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Hereditary stability among species of Dendrobium huoshanense by RAPD

霍山石斛种内遗传稳定性的RAPD初探



全 文 :中草药ChineseTraditionalandHerbalDrugs第36卷第3期2005年3月·427·
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霍山石斛种内遗传稳定性的RAPD初探
刘石泉,余庆波,李小军,周根余+
(i-海师范大学生命与环境科学学院生物系遗传学实验室,上海200234)
摘要:目的研究霍山石斛荚果内遗传稳定性及荚果间的差异大小。方法利用从20个随机引物筛选出来的3
个稳定性较好的10碱基引物对来自5个不同荚果的霍山石斛种群进行RAPD检测。结果5个荚果内遗传相似
系数较大,在92.5926%~100.00%,其中H1、H9、H10、H14存在一定程度的变异,H23是一个较为稳定的群体;5
个荚果问H1、H9、H10、H23的遗传距离较小,H14与其他4个荚果的遗传距离则较大。结论建立霍山石斛稳定
的元性快繁体系是切实可行的,同时说明霍山石斛种内存在一定的变异,H14与其他荚果的差异最大。
关键词:随机扩增多态性DNA;霍山石斛;荚果;遗传稳定性
中图分类号:R282.710.3文献标识码:A 文章编号:0253—2670(2005)03—0427—05
Hereditaryst bilityamongspeciesofDendrobiumhuoshanensebyRAPD
LIUShi—quan,YUQing—bo,LIXiao—jun,ZHOUGen—yu
(LaboratoryofGenetics,DepartmentofBiology,CollegeofLifeandEnvironmentSci ce,
ShanghaiNormalUniversity,Shanghai200234,China)
Abstract:ObjectiveTostudythhereditaryst bilityinthepodandthediversityw hinthepodsof
Dendrobiumhuoshanense.MethodsThreeoptimaldecameroligonucleotideprimerswithbetterstability
selectedfrom20randomprimerswereusedtodetectthepopulationsoffivedifferentpodsofD.huosha—
nensebyrandomamplifiedpolymorphicDNA(RAPD).ResultsThecoefficientofgenetics milaritywere
higherwithinfivepodsattherangeof92.5926%一100.oO%,thevariationpresentedintheHI,H9,
H10,andH14,butH23wasastablegroup.Therewasasmallerg neticd stancewithinthepodsH1,H9,
收稿日期:2004—05—22
基金项目:上海市高等学校科学技术发展基金资助项目(03DZ02)
作者简介:刘石泉(1969一),男,湖南益阳人,讲师,在读研究生,研究方向为药用组织培养及分子检测。E—mail:lsq205@sina.com
*通讯作者Tel:(021)64323698E—mail:zhougenyu@sina.com
万方数据
·428· 中草药ChineseTraditionalandHerbalDrugs第36卷第3期2005年3月
H10,andH23,butabiggeronebetweentheabovefourandH14.ConclusionThestablishmentofrapid
cloningsystemofD.huoshanenseisfea ible,andtheresultsindicatethathevariationsexistamongthe
abovepodsofD.huoshanenseandthemostdiversityappearsbetweenH14andtheotherfour.
Keywords:randommplifiedpolymorphicDNA(RAPD);DendrobiumhuoshanenseC.Z.TangetS.
J.Cheng;pod;hereditarystability
霍山石斛DendrobiumhuoshanenseC.Z.Tang
etS.J.Cheng又名米斛,兰科石斛属植物,原产安
徽霍山,是药用石斛中的极品。由于石斛是一种附生
植物,对生态环境要求比较严格,自然繁殖频率极低
(<5%),加上长期采集,野生植株已濒临灭绝。我国
现有的76种石斛属植物中,具药用价值的就有40
多种。其药理作用主要是强阴益精、补肾益力、明目
和延年益寿。近年来,包声雪[11等对霍山石斛资源进
行了大量研究。但对石斛离体条件下的遗传稳定性
和生理稳定性缺乏基础性研究,未能获得规范化石
斛繁殖技术体系和工艺流程,从而极大地阻碍了这
一名贵中药走向市场。霍山石斛因其质量上乘而驰
名中外,多年来市场上霍山石斛有名无实、有价无
市,资源接近枯竭。现在国内外市场上,凡冠以“霍山
石斛”、“霍斗”或“野生金霍斛”等名称的一些枫斗产
品,均不是用真正的霍山石斛加工而成的[1],国内学
者对石斛药材的分类和鉴定作了大量研究[2~5],但
真正应用于市场还有待进一步开发。笔者实地考察
了霍山县长冲乡种植的霍山石斛,从组织形态解剖
学上看,发现已有混杂。因此有必要对霍山石斛荚果
采用单荚果接种的方法进行提纯,严格培养过程,确
保是正宗的霍山石斛原种,以期获得霍山石斛遗传
性稳定的群体。本研究利用来自5个不同荚果的霍
山石斛进行RAPD研究,发现荚果内存在着较小的
遗传差异,来源不同荚果其RAPD条带差异性较
大,从而首次从分子水平上证明霍山石斛的产地差
异较为明显,很有可能已经混杂,有必要对其进行种
的真伪鉴定和遗传稳定性分析,以确保获得正宗霍
山石斛种群,发挥其应有的临床疗效。
1材料与来源
从霍山县长冲乡种植的霍山石斛中分别随机抽
取5个单株上各一个成熟荚果,在实验室中分别单
独继代,其采样时间和编号见表1。分别从继代8~
10次、生长一致的5个荚果群中随机抽取10株进
行实验。10碱基随机引物由生工公司合成,3个筛选
出来的稳定性较好的引物为P1341:GTCCAC—
CTCT;P1349:CCGATCCAAC;P1351:ACGCGC—
CTTC;Taq酶购自生工公司。PCR仪为美国MJ公
司PTC一100TM。
表1 5个霍山石斛荚果的采集情况
Table1 CollectionoffivepodsofD.huoshanense
2方法
2.1 DNA的提取:单株分别提取DNA[4],将沉淀
于37℃干燥30min,加入30弘LTE溶解,一20。C
保存备用。用分光光度计测得其DNA质量浓度为
50ng/肛L。
2.2 PCR条件的优化:以张铭‘43RAPD反应体系
条件为基准,分别对缓冲液(2、3、4弘I。)、M92+(2.5
mmol/L,2、3、4扯L)、dNTPs(100弘mol/L,0.6、
1.0、1.2、2.0、3.0/xL)、引物(0.6tLmol/L,1.2、
2.0、2.4、3.0、4.0肚L)、模板DNA(0.5、1.0、1.5、
2.0址L)、Taq酶(0.5U//_£L,0.1、0.2、0.3pL)、复
性温度(34、36、38、42‘C)进行梯度筛选实验,最后
确定30肛L反应体系中含ddH。019.3弘L;缓冲液
3tLL;M92+(2.5mmol/L)3肛L;dNTPs(100
/lmol/L)1.2肚L;引物(0.6/amol/L)2.4弘L;模板
DNA1 tLL;Taq酶(0.5U/弘L)0.1肛L。程序:94℃
预变性3min,94℃变性50S、36℃复性1min、
72℃延伸2min,循环40次;最后72℃延伸5min。
用1.5%琼脂糖、3V/em电压、回流冷却电泳槽凝
胶电泳分离PCR产物,用天龙科技有限公司GIS一
2008凝胶成像仪成像。
3结果
3.1 5个荚果内遗传差异性分析:P1341、P1349、
P13513个引物在霍山石斛5个群体中的RAPD电
泳结果见图1。图1可见H110个单株带型在3个
引物中明显分为两种(H10、H11相同记为HIA,
H12~H19相同记为H1B);H910个单株带型在3
个引物中明显分为两种(H20~H23相同记为
H9A,H24~H29相同记为H9B);H1010个单株带
万方数据
中草药ChineseTraditionalandHerbalDrugs第36卷第3期2005年3月·429·
型在P1341中明显分为3种(H30、H37相同记为
H10A,H31、H32相同记为HIOB,H33、H34、H35、
H36、H38、H39相同记为H10C),在P1349中条带
一致,在P1351中则只有H31、H32与其他8株相
比,少一条带;H1410个单株带型在3个引物中只
有 43增加了一条条带,记为H14B,其余的均相
同,记为H14A;H2310个单株带型在3个引物中则
完全一致。
图1 P1341、P1349、P13513个引物在霍山石斛5个群体(10个体/群体)中的RAPD电泳结果
Fig.1RAPDeleetrophoretogramsfromfivepodgroupsofD.huoshanensewiththreeprimers
ofP1341,P1349,andP1351(tenindividualspergroup)
统计5个群体中的RAPD电泳结果时舍弃小
于200bp和大于2500bp的条带,只采用200~
2500bp的重复性较好的条带,以100bpMarkers
(Biolab公司)作为相对分子质量标记的标准,Cross
Checker(J.B.Buntijer,1999)软件将每个样品的
扩增带型中按有或无来记录,有此条带赋值1,无此
条带赋值为0,计算遗传相似系数(GS)和遗传距离
(GD)。GS一2NAB/(ⅣA+NB)(ⅣAB是样品A和样品
B共有的条带数,ⅣA和Ⅳ。分别是样品A和样品B
具有的条带数),GD一1一GS。从表2看,荚果内的
GS是很高的,最低的也有92.5926%,最高为
100%,这主要是由于兰科植物属于严格自花授粉且
分别来自独立荚果,应该都象H23一样,条带完全
一致。至于荚果内出现的2种或3种RAPD带型,
笔者认为主要是在组培过程中出现的变异,因为在
组织培养过程中,其变异是普遍存在的,如薛建平[71
等、陆伟达[83等、李亮亮[91等分别在药菊、麻疯树、掌
叶半夏组织培养过程中等均有大量的报道。
3.2 5个荚果出现的10种RAPD带型的遗传差异
性分析:3个引物在5个荚果内出现的10种RAPD
带型见图2。5个荚果间的RAPD带型较为不一致,
其GD分析见表3。5个荚果内的不同RAPD带型
之间的GD明显要小得多,而荚果间的GD有较大
的,也有较小的,最大为0.1429,最小为0.0175,说
万方数据
·430· 中草药ChineseTraditionalandHerbalDrugs第36卷第3期2005年3月
明这5个荚果本身存在着较大的遗传差异,其中
H1、H9、H10、H23的GD较小,H14与其他4个荚
果的则较大,很有可能不是同一种,在产地就已经混
杂。这一结果与笔者在实验室得到的霍山石斛开花
株经专家鉴定的结果及野外实地考察结果基本上是
吻合的;H14是霍山石斛的一个亚种。当然这也并
不能排除H14是由正宗的霍山石斛变异而来,因为
只是进行了3个引物的RAPD分析,其GD结果并
不一定完全能说明问题,而且究竟要多大的GD才
能算得上是新种也并没有完全定论,实验说明即使
在霍山石斛单荚果内,同样条件下组织培养出来的
苗之间也存在一定的GD,只不过是相当小而已,荚
果问的GD要大一些,很显然说明在采集荚果之前
就存在一定差异。当然不排除实验误差,但单荚果培
养条件一致,组织培养导致的变异基本上几率是相
等的,RAPD实验条件也经过严格重复筛选,即使
存在误差的话,误差大小应该说是基本一致的。所以
说H14与其他荚果GD大,至少说明其变异较明
显,至于是否为非霍山石斛种,还有待于深入研究。
表2 3条引物从5个荚果群体(10个体/群体)中
扩增的条带数据
Table2 Dataofamplifiedbandswiththreeprimers
fromfivepodgroupsofD.huoshanense
(tenindividualspergroup)
P1349中:H9B与HgA同;H10B、H10C与H10A同;H14B与H14A同,在该引物中H9B、H10B、H10C、H14B略去;P1351中:H10C与
H10A同;H14B与H14A同,在该引物中H10C、H14B略去
H9B,H10B,H10C,H14BwereomittedinP1349becauseH9BandH9A,HlOB,H10CandH10A,H14BandH14Awereidentical;H10C
andH14BwereomittedinP1351becauseH10CandH10A,H14BandH14Awereidentical
图2 P1341、P1349、P13513个引物在5个荚果群体内出现的10种RAPD带型
Fig.2TenRAPDband—typesfromfivepodgroupsofD.huoshanensewiththreeprimersofP1341,P1349,andP1351
表3 5个荚果群体内出现的10种RAPD带型的遗传距离分析
Table3 Geneticd stanceoft nRAPDband—typesfromfivepodgroupsofD.huoshanense
4讨论
虽然对每一个引物而言,其检测的基因DNA
多态性是有限的,但可用的引物数很多,可检测区域
几乎覆盖整个基因组,所以从理论上讲,RAPD可
以对整个基因组DNA进行多态性检测。RAPD技
术目前已经十分成熟,运用相当广泛,几乎渗透于整
个基因组研究的各个方面,如进行遗传多样性与种
质资源的研究、物种进化与亲缘关系研究、中药真
伪、近缘药材及代用品鉴别研究、药材的野生类型与
栽培品种的研究、道地药材研究等口0|。
本研究首次运用RAPD技术,探讨了霍山石斛
组织培养过程中不同荚果内的遗传稳定性,说明荚果
万方数据
中草药ChineseTraditionalandHerbalDrugs第36卷第3期2005年3月·431·
内存在一定程度的变异,所研究的5个荚果中,H1分
为2个RAPD带型,H9为2个,H10为3个,H14只
有一株在一个引物中有一条不同的条带,H23则所有
带型均相同,5个荚果群体内GS均很高,最小也为
92.5926%,说明同一荚果群体在组织培养过程中其
变异程度相当小,运用组培方法建立霍山石斛稳定的
无性快繁体系是切实可行的,不但能挽救濒临灭绝的
霍山石斛,而且能满足市场的大量需求;同时,H1、
H9、H10、H23群体间的GD较小,H14与其他4个
荚果的则较大,说明H14是距其他4个荚果亲缘关
系较远的一个群体,很有可能不是同一种,在产地就
已经混杂,当然这一结果还有待于进一步的研究。但
至少首次从分子水平证明在霍山产地,霍山石斛种群
内存在较大的差异,因此确定霍山石斛种源真伪、保
持遗传稳定性,是建立适合市场需求的稳定的霍山石
斛快繁体系首要的前提条件。
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不同种质资源及贮藏条件对缬草种子发芽率的影响
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摘要:目的探讨不同种质资源、贮藏条件及萌发温度对缬草种子发芽率的影响。方法采用不同条件贮藏的缬
草种子进行常规种子发芽试验,计算不同萌发条件下的种子发芽率。结果 不同来源的缬草种子发芽率有较大差
异,缬草的种子发芽率要高于其变种宽叶缬草的发芽率,栽培缬草的种子发芽率要远高于野生缬草种子的发芽率。
贮存时间、贮存温度、萌发温度等因素对缬草种子发芽率均会产生影响。结论 为保持缬草种子的发芽率,贮藏过
程中要保持适当的低温和透气性,要长期保存缬草种子,则必须要以较低的温度保存;种子繁育要在适宜的时间和
温度等条件下进行。
关键词:缬草;种质资源;贮藏条件;发芽率
中图分类号:R282.21 文献标识码:A 文章编号:0253—2670(2005)03—0431—04
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基金项目:国家自然科学基金资助项目(30270152)
作者简介:黄宝康(1969一),男,浙江东阳人,第二军医大学药学院副教授,在读博士研究生,主要从事中药资源与品质评价及中药新药
的研究与开发工作。 E—mail:hbk999@sohu.com
*通讯作者:Tel(021)25074577ECmail:hczheng@sohu.tom
万方数据
霍山石斛种内遗传稳定性的RAPD初探
作者: 刘石泉, 余庆波, 李小军, 周根余, LIU Shi-quan, YU Qing-bo, LI Xiao-jun,
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6.莫可元 RAPD技术在中药鉴定及相关领域应用的研究进展[期刊论文]-中国药师 2007(9)
7.刘春生 ITS序列和β-香树酯醇合成酶基因与甘草酸形成和积累的相关性研究[学位论文]博士 2006

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