全 文 :四 川 大 学 学 报 (医 学 版 )
J Sichuan Univ(Med Sci Edi)
2016;47(1):14 -18
葎草花粉主要变应原Hum s1的表达、纯化与结构预测*
刘 昀,孙秀珍,徐 晶,吴媛媛
西安交通大学第二附属医院 呼吸科 (西安710004)
【摘要】 目的 克隆、表达、纯化葎草花粉主要变应原 Hum s1,预测、分析其蛋白结构及功能,为评估该重组
变应原的诊断及治疗效果奠定基础。方法 采用PCR扩增目的基因 Hum s1,并将 Hum s1通过KpnⅠ/XhoⅠ
位点克隆到pET32a表达载体,转化到克隆菌株E.coli DH5α,用PCR验证重组载体,并将表达载体转化至表达菌
株E.coli BL-21,IPTG诱导表达目标基因,利用快速蛋白液相色谱技术纯化融合蛋白,并对表达蛋白的结构与功
能进行预测分析。结果 成功构建原核表达质粒pET32a-G2,并表达纯化葎草花粉主要变应原 Hum s1,纯度达
90%以上。分析其结构含有3个潜在的抗原表位,2个EF-手型结构域,成功构建其三维模型。ELESA试验证明
重组蛋白能与葎草花粉过敏患者血清结合,具有免疫学活性。结论 成功构建了葎草花粉变应原 Hum s1的原核
表达载体,表达并纯化了重组蛋白,并通过生物信息学方法获得了目的蛋白的抗原表位和三维结构模型,为进一步
开展重组疫苗研究奠定了基础。
【关键词】 葎草花粉 重组变应原 基因克隆
Expression,Purification and Structure Prediction of Hum s1,a Major Alergen of Humulus Scandens LIU Yun,
SUN Xiu-zhen,XU Jing,WU Yuan-yuan.Department of Respiratory,the Second Affiliated Hospital of Xi’
an Jiaotong University,Xi’an 710004,China
【Abstract】 Objective Hum s1,a major alergen of Humulus Scandens,was cloned,expressed and purified.
Its protein structure and function was predicted and analyzed,which provided a foundation for further studies into
the diagnostic and therapeutic efficacy of the recombinant alergen.Methods The target gene was amplified by PCR
and sub-cloned into the expression vector pET32athrough KpnⅠ/XhoⅠ site.The recombinant plasmid was
transformed into clone strain E.coli DH5α.The positive recombinant plasmid identified by PCR was transformed
into the expression strain E.coli BL-21.The expressed fusion protein was induced by IPTG,and purified using fast
protein liquid chromatography.The structure and function of the protein was predicted and analyzed.Results
Prokaryotic expression plasmid pET32a-G2was constructed successfuly.Hum s1was expressed and purified.The
purity of expressed fusion protein exceeded 90%.It has three potential antigen epitopes and two EF-hand structural
domains.A three-dimensional model was successfuly constructed.The recombinant protein was proved to have
immunological activity,with ELESA showing good attachment to sera samples of patients who were alergic to
Humulus Scandens.Conclusion Prokaryotic expression vector of Hum s1was successfuly constructed.The
recombinant protein was expressed and purified,with its epitope and three-dimensional model being predicted by
bioinformatics.The study provided a basis for further development of recombinant vaccines.
【Key words】 Humulus Scandens Recombinant alergen Gene clone
支气管哮喘是呼吸系统常见病,近年来在我国
的发病率有随着环境污染的加重而逐年增高的趋
势。而目前哮喘的治疗主要依赖于激素,特异性免
疫治疗(脱敏治疗)是唯一针对哮喘病因的治疗方
法,也是患者可以脱离激素的希望,其疗效已得到肯
定[1]。现临床上用于脱敏治疗的变应原疫苗多为粗
制或纯化的变应原浸液,因其成分复杂,有引起严重
过敏反应的风险。重组变应原疫苗因其成分明确,
而且其组成成分可以精确定量并标准化,减少了不
* 国家自然科学基金(No.81102252)资助
良反应的发生,应用其替代纯化变应原疫苗用于哮
喘患者的脱敏治疗成为目前研究的热点。国内有人
应用重组尘螨变应原疫苗用于哮喘动物模型的脱敏
治疗,取得较好疗效[2];国外有研究者在2012年首
次将重组变应原疫苗用于临床试验[3]。葎草花粉是
中国大多数地区哮喘患者的主要花粉致敏原,本课
题组近30年的吸入变应原调查结果也显示葎草花
粉是西安地区的夏秋季的主要花粉致敏原[4 -7]。本
课题组在既往调查研究的基础上已构建了葎草花粉
cDNA表达文库[8],筛选并获得了多个葎草花粉主
要变应原cDNA克隆[9],本研究主要目的是对筛选
DOI:10.13464/j.scuxbyxb.2016.01.004
第1期 刘 昀等:葎草花粉主要变应原 Hum s1的表达、纯化与结构预测
出的葎草花粉主要变应原 Hum s1进行表达、纯化
及结构预测,为评估该重组变应原的诊断及治疗效
果奠定基础。
1 材料及方法
1.1 材料
1.1.1 菌株和质粒 菌株E.coli BL-21及E.coli
DH5α为本实验室保存,表达质粒pET32a购自
Phamacia公司,pTripIE×2阳性噬菌粒为本实验室
筛选出的阳性克隆剪切而成的噬菌粒。
1.1.2 主要试剂 KpnⅠ、XhoⅠ购自Phamacia
公司,T4 DNA 连 接 酶、Taq DNA 聚 合 酶 为
Promega公司产品,His-tag亲和层析柱及 Q柱为
GE公司预装柱,PCR引物由上海生工合成。
1.1.3 患者血清 8例葎草花粉特异性过敏患者
血清来源于西安交通大学第二附属医院变态反应室
2010~2014年收集的葎草花粉过敏患者血清库。
葎草花粉过敏的诊断标准:①葎草花粉变应原皮内
试验风团直径≥组胺对照的风团直径;②CAP变应
原体外检测系统检测血清葎草花粉特异性IgE
(sIgE)为2级及以上。
1.2 方法
1.2.1 含Hum s1基因表达质粒的构建 合成表
达载体亚克隆所需的引物(G2),引物序列(5′-3′)
G2-F:ggGGTACCGACGACGACGACAAGATGG
CTGAAGTTAAAGAAG,G2-R:ccgCTCGAGTT
ATTTTGAGAGTTTATTG,上下游引物分别引入
KpnⅠ/XhoⅠ酶切位点;①以阳性噬粒pTripIE×
2为模板,PCR法扩增目的基因Hum s1,PCR产物
引用KpnⅠ/XhoⅠ双酶切后与同样经KpnⅠ/Xho
Ⅰ双酶切的pET32a表达载体,在T4DNA连接酶
的作用下连接。将目的基因通过KpnⅠ/XhoⅠ位
点克隆到pET32a表达载体,并且在基因的N端加
入肠激酶酶切位点;②将构建好的pET32a-G2质粒
转化到感受态克隆菌株E.coli DH5α,并培养扩增,
随机挑取克隆作为模板,以s1-F/T7ter为引物,用
PCR验证重组载体;③选择PCR阳性克隆送测序
检测,并培养抽提质粒。
1.2.2 融合蛋白的表达 ①将5ng pET32a-G2质
粒转化到表达菌株E.coli BL-21,并蓝白斑筛选阳
性克隆;②分别挑选3个白色克隆,用LB培养基扩
增这些克隆,每小时取少量菌液,应用分光光度计测
定细菌生长浓度(以空白LB为对照调零,波长为
600nm),并在光密度值(OD600)达到0.8左右时加
入IPTG至终浓度为1mmol/L,诱导表达3h或
16h,并通过SDS-PAGE检测表达情况,结果显示
在3h和16h均有蛋白表达,且16h表达量较3h
大,故选择16h诱导表达;③选择有明显目标蛋白
表达的菌株,使用LB培养基,摇瓶培养1L培养
液。37℃培养约6h,当细菌 OD600达到0.8加入
IPTG至终浓度为1mmol/L,继续诱导表达16h
(过夜);④用高速冷冻离心机离心收集培养好的菌
体。
1.2.3 目标蛋白的纯化 ①将1.2.2中表达后的
菌体重新悬浮于Tris-HCl(pH8.0)缓冲液中,应用
超声破菌。离心,15 000r/min,20min,电泳检测。
目标融合蛋白在破菌上清中。将上清转入干净的试
剂瓶,弃去沉淀。②利用快速蛋白液相色谱(AKTA
Explorer 100,GE)纯化融合蛋白。先利用 His-tag
亲和层析柱初步纯化融合蛋白,上样及平衡缓冲液
为缓 冲 液 A:50 mmol/LTris-HCl,0.5 mol/L
NaCl,pH8.0;洗脱缓冲液为缓冲液B:50mmol/L
Tris-HCl,0.5 mol/L NaCl,0.5 mol/L 咪唑,
pH8.0,用50mL缓冲液A平衡柱子,然后上样,再
用0~100%缓冲液B梯度洗脱,收集目标组分;③
利用重组肠激酶对融合蛋白进行酶切,37℃水浴过
夜;④利用 His-tag柱和Q柱对酶切后目标蛋白进
行纯化,His-tag柱上样及洗脱同上,收集穿透液,再
经Q柱纯化,Q柱上样及平衡缓冲液为缓冲液 A:
50mmol/L Tris-HCl,pH8.0;洗脱缓冲液为缓冲
液 B:50 mmol/L Tris-HCl,1 mol/L NaCl,
pH8.0,用50mL缓冲液A平衡柱子,然后上样,再
用0~100%缓冲液B梯度洗脱,收集目标组分。
1.2.4 目的基因编码蛋白结构的生物信息学分析
应用Antheprot软件预测Hum s1基因编码蛋白的
亲、疏水性,二维结构及抗原性;InterProScan分析
蛋白结构域,应用SWISS-MODEL同源建模软件,
构建目标蛋白三维模型,并用SWISS-PdbViewer
软件观察三维模型。
1.2.5 ELISA试验鉴定表达蛋白的免疫学特性 将
表达并纯化的融合蛋白分别经1∶10、1∶100,
1∶1 000稀释后,包被ELISA板,并应用正常人血清
1∶100作为阴性对照,葎草花粉过敏患者血清1∶100
稀释后加入ELISA板孵育1h,洗板后,加羊抗人
sIgE反应后显色,酶标仪上450nm测定OD值。
2 结果
2.1 融合蛋白的表达
51
四川大学学报(医学版) 第47卷
选择有明显目标蛋白表达的菌株,并选择16h
作为诱导时间,IPTG诱导融合蛋白的表达,电泳检
测表达情况,结果显示在26×103 处有融合蛋白的
表达,蛋白相对分子质量与预计值(26.3×103)相
符,且存在于裂解液上清中,见图1。应用凝胶电泳
图像分析系统计算出目的蛋白约占总蛋白的35%
以上 ,说明Hum s1基因在pET32a-G2表达载体
系统中得到高效表达。
图1 目标蛋白表达结果
Fig 1 The expression of target protein
A:The lysate of whole bacteria without induction;B:The
lysate of whole bacteria after induction;C:The sediment of whole
bacteria lysate after induction;D:The supernatant of whole bacteria
lysate after induction;MK:Protein marker
2.2 目标蛋白的纯化
融合蛋白经酶切并 His-tag柱纯化后的结果见
图2,电泳结果表明融合蛋白被酶切后呈现出2条
相对分子质量分别为16×103 及10×103 的蛋白条
带,目标蛋白存在于 His柱穿透液。图3显示了经
Q柱纯化后的目标蛋白,经Pixel Intensity软件计
算目标蛋白纯度达90%以上。
图2 融合蛋白酶切及His柱纯化酶切后目标蛋白结果
Fig 2 The results of digestion of fusion protein and purification of
digested protein with His column
I:The fusion protein before digestion;J:The fusion protein
after digestion;K:The penetration solution of His column;L:The
eluantion of His column 1;M:The eluantion of His column 2;MK:
Protein marker
2.3 目的基因编码蛋白结构的生物信息学分析
用Antheprot软件对Hum s1基因编码蛋白进
行分析,结果见图4,显示其有3个潜在的抗原表
位,分别为1~9位、17~24位及36~56位氨基酸
(黄色突出部分),肽链的二级结构(图5)以α-螺旋
为主(76%),片层与转角结构非常少。亲、疏水性分
布 较 均 匀,为 膜 表 面 蛋 白,无 跨 膜 结 构。
InterProScan分析出Hum s1基因编码蛋白含有2
个钙结合蛋白的EF-手型结构域。SWISS-MODEL
图3 目标蛋白经Q柱纯化后电泳图及纯度分析
Fig 3 Purification of target protein with Q column and purity analysis
N:The fusion protein after digestion;O:The penetration
solution of Q column;1:The eluantion of Q column 1;2:The
eluantion of Q column 2;3:Eluant of Q column 1;MK:Protein
marker;S:Eluant of Qcolumn 2
图4 Hum s1基因编码蛋白抗原性、疏水性、跨膜结构预测
Fig 4 Prediction of antigenicity,hydrophobicity and transmembrane
structure of the protein encoded by Hum s1gene
1:The curve of antigenicity;2:The curve of hydrophobicity;
3:The curve of transmembrane structure
图5 Hum s1基因编码蛋白二级结构预测及比例
Fig 5 Prediction and proportion of secondary structure of the protein
encoded by Hum s1gene
Blue:Helix;Yelow:Sheet;Green:Turn;Light blue:Coil
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第1期 刘 昀等:葎草花粉主要变应原 Hum s1的表达、纯化与结构预测
同源构建出三维目标蛋白模型(图6),以2opoB为
模板,序列同源性58%,E-value:1.82e-15,分辨率
1.75A,说明构建的三维模型稳定,可靠。
2.4 ELISA试验鉴定表达蛋白的免疫学特性
ELISA试验显示表达的目的蛋白与8例葎草
花粉过敏患者血清sIgE均能特异性结合,具有良好
的免疫学活性(图7)。
图6 Hum s1基因编码蛋白二级结构预测
Fig 6 Prediciton of secondary structure of the protein encoded by
Hum s1gene
图7 表达的目的蛋白与8例葎草花粉过敏患者血清特异性IgE结
合ELISA实验
Fig 7 The specific IgE ELISA binding experiment of target protein
using serum sample of eight patients who were alergic to
Humulus Scandens
1-8:The serum of eight patients
3 讨论
本课题组的既往研究发现葎草花粉是西安地区
主要的气传花粉致敏原[10],我们将葎草花粉变应原
提取液用于过敏性哮喘患者过敏原的诊断及特异性
免疫治疗,曾取得较好疗效。但因为粗制变应原提
取液成分复杂,有引起严重过敏反应的风险,国家已
严格限制粗制变应原在过敏性疾病的诊断及治疗中
的应用。因此,寻找新的、安全性更高的变应原产物
用于过敏性疾病的诊断及治疗,成为目前变态反应
研究的热点。
变应原提取液的的纯度及质量决定了过敏原诊
断的准确性及特异性免疫治疗的疗效及副作用,天
然变应原提取液成分非常复杂,除包含有主要致敏
蛋白、多种次要致敏蛋白,还包含有多种杂质,其组
分难以精确标准化及定量,其应用于过敏性疾病的
特异性免疫治疗,不仅有诱发严重过敏反应的危险,
也有诱导新的过敏产生的风险,使患者对原来不过
敏的成分反而产生过敏,从而加重过敏性哮喘的症
状,因此粗制变应原提取液的应用受到限制[11]。而
详细了解变应原的成分及组分,解读变应原致敏组
分的基因及分子结构,制备重组变应原疫苗用于过
敏性疾病的诊断及特异性免疫治疗,为变态反应性
疾病的特异性免疫治疗提供了新的思路[12,13]。在
近十年来,国内外有关重组变应原的研究取得了很
大的进展,杨属、梯牧草、悬铃木属、车前属、松属、橄
榄属等多种花粉变应原的致敏蛋白成分已被确
定[14],多种变应原的主要致敏蛋白(如Bet v1,Blag
2及Ara h1等)的三维结构已被成功构建,桦树花
粉的IgE结合位点、T细胞活化位点已被明确定位,
从而重组合成低致敏性花粉变应原疫苗用于脱敏治
疗[15,16]。
本研究在既往研究的基础上,对从葎草花粉
cDNA表达文库中筛选到的一个新发现的葎草花粉
cDNA序列(将此基因命名为Hum s1)进行了表达、
纯化及结构预测分析。为获得大量高纯度的变应
原,我们采用了pET表达系统,结果获得占总蛋白
量35%的目的蛋白,蛋白相对分子质量与预计值相
符,表明目标蛋白在此表达系统内高效表达,经 His
柱和Q柱纯化后,蛋白纯度达到90%以上。ELISA
试验显示表达的目的蛋白与8例葎草花粉过敏患者
血清sIgE均能特异性结合,具有良好的免疫学活
性。
蛋白质的氨基酸序列及其三级结构决定了蛋白
的生物学特性,近年来,随着计算机技术的发展,近
期研制的很多软件都可预测蛋白结构,而且,研究证
明预测得到的蛋白结构与试验测定的结构相符。本
研究对Hum s1基因编码的蛋白结构及功能进行预
测,Antheprot软件预测其有3个潜在的抗原表位,
分别为1~9位、17~24位及36~56位氨基酸,肽
链的二级结构以α-螺旋为主,片层与转角结构非常
少。亲、疏水性分布较均匀,为膜表面蛋白,无跨膜
结构。InterProScan分析Hum s1基因编码蛋白含
有2个钙结合蛋白的EF-手型结构域,提示Hum s1
基因属于花粉钙结合蛋白家族(polcalcins)。而对
钙结合蛋白家族的研究发现,EF-手型结构域广泛
71
四川大学学报(医学版) 第47卷
存在于多种花粉变应原的基因结构中,如具有2个
手型结构域的Bet v4、Aln g4、Cyn d7、Phl p7、Ole
e3和Bra r1,3个手型结构域的Bet v3,4个手型结
构域的Jun o4、Ole e8等花粉变应原,钙离子在这些
花粉变应原与IgE 抗体的结合中发挥重要作
用[17,18]。本研究同时应用SWISS-MODEL软件同
源建模的方式构建目标蛋白三维模型,以预测出该
蛋白的三维结构,从图中也可以看出Hum s1基因
编码蛋白含有5个α-螺旋结构。而既往研究发现,
变应原蛋白表面的α-螺旋可能是潜在的IgE 结合
位点[19]。根据上述潜在的抗原表位及IgE结合位
点,我们可以改造上述EF结构域或α-螺旋结构,从
而获得低致敏性变应原,降低重组变应原的致敏
性,减弱脱敏治疗过程中可能诱发的过敏反应,为
葎草花粉过敏性疾病的特异性免疫治疗提供新的研
究方向。
本研究通过重组、表达葎草花粉主要变应原
Hum s1基因并对其编码蛋白的结构及功能进行预
测,为制备低致敏性的标准化重组变应原奠定了基
础。
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