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Identification and determination of biological functions of endophytic bacteria from Achnatherum inebrians in Alpine grassland of East Qilian Mountains

东祁连山高寒草地几株醉马草内生细菌的生物功能评价及鉴定



全 文 :东祁连山高寒草地几株醉马草内生细菌的
生物功能评价及鉴定
杨成德,王颖,王玉琴,姚玉玲,薛莉,徐长林,陈秀蓉
(草业生态系统教育部重点实验室 甘肃农业大学草业学院 甘肃省草业工程实验室 中-美草地畜牧业可持续发展研究中心,甘肃 兰州730070)
摘要:采用表面消毒划线法从醉马草分离获得6株内生细菌,分别命名为261MG1、261MG2、261MG3、261MG4、
261MY5和261MY6,并对其进行了生物功能测定和鉴定。结果表明,有5株内生细菌对马铃薯炭疽病菌和马铃薯
坏疽病菌有较好拮抗作用,有4株对马铃薯枯萎病菌有较好拮抗作用,且261MG2、261MG3、261MG4和261MY6
对3种病原菌均有较好拮抗作用;除261MG4外均有固氮和产吲哚乙酸能力;通过培养性状和形态特征,结合16S
rDNA序列相似性分析,将261MG1、261MG2、261MG3、261MY6、261MG4和261MY5分别鉴定为枯草芽孢杆菌
犅犪犮犻犾犾狌狊狊狌犫狋犻犾犻狊、犅犪犮犻犾犾狌狊犪狓犪狉狇狌犻犲狀狊犻狊、莫海威芽孢杆菌犅犪犮犻犾犾狌狊犿狅犼犪狏犲狀狊犻狊、解淀粉芽孢杆菌犅犪犮犻犾犾狌狊犪犿狔犾狅犾犻狇
狌犲犳犪犮犻犲狀狊、耐盐短杆菌犅狉犲狏犻犫犪犮狋犲狉犻狌犿犺犪犾狅狋狅犾犲狉犪狀狊和棒形杆菌犆犾犪狏犻犫犪犮狋犲狉sp.。该研究结果为醉马草内生细菌进
一步开发利用提供了依据。
关键词:醉马草;内生细菌;生物功能;鉴定
中图分类号:S543+.901;S432.4+2  文献标识码:A  文章编号:10045759(2014)05024907
犇犗犐:10.11686/cyxb20140529  
  植物内生细菌是指整个生活周期或部分阶段在健康植物组织内栖居而对植物不造成实质性危害的细菌,即
与植物建立了和谐联合关系并与宿主协同进化的微生物[1];一方面,植物体为其提供生长必需的场所和营养等;
另一方面,部分内生细菌具有抑菌、固氮、产生吲哚乙酸(IAA)及溶磷等生物功能,可以增强宿主植物的抗虫性、
抗病性、抗旱性及生长竞争能力等[23],其产生的生物活性物质、抗逆境相关酶的(超)表达及诱导抗性也能直接或
间接有利于宿主植物,加强或调节了植物营养的获得、新陈代谢和对逆境的忍耐能力等。因此,植物内生细菌是
一个潜在的巨大的微生物资源库,其生物防治功能已成为内生细菌研究的热点之一。Liu等[4]报道了内生沙雷
氏细菌G3潜在的生防应用价值;Vetrivelkalai等[5]报道了内生菌对根结线虫的防病潜力及对植物的促生潜力;
高晓星等[6]和李振东等[7]报道了高寒草地珠芽蓼(犘狅犾狔犵狅狀狌犿狏犻狏犻狆犪狉狌犿)等植物内生细菌对多种植物病原真菌
的抑制作用;也有学者[810]报道了植物内生细菌的促生及对宿主真菌性病害的防御作用。醉马草(犃犮犺狀犪狋犺犲狉狌犿
犻狀犲犫狉犻犪狀狊)为禾本科(Gramineae)芨芨草属(犃犮犺狀犪狋犺犲狉狌犿)的多年生草本植物,生命力和繁殖力极强,有超强的耐
旱力,是我国北方天然草原主要的烈性毒草之一,有关其内生真菌的相关报道较多[1112],内生细菌方面张雪兵
等[1314]报道了在新疆的相关研究,高寒草地醉马草内生细菌的相关研究未见报道。高寒草地醉马草内生细菌生
物功能如何?有没有开发为生物农药的潜力?基于此,本试验对从东祁连山高寒草地醉马草中分离获得的6株
内生细菌的生物功能进行了评价,并利用16SrDNA序列分析,结合形态特征对其进行了鉴定,以期为植物病害
生物防治提供菌种资源,也为高寒草地醉马草内生细菌的开发利用提供依据。
1 材料与方法
1.1 材料
1.1.1 培养基 马铃薯葡萄糖琼脂培养基(PDA)用于植物病原真菌的培养和对峙试验、肉汁胨培养基(NA)用
第23卷 第5期
Vol.23,No.5
草 业 学 报
ACTAPRATACULTURAESINICA   
249-255
2014年10月
收稿日期:20131011;改回日期:20131107
基金项目:草业生态系统教育部重点实验室(甘肃农业大学)开放课题项目(No.CYzs2011011)资助。
作者简介:杨成德(1975),男,甘肃武都人,副教授,博士。Email:yangcd@gsau.edu.cn
通讯作者。Email:chenxiurong@gsau.edu.cn
于内生细菌的分离、纯化和保存等[15],金氏(King)培养基用于产IAA试验,Pikovaskaia培养基(PKO)和蒙金娜
培养基分别用于溶解无机磷和有机磷试验。
1.1.2 供试菌 供试内生细菌:2012年7月分离自东祁连山高寒草地醉马草根和叶的内生细菌。
供试病原菌:马铃薯炭疽病菌(犆狅犾犾犲狋狅狋狉犻犮犺狌犿犮狅犮犮狅犱犲狊),马铃薯枯萎病菌(犉狌狊犪狉犻狌犿犪狏犲狀犪犮犲狌犿)和马铃薯
坏疽病菌(犘犺狅犿犪犳狅狏犲犪狋犪),由甘肃农业大学草业学院植物病理实验室提供。
1.2 内生细菌的分离纯化
将醉马草组织用自来水清洗表面,晾干后称取2g,表面消毒后置于无菌研钵中研碎,吸取植物组织研磨浸出
液按10倍浓度梯度稀释后,取0.2mL涂布于NA培养基,以最后一次洗涤水为对照,28℃培养3~7d,根据菌
落形态、颜色、大小、边缘整齐度及表面形态等分类,并纯化后4℃保存备用[16]。
1.3 生物功能测定
1.3.1 拮抗能力测定 采用平板对峙法[5,15,17]测定抑菌效果。用直径5mm打孔器取指示菌菌块置于PDA 平
板中央,在其四周等距离接种活化后的内生细菌,4次重复,马铃薯坏疽病菌置于20℃培养,其他指示菌置于
28℃培养,至对照满皿后测量菌落直径,计算抑菌率。
1.3.2 固氮能力测定 供试内生细菌菌悬液0.2mL接种于阿须贝无氮平板和液体培养基内,以无菌水为对
照,3次重复,平板置于28°C培养箱培养,液体培养基置于120r/min振荡培养,第7天平板上有菌落和液体培
养基变浑浊者为阳性,记为“+”,否则记为“-”。
1.3.3 溶磷能力测定 将0.2mL菌悬液涂布于Pikovaskaia’s培养基(PKO)[18]上,28℃培养14d后观察解磷
圈,3次重复;根据解磷圈与菌落直径比值大小确定其溶磷能力。
1.3.4 产IAA能力测定 采用Salkowski比色法[19]。将0.1mL菌悬液分别接种于含100mg/L色氨酸和不
含色氨酸的金氏培养液中,以加等量无菌水为对照,于28℃、120r/min恒温振荡培养12d,取50μL加入等量比
色液(PC比色液或S2比色液),室温静置15min后,观察显色反应,3次重复均变红色表示能分泌IAA,记“+”,
否则记“-”。
1.4 内生细菌的鉴定
1.4.1 培养形状观察[20] 在NA固体培养基上观察内生细菌菌落形态特征并描述和照相。
1.4.2 形态观察 内生细菌在NA平板上经18~24h活化培养后革兰氏染色和镜检,观察菌体颜色和形态,随
机测量30个菌体的长和宽,并显微拍照。
1.4.3 16SrDNA鉴定[5] 利用16SrDNA通用引物,其序列为:引物1为5′CCGGATCCAGAGTTTGAT
CATGGCTCAGCA3′,引物2为5′CGGGATCCTACGGCTACCTTGTTACGACTT3′。内生细菌活
化后在LB培养液28℃振荡过夜培养,后按上海生工试剂盒说明书提取DNA,经电泳检测具特异性DNA条带
的样品进行PCR扩增。扩增体系为:10×buffer2.5μL,dNTP(5mmol/L)0.5μL,MgCl2(25mmol/L)2.5μL,
TaqDNA聚合酶(5U/μL)0.3μL,引物(10μmol/L)1和2各0.5μL,模板DNA0.5μL(以加0.5μLddH2O为
对照),补ddH2O至25μL;扩增程序为:95℃预变性5min;94℃变性30s;65℃退火40s;72℃延伸90s;30个循
环;72℃延伸8min。经电泳检测在1500bp处具特异性条带的扩增产物测序,与GenBank数据库中序列相似性
比较(http:∥www.ncbi.nlm.nihgov/blast.cgi),并用Clustal(1.8)软件进行多重序列比较和用 Mega(4.0)软件
构建系统发育树,确定其系统发育学地位。
2 结果与分析
2.1 内生细菌的分离纯化
从接种醉马草组织浸提液的平板上依据菌落形态、颜色和大小等挑取不同单菌落,反复划线纯化后从醉马
草中分离出6株内生细菌,其中根部4株,叶部2株,分别编号为261MG1、261MG2、261MG3、261MG4、261MY5
和261MY6,保存备用;对照没有细菌菌落长出,说明表面消毒彻底,所得细菌均为内生细菌。
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2.2 生物功能测定
经对峙培养,261MY5对3种指示菌的拮抗作用均较差,其他5株内生菌株对3种指示菌均有较强的抑菌
作用,其中对马铃薯坏疽病菌最强为261MY6,其抑菌率为69.62%,最弱为261MG3,其抑菌率为55.69%;对马
铃薯枯萎病菌最强为261MY6,其抑菌率为64.51%,最弱为261MG1,其抑菌率仅为27.68%;对马铃薯炭疽病
菌最强为261MY6,其抑菌率为83.65%,最弱为261MG2,其抑菌率也达73.39%。综合来看,对马铃薯炭疽病
的拮抗作用最明显,其中261MY6对3种指示菌的拮抗作用最强,其抑菌率最低也达69.62%,最高达83.65%
(图1,表1)。该结果说明6株醉马草内生细菌均具有抑菌能力,且多个菌株均具有一菌多防功能,在微生物农药
开发中潜力巨大。
图1 261犕犢6的抑菌作用
犉犻犵.1 犜犺犲犪狀狋犪犵狅狀犻狊犿犲犳犳犲犮狋狅犳261犕犢6
 
表1 醉马草内生细菌的生物功能测定
犜犪犫犾犲1 犇犲狋犲狉犿犻狀犪狋犻狅狀狅犳犫犻狅犾狅犵犻犮犪犾犳狌狀犮狋犻狅狀狊狅狀犲狀犱狅狆犺狔狋犲犫犪犮狋犲狉犻狌犿犳狉狅犿犃.犻狀犲犫狉犻犪狀狊
菌株
Strain
抑菌作用
Antagonismeffect(%)
马铃薯坏疽病
犘.犳狅狏犲犪狋犪
马铃薯枯萎病
犉.犪狏犲狀犪犮犲狌犿
马铃薯炭疽病
犆.犮狅犮犮狅犱犲狊
固氮能力
Nitrogen
fixation
溶磷能力
Phosphorussolubilizing(d/D)
无机磷Inorganic
phosphorus
有机磷
Organophosphate
产IAA能力
SecretingIAA
含色氨酸 With
tryptophan
不含色氨酸
Withouttryptophan 
261MG1 66.77 27.68 77.88 + - - + +
261MG2 63.61 52.21 73.39 + - - + +
261MG3 55.69 49.82 78.21 + 1.12 - + +
261MG4 66.13 50.17 78.52 - 1.21 - + +
261MY5 31.25 23.65 34.25 + - - + +
261MY6 69.62 64.51 83.65 + 1.07 - + +
 “-”:无功能;“+”:有功能。
 “-”:Withoutbiologicalfunction;“+”:Withbiologicalfunction.
6株醉马草内生细菌中除261MG4外均能固氮,但均不能溶解有机磷,261MG4,261MG3和261MG6对无机
磷有较弱的溶解能力,6株内生细菌均能产IAA(表1)。该结果说明醉马草内生细菌具有功能多样性。
152第23卷第5期 草业学报2014年
2.3 内生细菌的鉴定
2.3.1 培养形状观察 261MG1:菌落直径3mm,圆形,边缘整齐,表面褶皱,中心凹陷,呈草帽状,较干燥,整体
呈淡红色,可产生红色色素致培养基变红(图2)。
261MG2:菌落直径13mm,不规则形,边缘不整齐,表面褶皱,中心凹陷,较湿润,产生红色色素致培养基变
红(图2)。
261MG3:菌落直径5mm,椭圆或圆形,边缘整齐,表面褶皱,菌落中央低陷,呈草帽状,菌落呈淡红色(图2)。
261MG4:菌落直径2mm,圆形,边缘整齐,中心凹陷,呈草帽状,菌落为淡红色(图2)。
261MY5:菌落直径4mm,圆形,边缘整齐,菌落隆起呈台状,半透明,米白色(图2)。
261MY6:菌落直径3mm,圆形,边缘整齐,表面褶皱,中央稍低陷,奶白色(图2)。
从6株内生细菌培养性状看醉马草内生细菌在形态上存在多样性。
图2 内生细菌的培养性状
犉犻犵.2 犆狌犾狋狌狉犲犮犺犪狉犪犮狋犲狉狅犳犲狀犱狅狆犺狔狋犲犫犪犮狋犲狉犻狌犿犳狉狅犿犃.犻狀犲犫狉犻犪狀狊
 
图3 内生细菌的革兰氏染色
犉犻犵.3 犌狉犪犿狊狋犪犻狀狅犳犲狀犱狅狆犺狔狋犲犫犪犮狋犲狉犻狌犿犳狉狅犿犃.犻狀犲犫狉犻犪狀狊
252 ACTAPRATACULTURAESINICA(2014) Vol.23,No.5
2.3.2 形态观察 6株醉马草内生细菌均为革兰氏
阳性和杆状(图3),但菌体大小差别较大,菌体最长的
为261MG3,其长度达 2.09μm,菌体最宽的 为
261MG2,其宽度为0.77μm,其他菌株长和宽介于这
两数值间(表2)。
2.3.3 16SrDNA鉴定 获得的序列与GenBank数
据库中序列比对和构建系统发育树表明,261MG1、
261MG2、261MG3和261MY6分别与芽孢杆菌属的
犅犪犮犻犾犾狌狊狊狌犫狋犻犾犻狊(JX848636)、犅犪犮犻犾犾狌狊犪狓犪狉狇狌犻犲狀狊犻狊
(GU568194)、犅犪犮犻犾犾狌狊犿狅犼犪狏犲狀狊犻狊(JF496257)和犅犪
犮犻犾犾狌狊犪犿狔犾狅犾犻狇狌犲犳犪犮犻犲狀狊(KC752450)的一致性在
99%以上,且在系统发育树上聚在一起(图4),初步将
表2 内生细菌的形态特征
犜犪犫犾犲2 犕狅狉狆犺狅犾狅犵犻犮犪犾犮犺犪狉犪犮狋犲狉狅犳犲狀犱狅狆犺狔狋犲
犫犪犮狋犲狉犻狌犿犳狉狅犿犃.犻狀犲犫狉犻犪狀狊
菌株
Strain
大小
Size(μm)
革兰氏染色
Gramstain
形状
Morphology
261MG1 1.74×0.46 G+ 杆状Rod
261MG2 1.59×0.77 G+ 杆状Rod
261MG3 2.09×0.56 G+ 杆状Rod
261MG4 1.56×0.62 G+ 杆状Rod
261MY5 1.77×0.51 G+ 杆状Rod
261MY6 2.04×0.71 G+ 杆状Rod
 G+:革兰氏阳性菌。
 G+:Grampositivebacteria.
图4 醉马草内生细菌的系统发育树
犉犻犵.4 犘犺狔犾狅犵犲狀犲狋犻犮狋狉犲犲狅犳犲狀犱狅狆犺狔狋犲犫犪犮狋犲狉犻狌犿犳狉狅犿犃.犻狀犲犫狉犻犪狀狊
352第23卷第5期 草业学报2014年
其分别鉴定为芽孢杆菌属的犅犪犮犻犾犾狌狊狊狌犫狋犻犾犻狊、犅犪犮犻犾犾狌狊犪狓犪狉狇狌犻犲狀狊犻狊、犅犪犮犻犾犾狌狊犿狅犼犪狏犲狀狊犻狊和犅犪犮犻犾犾狌狊犪犿狔犾狅犾犻狇
狌犲犳犪犮犻犲狀狊,261MG4与犅狉犲狏犻犫犪犮狋犲狉犻狌犿犺犪犾狅狋狅犾犲狉犪狀狊(HE970648)的一致性在99%以上,且在系统发育树上聚在
一起(图4),初步鉴定其为短杆菌属的犅狉犲狏犻犫犪犮狋犲狉犻狌犿犺犪犾狅狋狅犾犲狉犪狀狊,261MY5与犆犾犪狏犻犫犪犮狋犲狉sp.(JX164054)的一
致性在99%以上(图4),且在系统发育树上聚在一起,初步鉴定其为棒形杆菌属细菌。该结果表明,6株内生细
菌分属于3个属6个种,说明醉马草内生细菌也具有种类多样性,但芽孢杆菌属细菌4株,占66.7%,为优势类
群。
3 讨论
植物内生细菌分布广、种类多,几乎存在于所有已研究过的陆生及水生植物中,在各种农作物及经济作物中
发现的内生细菌已超过120种[21];由于内生菌生境的特殊性,其产生的生物活性物质、抗逆境相关酶的(超)表达
及诱导抗性均直接或间接有利于宿主植物,即存在内生细菌的宿主植物往往具有生长快速、抗逆境和抗病害等特
点,比未感染内生菌的植物更具生存竞争力。内生细菌在植物体内具有独立繁殖和传导特性,且很多内生细菌具
有拮抗和促生作用,具有开发为微生物农药和肥料的潜力。所以,拮抗内生细菌的筛选和应用在提倡绿色农药的
今天也逐渐成为植物病害防治研究中的热点[2122]。本试验从醉马草体内分离出6株内生细菌,其中有5株对马
铃薯坏疽病菌有较好的抑制效果,最高抑菌率达69.62%,4株对马铃薯枯萎病菌有较好的抑制效果,最高抑菌率
达64.51%,对马铃薯炭疽病的拮抗作用最明显,最低抑菌率达73.39%。6株醉马草内生菌中261MY6具有一
菌多防的效果,且具有固氮、溶磷和产生IAA能力,是开发植物病害生物菌剂的良好菌种资源;其他菌株单用功
能略低于261MY6,可以通过筛选协同作用的菌株复配以提高其生物功能,如张英等[23]报道菌株复配后产IAA
量显著高于单菌株。6株内生细菌在形态、大小及培养性状上均有差异,根据培养性状及16SrDNA序列分析鉴
定6株内生细菌分属于3个属6个种,其中芽孢杆菌属细菌占4株,占66.7%。该结果说明醉马草内生细菌具有
功能、种类及形态多样性,且芽孢杆菌为主要类群[24]。本试验从醉马草根部获得4株,叶片获得2株,总体数量
较少,此可能与东祁连山高寒草地醉马草本身有关系,同样的分离方法从线叶嵩草(犓狅犫狉犲狊犻犪犮犪狆犻犾犾犻犳狅犾犻犪)及针
茅(犛狋犻狆犪犮犪狆犻犾犾犪狋犪)等植物中均可分离获得较多的菌株;也可能与所使用培养基有关系,醉马草内生细菌需要的
营养组成与其他牧草内生细菌有差异,致分离数量偏少;或可能与消毒使用的消毒剂有关系,化学方法可能杀死
部分内生细菌,导致内生细菌的数量或种类减少[3],但此有待进一步研究。本试验关于醉马草内生细菌的防病
促生研究主要集中在室内,丰富了东祁连山高寒草地内生细菌的研究,但这些内生细菌能否开发为微生物农药或
肥料应用于生产有待于进一步研究。
参考文献:
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犐犱犲狀狋犻犳犻犮犪狋犻狅狀犪狀犱犱犲狋犲狉犿犻狀犪狋犻狅狀狅犳犫犻狅犾狅犵犻犮犪犾犳狌狀犮狋犻狅狀狊狅犳犲狀犱狅狆犺狔狋犻犮犫犪犮狋犲狉犻犪
犳狉狅犿犃犮犺狀犪狋犺犲狉狌犿犻狀犲犫狉犻犪狀狊犻狀犃犾狆犻狀犲犵狉犪狊狊犾犪狀犱狅犳犈犪狊狋犙犻犾犻犪狀犕狅狌狀狋犪犻狀狊
YANGChengde,WANGYing,WANGYuqin,YAOYuling,XUELi,XUChanglin,CHENXiurong
(KeyLaboratoryofGrasslandEcosystem,MinistryofEducation,ColegeofPrataculturalScience,
GansuAgriculturalUniversity,PrataculturalEngineeringLaboratoryofGansuProvince,
SinoU.S.CenterforGrazinglandEcosystemSustainability,Lanzhou730070,China)
犃犫狊狋狉犪犮狋:6endophyticbacteriaof犃犮犺狀犪狋犺犲狉狌犿犻狀犲犫狉犻犪狀狊colectedfrom AlpinegrasslandonEastQilian
Mountainswereisolatedusingasurfacedisinfection method,andnamed261MG1,261MG2,261MG3,
261MG4,261MY5and261MY6,respectively.Ofthese,5strainshadstrongantifungalactivityagainst犆狅犾犾犲
狋狅狋狉犻犮犺狌犿犮狅犮犮狅犱犲狊and犘犺狅犿犪犳狅狏犲犪狋犪,and4strainswereactiveagainst犉狌狊犪狉犻狌犿犪狏犲狀犪犮犲狌犿.Inaddition,
261MG2,261MG3,261MG4and261MY6hadinhibitoryactivityagainst3otherpathogens.Exceptfor
261MG4,theendophyticbacteriahadthenitrogenfixingabilityandIAA(indoleaceticacid)secreting.Based
ontheculturecharacteristics,morphologicalcharacteristicsand16SrDNAgenesequenceanalysis,261MG1,
261MG2,261MG3,261MY6,261MG4and261MY5wereidentifiedas犅犪犮犻犾犾狌狊狊狌犫狋犻犾犻狊,犅犪犮犻犾犾狌狊犪狓犪狉狇狌犻犲狀
狊犻狊,犅犪犮犻犾犾狌狊犿狅犼犪狏犲狀狊犻狊,犅犪犮犻犾犾狌狊犪犿狔犾狅犾犻狇狌犲犳犪犮犻犲狀狊,犅狉犲狏犻犫犪犮狋犲狉犻狌犿犿犻犮犺犻犵犪狀犲狀狊犻狊,and犆犾犪狏犻犫犪犮狋犲狉sp.,re
spectively.Thestudyprovidestheevidencefortheexistenceofendophyticbacteriaof犃.犻狀犲犫狉犻犪狀狊inEastQil
ianMountainsAlpinegrassland,andtheinitialexplorationoftheiridentityandproperties.
犓犲狔狑狅狉犱狊:犃犮犺狀犪狋犺犲狉狌犿犻狀犲犫狉犻犪狀狊;endophyticbacterium;biologicalfunctions;identification
552第23卷第5期 草业学报2014年