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白菜BcRALF基因启动子的分离



全 文 :园 艺 学 报 2011,38(增刊):2538 http: // www. ahs. ac. cn
Acta Horticulturae Sinica E-mail: yuanyixuebao@126.com

收稿日期:2011–09–12
基金项目:教育部留学回国人员科研启动基金项目(2009-1001);浙江省自然科学基金项目(Y3090294);浙江省人事厅留学回国基金
项目(J20090028)
* 通信作者(E-mail:xlyu@zju.edu.cn;Tel:0571-88982354)
白菜 BcRALF 基因启动子的分离
阮玉蓉,胡 帅,王芳展,刘振宁,刘亚培,余小林*
(浙江大学蔬菜研究所,农业部园艺植物生长发育与品质调控重点开放实验室,杭州 310058)
快速碱化因子(Rapid Alkalinization Factors,RALF)是最早从烟草叶片中发现的一类多肽信号
类物质。本研究中在已分离得到白菜BcRALF基因全长序列的基础上,采用TAIL-PCR技术克隆获得
白菜BcRALF基因的启动子序列,利用PLACE、PlantCARE和DNAMAN等植物转录元件分析软件对
克隆到的启动子序列进行分析,寻找转录因子结合位点和作用元件。通过启动子缺失分析法研究该
启动子的结构和功能,并比较不同类型启动子对BcRALF基因的驱动差异,为精确调控BcRALF基因
在植物体内的表达和深入分析BcRALF基因的生物学功能奠定研究基础。
材料为白菜‘矮脚黄’核不育两用系。TAIL-PCR方法如下:取 50 ng白菜 DNA,在 20 μL体
系中,以 SP1与 6个简并引物分别配对,进行第 1次 PCR扩增,所得产物稀释 40倍后取 1 μL作模
板,以 SP2和相应的简并引物开始第 2次 PCR扩增,所得产物稀释 10倍后取 1 μL作模板,以 SP3
和相应的简并引物开始第 3次 PCR扩增。5′端 3个特异引物序列分别如下,SP1:5′-CTAGAGATTGACCA
CGACAACGAT-3′;SP2:5′-TAAACTGTGATCTCCATGAAG-3′;SP3:5′-AGAGCCAATAACACCACAAG-3′。
通过 TAIL-PCR初步获得了与理论相符即第 2和第 3次扩增产物之间的大小差距与 SP2和 SP3
之间的大小差距相当的扩增产物。将第 1组的第 3轮扩增产物中的目的片段回收,并分别克隆到 T
载体上。经转化、蓝白斑筛选及酶切检测,获得目的重组子。结果显示,该 BcRALF基因启动子序
列为 792 bp,其碱基 A、G、T、C所占比例依次是 34.34%、13.26%、33.33%和 19.07%;A + T的
比例为 67.68%,C + G的比例为 32.32%,符合启动的碱基组成。该启动子区含有丰富的顺式作用元
件。该序列含有 TATA box等启动子特有元件,分别在-50、-459有 2个 TATA box,TATA box其核
心序列为 TATA(A/T),是 RNA聚合酶Ⅱ识别的位点,也是一些反式作用因子与 DNA相互作用的
位点之一;该序列在-13、-122、-558、-632位置存在 4个 GATA box,是 35S启动子特有元件;在-264
处有 1个 EBOX元件 CANNTG;在-480处存在 1个 YTCANTYY元件;在-264位置存在 1个 MYC
识别位点;同时在-135和-761处还存在 2 个 MYB识别位点 WAACCA;在-508位置有 1个 ACGT
元件;在-783位置有 TATCCA元件。此外,在启动子的反向互补链上也发现一些重要的功能元件,
如 2个 POLLEN1LELAT52元件、1个 I-box元件GATAA、1个WRKY710S元件 TGAC、4个 TATA box、
5个 GATA box、2个 GTGA元件、1个MYC识别位点,调节盐和病原物诱导下基因表达的抗性相
应元件。目前正通过瞬间或稳定表达转基因的方法确定该启动子的表达特性。

关键词:白菜;快速碱化因子(RALF);启动子;分离
中图分类号:S 634.3 文献标识码:A 文章编号:0513-353X(2011)S-2538-01