全 文 :西北植物学报,2015,35(9):1767-1775
Acta Bot.Boreal.-Occident.Sin.
文章编号:1000-4025(2015)09-1767-09 doi:10.7606/j.issn.1000-4025.2015.09.1767
收稿日期:2015-05-04;修改稿收到日期:2015-07-19
基金项目:国家自然科学基金(31460043);新疆自治区优秀青年科技人才培养项目(2013721013)
作者简介:程 刚(1987-),男,在读博士研究生,研究方向为植物学。E-mail:enjoy123fly@163.com
*通信作者:兰海燕,博士,教授,研究方向:植物抗逆分子生物学。E-mail:lanhaiyan@xju.edu.cn
异子蓬PEPC基因原核表达及其重组菌
在非生物胁迫下的耐受力解析
程 刚,兰海燕*
(新疆大学生命科学与技术学院新疆生物资源基因工程重点实验室,乌鲁木齐830046)
摘 要:该研究在Escherichia coli Transetta(DE3)中表达了C4 盐生植物异子蓬的磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶基因
(PEPC),并进行了酶学特性及非生物胁迫响应分析,以期初步阐明PEPC基因在非生物胁迫下的生物学功能,为
异子蓬PEPC的非生物胁迫的抗性生理研究提供参考依据。基于5′-RACE技术获得异子蓬PEPC全长基因
(GenBank登录号为KP985714),构建了E.coli Transetta::pGEX-4T-1-PEPC重组菌株。通过分光光度法和酶联
免疫吸附技术(ELISA)分别测定了PEPC重组蛋白的酶活和含量,并检测E.coli Transetta::pGEX-4T-1-PEPC重
组菌株在非生物胁迫下的耐受性。生物信息学分析发现,该PEPC基因的cDNA全长为2 901bp,编码966个氨
基酸,与甜菜(Beta vulgaris)PEPC的氨基酸序列一致性达90%,具有PEPC的典型保守结构域(PEPcase)以及
VlTAHPTQsiRR和VMIGYSDSgKDAG活性位点;PEPC蛋白属PEPC-1型的不含信号肽的非分泌型亲水蛋白。
Western blot结果显示,融合GST的PEPC蛋白的分子量约130~140kD;在37℃用0.8mmol/L IPTG诱导
E.coli Transetta::pGEX-4T-1-PEPC重组菌株显示出更高的PEPC酶活及含量,而且E.coli Transetta::pGEX-
4T-1-PEPC重组菌在200~800mmol/L NaCl、5%~20% 聚乙二醇(PEG)6 000、25℃~52℃温度范围、50~400
μmol/L甲基紫精和pH 3.0~11.0的非生物胁迫下生长均明显优于对照。研究表明,异子蓬PEPC基因的表达提
高了E.coli耐受非生物胁迫的能力。
关键词:异子蓬;C4 盐生植物;磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶;非生物胁迫
中图分类号:Q786;Q789 文献标志码:A
Procaryotic Expression of PEPCfrom Halophyte Suaeda aralocaspica
and Analysis of Stress Tolerance of the Recombinant Strain
CHENG Gang,LAN Haiyan*
(Xinjiang Key Laboratory of Biological Resources and Genetic Engineering,Colege of Life Science and Technology,Xinjiang Uni-
versity,Urumqi 830046,China)
Abstract:To elaborate the biological function of PEPC which encodes phosphoenolpyruvate carboxylase
from C4halophyte Suaeda aralocaspica,we investigated the performance of recombinant PEPC in Esche-
richia coli Transetta(DE3)under various abiotic stresses.The ful-length cDNA of PEPC (GenBank ac-
cession No.KP985714)was obtained by 5′-RACE technique and its procaryotic expression vector pGEX-
4T-1-PEPCwas constructed.The content and enzyme activity of PEPC were measured by the spectropho-
tometric method and enzyme linked immunosorbent assay(ELISA).Meantime,the tolerance of the recom-
binant E.coli Transetta::pGEX-4T-1-PEPCto different abiotic stresses was also investigated.Bioinforma-
tics analyses showed that PEPCcontained 2 901bp nucleotides and encoded 966amino acids,which posses-
ses the typical conserved domains of PEPC(e.g.active sites VlTAHPTQsiRR and VMIGYSDSgKDAG),
and shares 90%amino acid similarity to PEPC fromBeta vulgaris;our PEPC was a non-secretory PEPC-1
type hydrophilic protein without signal peptide sequence,and the molecular weight of the recombinant
PEPC was approximately 130-140kD,which was confirmed by western blot analysis.The recombinant
PEPC presented relatively higher enzymatic activity when induced by 0.8mmol/L IPTG at 37℃.Com-
pared with the control strain,the recombinant E.coli Transetta::pGEX-4T-1-PEPCshowed better growth
performance under various abiotic stresses[i.e.200-800mmol/L NaCl,5%-20%PEG 6 000,25℃-52
℃,50-400μmol/L methyl viologen,and the wide acid and base range(pH 3.0-11.0)].The results
showed that overexpression of PEPCgene fromS.aralocaspicain E.coli enhanced the tolerance under va-
rious abiotic stresses,which suggests that PEPC may confer stress tolerance to E.coli.Our work can pro-
vide more evidence for revealing the biological function of PEPC fromS.aralocaspica.
Key words:Suaeda aralocaspica;C4halophyte;phosphoenolpyruvate carboxylase;abiotic stresses
磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶(PEPC)是C4 光合
途径中重要的光合调控酶,催化磷酸烯醇式丙酮酸
(PEP)的β-羧化并以四碳酸形式固定 CO2,充当
CO2 泵的作用[1-3]。PEPC存在于所有植物、绿藻、
光合细菌、古细菌及非光合细菌中,主要参与C4 及
景天酸光合代谢途径[4-5]。PEPC在植物中主要以
C4 型、C3 型、CAM 型以及细菌型4种同工酶形式
存在[6-7]。除了调控光合作用,PEPC还参与三羧酸
循环(TCA)中各种生物合成及氮同化过程所消耗
的中间产物的回补反应,在植物、藻类及细菌中起到
重要的非光合协调作用[8-10]。除此之外,PEPC在植
物应对逆境胁迫中也发挥重要作用,如非生物胁迫
中的盐[11]、干旱[12]、低温[13]、臭氧胁迫[14]等均能诱
导PEPC基因上调表达,参与植物抗逆反应。特别
是通过转基因方法将C4 植物PEPC基因导入C3
经济作物中,以提高其光合速率及胁迫耐受性,从而
增加作物产量和适应性的研究已被广泛报道。研究
发现,转玉米PPDK 和PEPC 基因的拟南芥和水
稻较对照具有更高的光合速率[15-16],干旱胁迫下,过
表达PEPC水稻较对照具有更高光耐受性[17]。在
生物胁迫中,一些植物病毒能够诱导PEPC基因的
高表达,间接帮助植物抵御病毒侵害[18]。
近年来发现的几种单细胞C4 植物光合碳同化
模式[19],为人类进一步认识光合碳同化途径及其进
化关系提供了新证据。异子蓬(Suaeda aralocaspi-
ca)作为藜科异子蓬属一年生盐生植物,在中国仅分
布于新疆,生长于重度盐化荒漠,整个生活史均具极
强的抗逆性[20]。异子蓬特有的单细胞 C4 光合途
径,能够在单个叶肉细胞内经极性区隔化分布的两
种异型叶绿体进行高效光合作用[21]。因此,探索单
细胞C4 植物异子蓬中PEPC的相关功能对揭示该
物种高光效机制及逆境胁迫响应机制具有重要意
义。前期研究中发现异子蓬中至少有2种植物型
PEPC(根据文献命名为PEPC-1型和PEPC-2型),
目前获得了 PEPC-1型 PEPC 基因的cDNA 全
长[22]。本研究通过原核表达异子蓬 PEPC-1型
PEPC基因,分析了PEPC在原核表达系统中的酶
学特性,并检测了PEPC重组菌在非生物胁迫下的
耐受性能。本研究为后续深入分析PEPC的功能及
利用其改良作物光合特性和抗逆性提供参考依据。
1 材料和方法
1.1 实验材料
异子蓬(Suaeda aralocaspica)种植于新疆大学
新疆生物资源基因工程重点实验室阳台。本研究所
用的菌株、质粒和PCR扩增用引物序列见表1。
1.2 方 法
1.2.1 cDNA全长序列的克隆 取发育2个月的
异子蓬幼苗嫩叶0.15g,于液氮中磨碎至均匀粉末
状,用RNAprep Pure植物总RNA提取试剂盒(天
根)提取异子蓬总RNA,置-80℃备用。
取上 述 总 RNA 1μg,用 M-MLV 试 剂 盒
(TaKaRa)反转录合成cDNA第一链,以此作为模
板,根据已报道异子蓬 PEPC 基因的部分序列
(DQ538353),以及近源种中相似性较高的PEPC
保守编码序列(DQ538352、AY950667)设计简并引
物(表1),获得部分序列(缺失5′端)。PCR反应程
序为94℃预变性5min;94℃变性30s,58.8℃复
性30s,72℃延伸3min,30个循环后,72℃延伸7
min。随后,利用SMARTer TM RACE cDNA Am-
plification Kit(Clontech,TaKaRa)及引物GSP1和
NGSP1扩增获得PEPC 基因5′端序列。获得的
PEPC全长cDNA由上海Sangon公司测序。
1.2.2 PEPC生物信息学分析 用http://blast.
8671 西 北 植 物 学 报 35卷
表1 菌株、质粒和PCR扩增所用引物
Table 1 Strains,plasmids and PCR amplification primers used in this study
类别Category 名称 Name 描述 Description 来源 Reference
菌株Strains
E.coli Transetta(DE3)
F-ompThsdSB(rB
-mB
-)gal dcm lacY1(DE3)pRARE(argU,
argW,ileX,glyT,leuW,proL)(Camr)
TransGen Biotech Co.
E.coli Trans5α
F-φ80dlac ZΔM15Δ(lacZYA-argF)U169 end A1 recA1
hsdR17(rk-,mk+)supE44λ-thi-1 gyrA96 relA1 phoA
TransGen Biotech Co.
质粒Plasmids
pMD18-T OriColE1,LacZ operator,MCS,Ampr,expression vector TaKaRa Co.
pGEX-4T-1 OripBR322,tac promoter,MCS,Ampr,GST gene fusion vector Stored in the lab
引物(5′→3′)
Primer(5′→3′)
PEPC_Upa ATGGCWASWGKGAAGKTGGAGAA 本研究 This work
PEPC_Downa TTAACCGGTGTTCTGCATTCCAG 本研究 This work
GSP1 AGGTGTTACTCTTGGATTTCCATCTCGG 本研究 This work
NGSP1 GCAGAACTCTCATCAGCAAAATCCC 本研究 This work
PEPC_Upb CCGGAATTCATGGCAAGTGTGAAGTTGG 本研究 This work
PEPC_Downb TTTGCGGCCGCACCGGTGTTCTGCATTC 本研究 This work
注:a表示PEPC同源克隆的简并引物;b表示PEPC全长序列的引物;下划线表示酶切位点。
Note:astands for the degenerate primers used in homologous clone;b stands for the primers used in the amplification of ful-length PEPC
cDNA;The underline site indicates the endonuclease sequence.
ncbi.nlm.nih.gov程序进行序列比对,并用Clustal
X进行多序列比对分析[23]。用 http://web.ex-
pasy.org/translate/在线软件进行蛋白翻译分析;
利 用 Protparam(http://web.expasy.org/prot-
param/)对蛋白质基本理化性质进行预测;Motif
Scan(http://myhits.isb-sib.ch/cgi-bin/motif_
scan)对蛋白质功能位点进行预测分析;http://cel-
lo.life.nctu.edu.tw 在线软件进行亚细胞定位预
测;SignalP4.0(http://cbs.dtu.dk/services/Sig-
nalP/)预测蛋白质信号肽序列;http://expasy.org/
tools/protscale.html分析蛋白亲疏水性;Predict-
Protein(https://www.predictprotein.org)及
Swiss-Model(http://swissmodel.expasy.org/)预
测蛋白质二级及三级结构。
1.2.3 基因诱导表达及免疫印迹分析 将E.coli
Transetta::pGEX-4T-1-PEPC 重组菌和 E.coli
Transetta::pGEX-4T-1对照菌,接种于含100μg/
mL氨苄青霉素的LB液体培养基,于37℃、220r/
min培养至 OD6000.4~0.6,加入0.8mmol/L
IPTG诱导4h。离心收集5mL菌液,用PBS(pH
7.4)缓冲液洗涤菌体2次,加入1mL PBS缓冲液,
超声波破碎菌体(功率200W,超声3s,间隔10s,
重复10次),随后4℃、12 000g离心10min,取上
清及1mL PBS缓冲液重悬沉淀进行SDS-PAGE
检测。SDS-PAGE结束后,90V历时50min将蛋
白转印至 PVDF膜。先用 1∶10 000 稀释 GST
Tag鼠源单克隆抗体与膜反应2h,再用1∶10 000
羊抗小鼠IgG二抗孵育2h,洗膜后加入DAB显色
液室温避光孵育5~10min,至出现目的条带后终
止显色反应,观察结果。
1.2.4 重组菌表达蛋白的酶活分析 用索莱宝磷
酸烯醇式丙酮酸羧化酶试剂盒(北京)和朗顿植物磷
酸烯醇式丙酮酸羧化酶酶联免疫检测试剂盒(上
海),检测E.coli Transetta::pGEX-4T-1-PEPC重
组菌的PEPC酶活性和蛋白含量,以空载菌株E.
coli Transetta::pGEX-4T-1作为对照。样品前处
理步骤为:离心收集10mL菌液,用PBS(pH 7.4)
缓冲液洗涤菌体2次,加入1mL提取液(含100
mmol/L PMSF的PBS缓冲液),超声波破碎菌体
(功率200W,超声3s,间隔10s,共5min),随后4
℃、8 000g离心10min,取上清,置冰上待测。按照
Deng等[24]的方法,在340nm处检测样品吸光度,
通过监测 NADH 的减少量来评价PEPC酶活,每
mg组织蛋白在反应体系中每分钟消耗1nmol
NADH定义为一个酶活力单位。用生物素双抗体
夹心酶联免疫吸附法(ELISA)评价菌体中PEPC的
含量变化水平。
1.2.5 重组菌的生长和胁迫耐受性测定 重组菌
生长情况测定按照Narayan等的方法[25],并做适当
修改。菌体在0.8mmol/L IPTG诱导表达4h,调
节重组菌E.coli Transetta::pGEX-4T-1-PEPC和
对照菌株E.coli Transetta::pGEX-4T-1的初始
OD值相等,按1%(v/v)的接种量2次转接至含
100μg/mL氨苄青霉素的新鲜LB培养基中,每隔2
h取样,在600nm处测定菌液OD值。
重组菌E.coli Transetta::pGEX-4T-1-PEPC
和对照菌株E.coli Transetta::pGEX-4T-1的非生
物胁迫耐受性检测按照Singh等方法[5],并做适当
96719期 程 刚,等:异子蓬PEPC基因原核表达及其重组菌在非生物胁迫下的耐受力解析
修改。将0.8mmol/L IPTG诱导表达4h后的重
组菌和对照菌株调节OD值一致,按1%(v/v)的接
种量,接种在添加有200~800mmol/L NaCl、5%
~20%PEG 6 000、50~400μmol/L甲基紫精以及
pH 3.0~11.0的LB液体培养基,于37℃、220r/
min振荡培养。温度胁迫实验是将诱导后培养物添
加到LB(pH 7.0),于25℃~52℃,220r/min振荡
培养。所有非生物胁迫实验每2h取样1次,在600
nm处检测菌液OD值。
1.3 数据分析
实验数据统计分析及作图采用 GraphPad
Prism 5.01软件进行。
2 结果与分析
2.1 PEPC基因克隆及原核表达
以异子蓬总 RNA 反转录获得的cDNA 为模
板,通过5′-RACE和同源克隆技术,对目的片段进
行扩增,得到3 000bp左右条带(图1,A),与预期
片段大小一致。
测序结果表明,PEPC基因cDNA全长为2 901
bp。在线蛋白翻译分析(http://web.expasy.org/
translate/)发现,该序列具有完整读码框,可进行后
续蛋白表达。后将PEPC基因重组子转化E.coli
Transetta(DE3),得到重组菌E.coli Transetta::
pGEX-4T-1-PEPC(图1,B)。
图1 异子蓬PEPC基因cDNA扩增(A)及重组原核表达
载体pGEX-4T-1-PEPC双酶切鉴定(B)
M1.DL 5 000;M2.DL 15 000;A.1.PEPC基因PCR扩增产物;
B.1.EcoRⅠ和NotⅠ消化的pGEX-4T-1;2.EcoRⅠ和
NotⅠ消化的pGEX-4T-1-PEPC重组质粒。
Fig.1 PCR results of PEPCcDNA of S.aralocaspica(A)
and restriction digestion of pGEX-4T-1-PEPCvector(B)
M1.DL 5 000;M2.DL 15 000;A.1.PEPCgene fragment by PCR;
B.1.pGEX-4T-1digested by EcoRⅠand NotⅠ;
2.Recombinant plasmid pGEX-4T-1-PEPCdigested
by EcoRⅠand NotⅠ.
2.2 异子蓬PEPC生物信息学分析
本研究通过生物信息学平台系统分析了异子蓬
PEPC的蛋白信息。ProtParam 分析发现,异子蓬
PEPC 基因编码 966个氨基酸,理论分子量为
110.2kD,等电点为6.10。该蛋白质的主要氨基酸
构成为 Leu(12.2%)、Glu(8.5%)、Arg(7.3%)、
Ala(6.8%)、Asp(6.1%),推测的分子式为 C4903
H7801N1361O1450S37。理论不稳定系数为38.65,属于
稳定型蛋白。亲水性及疏水性分析发现,该蛋白多
肽链中亲水性氨基酸多于疏水性氨基酸且均匀分
布,因此推测异子蓬PEPC属于亲水蛋白。
前人研究发现,植物中C4 型PEPC的C末端
第774位或附近的1个氨基酸残基为保守丝氨酸
(Ser),而 C3 型 PEPC 的相应位置则为丙氨酸
(Ala)[21-22]。本研究克隆的异子蓬PEPC在C末端
第775位氨基酸是丙氨酸(图2),推测可能属于C3
型PEPC,并将其命名为PEPC-1型PEPC。
异子蓬PEPC蛋白功能位点与功能域预测发
现,163~966位氨基酸之间存在一个典型PEPC结
构域。氨基酸序列分析表明,异子蓬PEPC含有植
物型PEPC所有基本模体、保守残基、催化位点及磷
酸化和泛素化位点[26](图2)。其中,位于 N 端的
11SIDAQLR17模体,在C4、CAM 及部分C3 植物中
参与调控植物酶活性的昼夜变化,该模体中的丝氨
酸残基为专一磷酸化位点[27]。位于 C 端的963
QNTG966模体决定了 PEPC最大催化活性[28]。640
GRGGTVGRGG649模体中 R647残基直接参与该酶
的羧化反应[29]。根据PROSITE数据库分析,异子
蓬PEPC氨基酸序列含有2个大的PEPC活性位
点,分别位于169~180氨基酸位点(PS00781,Vl-
TAHPTQsiRR)和 592 ~ 604 氨 基 酸 位 点
(PS00393,VMIGYSDSgKDAG)之间。
PEPC亚细胞定位和结构预测结果显示,异子
蓬PEPC位于线粒体基质空间、线粒体内膜、线粒
体间隙和叶绿体类囊体膜的可能性系数分别为
0.527、0.255、0.255和0.280。PEPC蛋白跨膜结
构域和信号肽分析发现,该蛋白不含信号肽,属于非
分泌型蛋白。
利用PredictProtein程序预测异子蓬 PEPC二
级结构(图3)分析发现,α-螺旋、无规则卷曲和延伸
链含量分别为65.73%、30.43%和3.83%,α-螺旋
和无规则卷曲大量分布,而延伸链稀疏地散布在其
中。利用Swiss-Model程序提供的同源建模法,对
异子蓬PEPC蛋白质进行同源建模,获得的三级结
0771 西 北 植 物 学 报 35卷
图2 异子蓬PEPC氨基酸序列的分析
方框标示酶催化反应中重要的结构域;灰色背景标示保守残基;黑色背景标示功能位点;下划线标示模体
Fig.2 Analysis of amino acid sequence of PEPC fromS.aralocaspica
Boxes indicate the important catalytic domains;Gray and black indicate the conserved residues and functional sites,respectively;
Underline sequences mean motifs
图3 异子蓬PEPC三级结构预测
Fig.3 The predicted tertiary structure of PEPC protein
构如图3所示。
2.3 异子蓬PEPC蛋白诱导表达及免疫印迹分析
SDS-PAGE结果显示,重组菌E.coli Transet-
ta::pGEX-4T-1-PEPC样品在130kD处有差异表
达条带(PEPC 110kD+GST 26kD),表明构建原
核表达载体正确(图4,A)。取超声处理后菌体上清
及沉淀进行蛋白可溶性检测(图4,B)。结果表明目
的蛋白主要以包涵体形式存在于沉淀中。
Western印迹结果发现,重组菌和对照菌E.
coli Transetta::pGEX-4T-1经IPTG诱导后分别
检测到 GST融合蛋白(130kD)和 GST标签(26
kD),且重组菌未诱导情况下也检测到较弱条带,说
明PEPC存在本底表达(图4,C)。
2.4 重组蛋白的酶活分析
本研究采用酶联免疫吸附技术和分光光度法,
对E.coli Transetta::pGEX-4T-1-PEPC 重组菌
PEPC蛋白含量及活性进行了测定。结果表明,重
组 菌经0.8mmol/L IPTG诱导4h,PEPC含量达
17719期 程 刚,等:异子蓬PEPC基因原核表达及其重组菌在非生物胁迫下的耐受力解析
图4 PEPC重组蛋白的SDS-PAGE及 Western blot分析
A和B.SDS-PAGE分析:M1.蛋白质分子量对照;1.重组菌诱导前;2.重组菌诱导后;3.重组菌诱导前总蛋白;4.重组菌诱导前上清;
5.重组菌诱导前上清;6.重组菌诱导后总蛋白;7.重组菌诱导后沉淀;8.重组菌诱导后上清;C.Western blot分析:
M2.预染蛋白质分子量对照;9.对照菌诱导后;10.重组菌诱导后。箭头所示为PEPC重组蛋白条带。
Fig.4 Analysis of the recombinant PEPC protein by SDS-PAGE and Western blot
A and B.SDS-PAGE analysis of recombinant PEPC protein.M1.Protein molecular weight marker;1.Un-induced recombinant
E.coli Transetta::pGEX-4T-1-PEPC;2.Induced recombinant E.coli Transetta::pGEX-4T-1-PEPC;
3.Total crude extract of un-induced recombinant strains;4.Insoluble fraction of un-induced recombinant strains;
5.Soluble fraction of un-induced recombinant strains;6.Total crude extract of induced recombinant strains;
7.Insoluble fraction of induced recombinant strains;8.Soluble fraction of induced recombinant strains;
C.Western blot analysis of recombinant PEPC protein.M2.Prestained protein molecular weight marker;
9.Induced control E.coli Transetta::pGEX-4T-1;10.Induced recombinant E.coli Transetta::pGEX-4T-1-PEPC.
The arrow indicates the target recombinant PEPC protein.
0.19ng/mL,分别是非诱导组和对照组的2.01和
29.69倍(图5)。PEPC活性为176.13U/mg,分别
是非诱导组和对照组的2.35和5.38倍。该结果表
明通过IPTG诱导,重组菌表达了目的蛋白PEPC
且具有活性。非诱导重组菌中PEPC基因有少量
泄漏表达,因此与对照菌相比检测到一定的PEPC
含量及活性。
2.5 重组菌胁迫耐受性测定
为了验证 PEPC 重组菌 E.coli Transetta::
pGEX-4T-1-PEPC在不同非生物胁迫下的耐受性,
本研究检测了200~800mmol/L NaCl、5%~20%
PEG6000、25℃~52℃、50~400μmol/L甲基紫精
和pH 3.0~11.0等不同条件下的菌体生长(图6,
A~E)。结果显示,在400mmol/L NaCl处理12h
时,重组菌液 OD600值是对照的1.58倍。在10%
PEG 6 000、25℃、75μmol/L甲基紫精和pH 9.0
胁迫下,重组菌分别是对照的1.25、2.73、1.92和
1.82倍。并且,随着胁迫增强,重组菌的生长呈现
优于对照菌的趋势。以上结果表明,过量表达
PEPC能够赋予宿主菌更好的耐受非生物胁迫的
能力。
本研究进一步探讨了400mmol/L NaCl、10%
PEG 6 000、25℃、75μmol/L甲基紫精、pH 9.0等
单一非生物胁迫条件下菌体生长情况(图7,B~F)。
图5 异子蓬PEPC蛋白含量和活性测定
1.对照菌非诱导;2.重组菌非诱导;3.重组菌诱导后;
图中数据为平均值±SD(n=3);下同。
Fig.5 The protein content and enzyme activity of PEPC
fromS.aralocaspica
1.Un-induced control E.coli Transetta::pGEX-4T-1;
2.Un-induced recombinant E.coli Transetta::pGEX-4T-1-PEPC;
3.Induced recombinant E.coli Transetta::pGEX-4T-1-PEPC;
Bar represents mean±SD of three replicates;The same as below.
结果显示,在正常条件下(37℃、pH 7.0),重组菌和
对照菌生长没有差异,10h后基本达到平稳期(图
7,A)。在胁迫条件下,除10%PEG 6 000以外,12
h两者菌体生长量均有显著差异,并且对照菌的生
长受到明显胁迫抑制。以上结果表明,PEPC基因
的表达促进了菌体在非生物胁迫下的生长。
2771 西 北 植 物 学 报 35卷
图6 非生物胁迫下的菌体生长检测
Fig.6 Strains growth under various abiotic stresses
3 讨 论
尽管PEPC基因在C3 或具花环结构的C4 植
物中已被广泛研究,但在单细胞C4 植物中的研究鲜
见报道。本研究克隆了单细胞 C4 植物异子蓬
PEPC基因cDNA全长序列,包含2 9 0 1bp个核苷
图7 E.coli Transetta::pGEX-4T-1-PEPC重组菌
在不同非生物胁迫下的生长检测
Fig.7 Growth of the recombinant E.coli
Transetta::pGEX-4T-1-PEPC
under different abiotic stresses
酸,编码966个氨基酸,序列中含有多个PEPC已知
模体、保守残基、酶催化位点、磷酸化和泛素化位点
及两个大的PEPC活性位点[22]。氨基酸序列多重
比对发现,异子蓬PEPC序列与甜菜(Beta vulgar-
is)、五色苋(Alternanthera ficoidea)及莲子草(Al-
ternanthera sessilis)的同源性最高,均达90%以
上[22]。通过生物信息学方法对异子蓬PEPC蛋白
质理化性质、结构及功能位点等预测分析发现,异子
蓬PEPC同其他种属植物型PEPC类似[30-31]。该蛋
白主要分布于线粒体基质,属于无跨膜结构域和信
号肽的非分泌蛋白。对其三级空间结构分析显示,
异子蓬PEPC主要以α-螺旋为主,其酶催化反应结
构域位于蛋白中心位置,符合酶活性中心局限于大
分子一定区域的规律[32]。
经免疫印迹检测原核表达的 130kD 重组
GST-PEPC蛋白主要以包涵体形式存在,在菌体裂
解后上清及未诱导情况下也有少量表达。本实验克
隆的异子蓬PEPC属PEPC-1型,其体外重组酶活
性检测显示,底物PEP能够在PEPC及苹果酸脱氢
酶催化下,通过消耗 NADH 最终生成苹果酸,该结
37719期 程 刚,等:异子蓬PEPC基因原核表达及其重组菌在非生物胁迫下的耐受力解析
果与Park等研究结果一致[33]。众所周知,PEPC作
为重要的光合关键酶在植物中被广泛研究。C4 型
PEPC在C4 光合途径中催化PEP结合大气中CO2
形成四碳酸,后经脱羧作用释放CO2,并将其供给
C3 循环使用,起到了 CO2 浓缩作用[5,9,22]。C3 型
(和/或根型)PEPC在C3 及C4 植物中则可能在三
羧酸循环的中间物质的回补反应中行使重要功能,
包括草酰乙酸(OAA)、苹果酸等[5]。
已有大量报道集中在PEPC抗逆功能的研究。
在转基因植物中过量表达C4 植物PEPC,能不同程
度地增强植物抵御和适应外界胁迫的能力。除了增
强植物耐旱[34-35]、耐盐[11]、耐高温[17]等能力外,Be-
guma等[36]发现,转PEPC基因水稻具有耐受重金
属毒害的能力。此外,在E.coli中过量表达PEPC
基因有利于细胞抵御逆境胁迫[5,33]。本研究也发现
原核表达的PEPC蛋白在NaCl、PEG 6 000、甲基紫
精(MV)、pH 3.0~11.0的胁迫下能促进菌体生
长,由此推测PEPC在非生物胁迫下参与了E.coli
耐受非生物胁迫的胁迫生理过程,该结果与Singh
等研究结果相符[5]。推测PEPC参与胁迫应答可能
存 在两种机制,一是PEPC能够催化PEP生成
OAA和/或随后的苹果酸,OAA在TCA循环中起
重要的回补反应[37-38];二是菌体内积累大量的苹果
酸能够作为渗透调节物质帮助抵御胁迫产生的细胞
损伤[39-40]。因此,PEPC作为一种重要的酶,能够促
进菌体积极应对逆境胁迫。这进一步佐证了PEPC
抗逆性能研究在生物逆境生理研究领域的重要性。
本研究原核表达了异子蓬PEPC-1型PEPC
基因,该基因的异源表达提高了E.coli耐受非生物
逆境胁迫的能力。因此,本研究将为PEPC逆境生
理和逆境生物的工程改造提供了信息。
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