免费文献传递   相关文献

Proteome analysis of pathogen-responsive proteins from apple leaves induced by Alternaria alternata apple pathotype

苹果叶片应答斑点落叶病菌胁迫的蛋白质组学分析



全 文 :植物病理学报
ACTA PHYTOPATHOLOGICA SINICA  44(4): 438 ̄442(2014)
收稿日期: 2013 ̄10 ̄06ꎻ 修回日期: 2014 ̄03 ̄14
基金项目: 农业部现代农业产业技术体系建设专项资金(CARS-28)ꎻ国家自然科学基金资助项目(30900968ꎻ 31201602)ꎻ国家“863”项目
(2011AA10020404)ꎻ国家科技支撑计划项目(2013BAD02B01)
通讯作者: 丛佩华ꎬ研究员ꎬ主要从事苹果育种研究ꎻTel: 0429-3598103ꎬE ̄mail: congph@163􀆰 comꎮ
doi:10.13926 / j.cnki.apps.2014.04.014
􀤃􀤃􀤃􀤃􀤃􀤃
􀤃􀤃􀤃􀤃􀤃
􀤃
􀦃 􀦃
􀦃
􀦃
研究简报
苹果叶片应答斑点落叶病菌胁迫的蛋白质组学分析
张彩霞1ꎬ2ꎬ 张利义1ꎬ2ꎬ 田 义1ꎬ2ꎬ 陈 莹1ꎬ2ꎬ 康国栋1ꎬ2ꎬ 丛佩华1ꎬ2∗ꎬ
王 强1ꎬ2ꎬ 杨 玲1ꎬ2ꎬ 李武兴1ꎬ2
( 1 农业部园艺作物种质资源利用重点实验室ꎬ辽宁兴城 125100ꎻ 2 中国农业科学院果树研究所ꎬ辽宁兴城 125100)
Proteome analysis of pathogen ̄responsive proteins from apple leaves induced by
Alternaria alternata apple pathotype  ZHANG Cai ̄xia1ꎬ2ꎬ ZHANG Li ̄yi1ꎬ2ꎬ TIAN Yi1ꎬ2ꎬ CHEN
Ying1ꎬ2ꎬ KANG Guo ̄dong1ꎬ2ꎬ CONG Pei ̄hua1ꎬ 2ꎬ WANG Qiang1ꎬ2ꎬ YANG Ling1ꎬ2ꎬ LI Wu ̄xing1ꎬ2( 1 Key La ̄
boratory of Biology and Genetic Improvement of Horticultural Crops (Germplasm Resources Utilization)ꎬ Ministry of Agricul ̄
tureꎬ Xingcheng Liaoning 125100ꎬ Chinaꎻ2 Research Institute of Pomologyꎬ Chinese Academy of Agricultural Sciencesꎬ
Xingcheng Liaoning 125100ꎬ China)
Abstract: In order to elucidate key proteins related to disease ̄resistance in apple leavesꎬ the total proteins
were extracted from control and infected apple leavesꎬ and separated by two ̄dimensional electrophoresis􀆰 The
differential expressed proteins were then identified by MALDI ̄TOF ̄TOF / MS􀆰 In totalꎬ 25 differential
expressed proteins were detected by Image Master Software􀆰 After tryptic digestionꎬ MALDI ̄TOF ̄TOF / MS
analysis and database searchingꎬ 20 protein spots were finally identifiedꎬ including 11 functional proteins
related to photosynthesisꎬ energy metabolismꎬ stress and defense responses􀆰 The pathogenesis ̄related proteins
involved in defense responses such as APXꎬ GPX and Mal d1 were differentially expressed in apple leaves􀆰 It
indicates that these proteins may play a key role in the resistance to A􀆰 alternata apple pathotype􀆰
Key words: differential proteomicsꎻ apple leavesꎻ A􀆰 alternata apple pathotypeꎻ stress
文章编号: 0412 ̄0914(2014)04 ̄0438 ̄05
    苹果斑点落叶病(Apple Alternaria Blotch)又
称褐纹病ꎬ是目前我国苹果主产区的主要病害之
一ꎮ 病原菌是植物发病的主要生物胁迫因子ꎮ 目
前ꎬ植物寄主应答病原真菌胁迫的蛋白质组学研究
在拟南芥、水稻等模式植物中已广泛展开ꎮ 以往关
于苹果斑点落叶病的研究大多围绕其致病机制、防
治方法及抗性评价等[1]ꎬ对侵染过程中与苹果抗
病性密切相关的寄主自身动态防御反应机制研究
报道甚少ꎮ开展苹果属植物寄主响应病原菌胁迫
的差异蛋白质组学研究ꎬ通过对抗性相关蛋白的差
异表达分析ꎬ可从分子水平直接了解苹果属植物应
答病原菌胁迫所启动的抗性机制ꎮ 本研究以苹果
叶片与斑点落叶病菌(A􀆰 alternata apple pathotype)
为研究对象ꎬ利用蛋白质组学方法分析胁迫过
程中差异表达的功能蛋白ꎬ以揭示苹果叶片应
答病原菌胁迫的蛋白质组变化ꎬ为优质抗病苹
果新种质的遗传改良和定向选育提供部分理论
依据和技术借鉴ꎮ
 
  4期 张彩霞ꎬ等:苹果叶片应答斑点落叶病菌胁迫的蛋白质组学分析
1  材料与方法
1􀆰 1  苹果试材及病原菌接种
    苹果叶片试材取自国家苹果育种中心资源圃
内ꎬ清洗后于大培养皿中无菌保湿 2 d 后淘汰发病
叶片ꎮ 供试病原菌(A􀆰 alternata apple pathotype)接
种于 PDA 培养基ꎬ25℃、24 h 光照条件下培养ꎬ毛
笔刷收集菌苔分生孢子制成孢子悬液ꎮ 将孢子悬
液点接于叶片下表皮叶脉两侧ꎬ以无菌水为空白对
照ꎬ接种后模拟果园光周期设置光照条件ꎬ25℃恒
温保湿培养ꎬ24、48 h后观察取样ꎮ
1􀆰 2  苹果叶片总蛋白提取及定量
    分别取培养皿中对照叶片及发病叶片ꎬ去除叶
柄ꎬ各称取 2 gꎬ于液氮中迅速研磨成粉末ꎮ 总蛋白
提取参照 Tris ̄饱和酚抽提法[2]完成ꎮ 将制备好的
蛋白干粉溶于样品裂解液[2]ꎮ 采用双向电泳蛋白
定量试剂盒(2 ̄D QUANT KITꎬGE Healthcare)对
蛋白溶液样品进行定量ꎮ
1􀆰 3  双向电泳
    本试验等电聚焦过程采用预制 IPG 胶条(18
cmꎬ pH 4~7)ꎬ上样量 800 μgꎬ上样体积 350 μLꎬ
IPG泡涨盘完成被动水化过程ꎮ 水化结束后立即
进行等电聚焦电泳( IPG ̄IEF)ꎮ 等电聚焦过程结
束后ꎬ将胶条分别置于含 1%DTT 和 2􀆰 5% 碘乙酰
胺的平衡液[2]中分别平衡 15 minꎬ 然后再转移至
垂直板电泳槽上进行第二向电泳ꎮ 电泳完成后的
凝胶进行考马斯亮蓝 R ̄350(CBB R ̄350)染色ꎮ
1􀆰 4  图像扫描及分析
    凝胶脱色后立即用 Image Scanner 扫描仪进行
扫描ꎮ 凝胶图像采用 Image Master 2D P1atinum
7􀆰 0分析软件进行差异点分析ꎬ运用 SPSS 统计软
件进行 ANOVA(P<0􀆰 05)显著性分析ꎮ
1􀆰 5  差异蛋白点质谱分析及数据库检索
    将切下的差异蛋白点利用胶内原位酶解方法进
行处理ꎬ串联飞行时间质谱仪(4800 Plus MALDI
TOF / TOFTM   Analyzer) 进行质谱分析ꎮ 本研究中
质谱分析(MALDI ̄TOF ̄TOF / MS)工作由中科院
(上海)蛋白质组研究分析中心完成ꎮ 将获得的
PMF图谱数据利用 Mascot软件在 NCBI数据库中
进行检索ꎮ
2  结果与分析
2􀆰 1  苹果叶片应答病原菌胁迫的双向电泳图谱
分析及质谱鉴定
    对斑点落叶病菌侵染前后苹果叶片总蛋白进行
双向电泳分析ꎬ获得清晰的蛋白质表达谱(图 1)ꎮ
结果表明ꎬ有 39个蛋白质点发生变化ꎬ再经 SPSS软
件分析ꎬ共获得 25个显著性差异蛋白点(图 1)ꎬ其
中 20个蛋白点得到成功鉴定(表 1)ꎬ包括 5个下调
蛋白和 15个上调蛋白(图 2)ꎮ 此外ꎬ已鉴定的蛋白
点中除了 5个与苹果属植物同源的蛋白外ꎬ其余蛋
白均为与其他植物高度同源的相关蛋白ꎮ
Fig. 1  Comparison of proteome patterns of control and infected leaves
in response to the fungal pathogen Alternaria alternata apple pathotype
A: Control leaves( inoculated with water for 48 h)ꎻ B: Infected leaves ( inoculated with pathogen for 48 h)ꎻ
The spots with altered abundance are circled with lines.
934
 
植物病理学报 44卷
Table 1  Identification of differential proteins in apple leaves induced by Alternaria alternata
apple pathotype with MALDI ̄TOF / TOF and database searching
Protein
No􀆰
Protein name Accession No􀆰
MW
(Da) / pI
Species
MASCOT
score
Peptides
count􀆰
Possible
function
1 Apgm gi | 4165550 60927􀆰 1 / 5􀆰 44 Malus x domestica 88 7 Unknown protein

S ̄adenosylmethionine
synthetase 3(SAMS)
gi | 224108858 43610􀆰 8 / 5􀆰 5 Populus trichocarpa 411 12 Stress response

S ̄adenosylmethionine
synthetase 1(SAMS)
gi | 224101473 43612􀆰 9 / 5􀆰 5 P􀆰 trichocarpa 487 13 Stress response

Glutamate ̄1 ̄semialdehyde
2ꎬ1 ̄aminomutase 2
gi | 297816078 50746􀆰 6 / 6􀆰 36
Arabidopsis
lyrata subsp􀆰
121 5 Photosynthesis

Putative NAD dependent
epimerase / dehydratase
gi | 255559448 43230􀆰 8 / 8􀆰 75 Ricinus communis 331 7 TCA metabolic

Putative ferredoxin ̄
NADP(H) oxidoreductase
gi | 41052915 41094􀆰 6 / 7􀆰 98
Oryza sativa
Japonica group
321 11 Photosynthesis
7 Unnamed protein product gi | 297746499 24323􀆰 4 / 7􀆰 63 Vitis vinifera 97 2 Unknown protein
11 Mdfwg2100K20 gi | 226747930 26648 / 9􀆰 62 M􀆰 x domestica 389 6 Unknown protein
12
Ribosomal protein
30S subunit
gi | 170131 33972􀆰 5 / 6􀆰 69 Spinacia oleracea 114 6 Protein synthesis
13
Proteasome alpha
subunit ̄like protein
gi | 76160982 28275􀆰 2 / 5􀆰 4 Solanum tuberosum 155 4 Protein synthesis
14
Ascorbate
peroxidase(APX)
gi | 145581388 27711􀆰 8 / 5􀆰 53 M􀆰 x domestica 155 5 Defense response
15
Cytosolic triose
phosphate isomerase
gi | 414550 27366􀆰 1 / 5􀆰 24 A􀆰 thaliana 150 4 Glycolysis
16
Ribulose 1ꎬ5 ̄bisphosphate
carboxylase
gi | 9909636 26790􀆰 5 / 7􀆰 01 Elatine hydropiper 137 5 Photosynthesis
17
Putative beta4
proteasome subunit
gi | 14594929 14590􀆰 3 / 6􀆰 4 Nicotiana tabacum 182 4 Protein synthesis
18
Glutathione
peroxidase(GPX)
gi | 33308408 18690􀆰 5 / 6􀆰 14 M􀆰 x domestica 507 12 Defense response
20
Amino acid binding
proteinꎬ putative
gi | 255564051 30918􀆰 9 / 5􀆰 48 R􀆰 communis 180 3 Protein synthesis
21
Amino acid binding
proteinꎬ putative
gi | 255564051 30918􀆰 9 / 5􀆰 48 R􀆰 communis 162 1 Protein synthesis
22 AT2G37660 gi | 227204455 26336􀆰 8 / 5􀆰 29 A􀆰 thaliana 167 2 Unknown protein
24
Mal d1 / major
allergen Mal d 1
gi | 2443824 17513􀆰 9 / 5􀆰 62 M􀆰 x domestica 244 6 Defense response
25
Ribulose ̄1ꎬ5 ̄bisphosphate
carboxylase / oxygenase
large subunit
gi | 75758075 51998􀆰 1 / 5􀆰 91 Eryngium giganteum 406 20 Photosynthesis
044
 
  4期 张彩霞ꎬ等:苹果叶片应答斑点落叶病菌胁迫的蛋白质组学分析
2􀆰 2  蛋白功能鉴定及丰度变化分析
    经功能分析ꎬ4个蛋白质点鉴定为未知功能蛋
白ꎬ其余 16个蛋白质点依据其参与的相关功能分
为 5 类 (图 3 )ꎮ 防御反应相关蛋白中ꎬ APX
(Spot14)和 GPX(Spot 18)应答病原菌胁迫反应呈
明显上调表达ꎬ而过敏原蛋白 Mal d1(Spot 24)则
下调表达直至消失ꎮ 胁迫反应相关的 SAMS(Spot
2和 3)ꎬ均呈现下调表达趋势ꎮ 光合作用相关蛋
白(Spot 4ꎬ6ꎬ16 和 25)中ꎬ除了 Rubisco 大亚基
(Spot 25)外ꎬ其余均呈明显上调表达ꎮ 能量代谢相
关蛋白(Spot 5ꎬ15)分别参与植物体内三羧酸循环
代谢和糖酵解代谢ꎬ呈上调表达ꎮ 此外ꎬ5个参与蛋
白质合成相关的蛋白(Spot 12ꎬ13ꎬ17ꎬ20 和 21)ꎬ经
病原菌胁迫后ꎬ在苹果叶片中均呈上调表达ꎮ
Fig. 2  Variations in expression abundance of differentially expressed proteins
of apple leaf induced by Alternaria alternata apple pathotype
CK: Control leafꎻ 2 d: Inoculation for 48 h.
Fig. 3  Functional categorization of differentially expressed proteins
144
 
植物病理学报 44卷
3  结论与讨论
    SAMS是植物细胞应答逆境胁迫的关键蛋白ꎮ
本研究中 2 个蛋白点( Spot 2 和 3)分别鉴定为
SAMS 3和 SAMS 1ꎬ均明显下调表达ꎬ表明 SAMS
参与了苹果叶片细胞应答病原菌胁迫的反应ꎮ
    PR类蛋白是植物寄主在抗病反应过程中产生
的一类广谱抗性可溶性蛋白ꎮ APX ( Spot14)与
GPX(Spot18)均是植物清除 ROS 的关键酶ꎬ 与植
物抗逆性密切相关[ 3ꎬ 4 ]ꎬ苹果过敏原蛋白 (Mal
d1) ( Spot 24) 是苹果体内重要的抗性相关蛋
白[ 5 ]ꎬ3 个蛋白均属病程相关蛋白ꎮ 本研究中ꎬ
APX(Spot14)与 GPX(Spot18)均发生了明显的上
调表达ꎬ表明它们在苹果叶片受病原菌侵染后通过
不断上调表达参与防御反应ꎬ以降低叶片细胞因病
原菌侵染增加的 ROS浓度ꎬ减轻高浓度 ROS对寄
主的伤害ꎮ 而 Mal d1 蛋白(Spot 24)下调表达至
消失ꎬ表明该蛋白也参与苹果叶片应答病原菌侵染
的防御反应ꎬ通过下调表达ꎬ降低病原菌对寄主的
伤害程度ꎮ
    苹果叶片细胞应答斑点落叶病菌胁迫过程中ꎬ
可以通过启动多个途径来实现对病原菌胁迫的防
御ꎬ包括光合作用、能量代谢、胁迫反应及防御反应
等相关蛋白的差异表达ꎬ其中 APX、GPX及Mal d1
在苹果叶片应答病原菌胁迫过程中起到关键作用ꎬ
本研究从蛋白质水平上初步分析了苹果叶片应答
斑点落叶病菌胁迫所启动的抗性相关蛋白表达情
况ꎬ可为进一步开展苹果抗病分子机制研究提供参
考ꎮ
参考文献
[1]   Li Yꎬ Zhang L Yꎬ Zhang Zꎬ et al􀆰 A simple sequence
repeat marker linked to the susceptibility of apple to
Alternaria Blotch caused by Alternaria alternata apple
pathotype  [J] 􀆰 Journal of the American Society for
Horticultural Scienceꎬ 2011ꎬ 136 (2):109-115􀆰
[2]   Zhang C Xꎬ Chen Yꎬ Li Zꎬ et al􀆰 Extraction and
two ̄dimensional gel electrophoresis analysis of total
protein from apple leaves ( in Chinese) [ J] 􀆰 Journal
of Fruit Science (果树学报)ꎬ 2012ꎬ 488-492􀆰
[3]   Faizea Mꎬ Burgos Lꎬ Faizeb Lꎬ et al􀆰 Modulation of
tobacco bacterial disease resistance using cytosolic
ascorbate peroxidase and CuꎬZn ̄superoxide dismutase
[J] 􀆰 Plant Pathologyꎬ 2012ꎬ 61: 858-866􀆰
[4]   Verma O Pꎬ Ojha P Kꎬ Bailey S Bꎬ et al􀆰 Isolationꎬ
partial purification and characterization of phospholipid
hydroperoxide glutathione peroxidase ( phgpx enzyme
from Oryza sativa seedlings [ J] 􀆰 Journal of Chemical
Engineering and Process Technologyꎬ 2011ꎬ 2-5􀆰
[5]   Breiteneder Hꎬ Ebner C􀆰 Molecular and biochemical
classification of plant ̄derived food allergens [ J ] 􀆰
Journal of Allergy and Clinical Immunologyꎬ 2000ꎬ
106: 27-36􀆰
责任编辑:于金枝
244