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Cloning and Expression Analysis of Key Genes PPH and PAO for Chlorophyll Degradation in Cucumber

瓜叶绿素降解关键酶基因PPH和PAO cDNA片段的克隆与表达初步分析



全 文 :园 艺 学 报 2011,38(6):1104–1110 http: // www. ahs. ac. cn
Acta Horticulturae Sinica E-mail: yuanyixuebao@126.com
收稿日期:2011–01–11;修回日期:2011–05–03
基金项目:国家‘948’项目(2008-Z26);湖北省科技攻关项目(20066109)
* 通信作者 Author for correspondence(E-mail:xyjho@mail.hzau.edu.cn)
致谢:本文得到华中农业大学园艺林学学院长江学者匡汉晖教授的修改,在此表示感谢。
黄瓜叶绿素降解关键酶基因 PPH 和 PAO cDNA
片段的克隆与表达初步分析
王 伟,徐跃进*,万正杰
(华中农业大学园艺林学学院,国家蔬菜改良中心华中分中心,园艺植物生物学教育部重点实验室,武汉 430070)
摘 要:以西双版纳黄瓜和‘华黄 5 号’黄瓜叶片为试验材料,研究了衰老过程中两种黄瓜叶片叶
绿素含量变化及脱镁叶绿素脱镁叶绿酸水解酶基因 PPH 和脱镁叶绿酸 a 加氧酶基因 PAO 的表达。结果表
明:随着叶片衰老,叶绿素 a 和叶绿素 b 含量显著降低,叶绿素 a 与叶绿素 b 的比值在 0.5 左右,推测叶
绿素 b 的含量可能对黄瓜叶片保绿起到重要作用。荧光定量 RT-PCR 分析结果显示:PPH 和 PAO 在西双
版纳黄瓜叶片生长 35 d 时表达量最高,分别为 5.50 和 1.86;PPH 在‘华黄 5 号’叶片 35 d 时表达量最高,
为 7.14,而 PAO 在 35 和 45 d 表达量都很高,分别为 3.90 和 3.91;PPH 和 PAO 在西双版纳黄瓜叶片中的
表达量低于在‘华黄 5 号’中。
关键词:黄瓜;叶绿素;降解;PPH;PAO;衰老;表达
中图分类号: S 642.2 文献标识码:A 文章编号:0513-353X(2011)06-1104-07

Cloning and Expression Analysis of Key Genes PPH and PAO for Chlorophyll
Degradation in Cucumber
WANG Wei,XU Yue-jin*,and WAN Zheng-jie
(College of Horticulture and Forestry,Huazhong Agricultural University;National Center for Vegetable Improvement
(Centeral China);Key Laboratory of Horticulture Plant Biology,Ministry of Education,Wuhan 430070,China)
Abstract:The change of chlorophyll content and the expression of pheophytin pheophorbide
hydrolase gene(PPH)and pheidea oxygenase gene(PAO)were analyzed during leaf senescence of
Cucumis sativus L. var. xishuangbannanesis Qi et Yuan and‘Huahuang 5’. The results showed that
chlorophyll a and b content decreased significantly during the leaf senescence. The ratio of chlorophyll a
and b was around 0.5,suggesting that chlorophyll b content might play a role in keeping green. Real-time
PCR results showed that PPH and PAO had the highest expression in leaves of xishuangbannanesis Qi et
Yuan at 35 d,with the relative expression values of 5.50 and 1.86,respectively. The maximum expression
values of PPH in leaf of‘Huahuang 5’occurred at 35 d,with relative expression value of 7.14. The highest
expression of PAO in leaf of‘Huahuang 5’occurred at 35 d and 45 d,with the relative expression values
of 3.90 and 3.91,respectively. The expression of PPH and PAO in leaves of Cucumis sativus L. var.
xishuangbannanesis Qi et Yuan were lower than that in‘Huahuang 5’.


6 期 王 伟等:黄瓜叶绿素降解关键酶基因 PPH 和 PAO cDNA 片段的克隆与表达初步分析 1105

Key words:cucumber;chlorophyll;breakdown;PPH;PAO;senescence;expression

黄瓜(Cucumis sativus L.)的产量和品质受叶绿素降解的影响非常明显。对叶绿素降解代谢分
子机制的了解有助于探明衰老过程中光合功能衰退的调控机理,从而为作物产量和品质性状的遗传
改良提供理论依据。
脱镁叶绿素脱镁叶绿酸水解酶(pheophytin pheophorbide hydrolase,PPH)和脱镁叶绿酸 a 加氧
酶(pheidea oxygenase,PAO)是叶绿素降解代谢的关键酶(Silvia et al.,2009;Asumi et al.,2010)。
PPH 是叶绿素降解过程中新发现的一种酶(Nancy,2009),在叶绿素降解过程中 PPH 是卟啉–植
醇水解过程参与的候选酶,对脱镁叶绿素很活跃,但对叶绿素却没有作用。PPH 酶的作用是将脱镁
叶绿素 a 转换为脱镁叶绿酸 a。在叶片衰老过程中 PPH 基因的表达加强,加快脱镁叶绿素 a 转换为
脱镁叶绿酸 a,加速叶片衰老。PPH 酶的缺失能够造成植物滞绿表现型,是一种非功能的滞绿,叶
绿素代谢在一定程度上受损,叶绿素缓慢降解,叶片保绿时间较长,衰老被延迟。脱镁叶绿酸 a 加
氧酶(PAO)是催化叶绿素卟啉环开环成为四元线性吡咯衍生物的关键酶,是一种铁硫蛋白,被一
种加速细胞死亡基因编码(Adriana et al.,2003),PAO 酶作用于叶绿素降解的方式较灵活,如持绿
蛋白 SGR(senescence-inducible chloroplast stay-green protein)可通过影响 PAO 酶的活性使植物表现
为滞绿(Stefan,2009),PAO 编码基因缺失会产生滞绿突变体(Stefan et al.,1998;Davyd et al.,
2006)。PAO 基因的表达与衰老密切相关。在植株衰老和伤害时 PAO 基因表达水平上调,在叶片衰
老后期,PAO 活性达到最高;在衰老的叶片中,抑制 PAO 的活性,将导致脱镁叶绿酸 a 的积累和
叶绿素降解的抑制;在滞绿突变体的叶片衰老过程中 PAO 活性非常低。因此通常认为编码该酶的基
因突变是滞绿突变体保持绿色的原因之一。
关于黄瓜衰老及保绿的分子机理方面的研究较少,文献报道大多仅为衰老过程生理生化特性及
细胞学研究(李艳秋,2006;王志坤 等;2007;商庆梅,2009)。本研究中以西双版纳黄瓜野生种
和栽培品种‘华黄 5 号’为研究对象,克隆了叶绿素降解途径中 PPH 和 PAO 两个关键酶基因片段,
利用荧光定量 RT-PCR 技术手段,研究其表达差异,为深入研究 PPH 和 PAO 酶编码基因的生物信
息学及黄瓜产量和品质进行遗传改良提供分子基础。
1 材料与方法
1.1 材料及其叶绿素含量测定
试材为黄瓜品种‘华黄 5 号’和野生西双版纳黄瓜(Cucumis sativus L. var. xishuangbannanesis Qi
et Yuan),均由华中农业大学黄瓜育种课题组提供。‘华黄 5 号’为本实验室 2009 年选育的新品种,
叶片深绿,生长后期叶片黄化面积大,数量也较多,茎较粗,生长势较强,早熟。野生西双版纳黄
瓜生长期可长达 200 d,叶片墨绿,生长后期叶片黄化面积小,数量较少,茎粗,生长势强,晚熟。
两份材料于 2010 年 6 月播种于国家蔬菜改良中心华中分中心(华中农业大学校内)大棚内,土壤肥
力一致,正常栽培管理。待植株生长至第 5 节位时,选长势一致的植株对第 5 节位叶片进行叶龄(叶
片伸出后天数)标记,于叶片伸出后 5、15、25、35 和 45 d 取样。叶绿素含量测定参照李合生(2000)
的方法进行。
1.2 引物设计与合成
根据 GenBank 登录的 PPH 和 PAO 酶编码基因的保守序列,利用 Primer 3.0 软件进行引物设计,
1106 园 艺 学 报 38 卷
PPH 的引物序列为 PPH-F:5′-CATCGAACAGGTCATTGGTG-3′和 PPH-R:5′-ACTTTCGGGGTCGCT
TATTT-3′;PAO 的引物序列为 PAO-F:5′-GGGCATTGAAAACTG G AAGA-3′和 PAO-R:5′-CTAATGGT
CCCTGGGGATTT-3′。以上引物由上海生工生物工程服务有限公司合成。
1.3 RT-PCR 扩增及产物序列测定
以提取的黄瓜叶片 RNA 为模板进行反转录之后向反应体系加入 ddH2O 36.5 μL,10 × Taq buffer
5 μL,dNTP(2 mmol · L-1)4 μL,cDNA 第 1 链模板 2 μL,正、反向引物各 1 μL,Taq 酶(5 U · μL-1)
0.5 μL。其 PCR 反应条件为 94 ℃预变性 4 min、94 ℃变性 30 s,52 ℃退火 30 s,72 ℃延伸 30 s,
35 个循环;72 ℃延伸 4 min。PCR 产物经 1.5%的琼脂糖凝胶电泳检测。
PCR 产物经回收、纯化,与 psure-T 载体(购自北京庄盟生物技术有限公司)连接,转化 DH5α
感受态细胞,蓝白斑筛选后测序(上海桑尼生物工程技术服务有限公司)。
1.4 实时荧光定量 PCR 分析
提取黄瓜叶片 RNA,利用 ReverAid FirstStrand cDNA Synthesis Kit(Fermentas,Lithuania)合
成 cDNA 第 1 链备用。
按照 2 × SYBERGREENPCRMasterMix(TOYOBO,Japan)试剂盒操作指导,采用实时荧光定
量 PCR(Real-time quantitative PCR,QRT-PCR)方法,检测基因的相对表达量(Ficko & Cernelc,
2005)。扩增目标 PPH、PAO 基因引物设计为 PPH-F:5′-GCAATGTGACGCCCTTAACT-3′和 PPH-R:
5′-CATCGAACAGGTCATTGGTG-3′;PAO-F:5′-GGGCATTGAAAACTGGAAGA-3′和 PAO-R:5′-TTA
CTTGGCGATCAAAAATGG-3′。预测产物长度分别为 113 和 117 bp,适用于 QRT-PCR;以 β-actin
基因为内参,其引物序列为 β-actin-F:5′-CCAAGCAGCATGAAGATCAA 和 β-actin-R:5′-ATCTGCT
GGAAGGTGCTGAG。预测产物长度是 100 bp,适用于 QRT-PCR。以生长 5 d 叶片的表达量定为“1”,
按照相对定量公式 2-△△Ct 作图。
2 结果与分析
2.1 黄瓜叶片衰老过程中叶绿素含量的变化
在衰老过程中,叶片中叶绿素含量的高低和变化的快慢可以反映叶片衰老的快慢。从图 1 可以
看出,在黄瓜叶片衰老过程中,叶绿素 a 和叶绿素 b 含量均呈先上升后下降的趋势。西双版纳黄瓜

图 1 黄瓜叶片叶绿素 a、b 含量
Fig. 1 Chlorophyll a and b content of cucumber leaf
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图 2 黄瓜叶片叶绿素 a/b 比值
Fig. 2 The ration of chlorophyll a and b of cucumber leaf
图 3 黄瓜 PPH 和 PAO 基因的 RT-PCR 产物电泳图谱
M:DNA marker 2000;1、3:‘华黄 5 号’;
2、4:西双版纳黄瓜。
Fig. 3 Electrophoresis pattern of PPH and PAO RT-PCR
products of cucumber
M:DNA marker 2000;1,3:Leaf of Huahuang 5;
2,4:Leaf of Xishuangbanna cucumber.
叶片在生长 25 d 时叶绿素 a 含量最高,生长 45 d 下降 43.8%;叶绿素 b 在生长 15 d 时最高,生长
45 d 下降 46.4%;叶绿素 a/b 比值只有在生长 25 d 与其它天差异显著外,其余天数之间差异不显著
(图 2)。
‘华黄 5 号’黄瓜叶片在生长 15 d 叶绿素
a 和叶绿素 b 含量最高,生长 45 d 时分别下降
42.8%和 43.3%(图 1),叶绿素 a/b 比值在生长
25、35 和 45 d 差异显著(图 2)。
野生种和栽培品种叶绿素 a 和叶绿素 b 含
量在衰老不同阶段差异显著(P < 0.05)(图 1)。
西双版纳黄瓜叶绿素 a/b 在生长 25 d 时最大,
华黄 5 号叶绿素 a/b 在生长 35 d 时最大,虽然
叶绿素 a/b 在生长前期差异不显著,但在后期
达到差异显著水平(P < 0.05)(图 2)。
2.2 PPH 和 PAO cDNA 片段的克隆
以两个黄瓜品种叶片总 RNA 反转录的
cDNA 为模板。进行 RT-PCR 扩增,扩增产物
经 0.8%琼脂糖凝胶电泳检测,在栽培种和野生
种中均扩增得到预期大小的 cDNA 片段,PCR
扩增产物均为单一条带,各引物对的特异性较
高。
PPH基因的 cDNA片段测序后核苷酸序列
为 265 bp(图 3),同源比对结果显示与拟南芥
(AT5G13800)、花椰菜(OL386R)、葡萄
(XM002271131.1)和烟草(AM851012.1)的
同源基因分别具有 87%、88%、80%和 78%的
核苷酸序列相似性。
PAO 基因的 cDNA 片段测序后核苷酸序列
为 230 bp(图 3),与拟南芥(NM-114357.5)、
葡萄(FJ799360.1)、花椰菜(AB470926)、毛
果杨(XM002331446.1)和蓖麻(XM002523689)
的同源基因分别具有 90%、86%、85%、83%和 82%的核苷酸序列相似性。证明该扩增产物是 PPH
和 PAO 酶基因片段。
2.3 PPH 和 PAO 基因在西双版纳黄瓜叶中的相对表达量
如图 4 所示,在西双版纳黄瓜叶片衰老过程中,PPH 和 PAO 基因在叶中的相对表达量的变化
趋势有所不同,PPH 基因的相对表达量是先上升后下降,在生长 35 d 时最高,为 5.50;45 d 时为
35 d 的 69%。PAO 基因在生长 15 和 25 d 时表达较弱,分别为 5 d 的 5.8%和 20%;在生长 35 d 时
表达最强,为 1.86;45 d 为 35 d 的 25%。相关性分析表明,这两个基因在西双版纳黄瓜叶片中的表
达呈正相关(r = 0.57)。

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PPH 的测序结果为:ACTTTCGGGGTCGCTTATTTTCTGCCAAACAAACTTTGTGAGCTTTCT
CACGTTGTCTGGTAATGGAAACTTCCCACCCCAAGGAAACAATTTTGCTAATCTCGGCGATCTT
ATAGGATTAGGAAAAAATCCCCAGAATGGAGTTGCATTTAGCAATGTGACGCCCTTAACTAAAT
CAGGATTGCACGCTGCAAAGTATAGTGCCACAAACCCTCCAAGTGAATTGCCCACAATGTAGA
CTGGTTCACCAATGACCTGTTCGATG。
PAO 的测序结果为:GGGCATTGAAAACTGGAAGAAGTTTCGAGCACTACATACAATAGAAC
GAGTTTTTCCAGGACCCATTGGCACATTGAAGGAGCAAATCCATATTACCCATTTTTGATCGCCA
AGTAAAGGAAGCTTTGAGTCAATTTCCACTTTGTTGATATAGTAACAAGGAGCAACAAACTCGG
CACTAATCCTTGGGTTACCCTTATTTGCTCCA GAAAATCCCCAGGGACCATTAG。
上述下划线部分为引物序列。这两个从野生西双版纳黄瓜和‘华黄 5 号’黄瓜叶片中扩增出来
的基因经过 BLAST 比对,在序列上没有差异。

图 4 PPH 和 PAO 基因在西双版纳黄瓜叶中的相对表达量
Fig. 4 Relative expression of PPH and PAO genes in leaf of Xishuangbanna cucumber

2.4 PPH 和 PAO 基因在‘华黄 5 号’黄瓜叶中的相对表达量
在‘华黄 5 号’叶片衰老的过程中,PPH 和 PAO 基因的表达模式与在西双版纳黄瓜叶片基本
相同。PPH 基因的相对表达量是先上升后下降,在 35 d 时表达量最高,为 7.14;45 d 时为 35 d 的
19%(图 5)。

图 5 PPH 和 PAO 基因在‘华黄 5 号’黄瓜叶中的相对表达量
Fig. 5 Relative expression of PPH and PAO genes in leaf of Huahuang 5
6 期 王 伟等:黄瓜叶绿素降解关键酶基因 PPH 和 PAO cDNA 片段的克隆与表达初步分析 1109

PAO 基因在生长 15 和 25 d 时表达较弱,分别为 5 d 的 83%和 76%,与西双版纳黄瓜不同的是,
PAO 基因在 35 和 45 d 表达都很强,分别为 3.90 和 3.91(图 5)。相关性分析表明,这两个基因在‘华
黄 5 号’黄瓜叶片中的表达呈正相关(r = 0.52)。
3 讨论
本试验中野生种和栽培种黄瓜叶片在衰老过程中叶绿素 a 和叶绿素 b 含量均先上升,后显著下
降,叶绿素 a/b 也均在下降,这与孙艳等(2008)研究结果一致。叶绿素 b 含量对叶绿素总含量起
到主导作用,与孙小镭等(2003)的研究结果一致。
PPH 基因在叶片衰老过程中相对表达量加强,加快叶绿素降解,加速叶片衰老(Zimmermann et
al.,2004)。对拟南芥叶片衰老的最新研究表明 PPH 酶是一种新型的水解酶,其调控基因为
At5g13800,拟南芥叶中 PPH 酶参与了叶绿素降解,证实叶绿素酶不是必须的,PPH 基因的表达和
其他滞绿相关的酶基因,如 NYC1、NOL、SGR 等表达没有冲突,有相关性。在本试验中,PPH 和
PAO 基因表达具有一定的相关性。黄瓜野生种和栽培种 PPH 基因的表达强弱不同,这与在花椰菜
(Brassica oleracea L. var. botrytis L.)花茎中的表达模式相似(Agustin et al.,2010),PPH 基因在
野生种和栽培种衰老过程中表达都是先强后弱,野生种中的相对表达量低于栽培种,表明 PPH 基因
可能对加速衰老有一定的作用。拟南芥 PPH 突变体中发现有大量的叶绿素 a 和叶绿素 b 保留(Silvia
et al.,2009),这表明 PPH 酶基因的表达与叶绿素的积累可能有一定的联系,但栽培种和野生种之
间遗传背景差异很大,该基因的差异也有可能是其他原因引起的,所以有待于进一步深入研究。
PAO 基因在叶片的衰老过程中相对表达量同样加强,抑制 PAO 的活力,将导致脱镁叶绿酸 a 的
积累和叶绿素降解抑制(唐蕾,2008)。酒精能显著抑制花椰菜 PAO 基因的表达,酒精处理后,PAO
表达量较低,随着酒精作用减弱,其表达量逐渐上升,而正常植株 PAO 表达量在衰老过程中先上升
后下降(Asumi et al.,2010)。本试验结果与正常花椰菜中 PAO 表达趋势略有不同,但基本表达模
式相同,PAO 基因在野生种和栽培种中表达量先下降,后逐渐上升,然后再下降。这可能由于材料
的差异及处理不同造成 PAO 基因的表达结果不同。
在本试验中,PPH 和 PAO 基因在黄瓜叶片衰老过程中没有很高的相关性。可能叶片衰老过程
中,其他因子调控 PPH 和 PAO 基因的表达。尽管 PPH 和 PAO 缺失可以形成滞绿突变体,但影响
叶绿素降解可能还有其他一些关键酶,如叶绿素 b 向叶绿素 a 转化所需的 NYC1 和 CAO 等。叶绿素
a 和叶绿素 b 是保绿的主要色素,在叶绿素 b 向叶绿素 a 转化循环途径上进行深入研究可能会有一
些新的发现。PPH 和 PAO 缺失主要累积叶绿素 a,同时发现 PAO 引起的滞绿常与 RCCR 和 SGR 等
基因相关,如 SGR 通过调节 PAO 活性影响叶绿素和色素蛋白复合物的降解(严波,2007;Paavo,
2010)。
黄瓜生长期较短,采后叶绿素易降解,发黄变软,难以适应长途运输和较长时间的贮藏,其食
用品质和商品品质下降。延缓黄瓜植株衰老,延长保鲜期,成为生产上迫切需要解决的难题。虽然
在一些植物中获得滞绿突变体,但由于遗传背景不同,滞绿分子机理相差较大,有自身基因引起的,
也有环境引起的。所以 PPH 和 PAO 在黄瓜中的作用机理及滞绿突变体的获得还需要深入研究。

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