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Effect of different base fertilizers on soil microbial community diversity in cucumber rhizosphere

不同基肥对黄瓜根际土壤微生物群落多样性的影响


Genetic diversity and functional diversity of soil microbial community in cucumber rhizosphere as affected by different base fertilizers were studied by the Random Amplified Polymorphic DNA (RAPD) method and the BIOLOG technology, respectively. The results indicated that organic fertilizer at a rate of 75000 kg/ha or organic fertilizer (75000 kg/ha) with compound fertilizer at a rate of 300 kg/ha had higher effects on genetic diversity of soil microbial community under field conditions. Treatment of fertilizers as base application at level of 600 kg/ha resulted in decrease of DNA sequence richness index and diversity index of soil microbial communities, and the similarity coefficient of DNA sequence from soil microbial communities was the lowest compared with control. Organic fertilizer treatment was conducive to increasing DNA sequence diversity index and evenness index of soil microbial communities. Moreover, multivariate analysis of BIOLOG data indicated that organic fertilizer had a significant impact on sole carbon utilization pattern.


全 文 :收稿日期:!""#$"%$"& 接受日期:!""#$"’$(#
基金项目:国家自然科学基金项目()"&#(!%*)资助。
作者简介:吴凤芝((’%)—),女,黑龙江省勃利县人,博士,教授,主要从事设施园艺和土壤微生物生态学研究。+,-./0:1234!""%56.7889 :8-9 :;
不同基肥对黄瓜根际土壤微生物群落
多样性的影响
吴凤芝,于高波,刘 博
(东北农业大学园艺学院,哈尔滨 (&"")")
摘要:分别以 <=>?分子生物学方法和 @ABCBD生理学方法,研究了不同基肥对黄瓜根际土壤微生物群落 ?E=序
列多样性和群落功能多样性的影响。结果表明,在本试验条件下,基肥为 #&""" FG H 7-! 有机肥处理和 #&""" FG H 7-!
有机肥加 )"" FG H 7-!复合肥处理最好;基肥为 %"" FG H 7-!复合肥处理使土壤微生物群落 ?E=序列丰富度指数和
多样性指数显著下降,与对照的 ?E=序列相似系数最低;有机肥处理有利于土壤微生物群落 ?E=序列多样性、均
匀度和黄瓜产量的提高。此外,不同基肥处理改变了土壤微生物对单一碳源的利用能力。
关键词:基肥;黄瓜;土壤微生物;<=>?;@ABCBD
中图分类号:I(&*J)# 文献标识码:= 文章编号:(""K$&"&L(!""K)")$"&#%$"&
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6+-%),$%:DP;PS/: T/UPVW/S6 .;T 14;:S/8;.0 T/UPVW/S6 81 W8/0 -/:V8R/.0 :8--4;/S6 /; :4:4-RPV V7/28WX7PVP .W .11P:SPT R6
T/11PVP;S R.WP 1PVS/0/2PVW 3PVP WS4T/PT R6 S7P <.;T8- =-X0/1/PT >806-8VX7/: ?E=(<=>?)-PS78T .;T S7P @ABCBD
SP:7;808G6,VPWXP:S/UP06 9 Y7P VPW40SW /;T/:.SPT S7.S 8VG.;/: 1PVS/0/2PV .S . V.SP 81 #&""" FG H 7. 8V 8VG.;/: 1PVS/0/2PV(#&"""
FG H 7.)3/S7 :8-X84;T 1PVS/0/2PV .S . V.SP 81 )"" FG H 7. 7.T 7/G7PV P11P:SW 8; GP;PS/: T/UPVW/S6 81 W8/0 -/:V8R/.0 :8--4;/S6
4;TPV 1/P0T :8;T/S/8;W 9 YVP.S-P;S 81 1PVS/0/2PVW .W R.WP .XX0/:.S/8; .S 0PUP0 81 %"" FG H 7. VPW40SPT /; TP:VP.WP 81 ?E=
WPZ4P;:P V/:7;PWW /;TP[ .;T T/UPVW/S6 /;TP[ 81 W8/0 -/:V8R/.0 :8--4;/S/PW,.;T S7P W/-/0.V/S6 :8P11/:/P;S 81 ?E= WPZ4P;:P
1V8- W8/0 -/:V8R/.0 :8--4;/S/PW 3.W S7P 083PWS :8-X.VPT 3/S7 :8;SV80 9 BVG.;/: 1PVS/0/2PV SVP.S-P;S 3.W :8;T4:/UP S8
/;:VP.W/;G ?E= WPZ4P;:P T/UPVW/S6 /;TP[ .;T PUP;;PWW /;TP[ 81 W8/0 -/:V8R/.0 :8--4;/S/PW 9 \8VP8UPV,-40S/U.V/.SP .;.06,
W/W 81 @ABCBD T.S. /;T/:.SPT S7.S 8VG.;/: 1PVS/0/2PV 7.T . W/G;/1/:.;S /-X.:S 8; W80P :.VR8; 4S/0/2.S/8; X.SSPV; 9
7#2 8&)’-:R.WP 1PVS/0/2PV;:4:4-RPV;W8/0 -/:V8RPW;<=>?;@ABCBD
土壤微生物是土壤的重要组成部分,它对土壤
肥力的形成和植物养分的转化起着重要作用。土壤
微生物种类、数量的变化及它们在土壤中某些生物
化学过程的强度,在一定程度上反映了土壤有机质
矿化的速度及各种养分存在的状态,从而直接影响
土壤的供肥状况[(]。国内外有关不同施肥对作物的
产量、土壤微生物生物量及微生物活性的影响报道
较多[!$%],但采用 <=>? 技术(随机扩增多态性
?E=,<.;T8- =-X0/1/PT >806-8VX7/: ?E=)对土壤微
生物群落 ?E=序列多样性的研究报道较少。
我国是设施园艺面积最大的国家,但长期以来
人们为了追求较高的产量,盲目地大量施肥,造成设
施土壤环境的恶化,土壤次生盐渍化严重,制约着我
国设施农业的健康发展[#$K]。为此,以设施栽培中
植物营养与肥料学报 !""K,(*()):&#% $ &K"
!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!
>0.;S E4SV/S/8; .;T OPVS/0/2PV I:/P;:P
主要的蔬菜栽培种类黄瓜为试材,以施用不同基肥
为处理,研究不同基肥对黄瓜根际土壤微生物群落
多样性的影响,旨在为制定合理的基肥施用制度,促
进土壤良性生态循环提供科学依据。
! 材料与方法
!"! 试验材料
试验在东北农业大学试验实习基地种植 !" 年
的塑料大棚内进行。大棚内土壤的基本理化性状:
#$ %&’,有机质 ()&) * + ,*,全氮 ’&"- * + ,*,全磷 ’&.-
* + ,*,碱解氮 !!"&! /* + ,*,有效磷 ’0!&1 /* + ,*,缓效
钾 00"&" /* + ,*,速效钾 !1"&- /* + ,*。
供试黄瓜品种为山东密刺。供试肥料为撒可富
复合肥,养分含量为 -12,34 546为 ". 4". 40;供试
有机肥为干鸡粪,养分含量为每 "111 ,*含 3、5、6
分别为 (&1 ,*、%&. ,* 和 .&1 ,*。
!"# 试验设计
试验设 -个基肥处理,分别为不施基肥(7",对
照);单施撒可富复合肥 .11 ,* + 8/!(7!);基肥单施
有机肥 %(111 ,* + 8/!(7’);施撒可富复合肥 ’11
,* + 8/!和有机肥 %(111 ,* + 8/!(常规方法,7-),其它
管理措施一致(肥水管理等)。小区面积 "! /!,’次
重复,随机排列。黄瓜常规育苗、定植、管理,于拉秧
前采用抖落法采集黄瓜根际土壤,每个重复取 ’株,
混匀,过 ! //筛,一部分于 9 %1:保存备用,用于土
壤微生物群落 ;3<序列多样性的分析,另一部分用
于土壤微生物群落结构功能多样性的测定,结果为
’次测定的平均值。同时进行整个生育期产量的调
查分析。
!"$ 土壤微生物群落 %&’序列多样性的测定及分
析方法
土壤微生物群落 ;3< 多样性测试方法采用
=<5;分子标记(随机扩增 ;3<多态性)方法。数据
分析方法利用 >?@ABC, -&1 凝胶分析系统及 7DEBF
G/?*H图像分析软件对 5I=产物的电泳图片进行分
析,利用底片上的 =<5;指纹信息,通过分析统计 -
种处理的土壤微生物群落 ;3<的 =<5;条带数及
条带的灰度(范围 1!!((,1 灰度最小,!(( 灰度最
大),由于底片上 =<5;条带的灰度与其含量呈比例
关系,用条带灰度的大小来代替每个 =<5;条带的
扩增量,用于计算群落 ;3<序列的多样性指数、丰
富度指数及均匀度指数[)9"1]。
"&’&" 土壤微生物群落 ;3<序列的多样性 扩增
的 =<5;的条带的数量可代表群落 ;3<序列的丰
富度(7),它代表的是土壤微生物群落基因类型的量
化指标。土壤微生物群落 ;3<序列的多样性指数
可采用 78?FFBF9JH?KHC指数及均匀度指数来表示,
78?FFBF9JH?KHC 指数及其均匀度指数由下式计
算[)9"1]:
;L8 M 9!5D>F5D M 9!(3D + 3)>F(3D + 3)
NL8 M ;L8 + >F7
式中,;L8 为 78?FFBF9JH?KHC指数,NL8 为均匀度指
数,5D为第 G个 =<5;条带出现的概率,3D为第 G个
=<5;条带的扩增量,3为土壤微生物群落 ;3<的
=<5;条带的扩增总量(3 M!3D),7为群落 ;3<序
列丰富度指数。;L8最小值为 1,最大值为 >F7。
"&’&! 土壤微生物群落的 ;3<序列的相似系数
土壤微生物群落 ;3<序列的相似系数表示群落之
间 ;3<序列差异的信息。由下式计算求得[""]:
7OP M !3OP +(3O Q 3P)
式中,7OP为土壤 R和土壤 S之间的 ;3<序列相似系
数,3OP为土壤 R和土壤 S共有的扩增条带,3O为土
壤 R的扩增条带数,3P为土壤 S的扩增条带数。
"&’&’ 土壤微生物群落 ;3<序列的 5I=反应条件
土壤微生物 ;3<的提取采用夏北成["!]的 7;7 +
IT试剂盒纯化方法。土壤微生物群落 ;3< 序列的
5I=扩增反应采用焦晓丹的方法["’]。
!"( 土壤微生物群落功能多样性分析
UGX>XY碳素利用法:取经预培养(活化微生
物)后的新鲜土样(相当于 "1 *烘干土样重),放入
含 "11 /> 无菌水的三角瓶内,"(11 C + /DF 振荡 "1
/DF,然后用无菌水分步稀释得到 "19 ’倍,稀释液经
离心去除残留的土壤后,上清液用于接种。接种后
的微孔板在 !(:下培养 % W,每天用 UGX>XY自动读
数装置在 ()1 F/下测定吸光值。平均吸光值(?*H JH[[ IB[B\C ;HKH[B#/HF],谢活性密切相关。并由此计算出土壤微生物群落功
能多样性指数。用 YHFL]?C] ((3]W,XR^BCW,_6)软
件进行所有的方差分析和回归分析。为了缩小不同
重复间接种密度差异引起的误差,UGX>XY读数在分
析前均用平均吸光值进行了校正。吸光值用主成分
分析(5I<)["-]。
# 结果与分析
#"! 土壤微生物群落 %&’ 序列多样性的变化
()’*%)
!&"&" 土壤微生物群落 ;3<序列的总体扩增分析
%%(’期 吴凤芝,等:不同基肥对黄瓜根际土壤微生物群落多样性的影响
本试验共检测了 !"个随机引物(表 !),其扩增产
物在 !#$%的琼脂糖凝胶中均能分辨出清晰的
&’()条带,共计扩增出 !$!个 &’()条带(表 *),其
表 ! 筛选出的随机引物及其核酸序列
"#$%& ! "’& (&%&)*&+ ,-./&-( #0+ *’&.- 01)%&2*.+& (&31&0)&
引物编号
(+,-.+ /01.
序列
2’!3’4.56.7/.
89含量(%)
89 /07:.7:
*;! 9<9’8<8<99 ;"
!3$= 9<’989<9’9 ="
!*!2 ’9’9<9<899 ;"
!2"$ ’’8’8999<9 ;"
*3; ’9’9999’9’ ;"
>$ 99<99’8<8< ="
?3 9<999<89’’ ;"
@!* 888’98<<88 ="
’!* <98898’<’8 ;"
!*;$ 9’998’<99’ ;"
中非多态性条带 !A 条,占 !!%,多态性条带 !;*
条,占 $A% 。非多态性条带指对 B种土壤微生物群
落 )C’均能扩增出的条带,即此种微生物在 B种土
样中均存在。多态性条带指对 B种土壤微生物群落
)C’并非全能扩增出的条带。
*#!#* 不同基肥对土壤微生物群落 )C’序列多样
性指数的影响 不同基肥对黄瓜根际土壤微生物群
落 )C’序列多样性的影响(表 3)表明,复合肥处理显
著降低了土壤微生物群落 )C’ 序列丰富度指数,单
施有机肥的土壤微生物群落 )C’序列多样性指数、
丰富度指数和均匀度指数显著高于复合肥和不施基
肥处理的土壤,有机肥处理和有机加复合肥处理的土
壤微生物群落 )C’序列多样性指数均显著高于复合
肥处理。说明有机肥有利于土壤微生物多样性指数、
丰富度指数和均匀度指数的提高。有机肥加复合肥
处理与不施基肥处理的各项参数差异不显著。
表 4 !5 种引物对 6种土壤微生物群落总 789的扩增结果
"#$%& 4 "&0 ,-./&-( #/,%.:.&+ 21*,1*( *2 /.)-2$.#% )2//10.*; 789 2: (.< (#/,%&(
引物
(+,-.+
/01.
扩增条带数
’-DE,F,.1
F+GH-.7:I
非多态性条带数
C07D0EJ-0+DK,/
F+GH-.7:I
多态性条带数
(0EJ-0+DK,/
F+GH-.7:I
多态性条带所占比例(%)
&G:,0 0F D0EJ-0+DK,/ F+GH-.7:I
:0 :0:GE F+GH-.7:I
*;! *3 * *! A!
!3$= *B 3 *! $$
!*!2 *" ! !A A2
!2"$ *! * !A A"
*3; *; * *B A*
>$ *3 * *! A!
?3 *! 3 !$ $;
@!* *! * !A A"
’!* *3 * *! A!
!*;$ ** ! *! A2
总数 <0:GE !$! !A !;* $A
表 6 不同基肥对土壤微生物群落 789序列多样性的影响
"#$%& 6 =::&)* 2: +.::&-&0* :&-*.%.>&-( 20 ?&0&*.) +.@&-(.*; 2:
(2.% /.)-2$.#% )2//10.*;
处理
<+.G: L
丰富度指数
4
多样性指数
)IK
均匀度指数
MIK
4! 2#! N "#* O !#2$" N "#3 O "#AB$ N "#"! O
4* B#2 N "#* / !#B"; N "#! / "#A;$ N "#"* GO
43 ;#" N "#! G !#=;; N "#* G "#A=B N "#"3 G
4B 2#2 N "#! GO !#;;! N "#* GO "#A=$ N "#"* G
*#!#3 不同基肥对土壤微生物群落 )C’序列相似
系数的影响 表 B看出,不施基肥的土壤与施有机
肥的土壤相似程度较高,相似系数为 "#;2$;而与施
复合肥的处理相似程度较低,相似系数为 "#2;$。
基肥为复合肥的土壤与基肥为有机肥的土壤的相似
程度最高,相似系数为 "#=**;基肥为有机肥的土壤
与基肥为有机肥加复合肥的土壤的相似程度最低,
相似系数为 "#23$。
4A4 施肥对土壤微生物群落功能多样性的影响
(BCDEDF)
不同基肥处理土壤的平均吸光值(图 !)看出,
复合肥处理的吸光值在 A; K后显著高于其他处理,
无基肥和有机肥加复合肥处理的土壤间差异不显
$=2 植 物 营 养 与 肥 料 学 报 !B卷
表 ! 土壤微生物群落 "#$序列的相似系数
%&’() ! *+,+(&-+./ 01)22+0+)3. 12 41+( ,+0-1’+&(
01,,53+./ "#$ 4)65)30)
土壤 !"#$ !% !& !’ !(
!% )*+,- )*,+- )*,)&
!& . )*.&& )*,+,
!’ %, %/ )*+’-
!( %% %+ +
注:表中对角线上部为群落的相似系数,下部为群落共有的扩
增片段数。
0"12:342 5616 67"82 5#69":6$ 6;2 <#=#$6;#1> ?"2@@#?#2:1< "@ ?"==A:#1>
6:5 14"<2 72$"B 5#69":6$ 6;2 :A=72; "@ ?"==": 6=C$#@#25 76:5图 7 土壤微生物对碳源利用的平均吸光值
8+9:7 ;)&3 &’41-’&30) 12 <=>?>@ A(&.) 21-
.B) .)4.)C 41+(4
著,而两者均显著高于有机肥处理,而显著低于复合
肥处理。说明复合肥处理会使土壤微生物代谢活性
及微生物数量增加。
不同土壤的主成分变量分析结果表明,试验数
据的主成份分析能很好地区分这些土壤微生物的功
能多样性,其中第一主成份(EF%)解释了 (/*+)G的
变异,第二主成份(EF&)解释了 &(*-’G的变异(图
&)。复合肥处理和有机肥处理与对照相比,在 EF%
上均有明显差异,复合肥处理使土壤的 EF% 降低,
而有机肥处理使土壤的 EF% 值增大。复合化肥和
有机肥处理的 EF%与对照相近,但在 EF&上有明显
差异。以上结果揭示了培肥管理措施能明显影响土
壤微生物的群落结构。对主成分变量中最有影响碳
源的分析表明,HI木糖、酮式丁酸与 EF%正相关,而
衣康酸、二羟基苯甲酸与 EF%负相关。对于 EF&来
说,葡糖胺酸及乙酰IHI葡糖胺与之正相关,而 HI
纤维二糖丙酮酸甲酯与它呈负相关。这同样证明培
肥管理措施改变了土壤微生物对有机碳源的利用能
力。
图 D <=>?>@ EF>板测试中不同土壤主成份变量 GF7和 GFD
8+9:D G-+30+A&( 01,A13)3.(GF)GF7 &9&+34. GFD
9)3)-&.)C ’/ A-+30+A&( 01,A13)3. &3&(/4+4 +3 <=>?>@
EF> A(&.)4 ’).H))3 C+22)-)3. 41+(4
DIJ 不同基肥对黄瓜产量的影响
不同基肥处理对黄瓜产量的影响(图 ’)表明,
基肥为有机肥和有机肥加复合肥的处理的黄瓜产量
间无显著差异,并且二者显著高于复合肥处理和对
照。说明在本试验土壤条件下,有机肥处理和有机
加复合肥处理在产量上达到了同样的效果。
图 J 不同基肥对黄瓜产量的影响
8+9:J E22)0. 12 C+22)-)3. ’&4) 2)-.+(+K)-4 13 0505,’)- /+)(C
J 讨论
有研究表明,长期单施化肥与不施化肥相比,土
壤微生物数量有一定程度的增加[(]。在化肥污染情
况下,与无污染的土壤相比,土壤微生物数量大大
增加,但土壤微生物群落的 H0J 序列的丰富度和
均匀度及多样性指数都有所降低[%%]。本试验结果
表明,复合肥处理的土壤的微生物群落 H0J序列多
样性指数和丰富度指数均显著降低,但土壤微生物
的代谢活性及微生物数量却大大增加(图 %),与前
人研究结果相似。
在本试验土壤条件下,有机肥处理与有机肥加
/.+’期 吴凤芝,等:不同基肥对黄瓜根际土壤微生物群落多样性的影响
复合肥处理的黄瓜产量相近,可能是因为供试土壤
养分含量较高,存在明显的施肥报酬递减的规律,即
施肥量达到一定量后产量不再随着施肥量的增加而
增加[!"]。因此,在本试验条件下,只施入有机肥即
可,不必再施入 #$$ %& ’ ()*的复合肥,但在生产中仍
需施入一定量的复合肥。另外,在本试验土壤环境
下,单施 +$$ %& ’ ()*复合肥使土壤微生物群落 ,-.
序列多样性指数和丰富度指数显著下降,因此,合理
的施肥应引起高度重视。但如何进行更合理的有
机、无机结合还有待于进一步研究。
参 考 文 献:
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