免费文献传递   相关文献

云南松松塔中两种新木脂素圆二色谱的密度泛函研究



全 文 :第30卷 第6期 原 子 与 分 子 物 理 学 报 Vol.30 No.6
2013年12月 JOURNAL OF ATOMIC AND MOLECULAR PHYSICS  Dec.2013
收稿日期:2013-01-29
基金项目:国家自然科学基金(81260632)
作者简介:杨颖(1974-),硕士研究生,从事药物化学和物理化学研究.
通讯作者:莽朝永.E-mail:cymang@gmail.com
doi:103969/j.issn.1000-0364.2013.06.003
云南松松塔中两种新木脂素圆二色谱的
密度泛函研究
杨 颖1,刘光明1,李冬梅1,李寅珊1,雷 婷1,
罗建蓉1,赖 泳1,莽朝永1,2
(1.大理学院药学与化学学院,大理671000;
2.大理学院药物研究所,大理671000)
摘 要:采用梯度校正的密度泛函理论方法,计算了云南松松塔中分离的2种新木脂素的绝对结构为7S,
8R的手性结构、电子吸收光谱、电子圆二色谱、红外振动光谱和振动圆二色谱,计算值与实验值相符.分子
轨道和振动模式分析表明,两种新木质素具有相似的手性光谱.电荷密度转移对电子圆二色谱具有主要贡
献;而振动圆二色谱主要源于分子骨架运动.
关键词:云南松;木质素;密度泛函理论;电子圆二色谱;振动圆二色谱
中图分类号:O641   文献标识码:A   文章编号:1000-0364(2013)06-0873-06
Density functional study on the circular dichroism of two neolignans
from the pinecones of Pinus yunnanensis Franch
YANG Ying1,LIU Guang-Ming1,LI Dong-Mei 1,LI Yan-Shan1,LEI Ting1,
LUO Jian-Rong1,LAI Yong1,MANG Chao-Yong1,2
(1.Colege of Pharmacy and Chemistry of Dali University,Dali 671000,China;
2.Institute of Pharmaceutical Science of Dali University,Dali 671000,China)
Abstract:Density functional theory method was employed to calculate the chiral stereo-chemical struc-
tures,electronic absorption spectra,electronic circular dichroism (ECD),infrared vibrational spectra
and vibrational circular dichroism(VCD)of two neolignans with 7S,8Rabsolute configurations from the
pinecones of Pinus yunnanensis Franch.The calculated results have a good agreement with the experi-
ments.The analyses of molecular orbitals and vibrational modes reveal that the two neolignans display
the similar chiral spectra.We behold that the electronic transitions with charge transference make the
important contributions to the ECD spectra while the VCD spectra have the important origins in the mo-
lecular skeleton stretches.
Key words:Pinus yunnanensis Franch,lignan,density functional theory method,electronic circular di-
chroism,vibrational circular dichroism
  原 子 与 分 子 物 理 学 报   第30卷
1 引 言
松树具有许多宝贵的药用化学成分,最著名成
分如松香和松花粉.前者是传统的中草药和化工
原料;后者是新兴的保健品.近年来,科学家们发
现长期被忽视的松塔(pinecone)也具有药用前景,
不仅有抗肿瘤活性,还有很强的抑制 HIV复制作
用[1].松塔具有丰富的化学成分,主要成分是木质
素,此外还含有烯烃类、黄酮类和萜类化合物[2-4].
木脂素具有广泛的生物活性,如抗肿瘤、保肝、
抗氧化、抗 HIV作用、和杀虫杀菌等.木脂素是一
类由两分子苯丙素衍生物聚合而成的天然化合物,
分子中常具有多个手性碳原子,从而表现出光学活
性.由于同一分子的不同的手性异构体常表现出
不同的生物活性,可研制成不同的药物,因此手性
在目前的手性药物研制过程中,显得非常重要.例
如利他林(Ritalin)的RR异构体是注意力缺乏症
药物,而SS型异构体是抗忧郁药物.有时,单一异
构体药物能够产生更加有效的药物作用,而且避免
了对映异构体带来的副作用.
雷婷从云南松松塔中分离到5种木脂素(lig-
nan)和新木质素(neolignan)[5],为了揭示分子结
构与分子手性关系,我们从中选择了二种新木质素
L1和L2(图1),采用密度泛函理论(DFT)方法[6]
和含时密度泛函理论(TDDFT)方法[7],进行分子
结构、电子结构、电子圆二色谱(Electronic Circu-
lar Dichroism,ECD)、红外振动光谱、和振动圆二
色谱(Vibrational Circular Dichroism,VCD)的理
论研究.其实,新木质素L1是最先从檀香木中分
离到的[8];新木质素 L2,也曾在珊瑚树中分离
到[9].
我们曾经多次采用 DFT方法和 TDDFT方
法,计算研究不同结构类型的手性化合物如水簇合
物和环蕃等的ECD谱[10-12],初步揭示了ECD谱
与分子结构、电子结构之间的关系.在本研究中,
我们仍然采用DFT和TDDFT方法进行计算,来
探索两种新木质素的手性光谱和分子结构关系.
这样的研究,有助于我们懂得手性木质素分子结构
对手性光谱的影响和揭示手性光谱的微观起源,并
有助于木质素手性药物的分子设计.
2 计算方法
在 DFT 和 TDDFT 计 算 中,采 用 杂 化 的
B3LYP函数[13,14]和6-31+G*基组[15,16].计算工
作采用Gaussian 09程序[17]完成.在ECD谱的理
论计算中,采用Rj表示电子从基态跃迁到激发态
的电子旋转强度,Rj=Im[dj·m*j ],数值上等于
电偶极矩矢量dj= 〈Ψ0 d Ψj〉和磁偶极矩矢量
mj= 〈Ψ0 m Ψj〉点积的虚部.在 VCD谱计算
中,振动旋转强度也依赖于分子振动的电偶极矩和
磁偶极矩.
采用自编小程序,根据计算的电子跃迁吸收波
长、跃迁偶极强度和电子旋转强度,拟合具有洛伦
兹线形特征的 UV和ECD 谱.类似地,根据计算
的振动吸收波长、红外吸收强度和振动旋转强度,
拟合了IR谱和VCD谱.选择的光谱数据列于表1
和表2中,拟合的光谱表示在图2、3和6中,重要
的分子轨道表示在图4和图5中.
表1 在B3YLP/6-31+G*水平上计算的UV谱
Table 1 The calculated UV spectra at the B3YLP/6-31+G*level
E1 E2
λ/nm  f  Trans  MO λ/nm  f  Trans  MO
L1  266  0.024  s0→s1 H→L  209  0.084  s0→s28 H-3→L
L2  276  0.013  s0→s1 H→L  209  0.066  s0→s26 H-2→L+2
表2 在B3YLP/6-31+G*水平上计算的ECD谱
Table 2 The calculated ECD spectra at the B3YLP/6-31+G*level
E1 E2
λ/nm  R/10-40cgs  Trans  MO λ/nm  R/10-40cgs  Trans  MO
L1  266 +0.036  s0→s1 H→L  229 -0.075  s0→s13 H-2→L
L2  276 -0.056  s0→s1 H→L  219 -0.062  s0→s18 H-2→L+3
478
第6期    杨颖,等:云南松松塔中两种新木脂素圆二色谱的密度泛函研究  
图1 新木质素L1(a)和L2(b)的7S,8R绝对构型
Fig.1 Molecular structures of 7S,8Rabsolute configurations of neolignans L1(a)and L2(b)
图2 计算的和根据实验拟合的UV谱
Fig.2 Calculated(8nm half-width)and experimental UV spectra of neolignans L1(a,b),and L2(c,d),
where the experimental data were taken from Refs[8,9]
3 结果与讨论
3.1 电子吸收光谱
这两种新木质素具有相同的分子骨架,有两个
苯环(A和B)和一个含氧五元环(C).区别在于木
质素L1的A环上有一个OH而L2的 A环上是
OCH3.在L1分子中,A苯环与五元环C是完全
共面的,在新木质素L2中,这两个环之间也几乎
是共面的(二面角约为1.5°).至于B环与另外两
个环形成的平面之间的关系,在L1中,C6C1C7O
角为18°.在L2中,由于甲基排斥作用,C6C1C7O
角增大到51°.
拟合的 UV 谱见图2,选择的数据列在表1
中.在图2(a)中,相应的计算值分别是266、252和
209nm.根据图2(b),实验的L1的UV谱有3个
吸收峰[8],分别位于282、257和212nm.计算值比
实验值小一些,但基本上能够表现出实验的谱带特
征.此外,计算的最低能峰与实验值相比,相对强度
要弱得多.实验的吸收峰相对强一些,这可能主要
来源于电子光谱的分子振动加强和溶剂效应,其中
B环绕着C1-C7键的转动振动对最低吸收峰的
增强可能有重要影响.根据表1,在266nm处的
吸收峰由s0→s1电子跃迁产生,电子从 HOMO跃
迁到LUMO上.从图4可知,HOMO的电子密度
主要集中在苯环A上,而LUMO的电子密度主要
578
  原 子 与 分 子 物 理 学 报   第30卷
图3 计算的和根据实验拟合的ECD谱
Fig.3 Calculated(15nm half-width)and experimental ECD spectra of neolignans L1(a,b),and L2(c),
where the experimental data were taken from Ref[8]and converted intoΔεby the formula[θ]=
3298Δε
图4 新木质素L1的前沿分子轨道
Fig.4 Molecular orbitals of neolignan L1,where the
lower energy Cotton effect comes from HOMO
to LUMO,and the higher energy Cotton effect
has its orgin from HOMO-2to LUMO
图5 新木质素L2的前沿分子轨道
Fig.5 Molecular orbitals of neolignan L2,where the
lower energy Cotton effect comes from HOMO
to LUMO,and the higher energy Cotton effect
has its orgin from HOMO-2to LUMO+3
集中在苯环B上,因此发生了从 A环到B环的跃
迁转移,产生荷移吸收峰.位于209nm处高能吸
收峰,起源于s0→s28的电子跃迁,由 HOMO-3到
LUMO的电子跃迁所致.从图4中可知,发生了B
环到A环的电子跃迁转移,也是一个荷移吸收峰.
根据图2(d),实验上观察到两个吸收峰[9],分
别位于278和225nm处.计算的最低能吸收发生
在275nm处,由s0→s1电子跃迁产生,电子从HO-
MO跃迁到LUMO.从图5可知,HOMO电子主
要布居在A和C环,而LUMO电子主要布居在B
678
第6期    杨颖,等:云南松松塔中两种新木脂素圆二色谱的密度泛函研究  
图6 计算的IR谱
Fig.6 The calcualted IR spectra(a)and the VCD spectra(b)with the frequerncy correction of 0.962scalor factor
环,因此,跃迁导致了从A和C环到B环的电子转
移,是荷移吸收峰.实验的这个峰,相对强度大一
些,可能主要由于振动和溶剂效应贡献.实验上在
225nm处的吸收峰,理论计算值209nm.这个峰
来源于s0→s26电子跃迁的贡献,涉及到HOMO-2
到LUMO+2的电子跃迁.从图5可知,电子发生
了从A和C环到B环的转移,也是一个荷移吸收
峰.
3.2 电子圆二色谱
计算的ECD谱数据见表2,拟合的光谱见图
3.根据图3(a),计算的新木质素L1在266nm处
有一个弱的正Cotton效应,在220nm附近有一个
强的负Cotton效应.实验上[8],图3(b)表明新木
质素L1有两个ECD峰,分别位于295和229nm.
较低能峰为弱的正Cotton效应,较高能峰为强的
负Cotton效应.计算的波长比实验值小一些.与
UV谱相似,实验的较低能峰也存在着振动加强.
较低能峰起源于s0→s1电子跃迁,电子从 HOMO
跃迁到LUMO上,电荷密度发生了从A环到B环
的跃迁转移.处于229nm的较高能峰,起源于s0
→s13的电子跃迁,由 HOMO-2到LUMO的电子
跃迁所致.图4表明,电荷密度发生了从A环到B
环的跃迁转移.
在图3(c)中,新木质素L2也有两个ECD峰,
分别位于276和219nm处,均为负Cotton效应.
较低能峰由s0→s1电子跃迁产生,电子从 HOMO
跃迁到LUMO,导致了电荷从A和C环到B环的
电子转移.较高能峰起源于s0→s8电子跃迁,电子
从 HOMO-2跃迁到LUMO+3.图5表明,在这
个跃迁中,电子密度发生了从A环到B环的转移.
3.3 红外振动光谱
计算的红外振动光谱频率经过0.962的因子
校正.在图6(a)中,两种新木质素的IR谱很相近,
主要由于分子骨架相同,而且苯环B上都有羟基
和甲氧基,唯一区别L1的苯环 A上是-OH,L2
的苯环A上是-OCH3.可分为5个吸收带(A、
B、C、D、E).其中 A带为高频区,L1的吸收处于
3587~3619cm-1之间,最强吸收为3586cm-1;L2
的处于3581~3614cm-1之间,最强为3611cm-1,
源于苯环B上的 OH 伸缩.L1的B带处于2875
~3104cm-1之间,最强2918cm-1,L2的B带在
2874~3087cm-1之间,最强基频为2920cm-1,源
于苯环B上的甲氧基的C-H伸缩.最强吸收带
为C带,L1的位于1307~1607cm-1之间,最强基
频为1492cm-1;L2位于1302~1596cm-1,最强
1478cm-1,源于A环和C环上的骨架伸缩.D带
是最强的吸收带,均位于710~1277cm-1之间,L1
的最强基频为1225cm-1,L2的最强基频为1267
cm-1,整个分子骨架伸缩.在位于500cm-1以下
的最低能带E中,L1的最小频率是11cm-1,L2
是13cm-1.L1的最强频率270cm-1,源于苯环A
上的丙醇取代基上的-CH3OH 基团摇动;L2的
最强 频 率 是 381cm-1,源 于 五 元 环 C 上 的
-CH3OH基团的摇动.
3.4 振动圆二色谱
在图6(b)中,我们发现两个新木质素的VCD
是相似的,都具有3个强峰(A、B、C),分别呈正、
负、正Cotton效应.L1的3个峰最强基频分别为
1272、1092、955cm-1;而L2的三个峰的最强基频
分别为1263、1091和946cm-1.其中,A峰源于苯
环A上的丙醇取代基的伸缩;B峰源于苯环B环
的伸缩,C峰源于B环与C环之间的摇动.
4 结 论
在本文中,采用密度泛函方法计算了两种云南
778
  原 子 与 分 子 物 理 学 报   第30卷
松松塔中分离到的新木质素的 UV、IR、ECD和
VCD谱.计算结果与实验相符.分子轨道和振动
模式分析揭示了这些光谱的微观起源.我们发现,
电子跃迁发生了电荷密度转移,从而产生ECD峰;
而振动跃迁产生的三个强Cotton效应,主要源于
分子骨架运动.
参考文献:
[1] Lai P K,Donovan J,Takayama H,et al.Modification
of human immunodeficiency viral replication by pine-
cone extracts[J].AIDS Res.Hum.Retroviruses,
1990,6(2):205.
[2] Li Y S,Li D M,Jiang L Y,et al.Study on chemical
constituents of pinus yunnanensis[J].Chin.J.
Exp.Tradit.Med.Formulae,2012,18(2):119(in
Chinese)[李寅珊,李冬梅,蒋凌云,等.云南松松塔
的化学成分[J].中国实验方剂学杂志,2012,18(2):
119]
[3] Zhou P,Lin F,Liu J,et al.Determination of carbohy-
drate content in lignin-carbohydrate complex from
pine cone of pinus yunnanensis Franch[J].Lishizhe
Me Mate Med Res.,2011,22(8):1820(in Chinese)
[周萍,林樊,刘洁,等.云南松松塔木质素-糖复合物
中的糖含量测定[J].时珍国医国药,2011,22(8):
1820]
[4] Li Y S,Liu G M,Li D M.Analysis of volatile com-
ponents from pinecone of pinus yunnanensis Franch
by GC-MS[J].Lishizhen Med.Mater.Med.Res.,
2012,23(4):853(in Chinese)[李寅珊,刘光明,李
冬梅.云南松松塔中挥发性成分的气相色谱-质谱
联用分析[J].时珍国医国药,2012,23(4):853]
[5] Lei T.Study on chemical constituents of pinus yun-
nanensis[M].Master’s Thesis in Dali University,
2008(in Chinese)[雷婷.云南松松塔化学成分研究
[M].大理学院硕士学位论文,2008]
[6] Parr R G,Yang W.Density-functional theory of at-
oms and molecules[M].Oxford,Oxford University
Press,1989.
[7] Bauernschmitt R,Hser M,Treutler O,et al.Calcu-
lation of excitation energies within time-dependent
density theory using auxiliary basis set expansions
[J].Chem.Phys.Lett.,1997,264(6):573.
[8] Kim T H,Ito H,Hayashi K,et al.Aromatic constit-
uents from the heartwood of Santalum Album L.[J].
Chem.Pharm.Bull.,2005,53(6):641.
[9] Fukuyama Y,Nakahara M,Minami H,et al.Two
new benzofuran-type lignans from the wood of Vibur-
num awabuki[J].Chem.Pharm.Bull.,1996,44
(7):1418.
[10] Mang C Y,Li Z G,Wu K C.Density functional
study on chirospectra of hydrogen-bonded systems
X-(H2O)3(X=F,Cl,Br,I)[J].Chin.Phys.B,
2010,19(4):043601.
[11] Mang C Y,Liu C P,Wu K C.Electronic circular di-
chroism of some double-helical alkynyl cyclophanes
with 1,1′-binaphthyl auxiliaries investigated using
time-dependent density functional calculations[J].
Mol.Phys.,2012,110(13):1453.
[12] Mang C Y,Liu C P,Wu K C.Density functional
study of stereo-chemistry and chiroptics of helical
alkynyl cyclophanes with binaphthyls[J].Spectro-
chimica Acta Part A,2012,98:444.
[13] Becke A D.Density-functional exchange-energy ap-
proximation with correct asymptotic behavior[J].
Phys.Rev.A,1988,38(6):3098.
[14] Lee B,Yang W,Parr R G.Development of the Col-
le-Salvetti correlation-energy formula into a func-
tional of the electron density[J].Phys.Rev.B,
1988(2),37:785.
[15] Petersson G A,Al-Laham M A.Open-shel systems
and the total energies of the first-row atoms[J].J.
Chem.Phys.,1991,94(9):6081.
[16] Petersson G A,Bennett A,Tensfeldt T G,et al.
The total energies of closed-shel atoms and hy-
drides of the first-row elements[J].J.Chem.
Phys.,1988,89(4):2193.
[17] Frisch M J,Trucks G W,Schlegel H B,et al.
Gaussian 09W [CP].Walingford CT:Gaussian,
Inc.,2009.
878