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苹果SFBB基因家族的染色体定位及细胞遗传学特征



全 文 :园 艺 学 报 , (增刊): 2011 38 2456 http: // www. ahs. ac. cn
Acta Horticulturae Sinica E-mail: yuanyixuebao@126.com

收稿日期:2011–07–25
基金项目:日本学术振兴会(JSPS)项目(P08422)
* E-mail:wsh3xg@njau.edu.cn;Tel:025-84395724
苹果SFBB基因家族的染色体定位及细胞遗传学
特征
王三红1,*,佐佐英德2,菊池真司2,章 镇1
(1南京农业大学园艺学院,南京 210095;2千叶大学园艺学部遗传育种研究室,日本松户 271-8510)
苹果是配子体自交不亲和植物,由两个独立且紧密连锁的花柱S基因和花粉S基因分别控制雌
蕊和雄蕊中自交不亲和的特异性。花柱S决定子是由S-RNase基因编码具有核酸酶活性的碱性糖蛋
白。花粉S决定子是SLF/SFB编码的F-box蛋白。通过S-locus区域BAC重叠群测序,Sassa等(2007)
最先鉴定了两个花粉S候选基因SFBB9-α,SFBB9-β。Minamikawa等(2010)报道了在一个苹果单元
型中至少含有10个以上的F-box基因(命名为MdFBX基因),这些基因都符合具有花粉S基因的特点,
即花粉特异表达,具有S多型性且在遗传上与S-RNase紧密连锁。为了进一步确定S-locus区域的基
因组结构和细胞遗传学特点,通过高分辨率的苹果减数分裂粗线期染色体FISH和免疫荧光染色方
法,精确定位MdFBX基因与S-RNase基因的物理定位、连锁关系,分析和推测其物理距离,苹果
S-locus区域的染色质结构和基因重组抑制的关系。
苹果‘Florina’(S3S9)花芽取自日本长野果树试验场,于Farmer固定液[3︰1(体积比)乙醇︰
冰醋酸]固定24 h以上。覆盖苹果S-locus区域的细菌人工染色体(BAC)克隆购自美国德克萨斯A & M
大学。碱裂解法提取苹果BAC DNA,并经PEG8000纯化。用生物素、地高辛标记探针,标记方法采
用Roche公司的Dig/Biotin Nick Translation 试剂盒。三色FISH另一个探针同时用生物素和地高辛标
记。采用三明治方法放大和检测FISH信号。在徕卡荧光显微镜(Leica DM RXA2)上观察,通过计
算机连接在显微镜上CCD相机(Leica DC350F)获取杂交信号,利用Leica CW4000 和Adobe
Photoshop v5.1软件将单色图象叠加合成图像。
苹果减数分裂粗线期染色体原位杂交结果表明,S9单元型MdFBX基因与S9-RNase基因紧密连锁,
且定位在染色体的端粒附近。通过三色BAC-FISH 确定了MdFBX基因与S-RNase基因的相对位置,
从端粒至着丝粒方向依次是MdFBX10,MdSFBB9-α,S9-RNase,MdSFBB9-β,MdFBX13(15),MdFBX19,
MdFBX6,MdFBX16,MdFBX12,MdFBX17,MdFBX11,这些基因定位于约1 Mb大小的染色体区域,
该区域染色质结构呈高度异染色质化。由于异染色质区域可能伴随基因的高度甲基化,通过免疫荧
光染色方法,用anti-5mC抗体探测了S-locus区域基因的甲基化现象,结果表明在染色体上S-locus比
周围区域呈现出强烈的荧光信号,表明S-locus区域基因高度甲基化。
由此得出 MdFBX 基因与 S-RNase 基因在遗传和物理定位上紧密连锁,该区域的高度异染色质化
和甲基化是保证其不被重组的重要原因,这为进一步证明 MdFBX 基因是苹果花粉 S 基因提供了证据。
关键词:苹果;自交不亲和;SFBB 基因家族;花粉 S 基因;荧光原位杂交(FISH)
中图分类号:S 661.1 文献标识码:A 文章编号:0513-353X(2011)S-2456-01