全 文 ：菊三七碱的分子及晶体结构
华子千 徐筱杰
(北京大学生物系、
卫新成
化学系)
唐世蒙 吴余芬
( 江苏省植物研究所 )
摘 要
本文报导 T 从菊叶三七 〔G y n u r a s e g e t u m (L o u r . ) M e r r . 〕中提取的一个大环
双稠咄咯咤生物碱的分子及晶体结构 。 晶体为正交晶系 , 晶胞参数 : a 二 9 . 0 0 4 ( 3 )
A
, b 二 2 1 . 3 3 2 ( 3 ) A
, 。 = 1 7 . 1 7 3 ( 7 ) A
。 空间群为 D 鱼 p 2 1 2 1 2 1 , z = 4 , D o a : = 2 . 2 7
g /c 护 。 结构模型由 S H E L x T L 程序解出, 经最小二乘修正 , 最后的 一 致性 因子
R =
。
0 5 4 。
该化合物分子在咄咯核 e ( 1 )一C ( 2 ) 间是双键 ; o ( , )一c ( s )一C ( ; )一c ( 2 ) 双面角为
106
.
5 。 ; 大环包括 12 个原子 , 环上连接的侧基与有毒的千里光碱 (S en ec io n in e) 相
同 。
菊叶三七 〔G y n u r a s e g e t u m ( L o u r . ) 〔M e r r . 〕是一种菊科植物 , 民间常用于治疗内出
血 、跌打损伤 ,无名肿毒 ; 1 9 7 2年发现对疟原虫的抑制率高达89 % 。 江苏省植物研究所对菊三
七的抗疟成分作 了系统的提取鉴定工作 , 并从菊三七根中提得一种有抗疟作用的结晶〔’“。 我
们在培养该晶体准备进行结构分析过程中 , 得到一种棱柱状的单晶 。 经过分析 , 并与已知的
双稠咄咯咙生物碱的分子及 晶体结构进行比较 , 发现该晶体中存在着包含 12 个原子的大环 ,
环上连接的侧基与千里光碱一致的双稠毗咯生物碱分子 〔7 ’, 〔“ ’。
千里光碱是一种对人和哺乳动物有毒的双稠咄咯咤生物碱 , 许多菊科植物均含此类生物
碱 , 在某些国家发现此类生物碱对人 、 特别对畜牧业已造成了严重的问题 红’二, 仁舀〕 。 因此 , 对这
一类有毒生物碱的分子及晶体结构以及在植物中的分布 , 特别引起人们的注意 , 并作专门的
调查研究。 本文不单为研究这类化合物的结构与功能关系提供了新的数据 , 而且证明在菊三
七中亦含有这种有毒生物碱 , 这为临床上如何更好使用菊三七以及为防止该种植物造成人及
食草家畜中毒提供了依据 。
实 验
将菊三七碱溶于95 %乙醇 , 在室温下使溶剂慢慢蒸发 , 几天后长出质量较好的单晶 。 晶
体为无色棱柱状 。
衍射数据是在 S Y N T E x P 3 四圆衍射仪上 , 用铂靶 K 。 射线 , 以 2 0 : 口 扫描方式收集 。
在 3 。< 20 < 53 “ 范围内收集到独立衍射点2 1 1。个 , 可观察点占 90 . 9 % 为 1 9 1 7 [ 工> 1 . 9 6占
( 2 )〕。
DOI：10.13209/j.0479-8023.1983.042
9 0 北 京 大 学 学 报
晶体为正交晶系 , 分子式 e 工。H 2 5 o 5 N , a = 9 . 0 0 4 ( 3 ) A, b = 1 1 . 3 3 2 ( 3 ) A , e = 1 7 . 1 7 3
( 7 ) A ; z = 4 , v 二 1 7 5 2 . 2 ( 1 . 1 ) A , , D 。 : 1= 1 . 2 7 9 / e m , , F (0 0 0 ) = 7 2 0 ( e ) , 拌 (M o K a ) =
1
.
o e m
一 ‘。 根据 h o o , o k o , 0 0 1 消光规律 , 确定空间群为 p Z , 2 , 2 : 。
二 、 结构浏定与修正
数据经过经验吸收校正和 L 一P 校正 , 由 W ils o n 统计得到整体温度因子 B = 3 . 97 , 比
例因子 K 一 。. 0 5 0 8 。 应用 s H E L x T L 程序获得了 E 图 , 从 E 图中引出部分非氢原子的原子
坐标 。 接着进行了 F o ur ie r 合成 , 得到全部非氢原子坐标 。 然后对全部非氢原子采用块矩阵
最小二乘法进行各向同性温度因子修正 , R = 。. 0 9饥
从差值 Fo ur ie r 图中确定 了23 个氢原子坐标 , 其它氢原子坐标是按非氢原子坐标参数以
理论键长、 键角计算得到 。 然后对全部非氢原子坐标参数及各向异性温度因子 , 对氢原子坐
标参数及各向同性温度因子进行修正。 最后 , 得到 R :一 。5 4 , R Z一 。3 20
三 、 分子及晶体结构的描述
妇C杆
菊三七碱分子 C l 。H : S ON 的结构式如下 :
立体结构模型见图 1 ; 分子在晶胞中的坐标参
数及热参数列表 1 ; 键长、 键 角 数据 列于表
2 。
菊三七碱分子的耽咯环在 C ( , ) 与 C ( : ) 之
间有一个双键 。含有双键的五员环 (C ( 、。 , c ( 2 ) ,
C ( 3 ) , N , C ( 7 ) )是一个平面 , 与邻近的饱和 五
员环成一定角度 , C ( 魂) , N , c ( : 。与C ( 7 ) , N ,
C。 ) 的双面角为 1 25 . 7 “ 。 饱和 五 员环 (N,
C ( 4 ) , C ( 。) , C ( 。》, C ( 了 ) ) 的C (。 )原子往外突出 , 偏
离同一平面 0 . 2 5 A , 致使 C ( 。 ) , C ( 。 ) , C ( 7 ) 与 C ( ‘) ,
= 0 3
C ( : ) , C ( 。、的双面角成 4 0 . 3 “ 。 含有双键
的五员环的平面方程和原子偏离平面的距离列于表 3 。
分子的大环包括 12 个原子 。 在 C ( 。) , C ( : ‘ , 位置的毅基 与大环平均平面成一定角度 , 分
别为 6 2 . 0 。与 5 4 , 8 “ 。 内酩键周围的五个原子 ( C ( : 3 ) , C ( : ‘) , O ( : 。, 0 ( 2 ) , C ( 。 ) 和 C ( 工。) , C ( 。) ,
0 ( 3 ) , 0 ( 工) , C ( 。 ) ) 大体位于同一平面。 平面方程及原子偏离平面的距离列于表 3 。 两面的双
面角为16 . 8 7 。 。 大环内有两个不对称碳原子 (C 盖。) 和 C六, ) ) 。 C六。) 上的两个侧基是甲基和羚
基 , e 六l ) 上的侧基是甲基 , C ( 1 。) , C 。: 1 ) , C 。1 。, 与 C ( , : ) , C ( : : ) , C ( 1 。, 的双面角为 4 5 . 4 2 。 。
C ( 工 3 ) 与 C ( 1 7 )之间是双键 , 与双键有关的原子 ( C ( : 3 ) , C ( 1 了) , C 。, 。 ) , C 。: : ) , C ( 1 4 ) ) 共面 , 平
面方程列于表 3 , 它与淡基平面 ( C ( 1 ‘ ) , C ( : : ) , o ( ; ) , o ( 2 ) ) 的夹角为4 6 . 4 3 。 。
整个大环的扭角列于表 4 。
分析分子间的相互接触距离 , C 、: 。 ) 上 O H 基与另一分子的 N 原子间的距离为 2 . 80 A ,
0 一H. “ N 间的角度为 1 5 9 . 了。 , 存在分子间的氢键 。 图 2 示出晶胞在 仁 方向投影 , 突出表示
菊三七碱的分子及晶体结构 9 1
表一 原 子 坐 标 及 热 参 数 值
原 X
· 1 0
( SD )
Y · 10 4
( S D )
Z · 1 0 4
( SD )
B i z( s D ) B 2 2 ( S D ) B 3 3 ( s D ) B i Z (s D ) B i 3 ( s n ) B 2 3 ( s D )子
C ( 1 )
C ( 2 )
C ( 3 )
N
C ( 4 )
C ( 5 )
C ( 6 )
C ( 7 )
C ( 8 )
0 ( 1 )
C ( 9 )
C ( 1 0 )
C ( 1 1 )
C ( 1 2 )
C ( 1 3 )
C ( ! 4 )
0 ( 2 )
0 ( 3 )
C ( 1 5 )
0 ( 5 )
C ( 1 6 )
C ( 1 7 )
C (1 8 )
0 ( 4 )
5 3 4 2 ( 4 )
63 5 2 ( 4 )
6 3 6 5 ( 4 )
5 3 0 7 ( 3 )
4 2 3 9 ( 4 )
2 7 94 ( 4 )
2 8 7 7 ( 3 )
4 5 12 ( 3 )
5 1 5 5 ( 4 )
3 8 3 3 ( 3 )
4 0 6 6 ( 4 )
2 5 9 4 ( 4 )
1 4 5 8 ( 4 )
1 9 5 8 ( 4 )
1 0 8 0 ( 4 )
1 1 8 0 ( 3 )
2 6 1 8 ( 2 )
5 2 5 7 ( 3 )
2 1 0 5 ( 5 )
2 8 9 7 ( 3 )
4 9 7 6 ( 5 )
2 1 5 ( 4 )
7 1 5 ( 4 )
1 6 2 ( 2 )
2 4 6 5 ( 3 )
3 1 8 3 ( 3 )
3 15 6 ( 3 )
2 1 8 8 ( 2 )
2 4 8 9 ( 3 )
1 9 4 4 ( 3 )
2 1 1 0 ( 3 )
1 8 3 5 ( 3 )
2 15 6 ( 3 )
2 7 4 2 ( 2 )
3 8 1 5 ( 3 )
4 3 3 7 ( 3 )
4 3 8 2 ( 3 )
5 1 5 4 ( 3 )
4 9 2 3 ( 3 )
3 6 9 4 ( 3 )
3 3 3 6 ( 2 )
4 2 7 8 ( 2 )
3 5 9 3 (4 )
5 4 8 5 ( 3 )
5 0 6 ( 6 )
5 7 3 6 ( 3 )
5 5 7 5 ( 4 )
3 0 7 4 ( 2 )
2 4 7 9 ( 2 )
2 1 7 9 ( 2 )
1 32 3 ( 2 )
1 1 1 7 ( 2 )
5 1 0 ( 2 )
8 0 4 ( 2 )
1 6 7 6 ( 2 )
1 8 35 ( 2 )
3 3 15 ( 2 )
3 6 4 9 ( 1 )
3 9 7 6 ( 2 )
4 2 83 ( 2 )
3 6 4 0 ( 2 )
2 9 5 4 ( 2 )
2 2 2 2 ( 2 )
1 9 0 2 ( 2 )
1 8 8 9 ( 1 )
4 0 2 0 ( 2 )
4 9 9 3 ( 2 )
4 5 9 9 ( 1 )
6 1 0 5 ( 3 )
1 8 8 1 ( 2 )
1 1 6 1 ( 3 )
1 7 1 1 ( 2 )
3
.
7 ( 2 )
3
.
5 ( 2 )
4
.
2 ( 2 )
3
.
2 ( 1 )
3
.
9 ( 2 )
3
.
3 ( 2 )
3
.
6 ( 2 )
3
.
2 ( 1 )
6
.
8 ( 2 )
6
.
7 ( 2 )
6
.
8 (2 )
5
.
6 (2 )
4
.
3 (2 )
4
.
2 (2 )
3
.
6 (2 )
2
.
9 ( 1 )
3
.
1 ( 1 )
4
.
4 ( i )
7
.
9 (3 )
6
.
1 ( 2 )
3
.
7 (2 )
4
.
1 ( 2 )
5
.
6 (2 )
2
.
6 ( 1 )
3
.
3 (2 )
3
.
8 (2 )
4
.
6 ( 2 )
3
.
5 ( 1 )
6
.
2 ( 2 )
5
.
0 ( 2 )
2
.
6 ( 1 )
3
。
1 ( 2 )
4
.
6 (2 )
4
.
3 ( 1 )
3
.
4 ( 2 )
4
.
1 ( 2 )
4
.
7 ( 2 )
3
.
4 ( 2 )
3
.
0 ( 2 )
3
.
2 ( 2 )
3
.
0 ( 1 )
4
.
8 ( 1 )
6
.
4 ( 2 )
4
.
8 ( 1 )
2 1
‘
7 ( 6 )
3
.
6 ( 2 )
5
.
4 ( 2 )
3
.
9 ( 1 )
3
.
6 ( 2 )
5
.
7 ( 2 )
5
.
5 ( 2 )
3
.
7 ( 1 )
3
.
5 ( 2 )
3
.
8 ( 2 )
3
.
8 ( 2 )
3
.
1 ( 2 )
3
.
5 ( 2 )
3
.
4 ( 1 )
2
.
3 ( 2 )
3
.
0 ( 2 )
3
.
7 ( 2 )
4
.
1 ( 2 )
3
.
8 ( 2 )
3
.
1 ( 2 )
3
.
7 ( 1 )
6
.
5 ( 2 )
3
.
6 ( 2 )
3
.
8 ( 1 )
9
.
3 ( 4 )
4
.
9 ( 2 )
6
.
4 ( 3 )
7
.
2 ( 2 )
1
.
2 ( 1 )
0
.
0 ( 2 )
一 0 . 3 (2 )
0
.
6 ( 1 )
0
.
7 ( 2 )
0
.
9 ( 2 )
0
.
1 ( 1 )
0
.
5 ( 1 )
1
.
5 ( 2 )
一 0 . 9 ( 1 )
一 0 . 7 ( 2 )
一 1 . 8 (2 )
一 1 . 2 (2 )
一 0 . 5 (2 )
一 0 . 2 ( 2 )
0
.
5 ( 1 )
0
.
3 ( 1 )
一 1 . 1 ( 1 )
一 3 . 2 (2 )
一 1 . 6 (1 )
一 1 . 3 (4 )
0
.
6 (2 )
1
.
7 (2 )
一 0 . 2 ( 1 )
一 0 . 8 ( 1)
一 1 . 1 (2 )
一 0 . 2 ( 2 )
0
.
1 ( 1 )
一 0 . 2 ( 2 )
一 0 . 3 ( 1 )
一 0 . 1 ( 1 )
0
.
1 (1 )
一 0 . 7 (2 )
0
.
1 ( 1 )
一 0 . 2 ( 2 )
0
.
9 ( 2 )
1
.
0 ( 2 )
0
.
2 (2 )
0
。
7 ( 1 )
0
.
2 ( 1 )
一 0 . 2 ( 1 )
一 0 . 2 ( 1 )
1
.
3 (2 )
1
.
3 ( 1 )
一 0 . 9 (3 )
0
.
5 (2 )
一 0 . 9 ( 2 )
一 0 . 6 ( 1 )
一 0 . 2 ( 1 )
一 0 . 5 ( 2 )
0
.
4 ( 2 )
0
.
2 ( 1 )
0
.
5 ( 2 )
一 0 . 9 (2 )
一 0 。 4 ( 1 )
一 0 . 1 ( 1 )
一 0 . 1 ( 2 )
一 0 . 6 ( 1 )
0
.
3 ( 1 )
一 0 . 6 ( 1 )
一 0 . 6 (2 )
一 0 . 5 (1 )
一 0 . 3 ( 1 )
0
.
2 ( 1 )
一 0 . 3 ( 1 )
一 0 . 4 ( 1 )
0
.
6 ( 2 )
一 1 . 3 ( 1 )
6
.
4 ( 4 )
一 0 . 1 ( 2 )
0
,
6 ( 2 )
一 0 . 4 ( l )
9 2 北 京 大 学 学 报
表二 分 子 的 键 长 和 键 角
A 键 长 A 键 角 度 键 角 度 键 角
C i 一 C Z
C i 一 C 7
C I 一 C a
C Z一C 3
C‘一C S
C。一C 了
C : 一N
C一N
C 3 一N
0 2 一 C。
0 2 一 C 1 4
0 ‘一 C i ‘
C 13 一C z;
C 1 3一 C z 7
1
.
3 3 ( l )
1
.
5 1 ( 1 )
1
。
4 9 ( 1 )
1
.
4 7 ( 1 )
1
.
5 3 ( 1 )
1
.
5 3 ( 1 )
1
.
4 8 ( 1 )
1
.
4 6 ( 1 )
1
.
5 0 ( 1 )
1
.
4 6 ( 1 )
1
.
3 6 ( 1 )
C i 7 一 C i 。
C i 3 一C 1 2
C 1 2 一C l i
C i i 一C i 。
C i o 一C l i
C i o 一C l 。
C i o 一0 5
C i o 一C ,
C , 一 0 3
C s 一 0 1
0 1 一C 。
1 5 0 ( 1 ) 1 C 6 一 0 2 一C z ‘
1
.
2 0 ( 1 ) 1 C S一 C s
1
.
5 1 ( 1 )
1
.
5 4 ( l )
1
.
4 1 ( 1 )
1
.
5 1 ( 1 )
1
.
5 5 ( 1 )
1
.
4 ( 1 )
1
.
5 4 ( 1 )
1
.
2 0 ( 1 )
1
.
3 6 ( 4 )
1
.
4 8 ( 1 )
1
.
5 1 ( 1 )
1
1
.
5 0 ( 1 )
.
3 4 ( 1 )
0 2 一C z ; 一0 ‘
C l : 一C 一‘一0 ‘
C i 。一C i ‘一0 2
C i 3 一C i 7 一C l s
C i广C 13 一C i 4
C i Z一C i 3 一C i -
C i Z一C i 3 一C i :
C i i 一C zZ 一C i 3
C i o一 C l i 一 C i 6
C xz 一 C I广 C i 。
C i Z一 C i i 一C i o
C i : 一 C i o一 0 。
0 5 一 C i 。一C l i
1 1 6
.
2 (2 )
1 2 3
.
3 (3 )
1 2 6
.
7 (3 )
1 0 9
.
9 (3 )
12 6
.
7 ( 3 )
12 0
.
9 ( 3 )
1 1 5
.
8 ( 3 )
1 2 3
.
3 ( 3 )
1 2 2
.
8 ( 3 )
1 1 4
.
8 ( 4 )
11 7
.
6 ( 4 )
1 1 2
.
5 ( 3 )
1 0 4
.
5 ( 3 )
1 1 2
.
0 (3 )
C 2 2 一C i o 一C 。
C i s 一C i o 一 C i i
0 5 一 C 1 0 一 C。
C 25 一 C i o 一 C。
0 3 一 C。一0 1
C i o 一 C。一 0 1
C i o 一C , 一 0 5
C。一 0 1 一C 。
C i 一 C a 一0 1
C : 一 C i 一C S
C Z一C l一 C :
C : 一C i一 C s
C i 一C广N
C i 一C : 一 C。
1 0 9
.
2 (3 )
1 1 3
.
7 (3 )
1 0 8
.
3 (3 )
1 0 7
.
8 (3 )
1 2 4
.
0 (2 )
1 1 0
.
6 (3 )
1 24
.
4 (3 )
1 1 6
.
0 (3 )
1 1 1
。
2 ( 3 )
1 2 2
.
6 ( 3 )
1 1 0
.
2 (3 )
1 2 6
.
7 (3 )
104
.
0 (2 )
1 2 0
。
7 (3 )
C 6 一C 7 一N
C厂 C。一0 2
C S一 C。一 CZ
C S一 C s 一C 7
C 3 一 C Z一C z
C Z一C 3一N
C S一C ‘一N
C‘一C S一 C 6
C‘一N 一C :
C 3 一N 一C ;
C 3一 N 一 C 7
10 5
.
2 ( 2 )
1 07
.
7 (2 )
1 11
.
1 (3 )
1 0 1
.
5 (3 )
1 1 2
.
4 (3 )
1 0 4
.
3 ( 3 )
1 0 3
.
3 (3 )
1 0 3
.
6 ( 3 )
1 0 9
.
8 ( 3 )
1 14
.
6 ( 3 )
1 0 8
.
1 ( 3 )
图 l 菊三七碱分子的立体结构图
菊三七碱的分子及晶体结构
表三 平均平面方程和原子偏离平面的距离
平 面 内 原 子 偏离平面的距离 (A )
C ( 1 3 )
C‘1 ; )
O ( , )
O ( 2 )
} C‘
6 ,
一 0 . 0 3 6 8
0
.
0 2 5 6
0
.
0 0 3 3
0
.
0 5 0 3
一 0 。 0 4 2 4
C ( 1 0 )
C ( 。)
0 ( 。)
0 ( 1 )
C ( s )
0
。
0 0 6 8
一 0 。 0 0 0 2
一 0 。 0 03 1
一 0 . 0 1 3 2
0
。
0 0 9 7
一 0 。 0 64 6
0
。
0 5 2 1
一 0 . 0 1 9 5
一 0 . 0 2 0 8
0
.
0 5 2 8
、JŽ .声、少户泛U血‘司.叮才
N
Z‘声r、r忆C
C ( 2 3 )
C ( 2 7 )
C ( 一。)
C ( 1 2 )
C ( 1 ‘)
0
。
0 1 3 2
O
。
0 0 1 2
一 0 0 0 4 3
一 0 . 0 0 7 1
一 O 。 0 0 2 9
0
.
1 0 6 8 x + 0
.
3 3 1 5 y 一 0 . 9 3 7 4 2 + 1 . 5 8 7 0 = 0
一 0 . 158 0 x + 0 . 4 4 4 9 y 一 0 . 8 8 1 5 2 + 4 . 67 3 8 =
一 0 . 6 86 2 x + 0 . 7 2 4 1 y 一 0 . 0 6 9 2 2 + 1 . 5 5 2 5 =
0
.
7 7 5 6 x + 0
.
2 8 4 0 y + 0
.
5 6 3 6 2 + ( 一 0 . 1 7 4 7 ) = 0
34
菊三七碱的分子及晶体结构
表三 平均平面方程和原子偏离平面的距离
平 面 内 原 子 偏离平面的距离 (A )
C ( 1 3 )
C‘1 ; )
O ( , )
O ( 2 )
} C‘
6 ,
一 0 . 0 3 6 8
0
.
0 2 5 6
0
.
0 0 3 3
0
.
0 5 0 3
一 0 。 0 4 2 4
C ( 1 0 )
C ( 。)
0 ( 。)
0 ( 1 )
C ( s )
0
。
0 0 6 8
一 0 。 0 0 0 2
一 0 。 0 03 1
一 0 . 0 1 3 2
0
。
0 0 9 7
一 0 。 0 64 6
0
。
0 5 2 1
一 0 . 0 1 9 5
一 0 . 0 2 0 8
0
.
0 5 2 8
、JŽ .声、少户泛U血‘司.叮才
N
Z‘声r、r忆C
C ( 2 3 )
C ( 2 7 )
C ( 一。)
C ( 1 2 )
C ( 1 ‘)
0
。
0 1 3 2
O
。
0 0 1 2
一 0 0 0 4 3
一 0 . 0 0 7 1
一 O 。 0 0 2 9
0
.
1 0 6 8 x + 0
.
3 3 1 5 y 一 0 . 9 3 7 4 2 + 1 . 5 8 7 0 = 0
一 0 . 158 0 x + 0 . 4 4 4 9 y 一 0 . 8 8 1 5 2 + 4 . 67 3 8 =
一 0 . 6 86 2 x + 0 . 7 2 4 1 y 一 0 . 0 6 9 2 2 + 1 . 5 5 2 5 =
0
.
7 7 5 6 x + 0
.
2 8 4 0 y + 0
.
5 6 3 6 2 + ( 一 0 . 1 7 4 7 ) = 0
34
菊三七碱的分子及晶体结构 95
分子间的氢键联系。
根据文献报导 〔‘“, 在世界各地的很多植物中都存在双稠咄咯咤生物碱 , 其中有很多对人
及哺乳动物的肝 、 肺有严重的损伤作用 , 但是人们进一步发现这类化合物的最重要的生物学
作用是阻止细胞的分裂 。 因此把它作为抗肿瘤的药物来进行研究 。
目前 , 虽然对这一类化合物损害器官的分子机理不十分清楚。 但是人们通过 x 射线晶体
结构分析 〔‘’, 〔川 已发现仅具有如下化学结构特征的分子才出现 生物 活 性。 第一 , 在咄咯环
C ( 1》 和 C( 2 ) 之间存在双键 , 第二 , 次碱的经基必须醋化 , 第三 , 次酸必须具有分支的烃链 。
还发现这一类化合物的作用效力是与 C ( 1 )一C ( 2 ) 双键的反应性有关 , 而 反 应 性又 ,与 C ( 2 )一
C (
; 》一 C ( : )一O ( , ) 双面角的大小有关 , 双面角大 , 空间障碍小 , 作用物易于接近双键位置 , 作
用效力高 。 因此对具有不同生物活性的这一类化合物的三维结构的研究 , 对搞清结构与功能
的关系将是十分重要的。
本文报导的菊三七碱的分子及晶体结构表明 , 分子的毗咯环上 C ( , ) 和 C ( 2 ) 之间存在双
键 , c ( 2 )一 c ( , )一c ( : )一。( , ) 的双面角为 1 06 . 5 “ , 以及分子内存在两个内醋键 , 大环有侧链等
结构特点 , 这为解释菊三七碱的生物活性提供了结构基础 , 并可以予示它的毒性应较大 , 以
及作用效率应是较高的 。
参 考 文 献
〔1 〕 唐世蓉 , 吴余芬 , 中草药 , 1 1卷 , 5 期, 1 9 3 ( 1 9 8 0 ) ·
〔2 」 E . M e l e an , P h a r m . R e v . , v OI . 2 2 , 掩 4 , 4 30 ( 1 9 7 0 ) .
〔3 〕 R . S e h o e n t al , N a t u r e , vo l . 17 9 , 3 6 1 ( 19 5 7 ) .
〔4 〕 J . L . S u s s m a n , 5 . J . W o d e k , A e t a C r y s t . , B 2 9 , 2 9 1 8 ( 1 9 7 3 ) ·
[ 5 〕 T a s k K h o a z 五a e v , c h e m . N a t . C o m P o u d s , v o l . 1 5 , 沌 3 , 3 1 5 ( 1 9 7 9 ) .
[ 6 〕 T a s h K h o a z h a e v , Cb e m . N a t . C o mP o u d s , v o l . 1 5 , 地 3 , 3 1 9 ( 1 9 7 9 ) ·
〔7 〕 J . F r i d r ie h s o n s , A . M e m a t五i a s o n , o , J . S o t o r , A e t a C r y s t . 1 6 , 1 0 7 5 ( 19 6 3 ) ·
〔8 〕 T . A . G o is s m a n , A u s t . J . 以恤 . v o l . 12 , 渔 2 , 2 4 7 ( 1 95 9 ) .
〔9 〕 J · F r i d r ie h s o n s , M . A . M a t五i e s o n , J . D . Su t o r , T e t r a 五e d r o n L e t t e r s , 她 2 3 , 3 5 ( 1 9 6 0 ) .
[ 1 0〕 M . A . M a t li i e s o n , P u r e A PP I . Ck e m . v o l . 2 , 5 05 ( 1 9 6 1 ) .
〔1 1〕 J . J . S t e z o w s k i , A e t a C r y s t . B 3 2 , 2 5 5 7 ( 1 9 7 6) .
[ 1 2〕 R . R o qU e s , J . L a P a s s e t , A e t a C r y s t . B 3 2 , 13 94 ( 1 0 7 6 ) .
[ 1 3〕 A . T , M e Ph a i l , K a y D . o n a n , T a tr a h e d r o n L e t t e r s , 冲 6 , 4 8石( 1 , 7 6 ) .
[ 14〕 H . S t o e ck i i 一E v a n s , D . H . G . G r o u t , H e l v . Ch i m . A e t a , v o l . 5 9 . F e s e . 6 , 2 1 6 8 ( 1 9 7 6 ) .
96 北 京 大 学 学 报
M o l e e u l a r a n d C r y s t a l S t r u c t u r e o f a P y r r o l i z i d i n e
A lk a l o i d f r o m G y n u r a S e g e t u m (l o u r
.
) M e r r
.
H u a Z i q i a n , X u X i a o j 犷e , 平 e i X i n e he n g
P e 无i n g U n i 刀e r : i t y
T a n g S h i r o n g
, 平u Y u f e n
J i a n g S u I n s r i u t e o f B o t a n y N a n J i n g
A b s t r a e t
T h e m o l e e u l a r a n d e r y s t a l s t r u e t u r e o f t h e t i t l e e o m p o u n d w h i e h 1 5 a m a e r o e y e l e
P y r r o l i z i d i n e a l k a l o i d e x t r a e t e d f r o o G y n u r a s e g e t u m ( l o u r
.
)M e r r
. , h a s b e e n d e t e r m i n e d
b y d i r e e t m e t h o d
.
T h e e r y s t a l 1 5 o r t h o r h o m b i e w i t h o P a e e g r o u p p Z : 2 : 2 1 , a = 9 . 0 0 4 ( 3 ) A ,
b = 1 1
.
3 3 2 ( 2 ) A
, c = 1 7
.
1 7 3 (7 ) A
, z = 4
, D = 1
.
2 7 9 / e m ,
.
T h e s t r u e t u r e w a s r e f i n e d b y t h e
m e t h o d o f l e a s t 一s q u a r e s t o a n R i n d e x o f
.
0 5 4
·
A d o u b l e b o n d b e t w e e n c ( i ) a n d c (2 ) i n p y r r o l i z i d i n e n u e l e u s 15 P r e s e n t i n t h e
m o l e e u l a r s t r u e t u r e : t h e d i h e d r a l a n g l e b e t w e e n t h e P l a n e s C ( 1 ) c ( 2 ) c (8 ) a n d C ( 1 )
C ( s ) 0 ( i ) i , 1 0 6
.
5 ; t h e b a e k b o n e o f t h e m a e r o e y e l e e o n s i s t s o f 1 2 a t o m s ; t五e s i d e g -
r o u P s o f t h e m a e r o e y e l e e o i n e i d e w i t h t h o s e o f t h e P o i s o n o u s S e n e i o n i n e
.