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Recent progress of genetic engineering on 1,3-propanediol biosynthesis

微生物法生产1,3-丙二醇的基因工程研究进展



全 文 : 万方数据
万方数据
2006年5月 黄志华等:微生物法生产l,3一丙二醇的基因工程研究进展 ·3·
讹调节子受三个因子调控。首先,妣调节
子被讹R编码的抑制子抑制,该抑制子作用为转
录水平从而抑制妣系统酶的合成。在DHA存在
下抑制子失活,其机理可能是与抑制因子结合并使
其失活H¨。其次,氧对如n系统有负调节作用。当
细胞厌氧代谢甘油时,氧将引起甘油脱氢酶和1,3一
PD氧化还原酶不可逆失活-9J。第三个调节讹系
统的因子是环化磷酸腺苷(cAMP)。当在K.p聊“一
瑚n池厌氧生长培养基中加入底物葡萄糖时,甘油
脱氢酶和1,3.PD氧化还原酶活性丧失一半。cAMP
的存在消除了葡萄糖的代谢抑制,说明葡萄糖和
cAMP的调控作用。cAMP的正调节作用可能是因
为它能够刺激RNA聚合酶和启动子结合从而激活
rIlI矾A的合成‘12I。
2构建基因工程菌株的5种思路
为了提高生物法生产1,3.PD的产量和产率,降
低原料成本,提高生物法生产1,3一PD的竞争力,需
要得到高产量、高产率和高转化率的菌株。利用基
因工程方法构建基因工程菌株,就是一个很好的选
择。
基因工程菌的构建策略主要有5种实验方案,
见图2。
(1)通过基因工程方法强化还原途径中限速酶
(如甘油脱水酶)的表达以及阻断副产物代谢途径,
并多克隆表达编码激活因子的基因;
(2)将1,3.PD生产菌的如oB、抛T基因克隆
到甘油生产菌中,以希望获得能将葡萄糖转化为
1,3.PD的基因工程菌;
(3)将甘油生产菌的蹦R1、GPP2基因克隆到
1。3.PD生产菌中,以希望获得能将葡萄糖转化为
1,3.PD的基因工程菌;
(4)将1,3。PD产生菌的妣调控子调控的基因
克隆到E.co尻中,获得能转化甘油为1,3一PD的基因
工程菌;
(5)将1,3一PD的抛B、妣T基因和甘油生产
菌的D解1,GPP2基因克隆到E.c0如中,从而获得
能将葡萄糖转化为1,3.PD的基因工程菌。
2.1原始生产菌株中1,3.PD代谢途径的改造
Aherens等¨3o和Menzel等¨40发现在K.p,zeu一
啪凡i伽内,甘油脱水酶和丙酮酸激酶分别是还原途
径和氧化途径的限速酶。酶活分析表明甘油脱水酶
在C.6埘仍c啪中也是1,3.PD生产的限速酶。Men.
zel等人【14J对K.p珊姗oni僦的代谢工程改造做了大
量研究,他们构建了含有编码甘油脱水酶和1,3.PD
氧化还原酶基因的质粒,将其插入野生菌种中,结果
证明这两个酶的活性得到了大幅度提高。但是在实
际的发酵过程中,该工程菌并未产出高浓度的1,3.
PD。原因可能有两个方面,一是所构建质粒的稳定
性差,二是最终产物1,3一PD对如。调节子的基因表
达有着强烈的反馈抑制作用。
④ @
图2基因工程菌的构建策略
Fig.2Strate百esofgeneticre onlbinantsn
1,3一pIDpanediolbiosy lthesis
甘油脱水酶很容易在发酵的过程中失活¨“,从
而降低1,3.PD的合成效率。Tomya等人的研究表
明,向甲苯处理后的K.p,ze啪ni伽和K.眦脚m细
胞中加入ATP、M孑+(或Mn2+)及辅酶B1:时,可以使
失活的脱水酶复活【16|。当将K.咧o∞中二醇脱水
酶基因与其37一末端的两段读码框共同在E.c0如中
表达后,再加入A耶、M92+及辅酶B,:,其感受态细胞
能使自杀性失活的脱水酶恢复催化活性,也能激活
脱水酶一氰钴氨素的复合体。因此认为这两个读码
框编码能使二醇脱水酶复活的蛋白因子(简称复活
因子),分别命名为拙A和鼢B基因¨7I。现在,脱
水酶复活因子已经分别在K.pne啪n妣u5|、C.咖一
M以护83中发现并得到证实。目前对复活因子的应
用研究大多集中在其复活调控功能上(如表2所
示),而其对1,3.丙二醇合成影响的研究开展较少,
此这方面还有很大的研究空间。
此外,编码甘油脱水酶的DNA序列具有高度的
保守性,这非常有利于利用分子生物学筛选技术来
开展相关微生物的识别工作。KnietschA等u引建立
了一个相关的DNA文库,他们利用DNA探针等基
因操作方法分离出了一系列甘油脱水酶的自然突变
体,这些突变体对于甘油和l,3.PD具有高的耐受
·I生。
万方数据
·4· 熏物加工过程 第4卷第2期
拙4嬲坍 髟.明哟∞ pusl2E系列(did—dehydratase)E.c0托JMl09 诱导表达,使失活的酶复活n73
g癌建 爱。≯凇瓣。疵e≯潮9(∥轰龄、繇8韵 E。。藏掰l游 6,3∥£l,3.渤‘矧
蒯科砌啦 &.嗍砌∞ puSl2End(6/5b)(dioldehydIaIase)E.c旅JMl09 诱导表达,使失活的酶复活‘‘51
鲋魄舢 K.p凇珊on妇 pCxV系列 E.∞矗JMl09(pUSl2E(GD))诱导表达,使失活的酶复活㈨
翻蒯勉s 幺趣勰蒎 西Slll 豆.∞菇麟109pCsl2;0(兹勰嬲)诱导表达,使失活的酶复活n83
最近,Rayllaud等人[2lj从分子和生化的角度对
编码g。6翰嘞聪瓣V磁1718酶l,3一P矜操缎子的基因
进行了分析。这个操纵子由妣Bl,讹B2和抛T
组成。当在以甘油为碳源,不含有维生素B1:的培养
基上培养表达该操纵子的露.∞鑫时,能产生l,3.羚
并且袭达出很离的甘油脱水酶和1,3。PD氧化还原
酶的话性。妣Bl和妣溉分别编码了一种新的
类型的甘油脱水酶和其复活蛋白,与所有已知的依
赖辅酶B,:的甘油脱水酶没有同源性,却非常类似于
丙酮酸甲酸裂勰酶和其复活蛋白以及它们的同类
物。发现不依赖辅酶Bn的甘油脱水酶,将极大地促
进发展一个经济的、不依赖辅酶B,:的并可利用再生
资源来合成l,3。鞫的生物过程。
2.2在1,3.PD生产菌株和甘油生产菌株中构建利
用葡萄糖合成l,3.PD的基因工程菌C删瞄1穰王硒融若23‘等将趸。黼8班黝强泌编码
甘油歧化所需酶的基因,转入了产甘油的酿酒酵母
&c玩rom删s∞删妇池中。研究发现利用该真核工
程蘸将葡萄糖转化为l,3+转是非常豳难昀,C粼艘.
on等人所构建的工程菌.s.∞聊蠡池YP}1500,在以葡
萄糖为底物发酵48h后,虽然相关的酶得以表达,
但是活性毒基常低并且没鸯检测到l,3一糟。对予在
K.pM姗on妇,G.6m俩c“m等1,3.PD生产菌株中表
达甘油合成基因的研究思路,虽然Biebl等人⋯提出
了既方案的可行性,但还没有迸一步研究报道。
2.3在E.co如中表达妣调节子调控的基因
sp嫩lger[12]和Ton一矧分别将甘油歧化途径中编
码GD融和蕊D程酶的基因转入到了蟊。耐i中,
GDHt和PDOR得以成功表达,但是酶活性比较低,
l,3.翔的最终发酵质量浓度只有6.5∥L。Sk曲啪3
将蹴B和蹴T构建在网一个操纵子中,妣B程
砒T由同一个启动子控制。该操纵子含有特异酶
切位点,从丽使于置换窟动子或者进行其他修饰,适
于不同的宿主。含有该操纵子的嚣.∞菇AGl在甘
油和葡萄糖的混合底物发酵过程中,l,3.m发酵终
笈量浓度为6。33∥己,结果也不理想。
周文广等人滔]从克氏肺炎杆菌中成功提取了
l,3.PD氧化还原酶基因妣T,并将其在大肠杆菌中
进行克隆穰表达,褥到了与天然纯l,3.鼬氧化还原
酶相同的产物蛋白。迟乃玉等人瞄]则克隆了巴氏
梭菌中编码l,3一PD氧化还原酶的妣T,并完成了
抵T基因{荑||序、表达载体构建稀在霪。∞磊中表达
的工作。张晓梅等人∞3从大肠杆菌中扩增出编码
l,3.丙二醇氧化还原酶同工酶的基因融D,再将含
甘油脱水酶基因执B和含l,3。丙二醇氧化还原酶
同工酶基因础D的重组质粒共转化大肠杆菌
臌l鹕褥到重组大肠杆菌JMl09(puCtac一蠢酝B,
pEtac一励D),该菌株在好氧条件下,以1.Ommol鹰
IPl’G诱导可将50g/L甘油转化为38.1g/L1,3一丙二
醇。
2.4在E.∞菇中构建利用葡萄糖合成l。3.PD的基
因工程菌
墨兹构造成功基因工程菌株采用了此方案。
DuPont公闭和Geneneor公司合作,已经获得能够将
葡萄糖转化为1,3.PD的基因工程菌株,并已经完成
中试实验。&‰£的基因工程蒽拣是建立在互。碱
K12的基础上的汹】。层.c0魔K12本身只有很弱的产
生甘油的能力,没有合成1,3.PD的能力,因此基因
工程菌主要依赖予外来的碳源代谢途径,该途径碳
源从DHAP转到l,3.PD的途径,D姒P是碳源代谢
的主要的节点。
该碳源代谢途径穰嗣从s。扰赫泌中褥至l的
3磷酸甘油脱氢酶和3一磷酸甘油磷酸酶来合成甘
油,利用从K.p删妇中获碍的甘油脱水酶
(抛Bl,谶口B2,蹴糙)帮其复活因子(蹴BX,
o掇)将甘油转化为3。HPA,利用一个大肠杆菌中以
前未确定的氧化还服酶嫩D褥不是l,3。pD氧化
还原酶磁靠T完成了整个途径,基因工程菌的示意
万方数据
万方数据
生物加工过程 第4卷第2期
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ll:i鏊蠢薹薹!垂黧薹!篓开始进行转化,一边冉继续培养。该转化
工艺忽视了后盼段——转化反应阶段介质体系的优
化问题 。
当前,有一种很具吸引力的取代生长细胞进行
微生物转化技术,郄应用细胞悬浮法又称置换培养
或静息细胞培养(replacementorrestingcellculture),
它将微生物的生长培养同生物转化严格地分开进
行。邵徽生物酶菌丝缨胞借助二级发酵臻莽程序产
生,然后通过采用过滤或离心的方法收获细胞物,细
胞物彻底洗涤,然后悬浮在合适的缓冲液介质
中陵o。通常可将细胞物浓度较生长塘养阶段增高2
~3倍。然后投加底物进行非生长细胞悬浮培养的
万方数据