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A Comparative Study of RAPD and Morphological Approaches to CharacterizeRelationships of Rosaroxburghii Tratt.and Its Relatives

刺梨及部分近缘种形态学性状和RAPD标记分析



全 文 :园 艺 学 报 2003,30(2):2O4—2O6
Ac.ta Horticu]turae Simba
刺梨及部分近缘种形态学性状和 RAPD标记分析
文晓鹏 ,2 庞晓明 邓秀新
(1华中农业大学作物遗传改良国家重点实验室,武汉430070; 贵州大学农学院,贵阳550025)
摘 要 :通过 36个形态学性状和29个引物 RAPD扩增获得的分子标记 ,探索刺梨及部分近缘种的亲缘
关系。结果表明,普通刺梨所有基因型之间的亲缘关系较近,而与其余种类相对较远;无籽刺梨与贵州缫
丝花的遗传距离较近,形态学和 RAPD聚类分析都显示很近的亲缘关系;尽管两类遗传距离的排序和聚类
分析有一定差异,但 Mantel相关性检测表现出显著相关性 (r=0.6122,P<0.01)。还就无籽刺梨的可能来
源进行了讨论 。
关键词:刺梨:近缘种 ;形态学 ;RAPD;Mantel检测
中图分类号 :S 66 文献标识码:A 文章编号:0513.353X (2003)02-0204-03
1 目的、材料与方法
根据前人对刺梨 (Rosa roxburghi Trat.)某些基因型及近缘种的部分形态学性状的描述ll 】,作
者以刺梨现存基因型及部分近缘种为试材,对其形态学和RAPD标记进行比较分析,以期为种质资源
的准确鉴定及起源进化研究提供新证据和新方法。材料共 12份,包含 5个栽培品种、2个变种及 5个
近缘种。参照前人的标准【 引,对 36个形态学性状进行记载、评分。以筛选出的29个多态性较好的
随机引物,采用 25 反应体系进行扩增。反应液含 1×反应缓冲液,2 mnM·L— Mg ,0.2 mnM·
L—dNTP,0.4 tlmol·L 引物,1.2 U raq DNA多聚酶,及1.6 nag·L 模板 DNA。扩增程序:第一循环
为 94℃变性 2 min,37oC退火 1 min,72oC延伸 2 nfin;接着 40个循环为 94℃变性 1 min,37℃退火 2
min,72~C延伸2 min;最后72~C延伸 10 min。扩增产物在含有 EB的1.6%琼脂糖凝胶上电泳,在紫
外凝胶成像仪上观察照像。为了保证谱带的稳定性,每个引物重复扩增2次,将重复出现的带标记为
1,无带时记为 0,统计供试材料的多态性数据。将标准化的形态学数据和 RAPD多态性数据 ,在
NTSYS 2.10 e软件上计算遗传距离和聚类分析,并对形态学分析和 RAPD分析进行 Mantel相关性检
测【4J。
2 结果与分析
2.1 形态学分析
从形态学上看,贵农 2号和贵农 7号相似性最大,遗传距离仅为2.26;在涉及无籽刺梨的组合
中,无籽刺梨和贵州缫丝花的遗传距离最近 (4.64),和金樱子、华蔷薇及萨蔓莎月季分别为 7.74、
7.96及7.44,而和普通刺梨所有类型的遗传距离均在 9以上。这在很大程度上表明,无籽刺梨和普
通刺梨的亲缘关系相差很远,而和贵州缫丝花最接近。
聚类分析 (图 1,左)显示,如果以8为阈值,所有材料可聚为两类,其中一类为普通刺梨类;
另一类包括元籽刺梨、贵州缫丝花、金樱子、华蔷薇和萨蔓莎月季,无籽刺梨就明显地和普通刺梨分
收稿 日期:2OO2—04—24;修回日期:2OO2—07—08
基金项目:国家自然科学基金重点项 目 (39830260);贵州省 自然科学基金资助项 目 (20013031)
贵州大学农学院樊卫国教授、贵州省植物园石圣德研究员提供了部分材料,特此致谢。
*通讯作者。
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2期 文晓鹏等:刺梨及部分近缘种形态学性状和 RAPD标记分析 205
开。以7.3为阈值,重瓣刺梨和普通刺梨的其余基因型分开;无籽刺梨、贵州缫丝花及金樱子归为一
组。以4.5为阈值,普通刺梨可归为 3类:贵农 1号、贵农 2号和贵农 7号为一类;贵农 5号、白花
刺梨及贵农 6号为另一类 ;重瓣刺梨为单独一类。
2.110 3.76 5.52 7.28 9.04
距离 Distance
圈I 刺梨及部分近缘种形态学 (左)及 RAPD (右)聚类图
1.贵农 l号,2.贵农 2号,3.贵农 5号,4.贵农 6号,5.贵农 7号 ,6.白花刺梨,7.重瓣刺梨,8.无籽刺梨,
9.贵州缫丝花,lO.金樱子,l1.华蔷薇 ,l2.萨蔓莎月季。
t3g.1 TheUIK~MA d.蛐dlq based O1m叫pI加l0 ∞I Ileft)andRAPD lright)distancesmnongthe aeceek~
0f R. roxbu,~,b//Trait.andits relatives
1.Qlir鹕 l,2.GIli 鹕 2,3.Qli 鹕 5,4.Ql 鹕 6,5.Qli 鹕 7,6.R. 幽昭舡 Tmtt. 诚 如 ,7.R. 幽口磬 Tmt. 昭M ,
8. R.st ,9.R.face- is,10. R. e£ , l1. R.m u Thumb.vat".伽 ,12. R.duhens/~Jacq.cv.Samantha.
2.2 RAPD分析
从筛选出的 29条随机引物中,共扩增出 244
条 RAPD谱带,其 中多态性 带 占68.85% (168
条),平均每条引物可产生5.8条多态性带。图 2
为引物 OPAF-16的扩增图谱,多态性带丰富。因
此,RAPD技术可用于刺梨及近缘种的种质鉴定。
聚类分析 (图 1,右)显示 ,以0.50为阈值 ,
所有材料可归为 5类:普通刺梨为一类,无籽刺
梨和贵州缫丝花为一类 ,华蔷薇 、萨蔓莎月季和
金樱子各为一类。在普通刺梨类中,贵农 6号和
其余基因型的亲缘关系最远;贵农 1号和贵农 2
号,贵农 5号和重瓣刺梨,及贵农 7号和白花刺
梨相对较近。
2.3 形态学性状和 I PD标记的比较分析
l2 ll 10 9 8 7 6 5 4 3 2 l M
圈 2 刺梨及部分近缘种的 RAPD扩增电泳圈 (OPAF-16)
图中代号 1~12为刺梨品种,其名称同图 1。
. 2 1hepre~leofRAPD锄 Imedwah 0】 F-16璐吨
晋l舶叫nic DNAs of R.邝喇_舶,咖茸Trat.and its rdafives
M.Msiker.Th e code narn~ inthisfigure aIethe 881ne asin 6g.1
前面分析显示,以形态学指标和 RAPD标记的遗传距离评判亲缘关系的远近会出现一定的差异。
但对二者的欧几里德距离矩阵进行 Mantel相关性检测结果表明达到 I%的显著水平 (r=0.6122)【引,
说明两种分析方法得出的结果具有很大程度的同一性。
本试验采用的材料包含了刺梨现存的类型和主要栽培株系,也包含与刺梨同属蔷薇属小叶组的另
一 近缘种——贵州缫丝花,金樱子组的唯一近缘种——金樱子 ,合柱组的华蔷薇,及月季组的萨蔓莎
月季等类型,可以作为刺梨及近缘种亲缘关系研究的典型。对此进行的分析及方法,对刺梨及近缘种
的系统演化和种质鉴定等领域的研究工作具有重要意义。两类标记系统的聚类分析中,无籽刺梨和贵
州缫丝花的亲缘关系都表现出高度相似性。但在普通刺梨中,两类聚类分析的结果表现出一定的相异
性:在形态学分析上,重瓣刺梨和其余基因型表现出较远的亲缘关系;而RAPD分析显示贵农6号和
其它基因型的遗传距离最远。从花器上看,重瓣刺梨及白花刺梨与普通刺梨的其它基因型差异较大,
1 2 5 3 6 4 7 8 9 0 2 1
卵卵咿卵卵 撕
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园 艺 学 报 3O卷
但 RAPD聚类分析的结果表明,二者和贵农 6号以外的基因型的亲缘关系都较近,其合理的解释是控
制刺梨花瓣数和花色的基因位点较少。两类聚类分析的不一致性还表现在普通刺梨和华蔷薇及普通刺
梨和萨曼莎月季的亲缘关系上。实际上 ,分子分析和形态学分析不一定都表现出一致的结果 .6j。况
且,形态学上的差异并不一定是 DNA水平变异的真实反映【7]。因此,单纯采用形态学性状进行刺梨
及近缘种的种质鉴定和亲缘关系分析具有一定的局限性。形态学和 RAPD标记距离矩阵的 Mantel相关
分析表明二者相关性显著,大大高于其它植物上的类似报道 ,6]。这不但意味着 RAPD技术用于刺梨
及其近缘种种质资源研究和鉴定的可行性 ,也反映了本文中所选用的形态学性状在资源评价中的合理
性。
无籽刺梨因其果实外表有刺,而将其归为 “刺梨”。季祥彪等通过部分形态学指标研究,揭示它
和普通刺梨的明显差别及和贵州缫丝花的相似性 j。本文通过形态学和 RAPD分析,均反映出它和贵
州缫丝花很近的亲缘关系。这说明,将无籽刺梨归为 “刺梨”未必妥当。有人认为它可能是一自然杂
种【3]。但一般情况下,杂种不孕是由于减数分裂过程中染色体行为异常所致。通过对无籽刺梨花器官
的观察,发现雄蕊高度败育,基本无花粉母细胞,花药干瘪,无花粉,偶尔出现 1 2粒瘦果种子 ,
疑为其它近缘种花粉授粉所致。同时,杂种的分子标记中,多态性带的比例应该较高,但是在所有的
供试材料中,无籽刺梨 RAPD标记的多态性比例反而最低。鉴于形态学和 RAPD分析的结果 ,无籽刺
梨很可能来源于贵州缫丝花的高度雄性不育变异。
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A Comparative Study of RAPD and Morphological Approaches to Characterize
Relationships of Rosa roxburghii Tratt.and Its Relatives
Wen Xiaopen~1
, Pang)(j猢 lin ,and Deng XJuyAnl
( National Key.1aboratory ofCrop Genetic Improvement, n 船 如l, University,Wuhan 430070,Ch/na; dg c lmf 一
, Cr~ho/.t unacrs~y,Gu/yang 550025,Ch/na)
Abstract: m 啊 si】【morphological traits and R 】D markers amplified with 29 arbitrary p血 船 were used to
discriminate the acoesSi0I1s,and to evaluate the relatedness of Rosa roxburghii Tmtt
. and a sa~aple set of its rela—
fives.Compared with the relatives,considerable close relationships were found among the genotypes of R
. rox.
burghii Tmtt.Furthermore,a hish relatedness was also obtained between R
. ster///s S.D. Shi an d R. kwei—
dum~ns/s Yu et Ku.A Mantel corespondence test showed a signifcant correlation(r=0.6122,P<0.01)be—
t’veen morphological traits and markers,despite certain discontance existing in the two approaches
. In addi—
tion,the origination of R.ster//s S.D. was discussed in the paper

Key words:Rosa roxburghii Tratt.;Relatives;Morphology;RAPD;Mantel correspondence test
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