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独角莲内生细菌TG116的分离鉴定及抑菌特性研究



全 文 : 第50卷2014年第5期      西 北 师 范 大 学 学 报 (自然科学版)
 Vol.50 2014 No.5      Journal of Northwest Normal University(Natural Science) 
收稿日期:2014-05-29;修改稿收到日期:2014-08-28
基金项目:甘肃省科技支撑计划项目(1304NKCA143);甘肃省高校科研项目(2013A-011);西北师范大学青年教师提升计
划资助项目 (NWNU-LKQN-10-18)
作者简介:令利军 (1975—),男,甘肃天水人,副教授,博士,硕士研究生导师.主要研究方向为植物与微生物互作.
E-mail:linglijun@nwnu.edu.cn
独角莲内生细菌TG116的分离鉴定及
抑菌特性研究
令利军,雷 蕾,冯 蕾,何 楠,丁 兰
(西北师范大学 生命科学学院,甘肃 兰州 730070)
摘要:以从独角莲块茎内分离到的细菌TG116为研究对象,通过16SrRNA序列分析结合形态特征和生理生化特性
对TG116进行鉴定,采用皿内涂布、平板对峙和异步培养等方法研究其抑菌特性,并对其生长曲线、最适温度、最
适pH值及耐盐性等进行了系统研究.结果表明:TG116对辣椒疫霉病菌(Phytophthora capsici)等7种供试植物病原
菌均有良好的掏抑制作用,表现出对植物病原真菌的广谱抗性且能使病原菌菌丝扭曲、变形等.结合形态学、生理生
化指标和16SrRNA序列分析等结果,初步鉴定TG116菌株为地衣芽孢杆菌(Bacillus licheniformis).研究结果为生
物防治作物病害提供新的菌种资源,为开发和利用独角莲内生拮抗菌提供了理论依据.
关键词:独角莲;内生菌;鉴定;抑菌特性;生长特性
中图分类号:Q 939.9    文献标志码:A    文章编号:1001-988Ⅹ(2014)05-0091-07
Isolation and identification of endophytic bacterium
TG116fromTyphonium giganteum
and its antimicrobial characteristics
LING Li-jun,LEI Lei,FENG Lei,HE Nan,DING Lan
(Colege of Life Science,Northwest Normal University,Lanzhou 730070,Gansu,China)
Abstract:The study is focused on the endophytic bacterium strain TG116isolated from the tuber of
Typhonium giganteum Engl.Morphological,physiological and biochemical characteristics of TG116are
identified using 16SrRNA sequence analysis.Antimicrobial characteristics of TG116are studied using
surface spread plate experiment,confront antibiotic culture experiment and differed antagonism
procedure.The growth curve,optimum temperature,optimum pH value and salt tolerance of strain
TG116are systematicaly studied in this paper at the same time.Results show that strain TG116display a
wide range of antifungal spectrum which exhibite antibiotic activities toward al the 7 tested
phytopathogens including Phytophthora capsici.The strain can cause the mycelia of fungi into distortion
and deformation.According to its morphological,physiological and biochemical characteristics and 16S
rRNA sequence analysis,the strain is preliminarily identified as Bacillus licheniformis.This study can
supply new strain resource for the biological control of crop disease and can also provide evidence for
exploring and utilizing antimicrobial endophytic bacteria in Typhonium giganteumEngl.
Key  words: Typhonium giganteum  Engl; endophytic  bacteria;identification; antimicrobial
characteristics;growth characteristics
19
西 北 师 范 大 学 学 报 (自然科学版)   第50卷 
Journal of Northwest Normal University(Natural Science)   Vol.50 
  一直以来,真菌病害引起的农作物减产及采后
损失都是影响农业生产的主要问题之一,化学药剂
是目前防治植物病害的主要措施,但其易导致病原
菌产生抗药性、有害物质残留、环境污染、伤害非
靶标生物和危害人类健康等问题的出现,生物防治
在应用中无污染、对环境安全、成本较低且有利于
提高农田生态系统生物多样性从而越来越受到人们
的重视[1].内生菌对化学药剂难以发挥作用的植
物维管束病害、土传病害和系统性病害的防治具有
独特优势[2].迄今为止,已从块根芍药、甘草、
蛇足石杉、铁棍山药等药用植物和马铃薯、番茄、
甘蓝和水稻等植物中获得对多种植物病害具有良好
抑制作用的内生菌[3].植物内生菌(Endophyte)指
的是一类在其生活史的一定或全部阶段生活于健康
植物各种组织及器官内部的真菌或细菌,宿主植物
至少在短期内不会表现出外在症状[4].植物内生
菌与宿主植物在长期的协同进化过程中形成了十分
密切的关系,内生菌在从宿主植物获得稳定生活环
境的同时也会通过产生水解酶类、抗生素类和生物
碱类等代谢产物,与病原菌竞争营养物质,诱导宿
主植物产生系统抗性以及增强植物的抵抗力等途径
发挥生物防治作用[5].
独角莲(Typhonium giganteum Engl)为中国
特有植物,属于天南星科(Araceae)、犁头尖属
(Typhonium),它的干燥块茎被用作药材,常称
为 “禹白附”;其化学成分丰富且药理作用广泛,
具有抗菌抗炎、抗肿瘤、抗破伤风毒素、免疫调
节、抗惊厥、镇静、祛风痰等功效[6],且独角莲
在生长过程中几乎不感染病虫害,根据药用植物内
生菌可产生与宿主相似甚至相同的活性物质且某些
活性物质可能参与到了植物的抗菌过程中推测[7],
与独角莲协同进化的内生菌也可能具有其独特性.
国内外学者注重于独角莲的药理作用、临床应用研
究和化学成分的提取,而关于独角莲内生菌的研究
未见报道.
本研究从独角莲块茎中分离得到1株对多种植
物 病 原 真 菌 均 有 良 好 抑 制 作 用 的 内 生
B.licheniformis,并命名为 TG116.研究结果对
TG116及类似生防菌的抑菌机制和应用推广提供
材料和理论依据.
1 材料与方法
1.1 材料
健康独角莲(T.giganteumEngl.)植株,采自
甘肃陇南文县.供试植物病原真菌为辣椒疫霉病菌
(Phytophthora capsici)、 辣 椒 炭 疽 病 菌
(Colletotrichum capsici)、马 铃 薯 立 枯 丝 核 菌
(Rhizoctonia solani)、小麦赤霉病菌(Fusarium
graminearum )、 黄 瓜 枯 萎 病 菌 (Fusarium
oxysporum)、黄瓜灰霉病菌(Botrytis cinerea)、
番瓜绵疫病菌(Pythium aphanidermatum),均由
甘肃省农业科学院植物保护研究所惠赠.供试细菌
为大肠杆菌(Escherichia coli)、金黄色葡萄球菌
(Staphylococcus aureus)、枯草芽孢杆菌(Bacillus
subtilis),均由本实验室保存.
独角莲内生细菌的分离、纯化和培养采用营养
琼脂培养基(NA),植物病原真菌的培养及拮抗性
实验采用马铃薯葡萄糖琼脂培养基(PDA).营养
琼脂培养基(NA):牛肉浸膏3g,蛋白胨10g,
氯化钠5g,琼脂18g,加水定容至1 000mL,
pH 7.0~7.2;马铃薯葡萄糖琼脂培养基(PDA):
马铃薯200g,葡萄糖20g,琼脂18g,加水定容
至1 000mL,pH自然.
1.2 TG116菌株的分离
参照梁洁等[8]的方法对独角莲块茎进行表面
清毒,取表面消毒处理后的独角莲块茎,无菌条件
下切成大小约0.5cm×0.5cm的组织块,置于分
离培养基上,使切口面与培养基接触,置于37℃
培养2~5d,待组织块周围长出菌落后,挑取转移
到新的培养基上,划线法纯化后保存备用[9].利
用漂洗液检验法和组织印迹法设两种空白对
照[9,10].TG116为分离菌株中的一株.
1.3 TG116菌株抑菌实验
1.3.1 菌株对植物病原真菌的抑制作用 将在
PDA培养基上活化和扩大培养后的供试植物病原
真菌打成直径为6mm 的菌饼,采用皿内涂布
法[11]、平板对峙法[12]和异步培养法[13]研究TG116
菌株对植物病原真菌的抑制能力,相对抑菌率=
(对照组病原真菌生长量-试验组病原真菌生长
量)/对照组病原真菌生长量×100%.参照文献
[14]的做法研究TG116菌株对植物病原真菌菌丝
形态的影响.
1.3.2 菌株对细菌的抑制作用 参照文献[15]的
做法,选用大肠杆菌、金黄色葡萄球菌和枯草芽孢
杆菌为供试菌.
1.4 TG116菌株的鉴定
1.4.1 形态观察及生理生化分析 参照文献[16]
的做法对TG116菌株进行扫描电镜观察,参照《常
见细菌系统鉴定手册》[17]观察 TG116菌株的培养
形态、革兰氏染色并测定其生理生化特征.
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1.4.2 16SrRNA序列测定及系统发育分析 采
用菌落PCR的方法扩增 TG116的16SrRNA 片
段,将30μL无菌水加入1.5mL离心管中并挑取
少量菌体于水中制成悬液,先煮沸10min,再迅
速放入冰中5min,以12 000r·min-1离心10min
后的上清液作为PCR模板[18],采用细菌通用引物
27F(5′-AGA GTT TGA TCC TGG CTC AG-3′)
和1492R(5′-GGT TAC CTT GTT ACG ACT T-
3′)[19],参照张国庆等[20]的方法扩增菌株 TG116
的16SrRNA.所得序列经校对后与GenBank数据
库中 的 已 有 序 列 进 行 BLAST 比 对 分 析,用
MEGA 6.0软件采用邻接法(Neighbor-Joining)聚
类分析,并构建系统发育树[21].
1.5 TG116菌株的生长特性分析
参照陈美标及王英等的报道[22,23],略有修改.
1.5.1 生长曲线的制作 将TG116菌株的新鲜种
子液以 1% 的接种量接入 NA 液体培养基中,
35℃,220r·min-1振荡培养,每隔2h取样,用分
光光度计测不同培养时间细菌悬浮液在OD600处的
吸光值,以不接种的NA液体培养基为空白对照.
1.5.2 最适生长温度的测定 将TG116菌株的新
鲜种子液以1%的接种量接入 NA液体培养基中,
分别置于20℃,25℃,30℃,35℃,40℃,45℃,
50℃,55℃,60℃,65℃,70℃下220r·min-1振荡
培养,10h后取样,用分光光度计测OD600,以不
接种的NA液体培养基为空白对照.
1.5.3 最适生长pH 值的测定 制备pH 分别为
3.0,4.0,5.0,6.0,6.5,7.0,7.5,8.0,8.5,9.0和
10.0的NA液体培养基,将TG116菌株的新鲜种
子液以1%的接种量接入不同pH值的NA液体培
养基中,35℃,220r·min-1振荡培养,10h后取
样,用分光光度计测OD600,以不接种的NA液体
培养基为空白对照.
1.5.4 耐盐性测定 将TG116菌株的新鲜种子液
以1%的接种量分别接种于 NaCl添加质量分数为
3%,4%,5%,6%,6.5%,7%,7.5%,8%,8.5%,
9%,10%的NA液体培养基中,35℃,220r·min-1
振荡培养,10h后取样,用分光光度计测不同
NaCl质量分数细菌悬浮液在 OD600处的吸光值,
以不接种的NA液体培养基为空白对照.
以上实验均至少设置3次重复.
2 结果与分析
2.1 TG116菌株对植物病原真菌的抑制作用
采用皿内涂布法、平板对峙法和异步培养法分
别评价了TG116菌株对供试植物病原菌的抑制能
力.结果显示,TG116菌株对供试的7种植物病
原菌均有良好抑制作用,为广谱型抑制菌.皿内涂
布法试验(图1A,B)中处理组供试植物病原菌与对
照组相比几乎不生长,故只能作为对TG116菌株
抑制能力的定性评价.通过平板对峙法(图1C,D)
进一步对菌株的抑制能力做了定量评价,结果如表
1所示.异步培养法处理组供试植物病原菌与对照
组相比也几乎不生长,表明TG116菌株发酵液中
含有对供试植物病原菌有强抑制作用的物质.
表1 TG116菌株对植物病原真菌的抑菌活性
Tab 1 Antibiotic activity of strain TG116
to pathogenic fungi
植物病原真菌Pathogenic fungi 抑菌率Inhibition rate/%
辣椒疫霉病菌P.capsici  81.98
辣椒炭疽病菌C.capsici  74.42
马铃薯立枯丝核菌R.solani  74.88
小麦赤霉病菌F.graminearum  84.83
黄瓜枯萎病菌F.oxysporum  75.78
黄瓜灰霉病菌B.cinerea  72.85
番瓜绵疫病菌P.aphanidermatum  78.69
图1 TG116菌株对植物病原真菌的抑制作用
Fig 1 Antibiotic activity of strain TG116against the pathogenic fungi
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西 北 师 范 大 学 学 报 (自然科学版)   第50卷 
Journal of Northwest Normal University(Natural Science)   Vol.50 
  镜检结果显示(图2),受到 TG116菌株影响
的植物病原菌菌丝形态与对照相比有明显差异,对
照菌丝形状均匀、细长,直立整齐有规律,生长旺
盛、密集饱满;受到TG116菌株影响的病原菌菌
丝形态发生变化,许多菌丝扭曲、变形,部分菌丝
变得透明干瘪,原生质外渗造成菌丝中空干枯.
2.2 TG116菌株对细菌的抑制作用
抑菌实验结果显示,TG116菌株对大肠杆菌、
金黄色葡萄球菌和枯草芽孢杆菌没有拮抗作用,表
明TG116为真菌特异型生防菌.
2.3 TG116菌株的鉴定
2.3.1 形态及生理生化鉴定 TG116菌株在 NA
培养基上菌落呈扁平圆形,边缘不规则,表面较光
滑,不产生色素,全株为乳白色,革兰氏染色为阳
性(图3A);扫描电镜观察为棍棒状,大小为(0.7
~0.9)μm ×(3~6)μm(图3B).TG116生理生化
特性实验结果见表2,结合其形态特征,初步将菌
株TG116归于芽孢杆菌属.
图2 TG116菌株对植物病原真菌菌丝的抑制作用
Fig 2 Antibiotic activity of strain TG116against the mycelia of fungal phytopathogens
   A.TG116 菌 株 革 兰 氏 染 色 形 态 (Gram strain
morphology of strain TG116);B.TG116菌株扫描电镜图
(The SEM picture of strain TG116)
图3 TG116菌株的形态
Fig 3 The morphology of strain TG116
2.3.2 分子生物学鉴定 采用细菌通用引物PCR
扩增16SrRNA,扩增片段纯化后克隆并测序,将
TG116菌株的16SrRNA 序列向 GenBank提交,
其序列登录号为 KJ726769.测序结果同源比对显
示,TG116菌株16SrRNA序列与芽孢杆菌属16S
rRNA高度相似,其中与B.licheniformis W-2(登
录号:GU216262.1)同源性为99%.从构建的系
统发育树来看(图4),TG116与地衣芽孢杆菌
B.licheniformis W-2(登 录 号:GU216262.1)、
B.licheniformis  KIBGE-IB5 (登 录 号:
EF656455.1)和B.licheniformis JK-SH001(登录
号:GQ169783.1)同源性高达99%.
图4 基于16SrRNA序列构建的TG116菌株的系统发育树
Fig 4 Phylogenetic tree of strain TG116based on 16SrRNA sequences
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表2 TG116菌株的生理生化特征
Tab 2 Physiological and biochemical characteristics
of strain TG116
测定指标 Test index 结果Results
接触酶Peroxidase +
厌氧生长Anaerobic growth +
明胶液化Gelatin liquefaction +
淀粉水解Amylolysis +
柠檬酸盐利用Citrate utilization +
丙酸盐利用 Malonic acid utilization +
甲基红 Methyl red test -
硝酸盐还原Nitrate reduction +
纤维二糖Celobiose +
2% NaCl生长Growth under 2% NaCl +
5% NaCl生长Growth under 5% NaCl +
7% NaCl生长Growth under 7% NaCl +
生长pH 5.7Growth under pH5.7 +
葡萄糖Glucose +
阿拉伯糖Pectinose +
木糖Xylose +
甘露醇 Mannitol +
果糖Fructose +
乳糖Lactose -
V-P测定V-P determination +
蔗糖Sucrose +
10℃生长 Growth at 10℃ -
40℃生长 Growth at 40℃ +
50℃生长 Growth at 50℃ +
55℃生长 Growth at 55℃ +
生长pH 6.8Growth under pH6.8 +
   “+”表示阳性(means positive reaction),“-”表示
阴性(means negative reaction).
  结合形态学、生理生化指标和16SrRNA序列
综合分析结果,将TG116菌株初步鉴定为地衣芽
孢杆菌(Bacillus licheniformis).
2.4 TG116菌株的生长特性
2.4.1 生长曲线 结果显示,0~8h间生长缓
慢,处于迟缓期;8~16h间活菌数增长迅速,处
于对数生长期;16h之后曲线平稳,生长进入稳
定期,16~48h间处于稳定生长期;接种48h后
进入衰退期(图5).
2.4.2 最适生长温度 温度对TG116菌株的生长
影响较大(图6),其在20~60℃范围内均能生长,
生长温度范围较广,最适生长温度为45℃.
2.4.3 最适生长pH 值 由图6可知,培养基的
初始pH对TG116菌株的生长有明显影响,其在
初始pH值3.0~9.0范围均可生长,具有较宽的
pH值适应范围;pH值在5.0~8.0范围内菌株生
长良好,最适生长初始pH值为7.0.
2.4.4 耐盐性能 如图7可知,与不添加 NaCl
相比,在培养基中加入NaCl后对菌株的生长均有
一定的影响,TG116菌株在低钠离子浓度下能正
常生长,高浓度的钠离子明显抑制了其生长.
图5 TG116菌株的生长曲线
Fig 5 The growth curve of strain TG116
图6 温度和pH值对TG116菌株生长的影响
Fig 6 The effects of temperature and pH
on the growth of strain TG116
图7 不同NaCl含量对TG116菌株生长的影响
Fig 7 The effects of different contents of NaCl
on the growth of strain TG116
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3 讨论
植物内生菌本身就存在于植物体内,具有便于
优先占据有益于生物防治的生态位、能够经受住植
物自身的防卫反应、生存环境稳定等优势[2,4],植
物内生菌同时还是良好的外源基因载体,为固氮、
抗病及杀虫等外源基因向植物体内的转移提供了新
的途径和方法[5].与分离自土壤等的生防菌相比
而言,TG116作为内生菌可能更易于在植株中定
殖、增殖,更有利于其生防作用的发挥.
药用植物有其独特的药理活性,特别在治疗某
些疑难杂症上具有不可替代的作用[24].药用植物
内含有丰富的生防资源菌,这些内生菌能够产生具
有抗菌等多种活性的产物,是植物病害生物防治的
重要微生物资源[3].药用植物这一宝贵的生防菌
资源库为筛选活性代谢产物及发现新物种提供了广
阔的研究空间,将内生菌的研究与药用植物的研究
相结合,寻求能够产生与宿主植物具有相似或相同
药理作用成分的内生菌,对突破药用植物生长周期
长等限制及对濒危药用植物资源的保护也具有积极
的作用[25].
本实验从独角莲块茎内分离到的TG116菌株
对7种供试植物病原真菌均有良好的抑制作用,为
广谱型植物病原真菌拮抗菌,能够使病原菌菌丝扭
曲、变形等.对TG116进行形态学、生理生化特
征和分子生物学鉴定,其形态学和生理生化反应与
芽孢杆菌属特征基本相似,16SrRNA序列的比对
分析显示TG116菌株属于芽孢杆菌属,与地衣芽
孢杆菌(Bacillus licheniformis)同源性高达99%,
与形态学和生理生化反应结果一致,因而确定
TG116 菌 株 为 地 衣 芽 孢 杆 菌 (Bacillus
licheniformis).地衣芽孢杆菌能够代谢产生抗生
素和抗菌蛋白等多种物质,在工业及医药业应用广
泛,在植物病害的防治中也具有利用价值,是一种
具有极高应用价值的微生物[26,27].芽孢杆菌因其
菌体本身及所产生的抗菌物质在防治病害及促进植
物生长发育等方面均有良好的效果而成为植物病害
生物防治的研究热点[28],其在自然界中存在广泛,
也是植物体内常见的内生细菌,不污染环境且对人
畜无毒无害,能够产生多种酶和抗菌素,抗菌活性
具有广谱性,不产生耐药性,生长快且所需营养简
单,能产生具有强耐热和抗逆性能的芽孢,在长期
储存过程中存活率高,芽孢杆菌所具有的特性有益
于其相关生防菌剂的生产、加工和在环境中存活、
定殖及繁殖等[29].目前,已有一些芽孢杆菌优势
菌株作为生物农药投入到植物病害防治的应用中,
在国外一些菌株已登记为生物杀菌剂用于防治多种
真菌病害[30].迄今为止,关于独角莲内生菌的研
究未见报道,TG116丰富了内生地衣芽孢杆菌的
资源,为生物防治作物病害提供了新的微生物资
源,且本研究表明,TG116菌株生长繁殖快,酸
碱条件和温度环境适应范围广泛,抑菌谱广,这些
都显示了该菌在植物病害生物防治方面的潜在应用
价值,其防病机理、促生作用、实用发酵条件及田
间应用效果等还需做进一步研究.
致谢:感谢甘肃省农业科学院植物保护研究所
李继平研究员惠赠植物病原真菌.
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(责任编辑 俞诗源)
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