全 文 :第9卷第5期
2011年9月
生 物 加 工 过 程
ChineseJournalofBioprocessEngineering
Vol.9No.5
Sep.2011
doi:10.3969/j.issn.1672-3678.2011.05.005
收稿日期:2011-05-06
基金项目:国家高技术研究发展计划(863计划)资助项目(2006AA02030109)
作者简介:于 芳(1987—),女,山东青岛人,硕士研究生,研究方向:发酵工程;郑 璞(联系人),研究员,Email:zhengpu@jiangnan.edu.cn
碳酸盐对谷氨酸产生菌在缺氧条件下产有机酸的影响
于 芳,郑 璞,倪 晔,董晋军,王兴林,孙志浩
(江南大学 生物工程学院 工业生物技术教育部重点实验室,无锡 214122)
摘 要:考察谷氨酸产生菌在缺氧条件下积累L乳酸和琥珀酸的情况。结果表明:在缺氧条件下,嗜乙酰乙酸棒
杆菌(Corynebacteriumacetoacidophilum)ATCC13870积累有机酸的浓度随菌体密度的增大而增加,其中琥珀酸和乳
酸积累的最适pH分别为75和80,最高质量浓度分别为225和60g/L。碳酸盐是影响产酸与有机酸分布的主
要因素。比较ATCC13870在NaHCO3浓度为40和400mmol/L时的代谢通量,发现后者合成琥珀酸的代谢通量比
前者提高了2141%,合成乳酸的代谢通量降低了618%,说明PEP节点处的代谢通量分配明显受NaHCO3浓度的
影响,而PYR节点受环境因素的影响不明显。
关键词:谷氨酸产生菌;乳酸;代谢流;缺氧;琥珀酸
中图分类号:Q933 文献标志码:A 文章编号:1672-3678(2011)05-0022-05
Influenceofbicarbonateonorganicacidof
glutamicacidproducingbacteriaunderoxygendeprivation
YUFang,ZHENGPu,NIYe,DONGJinjun,WANGXinglin,SUNZhihao
(KeyLaboratoryofIndustrialBiotechnologyoftheMinistryofEducation,SchoolofBiotechnology,
JiangnanUniversity,Wuxi214122,China)
Abstract:SuccinicacidandlacticacidaccumulationbyLglutamicacidproducingbacteriaunderoxygen
deprivationwereinvestigated.ResultsshowedthatCorynebacteriumacetoacidophilumATCC13870could
accumulatenotableconcentrationoforganicacid,inwhichtheyieldoforganicacidincreasedwithitscel
density.TheoptimalpHvaluesforsuccinicacidandlacticacidgenerationbyC.acetoacidophilumATCC
13870were75and80,respectively,atwhichtheconcentrationsofsuccinicacidandlacticacid
reachedto225and600g/L,corespondingly.Bicarbonatewasthekeyfactorinfluencingorganicacid
synthesismorethanglucose.Themetabolicfluxtothesuccinicacidsynthesispathwayincreasedby
2141%,whilethefluxtothelacticacidsynthesispathwaydecreasedby618% withincreasingsodium
bicarbonateconcentrationfrom40mmol/Lto400mmol/L.ThisindicatedthatPEPnodewasevidently
influencedbysodiumbicarbonateconcentrationbuttheinfluenceofPYRnodewasless.
Keywords:glutamicacidproducingbacteria;lacticacid;metabolicflux;oxygendeprivation;succinicacid
谷氨酸产生菌具有产酸效率高、食品安全性好
的特点,近年来已成为研究氨基酸产品的开发,探
索非氨基酸产物合成与调节途径及功能基因组的
模式菌[1]。其中,用谷氨酸产生菌生产有机酸的研
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究也受到人们的关注。Inui等[2]发现好氧培养的谷
氨酸产生菌处于缺氧环境时,细胞能够分泌相当量
的乳酸作为代谢产物,表明了用谷氨酸产生菌在缺
氧条件下生产有机酸的可能性;Okino等[3-4]用
C.glutamicum基因工程菌生产琥珀酸与 D 乳酸,
最高产量可分别达到146与120g/L,反映了谷氨酸
产生菌用于有机酸生产的潜在应用价值。
笔者考察C.acetoacidophilumATCC13870在缺
氧环境下产有机酸分布的情况及影响因素,通过代
谢流分析,揭示不同 NaHCO3浓度对关键代谢节点
处代谢流分布的影响,为进一步研究以谷氨酸产生
菌为模式菌生产乳酸或琥珀酸提供参考。
1 材料与方法
11 材料
111 菌株
嗜乙酰乙酸棒杆菌(Corynebacteriumacetoacidophi
lum)ATCC13870,由江南大学生物催化研究室保藏。
112 培养基
斜面培养基(1L):葡萄糖1g,蛋白胨10g,酵
母膏5g,NaCl5g,琼脂 20g。
种子培养基(1L):尿素2g,酵母膏 2g,酪蛋白
7g,(NH4)2SO47g,KH2PO405g,K2HPO405g,
MgSO4·7H2O05g,FeSO4·7H2O6mg,MnSO4·H2O
42mg,生物素 02mg,硫胺素 02mg和葡萄糖
40g。pH70~72。115℃灭菌20min。
发酵培养基(1L):KH2PO405g,K2HPO405g,
MgSO4·7H2O05g,FeSO4·7H2O6mg,MnSO4·H2O
42mg,生物素 02mg和硫胺素 02mg。pH70~
72。115℃灭菌20min。
12 实验方法
121 有机酸的发酵方法
从斜面上将菌种挑取2环于种子培养基中,在
30℃、200r/min培养 24h;将种子液离心(5000
r/min、4℃、10min),收集菌体,将菌悬液接种到
33℃、500mL有盖子的试剂瓶中。在发酵过程中
间歇性地补加碳酸盐。
122 代谢产物及残糖的测定
葡萄糖及琥珀酸、乙酸、乳酸的测定参照文献[5]。
123 ATCC13870缺氧条件下产有机酸代谢网络
的建立
从文献[6]可知,ATCC13870在缺氧条件下的
主产物为乳酸、琥珀酸和乙酸,并且存在 EMP、
HMP、回补途径、C3及 C4途径。而乙醛酸支路并未
出现;而且 PEPC(磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶)催化
的反应主要是回补反应。
按以下原则[7]建立代谢网络:1)代谢流分析是
基于拟稳态假设基础上的分析方法,缺氧环境中该
菌细胞无法生长,即生物量的合成为零;2)乙醛酸
循环在细胞代谢过程中不存在;3)按固定比例进行
的反应以及无分支点的中间反应,尽量简化为一个
反应方程;4)细胞生长停滞阶段,由于大量无效循
环的存在,细胞维持能量总量与 ATP的消耗量并不
相等,所以不考虑ATP总量的平衡。
124 流量平衡方程计算
假设细胞内的中间代谢物均处于拟稳态,即其
浓度变化速率为0。根据物料质量守恒定律计算代
谢物的积累速率有:
0=Ax(t)=G×r=Gm×rm+Gc×rc (1)
式(1)中,Ax(t)是中间代谢产物的积累速率,G是
n×k阶的代谢反应总行列矩阵,r是 k×1阶的反应
速率的向量,通过矩阵的分割将 G转化为2个矩阵
Gc和Gm。Gc中包含的是与待测反应通量(c)有关
的系数,Gm中则包含与已知通量(m)相关的系数。
式(1)的自由度:F=k-n。在琥珀酸代谢网络中,
一共有m(5)个代谢通量是可以测量的,即m>F=
4。所以Gc为一个13×12的矩阵,该系统为超定系
统,通过最小二乘法进行方程求解计算[8-9],利用
Matlab70软件计算得出代谢流分布。参照文献
[2-3,6]的研究,ATCC13870缺氧条件下发酵前
期产有机酸的速率最快,因此本文中需计算 ATCC
13870发酵8h的代谢通量。
2 结果与讨论
21 培养方式对ATCC13870产有机酸的影响
不同培养方式对 ATCC13780产有机酸的影响
结果见图 1。由图 1可知:缺氧静止培养条件下
ATCC13870的乳酸产量最高,而在缺氧振荡培养条
件下其琥珀酸产量最高,而且其好养条件下的产酸
水平远低于缺氧条件下的水平。
22 菌体密度对ATCC13870产有机酸的影响
考察不同菌体密度对 ATCC13870产酸的影
响,结果见图2。由图2可知:随着菌体密度增大,
乳酸和琥珀酸的产量也相应增加,当菌体密度(以
干细胞计)为60g/L时,乳酸和琥珀酸的产量达到
最高,分别为4546和2065g/L。
32 第5期 于 芳等:碳酸盐对谷氨酸产生菌在缺氧条件下产有机酸的影响
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图1 培养方式对ATCC13870产有机酸的影响
Fig.1 Efectsofculturemethodsonorganicacid
productionbyATCC13870
图2 菌体密度对ATCC13870产有机酸的影响
Fig.2 Efectsofcelconcentrationonorganicacid
productionbyATCC13870
23 葡萄糖浓度对ATCC13870产有机酸的影响
比较不同葡萄糖浓度下 ATCC13870产琥珀
酸和乳酸的情况,结果见图 3。由图 3可知:随着
葡萄糖浓度的增加,葡萄糖的消耗速率与琥珀酸、
乳酸的生成速率几乎恒定,分别为 377~397、
2158~2446和584~618mmol/(h·L)。说明
葡萄糖浓度为 100~400mmol/L时,琥珀酸与乳
酸的生成不受葡萄糖基质浓度的限制。
图3 葡萄糖浓度对ATCC13870产
有机酸的影响
Fig.3 Efectsofglucoseconcentrationonorganic
acidproductionbyATCC13870
24 pH对ATCC13870产有机酸的影响
考察发酵过程中不同的 pH对 ATCC13870产
酸的影响,在缺氧条件下发酵48h得到如图5所示
的结果。由图5可知:当pH75时,ATCC13870的
琥珀酸产量最高(225g/L),而当 pH为80时,其
乳酸的产量达到最高(60g/L)。
图4 pH对ATCC13870产有机酸的影响
Fig.4 EfectsofpHonorganicacidproduction
byATCC13870
25 碳酸盐种类对ATCC13870的产酸影响
在pH75条件下,考察Na2CO3、MgCO3、NaHCO3
和CaCO3这4种碳酸盐对ATCC13870产有机酸的影
响,结果见图5。由图5可知:补加Na2CO3、MgCO3、
NaHCO3和 CaCO3时的乳酸与琥珀酸的比值分别为
251∶1、206∶1、270∶1和 267∶1。由此可以看出,
NaHCO3最利于有机总酸的积累,而MgCO3则最利于琥
珀酸的积累。
图5 碳酸盐种类对ATCC13870产
有机酸的影响
Fig.5 Efectsofdiferentbicarbonatesonorganic
acidproductionbyATCC13870
26 NaHCO3浓度对 ATCC13870产有机酸代谢
流分布的影响
考察NaHCO3浓度分别为40和400mmol/L时,
ATCC13870的产有机酸的代谢通量(表1)。代谢
通量计算结果如图6所示。
42 生 物 加 工 过 程 第9卷
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表1 40和400mmol/LNaHCO3浓度条件下底物与产物的浓度变化
Table1 Therateofglucoseconsumptionandorganicacidproductiononsodiumbicarbonate
concentrationof40and400mmol/L
c(NaHCO3)/
(mmol·L-1)
ρ(葡萄糖)/
(g·L-1)
ρ(乳酸)/
(g·L-1)
ρ(琥珀酸)/
(g·L-1)
ρ(乙酸)/
(g·L-1)
速率/
(mmol·h-1·L-1)
7h 9h 7h 9h 7h 9h 7h 9h 葡萄糖 乳酸 琥珀酸 乙酸
40 68980 68020 5387 6138 0144 0257 0081 0109 100 156400 20820 8860
400 62096 59063 6281 8102 4344 5644 0259 0315 100 120085 65400 5540
图6 40和400mmol/LNaHCO3浓度条件下
ATCC13870的代谢通量分析比较
Fig.6 Comparisonofmetabolicfluxanalysisby
ATCC13870onsodiumbicarbonate
concentrationof40and400mmol/L
261 PEP节点分析
谷氨酸棒杆菌中CO2固定反应是提供琥珀酸前
体物草酰乙酸(OAA)的主要途径[10]。而乳酸的前
体物丙酮酸(PYR)是由磷酸烯醇式丙酮酸(PEP)经
过丙酮酸激酶催化生成的。PEP节点处的流量分配
如图7所示。由图7可知:在NaHCO3浓度为40和
400mmol/L条件下,后者合成 OAA的代谢通量比
前者提高了2141%,合成 PYR的代谢通量降低了
618%,说明 PEP节点处的代谢通量分配明显受
NaHCO3浓度的影响。增加NaHCO3浓度使相当一部
分的代谢流向着生成OAA的方向迁移,从而使合成
琥珀酸的代谢流增加,合成乳酸的代谢流减小。因
此,PEP节点为柔性节点。
262 PYR节点分析
研究表明,尽管PYC(丙酮酸羧化酶)是主要的
图7 2种NaHCO3浓度条件下PEP节点处的流量分配
Fig.7 FluxdistributionatthePEPnodeon
sodiumbicarbonateconcentrationof
40mmol/L(a)and400mmol/L(b)
补缺酶,但是草酰乙酸主要是由 PEPC催化生成的,
几乎很少的OAA是由PEPCK(磷酸烯醇式丙酮酸羧
图8 2种NaHCO3浓度条件下PYR节点处的流量分配
Fig.8 FluxdistributionatthePYRnodeon
sodiumbicarbonateconcentrationof
40mmol/L(a)and400mmol/L(b)
化激酶)和PYC催化生成的[10]。PYR节点处的流量
分配如图8所示。由图8可知:随着NaHCO3浓度的
增加,由PYR生成OAA的代谢流量仍为0,且通往乳
酸的代谢流降低了23%,因此,PYR为刚性节点,该
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节点受环境影响不明显。
3 结论
嗜乙酰乙酸棒杆菌 CacetoacidophilumATCC
13870在缺氧条件下积累琥珀酸和乳酸的最高质量
浓度分别可达到225和60g/L。
碳酸盐是影响产酸与有机酸分布的主要因素。
比较 ATCC13870在 NaHCO3浓度为 40与 400
mmol/L时的代谢通量,发现后者合成琥珀酸的代谢
通量比前者提高了2141%,合成乳酸的代谢通量
降低了618%,说明 PEP节点明显受 NaHCO3浓度
的影响,而PYR节点受环境因素的影响不明显。因
此,若用基因工程技术切断生成乳酸的代谢途径,
则更多的碳代谢有可能流向草酰乙酸与琥珀酸;若
通过基因工程技术,增强乳酸脱氢酶活性,使由丙
酮酸生成乳酸的代谢流量加大,则可提高乳酸的生
成量。实验结果为进一步研究用谷氨酸产生菌生
产乳酸与琥珀酸提供了参考。
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美国科学家在《科学·转化医学》杂志上撰文指出,他们研发出了一种新的生物合成材料,只需在皮下
注入这些可永久取代身体软组织的光激活移植物,医生们就可对创伤或疾病造成的组织损伤进行修复和功
能重建。这种非侵入式的移植技术尤其适用于面部整形,避免了现有技术存在的疤痕形成及功能丧失等问
题,有望开启新的整容时代。
以色列科学家研发纳米机器人可在人体内“巡逻”自动给药
以色列科学家正在研制一种微型纳米机器人,它可以在人体内“巡逻”,在锁定病灶后自动释放所携带
的药物。这种技术的原理是:在编程过程中将某种特定疾病定义为“是”状态。“巡逻”过程中,机器人可执
行一系列计算,检查所在位置处信使RNA上的疾病指标。如果某种特定疾病的所有指标都满足,机器人这
时会做出应该释放药物的判断。如果检测到的指标并不充分,它最后会位于“否”的状态。科学家对这种机
器人进行了不断的改进,并取得了突破性的进展,它现在可以从多种渠道来检测疾病指标,例如信使 RNA、
微RNA、蛋白质以及多种小分子。
(胡晓丽)
62 生 物 加 工 过 程 第9卷
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