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SRAP反应体系的优化及其在白簕品种间亲缘关系分析中的应用



全 文 :园 艺 学 报 2011,38(增刊):2639 http: // www. ahs. ac. cn
Acta Horticulturae Sinica E-mail: yuanyixuebao@126.com

收稿日期:2011–07–28
基金项目:广东省科技攻关项目(2008B021500011);广东省教育部产学研结合项目(2010B090400492)
* E-mail:chunhuagz@163.com;Tel:13610193120,020-84215921

SRAP 反应体系的优化及其在白簕品种间亲缘
关系分析中的应用
林春华 1,*,李兆龙 2,乔燕春 1,林伟君 3,刘自珠 1,谭 雪 1
(1 广州市农业科学研究院,广州 510308;2仲恺农业工程学院生命科学学院,广州 510225;3 广东省农业科学院科
技情报研究所,广州 510640)
白簕[Acanthopanax trifoliatus(Linn.)Merr. ],别名鹅掌簕、禾掌簕,三加皮,三叶五加,为
五加科(Araliaceae)攀援状灌木。白簕为民间常用草药,有舒筋活络、祛风除湿、理气、止咳之
效。目前国内外对白簕的研究重点在其化学成分和活性分析方面,有关种质资源收集、引种、鉴定
和利用等研究鲜有报道。本研究中通过优化 SRAP 反应体系,对白簕材料的遗传多样性及亲缘关系
进行分析,以期为白簕种质资源的保存、优良品种纯化以及杂交育种等工作提供参考依据。
分别从田间生物学性状和分子基因遗传水平两方面入手,对 7 份白簕材料进行了观察和分析。
分别于 2008 年、2009 年、2010 年连续 3 年将材料种植于广州市农业科学研究院恩平白簕基地及科
研示范基地进行表型调查记录。挑选其幼嫩叶片,改良 CTAB 法提取白簕基因组 DNA;采用优化
的 SRAP 反应体系对基因组进行处理,用 99 个 SRAP 引物组合对材料的多态性进行筛选,数据采
用 NTSYS2.1 软件处理,应用非加权类平均法(UPGMA)进行聚类分析,建立聚类图。
经对影响 SRAP-PCR 体系中的 Mg2+、dNTPs 和引物浓度等因子的优化,建立了一套适合白簕
SRAP 检测的 25 μL 反应体系:4 mmol · L-1 Mg2+,3 mmol · L-1 dNTPs,3 µmol · L-1 引物,20 ng 模
板 DNA,1.5 U Taq DNA 聚合酶。从 99 组 SRAP 引物组合中筛选出 17 个多态性较好的组合对 7
份材料进行分析,共扩增到 461 条谱带,其中多态性谱带 155 条,多态性谱带比率为 33.6%,不同
引物的扩增条带为 7 ~ 12 条,平均每个引物组合产生 10 个多态性条带。
根据 SRAP 扩增结果,计算各品种间的遗传相似系数。结果表明:这些材料间的遗传相似系数
的变化范围是 0.7077 ~ 0.9474,其中嫩芽呈红绿色的紫柄品种和嫩芽呈绿色的细叶密刺品种的相似
系数最小(0.7077),亲缘关系最远;嫩芽呈红绿色的大叶大刺和红梗品种之间相似系数最高
(0.9474),亲缘关系最近。
UPGMA 聚类分析结果表明,所检测的 7 个白簕品种分为二大类群,第一类群又分为 2 个亚类。
白梗簕菜、细叶小刺簕菜、紫柄簕菜、大叶大刺簕菜和红梗簕菜,聚成一组,其中白梗簕菜和细叶
小刺簕菜为一个亚类,紫柄簕菜、大叶大刺簕菜和红梗簕菜为第二亚类;青梗簕菜和细叶密刺簕菜
聚成了另一组;这些材料嫩芽颜色从下往上分别为绿色、红绿色和浅绿色,由此可知它们的分类依
据是白簕嫩芽颜色的深浅。
关键词:白簕;SRAP 反应体系;优化;亲缘关系
中图分类号:S 6 文献标识码:A 文章编号:0513-353X(2011)S-2639-01