].Acta
PedologicaSinica,2013,50(2):372-380
[8] KennedyA C. Bacterialdiversityin agroecosystems[J].
Agriculture,Ecosystems&Environment,1999,74(1):65-76
[9] DickRP,PankhurstC,DoubeBMetal.Soilenzymeactivities
asintegrativeindicatorsofsoilhealth[J].BiologicalIndicatorsof
SoilHealth,1997:121-156
[10] 颜慧,钟文辉,李忠佩,等.长期施肥对红壤水稻土磷脂脂
肪酸特性和酶活性的影响[J].应用生态学报,2008,19
(1):71-75
YanH,ZhongW H,LiZPetal.Efectsoflongterm
fertilizationonphospholipidfatyacidsandenzymeactivitiesin
paddyredsoil[J].ChineseJournalofAppliedEcology,2008,
19(1):71-75
[11] 白震,张明,闫颖,等.长期施肥对农田黑土微生物活力与
群落结构的影响[J].土壤学报,2009,46(1):107-116
BaiZ,ZhangM,YanYetal.Efectoflongtermfertilizationon
activityandcommunitystructureofsoilmicrobeinfarmland
molisol[J].ActaPedologicaSinica,2009,46(1):107-116
[12] 卜洪震,王丽宏,尤金成,等.长期施肥管理对红壤稻田土
壤微生物量碳和微生物多样性的影响[J].中国农业科学,
2010,43(16):3340-3347
BuH Z,WangLH,YouJCetal.Impactoflongterm
fertilizationonthemicrobialbiomasscarbonandsoilmicrobial
communitiesinpaddyredsoil[J].ScientiaAgriculturaSinica.,
2010,43(16):3340-3347
[13] BhatacharyyaP,ChakrabartiK,ChakrabortyA.Microbial
biomassandenzymeactivitiesinsubmergedricesoilamended
withmunicipalsolidwastecompostanddecomposedcowmanure
146
植 物 营 养 与 肥 料 学 报 21卷
[J].Chemosphere,2005,60(3):310-318
[14] 刘骅,林英华,张云舒,等.长期施肥对灰漠土生物群落和
酶活性的影响[J].生态学报,2008,28(8):3898-3904
LiuY,LinY H,ZhangY Setal.Efectsoflongterm
fertilizationonbiodiversityandenzymeactivityingreydesertsoil
[J].ActaEcologicaSinica.,2008,28(8):3898-3904
[15] 李晨华,贾仲君,唐立松,等.不同施肥模式对绿洲农田土
壤微生物群落丰度与酶活性的影响[J].土壤学报,2012,
49(3):567-574
LiCH,JiaZJ,TangLSetal.Efectofmodeloffertilizationon
microbialabundanceandenzymeactivityinoasisfarmlandsoil
[J].ActaPedologicaSinica,2012,49(3):567-574
[16] 林天,何园球,李成亮,等.红壤旱地中土壤酶对长期施肥
的响应[J].土壤学报,2005,42(4):682-686
LinT,HeYQ,LiCLetal.Responseofsoilenzymestolong
termfertilizationinuplandredsoil[J].ActaPedologicaSinica,
2005,42(4):682-686
[17] 和文祥,谭向平,王旭东,等.土壤总体酶活性指标的初步
研究[J].土壤学报,2010(6):1232-1236
HeW X,TanXP,WangXDetal.Studyontotalenzyme
activityindexinsoils[J].ActaPedologicaSinica,2010(6):
1232-1236
[18] 靳振江,邰继承,潘根兴,等.荆江地区湿地与稻田有机碳,
微生物多样性及土壤酶活性的比较[J].中国农业科学,
2012,45(18):3773-3781
JinZJ,TaiJC,PanGXetal.Comparisonofsoilorganic
carbon,microbialdiversityandenzymeactivityofwetlandsand
ricepaddiesinJingjiangareaofHubei,China[J].Scientia
AgriculturaSinica,2012,45(18):3773-3781
[19] 龚子同.中国土壤系统分类:理论·方法·实践[M].北京:
科学出版社,1999
GongZT.SoiltaxonomicclassificationofChina:Theory,
Methodology and Applications[M]. Beijing: Science
Press,1999
[20] 李辉信,袁颖红,黄欠如,等.不同施肥处理对红壤水稻土
团聚体有机碳分布的影响[J].土壤学报,2006,43(3):422
-429
LiHX,YuanYH,HuangQRetal.Efectsoffertilizationon
soilorganiccarbondistributioninvariousaggregatesofredpaddy
soil[J].ActaPedologicaSinica,2006,43(3):422-429
[21] 鲁如坤.土壤农业化学分析方法[M].北京:中国农业科技
出版社,2000
LuR K.Methodsofsoilandagriculturalchemistry[M].
Beijing:ChinaAgriculturalScientechPress,2000
[22] MarxMC,WoodM,JarvisSC.Amicroplatefluorimetricassay
forthestudyofenzymediversityinsoils[J].SoilBiologyand
Biochemistry,2001,33(12):1633-1640
[23] WiliamsCJ,ShingaraEA,YavitJB.Phenoloxidaseactivity
inpeatlandsinNewYorkState:responsetosummerdroughtand
peattype[J].Wetlands,2000,20(2):416-421
[24] MuyzerG,DeWaalEC,UiterlindenAG.Profilingofcomplex
microbialpopulationsbydenaturinggradientgelelectrophoresis
analysisofpolymerasechainreactionamplifiedgenescodingfor
16SrRNA[J].AppliedandEnvironmentalMicrobiology,1993,
59(3):695-700
[25] MayLA,SmileyB,SchmidtMG.Comparativedenaturing
gradientgelelectrophoresisanalysisoffungalcommunities
associatedwithwholeplantcornsilage[J].CanadianJournalof
Microbiology,2001,47(9):829-841
[26] MuyzerG,SmalaK.Applicationofdenaturinggradientgel
electrophoresis(DGGE) and temperature gradient gel
electrophoresis(TGGE)inmicrobialecology[J].Antonievan
Leeuwenhoek,1998,73(1):127-141
[27] DeForestJL.Theinfluenceoftime,storagetemperature,and
substrateageonpotentialsoilenzymeactivityinacidicforestsoils
usingMUB-linkedsubstratesandL-DOPA[J].SoilBiology
andBiochemistry,2009,41(6):1180-1186
[28] HedrickDB,PeacockA,StephenJRetal.Measuringsoil
microbialcommunitydiversityusingpolarlipidfatyacidand
denaturinggradientgelelectrophoresisdata[J].Journalof
MicrobiologicalMethods,2000,41(3):235-248
[29] 林先贵.土壤微生物研究原理与方法[M].北京:高等教育
出版社,2010
LinXG.Principlesandmethodsofsoilmicrobiologyresearch
[M].Beijing:HigherEducationPress,2010
[30] 郑勇,高勇生,张丽梅,等.长期施肥对旱地红壤微生物和
酶活性的影响[J].植物营养与肥料学报,2008,14(2):316
-321
ZhengY,GaoYS,ZhangLM etal.Efectsoflongterm
fertilizationonsoilmicroorganismsandenzymeactivitiesinan
uplandredsoil[J].PlantNutritionandFertilizerScience,
2008,14(2):316-321
[31] 袁颖红,李辉信,黄欠如,等.长期施肥对红壤性水稻土活
性碳的影响[J].生态环境,2007,16(2):554-559
YuanYH,LiHX,HuangQRetal.Efectsoflongterm
diferentfertilizationonlabileorganiccarboninredpaddysoil
[J].EcologyandEnvironment,2007,16(2):554-559
[32] ZhengJ,LiL,PanGetal.PotentialaerobicCmineralizationof
aredearthpaddysoilanditstemperaturedependenceunderlong
termfertilizertreatments[J].SoilUseandManagement,2012,
28(2):185-193
[33] ZelerV,BardgetRD,TappeinerU.Siteandmanagement
efectsonsoilmicrobialpropertiesofsubalpinemeadows:astudy
oflandabandonmentalonganorthsouthgradientin the
EuropeanAlps[J].SoilBiologyandBiochemistry,2001,33
(4):639-649
[34] 刘恩科,赵秉强,李秀英,等.不同施肥制度土壤微生物量
碳氮变化及细菌群落16SrDNAV3片段 PCR产物的 DGGE
分析[J].生态学报,2007,27(3):1079-1085.
LiuEK,ZhaoBQ,LiXYetal.MicrobialCandNbiomass
andsoilcommunityanalysisusingDGGE of16SrDNA V3
fragmentPCR productsunderdiferentlongterm fertilization
systems[J].ActaEcologicaSinica,2007,27(3):1079-1085.
[35] 袁红朝,秦红灵,刘守龙,等.长期施肥对红壤性水稻土细
246
3期 陆海飞,等:长期无机有机肥配施对红壤性水稻土微生物群落多样性及酶活性的影响
菌群落结构和数量的影响[J].中国农业科学,2011,44
(22):4610-4617
YuanHC,QinHL,LiuSLetal.Responseofabundanceand
compositionofthebacterialcommunitytolongtermfertilizationin
paddysoils[J].ScientiaAgriculturaSinica.,2011,44(22):
4610-4617
[36] GeY,ZhangJ,ZhangLetal.Longtermfertilizationregimes
afectbacterialcommunity structure and diversity ofan
agriculturalsoilinnorthernChina[J].JournalofSoilsand
Sediments,2008,8(1):43-50
[37] 王霞,陈哲,袁红朝,等.应用16SrDNA克隆文库技术研究
长期稻草还田对水稻土细菌多样性的影响[J].生态学报,
2010,30(13):3865-3874
WangX,ChenZ,YuanH C etal.Efectoflongterm
fertilizationbytheapplicationofricestrawonbacterialdiversity
inpaddysoil[J].ActaEcologicaSinica.,2010,30(13):3865
-3874
[38] 崔文文.规模化秸秆沼气反应器中微生物群落结构分析
[D].北京:中国农业科学院硕士学位论文,2013
CuiWW.Analysisonmicrobialcommunityofplantscalebiogas
digestorwithstrawassubstrate[D].Beijing:Msthesisof
ChineseAcademyofAgricultureSciences,2013
[39] 钱泽澍,闵航.沼气发酵微生物学[M].杭州:浙江科学技
术出版社,1986
QianZS,MinH.Microbiologyofbiogasfermentation[M].
Hangzhou:ZhejiangScienceandTechnologyPress,1986
[40] CardinaliRezendeJ,PereiraZL,SanzJLetal.Bacterialand
archaealphylogeneticdiversityassociatedwithswinesludgefrom
ananaerobictreatmentlagoon[J].WorldJournalofMicrobiology
andBiotechnology,2012,28(11):3187-3195
[41] HeJZ,ZhengY,ChenCRetal.Microbialcompositionand
diversityofanuplandredsoilunderlongterm fertilization
treatmentsas revealed by culturedependentand culture
independentapproaches[J].JournalofSoilsandSediments,
2008,8(5):349-358
346