全 文 :园 艺 学 报 2011,38(2):343–352 http: // www. ahs. ac. cn
Acta Horticulturae Sinica E-mail: yuanyixuebao@126.com
收稿日期:2010–08–06;修回日期:2011–01–11
基金项目:国家‘863’计划项目(2006AA10Z170);教育部博士点基金项目(20092103110001);国家博士后科学基金项目(200902551,
20080441101)
* 通信作者 Author for correspondence(E-mail:fenghuiaaa@263.net)
大白菜核雄性不育相关基因 BrLTP1 的克隆及
特征分析
刘志勇,叶雪凌,李承彧,冯 辉*
(沈阳农业大学园艺学院,沈阳 110866)
摘 要:利用 cDNA-AFLP 技术分析大白菜核雄性不育两用系‘AB02’可育株(msms)和不育株(Msms)
花蕾的基因表达谱,在可育株混合花蕾 cDNA 中扩增出 1 条特异条带 TDF-25,通过 RACE 和 RT-PCR 技
术克隆了该基因的全长 cDNA 序列。序列分析表明,该基因编码脂质转移蛋白,命名为 BrLTP1。BrLTP1
全长 cDNA 序列为 750 bp,推测编码 1 个包含 183 个氨基酸残基的前体蛋白。BrLTP1 蛋白含有典型的脂
质转移蛋白 N 端信号肽,保守的 AAI 结构域和半胱氨酸位点。预测 BrLTP1 蛋白含有多种修饰性位点,
包括 1个PKC磷酸化位点,2个N–糖基化位点和 10个N–端豆蔻酰基化位点。基因表达模式表明,BrLTP1
在两用系不育株花蕾中受到强烈抑制,在可育株的大花蕾、成熟花药以及花瓣中高水平表达。
关键词:大白菜;核基因雄性不育;脂质转移蛋白
中图分类号:S 634.1 文献标识码:A 文章编号:0513-353X(2011)02-0343-10
Cloning and Characterization of a Genic Male Sterility-related Gene
BrLTP1 in Chinese Cabbage
LIU Zhi-yong,YE Xue-ling,LI Cheng-yu,and FENG Hui*
(Department of Horticulture,Shenyang Agricultural University,Shenyang 110866,China)
Abstract:The gene differential expression analysis was performed by cDNA-AFLP in the genic male
sterile line‘AB02’of Chinese cabbage,and a differentially expressed cDNA fragment,TDF-25,was
only found in fertile plants. The full-length cDNA of BrLTP1,coding lipid transfer protein in Chinese
cabbage,was amplified by RACE and RT-PCR. The BrLTP1 gene was 750 bp long in cDNA and
hypothetical protein BrLTP1 included 183 amino acids with a signal peptide of 22 amino acids. Sequence
analysis revealed that the BrLTP1 protein has ten N-myristoylation sites,two N-myristoylation sites,and
one PKC phosphorylation site. Gene expression characteristics indicated that BrLTP1 was highly
expressed in big flower buds and mature anthers of fertile plants,with a extremely low expression level in
sterile buds.
Key words:Brassica campestris L. ssp. pekinensis(Lour.)Olsson;genetic male sterility;lipid transfer
protein
344 园 艺 学 报 38 卷
雄性不育是农作物杂种优势利用的重要途径,也是研究植物雄性器官发育分子机制的理想系
统。在前期研究中,本课题组发现了大白菜复等位核雄性不育现象,其育性由一个位点的 3 个复等
位基因控制:“Ms”为显性不育基因;“ms”为“Ms”的等位隐性可育基因;“Msf”为“Ms”的
等位显性恢复基因,三者之间的显隐关系为 Msf > Ms > ms(Feng et al.,1998)。目前已成功实现了
核不育复等位基因在不同生态型大白菜品种间及亚种间的转育交流,创制出多个不育株率和不育度
均为 100%的芸薹属 A 基因组蔬菜作物雄性不育系(冯辉 等,2007;Li et al.,2009;辛彬 等,2009)。
由于该不育源败育彻底,无不良性状伴生,且能够配制出 100%雄性不育系,其育性控制分子机制
研究更显重要(Feng et al.,2009,王丽丽 等,2010)。
植物雄性器官发育受复杂基因网络的精细调控,其中一些关键基因的突变可能引起下游众多育
性相关基因的表达发生改变,干扰花粉或花药的发育进程,从而导致雄性不育。通过比较突变株和
野生型花蕾的基因表达谱,克隆雄性不育相关基因并研究其特征特性,对于深入了解植物雄性器官
发育的分子机制具有重要意义(Kang et al.,2008;Huang et al.,2009)。
本研究中分析了不育株和可育株的基因表达差异,进而分离、克隆了1个在可育株特异性表达
而在不育株上不表达的大白菜脂质转移蛋白(Lipid-transfer protein,LTP)基因,为进一步研究脂质
代谢在大白菜花粉或花药发育过程中的作用提供素材。
1 材料与方法
1.1 试材
大白菜雄性不育两用系‘AB02’由沈阳农业大学蔬菜遗传育种课题组提供,其育性控制符合复
等位遗传模式,群体不育株基因型为 Msms,可育株基因型为 msms,不育株雄蕊深度退化,花丝短
缩,花药瘦小,可育株和不育株的其它性状高度一致。
2008 年 9 月,经春化后播种于沈阳农业大学蔬菜育种基地日光温室。当第 1 朵花开放时,鉴定
出不育株和可育株,采用混合花蕾取样策略,收集一级分枝的所有花蕾,分别构建不育花蕾池和可
育花蕾池,用于 cDNA-AFLP 分析;分别取可育株的根、花茎、花茎叶、角果、小蕾(< 1 mm)、
中蕾(1.5 ~ 2.5 mm)和大蕾(> 3.0 mm),以及可育花的花丝、花药、雌蕊、花瓣、萼片,经液氮
速冻后保存于–80 ℃,用于基因表达模式分析。
1.2 试剂
引物由北京奥科生物技术有限责任公司合成;5′ RACE和3′ RACE均为Invitrogen公司产品;
dNTP、Taq酶、DNA分子量标准、凝胶回收试剂盒均购自天根公司;第1链cDNA合成采用Invitrogen
公司SuperScript Ⅲ反转录系统;T4 DNA Ligase、RNaseH、T4 DNA Polymerase、E.coli DNA
PolymeraseⅠ、限制性内切酶EcoRⅠ和MseⅠ均购自NEB公司;T载体、RQ1 RNase-Free DNase为
Promega公司产品;大肠杆菌TOP10为辽宁省十字花科蔬菜遗传育种重点实验室保存。
1.3 cDNA-AFLP 分析与差异条带的回收
按照产品说明书,提取总 RNA 并去除所含的痕量 DNA,继而合成单链 cDNA。采用刘志勇等
(2008)所述方法合成双链 cDNA。cDNA-AFLP 体系及程序参照 Bachem 等(1996)所述方法,酶
切组合为 EcoRⅠ和 MseⅠ。选择性扩增产物经 5%聚丙烯酰胺凝胶电泳分离,银染法显示条带
(Sanguinetti et al.,1994)。从总 RNA 提取到银染同时设置两次重复。
2 期 刘志勇等:大白菜核雄性不育相关基因 BrLTP1 的克隆及特征分析 345
1.4 差异条带的回收与表达模式验证
回收测序差异表达基因片段,利用 NCBI 在线 Blast 程序预测差异表达基因的功能(刘志勇 等,
2008)。
设计 6 个差异表达基因的特异性引物,以 Elongation Factor-1α 作为内标基因(表 1),利用
QRT-PCR 技术分析其在可育池和不育池上的表达模式(刘志勇 等,2008)。反应在 iQ5 荧光定量
PCR 仪上进行,方法参照天根公司荧光定量试剂盒 Real Master Mix(SYBR GreenⅠ)说明书。PCR
反应条件:95 ℃预变性 3 min;95 ℃变性 15 s,60 ℃退火 20 s,68 ℃延伸 20 s,共 40 个循环,每
个样本重复 3 次。采用校正表达模式分析目的基因在不同样品中的相对表达量。
表 1 用于 QRT-PCR 分析的基因特异性引物
Table 1 Gene spesific primer for QRT-PCR analysis
转录驱使片段
TDF
引物名称和引物序列(5′–3′)
Primer number and Primer sequences
TDF-3 TDF3-L:ACTCCTACCTGGGGTTTCTTTT; TDF3-R:GATTGACTTCTTGCTTCGTGC
TDF-6 TDF6-L:CCTGAAGATACAGAAGGAAAGC; TDF6-R:TGACAATACTCCATCAAAAGCC
TDF-8 TDF8-L:CTTTTGTGGGTTTAGCATTAC; TDF8-R:TCACGCTCGTATTTATAGTCA
TDF-9 TDF9-L:TGTTATTGGCTCTTGCAGCAA; TDF9-R:TCGCATCCTCTTTGGTAACG
TDF-17 TDF17-L:GCTGCGTATTCCGATGCTA; TDF17-R:GTGTTAACGAACCCGATGTT
TDF-21 TDF21-L:GATAGCATTCACACCGCTTCAC TDF21-R:ACCATTCTCCACAGCCCTCT
1.5 大白菜脂质转移蛋白基因 BrLTP1 全长 cDNA 序列的克隆
根据 TDF-25 序列,设计用于 5′ RACE 的基因特异性嵌套引物(5RLTP-1:5′-TGAGATGTCAG
GGTTGGCG;5RLTP-2:5′-AGGGAGATCAAGAGCGTTGTC-3′)和 3′RACE 嵌套引物(3RLTP-1:
5′-GACAACGCTCTTGATCTCCCT-3′;3RLTP-2:5′-CGCCAACCCTGACATCTCA-3′)。以可育株花
蕾的混合 cDNA 为扩增模板,按照试剂盒说明书分别进行 5′RACE 和 3′RACE。
将经测序验证后的 5′RACE 和 3′RACE 片段以及 TDF-25 片段进行拼接,得到全长 cDNA 序列,
命名为 BrLTP1。根据拼接序列,设计全长扩增引物(Q-L:5′-ACAAAACATTCAAACACAAGA-3′
和 Q-R:5′-GTTGAAAATTAGAAATATTATTAGA-3′),验证拼接结果。PCR 反应条件:95 ℃预变性
3 min;95 ℃变性 30 s,58 ℃退火 30 s,72 ℃延伸 1 min,共 30 个循环;72 ℃终反应 5 min。
1.6 BrLTP1 基因特征分析
利用 DNAStar 软件分析 BrLTP1 基因最大开放阅读框,推导氨基酸序列;利用 NCBI 的在线
BLAST 程序进行同源搜索和预测保守结构域;利用 ClustalX 2.0 软件进行多序列对齐和排序,使用
GenDOC 和 MEGA4 软件输出同源比对和进化树构建结果(Tamura et al.,2007);使用 SignalP(http://
www. cbs. dtu. dk /services/SignalP/)预测可能存在的信号肽;利用 SOSUI(http: // bp. nuap. nagoya-u.
ac. jp/sosui/)预测蛋白质的疏水性和跨膜结构域;使用 Prosite 程序推测可能存在的修饰性位点(http://
www. expasy. ch/prosite/);蛋白质二级结构分析在 http: // www. predictprotein. org/网站上进行。
1.7 BrLTP1 基因表达模式分析
设计基因特异引物(TDF25-L:5′-TATCATCATCTAACGCCGCAAT-3′ 和 TDF25-R:5′-GAATC
ACCGAGTGGAGAAACG-3′),利用 QRT-PCR 分析 BrLTP1 在可育池、不育池,以及在可育株根、
花茎、花茎叶、小蕾、中蕾、大蕾、花丝、花药、雌蕊、花瓣和萼片上的表达模式,反应体系同
1.4 节。
346 园 艺 学 报 38 卷
2 结果与分析
2.1 ‘AB02’可育株和不育株花蕾基因表达具有明显差异
利用cDNA-AFLP技术对雄性不育两用系‘AB02’可育株和不育株花蕾的基因差异表达进行了
分析。结果显示,cDNA-AFLP 所产生的条带表达模式重复性好,128对引物组合共产生了约6 000
条长度在50 ~ 600 bp之间的TDF,可育株和不育株花蕾转录组具有明显差异,共检测到了25条差异
TDF,均表现为在可育株上特异性或优势表达,而在不育株上不表达或表达量相对较低(图1)。
序列分析表明,25个TDF为非冗余序列。除TDF-7外,其余24个TDF序列在NCBI的公共数据库
中存在同源序列(表2)。其中,TDF-25与甘蓝型油菜的1个EST(GR451396)同源性为100%,后者
来自编码LTP的Unigene(Bna.1030),说明TDF-25所在基因很可能编码LTP。
值得注意的是,TDF-5也编码LTP,暗示可能有多个LTP家族成员参与了大白菜雄配子发育过程。
利用QRT-PCR对其中6个基因的表达模式进行了验证。结果显示,6个基因在可育池和不育池之间表
达均存在显著性差异,与cDNA-AFLP结果高度一致(图1,图2)。
图 1 利用 cDNA-AFLP 获得的部分差异表达基因
F. 可育株混合花蕾;S. 不育株混合花蕾。
Fig. 1 Differentially expressed genes abtained by cDNA-AFLP
F. Fetile bud pool;S. Sterile bud pool.
图 2 差异表达基因的 QRT-PCR 验证
F. 可育株混合花蕾;S. 不育株混合花蕾。
Fig. 2 Expression validation of differentially expressed genes by real-time RT-PCR
F. Fetile bud pool;S. Sterile bud pool.
2 期 刘志勇等:大白菜核雄性不育相关基因 BrLTP1 的克隆及特征分析 347
表 2 TDF序列同源性比较结果
Table 2 Analyses of TDF sequences similarity using Blast
转录驱使片段
TDF
长度/bp
Length
功能预测
Function characterization
E-值
E-value
一致性/%
Identity
TDF-1 244 拟南芥未知功能蛋白
Unknown protein[Arabidopsis thaliana]X
1.00e-22 86
TDF-2 102 拟南芥液泡膜内在蛋白
Delta tonoplast integral protein[A. thaliana]U
98.8
TDF-3 84 大白菜花粉 cDNA 文库 EST
EST from pollen cDNA library[Brassica. rapa]N
6e-29 100
TDF-4 246 推测的拟南芥胶质乙酰酯原酶
Putative pectinacetylesterase precursor[A. thaliana]X
2.00e-23 75
TDF-5 173 推测的拟南芥脂质转移蛋白
Putative lipid transfer protein[A. thaliana]X
9.00e-15 65
TDF-6 330 拟南芥 F-box 蛋白
F-box family protein[A. thaliana]X
3.00e-16 50
TDF-7 61 功能未知 Function unknown
TDF-8 302 拟南芥裂解酶
Lyase[A. thaliana]X
1.00e-35 82
TDF-9 75 拟南芥氨基酸转运蛋白
Amino acid transporter family protein[A. thaliana]X
93.8
TDF-10 182 拟南芥羧肽酶 Y 类似蛋白
Carboxypeptidase Y-like protein[A. thaliana]X
6.00e-22 85
TDF-11 280 甘蓝过氧物酶
Peroxidase[Brassica oleracea]X
2.00e-36 98
TDF-12 149 推测的拟南芥丝氨酸蛋白酶
Putative cysteine proteinase[A. thaliana]X
7.00e-09 81
TDF-13 286 拟南芥内在膜蛋白
Integral membrane family protein[A. thaliana]X
5.00e-16 89
TDF-14 83 大白菜花蕾 cDNA 文库 EST
EST from floral bud cDNA library[B. rapa]N
5e-35 100
TDF-15 116 拟南芥含有 PH 结构的蛋白
Pleckstrin homology domain-containing protein[A. thaliana]X
2.00e-06 86
TDF-16 85 大白菜花粉钙结合蛋白
Pollen calcium-binding protein[B. rapa]X
8.00e-08 100
TDF-17 78 拟南芥果胶甲酯酶
Pectin Methylesterase[A. thaliana]P
0 76
TDF-18 105 拟南芥丝氨酸蛋白酶
Cysteine proteinase[A. thaliana]
5.00e-13 88
TDF-19 95 拟南芥液泡膜 H+-ATPase
Vacuolar proton-ATPase subunit[A. thaliana]X
8.00e-08 93
TDF-20 104 拟南芥未知功能蛋白(AT3G48660)mRNA
Unknown protein(AT3G48660)mRNA[A. thaliana]N
1.00e-28 90
TDF-21 331 受体丝氨酸/苏氨酸激酶
Receptor serine/threonine kinase[A. thaliana]X
3.00e-52 90
TDF-22 94 甘蓝型油菜 mRNA 序列
mRNA sequence[Brassica napus]N
5.00e-41 100
TDF-23 154 拟南芥钙结合蛋白
Calcium-binding protein[A. thaliana]X
5e-19 90
TDF-24 123 拟南芥果胶甲酯酶
Pectin methylesterase[A. thaliana]X
1e-11 82
TDF-25 95 甘蓝型油菜 EST(GR451396)
EST(GR451396)[B. napus]N
2e-41 100
注:X、N和P分别代表BlastX、BlastN和BlastP分析。U代表基于Unigene的分析结果。
Note:X,N and P represented similarity analyses of TDF sequences using BlastX,BlastN and BlastP,respectively. U represented the analyses
abased on relevant unigenes.
2.2 大白菜脂质转移蛋白基因 BrLTP1 全长基因的克隆
利用 5′ RACE 锚定引物和引物 5RLTP-2 扩增出 1 条约 400 bp 的条带(图 3,A),测序表明扩
增片段中已经包括连续的 10 个胞嘧啶,且与 TDF-25 有 9 个碱基的重合(不包括引物部分),说明
已经扩增得到完整的 cDNA 5′ 端。3′ RACE 锚定引物和引物 3RLTP-2 扩增出 1 条约 400 bp 的条带
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(图 3,B),测序表明扩增片段与 TDF-25 有 35 个碱基的重合(不包括引物部分),且含有 16 个腺
嘌呤,说明已经获得了完整的 cDNA 3′ 末端序列。以上序列和 TDF-25 拼接,从而获得全长 cDNA
拼接序列。以此全长 cDNA 序列为基础设计基因特异引物,扩增得到目标基因的全长 cDNA 序列。
测序结果表明,该全长 cDNA 序列与前述 5′和 3′ RACE 片段拼接结果完全一致,全长均为 750 bp(图
3,C),命名为 BrLTP1(Brassica rapa Lipid-Transfer Protein 1)。
图 3 BrLTP1 基因的 5′ RACE(A)、3′RACE(B)以及全长 cDNA(C)扩增结果
M:DNA 标准分子量。1,2,3 分别为 5′RACE、3′RACE 以及全长 cDNA 扩增产物。
Fig. 3 PCR products of 5′ RACE(A),3′ RACE(B)and the full-length cDNA(C)of BrLTP1
M:DNA marker. 1,2 and 3 indicate the products of 5′ RACE,3′ RACE and
full length cDNA of BrLTP1,respectively.
2.3 BrLTP1 基因特征分析
2.3.1 核酸序列分析
利用 DNAStar 软件对 BrLTP1 基因序列进行分析,发现其最大开放阅读框为 552 bp,起始密码
子 ATG 始于第 80 位,终止密码子 TGA 终于第 631 位,预测编码一个含有 183 个氨基酸的蛋白质。
起始密码子 ATG 上游-3 位核苷酸为 A,+4 位为 G,是一个典型的 KozaK 结构,这一结构对于蛋白
质合成的 40S 起始复合物正确识别启始密码子具有很重要的作用。3′-UTR 的碱基组成极不平衡,A/T
含量达到 79.8%,可能与基因调控有关(图 4)。
图 4 BrLTP1 基因的 cDNA 及推导的氨基酸序列
下划线部分为信号肽;阴影加框线部分为 AAI 结构域。
Fig. 4 Nucleotide sequence of tomato BrLTP1 cDNA and deduced amino acid sequence
The signal peptide is underlined;Shaded frame indicates the conserved AAI domain.
2 期 刘志勇等:大白菜核雄性不育相关基因 BrLTP1 的克隆及特征分析 349
2.3.2 蛋白序列分析
BrLTP1 分子量为 18.23 kD,等电点(PI)为 7.534,pH 7.0 时的电荷为 0.829。BrLTP1 蛋白质
含有 8 个强碱性氨基酸(K,R),7 个强酸性氨基酸(D,E),64 个疏水氨基酸(A,I,L,F,
W,V),64 个极性氨基酸(N,C,Q,S,T,Y)。signalP3.0 预测表明,BrLTP1 存在信号肽的
可能性为 0.993,Ser22 ~ Arg23 为前体蛋白剪切位点的可能性为 0.899。经 SOSUI 分析,发现 BrLTP1
为膜蛋白,含有 1 个跨膜结构域(1 ~ 21)。
通过 Prosite 数据库查询,发现 BrLTP1 含有 10 个 N–豆蔻酰化位点(29 ~ 34、30 ~ 35、31 ~ 36、
33 ~ 38、121 ~ 126、122 ~ 127、142 ~ 147、144 ~ 149、147 ~ 152 和 168 ~ 173),2 个 N–糖基化
位点(93 ~ 96、126 ~ 129)以及 1 个 PKC 磷酸化位点(132 ~ 134)。SMART 分析表明,在 42 ~ 115
位存在 AAI 结构域。通过 PredictProtein 预测 BrLTP1 蛋白质的二级结构,表明该蛋白含有 37.6%的
α 螺旋、3.28%的 β 折叠和 59.56%的环状结构。以上分析结果表明,BrLTP1 为具有前导信号肽的膜
蛋白,其功能可能与脂质转移相关,推测出的多个修饰性位点可能对蛋白的加工或者对生物功能调
节具有重要作用。
经氨基酸序列同源搜索和多序列比对,发现BrLTP1与拟南芥protease inhibitor/seed storage/LTP
family成员NP_173264同源性达到60%,与其他LTP家族成员的同源性很低(< 30%),但BrLTP1半
胱氨酸位置符合植物LTP的保守性(图5)。
利用MEGA 4.0软件采用比邻法对大白菜拟南芥、白菜、蓖麻等植物LTPs的亲缘关系进行了分
析,结果表明BrLTP1与Boutrot等(2008)所报道的拟南芥LTP,Tian等(2009)公布的白菜LTP蛋
白(ABQ63061)的亲缘关系均较远,与拟南芥LTP蛋白 NP_173264和蓖麻XP_002530788的亲缘关
系较近,处于同一分枝(图6)。
值得注意的是,BrLTP1、XP_002530788和NP_173264分子量明显大于其它已报道的LTP蛋白,
主要在于其拥有一个延长的C–末端。
图 5 BrLTP1 和其他植物脂质转移蛋白的氨基酸序列多重比对
XP_002530788 来自蓖麻,ABQ63061 来自白菜,其余蛋白序列来自拟南芥。
Fig. 5 Multiple sequence alignment of amino acid sequence of BrLTP1 and lipid transfer proteins in other plants
XP_002530788(Ricinus communis);ABQ63061(Brassica rapa subsp. campestris);
Other sequences are from A. thaliana.
350 园 艺 学 报 38 卷
图 7 利用QRT-PCR检测BrLTP1在可育池和
不育池之间的表达差异
F,S分别代表可育池和不育池。
Fig. 7 Amplification of BrLTP1 in female pool and male
pool by QRT-PCR.
F:Fetile bud pool;S:Sterile bud pool.
图 8 BrLTP1基因表达模式分析
1 ~ 12 分别代表雄性不育两用系‘AB02’可育株的根、茎、叶、
大蕾、中蕾、小蕾、角果、萼片、花丝、花药、花瓣和雌蕊。
Fig. 8 Gene expression analysis of BrLTP1
1–12 represent root,stem,leaf,big floral bud,middle floral bud,
small floral bud,silique,sepal,filament, anther,petal and
pistil of fertile plants in‘AB02’,respectively.
图 6 BrLTP1和其他植物脂质转移蛋白的氨基酸序列系统进化树
XP_002530788 来自蓖麻,ABQ63061 来自白菜,其余蛋白序列来自拟南芥。
Fig. 6 Phylogenetic tree of amino acid sequence of BrLTP1 and lipid transfer proteins in other species
XP_002530788(Ricinus communis);ABQ63061(Brassica rapa subsp.campestris);
Other sequences are from A. thaliana.
2.4 BrLTP1 基因表达模式分析
QRT-PCR 分析表明,BrLTP1 在可育花蕾中的表达量约为不育花蕾的 30 倍,同 cDNA-AFLP 结
果一致,说明 BrLTP1 的表达在不育系中受到了强烈抑制(图 7)。
在 12 个组织和器官中,BrLTP1 在小蕾中的表达量最低,在大花蕾、花药以及花瓣中的表达量
较高,分别约为小蕾中表达量的 860 倍、235 倍和 395 倍(图 8)。以上结果表明,BrLTP1 在花器官
优势表达,是一个雄性不育相关基因。
2 期 刘志勇等:大白菜核雄性不育相关基因 BrLTP1 的克隆及特征分析 351
3 讨论
脂类不仅是细胞的主要组成成分之一,而且一些脂质分子作为第二信使参与了动植物细胞功能
的调节,在细胞信号转导中构成脂类信号通路(Raffaele et al.,2009)。非特异性脂质转运蛋白
(nsLTPs)在植物的生长发育、抗逆过程中具有广泛的生物学功能,而其在生殖发育中的作用备受
关注(Blein et al.,2002;Imin et al.,2006)。nsLTP蛋白由多基因家族编码,具有多种异构体(Boutrot
et al.,2008)。目前,研究者已经得到多个在植物雄性器官特异性或优势表达的nsLTP。Ariizumi等
(2002)发现拟南芥LTPl2表达出现在花粉发育的单核和二核花粉阶段,并进一步定位在绒毡层,它
的功能被认为在花粉发育过程中从绒毡层到花粉外壁传递脂质。在水稻、桃的生殖器官以及油菜绒
毡层和小孢子中也存在特异表达的LTP基因,可能参与了雄性生殖器官中花粉壁发育所需物质的累
积积淀(Foster et al.,1992;Botton et al.,2002;Boutrot et al.,2007)。对白菜核雄性不育mmc突变
体与其野生植株花蕾差异表达分析中,发现了1个推测的LTPs基因BcMFl5,该基因在野生型植株花
蕾和嫩角果中特异表达,而在mmc突变体没有任何表达,这表明它与白菜花粉发育密切相关(Tian et
al.,2009)。Chen等(2009)利用拟南芥ATH1芯片分析了甘蓝型油菜雄性不育系S45AB可育株和
不育株花蕾的基因表达谱,其中1个LTP基因在不育株上受到强烈抑制。
作者通过比较分析大白菜复等位核雄性不育系统可育株(msms)和不育株(Msms)花蕾的基
因表达谱,共获得25个差异表达基因片段,其中2个编码LTP,暗示了‘AB02’雄性不育性的形成
可能与脂质代谢的异常有关。进一步的序列分析和基因表达表明,BrLTP1为花器官优势表达基因,
推测的BrLTP1蛋白含有典型的N端信号肽、保守的AAI结构域和半胱氨酸骨架,但与以前所报道的
LTP有很大的不同。首先,BrLTP1分子量远远大于以往报道的植物LTP;其次,LTPs往往含有保守
的钙调素结合位点,可能参与钙调素所介导的信号转导(Tian et al.,2009),但BrLTP1并不含有此
位点。由于在复等位核不育系统中,不育株和可育株在转录组上存在明显差异,BrLTP1只是其中之
一,它在雄性不育性形成中的角色尚未得知。与BrLTP1同源性最高的蛋白为拟南芥NP_173264。在
Pfam数据库中,NP_173264被归为独立的基因家族(protease inhibitor/seed storage/LTP family) ,目
前该家族成员的功能还是未知的。作者已从ABRC购买了NP_173264的T-DNA插入突变体,欲通过
分析野生型与突变体的育性差异,进而推测BrLTP1的可能功能。同时,构建了BrLTP1的RNAi载体,
拟在正常可育品系中沉默该基因,研究其在植物雄配子发育过程中的具体功能。
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